Estructura de exones del gen DAZ/SPGY en Yg11 e identificación de su homólogo ancestral SPGYLA en el cromosoma 3
Zhi-Hong Shan
El Dr. Med.
Exón
estructura
del gen DAZ/SPGY en Yq11 e identificación de su antepasado
homólogo SPGYLA en el cromosoma 3
Nacido el 2 de mayo de 1962 en Teng Chong, provincia de Yunnan, P. R. China Examen Estatal de Selección Universitaria durante el 7-10 de julio de 1980 en Teng Chong, provincia de Yunnan, P. R. China M.D. Estudiante en el Colegio Médico Kunming de 1980 a 1985, Kunming, provincia de Yunnan, P. R. China; Licenciado: Licenciado en Ciencias de Medicina M. D. Estudiante (experiencia de investigación) en el Departamento de Obstetricia y Ginecología de 1985 a 1988, Kunming Medical College, provincia de Yunnan, P. R. China; Licenciado: Máster en Ciencias de Medicina Asistente en el Departamento de Obstetricia y Ginecología de 1988 a 1991, Kunming, provincia de Yunnan, P. R. China Profesor en AZ de Obstetricia y Ginecología de la provincia de Yunnan.
El objetivo se alcanzó mediante el análisis de la estructura de exón-intrón de DAZ/SPGY y la identificación de su gen ancestral SPGYLA en el brazo corto del cromosoma 3. Estos resultados se lograron de la siguiente manera.
El PCR con primers específicos de la parte N terminal de las secuencias DAZ y CT340 vinculadas a Y (cópia candidata de DAZ autosómica) identificó cinco grupos de clones de cDNA de la piscina de cDNA aislados por crosshybridization a SPGY1.
Se encontró que una estrategia de secuenciación de clonación basada en PCR es una manera eficiente de determinar la estructura de exones/intrones DAZ/SPGY y la identificación de sus secuencias límite esenciales para el análisis de mutaciones específicas de exones en los experimentos SSCP. Hay 10 exones DAZ/SPGY de diferentes longitudes (exón 1: 270 bp; exón 2: 147 bp; exón 3: 92 bp; exón 4: 52 bp; exón 5: 64 bp; exón 6: 140 bp; exón 7: n x 72 bp; exón 8: 35 bp; exón 9: 99 bp; exón 10: 917 bp) interrumpidos por 9 intrones (in intrón 1: kb; intrón 2: 300 bp; 7-8 intrón 3: 600 bp; intrón 4: 500 bp; 5: 500 bp; 6: 89 bp; intrón 6: 8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 7,8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb: 4,8 kb; intrón: 4,8 kb: 4,8 kb: 7, y intrón: 4,8 kb: 4,8 kb: 4, y intrón: 4,8 kb: 4, y intrón: 4,8 kb: 4, y intrón: 4,8 kb: 4, y el intrón: 4,8 kb: 4, y el intrón es la última copia de intrón de intrón de intrón de intrón de intrón:
La copia autosómica DAZ/SPGY fue identificada mediante análisis de secuencia del CT340.
CT355 es la única secuencia de longitud completa (2921 bp) que contiene un marco de lectura abierto completo que codifica una proteína de unión de ARN con 289 aminoácidos. CT355 fue mapeado al brazo corto del cromosoma 3 por experimentos de FISH y fue designado como SPGYLA (SPGY ike-utosomal). La localización cromosómica fue confirmada por PCR con CT355 primers específicos en muestras de ADN genómico de un panel de células híbridas hámster-humano que contienen diferentes conjuntos de cromosomas humanos. Al igual que DAZ/SPGY, se encontró que SPGYLA se expresa específicamente en los testículos humanos.
El resultado más intrigante parece ser que la secuencia de codificación de SPGYLA es más homóloga a la del gen homólogo del ratón Dazla que a la del gen homólogo humano Y cromosómico DAZ/SPGY. SPGYLA, al igual que el gen del ratón Dazla, contiene solo una unidad de exón 7 de 72 bp. Además, SPGYLA contiene una región de secuencia de 130 bp (caja CTA) presente en Dazla pero no en DAZ/SPGY. La estructura de secuencia de SPGYLA también se encontró en la boule del gen Drosophila. Estos indican que SPGYLA es altamente conservada, y sugieren que SPGYLA tiene una función en la espermatogénesis humana similar a la de Dazla en la spermatogénesis del ratón o la de la boule en la Drosoflia spermatogénesis.
Experimentos de manchas en el zoológico
el uso de muestras genómicas de ADN de diferentes mamíferos indicó que el
El locus del gen DAZ/SPGY en el cromosoma Y humano puede haberse translocado por primera vez desde su posición genómica autosómica SPGYLA antepasada durante la evolución de los primates. Se estimó que el rango de tiempo de este evento de translocación fue de alrededor de 35-50 millones de años atrás, después de la divergencia de platyrrhini (monos del nuevo mundo) y antes de la divergencia de catarrhini (monos del viejo mundo). Por lo tanto, se puede especular que el gen DAZ/SPGY tiene una función de espermatogénesis específica de los primates diferente a la de SPGYLA, pero muy probablemente interactuando con ella.
El análisis genómico inicial de la unidad de secuencia de caja de CTA en SPGYLA reveló que contiene el 3′ extremo del exón 8 de SPGYLA (16 bp). Los primeros 35 nucleótidos de este exón son homólogos al exón 8 del gen DAZ/SPGY. Consecuentemente, el exón 8 de SPGYLA es de 16 nucleótidos más largos que el exón 8 de DAZ/SPGY.
Los otros 114 bp de la caja de CTA fueron identificados como un exón único de SPGYLA (exón 9). El exón 9 de DAZ/SPGY se convierte en exón 10 de SPGYLA y el exón 10 de DAZ/SPGY representa el exón 11 de SPGYLA. Se realizaron experimentos SSCP para buscar mutaciones puntuales en los exones 1, 2 y 4 de DAZ/SPGY en 70 pacientes y en el exón 9 del gen SPGYLA en 150 pacientes. Estos casos fueron seleccionados para un cariotipo normal y la ausencia de microdelaciones en Yq11.