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Estudio de las relaciones genéticas de las estirpes del cerdo ibérico mediante marcadores microsatélites

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Estudio de las relaciones genéticas de las estirpes del cerdo ibérico mediante marcadores microsatélites

Author: Membrillo, A.; Azor Ortiz, Pedro Javier; Clemente, I.; Dorado, Gabriel; Diéguez, E.; Gómez, J.; Jiménez Marín, Ángeles; Santos, E.; Molina, A.
Publisher: Junta de Andalucía. Consejería de Agricultura y Pesca.
Year: 2007
Source: https://idus.us.es/bitstreams/9c01af86-93e4-4efa-bc12-c68eed94e269/download
MICROSATÉLITES
Memb illo A.1,Azo P.J.1,Clemen e I.1,Do ado G.2,Diéguez E.3,
Gómez, J. 1,Jiménez A.1,San os E.1yMolina A.1
1G upo Me agem. Dp o de Gené ica. Facul ad de Ve e ina ia. Uni e sidad de
Có doba. Edi . Mendel Pl. Baja. Campus de Rabanales. C a. N-IV, km 396ª. 14071
Có doba. SPAIN. E-mail: [email p o ec ed]
2Dp o de Bioquímica y Biología Molecula . Uni e sidad de Có doba. Edi . Se e o
Ochoa. Campus de Rabanales. C a. N-IV, Km 396ª. 14071 Có doba. SPAIN
3Asociación Española de C iado es de Ganado Po cino Selec o Ibé ico Pu o y
T onco Ibé ico. C/ San F ancisco, 51, 1º-D. 06300 Za a. Badajoz. SPAIN
INTRODUCCIÓN
El Ce do Ibé ico cons i uye la única aza po cina au óc ona de omen o
de España incluida en el Ca álogo o icial de azas de ganado de España (RD
1682/1997). Es a aza p esen a una g an a iabilidad que se aduce en la
p esencia de a ias es i pes den o de ella. Aunque exis en a ias es i pes
del Ce do Ibé ico, ac ualmen e exis en 4 o icialmen e econocidas en el ca a-
logo de azas (O den APA/53/2007) (En epelado, Neg o Lampiño, Re in o y
To biscal). Has a el momen o, la base de la di e enciación de las es i pes se
ha lle ado a cabo en base a ca ac e es mo ológicos y ane óp icos p inci-
palmen e. Hoy día es a di e enciación puede se es udiada desde el pun o
de is a gené ico u ilizando he amien as de gené ica molecula . Exis en
a ios abajos en los que se ha demos ado que los ma cado es molecula-
es de ipo mic osa éli e son una he amien a de g an alo pa a su uso en
es udios de di e enciación gené ica de poblaciones de animales (Azo
e al.
,
2007, Ma ínez
e al.
,2000). El obje i o de es e abajo ha sido pone de
mani ies o las elaciones gené icas exis en es en e las di e en es es i pes y
líneas econocidas adicionalmen e en el Ce do Ibé ico u ilizando ma cado-
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ESTUDIO DE LAS RELACIONES GENÉTICAS DE LAS
ESTIRPES DEL CERDO IBERICO MEDIANTE MARCADORES
es mic osa éli es.
Conseje ía de Ag icul u a y Pesca
Palab as cla e: Ce do Ibé ico, es i pes, a iabilidad gené ica, mic osa-
éli es, di e enciación gené ica.
MATERIAL Y MÉTODOS
Pa a es e es udio se han u ilizado 350 animales de la aza po cina ibé i-
ca ep esen an es de las es i pes: En epelado, Neg o Lampiño, di e en es
líneas de Re in o (Villalón, Sil ela, Valdeseque a y Mamellado), To biscal y
o as como ce dos Alen ejanos, el Manchado de Jabugo y el Neg o de los
Ped oches. Las mues as ue on sang e en e a ex aída del seno in ao bi a-
io, u ilizando sis emas Vacu aine ® en ubos de 7 ml que con enían
EDTAk3 como an icoagulan e. También se han omado mues as de 30 ani-
males de la aza Du oc pa a su u ilización como e e encia y po su impo -
ancia ya que se u iliza como aza pa en al en los c uzamien os que se lle-
an a cabo en el ce do ibé ico de acue do a la No ma de Calidad (RD
1083/2001).
La ex acción del ADN a pa i de las mues as se lle ó a cabo u ilizando
la me odología de Mille
e al.
,(1998) y diges ión con p o einasa K. Todos
los animales ue on geno ipados pa a un o al de 35 ma cado es mic osa é-
li es dis ibuidos po odo el genoma po cino en e los que se encuen an los
25 ecomendados po la FAO pa a es e ipo de es udios. Los ma cado es
mic osa éli es ue on ampli icados median e PCR múl iple (Reacción en
cadena de la Polime asa). Los agmen os ampli icados ue on comp obados
en gel de aga osa al 2% y pos e io men e analizados en un secuenciado
au omá ico capila ABI3730 de Applied Biosys ems. Los alelos ue on ipi i-
cados con el so wa e GeneMappe 4.0.1. Pa a el cálculo de los es adís i-
cos elacionados con la a iabilidad y di e enciación poblacional se ha usado
el so wa e Gene ix 4.0.5. Pa a de e mina la p oximidad gené ica en e las
di e en es poblaciones analizadas hemos calculado la ma iz de dis ancia de
Reynolds (Reynolds
e al.
,1983) y se ha ep esen ado u ilizando el algo i -
mo Neigbou g Joining usando el so wa e Phylip 3.65.
RESULTADOS Y DISCUSIÓN
El núme o medio po locus po población ha oscilado en e 2,25 y 2,54
en las poblaciones Manchado de Jabugo y Villalón y 4,8 en la aza Du oc
(Tabla 1).
394
Las azas au óc onas en la p oducción ex ensi a adicional
o medio de alelos po locus en las poblaciones Ibé ica y Du oc analizadas.
395
Al calcula los alo es de las he e ocigosidades obse ada (Ho) y espe a-
da (He) se comp ueba que de nue o las poblaciones Manchado de Jabugo
yVillalón son las poblaciones que p esen an los meno es alo es, indica i o
de una meno a iabilidad gené ica y po an o meno consanguinidad. Pa a
es os pa áme os la población de Neg o de los Ped oches ha sido la pobla-
ción que ha p esen ado los alo es más ele ados
Cuando es udiamos los es adís icos F de W igh medios en e odas las
poblaciones (Tabla 2) y en e odos los pa es de poblaciones (Tabla 3)
obse amos que los alo es pa a el FST son muy ele ados, lo que indica que
la p opo ción de la a iación debida a la di e encia en e poblaciones es muy
ele ada (20%), mayo a la ob enida en e o as azas de animales domés i-
cos, o lo que es lo mismo, que exis e una g an di e enciación en e ellas. El
mayo ni el de di e enciación gené ica lo p esen a la población Manchado de
Jabugo con espec o al es o de es i pes, incluso mayo a la obse ada en e
la aza Du oc y el es o de es i pes ibé icas.
Tabla 2. Valo es de los es adís icos F de W igh en e odas las poblaciones
po cinas es udiadas.
Tabla 1. Valo es de He e ocigosidad obse ada (Ho) y espe ada (He)y núme-
Conseje ía de Ag icul u a y Pesca
En la abla 3 se exponen los alo es, en e las poblaciones es udiadas, del
núme o de mig an es po gene ación (Nm). Cabe des aca que el mayo
alo de lujo gené ico encon ado ha sido en e las poblaciones Mamellado
ySil ela.
La ep esen ación, en un á bol con aíz, de las dis ancia de Reynolds
en e las poblaciones po cinas es udiadas (Figu a 1) mues a una cla a ag u-
pación de los animales en es g upos poblacionales.
Figu a 1. Cladog ama que ep esen a la ma iz de dis ancia de Reynolds
en e las es i pes del Ce do Ibé ico y el Du oc U ilizando un panel de 35 ma -
cado es mic osa éli es.
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MDJ
ALE
TOR
LAM
NDP
ENT
SIL
MAM
VIL
DUR
VAL
Po un lado se ag upan los animales de la aza Du oc, po o o los ani-
males pe enecien es a la población Manchado de Jabugo y po o o lado se
ag upan el es o de es i pes del Ce do Ibé ico. Es a di e enciación de la
población Manchado de Jabugo con espec o al es o de es i pes del Ce do
Ibé ico, ya ha sido cons a ada an e io men e en es udios ealizados con ADN
mi ocond ial, habiéndose encon ado haplo ipos de p ocedencia asiá ica que
no es án p esen es en las demás es i pes del Ce do Ibé ico (Al es
e al.
,
2003). Es as poblaciones, a su ez, se dis ibuyen en dos subg upos, po un
lado la población Neg o de los Ped oches y el es o de es i pes y líneas. Es
den o de es e úl imo subg upo donde se ap ecia una sepa ación de las
poblaciones de in luencia mayo i a ia de sang e Lampiña (Lampiño y
To biscal) de las es i pes con in luencia de sang e Re in a (Alen ejano,
Valdeseque a, Mamellado, Sil ela, En epelado y Villalón). Las poblaciones
Las azas au óc onas en la p oducción ex ensi a adicional
Sil ela, Mamellado y Villalón se ag upan conjun amen e den o de es e
g upo ya que p esen an un o igen común (Clemen e
e al.
,2006), y el
Valdeseque a p ocede de Sil ela. Finalmen e, el En epelado p ocede de c u-
zamien os, u ilizando el Re in o Ex emeño. (Clemen e
e al.
,2006).
Tabla 3. Ma iz de po cen ajes de FST (sob e la diagonal) y lujo gené ico
(Nm) (bajo la diagonal) en e las poblaciones Ibé ica y Du oc analizadas.
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CONCLUSIONES
La aza Du oc y la población Manchado de Jabugo se encuen an cla a-
men e di e enciadas an o en e sí, como del es o de las es i pes y líneas
del Ce do Ibé ico.
Las es i pes y líneas del Ce do Ibé ico cons i uyen un g upo bien de ini-
do mos ando, no obs an e, un ele ado ni el de di e enciación gené ica
en e ellas, lo que apoya la di e sidad in a- acial econocida.
AGRADECIMIENTOS
Es e abajo ha sido pa cialmen e inanciado g acias al con enio especí-
ico de colabo ación i mado en e la Conseje ía de Ag icul u a y Pesca de la
Jun a de Andalucía y la Uni e sidad de Có doba, a a és del g upo MERA-
GEM, pa a la ealización de un es udio genómico del Po cino Ibé ico que pe -
mi a la iden i icación de secuencias génicas dis in i as pa a la ca alogación,
ce i icación del o igen, azabilidad y con ol de calidad.

Conseje ía de Ag icul u a y Pesca
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
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