Estudio de las relaciones genéticas de las estirpes del cerdo ibérico mediante marcadores microsatélites

MICROSATÉLITES Memb illo A.1,Azo P.J.1,Clemen e I.1,Do ado G.2,Diéguez E.3, Gómez, J. 1,Jiménez A.1,San os E.1yMolina A.1 1G upo Me agem. Dp o de Gené ica. Facul ad de Ve e ina ia. Uni e sidad de Có doba. Edi . Mendel Pl. Baja. Campus de Rabanales. C a. N-IV, km 396ª. 14071 Có doba. SPAIN. E-mail: [email p o ec ed] 2Dp o de Bioquímica y Biología Molecula . Uni e sidad de Có doba. Edi . Se e o Ochoa. Campus de Rabanales. C a. N-IV, Km 396ª. 14071 Có doba. SPAIN 3Asociación Española de C iado es de Ganado Po cino Selec o Ibé ico Pu o y T onco Ibé ico. C/ San F ancisco, 51, 1º-D. 06300 Za a. Badajoz. SPAIN INTRODUCCIÓN El Ce do Ibé ico cons i uye la única aza po cina au óc ona de omen o de España incluida en el Ca álogo o icial de azas de ganado de España (RD 1682/1997). Es a aza p esen a una g an a iabilidad que se aduce en la p esencia de a ias es i pes den o de ella. Aunque exis en a ias es i pes del Ce do Ibé ico, ac ualmen e exis en 4 o icialmen e econocidas en el ca a- logo de azas (O den APA/53/2007) (En epelado, Neg o Lampiño, Re in o y To biscal). Has a el momen o, la base de la di e enciación de las es i pes se ha lle ado a cabo en base a ca ac e es mo ológicos y ane óp icos p inci- palmen e. Hoy día es a di e enciación puede se es udiada desde el pun o de is a gené ico u ilizando he amien as de gené ica molecula . Exis en a ios abajos en los que se ha demos ado que los ma cado es molecula- es de ipo mic osa éli e son una he amien a de g an alo pa a su uso en es udios de di e enciación gené ica de poblaciones de animales (Azo e al. , 2007, Ma ínez e al. ,2000). El obje i o de es e abajo ha sido pone de mani ies o las elaciones gené icas exis en es en e las di e en es es i pes y líneas econocidas adicionalmen e en el Ce do Ibé ico u ilizando ma cado- 393 ESTUDIO DE LAS RELACIONES GENÉTICAS DE LAS ESTIRPES DEL CERDO IBERICO MEDIANTE MARCADORES es mic osa éli es. Conseje ía de Ag icul u a y Pesca Palab as cla e: Ce do Ibé ico, es i pes, a iabilidad gené ica, mic osa- éli es, di e enciación gené ica. MATERIAL Y MÉTODOS Pa a es e es udio se han u ilizado 350 animales de la aza po cina ibé i- ca ep esen an es de las es i pes: En epelado, Neg o Lampiño, di e en es líneas de Re in o (Villalón, Sil ela, Valdeseque a y Mamellado), To biscal y o as como ce dos Alen ejanos, el Manchado de Jabugo y el Neg o de los Ped oches. Las mues as ue on sang e en e a ex aída del seno in ao bi a- io, u ilizando sis emas Vacu aine ® en ubos de 7 ml que con enían EDTAk3 como an icoagulan e. También se han omado mues as de 30 ani- males de la aza Du oc pa a su u ilización como e e encia y po su impo - ancia ya que se u iliza como aza pa en al en los c uzamien os que se lle- an a cabo en el ce do ibé ico de acue do a la No ma de Calidad (RD 1083/2001). La ex acción del ADN a pa i de las mues as se lle ó a cabo u ilizando la me odología de Mille e al. ,(1998) y diges ión con p o einasa K. Todos los animales ue on geno ipados pa a un o al de 35 ma cado es mic osa é- li es dis ibuidos po odo el genoma po cino en e los que se encuen an los 25 ecomendados po la FAO pa a es e ipo de es udios. Los ma cado es mic osa éli es ue on ampli icados median e PCR múl iple (Reacción en cadena de la Polime asa). Los agmen os ampli icados ue on comp obados en gel de aga osa al 2% y pos e io men e analizados en un secuenciado au omá ico capila ABI3730 de Applied Biosys ems. Los alelos ue on ipi i- cados con el so wa e GeneMappe 4.0.1. Pa a el cálculo de los es adís i- cos elacionados con la a iabilidad y di e enciación poblacional se ha usado el so wa e Gene ix 4.0.5. Pa a de e mina la p oximidad gené ica en e las di e en es poblaciones analizadas hemos calculado la ma iz de dis ancia de Reynolds (Reynolds e al. ,1983) y se ha ep esen ado u ilizando el algo i - mo Neigbou g Joining usando el so wa e Phylip 3.65. RESULTADOS Y DISCUSIÓN El núme o medio po locus po población ha oscilado en e 2,25 y 2,54 en las poblaciones Manchado de Jabugo y Villalón y 4,8 en la aza Du oc (Tabla 1). 394 Las azas au óc onas en la p oducción ex ensi a adicional o medio de alelos po locus en las poblaciones Ibé ica y Du oc analizadas. 395 Al calcula los alo es de las he e ocigosidades obse ada (Ho) y espe a- da (He) se comp ueba que de nue o las poblaciones Manchado de Jabugo yVillalón son las poblaciones que p esen an los meno es alo es, indica i o de una meno a iabilidad gené ica y po an o meno consanguinidad. Pa a es os pa áme os la población de Neg o de los Ped oches ha sido la pobla- ción que ha p esen ado los alo es más ele ados Cuando es udiamos los es adís icos F de W igh medios en e odas las poblaciones (Tabla 2) y en e odos los pa es de poblaciones (Tabla 3) obse amos que los alo es pa a el FST son muy ele ados, lo que indica que la p opo ción de la a iación debida a la di e encia en e poblaciones es muy ele ada (20%), mayo a la ob enida en e o as azas de animales domés i- cos, o lo que es lo mismo, que exis e una g an di e enciación en e ellas. El mayo ni el de di e enciación gené ica lo p esen a la población Manchado de Jabugo con espec o al es o de es i pes, incluso mayo a la obse ada en e la aza Du oc y el es o de es i pes ibé icas. Tabla 2. Valo es de los es adís icos F de W igh en e odas las poblaciones po cinas es udiadas. Tabla 1. Valo es de He e ocigosidad obse ada (Ho) y espe ada (He)y núme- Conseje ía de Ag icul u a y Pesca En la abla 3 se exponen los alo es, en e las poblaciones es udiadas, del núme o de mig an es po gene ación (Nm). Cabe des aca que el mayo alo de lujo gené ico encon ado ha sido en e las poblaciones Mamellado ySil ela. La ep esen ación, en un á bol con aíz, de las dis ancia de Reynolds en e las poblaciones po cinas es udiadas (Figu a 1) mues a una cla a ag u- pación de los animales en es g upos poblacionales. Figu a 1. Cladog ama que ep esen a la ma iz de dis ancia de Reynolds en e las es i pes del Ce do Ibé ico y el Du oc U ilizando un panel de 35 ma - cado es mic osa éli es. 396 MDJ ALE TOR LAM NDP ENT SIL MAM VIL DUR VAL Po un lado se ag upan los animales de la aza Du oc, po o o los ani- males pe enecien es a la población Manchado de Jabugo y po o o lado se ag upan el es o de es i pes del Ce do Ibé ico. Es a di e enciación de la población Manchado de Jabugo con espec o al es o de es i pes del Ce do Ibé ico, ya ha sido cons a ada an e io men e en es udios ealizados con ADN mi ocond ial, habiéndose encon ado haplo ipos de p ocedencia asiá ica que no es án p esen es en las demás es i pes del Ce do Ibé ico (Al es e al. , 2003). Es as poblaciones, a su ez, se dis ibuyen en dos subg upos, po un lado la población Neg o de los Ped oches y el es o de es i pes y líneas. Es den o de es e úl imo subg upo donde se ap ecia una sepa ación de las poblaciones de in luencia mayo i a ia de sang e Lampiña (Lampiño y To biscal) de las es i pes con in luencia de sang e Re in a (Alen ejano, Valdeseque a, Mamellado, Sil ela, En epelado y Villalón). Las poblaciones Las azas au óc onas en la p oducción ex ensi a adicional Sil ela, Mamellado y Villalón se ag upan conjun amen e den o de es e g upo ya que p esen an un o igen común (Clemen e e al. ,2006), y el Valdeseque a p ocede de Sil ela. Finalmen e, el En epelado p ocede de c u- zamien os, u ilizando el Re in o Ex emeño. (Clemen e e al. ,2006). Tabla 3. Ma iz de po cen ajes de FST (sob e la diagonal) y lujo gené ico (Nm) (bajo la diagonal) en e las poblaciones Ibé ica y Du oc analizadas. 397 CONCLUSIONES La aza Du oc y la población Manchado de Jabugo se encuen an cla a- men e di e enciadas an o en e sí, como del es o de las es i pes y líneas del Ce do Ibé ico. Las es i pes y líneas del Ce do Ibé ico cons i uyen un g upo bien de ini- do mos ando, no obs an e, un ele ado ni el de di e enciación gené ica en e ellas, lo que apoya la di e sidad in a- acial econocida. AGRADECIMIENTOS Es e abajo ha sido pa cialmen e inanciado g acias al con enio especí- ico de colabo ación i mado en e la Conseje ía de Ag icul u a y Pesca de la Jun a de Andalucía y la Uni e sidad de Có doba, a a és del g upo MERA- GEM, pa a la ealización de un es udio genómico del Po cino Ibé ico que pe - mi a la iden i icación de secuencias génicas dis in i as pa a la ca alogación, ce i icación del o igen, azabilidad y con ol de calidad. Conseje ía de Ag icul u a y Pesca REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS Al es E, Ó ilo C, Rod íguez MC & Silió L 2003 Mi ochond ial DNA sequence a ia ion and phylogene ic ela ionships among Ibe ian pigs and o he domes ic and wild pig popula ions. Animal Gene ics 34 319–324. Azo , P. J., Vale a, M., Gómez, M. D., Goyache, F. and Molina, A. (2007). Gene ic cha ac e iza ion o he Spanish T o e ho se b eed using mic o- sa elli e ma ke s. Gene ics and Molecula Biology. Vol. 30, 1, 37-42. Clemen e, I.; Memb illo, A.; Azo , P.J.; Do ado, G.; Rode o, A.; Molina, A. 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