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Tumorbiologische Bedeutung von SMARCA4 und SMARCE1 im Magenkarzinom, Korrelation mit ARID1A, Mikrosatellitenstatus sowie SMARCE1/ERBB2 Ko-Amplifikation

Abstract

Das Magenkarzinom zählt zu den 10 häufigsten Tumorarten in der deutschen Bevölkerung. Die Prognose ist bei einer 5-Jahres-Überlebensrate von…

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Tumorbiologische Bedeutung von SMARCA4 und SMARCE1 im Magenkarzinom, Korrelation mit ARID1A, Mikrosatellitenstatus sowie SMARCE1/ERBB2 Ko-Amplifikation

Author: Pries, Katharina
Year: 2024
Source: https://macau.uni-kiel.de/servlets/MCRFileNodeServlet/macau_derivate_00006856/Dissertation_Pries_2023.pdf
Aus dem Ins i u ü Pa hologie
(Di ek o : P o . D . med. C. Röcken)
im Uni e si ä sklinikum Schleswig-Hols ein, Campus Kiel
an de Ch is ian-Alb ech s-Uni e si ä zu Kiel
Tumo biologische Bedeu ung on
SMARCA4 und SMARCE1 im Magenka zinom,
Ko ela ion mi ARID1A, Mik osa elli ens a us sowie
SMARCE1/ERBB2 Ko-Ampli ika ion
Inaugu aldisse a ion
zu
E langung de Dok o wü de de Medizin
de Medizinischen Fakul ä
de Ch is ian-Alb ech s-Uni e si ä zu Kiel
o geleg on
KATHARINA PRIES
aus Hambu g
Kiel 2023
1. Be ich e s a e : P o . D . Ch is oph Röcken, Ins i u ü Pa hologie
2. Be ich e s a e /in: P o . D . D . Janka Held-Feind , Klinik ü Neu ochi u gie
Tag de mündlichen P ü ung: 20.11.2024
Zum D uck genehmig , Kiel, den 30.08.2024
gez.: P o . D . Ch is oph Röcken, Ins i u ü Pa hologie
I
Inhal s e zeichnis
Abkü zungs e zeichnis .......................................................................................... III
Tabellen e zeichnis ................................................................................................ VI
Abbildungs e zeichnis ........................................................................................... VII
1 Einlei ung ............................................................................................................ 1
1.1 Das Magenka zinom ...................................................................................... 1
1.1.1 Epidemiologie ......................................................................................... 1
1.1.2 Ä iopa hogenese ..................................................................................... 1
1.1.3 Pa hologie ............................................................................................... 4
1.1.4 TNM-Klassi ika ion und UICC-S adien .................................................... 5
1.1.5 P ognose ................................................................................................ 7
1.1.6 The apie .................................................................................................. 7
1.2 De SWI-/SNF-Komplex ................................................................................ 9
1.2.1 Funk ion und Au bau ............................................................................... 9
1.2.2 Tumo biologische Bedeu ung on SMARCA4 und SMARCE1 ............. 10
1.3 F ages ellung ............................................................................................... 11
2 Ma e ial ............................................................................................................. 13
2.1 S udienkollek i ........................................................................................... 13
2.2 Ge ä e ......................................................................................................... 13
2.3 So wa e ...................................................................................................... 14
2.4 Chemikalien ................................................................................................. 14
2.5 Ki sys eme ................................................................................................... 15
2.6 An ikö pe .................................................................................................... 15
2.7 Oligonukleo ide ............................................................................................ 15
2.8 Ve b auchsma e ial ..................................................................................... 15
3 Me hoden .......................................................................................................... 16
3.1 Immunhis ochemie ...................................................................................... 16
3.1.1 Auswe ung ........................................................................................... 17
3.2 Ve gleich on SMARCE1 und HER2 ........................................................... 18
3.3 D ople Digi al PCR ..................................................................................... 19
3.3.1 Du ch üh ung ........................................................................................ 19
3.3.2 Auswe ung ........................................................................................... 21
3.4 He kun wei e e klinisch-pa hologische Da en ......................................... 21
3.5 S a is ische Auswe ung .............................................................................. 21
II
4 E gebnisse ........................................................................................................ 24
4.1 Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 ................................................ 24
4.2 Ko ela ion mi Pa ien encha ak e is ika ...................................................... 26
4.3 SMARCE1 und HER2 in Immunhis ochemie und CISH .............................. 38
4.4 Ampli ika ion on SMARCE1 in de ddPCR ................................................. 40
4.5 Ampli ika ion on SMARCE1 und ERBB2 ................................................... 40
5 Diskussion ........................................................................................................ 43
5.1 Me hodische Diskussion .............................................................................. 43
5.2 Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 ................................................ 45
5.3 SMARCA4, SMARCE1 und ande e umo biologische Eigenscha en ......... 46
5.4 Ampli ika ion on SMARCE1 ....................................................................... 49
5.5 SMARCE1 und HER2 .................................................................................. 49
6 Zusammen assung .......................................................................................... 51
7 Li e a u e zeichnis ......................................................................................... 53
A Anhang .............................................................................................................. 58
A.1 E hik o um ................................................................................................... 58
B Publika ionen ................................................................................................... 60
C Danksagung ..................................................................................................... 61
D E klä ung .......................................................................................................... 62
III
Abkü zungs e zeichnis
bzw. beziehungsweise
ca. ci ca
CIN ch omosomal ins abil
CISH Ch omogene in si u Hyb idisie ung
CNV Copy Numbe Va ia ion
DAB Diaminbenzidin
ddPCR D ople Digi al PCR
DNA desoxy ibonucleid acid (engl.), Desoxy ibonukleinsäu e
EBV Eps ein-Ba Vi us
EDTA E hylendiamin e aessigsäu e
EGFR epide mal g ow h ac o ecep o (engl.),
epide male Wachs ums ak o ezep o
engl. Englisch
ESD endoskopische Submukosadissek ion
e al. e alii (la .), und ande e
FFPE Fo malin- ixed pa a in embedded issue
g G amm
GTP Guanosin iphospha
GTPase GTP-bindendes P o ein, G-P o ein
H. pylo i Helicobac e Pylo i
HE Hema oxylin und Eosin
HER2 Human epide mal g ow h ac o ecep o 2 (engl.), Hu-
mane epide male Wachs ums ak o ezep o 2
IHC Immunhis ochemie
la . la einisch
l Li e
li. links
mg Millig amm
Min Minu e

IV
ml Millili e
mm Millime e
MSI Mik osa eli en ins abil
µg Mik og amm
µl Mik oli e
µm Mik ome e
n Anzahl
nm Nanome e
OS O e all Su i al (engl.), Gesam übe leben
PIK3CA Phospha idylinosi ol-4,5-Bisphosphona 3-Kinase ka aly i-
sche Un e einhei Alpha
PCR polyme ase chain eac ion (engl.), Polyme aseke en eak-
ion
e. ech s
RNA ibonucleic acid (engl.), Ribonukleinsäu e
Sek Sekunde
SMARCA4 SWI-/SNF ela ed, ma ix associa ed, ac in dependen eg-
ula o o ch oma in, sub amily a, membe 4 (engl.), SWI-
/SNF bezogene , Ma ix assoziie e , Ac in abhängige
Ch oma in egula o , Un e amilie A, Mi glied 4
SMARCE1 SWI-/SNF ela ed, ma ix associa ed, ac in dependen eg-
ula o o ch oma in, sub amily e, membe 1 (engl.), SWI-
/SNF bezogene , Ma ix assoziie e , Ac in abhängige
Ch oma in egula o , Un e amilie E, Mi glied 1
SWI-/SNF-Komplex Swi ch-/Suc ose-non- e men ing-Komplex
TMA Tissue Mic o A ay
TSS Tumo speci ic su i al (enlg.), Tumo spezi isches
Übe leben
TNM Tumo -Nodus-Me as asen
u.a. un e ande em
UKSH Uni e si ä sklinikum Schleswig-Hols ein
UICC Union o In e na ional Cance Con ol (engl.)
.a. o allem
s. e sus (la .), gegen
V
WHO Wel gesundhei so ganisa ion
z.B. zum Beispiel
°C G ad Celsius
z.T. zum Teil
VI
Tabellen e zeichnis
Tabelle 1: TNM-Klassi ika ion on 2017. Quelle: Wi ekind, 2017 [33] ............................................... 5
Tabelle 2 UICC-S adien des Magenka zinoms. Quelle: Wi ekind, 2017 [33] ..................................... 6
Tabelle 3: Cyling Phasen bei de ddPCR Hie au ge üh sind die Cycling Phasen des gewähl en
P o okolls, welche de The mocycle ü die ddPCR du chlie . Dabei wu de die P oben-DNA 40 Mal
dena u ie und du ch DNA-Syn hese in jedem Zyklus e doppel , sodass die Ausgangsmenge de
P oben-DNA um 240 e meh we den konn e....................................................................................... 20
Tabelle 4: Kombina ionen de bei SMARCA4 nachgewiesenen Fä bein ensi ä en [56] ............... 25
Tabelle 5: Kombina ion de bei SMARCE1 nachgewiesenen Fä bein ensi ä en [56] ................... 25
Tabelle 6: S a is ische Auswe ung Exp ession on SMARCE1 und klinisch-pa hologische
Pa ien encha ak e is ika (1) Fishe 's exac Tes , (2) Kendall's au Tes , (3) log- ank Tes , die nach angewand e
Mul iple-Tes ing-Ko ek u signi ikan e bliebenen We e wu den mi * ma kie . Teile diese Tabelle wu den be ei s
publizie © P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56]. ........................... 28
Tabelle 7: S a is ische Auswe ung de Exp ession on SMARCA4 und de Dys egula ion des
SWI-/SNF-Komplexes (1) Fishe 's exac Tes , (2) Kendall's au Tes , (3) log- ank Tes , die nach angewand e
Mul iple-Tes ing-Ko ek u signi ikan e bliebenen We e wu den mi * ma kie . Teile diese Tabelle wu den be ei s
publizie © P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56]. ............................ 32
Tabelle 8: Ve gleich SMARCE1 und HER2 IHC und CISH Au ge üh is de jeweilige His osco e des
un e such en Falls, welche die Ausp ägung de Exp ession on SMARCE1 wiede geben soll. Sowie die
Ausp ägung de Exp ession on HER2 in de Immunhis ochemie, und die Ampli ika ion on HER2 in de CISH,
welche in eine o angegangenen S udie des Ins i u s ü Pa hologie am UKSH Kiel un e such wu den [57].Teile
diese Tabelle wu den be ei s publizie © P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley & Sons
L d. [56] ................................................................................................................................................. 39
Tabelle 9: Ampli ika ionsanalyse on SMARCE1 du ch ddPCR Angegeben sind die G öße de
Tumo a eale in de jeweiligen in de Immunhis ochemie nachgewiesene Exp essionsin ensi ä on
SMARCE1, die We e de CNV aus de e s en und zwei en ddPCR mi de zugehö igen
abschließenden Bewe ung sowie die Da en des S udienkollek i s zum Ampli ika ionss a us on HER2
aus CISH-Un e suchungen o angegangene S udien des Ins i u s ü Pa hologie am UKSH Kiel [57].
In 3 Fällen lag kein Ma e ial ü eine zwei e ddPCR o : n.a. = nich anwendba . Teile diese Tabelle
wu den be ei s publizie © P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56] ...... 41
VII
Abbildungs e zeichnis
Abbildung 1: Re e enz älle ü die In ensi ä en des His osco es bei de IHC-Analyse Da ges ell
sind die In ensi ä en 0 bis 3+ ( on links nach ech s). Obe e Reihe: An i-SMARCA4 IHC (400- ache
Ve g öße ung). Un e e Reihe: An i-SMARCE1 IHC (400- ache Ve g öße ung) © P ies e al. Cance
Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56] ............................................................................ 18
Abbildung 2: He e ogenes Exp essionsmus e in SMARCA4 und SMARCE1 links: An i-
SMARCA4 IHC (400- ach e g öße ) ech s: An i-SMARCE1 IHC (400 ach- e g öße ) © P ies e al.
Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56] ................................................................ 26
Abbildung 3: Kaplan-Meie Ku e zum OS on SMARCA4 und SMARCE1 Da ges ell sind die
Gesam übe lebensku en (OS) on SMARCA4 und SMARCE1 dicho omisie am Median und
ka ego isie in „hohe“ und „nied ige“ Exp ession. ................................................................................ 36
Abbildung 4: Kaplan-Meie Ku en zum TSS on SMARCA4 und SMARCE1 Da ges ell sind die
Ku en zum umo spezi ischen Übe leben (TSS) on SMARCA4 und SMARCE1 dicho omisie am
Median und ka ego isie in „hohe“ und „nied ige“ Exp ession. © P ies e al. Cance Medicine
published by John Wiley & Sons L d. [56]. ........................................................................................... 36
Abbildung 5: Kaplan-Meie Ku en zum OS und TSS on SMARCE1 In ensi ä 3+ o handen
Da ges ell sind die Ku en zum Gesam übe leben (OS) und umo spezi ischen Übe leben (TSS) zum
Vo handensein de In ensi ä 3+ in de IHC on SMARCE1 ................................................................. 37
Abbildung 6: Kaplan-Meie Ku en OS und TSS de Dys egula ion des SWI-/SNF-Komplexes
Da ges ell sind die Ku en zum Gesam übe leben (OS) und umo spezi ischen Übe leben (TSS) zu
Dys egula ion des SWI-/SNF-Komplexes, welche als o handene Exp ession on SMARCA4 und
SMARCE1 „beide hoch“ und „beide nied ig“ de inie wu de. ............................................................... 37
Abbildung 7: Ve gleich de Exp ession und Ampli ika ion on SMARCE1 und HER2 Obe e
Reihe: übe eins immend keine Exp ession on SMARCE1 (links) und HER2 (Mi e), sowie keine
Ampli ika ion on HER2 ( ech s) im gleichen Tumo a eal. Un e e Reihe: übe eins immend s a ke
Exp ession on SMARCE1 (links) und HER2 (Mi e) sowie Ampli ika ion on HER2 ( ech s) in einem
ande en Tumo a eal desselben Falls. Links An i-SMARCE1 An ikö pe (400- ach e g öße ), Mi e
Ani -HER2 An ikö pe (400- ach e g öße ), ech s HER2 CISH (400- ach e g öße ). © P ies e al.
Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56] ................................................................ 38
Einlei ung 7
1.1.5 P ognose
Neben dem TNM-S a us beein lussen wei e e Tumo eigenscha en die P ognose.
Diese lassen sich in essenzielle und zusä zliche Fak o en un e scheiden, die wiede-
um in umo -, wi - und umwel bezogene Fak o en un e eil we den können.
De TNM-S a us s ell als eine de wich igs en P ognose ak o en einen essenziellen,
umo bezogenen Fak o da . Auch de HER2-S a us zähl in diese Ka ego ie. Ein wei-
e e essenzielle , jedoch umwel bezogene Fak o is de Residual umo s a us. So
mach es einen Un e schied, ob de Tumo R0, also im gesunden Gewebe, en e n
wu de ode , ob de Tumo in die R2-Ka ego ie zähl , bei de be ei s mak oskopisch
sich ba Teile des Tumo s nach de Resek ion im Kö pe e blieben sind. Zusä zliche
umo bezogene Fak o en sind die Tumo lokalisa ion (Ka dia s. dis ale Magen), de
His ologische Typ (di us s. in es inal) und die Ge äßin asion. Auch das Al e und die
dami e bundenen häu ige en Komo bidi ä en nehmen als wi bezogene Fak o ei-
nen Ein luss au die P ognose des Pa ien en [33, 35]. Dennoch is man au de Suche
nach wei e en, neuen Fak o en. Als iel e sp echend haben sich dabei das molekula e
P o il des Tumo s (Mik osa elli enins abili ä ) und die E hnie (Asia isch s. Nich -Asia-
isch) he ausges ell . Alle dings sind nich alle übliche weise ü maligne Tumo en an-
gewand en P ognosema ke auch sinn oll beim Magenka zinom anzuwenden. Dies
gil z. B. ü den Ki67-P oli e a ionsindex, de zu den am häu igs en angewand en
P ognosema ke n ü maligne Tumo en zähl . Es zeig e sich kein Zusammenhang zwi-
schen dem immunhis ologisch bes imm en Ki67-Index und dem Pa ien enübe leben
[36]. Neben po enziellen p ognos ischen Ma ke n ha die A de The apie einen en -
scheidenden Ein luss au das Pa ien enübe leben.
1.1.6 The apie
Das Ziel de Behandlung is g undsä zlich da on abhängig, wie wei die E k ankung
be ei s o gesch i en is . Eben alls da on abhängig sind auße dem die he apeu i-
schen Möglichkei en. Wäh end im F ühs adium noch eine endoskopische Resek ion
in Fo m eine endoskopische Submukosadissek ion (ESD) du chge üh we den kann,
is ü o gesch i ene e S adien ode auch schlech di e enzie e Tumo e ein adika-
le es Vo gehen, beispielsweise du ch eine Teil esek ion bis hin zu o alen Resek ion
des Magens, no wendig [37].

Einlei ung 8
Bishe gil de chi u gische Ansa z als einzige ku a i e Behandlung ü Magenka zi-
nome und s ell dami die S anda d he apie esek able Tumo e da . Neben de chi u -
gischen The apie wi d in einigen Fällen auch die pe iope a i e Chemo he apie emp-
ohlen. Sie kann nachgewiesene maßen das Gesam übe leben e besse n. Von eine
p äope a i en Radiochemo he apie ode An ikö pe he apie wi d jedoch abge a en
[37].
Da ca. jedes d i e diagnos izie e Magenka zinom be ei s me as asie is , sind die
The apiemöglichkei en o beg enz [2]. Die pallia i e The apie ha dann das Ziel, das
Übe leben zu e besse n und die Lebensquali ä zu e hal en. An diese S elle kann
eine sys emische Chemo he apie eingese z we den. Vo Beginn eine pallia i en The-
apie soll e auße dem de HER2-S a us bes imm we den. Diese gil als ein posi i e
p ädik i e Fak o ü eine An ikö pe he apie mi T as uzumab, die im Falle eines
He 2/neu-übe exp imie enden Tumo s zusä zlich zu eine Chemo he apie angewand
wi d [37]. Zusä zlich dazu kann eine Mis el he apie die Lebensquali ä des Pa ien en
e besse n, auch wenn sie nich zu Ve besse ung des Übe lebens bei agen kann
[38].
Die Ve besse ung de Behandlung du ch geziel e Tumo he apien („Ta ge ed-The a-
pies“) is Gegens and ak uelle Fo schungsa bei en. Dabei kommen Medikamen e
zum Einsa z die gegen o he im Tumo un e such e Ziels uk u en ge ich e sind, wie
z.B. T as uzumab bei HER2-posi i en Magenka zinomen. Besonde s die genauen Me-
chanismen, die zu Tumo wachs um, Me as asie ung abe auch zu Medikamen en e-
sis enz üh en sind hie on In e esse. Die be eilig en Rezep o en, signal e mi elnden
P o eine und ande e ü den Tumo spezi ische Eigenscha en we den gegen den Tu-
mo genu z . Hie ü gib es be ei s un e schiedliche Me hoden. Beispielsweise können
An ikö pe wahlweise di ek ih e Wi kung an Rezep o en en al en ode abe da ü ge-
nu z we den, gekoppel e Chemo he apeu ika spezi isch an ih en Wi kungso zu b in-
gen. Auch das kö pe eigene Immunsys em kann geziel s imulie und zu Bekämp ung
on Tumo zellen eingese z we den. Du ch das zunehmende Ve s ändnis de Tumo -
biologie können The apeu ika also imme p äzise gegen Tumo e eingese z we den.
He kömmliche Chemo he apeu ika wi ken an allen sich schnell e meh enden Zellen
gleiche maßen und üh en dadu ch zu Nebenwi kungen wie Haa e lus , Beein äch-
igung des Knochenma ks ode des Gas oin es inal ak s [39]. De Un e gang des
Knochenma ks kann jedoch nich nu zu eine Anämie üh en, sonde n auch die
Einlei ung 9
Funk ion des Immunsys ems on Pa ien en deu lich einsch änken. Pa ien en sind
dann nich nu an ällige ü In ek e, sie sind auch ge äh de e ü das Au e en eine
eb ilen Neu openie [40], welche als schwe e Nebenwi kung als lebensbed ohlich gil
[41]„Ta ge ed The apies“ sollen den Tumo im Ve gleich zu he kömmlichen
Chemo he apeu ika dami nich nu wi kungs olle sonde n auch nebenwi kungsä me
ü gesunde Zellen bekämp en [39].
1.2 De SWI-/SNF-Komplex
1.2.1 Funk ion und Au bau
Beim Swi ch-/Suc ose-non- e men ing-Komplex (SWI-/SNF-Komplex) handel es sich
um einen ATP-abhängigen Ch oma in-Remodelle . E is in de Lage, die T ansk ip ion
zu egulie en, indem e die Ch oma ins uk u e ände . Dabei üh die ATPase Ak i-
i ä des Komplexes zu eine Un e b echung des His on-DNA-Kon ak es. Es komm zu
eine DNA-T ansloka ion, indem eine Loop-Fo ma ion gebilde wi d, welche sich um
das Nukleosom ausb ei e und die DNA anschließend mi Abs and zu o he igen Nuk-
leosom-Posi ion neu posi ionie . Diese Ablau wi d auch als „Sliding“ bezeichne und
kann auße dem zu eine Ejek ion eines benachba en Nukleosomen üh en. Du ch
diesen Vo gang wi d die Zugänglichkei ü T ansk ip ions ak o en e höh und dami
die T ansk ip ion egulie [42].
De SWI-/SNF-Komplex bes eh aus 9 bis 12 Un e einhei en. Man un e scheide
haup sächlich zwei A en on SWI-/SNF-Komplexen: BRG1-assoziie e Fak o (BAF,
auch bekann und im Folgenden bezeichne als SWI-/SNF-A) und polyb omo BRG1-
assoziie e Fak o (PBAF, auch bekann und im Folgenden bezeichne als SWI-/SNF-
B). Die Ke nun e einhei en inden sich dabei sowohl im SWI-/SNF-A-Komplex, als
auch im SWI-/SNF-B-Komplex. Zu diesen Un e einhei en gehö en BRG1 (im Folgen-
den als SMARCA4 bezeichne ), BAF155 (SMARCC1), BAF170 (SMARCC2) und
SNF5 (SMARCB1). Auße den Ke nun e einhei en gib es wei e e a iie ende Un-
e einhei en, die sich eben alls in beiden Komplexen inden lassen. Hie zu zählen ß-
Ac in, BAF53 (SMARCA2), BAF60
(SMARCD3), BAF45 sowie BAF57 (SMARCE1) [42].
Einlei ung 10
De SWI-/SNF-A-Komplex un e scheide sich om SWI-/SNF-B-Komplex du ch ü ihn
spezi ische Un e einhei en. Eine spezi ische Un e einhei des SWI-/SNF-A-Komplexes
is das AT- eiche-in e ak i e-Domain-P o ein 1A und 1B (ARID1A/ ARID1B), ü das
be ei s ein Zusammenhang mi dem TNM-S a us und de In asions ie e des Magen-
ka zinoms nachgewiesen we den konn e [42, 43]. Zu den spezi ischen Un e einhei en
des SWI-SNF-B-Komplexes gehö en BAF200 (ARID2), BAF180 (PBRM1) und BRD7.
De SWI-/SNF-A-Komplex kann dabei sowohl SMARCA4 als auch BRM als ka aly i-
sche ATPase Un e einhei beinhal en, wäh end allein SMARCA4 als ka aly ische AT-
Pase Un e einhei des SWI-/SNF-B-Komplexes dien [42].
1.2.2 Tumo biologische Bedeu ung on SMARCA4 und SMARCE1
SWI-/SNF ela ed, ma ix associa ed, ac in dependen egula o o ch oma in, sub a-
mily a, membe 4 (SMARCA4) is eine de ka aly ischen ATPase Un e einhei en des
SWI-/SNF-Komplexes, dessen Gen au Ch omosom 19 lokalisie is (19p 13.2) [42,
44]. Obwohl häu ige on Mu a ionen in SMARCA4 be ich e wi d, die übe einen Funk-
ions e lus de Un e einhei zu einem agg essi e en Tumo wachs ums üh en und da-
mi au eine Rolle als Tumo supp esso schließen lassen, wu de auch schon Gegen-
eiliges beobach e [45–47]. Somi is die umo biologische Bedeu ung on SMARCA4
bis heu e nich nu ü das Magenka zinom unkla .
SWI-/SNF ela ed, ma ix associa ed, ac in dependen egula o o ch oma in, sub a-
mily e, membe 1 (SMARCE1) is eine de a iablen Un e einhei en des SWI-/SNF-
Komplexes, dessen Gen sich au Ch omosom 17 be inde (17q21.2) und dami eng mi
ERBB2 benachba is , welches ü H2/neu kodie (17q12-21) [48]. De humane epi-
de male Wachs ums ak o ezep o 2 (He 2/neu) is . a. ü seine Rele anz beim
B us k ebs bekann und wi d do be ei s als ein wich ige Bioma ke zu The apiepla-
nung eingese z [49, 50]. Eine Übe exp ession on He 2/neu e mi el eine Zunahme
de Zellp oli e a ion und e leich e dadu ch ein unkon ollie es (Tumo -) Zellwachs-
um. Die Übe exp ession on He 2/neu gil des Wei e en bei B us k ebspa ien en als
ein Indika o ü eine schlech e P ognose [51, 52]. Beim Magenka zinom wi d He 2/neu
als Ang i spunk eine de zielge ich e en The apien („ a ge ed he apies“,An ikö -
pe he apie) genu z , um die Übe lebenszei de pallia i en Pa ien en zu e länge n
[37]. Fü SMARCE1 wu de in eine S udie aus Asien beobach e , dass eine hohe
Einlei ung 11
Exp ession einen signi ikan en Zusammenhang mi eine schlech en P ognose sowie
o gesch i ene Tumo g öße, In asions ie e und höhe em UICC-S adium beim Ma-
genka zinom au wies [53]. Ande e S udien bes ä ig en auße dem, dass eine e höh e
Exp ession on SMARCE1 mi Me as asie ung des Tumo s in Zusammenhang ge-
b ach we den kann [54, 55]. Diese Eigenscha schein SMARCE1 übe den
ERK/MAPK-Signalweg zu e mi eln, welche eben alls du ch die Ak i ie ung on
He 2/neu in Gang gese z we den kann [51, 53].
1.3 F ages ellung
Die Funk ionsweise des SWI/SNF-Komplexes sowie die bishe dazu o liegenden S u-
dien geben Hinweise au eine Rele anz in de Tumo biologie des Magenka zinoms
eben dieses Komplexes ode seine Un e einhei en [45–47, 53–55]. Ebenso wi die
äumliche Nähe on SMARCE1 zu ERBB2 au Ch omosom 17 [48] die F age au , ob
hie eine Ko-Ampli ika ion o lieg . Eine de a ige Ko-Ampli ika ion könn e mögliche -
weise in de En s ehung on Resis enzen gegen The apeu ika wie T as uzumab, wel-
ches als An ikö pe in de pallia i en The apie HER2-posi i e Magenka zinome ein-
gese z wi d, be eilig sein. Dahe sollen in diese Disse a ion die hie genann en Hy-
po hesen übe p ü we den:
(1) SMARCA4 und SMARCE1 zeigen un e schiedlichen A en de Exp ession sowie
in a umo ale He e ogeni ä beim Magenka zinom.
(2) Die Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 ko elie mi klinisch-pa hologi-
schen Pa ien encha ak e is ika.
(3) Es lieg eine Ko-Ampli ika ion on SMARCE1 und ERBB2 o .
Um diese Thesen zu p ü en, wu de zunächs jeweils ein An ikö pe ü die immunhis-
ochemische Fä bung on SMARCA4 und SMARCE1 e ablie . Diese wu den einzeln
zu immunhis ochemischen Fä bung on Ganzgewebeschni en eine gu cha ak e i-
sie en Koho e on übe 400 Magenka zinompa ien en genu z . Die ge ä b en Gewe-
beschni e wu den im Anschluss mik oskopie und anhand eine op ischen Skala
(His o-Sco e) bewe e , um die Ausp ägung sowie die A de Exp ession zu e mi eln.
Die so e hobenen Da en wu den in eine Da enbank einge agen, in de be ei s iele
wei e e klinisch-pa hologische Pa ien encha ak e is ika zu den Fällen des
Einlei ung 12
S udienkollek i s un e such wu den. Die in o angegangen Un e suchungen be ei s
als HER2 posi i bewe e en Fälle wu den speziell in de Exp ession on He 2/neu und
SMARCE1 e glichen, um zunächs es zus ellen, ob SMARCE1 und He 2/neu an den
gleichen S ellen inne halb de Ka zinome exp imie wu den. Zusä zlich wu de ch o-
mogene in si u Hyb idisie ung (CISH) on HER2, welche einen Hinweis au die zu-
g unde liegende Ampli ika ion on ERBB2 lie e n, in den Ve gleich mi einbezogen.
Zule z wu den ausgewähl e Fälle, un e denen sich auch ERBB2-ampli izie e be an-
den, mi els ddPCR au die Ampli ika ion on SMARCE1 un e such . Im Anschluss
wu de eine s a is ische Auswe ung de e hobenen Da en du chge üh und die Ex-
p ession on SMARCA4 und SMARCE1 mi o liegenden klinisch-pa hologischen Pa-
ien encha ak e is ika ko elie .

Me hoden 13
2 Ma e ial
2.1 S udienkollek i
Das S udienkollek i umschließ 468 he apienai e Adenoka zinome des Magens ode
gas oösophagealen Übe gangs aus dem A chi des Ins i u s ü Pa hologie des Uni-
e si ä sklinikums Schleswig-Hols ein (UKSH), welche zwischen 1997 und 2009 diag-
nos izie und ope ie wo den sind. Eingeschlossen wu den Pa ien en im Al e on 28
bis 92 Jah en. Das Du chschni sal e des Kollek i s lieg bei 67 Jah en. Fälle, ü die
nich meh aus eichend Gewebe zu Un e suchung o handen wa , wu den ausge-
schlossen. Die nachs ehend au ge üh en Pa ien encha ak e is ika wu den du ch das
Ins i u ü Pa hologie des UKSH be ei s o Beginn diese S udie e ass : Geschlech ,
Al e , Tumo lokalisa ion, Tumo yp nach Lau én, G ading, TNM-S a us und UICC-S a-
dium. Follow-up-Da en übe den Pa ien en od wu den om K ebs egis e Schleswig-
Hols ein bezogen. Die olls ändigen Pa ien encha ak e is ika sind zudem in den Ta-
bellen 6 und 7 da ges ell
2.2 Ge ä e
Das e wende e Gewebe wu de in de Kühl-Ge ie kombina ion Liebhe p emium no-
os (Liebhe , Bulle, Schweiz) gelage . Zum Pipe ie en wu den Eppendo Resea ch
plus Pipe en (Eppendo AG, Hambu g) in den G ößen 10µl, 20µl, 100µl und 200µl
sowie de Vo ex Schü le V 2 (IKA-We ke GmbH & Co. KG, S au en) genu z . De
Leica BOND-MAX (Leica Biosys ems, We zla ) wu de zu Fä bung eingese z . Mi dem
Cogni i e Cxi Labe P in e (Leica Biosys ems, We zla ) wu den E ike en ged uck .
Deckgläse n wu den mi de P omoun e RCM 2000 Co e slipping Machine (MEDITE
Medical GmbH, Bu gdo ) au geb ach . Einzelne ge ä b e Gewebeschni e wu den mi
dem Leica Scanne SCN 400 (Leica Mic osys ems, We zla ) eingescann und digi ali-
sie .
Des Wei e en wu de de Vo ex Schü le V 2 (IKA-We ke GmbH & Co. KG, S au en)
und die The mo Scien i ic™ Pico™ 17 Mik ozen i uge (The mo Fishe Scien i ic, Mas-
sachuse s, USA) e wende . Es wu de Eis aus dem Eisbe ei e Sco sman AF130
(Sco sman Ice Sys ems, Ve non Hills, USA) eingese z . Gea bei e wu de an mi Ul -
a iole S e ilizing PCR Wo ks a ion (Peqlab Bio echnologie GmbH, E langen) ausge-
s a e en A bei splä zen. Fü die Du ch üh ung de ddPCR kamen ein DG8™ Ca idge
Holde #1863051 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien, USA), ein QX200 D ople
Me hoden 14
Gene a o #1864002 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien, USA), de PX1 Hea Seale
#1864000 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien, USA), ein C1000 Touch The mocycle
mi Deep Well Reac ion Module #1851197 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien, USA)
sowie de QX200 D ople Reade #1864003 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien, USA)
und ein Leno o ThinkPad L540 (Leno o, Qua y Bay, Hongkong) zum Einsa z.
2.3 So wa e
Zu E assung und s a is ischen Auswe ung de gewonnenen Da en wu de an Com-
pu e n mi dem Be iebssys em Mic oso ® Windows 10 (Mic oso Deu schland
GmbH, Schwabing) gea bei e . Die E assung de Da en e olg e mi Mic oso O ice
365® P oPlus (Mic oso Deu schland GmbH, Schwabing sowie speziell ü die ddPCR
mi Quan aSo ™ Ve sion 1.7 #1864011 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien, USA). Die
s a is ische Auswe ung e olg e mi Hil e on SPSS 27.0 (IBM Co po a ion, New Yo k,
USA)
2.4 Chemikalien
Fü die immunhis ochemische Fä bung am Leica BOND-MAX (s. 2.2 Ge ä e) wu den
die Bond Dewax Solu ion (Leica Biosys ems, We zla ), die Bond Epi ope Re ie al So-
lu ion 2 (Leica Biosys ems, We zla ), Bond P ima y An ibody Diluen (Leica Biosys-
ems, We zla ) und BOND Wash Solu ion 10X Concen a e (Leica Biosys ems, We z-
la ) genu z . Nach de Fä bung wu den die Objek äge in 70% E hanol (Th. Geye
GmbH & Co. KG, Renningen) ge auch und mi dH2O (Th. Geye GmbH & Co. KG,
Renningen) abgewaschen. Fü das Waschen de Schni e in de au s eigenden Alko-
hol eihe wu de Xylol (Th. Geye GmbH & Co. KG, Renningen) e wende .
Fü den P obenansa z de ddPCR wu de mi Nuclease eiem Wasse (Qiagen, Hilden)
und ddPCR Supe mix o P obes (No dUTP) (Bio-Rad, Kali o nien, USA) gea bei e .
Auße dem wu de D ople Gene a o Oil o P obes #1863005 (Bio-Rad Labo a o ies,
Kali o nien, USA) und D ople Reade Oil #1863004 eingese z (Bio-Rad Labo a o ies,
Kali o nien, USA).
Me hoden 15
2.5 Ki sys eme
Zu immunhis ochemischen Fä bung wu de das BOND Polyme Re ine De ec ion Ki
(Leica Biosys ems, We zla ) eingese z .
2.6 An ikö pe
In de immunhis ochemischen Fä bung on SMARCA4 kam de monoklonale Maus
An ikö pe An i-SMARCA4/-BRG1, Klon E8V5B on Cell Signaling Technology (Be-
e ly, MA, USA) in de Ve dünnung 1 : 400 zum Einsa z. Zu immunhis ochemischen
Fä bung on SMARCE1 wu de de monoklonale Hasen An ikö pe , An i-SMARCE1/-
BAF57, Klon E6H5J on Cell Signaling Technology (Be e ly, MA, USA) in de Ve dün-
nung 1 : 300 eingese z .
2.7 Oligonukleo ide
Fü die Du ch üh ung de ddPCR wu den ü SMARCE1 die im Folgenden genann en
P ime eingese z . Selbs design e P ime (Biome s.ne GmbH, Ulm) SMARCE1 o -
wa d: 5’-ACACTCCTTTTTATGGTTACTGGT-3’ und selbs design e P ime (Bio-
me s.ne GmbH, Ulm) SMARCE1 e e se: 5’-TTCTCTGGAAACGGGCGGT-3’. Die
Sonde ü SMARCE1 wa eben alls selbs designed (Biome s.ne GmbH, Ulm) und
ha e die Sequenz 5’-6-FAM-TGTTCACTCCAGATTATGATGATGGC-BMN-Q530-3’.
Fü EFTUD2 wu den P ime nach dem Design on Liu e al. [53] e wende . P ime
EFTUD2 o wa d (Biome s.ne GmbH, Ulm): 5’-GGTCTTGCCAGACACCAAAG-3’ und
P ime EFTUD2 e e se (Biome s.ne GmbH, Ulm): 5’-TGAGAG-
GACACACGCAAAAC-3’. Die Sonde ü EFTUD2 wu de selbs designed (Biome s.ne
GmbH, Ulm) und ha die Sequenz 5’-6-HEX-GGACATCCTTTGGCTTTTGA-BMN-
Q530-3’.
2.8 Ve b auchsma e ial
Als Ve b auchsma e ial ü die Immunhis ochemie kamen Objek äge de So e Su -
gipa h® Apex BOND Supe io Adhesi e Slides on Leica Biosys ems (We zla ) zum
Einsa z. Dazu wu den Deckgläse N .1 on Th. Geye GmbH & Co. KG (Renningen)
e wende . Zum Pipe ie en des An ikö pe -Ansa zes wu den Biosphe e® ges op e
Fil e -Tips on SARSTEDT AG & Co. KG (Nümb ech ) genu z .
Me hoden 16
Die P oben de ddPCR wu den in das DG8™ Ca idge #1864008 (Bio-Rad Labo a-
o ies, Kali o nien, USA) pipe ie und mi einem DG8™ Gaske #1863009 (Bio-Rad
Labo a o ies, Kali o nien, USA) e schlossen. Die e igen D ople s we den in
ddPCR™ 96 well pla es #12001925 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien, USA) übe üh
und mi eine Pie cable Foil Hea Seal #1814040 (Bio-Rad Labo a o ies, Kali o nien,
USA) e siegel . Zum Pipe ie en wu den Biosphe e® ges op e Fil e -Tips on
SARSTEDT AG & Co. KG (Nümb ech ) e wende .
3 Me hoden
3.1 Immunhis ochemie
Zu Un e suchung de Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 in Magenka zinom-
gewebe wu den immunhis ochemische Fä bungen mi da ü spezi ischen An ikö pe n
du chge üh .
Die ü die hie du chge üh e immunhis ochemische Un e suchung e wende en Ge-
webep oben wa en alle in Fo malin ixie und in Pa a in eingebe e wo den (FFPE:
Fo malin- ixed pa a in-embedded issue). Aus diesen Pa a in-Blöcken wu den 2 µm
dicke Schni e he ges ell , welche au Objek äge n au geb ach und zu Fä bung ge-
nu z wu den.
Die immunhis ochemische Fä bung de FFPE-Gewebeschni e wu de am Bond-Max
au oma isie du chge üh . Sowohl ü SMARCA4 als auch SMARCE1 beinhal e e das
Fä bep o okoll eine Vo behandlung mi de Bond Epi ope Re ie al Solu ion 2 (ER2)
übe 20 Minu en. Fü die Fä bung zu Da s ellung de Exp ession on SMARCA4
wu de ein monoklonale Maus-An ikö pe gegen SMARCA4 in de Konzen a ion
1:400, mi Bond P ima y An ibody Diluen e dünn , angewende . Fü die Fä bung zu
Da s ellung de Exp ession on SMARCE1 wu de ein monoklonale Hasen-An ikö pe
gegen SMARCE1 in de Konzen a ion 1:300, mi Bond P ima y An ibody Diluen e -
dünn , angewende . Zu De ek ion de An ikö pe bindung wu de das Polyme Re ine
De ec ion Ki on Leica Biosys ems e wende , in welchem als Subs a DAB en hal en
wa . Als Gegen ä bung wu de Häma oxylin eingese z .
Nach de immunhis ochemischen Fä bung wu den die Gewebeschni e ü 20 Minu en
in 70%igen Alkohol geleg , mi Lei ungswasse und des illie em Wasse (dH2O) ge-
spül und anschließend in eine au s eigenden Alkohol eihe dehyd ie . Zule z wu den
Me hoden 23
Kaplan-Meie -Me hode bes imm . Um hie die Signi ikanz de Un e schiede zu bes im-
men, wu de de log- ank Tes angewand [56].

E gebnisse 24
4 E gebnisse
4.1 Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1
SMARCA4 und SMARCE1 we den nukleä exp imie . Die Exp ession on SMARCA4
konn e immunhis ochemisch sowohl in Tumo zellen als auch in nich neoplas ischem
und me aplas ischem Epi hel nachgewiesen we den. Ebendies gal auch ü die Ex-
p ession on SMARCE1. Hie konn e jedoch auch eine konsequen e und s a ke Ex-
p ession in Lymphozy en nachgewiesen we den, welche als in e ne Kon olle genu z
wu de. Die Fä bein ensi ä en de Immunhis ochemie eich en on 0 bis 3+ (s. Abbil-
dung 1). Dabei zeig en 50,1 % de ü SMARCA4 un e such en Fälle an eilig keine
Exp ession (0) im Tumo a eal. In 87,8 % kam an eilig eine schwache (1+), in 89,3 %
eine mäßige (2+) und in 53,1 % de Fälle eine s a ke (3+) Exp ession o . 66,9 % de
ü SMARCE1 un e such en Fälle zeig en an eilig keine (0) Exp ession im Tumo a eal.
In 97,2 % kam an eilig eine schwache (1+), in 76,9 % eine mäßige (2+) und in 17,9 %
de Fälle eine s a ke (3+) Exp ession o . Die Spanne de G öße de Fläche, die eine
Exp ession on SMARCA4 im Tumo a eal au wies, eich e ü die Ka ego ie „keine
Exp ession“ (0) on 0 % bis 100 % des gesam en Tumo a eals. Fü die Ka ego ien
„schwache Exp ession“ (1+), „mäßige Exp ession“ (2+) und „s a ke Exp ession“ (3+)
eich e die Spanne on 0 % bis 95 % des gesam en Tumo a eals. Fü SMARCE1
eich e die Spanne de G öße de Fläche, die keine Exp ession (0) im Tumo a eal
au wies on 0 % bis 100 % des gesam en Tumo a eals. Fü die Ka ego ie „schwache
Exp ession“ (1+) eich e die Spanne on 0 % bis 99 %, ü „mäßige Exp ession“ (2+)
on 0 % bis 95 % und ü „s a ke Exp ession“ (3+) on 0 % bis 90 % des gesam en
Tumo a eals. Sowohl ü SMARCA4 als auch ü SMARCE1 zeig e jeweils ein Fall kei-
nen Nachweis de Exp ession in Tumo zellen (0 x 100 % = His osco e 0) [56].
Insgesam zeig en 466 Fälle, die mi dem An ikö pe zum Nachweis de Exp ession
on SMARCA4 ge ä b wu den, un e schiedliche Kombina ionen on zwei ode meh
Fä bein ensi ä en. Ein Fall wies im gesam en Tumo be eich keine Exp ession on
SMARCA4 au und dami auch keine Kombina ion on un e schiedlichen Fä bein en-
si ä en. Die ü SMARCA4 nachgewiesenen Kombina ionen de Fä bein ensi ä en sind
die in Tabelle 4 au ge üh en.
E gebnisse 25
Tabelle 4: Kombina ionen de bei SMARCA4 nachgewiesenen Fä bein ensi ä en [56]
Kombina ion de
Fä bein ensi ä en
Anzahl de Fälle
An eil am gesam en Kollek i
0/ 1+
43
9,2 %
0/ 2+
4
0,9 %
1+/ 2+
66
14,1 %
2+/ 3+
38
8,1 %
0/ 1+/ 2+
101
21,6 %
0/ 1+/ 3+
2
0,4 %
0/ 2+/ 3+
10
2,1 %
1/ 2+/ 3+
129
27,6 %
0/ 1+/ 2+ / 3+
69
14,7 %
467 Fälle, die mi dem An ikö pe zum Nachweis de Exp ession on SMARCE1 ge-
ä b wu den, wiesen eben alls un e schiedliche Kombina ionen on zwei ode meh
Fä bein ensi ä en au . Ein Fall wies im gesam en Tumo be eich keine Exp ession on
SMARCE1 au und dami auch keine Kombina ion on un e schiedlichen Fä bein en-
si ä en. Die ü SMARCE1 nachgewiesenen Kombina ionen de Fä bein ensi ä en sind
die in Tabelle 5 au ge üh en.
Tabelle 5: Kombina ion de bei SMARCE1 nachgewiesenen Fä bein ensi ä en [56]
Kombina ion de
Fä bein ensi ä en
Anzahl de Fälle
An eil am gesam en Kollek i
0/ 1+
106
22.6 %
0/ 2+
1
0.2 %
1+/ 2+
95
20.3 %
1+/ 3+
1
0.2 %
2+/ 3+
9
1.9 %
0/ 1+/ 2+
181
38.7 %
0/ 2+/ 3+
2
0.4 %
1+/ 2+/ 3+
50
10.7 %
0/ 1+/ 2+/ 3+
22
4.7 %
E gebnisse 26
Wie hie da ges ell we den konn e, gib es eine Vielzahl an Kombina ionen de Fä -
bein ensi ä en in un e schiedlich g oßen Flächenan eilen de ü SMARCA4 und
SMARCE1 ge ä b en Tumo a eale. Diese Da en belegen eine he e ogene Exp ession
on SMARCA4 und SMARCE1 im Magenka zinom, sowohl als „g ey-scale“ (G aus u-
en, ineinande übe gehende Ände ung de Fä bein ensi ä en) als auch als „black-and-
whi e“- Mus e (Schwa z-Weiß, s a ke Fä bein ensi ä i au di ek ang enzende Tu-
mo a eale ohne Exp ession). Dabei lag sowohl ü SMARCA4 als auch ü SMARCE1
in de Meh hei de Fälle ein „g ey-scale“-Mus e o . Die nach olgende Abbildung 2
zeig jeweils einen exempla ischen Fall ü die zu o e wähn en Exp essionsmus e
[56].
Abbildung 2: He e ogenes Exp essionsmus e in SMARCA4 und SMARCE1
links: An i-SMARCA4 IHC (400- ach e g öße )
ech s: An i-SMARCE1 IHC (400 ach- e g öße )
© P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56]
4.2 Ko ela ion mi Pa ien encha ak e is ika
Säm liche im Folgenden e wähn en E gebnisse sind in Tabelle 6 und Tabelle 7 am
Ende on Kapi el 4.2 zusammenge ass .
Nachdem die Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 am Median dicho omisie
und mi den klinisch-pa hologischen Pa ien encha ak e is ika des S udienkollek i s
ko elie wu de, anden sich be ei s e s e au ällige We e in de S a is ik. Es zeig e
sich eine Ko ela ion ü SMARCA4 mi Mik osa eli enins abili ä und de Exp ession
E gebnisse 27
on ARID1A. Fü SMARCE1 konn e eben alls eine Ko ela ion mi Mik osa eli enin-
s abili ä , de Exp ession on ARID1A sowie de Exp ession on TP53 nachgewiesen
we den. Ansons en konn en wede ü die Exp ession on SMARCA4 noch on
SMARCE1 wei e e Ko ela ionen es ges ell we den (Tabelle 6 und 7). Im zwei en
Sch i wu den die Fälle des S udienkollek i s sowohl ü die Exp ession on
SMARCA4 als auch ü die Exp ession on SMARCE1 in Qua ile un e eil . Dazu
wu de ü SMARCA4 das 1. Qua il (His osco e <111) gegen die es lichen d ei Qua -
ile (His osco e ≥111) e glichen. Fü SMARCE1 wu de das 4. Qua il (His osco e
>170) gegen die e s en d ei Qua ile (His osco e ≤170) e glichen. Bei Anwendung
diese Ka ego isie ung konn en die olgenden Ko ela ionen es ges ell we den.
SMARCA4 ko elie e wei e hin mi Mik osa eli enins abili ä , de Exp ession on
SMARCA4 und zusä zlich de Exp ession on TP53, wäh end sich ü SMARCE1 nu
noch eine Ko ela ion mi Mik osa eli enins abili ä und de Exp ession on ARID1A
zeig e [56].
Beim Ve gleich de Exp ession on SMARCA4 mi de Exp ession on SMARCE1, um
die A des Ve hal ens beide Un e einhei en des SWI-/SNF-Komplexes zueinande zu
e mi eln, konn e nachgewiesen we den, dass eine nied ige Exp ession on
SMARCA4 mi eine nied igen Exp ession SMARCE1 ko elie e. Eben alls and sich
eine Ko ela ion zwischen eine hohen Exp ession on SMARCA4 und eine hohen
Exp ession on SMARCE1 [56].
Die Übe p ü ung de Dys egula ion des SWI-/SNF-Komplexes e gab einen signi ikan-
en Zusammenhang mi de Exp ession on ARID1A. Diese wu den ka ego isie in
„jede Exp ession“ e sus „komple e Ve lus de Exp ession“ sowie in „komple e Ve -
lus de Exp ession ode schwa z-weiß Mus e “ e sus „jede ande e Exp ession on
ARID1A“. Wei e hin ko elie e die Dys egula ion des SWI-/SNF-Komplexes mi de
Exp ession on TP53 sowie Mik osa eli enins abili ä [56].
Das Gesam übe leben und das umo spezi ische Übe leben hängen insbesonde e on
un e schiedlichen klinisch-pa hologischen Pa ien eneigenscha en ab. Diese sind bei-
spielsweise de Phäno yp nach Lau én, de TNM-S a us, das UICC-S adium, abe
auch das G ading, de Mik osa eli ens a us und das Vo handensein ode Fehlen on
ande en Bioma ke n. Dennoch konn e in de gesam en s a is ischen Auswe ung kein
E gebnisse 28
Zusammenhang zwischen de Exp ession on SMARCA4 ode SMARCE1 und dem
Pa ien enübe leben nachgewiesen we den (siehe Abb. 3 - 6) [56].
Tabelle 6: S a is ische Auswe ung Exp ession on SMARCE1 und klinisch-pa hologische Pa i-
en encha ak e is ika
(1) Fishe 's exac Tes , (2) Kendall's au Tes , (3) log- ank Tes , die nach angewand e Mul iple-Tes ing-Ko ek u signi-
ikan e bliebenen We e wu den mi * ma kie . Teile diese Tabelle wu den be ei s publizie
© P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56].
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 In ensi ä 3+ p äsen
To al
His osco e nied-
ig
(< 120)
His osco e hoch
(≥ 120)
Q123
Q4
ehl
p äsen
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
To al
232
236
358
110
384
(82,1)
84
(17,9)
Geschlech
n p(1
468
0,704
468
0,824
468
0,265
Weiblich
179
(38,2)
91
(50,8)
88
(49,2)
138
(77,1)
41
(22,9)
142
(79,3)
37
(20,7)
Männlich
289
(61,8)
141
(48,8)
148
(51,2)
220
(76,1)
69
(23,9)
242
(83,7)
47
(16,3)
Al e
n p(1
468
0,355
468
0,514
468
1,000
< 68 Jah e
237
(50,6)
112
(47,3)
125
(52,7)
178
(75,1)
59
(24,9)
194
(81,9)
43
(18,1)
>= 68 Jah e
231
(49,4)
120
(51,9)
111
(48,1)
180
(77,9)
51
(22,1)
190
(82,3)
41
(17,7)
Lokalisa ion
n p(1
466
0,046
466
0,077
466
0,026
P oximal
146
(31,3)
62
(42,5)
84
(57,5)
104
(71,2)
42
(28,8)
111
(76,0)
35
(24,0)
Dis al
320
(68,7)
169
(52,8)
151
(47,2)
253
(79,1)
67
(20,9)
272
(85,0)
48
(15,0)
Lau én Phä-
no yp
n p(1
468
0,884
468
0,408
468
0,023
In es inal
240
(51,3)
118
(49,2)
122
(50,8)
178
(74,2)
62
(25,8)
190
(79,2)
50
(20,8)
Di us
148
(31,6)
72
(48,6)
76
(51,4)
116
(78,4)
32
(21,6)
127
(85,8)
21
(14,2)
Gemisch
31
(6,6)
15
(48,4)
16
(51,6)
27
(87,1)
4
(12,9)
30
(96,8)
1
(3,2)
Unklassi-
izie ba
49
(10,5)
27
(55,1)
22
(44,9)
37
(75,5)
12
(23,5)
37
(75,5)
12
(24,5)
G ading
n p(1
468
0,588
468
0,305
468
0,570
G1 / G2
110
(23,5)
52
(47,3)
58
(52,7)
80
(72,7)
30
(27,3)
88
(80,0)
22
(20,0)
G3 / G4
358
(76,5)
180
(50,3)
178
(49,7)
278
(77,7)
80
(22,3)
296
(82,7)
62
(17,3)
T
n p(1
468
0,522
468
0,626
468
0,208
T1a / T1b
58
(12,4)
27
(46,6)
31
(53,4)
45
(77,6)
13
(22,4)
48
(82,8)
10
(17,2)
T2
53
(11,3)
30
(56,6)
23
(43,4)
46
(86,8)
7
(13,2)
42
(79,2)
11
(20,8)
T3
185
(39,5)
84
(45,4)
101
(54,6)
128
(69,2)
57
(30,8)
146
(78,9)
39
(21,1)
T4a / T4b
172
(36,8)
91
(52,9)
81
(47,1)
139
(80,8)
33
(19,2)
148
(86,0)
24
(14,0)
N
n p(1
467
0,949
467
0,742
467
0,528
N0
134
(28,6)
68
(50,7)
66
(49,3)
106
(79,1)
28
(20,9)
109
(81,3)
25
(18,7)
N1
64
(13,7)
28
(43,8)
36
(56,3)
40
(62,5)
24
(37,5)
46
(71,9)
18
(28,1)
N2
84
(18,0)
45
(53,6)
39
(46,4)
67
(79,8)
17
(20,2)
76
(90,5)
8
(9,5)
N3a/b
185
(39,6)
91
(49,2)
94
(80,8)
144
(77,8)
41
(22,2)
152
(82,2)
33
(17,8)

E gebnisse 29
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 In ensi ä 3+ p äsen
To al
His osco e nied-
ig
(< 120)
His osco e hoch
(≥ 120)
Q123
Q4
ehl
p äsen
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
M
n p(1
468
0,241
468
0,098
468
0,647
M0
378
(80,8)
182
(48,1)
196
(51,9)
283
(74,9)
95
(25,1)
308
(81,5)
70
(18,5)
M1
90
(19,2)
50
(55,6)
40
(44,4)
75
(83,3)
15
(16,7)
76
(84,4)
14
(15,6)
UICC-S a-
dium
n p(1
467
0,450
467
0,441
467
0,638
IA / IB
81
(17,3)
41
(50,6)
40
(49,4)
66
(81,5)
15
(18,5)
67
(82,7)
14
(17,3)
IIA / IIB
99
(21,2)
46
(46,5)
53
(53,5)
69
(69,7)
30
(30,3)
79
(79,8)
20
(20,2)
IIIA / IIIB / IIIC
197
(42,2)
95
(48,2)
102
(51,8)
147
(74,6)
50
(25,4)
161
(81,7)
36
(18,3)
IV
90
(19,3)
50
(55,6)
40
(44,4)
75
(83,3)
15
(16,7)
76
(84,4)
14
(15.6)
LN Ra io
n p(1
467
0,926
467
0,329
467
0,336
nied ig
(<0.189)
227
(48,6)
112
(49,3)
115
(50,7)
169
(74,4)
58
(25,6)
182
(80,2)
45
(19,8)
hoch
(≥0.189)
240
(51,4)
120
(50,0)
10
(50,0)
188
(78,3)
52
(21,7)
201
(83,8)
39
(16,3)
L
n p(1
449
0,131
449
0,377
449
0,271
L0
219
(48,8)
115
(52,5)
104
(47,5)
171
(78,1)
48
(21,9)
184
(84,0)
35
(16,0)
L1
230
(51,2)
104
(45,2)
126
(54,8)
171
(74,3)
59
(25,7)
183
(79,6)
47
(20,4)
V
n p(1
448
0,290
448
0,154
448
0,170
V0
399
(89,1)
198
(49,6)
201
(50,4)
308
(77,2)
91
(22,8)
329
(82,5)
70
(17,5)
V1
49
(10,9)
20
(40,8)
29
(59,2)
33
(67,3)
16
(32,7)
36
(73,5)
13
(26,5)
R
n p(1
464
0,575
464
1,000
464
1,000
R0
406
(87,5)
198
(48,8)
208
(51,2)
310
(76,4)
96
(23,6)
333
(82,0)
73
(18,0)
R1 / R2
58
(12,5)
31
(53,4)
27
(46,6)
45
(77,6)
13
(22,4)
48
(82,8)
10
(17,2)
HER2
n p(1
437
0,223
437
0,305
437
0,038
Nega i
401
(91,8)
204
(50,9)
197
(49,1)
310
(77,3)
91
(22,7)
336
(83,8)
65
(16,2)
Posi i
36
(8,2)
14
(38,9)
22
(61,1)
25
(69,4)
11
(30,6)
25
(69,4)
11
(30,6)
MET
n p(1
456
0,147
456
1,000
456
0,635
Nega i
423
(92,8)
216
(51,1)
207
(48,9)
325
(76,8)
98
(23,2)
349
(82,5)
74
(17,5)
Posi i
33
(6,9)
12
(36,4)
21
(63,6)
26
(78,8)
7
(21,2)
26
(78,8)
7
(21,2)
ARID1A
jede Exp es-
sion s.
komple e
Ve lus
n p(1
415
0,000*
415
0,000
415
0,165
His osco e
= 0 (Ve lus )
45
(10,8)
38
(84,4)
7
(15,6)
43
(95,6)
2
(4,4)
40
(88,9)
5
(11,1)
His osco e
> 0
370
(89,2)
157
(42,4)
213
(57,6)
268
(72,4)
102
(27,6)
295
(79,7)
75
(20,3)
ARID1A
B/W s.
non-B/W
n p(1
392
0,075
392
0,215
392
0,093
non-B/W
370
(94,4)
157
(42,4)
213
(57,6)
268
(72,4)
102
(27,6)
295
(79,7)
75
(20,3)
B/W
22
(5,6)
14
(63,6)
8
(36,4)
19
(86,4)
3
(13,6)
21
(95,5)
1
(4,5)
ARID1A
Ve lus o.
B/W s.
Res
n p(1
437
0,000*
437
0,000
437
0,027
E gebnisse 30
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 In ensi ä 3+ p äsen
To al
His osco e nied-
ig
(< 120)
His osco e hoch
(≥ 120)
Q123
Q4
ehl
p äsen
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
Res
370
(84,7)
157
(42,4)
213
(57,6)
268
(72,4)
102
(27,6)
295
(79,7)
75
(20,3)
Ve lus o.
B/W
67
(15,3)
52
(77,6)
15
(22,4)
62
(92,5)
5
(7,5)
61
(91,0)
6
(9,0)
TP53 His o-
sco e Me-
dian
n p(1
459
0,007
459
0,743
459
0,116
nied ig (His-
osco e
≤ 91.5)
230
(50,1)
128
(55,7)
102
(44,3)
177
(77,0)
53
(23,0)
195
(84,8)
35
(15,2)
hoch (His o-
sco e
> 91.5)
229
(49,9)
98
(42,8)
131
(57,2)
173
(75,5)
56
(24,5)
181
(79,0)
48
(21,0)
TP53 His o-
sco e Qua -
ile
n p(1
459
0,020
459
0,038
459
0,398
Q1/Q4
229
(49,9)
100
(43,7)
129
(56,3)
165
(72,1)
64
(27,9)
184
(80,3)
45
(19,7)
Q2/Q3
230
(50,1)
126
(54,8)
104
(45,2)
185
(80,4)
45
(19,6)
192
(83,5)
38
(16,5)
TP53 IHC
G oup
n p(1
459
0,448
459
0,075
459
1,000
No mal
(IHC0 < 90%
and IHC3 <
50%)
274
(59,7)
139
(50,7)
135
(49,3)
217
(79,2)
57
(20,8)
224
(81,8)
50
(18,2)
Ex em
(IHC0 ≥ 90%
o. IHC3 ≥
50%)
185
(40,3)
87
(47,0)
98
(53,0)
133
(71,9)
52
(28,1)
152
(82,2)
33
(17,8)
TP53 Mu a-
ion
n p(1
107
0,153
107
0,240
107
0,445
w o. silen
Mu a ion
72
(67,3)
40
(55,6)
32
(44,4)
57
(79,2)
15
(20,8)
59
(81,9)
13
(18,1)
Mu a ion
35
(32,7)
14
(40,0)
21
(60,0)
24
(68,6)
11
(31,4)
26
(74,3)
9
(25,7)
SMAD4 Cy
His osco e
Q123/Q4
n p(1
458
0,050
458
0,220
458
0,128
Q123
364
(79,5)
189
(51,9)
175
(48,1)
283
(77,7)
81
(22,3)
305
(83,8)
59
(16,2)
Q4
94
(20,5)
38
(40,4)
56
(59,6)
67
(71,3)
27
(28,7)
72
(76,6)
22
(23,4)
SMAD4 Nuc
HSco e0
n p(1
458
0,707
458
0,824
458
0,220
p äsen
260
(56,8)
131
(50,4)
129
(49,6)
200
(76,9)
60
(23,1)
219
(84,2)
41
(15,8)
ehl
198
(43,2)
96
(48,5)
102
(51,5)
150
(75,8)
48
(24,2)
158
(79,8)
40
(20,2)
H. pylo i
n p(1
396
0,674
396
1,000
396
0,267
Nega i
336
(84,8)
170
(50,6)
166
(49,4)
259
(77,1)
77
(22,9)
275
(81,8)
61
(18,2)
Posi i
60
(15,2)
28
(46,7)
32
(53,3)
46
(76,7)
14
(23,3)
53
(88,3)
7
(11,7)
EBV-S a us
n p(1
453
0,036
453
0,583
453
1,000
Nega i
434
(95,8)
210
(48,4)
224
(51,6)
330
(76,0)
104
(24,0)
356
(82,0)
78
(18,0)
Posi i
19
(4,2)
14
(73,7)
5
(26,3)
16
(84,2)
3
(15,8)
16
(84,2)
3
(15,8)
MSI S a us
n p(1
452
0,000*
452
0,001
452
0,170
MSS
417
(92,3)
194
(46,5)
223
(53,5)
311
(74,6)
106
(25,4)
339
(81,3)
78
(18,7)
MSI
35
(7,7)
30
(85,7)
5
(14,3)
34
(97,1)
1
(2,9)
32
(91,4)
3
(8,6)
PIK3CA
n p(1
461
1,000
461
0,806
461
1,000
Wild yp
437
(94,8)
219
(50,1)
218
(49,9)
336
(76,9)
101
(23,1)
359
(82,2)
78
(17,8)
E gebnisse 31
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 Exp ession
im Zellke n
SMARCE1 In ensi ä 3+ p äsen
To al
His osco e nied-
ig
(< 120)
His osco e hoch
(≥ 120)
Q123
Q4
ehl
p äsen
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
mu ie
24
(5,2)
12
(50,0)
12
(50,0)
18
(75,0)
6
(25,0)
20
(83,3)
4
(16,7)
KRAS
n p(1
461
0,323
461
0,382
461
1,000
Wild yp
444
(96,3)
220
(49,5)
224
(50,5)
339
(76,4)
105
(23,6)
365
(82,2)
79
(17,8)
mu ie
17
(3,7)
11
(64,7)
6
(35,3)
15
(88,2)
2
(11,8)
14
(82,4)
3
(17,6)
RHOA
n p(1
400
0,803
400
0,245
400
0,200
Wild yp
384
(96,0)
178
(46,4)
206
(53,6)
290
(75,5)
94
(24,5)
313
(81,5)
71
(18,5)
mu ie
16
(4,0)
8
(50,0)
8
(50,0)
10
(62,5)
6
(37,5)
11
(68,8)
5
(31,3)
Jede Mu a-
ion
n p(1
37
0,515
37
1,000
37
0,713
Wild yp
23
(62,2)
11
(47,8)
12
(52,2)
15
(65,2)
8
(34,8)
17
(73,9)
6
(26,1)
Mind. 1 Mu-
a ion
14
(37,8)
5
(35,7)
9
(64,3)
10
(71,4)
4
(28,6)
9
(64,3)
5
(35,7)
E-Cadhe in
n p(1
431
0,127
431
0,197
431
0,062
nega i
317
(73,5)
166
(52,4)
151
(47,6)
248
(78,2)
69
(21,8)
268
(84,5)
49
(15,5)
posi i
114
(26,5)
50
(43,9)
64
(56,1)
82
(71,9)
32
(28,1)
87
(76,3)
27
(23,7)
ß-Ca enin
n p(1
433
0,122
433
0,451
nega i
245
(56,6)
128
(52,2)
117
(47,8)
204
(83,3)
41
(16,7)
posi i
188
(43,4)
84
(44,7)
104
(55,3)
151
(80,3)
37
(19,7)
O e all Su -
i al [Mo-
na e]
p(3)
456
0,931
456
0,498
456
0,913
To al / E en s
/ zensie
224/173/51
232/181/51
347/269/78
109/85/24
374/288/86
82/66/16
Median Su -
i al
14,0 ± 1,8
15,6 ± 1,4
14,1 ± 1,2
16,7 ± 2,6
14,6 ± 1,1
16,0 ± 4,0
95% C.I.
10,5 – 17,5
12,9 – 18,3
11,7 – 16,4
11,7 –
21,7
12,6 – 16,7
8,2 -23,8
Tumo Spe-
ci ic Su i-
al [Mona e]
p(3)
427
0,610
427
0,320
427
0,471
To al / E en s
/ zensie
207/142/65
220/147/73
323/221/102
104/68/36
349/238/111
78/51/27
Median Su -
i al
14,7 ± 1,9
17.1 ± 1,9
15,5 ± 1,5
19,5 ± 3,3
15,5 ± 1,4
22,2 ±
2,7
95% C.I.
11,0 – 18,3
13,3 – 20,8
12,6 – 18,3
13,1 –
25,9
12,8 – 18,2
16,9 -
27,5
E gebnisse 32
Tabelle 7: S a is ische Auswe ung de Exp ession on SMARCA4 und de Dys egula ion des
SWI-/SNF-Komplexes
(1) Fishe 's exac Tes , (2) Kendall's au Tes , (3) log- ank Tes , die nach angewand e Mul iple-Tes ing-Ko ek u signi-
ikan e bliebenen We e wu den mi * ma kie . Teile diese Tabelle wu den be ei s publizie
© P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley & Sons L d. [56].
SMARCA4 Exp ession
im Zellke n
SMARCA4 Exp ession
im Zellke n
Dys egula ion on
SMARCE1 und SMARCA4
To al
His osco e nied-
ig
(≤ 175)
His osco e hoch
(> 175)
Q1
Q234
Beide His osco e
nied ig
Beide His o-
sco e hoch
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
n
(%)
To al
236
231
117
350
148
(31,6)
147
(31,4)
Ge-
schlech
n
p(1
467
0,128
467
0,443
295
0,476
Weiblich
179
(38,2)
82
(45,8)
97
(54,2)
41
(22,9)
138
(77,1)
55
(47,4)
61
(52,6)
Männlich
289
(61,8)
154
(53,5)
134
(46,5)
76
(26,4)
212
(73,6)
93
(52,0)
86
(48,0)
Al e
n
p(1
467
0,267
467
0,749
295
0,201
< 68 Jah e
237
(50,6)
113
(47,9)
123
(52,1)
61
(25,8)
175
(74,2)
68
(46,3)
79
(53,7)
>= 68
Jah e
231
(49,4)
123
(53,2)
108
(46,8)
56
(24,2)
175
(75,8)
80
(54,1)
68
(45,9)
Lokalisa-
ion
n
p(1
465
0,369
465
0,731
294
0,526
P oximal
146
(31,3)
79
(54,1)
67
(45,9)
35
(24,0)
111
(76,0)
42
(47,2)
47
(52,8)
Dis al
320
(68,7)
157
(49,2)
162
(50,8)
82
(25,7)
237
(74,3)
106
(51,7)
99
(48,3)
Lau én
Phäno yp
n
p(1
467
0,031
467
0,179
295
0,210
In es inal
240
(51,3)
134
(56,1)
105
(43,9)
69
(28,9)
170
(71,1)
82
(54,3)
69
(45,7)
Di us
148
(31,6)
63
(42,6)
85
(57,4)
30
(20,3)
118
(79,7)
39
(42,9)
52
(57,1)
Gemisch
31
(6,6)
12
(38,7)
19
(61,3)
5
(16,1)
26
(83,9)
8
(40,0)
12
(60,0)
Unklassi-
izie ba
49
(10,5)
27
(55,1)
22
(44,9)
13
(26,5)
36
(73,5)
19
(57,6)
14
(42,4)
G ading
n
p(1
467
0,021
467
0,377
295
0,266
G1 / G2
110
(23,5)
66
(60,6)
43
(39,4)
31
(28,4)
78
(71,6)
38
(56,7)
29
(43,3)
G3 / G4
358
(76,5)
170
(47,5)
188
(52,5)
86
(24,0)
272
(76,0)
110
(48,2)
118
(51,8)
T
n
p(1
467
0,434
467
0,592
295
0,878
T1a / T1b
58
(12,4)
25
(43,9)
32
(56,1)
15
(26,3)
42
(73,7)
14
(42,4)
19
(57,6)
T2
53
(11,3)
34
(64,2)
19
(35,8)
13
(24,5)
40
(75,5)
21
(67,7)
10
(32,3)
T3
185
(39,5)
95
(51,4)
90
(48,6)
49
(26,5)
136
(73,5)
59
(47,6)
65
(52,4)
T4a / T4b
172
(36,8)
82
(47,7)
90
(52,3)
40
(23,3)
132
(76,7)
54
(50,5)
53
(49,5)
N
n
p(1
466
0,153
466
0,144
294
0,349
N0
134
(28,6)
76
(56,7)
58
(43,3)
38
(28,4)
96
(71,6)
46
(56,1)
36
(43,9)
N1
64
(13,7)
28
(43,8)
36
(56,3)
18
(28,1)
46
(71,9)
17
(40,5)
25
(59,5)
N2
84
(18,0)
45
(54,2)
38
(45,8)
21
(25,3)
62
(74,7)
31
(56,4)
24
(43,6)
N3a/b
185
(39,6)
87
(47,0)
98
(53,0)
40
(21,6)
145
(78,4)
54
(47,0)
61
(53,0)
M
n
p(1
467
0,348
467
0,417
295
1,000
M0
378
(80,8)
195
(51,7)
182
(48,3)
98
(26,0)
279
(74,0)
118
(50,0)
118
(50,0)
M1
90
(19,2)
41
(45,6)
49
(54,4)
19
(21,1)
71
(78,9)
30
(50,8)
29
(49,2)
UICC-S a-
dium
n
p(1
466
0,208
466
0,173
294
0,731
E gebnisse 39
Tabelle 8: Ve gleich SMARCE1 und HER2 IHC und CISH
Au ge üh is de jeweilige His osco e des un e such en Falls, welche die Ausp ägung de Exp ession on
SMARCE1 wiede geben soll. Sowie die Ausp ägung de Exp ession on HER2 in de Immunhis ochemie, und die
Ampli ika ion on HER2 in de CISH, welche in eine o angegangenen S udie des Ins i u s ü Pa hologie am
UKSH Kiel un e such wu den [57].Teile diese Tabelle wu den be ei s publizie © P ies e al. Cance Medicine
published by John Wiley & Sons L d. [56]
N .
SMARCE1
His osco e
HER2 Immunhis o-
chemie
HER2 Ampli i-
ka ion
Beme kung
Komple e Übe eins immung
31
280
2+
+
25
255
3+
X
HER2 Ampli ika ion nich bewe ba .
26
250
3+
+
17
230
3+
+
18
220
3+
+
34
215
3+
+
30
185
3+
+
32
185
2+
+
8
175
3+
+
4
165
3+
+
5
160
3+
+
13
160
2+
+
9
140
3+
+
24
140
3+
X
HER2 Ampli ika ion nich bewe ba .
1
130
3+
+
6
110
2+
+
27
105
3+
+
14
95
3+
+
15
85
3+
+
2
50
3+
+
Pa ielle Übe eins immung
11
230
3+
+
Pa ielle Übe eins immung. SMARCE1 und HER2 posi-
i e Tumo a eale s immen übe ein. Es zeig sich jedoch
ein s a k posi i es A eal ü SMARCE1, welches HER2
nega i is .
12
190
3+
+
Die Exp ession on HER2 is he e ogen. HER2 posi i e
A eale sind s a k SMARCE1 posi i .
33
180
3+
+
Die Exp ession on HER2 is he e ogen. Die Exp es-
sion on SMARCE1 is wei e b ei e , zeig jedoch
keine Va ia ion.
7
170
3+
+
De G oß eil des Tumo s is muzinös. Übe eins im-
mung nu im nich muzinösen Tumo an eil. De muzi-
nöse Tumo an eil is komple HER2 nega i abe
SMARCE1 posi i .
19
115
3+
+
Die Exp ession on HER2 is he e ogen. HER2 posi i e
A eale sind s a k SMARCE1 posi i .
28
110
2+
+
Pa ielle Übe eins immung. SMARCE1 und HER2 posi-
i e Tumo a eale s immen übe ein. Es zeig sich jedoch
ein s a k posi i es A eal ü SMARCE1, welches HER2
nega i is .
29
85
3+
X
HER2 nega i e Tumo a eale sind eilweise SMARCE1
posi i . HER2 Ampli ika ion nich bewe ba .

E gebnisse 40
N .
SMARCE1
His osco e
HER2 Immunhis o-
chemie
HER2 Ampli i-
ka ion
Beme kung
21
75
3+
+
Die Exp ession on HER2 is he e ogen. HER2 posi i e
A eale sind s a k SMARCE1 posi i .
Keine Übe eins immung
35
170
3+
X
HER2 posi i e und SMARCE1 posi i e A eale sind un-
e schiedlich e eil . HER2 Ampli ika ion nich bewe -
ba .
16
165
3+
X
G oß lächig HER2 posi i e A eale sind SMARCE1 ne-
ga i . HER2 Ampli ika ion nich bewe ba .
23
120
2+
+
Das kleine HER2 posi i e A eal is komple SMARCE1
nega i . G oße SMARCE1 posi i e A eale sind HER2
nega i .
22
105
3+
+
De g oße HER2 posi i e Be eich is in de SMARCE1
Fä bung nich o handen. De kleine HER2 posi i e Be-
eich, welche in de SMARCE1 Fä bung en hal en is ,
is SMARCE1 nega i . G oße SMARCE1 posi i e A e-
ale sind HER2 nega i .
20
70
3+
X
Die HER2 posi i en A eale sind zum Teil SMARCE1
posi i und nega i . HER2 Ampli ika ion nich bewe ba .
36
50
3+
+
SMARCE1 is g öß en eils nega i (His osco e 50!). Die
posi i en A eale ü HER2 und SMARCE1 sind un e -
schiedlich e eil .
3
1
3+
+
Das kleine HER2 posi i e A eal is komple SMARCE1
nega i (His osco e 1!).
10
/
Kein Gewebe ü SMARCE1 Immunhis ochemie o -
handen.
37
100
Das HER2 posi i e A eal is in de Fä bung ü
SMARCE1 au G und eine ande en Tumo ebene nich
o handen.
4.4 Ampli ika ion on SMARCE1 in de ddPCR
Die Analyse de Ampli ika ion mi Hil e de ddPCR e gab eine Ampli ika ion on
SMARCE1 in 4 on 34 Fällen. Dabei wu den Fälle mi eine CNV (Copy-Numbe -Va i-
a ion) > 3 als ampli izie gewe e . Die G öße de CNV eich e dabei on 3,99 (e s e
ddPCR) /3,81(zwei e ddPCR) bis 20/19,3 (siehe Tabelle 9). In 3 Fällen lag nich aus-
eichend Ma e ial ü eine zwei e ddPCR o [56].
4.5 Ampli ika ion on SMARCE1 und ERBB2
Die du chge üh e ddPCR zeig e in 4 on 34 un e such en Fällen eine Ampli ika ion
on SMARCE1. Bei d ei on diesen Fällen wa zu o schon au eine Ampli ika ion on
ERBB2 un e such und als ampli izie klassi izie wo den [57]. Dami konn e in 3 on
4 (75%) Fällen eine Ko-Ampli ika ion on SMARCE1 und ERBB2 nachgewiesen we -
den. In einem Fall lag zwa eine Ampli ika ion on ERBB2 o , es konn e jedoch keine
E gebnisse 41
Ampli ika ion on SMARCE1 ge unden we den. Die olgende Tabelle 3.6 s ell die E -
gebnisse de Ampli ika ionsanalyse on SMARCE1 in Gänze da [56].
Tabelle 9: Ampli ika ionsanalyse on SMARCE1 du ch ddPCR
Angegeben sind die G öße de Tumo a eale in de jeweiligen in de Immunhis ochemie nachgewie-
sene Exp essionsin ensi ä on SMARCE1, die We e de CNV aus de e s en und zwei en ddPCR mi
de zugehö igen abschließenden Bewe ung sowie die Da en des S udienkollek i s zum Ampli ika i-
onss a us on HER2 aus CISH-Un e suchungen o angegangene S udien des Ins i u s ü Pa hologie
am UKSH Kiel [57]. In 3 Fällen lag kein Ma e ial ü eine zwei e ddPCR o : n.a. = nich anwendba .
Teile diese Tabelle wu den be ei s publizie © P ies e al. Cance Medicine published by John Wiley &
Sons L d. [56]
N .
SMARCE1 In ensi ä 0 %-A eal
SMARCE1 In ensi ä 1+ %-A eal
SMARCE1 In ensi ä 2+ %-A eal
SMARCE1 In ensi ä 3+ %-A ea
SMARCE1 His osco e
CNV SMARCE1 e s e ddPCR
CNV SMARCE1 zwei e ddPCR
SMARCE1 Ampli ika ion
ERBB2 Ampli ika ion
Po en iell ampli izie e Fälle mi hohe SMARCE1 Exp ession
1
0
30
10
60
230
2,33
2,48
-
-
2
0
10
10
80
270
3,99
3,81
+
-
3
0
10
0
90
280
2,08
2,39
-
-
4
0
0
70
30
230
2,08
2,08
-
-
5
0
10
50
40
230
20,00
19,30
+
+
6
0
15
65
20
205
2,56
2,59
-
-
7
0
20
10
70
250
10,4
11,40
+
+
8
0
0
80
20
220
2,29
2,36
-
-
9
0
5
35
60
255
2,29
2,51
-
-
10
5
40
35
20
170
2,77
2,85
-
-
11
10
0
70
20
200
2,19
2,20
-
-
12
0
5
10
85
280
8,82
9,6
+
+
13
0
5
70
25
220
2,31
2,21
-
-
14
0
0
30
70
270
1,89
1,94
-
-
15
0
0
60
40
240
2,06
n.a.
-
-
16
0
20
50
30
210
2,03
2,27
-
-
Po en iell nich ampli izie e Fälle mi nied ige SMARCE1 Exp ession
17
95
5
0
0
5
2,42
2,59
-
-
18
95
5
0
0
5
2,24
2,90
-
-
19
95
5
0
0
5
2,01
2,37
-
-
20
95
5
0
0
5
2,23
2,53
-
-
E gebnisse 42
21
0
10
90
0
190
2,83
2,83
-
-
22
5
0
95
0
190
2,21
n.a.
-
+
23
0
5
90
5
200
2,28
2,44
-
-
24
1
5
90
4
197
2,3
2,38
-
-
25
0
10
90
0
190
2,84
3,14
-
-
26
0
0
90
10
210
2,35
2,48
-
-
27
0
10
89
1
191
2,55
2,31
-
-
28
0
0
95
5
205
2,31
2,24
-
-
29
0
5
93
2
197
2,26
n.a.
-
-
30
0
5
95
0
195
2,6
2,57
-
-
31
0
0
95
5
205
1,91
1,95
-
-
32
0
10
85
5
195
3
3,30
-
-
33
5
5
80
10
195
2,55
2,42
-
-
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2,42
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-
Diskussion 43
5 Diskussion
De SWI-/SNF-Komplex is als Ch oma in-Remodelle in de Lage, epigene ische Ve -
ände ungen zu e mi eln. Dies bie e Raum ü neue Möglichkei en in de zukün igen
Medizin, speziell in de Diagnos ik und The apie on K ebspa ien en. Dennoch is de
po en ielle Ein luss eine Dys egula ion dieses Komplexes wei es gehend unbekann ,
so auch in Bezug au das Magenka zinom. Zu einigen Un e einhei en des SWI-/SNF-
Komplexes gab es in de Ve gangenhei be ei s einzelne S udien, welche jedoch
haup sächlich aus dem asia ischen Raum s amm en. Dies is zunächs nach ollzieh-
ba , is hie doch die Inzidenz ü Magenka zinome im wel wei en Ve gleich am höchs-
en [1]. Dennoch is nich kla , ob sich die E gebnisse auch au die Wel be ölke ung
übe agen lassen. So gib es doch zahl eiche Umwel ein lüsse, die zu En s ehung
eines Magenka zinoms bei agen können. Un e ande em gel en die E näh ungsge-
wohnhei en, welche sich abhängig on de jeweiligen Kul u s a k un e scheiden kön-
nen, als Ein luss ak o in de Ä iopa hogenese (siehe Kapi el 1.1.2 „Ä iopa hoge-
nese“)[14, 15, 18–20, 22, 23]. Eine kü zlich e schienene S udie konn e zeigen, dass
eine hohe Exp ession on SMARCE1 zu eine schlech e en P ognose üh e und die
Me as asie ung o an ieb [53]. Die ak uelle S udienlage zum Ein luss de Un e einhei
SMARCA4 au die Tumo biologie is ambi alen . Einige kommen zu dem E gebnis,
eine hohe Exp ession sei mi einem o angesch i enen Tumo s adium und eine
schlech e en P ognose assoziie [45, 67], ande e weisen au eine Funk ion als Tu-
mo supp esso hin [42, 47]. In diese S udie wu de eine unabhängige Koho e on
wes lichen Magenka zinomen au den po enziellen umo biologischen Ein luss bezüg-
lich de Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 sowie die Exp essionsmus e
selbs und Zusammenhänge mi wich igen gene ischen Cha ak e is ika wie Mik osa -
eli ens abili ä , un e such [56].
5.1 Me hodische Diskussion
Zum Nachweis on SMARCA4 und SMARCE1 au P o einebene wu de die Immunhis-
ochemie gewähl . Die Immunhis ochemie gil als gängiges und e lässliches Ve ah-
en zu Da s ellung de Exp ession spezi ische Genp oduk e. Nach wiede hol en Fä -
bungen zu E ablie ung de An ikö pe e gab de An ikö pe zu SMARCA4-Fä bung
die bes en E gebnisse in de Ve dünnung 1:400 mi EDTA als Pu e . Fü SMARCE1
Diskussion 44
wu de die Fä bung mi eine Ve dünnung des An ikö pe s in 1:300 mi EDTA als Pu e
e ablie . Die Fä bungen mi Ci a e gaben zwa eben alls gu e E gebnisse, jedoch
muss e dazu eine ge inge e Ve dünnung de An ikö pe genu z we den, welches ei-
nen höhe en Ve b auch an An ikö pe insgesam bedeu e hä e. Aus diesen G ünden
en schied ich mich, bei gleichwe igem E gebnis ü eine Fä bung mi EDTA als Pu e .
Als in e ne Kon olle des Fä bee olgs on SMARCA4 und SMARCE1 wu den das
nich neoplas ische Epi hel sowie Lymphozy en ü SMARCE1 genu z . Die Fä bung
selbs e olg e au oma isie , sodass Schwankungen in de Du ch üh ung du ch die
du ch üh ende Pe son auszuschließen sind. Die Ve dünnung des jeweilig genu z en
An ikö pe s e olg e jedoch händisch, hie sind ge inge Inkonsis enzen denkba .
Zu Auswe ung de immunhis ochemischen Fä bung on SMARCA4 und SMARCE1
wu de de His osco e genu z , welche au eine indi iduellen Einschä zung des Un-
e suche s zu In ensi ä und an eilige G öße de Tumo a eale be uh . Um eine Be-
s ändigkei in de Einschä zung de In ensi ä en zu gewäh leis en, wu den o ab Ve -
gleichs älle ausgewähl und wäh end de Auswe ung hinzugezogen. Dennoch be uh
die Angabe des An eils eine In ensi ä inne halb des abgebilde en Tumo gewebes au
Schä zungen und kann on de exak en, nich bes immba en P ozen zahl abweichen.
Es wi d da on ausgegangen, dass sich Ungenauigkei en beim Schä zen du ch ebenso
o o kommendes Übe - wie Un e schä zen desselben Un e suche s ausgleichen. Die
Auswe ung de immunhis ochemischen Fä bungen mi Hil e des His osco es wu den
dahe nu du ch einen Un e suche du chge üh . Die so un e such en Fälle wu den
e s nach Abschluss de Auswe ung anhand des Medians dicho omie und in Qua ile
einge eil , um eine Beein lussung de E gebnisse du ch die Auswe ung de IHC selbs
zu e hinde n.
Zu Auswe ung eine po en iellen Ko-Exp ession on SMARCE1 und He 2/neu wu de
beim immunhis ochemischen Ve gleich sowie beim Ve gleich mi de CISH da au ge-
ach e , dass die jeweilige genu z e Tumo ebene inne halb eines Falls dieselbe wa
ode zumindes an eilig mi e ass , um alsch nega i e E gebnisse du ch in a umo ale
He e ogeni ä und S ichp oben ehle auszuschließen ode wenigs ens zu eduzie en.
Fü die Analyse de Ampli ika ion on SMARCE1 kam die ddPCR zu Anwendung, da
es keine komme ziellen Sonden ü eine in si u-Hyb idisie ung gab. Die ddPCR bie e
im Ve gleich zu he kömmlichen PCR-Ve ah en wie de qPCR (Real-Time PCR) iele

Diskussion 45
Vo eile. Dazu zähl die g öße e Tole anz gegenübe mi de DNA ko-isolie en Inhibi-
o en, welche besonde s g oßen Ein luss bei de Ampli ika ionsanalyse ha . Die ko-
isolie en Inhibi o en üh en bei eine qPCR zu eine Ve inge ung de E izienz de
PCR und einem e höh en Cq-We (Schwellenwe , ab wie iel Zyklen in de PCR eine
P obe ein posi i es Signal e gib ). In olgedessen wi d eine ge inge e Kopienzahl ge-
messen als die eigen liche du ch die Ausgangsmenge e eich e. Bei de ddPCR g ei-
en gleich zwei Mechanismen, welche diesem E ek en gegenwi ken. Zum einen we -
den bei de ddPCR posi i e und nega i e Signale im Ve häl nis zueinande ausgewe -
e , sodass de Ein luss de Inhibi o en e s dann sich ba wi d, wenn du ch die Inhibi-
o en ein posi i es Signal als nega i es Signal gewe e wi d. Zum ande en we den die
P oben zu Du ch üh ung de ddPCR s a k e dünn , sodass auch die Inhibi o en s a k
e dünn we den [68]. Dadu ch geling mi Hil e de ddPCR eine wesen lich sensi i e e
und genaue e Analyse de Kopienzahl des gesuch en DNA-Abschni s und dami eine
besse e Ampli ika ionsanalyse.
5.2 Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1
In a umo ale He e ogeni ä konn e be ei s ü iele Bioma ke n nachgewiesen we den
[36, 57, 61, 69]. Die meis en de in diese S udie eingeschlossenen Fälle zeig en ein
di us e eil es Exp essionsmus e un e schiedliche Fä bein ensi ä en inne halb ei-
nes Tumo s ü sowohl SMARCA4 als auch SMARCE1. Dieses Mus e , welches als
„g ey-scale“ bezeichne wi d und sich au ineinande übe gehende Fä bein ensi ä en
bezieh (siehe Abb. 2), wu de in 95,2 % (446 Fälle) alle ü SMARCA4 ge ä b en Fälle
ge unden. 98,9 % (463 Fälle) de ü SMARCE1 ge ä b en Magenka zinome zeig en
eben alls ein Exp essionsmus e in G aus u en. In 5 (1 %) Fällen konn e ein komple e
Ve lus de Exp ession on SMARCA4 nachgewiesen we den. Ein komple e Ve lus
de Exp ession on SMARCE1 wu de nu in einem Fall beobach e (0,2 %). Ein pa i-
elle Ve lus de Exp ession, welche sich als „black-and-whi e“ Mus e in de Fä bung
zeig e (siehe Abb. 2), konn e ü SMARCA4 in 16 (3 %) Fällen nachgewiesen we den,
ü SMARCE1 in 3 (0,6 %) Fällen. Diese E gebnisse üh en zu dem Schluss, dass die
Einschä zung des Ve lus s de Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 in kleinen
Gewebep oben wie z. B. Biopsien (Tumo s anzen) ode Tissue Mic o A ay Un e su-
chungen (TMA) an ällig ü S ichp oben ehle is [56].
Diskussion 46
Dami konn e die Hypo hese, dass SMARCA4 und SMARCE1 im Magenka zinom un-
e schiedliche A en de Exp ession sowie in a umo ale He e ogeni ä zeigen, bes ä-
ig we den.
SMARCA4 und SMARCE1 zählen zu den Un e einhei en des SWI-/SNF-Komplexes
[42]. Die e hobenen Da en weisen au eine Ko ela ion de Exp ession on SMARCA4
mi SMARCE1 und umgekeh hin. Eine nied ige Exp ession on SMARCA4 ko elie e
signi ikan mi eine nied igen Exp ession on SMARCE1 (p <0,001, siehe Tabelle 7).
Dies allein e laub jedoch noch keinen Schluss zu Dys egula ion de Un e einhei en.
Schließlich wi d ü SMARCE1 eine hohe Exp ession als dys egulie angenommen,
wäh end ü SMARCA4 ein Ve lus de Exp ession on Rele anz zu sein schein [53,
70, 71]. Es e anschaulich jedoch, dass die Dys egula ion des SWI-/SNF-Komplexes
komplex is und e mu lich meh als eine einzelne Un e einhei da an be eilig is .
Diese Annahme wi d du ch zusä zliche Da en de Un e suchung ges ü z , so konn e
ein signi ikan e Zusammenhang zwischen de Exp ession on sowohl SMARCA4 als
auch SMARCE1 mi ARID1A es ges ell we den, welches eine wei e e Un e einhei
des SWI/SNF-Komplexes da s ell [42]. In ühe en S udien des Ins i u s ü Pa hologie
des UKSH Kiel wu de be ei s de Nachweis in a umo ale He e ogeni ä on ARID1A
e b ach . Des Wei e en wu de in de S udie zu ARID1A ein Zusammenhang zwischen
dem Ve lus on ARID1A mi eine e höh en Exp ession on PD-L1 sowie mi dem
EBV- und Mik osa eli ens a us es ges ell , welche unabhängig on de p ozen ual
om Ve lus be o enen Tumo läche bes and [65, 72]. Schließlich könn en einzelne
Be eiche eines Tumo s on eine biologisch ele an en Dys egula ion des SWI-SNF-
Komplexes be o en sein, welche z.B. du ch inak i ie ende Mu a ionen on ARID1A
[43] e mi el wi d und wei e e Un e einhei en des SWI-SNF-Komplexes be e en
kann. Dies komplizie das Ve s ändnis des Zusammenhangs mi dem Pa ien enübe -
leben. So konn e, einzeln ü SMARCA4 und SMARCE1 be ach e , kein Zusammen-
hang mi dem Pa ien enübe leben nachgewiesen we den (siehe Abb. 3 - 6) [56].
5.3 SMARCA4, SMARCE1 und ande e umo biologische Eigen-
scha en
In diese S udie wu de de Zusammenhang on SMARCA4 und SMARCE1 mi kli-
nisch-pa hologischen Pa ien encha ak e is ika un e such . Ein bekann e Bioma ke
Diskussion 47
bei Tumo en is TP53, welche als Tumo supp esso häu ig in e schiedenen Ka zino-
men mu ie o lieg . Zu diesen Ka zinomen zähl auch das Magenka zinom [32, 73].
Dabei is TP53 nich in allen Magenka zinomen gleich häu ig mu ie . Es konn e in de
Ve gangenhei gezeig we den, dass Mu a ionen on TP53 zwa nu sel en bei EBV-
posi i en Magenka zinomen o kommen, jedoch o bei ch omosomal ins abilen (CIN)
Magenka zinomen nachgewiesen we den können [32, 73]. Ve gleichba mi dem SWI-
SNF-Komplex e häl sich p53 als T ansk ip ions-Ak i a o in einem komplexen Ne z-
we k aus Genen, dessen P oduk e eine Rolle in e schiedenen Signal-T ansduk ions-
wegen einnehmen [74]. Ich konn e zeigen, dass eine nied ige Exp ession on
SMARCA4 mi eine nied igen Exp ession on p53 im Magenka zinom assoziie is .
Diesen Zusammenhang konn e ich eben alls ü SMARCE1 und p53 nachweisen.
Diese E gebnisse üh en zu de Annahme, dass die Dys egula ion des SWI-/SNF-
Komplexes . a. in CIN-Magenka zinomen au i [56].
Eine in eg a i e, genomische Analyse des Cance Genome A las Resea ch Ne zwe ks
schläg zu Ein eilung on Pa ien en und Ve suchen zu „ a ge ed he apies“ die Un e -
scheidung on Magenka zinomen in ie Sub ypen o : EBV-, MSI- (Mik osa eli en-
ins abil), CIN- und genomisch s abilen Magenka zinomen o [32]. „Ta ge ed he a-
pies“ sind mode ne und zielge ich e e The apien in de Behandlung on K ebs. Dabei
we den geziel Eigenscha en des jeweiligen Ka zinoms als Ang i spunk e in de The-
apie genu z [75]. E gänzend zudem genann en Zusammenhang on SMARCA4 und
SMARCE1 mi TP53 konn e auße dem eine in e se Ko ela ion de Exp ession on
SMARCA4 und SMARCE1 mi MSI nachgewiesen we den. Eben alls zeichne e sich
eine Tendenz eines in e sen Zusammenhangs de Exp ession on SMARCE1 und
einem posi i em EBV-S a us bei Magenka zinomen ab. Dies un e s ü z die zu o ge-
mach e Annahme, dass eine Dys egula ion des SWI-/SNF-Komplexes . a. CIN-Ma-
genka zinome be i und wenige MSI- ode EBV-posi i e Magenka zinome [56].
Die E gebnisse bishe du chge üh e S udien zu SMARCA4 und SMARCE1 ließen
einen Ein luss beide au den TNM-S a us sowie das Pa ien enübe leben auch beim
Magenka zinom e mu en [53, 67]. Dennoch konn en wi keinen Zusammenhang zwi-
schen de Exp ession on SMARCA4 und SMARCE1 mi dem TNM-S a us ode dem
Pa ien enübe leben, wede im Gesam übe leben noch im umo spezi ischen Übe le-
ben, inden. SMARCA4 schein in bishe igen S udien als mögliche Tumo supp esso
in E scheinung zu e en [70, 71], o z dessen konn e in diese Un e suchung keine
Diskussion 48
Ko ela ion zwischen eine nied igen Exp ession ode dem komple en Ve lus de Ex-
p ession und dem TNM-S a us, dem Gesam - ode umo spezi ischen Übe leben
nachgewiesen we den. In den o ausgegangenen S udien, welche zu dem Schluss
kamen, dass die Dys egula ion de Un e einhei en einen Ein luss au die P ognose on
Pa ien en habe, wu den haup sächlich Pa ien enkoho en asia ische He kun als
G undlage genommen [53, 67]. Im Gegensa z dazu, wu de als G undlage diese S u-
die ein Pa ien enkollek i kaukasische He kun genu z . Da aus läss sich ablei en,
dass ein Un e schied zwischen Pa ien en kaukasische und asia ische He kun be-
s ehen könn e. Dies un e s ü z den Ansa z eine Un e scheidung zwischen asia i-
schen und nich asia ischen Magenka zinomen in de The apieplanung, da sich zu-
nehmend de Ve dach e hä e , dass die e hnische He kun des Pa ien en einen Ein-
luss au die P ognose ha [33, 56].
Zusä zlich zu dem Ein luss de einzelnen Un e einhei en SMARCA4 und SMARCE1
au die Tumo biologie des Magenka zinoms wu de in diese S udie de Zusammen-
hang eine Dys egula ion des SWI-/SNF-Komplexes mi den klinisch-pa hologischen
Pa ien encha ak e is ika un e such . Die Dys egula ion wu de dabei als hohe Exp es-
sion on sowohl SMARCA4 und SMARCE1 ode nied ige Exp ession diese beiden
Un e einhei en de inie . Ähnlich zu den bishe igen E gebnissen konn e auch hie ein
Zusammenhang mi dem p53- und Mik osa eli ens a us sowie dem ARID1A-S a us
beobach e we den. Wie zu o e wähn , handel es sich bei ARID1A um eine wei e e
Un e einhei des SWI-/SNF-Komplexes [42], welche den gleichen Zusammenhang mi
dem Mik osa eli ens a us zeig [65, 70], wie in diese S udie ü SMARCA4 und
SMARCE1 beleg . Dies zeig e neu wie komplex sich die Dys egula ion des SWI-
/SNF-Komplexes ges al e [56].
Kü zlich e schienene S udien zu SMARCA4 e gaben eine Be eiligung on SMARCA4
in de E-Cadhe in abhängigen Induk ion de Epi helial-Mesenchymalen T ansi ion
(EMT), welche zu eine o sch ei enden Me as asie ung üh [76, 77]. Die E gebnisse
diese Un e suchung konn en keinen Zusammenhang zwischen de Exp ession on
SMARCA4 und dem E-Cadhe in S a us bes ä igen sowie zu o be ei s genann auch
keinen Zusammenhang zum TNM-S a us, welche die Ausb ei ung de Me as asie ung
abbilde [56].
Li e a u e zeichnis 55
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Anhang 58
A Anhang
A.1 E hik o um
Anhang 59
Publika ionen 60
B Publika ionen
P ies K, K üge S, Heckl S, Beh ens H-M, Röcken C. SMARCA4 and SMARCE1 in
gas ic cance : Co ela ion wi h ARID1A, and mic osa elli e s abili y, and
SMARCE1/ERBB2 co-ampli ica ion. Cance Med. 2023;00:1-15.
doi:10.1002/cam4.5776

Danksagung 61
C Danksagung
Ich möch e zunächs meinem Dok o a e , He n P o esso D . med. Ch is oph Rö-
cken, Di ek o des Ins i u es ü Pa hologie des Uni e si ä sklinikums Schleswig-Hol-
s ein, am Campus Kiel danken. P o esso Röcken bo mi die Möglichkei , mich an de
Themen indung zu be eiligen und e möglich e mi Zugang zu allen Räumlichkei en und
Ma e ialen, die ü die Umse zung diese A bei on Nö en wa en. Sein eno mes En-
gagemen sowie die ausgezeichne e Be euung hal en mi wäh end des gesam en
P ozesses.
Besonde e Dank gil auße dem den Mi a bei e n und Mi a bei e innen des Immunla-
bo s und des molekula pa hologischen Labo s. Das Team un e s ü ze mich in de
p ak ischen Umse zung alle Gewebe ä bungen und de Be ei s ellung, de da ü be-
nö ig en Ma e ialien. Insbesonde e wäh end des eingesch änk en Zugangs zu den La-
bo en au G und de Co onapandemie wa das Team mi eine g oße Hil e, da ü bin
ich auße o den lich dankba . Ge ne möch e ich mich auch he zlich bei He n D . med.
S e en Heckl bedanken, welche mich spon an in de Du ch üh ung de ddPCR un e -
s ü z e. Eben alls bedanke ich mich bei He n Dipl.-Phys. Hans-Michael Beh ens und
F au Sand a K üge .
Ich danke F au Fee Anschei , die mich sei Kindhei s agen als enge F eundin und
Schwes e , die ich nie ha e, beglei e . Mein Dank gebüh auße dem F au Lea Klie,
ü die achlichen und mo i ie ende Gesp äche wäh end de A bei an unse en Dok-
o a bei en.
Schließlich möch e ich mich bei meine Familie bedanken. Ich danke meine Schwä-
ge in Lisa P ies, die diese Disse a ion so o Ko ek u las, bis sie sie auswendig
konn e. Abe o allem danke ich meinem Ehemann Eike P ies, de mi jeden Tag zu
Sei e s and, alle meine Launen aushiel und mi imme wiede die K a zum Wei e -
machen gab.
E klä ung 62
D E klä ung
Hie mi e klä e ich, Ka ha ina P ies, dass ich die o liegende A bei selbs s ändig an-
ge e ig habe. Es wu den nu die in de A bei ausd ücklich benann en Quellen und
Hil smi el benu z . Wö lich ode sinngemäß übe nommenes Gedankengu habe ich
als solches kenn lich gemach .