2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
Madani: Ju nal Ilmiah Mul idisiplin
Volume 3, Nomo 8, Sep embe 2025, P. 35-42
E-ISSN: 2986-6340
Licenced by CC BY-SA 4.0
DOI: h ps://doi.o g/10.5281/zenodo.17283347
Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa Alkaloid Dalam Inhibisi Enzim
Ase ilkoline ase Melalui Pendeka an In Silico Un uk Te api Alzheime
Hilma T i Annisa1, Sae ul Amin2
P og am S udi Fa masi, Fakul as Fa masi, Uni e si as Bak i Tunas Husada Tasikmalaya
e-mail : sae ulamin@uni e si as-b h.ac.id, [email p o ec ed]m
Abs ak
Penyaki Alzheime me upakan salah sa u gangguan neu odegene a i u ama yang di andai dengan penu unan
ungsi kogni i , memo i, dan pe ubahan pe ilaku p og esi . Pendeka an e apeu ik yang elah lama digunakan
adalah penghamba an enzim ase ilkolines e ase (AChE) un uk mempe ahankan kada ase ilkolin di celah
sinap ik. Senyawa alkaloid banyak di emukan dalam umbuhan oba adisional dan dike ahui memiliki po ensi
sebagai inhibi o AChE. Sei ing dengan be kembangnya eknologi, me ode in silico sepe i molecula docking,
molecula dynamics (MD), densi y unc ional heo y (DFT), se a p ediksi ADMET digunakan un uk
menge aluasi in e aksi molekul seca a e isien sebelum uji in i o maupun in i o. Peneli ian ini be ujuan un uk
mengulas po ensi alkaloid dalam menghamba AChE dengan pendeka an in silico sebagai al e na i e api
Alzheime . Me ode kajian dilakukan melalui li e a u e e iew sis ema is pada basis da a PubMed, ScienceDi ec ,
Resea chGa e, dan Google Schola dengan ka a kunci e s uk u , en ang ahun 2015–2025. Da i 15 a ikel yang
e iden i ikasi, 10 memenuhi ahap sk ining, dan 5 a ikel lolos k i e ia eligibili as. Hasil kajian menunjukkan
bahwa bebe apa alkaloid u ama sepe i be be ine, palma ine, hupe zine A, dan bi la anone memiliki sko binding
a ini y yang sebanding a au lebih baik dibanding ligan s anda , se a memben uk ika an hid ogen dan in e aksi
hid o obik s abil pada ca aly ic ac i e si e (CAS) dan pe iphe al anionic si e (PAS) enzim AChE. S udi oleh Qi
e al. (2022) dan Rawa e al. (2024) menegaskan e ek i i as alkaloid dengan alidasi in i o, sedangkan Guo e
al. (2020) dan Neg u e al. (2025) menunjukkan p ediksi ADMET yang mendukung p o il a makokine iknya.
Kajian ini menyimpulkan bahwa senyawa alkaloid be po ensi kua sebagai kandida e api Alzheime melalui
penghamba an AChE, semen a a pendeka an in silico be kon ibusi dalam mempe cepa penapisan molekul ak i
dan e isiensi pengembangan oba .
Ka a Kunci: Alzheime , Ase ilkolines e ase, Alkaloid, In silico, Inhibi o
Abs ac
Alzheime ’s disease is a majo neu odegene a i e diso de cha ac e ized by p og essi e cogni i e decline,
memo y loss, and beha io al impai men . A he apeu ic app oach widely employed is he inhibi ion o
ace ylcholines e ase (AChE) o sus ain ace ylcholine le els in he synap ic cle . Alkaloids, abundan ly ound in
medicinal plan s, ha e demons a ed p omising ac i i y as AChE inhibi o s. Wi h ad ances in compu a ional
echniques, in silico me hods including molecula docking, molecula dynamics (MD), densi y unc ional heo y
(DFT), and ADMET p edic ion a e inc easingly used o e alua e molecula in e ac ions e icien ly p io o in
i o o in i o alida ion. This s udy aims o e iew he po en ial o alkaloids in inhibi ing AChE h ough in silico
app oaches o Alzheime ’s he apy. A sys ema ic li e a u e e iew was conduc ed using PubMed, ScienceDi ec ,
Resea chGa e, and Google Schola wi h s uc u ed keywo ds, co e ing publica ions om 2015 o 2025. Ou o
15 iden i ied s udies, 10 we e sc eened, and 5 me eligibili y c i e ia. The indings indica e ha key alkaloids such
as be be ine, palma ine, hupe zine A, and bi la anone exhibi ed binding a ini ies compa able o o g ea e han
s anda d ligands, wi h s able hyd ogen bonding and hyd ophobic in e ac ions a he ca aly ic ac i e si e (CAS)
and pe iphe al anionic si e (PAS) o AChE. S udies by Qi e al. (2022) and Rawa e al. (2024) con i med hese
esul s h ough in i o alida ion, while Guo e al. (2020) and Neg u e al. (2025) epo ed a o able ADMET
p o iles suppo ing hei pha macokine ic easibili y. In conclusion, alkaloids ep esen s ong candida es o
Alzheime ’s he apy ia AChE inhibi ion, and in silico s a egies play a pi o al ole in accele a ing ac i e
compound sc eening and d ug de elopmen e iciency.
Keywo ds: Alzheime ’s disease, Ace ylcholines e ase, Alkaloids, In silico, Inhibi o s
A icle In o
Recei ed da e: 30 Augus 2025 Re ised da e: 17 Sep embe 2025 Accep ed da e: 2 Ok obe 2025
2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
PENDAHULUAN
Penyaki Alzheime (AD) me upakan gangguan neu odegene a i p og esi yang menjadi
penyebab u ama demensia, memenga uhi lebih da i 55 ju a o ang di dunia dan dipe ki akan meningka
dua kali lipa se iap dua dekade (WHO,2022) . Penyaki ini di andai oleh penu unan ungsi kogni i ,
gangguan memo i, dan pe ubahan pe ilaku yang semakin membu uk sei ing wak u. Seca a
neu opa ologis, Alzheime (AD) be hubungan dengan akumulasi plak β-amiloid, pemben ukan
neu o ib illa y angles , dis ungsi sinaps, dan degene asi neu on koline gik pada ko eks dan
hipokampu (Colo ic e al., 2013). Kompleksi as mekanisme pa ologi Alzheime (AD) menyebabkan
e api ku a i masih belum e sedia, sehingga upaya pengoba an dia ahkan pada mempe lamba p og esi
penyaki dan meningka kan kuali as hidup pasien.
Pendeka an a mako e api yang paling banyak digunakan saa ini adalah dengan meningka kan
kada ase ilkolin (AChE) di celah sinap ik melalui penghamba an enzim ase ilkolines e ase (AChE),
yang be pe an dalam deg adasi ACh menjadi kolin dan ase a (K yge e al., 1999). Inhibi o AChE
sepe i donepezil, i as igmine, dan galan amine e buk i mempe baiki gejala kogni i , namun
ke e ba asan sepe i e ek samping gas oin es inal, hepa o oksisi as, se a ke e ba asan pene asi ke
blood–b ain ba ie (BBB) masih menjadi an angan klinis (K yge e al., 1999) (Be ko e al., 2022).
Oleh ka ena i u, pengembangan kandida ba u dengan p o il keamanan dan a makokine ik yang lebih
baik sanga dibu uhkan.
Senyawa alkaloid me upakan kelompok me aboli sekunde dengan s uk u he e osiklik yang
kaya akan ni ogen dan dikenal memiliki bioak i i as be agam, e masuk ak i i as sebagai inhibi o
AChE. Galan amine, alkaloid yang be asal da i anaman kelua ga Ama yllidaceae, me upakan con oh
sukses yang elah digunakan sebagai oba lini pe ama pada e api Alzheime (AD) (Be ko e al.,
2022).. Peneli ian e ba u menunjukkan bahwa be bagai alkaloid lain, sepe i be be ine, palma ine,
cop isine, dan hupe zine A, memiliki po ensi menghamba AChE baik seca a in i o maupun in silico
dengan ene gi pengika an yang kompe i i e hadap inhibi o s anda (da Sil a Mesqui a e al., 2022).
S udi oleh Hylo oceus (2022) melapo kan bahwa de i a isoquinoline menunjukkan nilai docking −9,0
kcal/mol dan dip ediksi memiliki penye apan usus yang baik dan kemampuan menembus BBB.
Temuan ini mengua kan pen ingnya eksplo asi lebih lanju e hadap alkaloid sebagai kandida inhibi o
AChE.
Dalam e a penemuan oba mode n, pendeka an in silico menjadi komponen kunci ka ena
memungkinkan analisis in e aksi molekul- a ge seca a cepa dan hema biaya. Teknik sepe i
molecula docking, molecula dynamics (MD), quan i a i e s uc u e–ac i i y ela ionship (QSAR),
densi y unc ional heo y (DFT), dan p ediksi ADME/Tox digunakan un uk menya ing senyawa
po ensial, menilai a ini as ika an, s abili as kompleks ligan-enzim, se a menge aluasi p o il
a makokine ik dan oksisi as sebelum diuji seca a ekspe imen al (K yge e al., 1999). Misalnya, s udi
oleh Rawa e al. (2024) menemukan dua senyawa bi la anone dengan ene gi ika an −130,39 kcal/mol
dan kes abilan inggi pada simulasi MD 100 ns, menunjukkan po ensi sebagai inhibi o AChE yang
lebih baik da i ligan pembanding (K yge e al., 1999). S a egi ini idak hanya mempe cepa p oses
penemuan oba , e api juga meningka kan kemungkinan kebe hasilan kandida pada ahap p a-klinik.
Sejumlah peneli ian elah menunjukkan bahwa pendeka an in silico menjadi s a egi pen ing
dalam kimia medisinal un uk memahami in e aksi molekule an a a senyawa alam dengan a ge enzim
e en u. Amin e al. (2024) menegaskan bahwa molecula docking mampu mempe cepa p oses d ug
disco e y ka ena dapa memp ediksi a ini as ligan e hadap esep o dengan aku asi inggi sebelum
dilakukan uji ekspe imen al. Hal ini juga dipe kua oleh s udi Amin e al. (2025) yang menggunakan
la onoid sebagai kandida imunomodula o melalui docking dan analisis ADME, sehingga
membuk ikan bahwa me ode kompu asi ini dapa diaplikasikan lin as bidang penyaki .
Meliha banyaknya peneli ian yang menge aluasi alkaloid sebagai inhibi o AChE dengan
pendeka an in silico, dipe lukan sebuah elaah li e a u yang komp ehensi un uk me angkum da a yang
ada, menyo o i en e ba u, se a mengiden i ikasi kesenjangan peneli ian yang masih e buka. Oleh
ka ena i u, a ikel ini be ujuan un uk mengulas pe an senyawa alkaloid dalam menghamba AChE
melalui pendeka an in silico, dengan okus pada hasil docking, simulasi dinamika molekule , p ediksi
ADME/Tox, se a implikasinya dalam pengembangan e api Alzheime (AD) yang lebih selek i , e ek i ,
dan aman.
2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
METODE
Me ode yang digunakan dalam peneli ian ini adalah li e a u e e iew dengan pendeka an
sis ema is. Penca ian li e a u dilakukan seca a da ing melalui bebe apa basis da a in e nasional
be epu asi, yai u PubMed, ScienceDi ec , Resea chGa e, dan Google Schola . A ikel yang digunakan
dalam elaah ini di e bi kan pada en ang wak u 2015–2025. P oses penca ian dilakukan menggunakan
ka a kunci e s uk u dengan kombinasi Boolean ope a o , yai u: “alkaloid and ace ylcholines e ase
inhibi o ”, “alkaloid and Alzheime ’s disease”, “in silico and alkaloid and AChE”, se a “molecula
docking alkaloid Alzheime ”. K i e ia eksklusi dalam peneli ian ini melipu i a ikel yang idak e sedia
dalam ben uk eks lengkap se a publikasi yang idak menyajikan da a seca a jelas dan e pe inci.
Gamba 1. P isma Flowcha penca ian li e a u
HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil kajian da i be bagai peneli ian menunjukkan bahwa sejumlah senyawa alkaloid da i anaman
oba memiliki kemampuan menghamba enzim ase ilkolines e ase (AChE) yang be pe an pen ing
dalam egulasi neu o ansmisi koline gik. E ek i i as penghamba an ini sebagian besa dipe oleh
melalui pendeka an in silico sepe i molecula docking, analisis hubungan spek um-e ek, se a simulasi
dinamika molekule un uk memp ediksi in e aksi ligan dengan ca aly ic ac i e si e (CAS) dan
pe iphe al anionic si e (PAS) pada AChE. Bebe apa s udi juga mem alidasi emuan kompu asional
dengan uji bioak i i as in i o, sehingga membe ikan gamba an yang lebih lengkap mengenai po ensi
a makologis senyawa yang di eli i. Da a hasil kajian, nilai a ini as ika an, se a pola in e aksi ligan-
enzim da i masing-masing peneli ian disajikan seca a inci dalam Tabel 1.
Tabel 1. Ringkasan hasil peneli ian e kai po ensi senyawa alkaloid sebagai inhibi o AChE
melalui pendeka an in silico.
No
Sumbe
Me ode
(Pendeka an In
silico)
Senyawa
Alkaloid yang
Dianalisis
Po ensi (Nilai
docking dalam
kcal/mol, IC₅₀ dalam
µM).
Hasil & Kesimpulan
1
(Qi e al.,
2022)
Molecula
docking +
ko elasi
spek um-e ek
Be be ine,
palma ine,
columbamine,
cop isine
Ene gi ika an inggi
pada si us ka ali ik
AChE (nilai docking
mendeka i kon ol
posi i )
Mendukung bahwa
be be ine dan
palma ine adalah
kon ibu o u ama
ak i i as an i-AChE
da i eks ak Cop is.
2
(Guo e al.,
2020)
Docking dan
pemodelan
in e aksi enzim-
ligan
Senyawa u unan
sin e is be basis
ke angka alkaloid
(8i)
Compound 8i: IC₅₀
AChE = 0.39 µM;
docking menunjukkan
ika an pada CAS dan
8i adalah kandida
kua dengan po ensi
ganda (AChE/BChE)
dan a ini as inggi.
Iden i ika ion
Sc eening
Eligibili y
P oses Pemilihan Li e a u e
Menggunakana Da abase
PubMed : 2
Science Di ec : 4
Google Schoola : 6
Resea cgGa e : 3
A ikel yang e iden i ikasi: 15
Hasil Sk ining: 10
Sesuai dengan opik dan k i e ia s udi Pus aka: 5
Jumlah a ikel yang dise akan: 5
2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
No
Sumbe
Me ode
(Pendeka an In
silico)
Senyawa
Alkaloid yang
Dianalisis
Po ensi (Nilai
docking dalam
kcal/mol, IC₅₀ dalam
µM).
Hasil & Kesimpulan
PAS
(Ca aly ic/Pe iphe al
Anionic Si e)
3
(Neg u e
al., 2025)
Vi ual sc eening,
molecula
docking, ADME
& oxici y
p edic ion
Hupe zine A,
sanguinine,
c inine, kandida
ZINC
Docking sco e −10
sampai −11 kcal/mol
(se a a donepezil)
Tiga kandida ZINC
memenuhi Lipinski
ule dan pe meabel
BBB, disa ankan
un uk alidasi in i o.
4
(Rawa e
al., 2024)
Docking,
ADMET, DFT,
MD simula ion,
MMPBSA
Bi la anone,
Calomelanol J
Bi la anone
menunjukkan ΔG
−130,39 kcal/mol,
s abil 100 ns MD;
kandida po ensial
sebagai inhibi o
AChE
S abili as kompleks
inggi pada 100 ns
MD; kandida
menjanjikan sebagai
inhibi o AChE.
5
(Dos San os
e al., 2018)
Ringkasan s udi
docking & model
a mako o
Galan amine,
hupe zine A,
physos igmine
IC₅₀ galan amine sub-
µM; docking
menunjukkan ika an
kua di si us ka ali ik
Alkaloid alami
e buk i e ek i seca a
in silico dan
mendukung
pengembangan oba
Alzheime .
Ka ak e isasi Alkaloid Rhizoma Cop idis dan Ak i i as An i-AChE
Peneli ian oleh Qi e al. (2022) me upakan salah sa u s udi pen ing yang mengeksplo asi po ensi
alkaloid da i Rhizoma Cop idis dalam menghamba enzim ase ilkolines e ase (AChE) sebagai s a egi
e api penyaki Alzheime . Penulis melakukan eks aksi be ingka (pe oleum e e → e il ase a → n-
bu anol) da i empa spesies Cop is dan menganalisis kandungan 10 alkaloid u ama menggunakan
UPLC-QqQ-MS. Hasil uji ak i i as enzim menunjukkan bahwa aksi n-bu anol memiliki ak i i as
penghamba an AChE e inggi dibanding aksi lain, dengan po ensi paling menonjol pada spesies
Cop is ee a. Melalui analisis spec um–e ec ela ionship menggunakan algo i ma Random Fo es ,
Bo u a, dan ko elasi Pea son, Qi e al. mengiden i ikasi palma ine, columbamine, dan be be ine sebagai
kon ibu o u ama e hadap ak i i as inhibisi AChE. Uji ak i i as monome mempe kua hasil e sebu
dengan menunjukkan nilai IC₅₀ yang endah: palma ine (≈1,49 µg/mL), columbamine (≈2,29 µg/mL),
dan be be ine (≈3,22 µg/mL), yang mengindikasikan daya inhibisi yang kua . Un uk mempe jelas
mekanisme in e aksi, dilakukan molecula docking e hadap ke iga senyawa e sebu pada si us ak i
AChE. Hasil docking mempe liha kan bahwa ligan be ika an kua dengan ca aly ic ac i e si e (CAS)
melalui ika an hid ogen dan in e aksi π–π dengan esidu pen ing sepe i T p86 dan Phe338, yang
me upakan esidu kunci dalam pengika an subs a ase ilkolin. S abili as ika an ini mendukung emuan
in i o bahwa ke iga senyawa e sebu be pe an sebagai inhibi o kompe i i AChE.
Temuan Qi e al. ini membe ikan implikasi pen ing bagi pengembangan kandida e api be basis
bahan alam. Dengan menempa kan palma ine, columbamine, dan be be ine sebagai quali y ma ke s,
peneli ian ini menyajikan dasa ilmiah un uk seleksi ligan pada s udi in silico lanju an. Pendeka an
kombinasi i okimia, bioak i i as, dan pemodelan molekule sepe i ini me upakan s a egi yang e ek i
un uk mengiden i ikasi senyawa p ospek i sebelum memasuki ahap alidasi in i o lanju an a au uji
p aklinik. Temuan ini dipe kua oleh hasil p o iling dan analisis molecula docking yang dilakukan oleh
Calapai e al. (2024), yang menunjukkan bahwa bebe apa alkaloid alami da i spesies be beda juga
memben uk in e aksi hid ogen yang s abil pada esidu T p86 dan Phe338 enzim AChE, dengan nilai
binding a ini y be kisa −9,0 sampai −10,8 kcal/mol, sehingga mendukung pe an s uk u a oma ik be -
N sebagai penen u ak i i as penghamba an AChE.
2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
Desain Dual Inhibi o AChE/BChE Be basis 2-Oxoindolin
Peneli ian yang dilakukan oleh Guo e al. (2020) be okus pada desain, sin esis, se a e aluasi
senyawa u unan pipe idin-ka boksamida sebagai kandida inhibi o ase ilkolines e ase (AChE) dan
bu i ilkolines e ase (BChE) ganda (dual- a ge inhibi o s) un uk e api penyaki Alzheime . S udi ini
menggunakan pendeka an komp ehensi mulai da i desain be basis lead compound (G801-0274),
sin esis kimia, uji in i o menggunakan me ode Ellman, hingga analisis in silico melalui molecula
docking un uk mengungkap in e aksi ligan-p o ein seca a mende ail. Hasil pengujian ak i i as
enzima ik menunjukkan bahwa senyawa 8i memiliki po ensi penghamba an paling inggi e hadap
AChE dengan nilai IC₅₀ sebesa 0,39 µM, sekaligus ak i e hadap BChE dengan IC₅₀ 0,28 µM,
menjadikannya kandida dual inhibi o yang kua . Kebe hasilan ini dikai kan dengan kebe adaan gugus
2-oxoindolin yang be pe an pen ing dalam in e aksi dengan si us ak i enzim. S udi molecula docking
mempe liha kan bahwa 8i be ika an simul an pada ca aly ic ac i e si e (CAS) dan pe iphe al anionic
si e (PAS) AChE, melalui in e aksi π-π s acking dengan esidu T p286 dan Ty 341 pada AChE se a
Phe329 pada BChE. Mekanisme ika an ini be po ensi idak hanya menghamba hid olisis ase ilkolin,
e api juga mencegah ag egasi p o ein β-amiloid yang e kai dengan pa ogenesis Alzheime .
Konsis ensi hasil ini juga di emukan pada peneli ian alkaloid ma in oleh De an e al. (2024), di
mana senyawa Disco habdin G menunjukkan pola ika an π-π s acking dengan esidu T p86 dan Ty 341
yang se upa, mengindikasikan bahwa ak i i as penghamba an AChE idak e ba as pada alkaloid
anaman da a , melainkan juga dapa di emukan pada senyawa bioak i lau dengan ke angka a oma ik
se upa. Pendeka an ini memiliki implikasi klinis pen ing. Menginga ak i i as AChE cende ung
menu un pada ahap lanju Alzheime , sedangkan ak i i as BChE meningka sebagai kompensasi
me abolik, kebe adaan inhibi o ganda sepe i 8i memungkinkan pengendalian deg adasi ase ilkolin
seca a lebih e ek i sepanjang pe jalanan penyaki . Selain i u, p o il si o oksisi as senyawa 8i yang lebih
endah dibandingkan ac ine mempe kua po ensinya sebagai kandida oba yang lebih aman Seca a
keselu uhan, s udi Guo e al. menegaskan pen ingnya pengembangan molekul dengan mekanisme
pengika an ganda (PAS dan CAS) se a pendeka an desain be basis s uk u un uk menemukan agen
e apeu ik ba u. Hasil ini mendukung konsep bahwa alkaloid a au de i a he e osiklik se upa dapa
diop imasi seca a in silico un uk menghasilkan senyawa dengan a ini as dan selek i i as inggi e hadap
AChE/BChE, yang selanju nya diuji seca a in i o dan in i o sebelum menuju pengembangan klinis.
Temuan ini sejalan dengan Amin e al. (2025) yang menegaskan bahwa pendeka an in e disipline
melalui eksplo asi senyawa alami be basis in silico me upakan s a egi pen ing un uk mempe cepa
penemuan e api neu odegene a i , e masuk Alzheime .
Vi ual sc eening dan E aluasi ADME/Tox Kandida Alkaloid
S udi Neg u e al. (2025) menge aluasi lebih da i 100 alkaloid sebagai kandida inhibi o
ase ilkolines e ase (AChE) melalui pendeka an molecula docking dan p ediksi ADME/Tox. Me ode
docking yang digunakan di alidasi dengan e-docking ligan e e ensi donepezil (RMSD 0,41 Å),
memas ikan eliabili as hasil. Hasilnya menunjukkan bahwa sanguina ine, hupe zine A, dan c inine
memiliki a ini as pengika an yang inggi (–11,5 hingga –10,5 kcal/mol) dengan in e aksi kua pada
esidu kunci sepe i T p86, Phe338, Ty 341, dan Se 203 di ca aly ic ac i e si e (CAS) dan pe iphe al
anionic si e (PAS). In e aksi e sebu menandakan kemampuan ligan un uk menghamba hid olisis
ase ilkolin sekaligus memodulasi ag egasi β-amiloid, yang ele an dengan mekanisme pa o isiologi
Alzheime . Peneli ian oleh (Sa i h i e al., 2025) e hadap eks ak Pipe c oca um juga menunjukkan
ak i i as penghamba an AChE dengan nilai IC₅₀ sebesa 16,79 ppm dan in e aksi esidu His447 se a
Phe297, yang mempe kua hasil simulasi in silico pada s udi ini.
Selanju nya, dilakukan ligand-based i ual sc eening yang menghasilkan iga kandida ba u
(ZINC000055042508, ZINC000096316348, ZINC000067446933) dengan ene gi ika an kompe i i
e hadap donepezil dan p o il a makokine ik yang baik. P ediksi SwissADME menunjukkan
kemampuan pene asi sawa da ah o ak dan bioa ailabili as yang memadai, semen a a analisis P oTox-
III mengindikasikan isiko oksisi as yang ela i endah dengan ma gin keamanan yang lebih baik
dibanding donepezil. Temuan ini menegaskan bahwa kombinasi docking, i ual sc eening, dan
e aluasi ADME/Tox me upakan s a egi e ek i dalam mengiden i ikasi dan memp io i askan alkaloid
po ensial sebelum diuji seca a in i o maupun in i o un uk pengembangan e api Alzheime be basis
inhibi o AChE. Selain i u, s udi in silico pada alkaloid ipe helio idine menunjukkan bahwa bebe apa
senyawa dapa mengika si us ak i AChE dengan in e aksi hid ogen dan ika an π–π, sekaligus
2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
memp oyeksikan pa ame e ADME se a oksisi as—menambah buk i bahwa pendeka an
kompu asional dapa membe ikan gamba an pen ing e hadap po ensi a makokine ik dan keamanan
kandida inhibi o (De an e al., 2025).
In eg asi Docking, DFT, dan Simulasi MD un uk Validasi Kandida
Rawa e al. (2024) melakukan s udi in silico komp ehensi un uk mengiden i ikasi kandida
inhibi o AChE da i pus aka senyawa i okimia IMPPAT. Da i 127 senyawa yang disa ing, dilakukan
molecula docking un uk menen ukan ene gi ika an e baik, diiku i dengan p ediksi ADMET un uk
menge aluasi kelayakan a makokine ik. Hasil penya ingan awal menyo o i dua kandida unggulan,
bi la anone (IMPHY013027) dan calomelanol J (IMPHY007737), dengan sko docking yang lebih baik
da ipada ligan pembanding. Analisis lebih lanju menunjukkan bahwa kedua ligan ini memben uk
ika an hid ogen dan in e aksi hid o obik yang s abil dengan esidu pen ing pada ca aly ic ac i e si e
AChE, sehingga mendukung po ensi me eka sebagai inhibi o kompe i i yang e ek i .
Sebagai alidasi lanju an, peneli ian ini mengin eg asikan pe hi ungan DFT (Densi y Func ional
Theo y) un uk menganalisis kes abilan elek onik, se a simulasi dinamika molekule (MD) 100 ns dan
analisis MMPBSA un uk menge aluasi ene gi bebas ika an selama simulasi. Bi la anone menunjukkan
ΔG –130,39 kJ·mol⁻¹, semen a a calomelanol J memiliki ΔG –107,90 kJ·mol⁻¹, keduanya menunjukkan
kes abilan kompleks yang inggi sepanjang wak u simulasi. Pendeka an mul i- ahap ini menegaskan
bahwa kombinasi docking, DFT, MD, dan MMPBSA mampu membe ikan gamba an menyelu uh
en ang a ini as dan kes abilan ligan e hadap a ge enzim. Hasil e sebu membe ikan dasa yang kua
un uk melanju kan kandida ini ke ahap uji biologis lebih lanju guna mengon i masi ak i i asnya
e hadap AChE pada sis em in i o maupun in i o.
Mekanisme Aksi dan Po ensi Mul i a ge Senyawa Alami
Dos San os e al. (2018) melakukan elaah mendalam mengenai be bagai senyawa alami, e masuk
alkaloid, yang memiliki kemampuan menghamba ase ilkolines e ase (AChE). S udi ini menyo o i
bahwa alkaloid da i be bagai sumbe anaman, sepe i be be ine, galan amine, dan hupe zine A,
menunjukkan ak i i as penghamba an yang kompe i i maupun nonkompe i i e hadap AChE, dengan
nilai IC₅₀ dalam kisa an nanomola hingga mik omola endah. Ak i i as ini sebagian besa dikai kan
dengan kemampuan alkaloid un uk be in e aksi dengan ca aly ic ac i e si e (CAS) dan pe iphe al
anionic si e (PAS) melalui ika an hid ogen, in e aksi π–π s acking, dan gaya hid o obik. Peneli ian ini
menekankan pen ingnya pengika an pada PAS, ka ena selain menghamba hid olisis ase ilkolin, juga
dapa mengu angi ag egasi β-amiloid, membe ikan man aa ganda dalam kon eks e api Alzheime .
Selain i u, s udi ini mengga isbawahi pe an pendeka an in silico sebagai s a egi pen ing un uk
mengiden i ikasi dan mengop imalkan kandida inhibi o sebelum pengujian biologis. Molecula
docking, dinamika molekule , dan analisis a makokine ik kompu asional memungkinkan peneli i
menge aluasi a ini as, o ien asi ika an, se a kelayakan a makologis da i senyawa seca a e isien.
Temuan ini mempe kua pemahaman bahwa senyawa alkaloid idak hanya be ungsi sebagai inhibi o
AChE e api juga membe ikan e ek an ioksidan dan an iin lamasi, yang be po ensi meningka kan
p o eksi sa a seca a keselu uhan. Kombinasi e ek mul imekanis ik e sebu membua alkaloid menjadi
kandida menjanjikan un uk dikembangkan lebih lanju sebagai agen e api be basis mul i a ge dalam
pengelolaan penyaki Alzheime .
SIMPULAN
Hasil elaah e hadap lima a ikel yang di e iew menunjukkan bahwa senyawa alkaloid memiliki
po ensi signi ikan sebagai kandida inhibi o ase ilkolines e ase (AChE) un uk e api Alzheime .
Be bagai peneli ian melapo kan bahwa alkaloid sepe i palma ine, columbamine, be be ine, hupe zine
A, dan sanguina ine mampu be in e aksi seca a s abil dengan ca aly ic ac i e si e (CAS) dan pe iphe al
anionic si e (PAS) AChE, sebagaimana dibuk ikan melalui molecula docking, spec um–e ec
ela ionship, dan simulasi dinamika molekule yang konsis en menghasilkan ene gi ika an endah.
Pendeka an in silico juga memungkinkan pemilihan kandida dengan p o il a makokine ik baik dan
isiko oksisi as minimal, sehingga mempe cepa p oses penemuan oba dengan e isiensi inggi sebelum
ahap uji in i o maupun in i o. Hal ini sejalan dengan pandangan Amin, e al (2025) bahwa
peman aa an senyawa alami melalui s a egi kompu asi mode n be po ensi menghadi kan e api yang
lebih e ek i dan aman bagi pasien Alzheime . Seca a keselu uhan, kombinasi buk i ini menegaskan
2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
bahwa pengembangan inhibi o AChE be basis alkaloid melalui s a egi kompu asional me upakan
jalu yang menjanjikan un uk me ancang agen e apeu ik ba u yang e ek i , selek i , dan be po ensi
membe ikan man aa neu op o ek i dalam manajemen penyaki Alzheime .
UCAPAN TERIMAKASIH
Penulis mengucapkan e imakasih kepada P og am S udi Fa masi, Fakul as Fa masi, Uni e si as
Bak i Tunas Husada yang elah mendukung penulisan a ikel ini.
REFERENSI
Amin. (2025). Li e a u Re iew: Pe an Kimia Medisinal dalam Penanganan Alzheime dan Penyaki
Neu odegene a i Sae ul. Indonesian Resea ch Jou nal on Educa ion, 5, 1079–1085.
Amin, S., Ismail, M., Huda, S., P og am, ), Fa masi, S., Bak i, U., & Husada, T. (2025). Re iew A ikel:
Pendeka an Molecula Docking dalam Penemuan Senyawa Alami sebagai Penghamba Enzim
Diabe es Tipe 2. Indonesian Jou nal o Science, 2(1), 2025–2054.
Amin, S., Rian y, A. D., & Hidaya , T. (2024). S udi in Silico Senyawa yang Te kandung Dalam
Tanaman A emisinin (A eminisa annua L.) sebagai An i SARS-CoV2. Pe juangan Na u e
Pha maceu ical Con e ence, 1(1), 1–24. h p://www./d ugdesign/lipinski.jsp
Be ko , S., A anaso a, M., Geo gie , B., Bas ida, J., & Doy chino a, I. (2022). The Ama yllidaceae
alkaloids: an un apped sou ce o ace ylcholines e ase inhibi o s. Phy ochemis y Re iews, 21(5),
1415–1443. h ps://doi.o g/10.1007/s11101-021-09790-0
Calapai, M., Puzzo, L., Bo a, G., Vecchio, D. A., Blandino, R., Ba bagallo, A., Ammendolia, I., Ca dia,
L., Calapai, F., Cu ò, M., Fica a, G., Esposi o, E., T ima chi, F., Di Mau o, D., Calapai, G., &
Mannucci, C. (2024). E ec s o Physical Exe cise and Mo o Ac i i y on Dep ession and Anxie y
in Pos -Mas ec omy Pain Synd ome. Li e, 14(1), 1–13. h ps://doi.o g/10.3390/li e14010077
Colo ic, M. B., K s ic, D. Z., Laza e ic-Pas i, T. D., Bondzic, A. M., & Vasic, V. M. (2013).
Ace ylcholines e ase Inhibi o s: Pha macology and Toxicology. Cu en Neu opha macology,
11(3), 315–335. h ps://doi.o g/10.2174/1570159x11311030006
da Sil a Mesqui a, R., Ky ylchuk, A., Che ednichenko, A., Cos a Sá, I. S., Macedo Bas os, L., Mou a
A aújo da Sil a, F., Sa ai a Nunomu a, R. de C., & G a o , A. (2022). In Vi o and In Silico
E alua ion o Cholines e ase Inhibi ion by Alkaloids Ob ained om B anches o Abu a
panu ensis Eichle . Molecules, 27(10). h ps://doi.o g/10.3390/molecules27103138
De an , A., Che ie , T., & Mancini, I. (2025). Ace ylcholines e ase as a Ta ge o Helio idine-Type
Alkaloids Isola ed om Plan s: A Compu a ional S udy. 102. h ps://doi.o g/10.3390/ecsoc-28-
20223
Dos San os, T. C., Gomes, T. M., Pin o, B. A. S., Cama a, A. L., & De And ade Paes, A. M. (2018).
Na u ally occu ing ace ylcholines e ase inhibi o s and hei po en ial use o Alzheime ’s
disease he apy. F on ie s in Pha macology, 9(OCT), 1–14.
h ps://doi.o g/10.3389/ pha .2018.01192
Guo, Y., Yang, H., Huang, Z., Tian, S., Li, Q., Du, C., Chen, T., Liu, Y., Sun, H., & Liu, Z. (2020).
Design, syn hesis, and e alua ion o ace ylcholines e ase and bu y ylcholines e ase dual- a ge
inhibi o s agains Alzheime ’s diseases. Molecules, 25(3).
h ps://doi.o g/10.3390/molecules25030489
K yge , G., Silman, I., & Sussman, J. L. (1999). S uc u e o ace ylcholines e ase complexed wi h
E2020 (A icep ρ): Implica ions o he design o new an i-Alzheime d ugs. S uc u e, 7(3), 297–
307. h ps://doi.o g/10.1016/S0969-2126(99)80040-9
Neg u, D. C., Bungau, S. G., Radu, A., Ti , D. M., Radu, A. F., Nis o -Cseppen o, D. C., & Neg u, P.
A. (2025). E alua ion o he Alkaloids as Inhibi o s o Human Ace ylcholines e ase by Molecula
Docking and ADME P edic ion. In Vi o, 39(1), 236–250. h ps://doi.o g/10.21873/in i o.13822
Qi, L., Zhong, F., Liu, N., Wang, J., Nie, K., Tan, Y., Ma, Y., & Xia, L. (2022). Cha ac e iza ion o he
an i-AChE po en ial and alkaloids in Rhizoma Cop idis om di e en Cop is species combined
wi h spec um-e ec ela ionship and molecula docking. F on ie s in Plan Science,
13(Oc obe ), 1–13. h ps://doi.o g/10.3389/ pls.2022.1020309
Rawa , K., Tewa i, D., Bish , A., Chand a, S., Ti uneh, Y. K., Hassan, H. M., Al-Emam, A., Sindi, E.
R., & Al-Dies, A. A. M. (2024). Iden i ica ion o AChE a ge ed he apeu ic compounds o
Alzheime ’s disease: an in-silico s udy wi h DFT in eg a ion. Scien i ic Repo s, 14(1), 1–21.
2025
Madani : Ju nal Ilmiah Mul idisipline
Vol. 3 No. 8 Li e a u e Re iew: Po ensi Senyawa (Hilma, e ., al) | 35-42
h ps://doi.o g/10.1038/s41598-024-81285-2
Sa i h i, M., Koendho i, E. B., And ian o, D., Ku niasih, R., Dwicesa ia, M. A., Nu insani, E. Y. Y.,
Uma , M. A., & Hudayan i, M. (2025). Analysis o Bioac i e Compounds Pipe c oca um as
Inhibi o s o Ace ylcholines e ase In Silico and In Vi o. T ends in Sciences, 22(4), 1–19.
h ps://doi.o g/10.48048/ is.2025.9437
