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A iniciativa COAR Notify: promovendo a interoperabilidade e a inovação para uma ciência aberta sustentável e equitativa

Abstract

A Iniciativa COAR Notify está a desenvolver e promover a adoção de uma abordagem normalizada, interoperável e descentralizada para interligar os resultados da investigação alojados na rede distribuída de repositórios com outros recursos e serviços externos. O protocolo COAR Notify baseia-se nas normas W3C Linked Data Notifications e ActivityStreams2, facilitando a interação entre os repositórios e os serviços que implementam o protocolo. O foco inicial do desenvolvimento tem sido a ligação de recursos de repositórios com revisões por pares externas alojadas por revistas overlay e serviços de revisão por pares aberta, mas há outros casos de uso que são de interesse para a comunidade. A iniciativa recebeu, em julho de 2022, financiamento da Arcadia (fundo beneficente de Lisbet Rausing e Peter Baldwin) para um projeto que está a permitir investir no desenvolvimento da funcionalidade Notify em plataformas e serviços parceiros, com o objetivo de ser adotado em plataformas de código aberto, para que muitos repositórios possam fazer uso do protocolo. Esta comunicação enquadrará a iniciativa no atual contexto da ciência aberta, apresentará informação atualizada sobre os progressos realizados até ao presente pela Iniciativa COAR Notify e fornecerá informação sobre os desenvolvimentos previstos nos próximos tempos.

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A iniciativa COAR Notify: promovendo a interoperabilidade e a inovação para uma ciência aberta sustentável e equitativa

Author: Rodrigues, Eloy; Shearer, Kathleen; Klein, Martin; Walk, Paul; Nakano, Tamy
Publisher: Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
Year: 2023
DOI: 10.21680/2447-7842.2023v9n2ID33934
Source: https://repositorium.uminho.pt/bitstreams/9b64c7f6-a5e7-4703-b8da-2942aad06351/download
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__________________________________________________________________________________
Comunicação
DOI : 10.21680/2447-7842.2023 9n2ID33934
A inicia i a COAR No i y: p omo endo a in e ope abilidade e a ino ação pa a
uma ciência abe a sus en á el e equi a i a
The COAR No i y ini ia i e: p omo ing in e ope abili y and inno a ion o a
sus ainable and equi able open science
Eloy Rod igues 1
Ka hleen Shea e 2
Ma in Klein 3
Paul Walk 4
Tamy Nakano 5
Subme ido em: 17/04/2023
Ap o ado na Con OA: 14/06/2023
Publicado em: 25/11/2023
Resumo: A Inicia i a COAR No i y es á a desen ol e e p omo e a adoção de uma
abo dagem no malizada, in e ope á el e descen alizada pa a in e liga os
esul ados da in es igação alojados na ede dis ibuída de eposi ó ios com ou os
ecu sos e se iços ex e nos. O p o ocolo COAR No i y baseia-se nas no mas W3C
Linked Da a No i ica ions e Ac i i yS eams2, acili ando a in e ação en e os
eposi ó ios e os se iços que implemen am o p o ocolo. O oco inicial do
desen ol imen o em sido a ligação de ecu sos de eposi ó ios com e isões po
pa es ex e nas alojadas po e is as o e lay e se iços de e isão po pa es abe a,
mas há ou os casos de uso que são de in e esse pa a a comunidade. A inicia i a
ecebeu, em julho de 2022, inanciamen o da A cadia ( undo bene icen e de Lisbe
5Con ede a ion o Open Access Reposi o ies
4An lea
3Los Alamos Na ional Labo a o y
2Con ede a ion o Open Access Reposi o ies
1Uni e sidade do Minho
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Rausing e Pe e Baldwin) pa a um p oje o que es á a pe mi i in es i no
desen ol imen o da uncionalidade No i y em pla a o mas e se iços pa cei os, com
o obje i o de se ado ado em pla a o mas de código abe o, pa a que mui os
eposi ó ios possam aze uso do p o ocolo. Es a comunicação enquad a á a
inicia i a no a ual con ex o da ciência abe a, ap esen a á in o mação a ualizada
sob e os p og essos ealizados a é ao p esen e pela Inicia i a COAR No i y e
o nece á in o mação sob e os desen ol imen os p e is os nos p óximos empos.
Pala as-cha e: eposi ó ios da p óxima ge ação; in e ope abilidade; sis ema de
comunicação cien í ica; ino ação.
Abs ac : The COAR No i y Ini ia i e is de eloping and p omo ing he adop ion o a
s anda dized, in e ope able and decen alized app oach o linking esea ch esul s
hos ed in he dis ibu ed ne wo k o eposi o ies wi h o he ex e nal esou ces and
se ices. The COAR No i y p o ocol is based on he W3C Linked Da a No i ica ions
and Ac i i yS eams2 s anda ds, acili a ing in e ac ion be ween eposi o ies and
se ices ha implemen he p o ocol. The ini ial ocus o de elopmen has been on
linking eposi o y esou ces wi h ex e nal pee e iews hos ed by o e lay jou nals
and open pee e iew se ices, bu he e a e o he use cases ha a e o in e es o
he communi y. In July 2022, he ini ia i e ecei ed unding om A cadia (Lisbe
Rausing and Pe e Baldwin's cha i able us ) o a p ojec which is enabling
in es men in he de elopmen o No i y unc ionali y on pa ne pla o ms and
se ices, wi h he aim o i being adop ed on opensou ce pla o ms so ha many
eposi o ies can make use o he p o ocol. This communica ion will ame he ini ia i e
in he cu en con ex o open science, p esen up- o-da e in o ma ion on he
p og ess made o da e by he COAR No i y Ini ia i e and p o ide in o ma ion on he
de elopmen s planned o he nea u u e.
Keywo ds: nex gene a ion eposi o ies; in e ope abili y; schola ly communica ion
sys em; inno a ion.
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1 INTRODUÇÃO
A ciência abe a em um eno me po encial ans o mado , es abelecendo um
no o pa adigma de in es igação, no qual odos os in es igado es pa ilham e êm
acesso sem p eceden es a odo o co pus de in es igação pa a análise, ex ação de
ex o e dados, e ou os mé odos de in es igação ino ado es. Mas, pa a que es a
isão e es e po encial se conc e izem, de o ma sus en á el e equi a i a, não bas a
simplesmen e al e a os modelos de negócio, e ans o ma o pagamen o de
assina u as em pagamen o de axas de publicação. É necessá io in oduzi
ino ações nos p ocessos e e amen as de publicação e disseminação dos
esul ados de in es igação, ap o ei ando in eg almen e as possibilidades o e ecidas
pelo ambien e digi al (In e na ional Science Council, 2021) e, simul aneamen e,
e omando o con olo do sis ema de comunicação académica pela comunidade
cien í ica e as suas ins i uições.
Pa a es e im, a exis ência de uma ede o e e uncional de eposi ó ios,
capaz de assegu a o depósi o, acesso (humano e às máquinas) e p ese ação de
oda a gama de esul ados de in es igação é indispensá el. Pa a além de apoia a
mui o necessá ia bibliodi e sidade, uma ez que ecolhem di e sos ipos de
con eúdos, em di e en es domínios e línguas, os eposi ó ios podem desempenha
um papel undamen al pa a p omo e a ino ação e sus en abilidade na
comunicação cien í ica.
Nos úl imos anos, e em pa icula du an e a pandemia da COVID-19,
aumen ou a u ilização e a isibilidade de no as p á icas, modelos e pla a o mas de
comunicação cien í ica. O c escimen o da publicação de p ep in s, a adoção de
di e sas p á icas de e isão po pa es abe a (Ross-Hellaue , 2017) con e gi am no
es abelecimen o de um modelo ino ado de publicação, e e ido como
Publica -Re e -Cuida (Publish-Re iew-Cu a e), no qual os au o es de em começa
po disponibiliza um p ep in do seu a igo num eposi ó io (ou se ido de p ep in s)
de acesso abe o, pa a que es e possa se conside ado pa a e isão po pa es
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(abe a) e e en ual publicação em e is as adicionais, ou o e lay6. Es e modelo em
indo a se ado ado po di e sos a o es ele an es, como a e is a eLi e, que o
ado ou a pa i de julho de 2021 (Eisen e al., 2020), ou a pla a o ma de publicação
da Comissão Eu opeia, Open Resea ch Eu ope7.
Embo a exis a uma longa adição de pa ilha de p ep in s em alguns
domínios (Chia elli, Johnson, Pin ield, & Richens, 2019), como a ísica, es a p á ica
es á ago a a começa a se adop ada nou as disciplinas, em especial nas ciências
da ida, em g ande pa e de ido à pandemia de COVID-19. A es e ac o ac esce um
núme o c escen e de se iços abe os de e isão po pa es que acili am a e isão,
alidação e ecomendação de p ep in s po comunidades de in es igado es, de que
são exemplo, en e mui os ou os, o Pee Communi y In (PCI)8, ao qual di e sas
e is as con iam o seu p ocesso de e isão po pa es, ou o PRE e iew9.
Es es desen ol imen os es ão a lança as bases pa a um sis ema mais
e icien e, e icaz e abe o, em que os p ep in s são pa ilhados apidamen e a a és
de um eposi ó io, sendo depois e is os, con olados e ce i icados po se iços
ex e nos de e isão po pa es ou e is as o e lay, cujo núme o em indo a c esce ,
ainda que len amen e (Rousi & Laakso, 2022). Es es modelos al e na i os às
e is as adicionais o am ambém econhecidos pela cOALi ion S, em Julho de
2022, que anunciou que os a igos académicos que sejam sujei os a um p ocesso de
e isão po pa es independen e de uma e is a, com alidação implíci a ou explíci a,
são conside ados de mé i o equi alen e ao de um a igo publicado numa e is a
adicional10.
Um dos desa ios des e modelo é o ac o de se basea em dois se iços
dis in os que podem não e uma elação p eexis en e en e si. Po exemplo, o
a Xi 11, o g ande eposi ó io de p ep in s pa a ísica, ma emá ica e ciências
11 h ps://a xi .o g/
10 cOAli ion S - S a emen on pee e iewed publica ions -
h ps://www.coali ion-s.o g/s a emen -on-pee - e iewed-publica ions/
9h ps://p e e iew.o g/
8h ps://pee communi yin.o g/
7h ps://open- esea ch-eu ope.ec.eu opa.eu/
6Re is as que “publicam” con eúdos o iginalmen e c iados e disponí eis em pla a o mas - como
eposi ó ios ou se ido es de p ep in s - di e en es daquela em que o p ocesso edi o ial, de
ce i icação e con ole de qualidade é ealizado.
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in o má icas, é usado po dezenas de e is as o e lay que analisam e ap o am os
p ep in s con idos no eposi ó io. Mas não há ligações écnicas en e es as e is as e
o a Xi , nem exis em mecanismos pa a apoia a in e ação di e a en e os sis emas.
Como esul ado, o a Xi não em conhecimen o de que um de e minado p ep in é
ap o ado po uma des as e is as e não pode encaminha os u ilizado es pa a a
e isão po pa es ou pa a a ap o ação da e is a. O bioRxi 12, ou o eposi ó io de
p ep in s, em abalhado di e amen e com alguns se iços abe os de e isão po
pa es (PRE e iew e eLi e), mas pa a cada se iço oi necessá io negocia uma
o ma única e pe sonalizada de colabo ação.
Pa a acili a a adoção, de um modo mais amplo, des es no os modelos é
necessá io p omo e a in e ope abilidade, e a comunicação no malizada e
simpli icada, en e os di e en es eposi ó ios e se iços, e i ando a c iação de silos
ou a necessidade de negocia a in e ação se iço a se iço. E esse é p ecisamen e
o obje i o da Inicia i a COAR No i y.
2 A INICIATIVA COAR NOTIFY
A Inicia i a COAR No i y es á a desen ol e e a acele a a adoção pela
comunidade de uma abo dagem pad ão, in e ope á el e descen alizada pa a
in e liga os esul ados de in es igação alojados na ede dis ibuída de eposi ó ios
com ou os ecu sos ex e nos p oduzidos po se iços de e isão po pa es ou
e is as o e lay.
A COAR No i y baseia-se em á ios anos de abalho an e io da COAR
(Con ede a ion o Open Access Reposi o ies), desde a Nex Gene a ion Reposi o ies
- que iden i icou uncionalidades essenciais pa a a p óxima ge ação de eposi ó ios,
bem como as a qui ec u as e ecnologias necessá ias pa a as implemen a e
desen ol eu ecomendações sob e como os eposi ó ios pode iam se
in e ope á eis en e si e com ou os ipos de se iços e pla a o mas (Rod igues e al.,
2017) - e pos e io men e o concei o de uma es u u a de se iços de publicação
abe a designada Pub ai (Ross-Hellaue , Feche , Shea e , & Rod igues, 2019). Com
12 h ps://www.bio xi .o g/
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base nesse abalho, oi p opos a e deba ida em 2020 uma a qui e u a écnica pa a
liga os eposi ó ios a ou os se iços, que se o nou o alice ce écnico pa a a
inicia i a COAR No i y, lançada em janei o de 2021.
Em julho de 2022, a COAR ecebeu um inanciamen o da A cadia13 (uma
undação que abalha pa a p o ege a na u eza, p ese a o pa imónio cul u al e
p omo e o acesso abe o ao conhecimen o) pa a acele a o desen ol imen o do
p o ocolo COAR No i y e apoia a sua aplicação em di e en es cená ios e casos de
u ilização.
O p incipal caso de uso da Inicia i a COAR No i y é a ligação en e a igos em
di e en es eposi ó ios com e isões po pa es e ap o ações/ ecomendações
(endo smen s) de se iços ex e nos. Em pa icula , es á a se desen ol ido um
p o ocolo comum que de ine a na u eza e o ipo de no i icações que pe mi i ão aos
se iços pa icipan es " ala a mesma língua" quando ocam in o mações sob e um
p ocesso de e isão po pa es. A imagem abaixo ap esen a um exemplo simples de
como o COAR No i y é aplicado pa a apoia o luxo de abalho de e isão po pa es
num eposi ó io e num se iço de e isão po pa es.
Figu a 1 – Rep esen ação simpli icada de um wo k low COAR No i y
Fon e: Elabo ada pelos au o es (2023).
13 h ps://www.a cadia und.o g.uk/
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A Inicia i a COAR No i y es á a desen ol e -se no momen o ce o pois, como
e e imos a ás, se á um acili ado c í ico pa a o p og esso de uma sé ie de no as
endências no pano ama da comunicação cien í ica. O p o ocolo COAR No i y pode
se u ilizado pa a acili a as comunicações en e o au o (a a és de um eposi ó io
ou se ido de p ep in s compa í el), um se iço de e isão po pa es, e um edi o
pa a apoia uma g ande a iedade de cená ios.
Alguns dos cená ios iden i icados e que es ão a se implemen ados po
di e sos pa cei os incluem:
1. Pedido de
a. e isão,
b. ou ap o ação/endosso
c. ou publicação
iniciados pelos au o es
a. nos eposi ó ios, ou
b. nos se iços de e isão e e is as o e lay;
2. Anúncio de
a. e isão,
b. ap o ação/endosso
c. ou publicação
pelo se iço de e isão ou e is a o e lay
a. ao eposi ó io
b. ou se iço ag egado
O p o ocolo COAR No i y consis e em con enções comuni á ias
documen adas pa a a u ilização de Linked Da a No i ica ions (LDN) do W3C pa a a
in eg ação de sis emas de eposi ó io com se iços ele an es. O p o ocolo
especi ica:
- Pad ões de No i icação (modelos), que desc e em o payload pa a
no i icações eu ilizá eis, com base na no ma W3C Ac i i yS eams 2. Os
pad ões de no i icação da No i y são implemen ações mais especí icas dos
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pad ões gené icos desc i os em E en No i ica ions in Value-Adding
Ne wo ks14, desc e em as no i icações indi iduais de linked da a en iadas
en e eposi ó ios e se iços, uma ou mais das quais podem se u ilizadas
num cená io. Uma dada no i icação é de inida no con ex o de um cená io, e
u iliza um pad ão.
- Um ocabulá io, que é u ilizado pa a o nece alo es pa a de e minadas
p op iedades nos payload das no i icações.
- Cená ios que desc e em um caso exempli ica i o de ope ação (de um ou
mais dos casos de uso ambém iden i icados no websi e do p o ocolo),
en ol endo no malmen e um sis ema de eposi ó io e um ou o se iço. Es as
ope ações são ac i adas pelo in e câmbio de no i icações.
Toda a documen ação écnica do p o ocolo comum,que es á a se
desen ol ido pa a se "cola écnica" pa a pe mi i uma in e ope abilidade ala gada
en e eposi ó ios e ou os se iços, es á disponí el no websi e do p o ocolo15.
Embo a o oco inicial da inicia i a seja a ligação en e os ecu sos exis en es
em eposi ó ios com e isões po pa es em ou os se iços, es ão ambém a se
in es igados e desen ol idos uma sé ie de ou os casos de uso, incluindo a ligação
en e a igos e conjun os de dados de in es igação em eposi ó ios dis ibuídos, ou
en e os ecu sos dos eposi ó ios e sis emas de ges ão e ce i icação de in o mação
cien í ica.
3 O PROGRESSO REALIZADO NO PRIMEIRO ANO DO PROJETO
Desde que os abalhos inanciados pela A cadia começa am, em Julho de
2022, egis a am-se p og essos signi ica i os em di e sas en es. Uma g ande pa e
do o çamen o do COAR No i y es á a se dis ibuído aos nossos pa cei os de
implemen ação, pa a que es es e ec uem os desen ol imen os necessá ios à
u ilização do COAR No i y.
15 h ps://no i y.coa - eposi o ies.o g/
14 h ps://www.e en no i ica ions.ne /
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Os pa cei os com a implemen ação mais a ançada são Pee Communi y In
(PCI) e o eposi ó io HAL ( eposi ó io nacional ancês)16. O COAR No i y já es á a
se u ilizado po es es se iços pa a oca mensagens elacionadas com a e isão
po pa es de manusc i os deposi ados no HAL, na Pee Communi y In (PCI) e
Episciences17 (pla a o ma de e is as o e lay). As ês pla a o mas implemen a am
uma caixa de en ada/saída (inbox/ou box) No i y e es ão a ealiza o
desen ol imen o necessá io pa a supo a o COAR No i y nos seus luxos de
abalho exis en es.
Ou o desen ol imen o em cu so es á a se ealizado pela eLi e, o PRE e iew
e á ios se ido es de p ep in s. Nes e cená io, o p o ocolo COAR No i y se á
u ilizado pa a pe mi i ligações en e (1) á ios eposi ó ios de p ep in s (bioRxi ,
medRxi 18, e SciELO P ep in s19), (2) a pla a o ma de e isão de p ep in s,
PRE e iew, (3) as e is as eLi e, e (4) o se iço de ag egação e cu ado ia, Scie y20.
O desen ol imen o écnico já começou e as p imei as implemen ações uncionais do
COAR No i y nes es sis emas es ão p e is as pa a se emb o de 2023.
Em Po ugal, a Uni e sidade do Minho es á a abalha na implemen ação do
COAR No i y nos seus p óp ios sis emas, mas ambém na pe spe i a de ealiza
pilo os a ní el nacional no âmbi o do RCAAP21, pa a pe mi i que á ios se iços
ins i ucionais e nacionais in e ope em e comuniquem en e si. Há ês ipos de
se iços en ol idos nes e caso de uso - eposi ó ios ins i ucionais, alojados
localmen e (como o Reposi ó iUM22 da UMinho) ou na pla a o ma nacional de
alojamen o de eposi ó ios; e is as po uguesas de edi o as académicas (como a
UMinho Edi o a23) ou da pla a o ma nacional de alojamen o de e is as; e
eposi ó ios de dados ( an o a ní el ins i ucional como nacional). O COAR No i y se á
u ilizado pa a liga os manusc i os nos eposi ó ios po ugueses com as espe i as
e isões ou ap o ações/endossos em e is as nacionais (e ou os se iços
23 h ps://edi o a.uminho.p /p
22 h ps:// eposi o ium.sdum.uminho.p /
21 h ps://www. caap.p /
20 h ps://scie y.o g/
19 h ps://p ep in s.scielo.o g/
18 h ps://www.med xi .o g/
17 h ps://www.episciences.o g/
16 h ps://hal.science/
Na al, . 9, n. 2, p. 159 – 171, 2023.