Leioa, 21 de julio de 2023
T abajo Fin de G ado
G ado en Biología
Va iabilidad gené ica en poblaciones
humanas: e ec o de la selección na u al en los
genes del c omosoma 9
Au o a:
Naia a Villa ías González
Di ec o :
Mikel I iondo O ensanz
1
ÍNDICE
INTRODUCCIÓN ............................................................................................................................ 3
HIPÓTESIS Y OBJETIVOS ................................................................................................................ 5
MATERIALES Y MÉTODOS ............................................................................................................. 6
RESULTADOS ................................................................................................................................ 8
DISCUSIÓN ................................................................................................................................. 11
GEN GLIS3 .......................................................................................................................................... 12
GEN SMARCA2 ................................................................................................................................... 13
CONCLUSIONES .......................................................................................................................... 17
BIBLIOGRAFÍA ............................................................................................................................ 17
ANEXO ....................................................................................................................................... 22
2
RESUMEN
Median e es e es udio se ha que ido analiza el e ec o de la selección na u al sob e los
genes del c omosoma 9. Pa a ello, se han ob enido los da os de 129 SNPs pa iendo de los
geno ipos de 2504 indi iduos pe enecien es a 26 poblaciones. Median e el cálculo de la FST se
puede dis ingui en e la acción de la selección na u al y la acción de o os p ocesos neu ales
como de i a génica y lujo génico, los cuales a ec an a odo el genoma po igual.
T as selecciona aquellos SNPs con una FST mayo que la media, se han escogido dos
de ellos pa a explica la dis ibución de las ecuencias en las di e en es poblaciones. Cambios
en el gen GLIS3 se ha obse ado que pueden causa diabe es, po lo que es posible que la
dis ibución de las ecuencias se deba a adap aciones a la escasez de ecu sos. El gen
SMARCA2, po su pa e, in e ac úa con C/EBP-β, que pa icipa en la acción de la espues a
inmune. Po ello, las ecuencias obse adas pueden debe se a una adap ación a la esis encia a
mic oo ganismos.
PALABRAS CLAVE
C omosoma 9, selección na u al, SNP, GLIS3, diabe es, SMARCA2, inmunidad
ABSTRACT
Th ough his s udy, we wan ed o analyze he e ec o na u al selec ion on he genes o
ch omosome 9. Fo his pu pose, we ha e ob ained he da a o 129 SNPs using he geno ypes
o 2504 indi iduals belonging o 26 popula ions. By calcula ing he FST, i is possible o
dis inguish be ween he ac ion o na u al selec ion and he ac ion o o he neu al p ocesses such
as gene d i and gene low, which a ec he en i e genome equally.
A e selec ing hose SNPs wi h a FST g ea e han he a e age, wo o hem ha e been
selec ed o explain he dis ibu ion o equencies in he di e en popula ions. Changes in he
GLIS3 gene ha e been obse ed o be a cause o diabe es, so i is possible ha he equency
dis ibu ion is due o adap a ions o he sca ci y o esou ces. The SMARCA2 gene, o i s pa ,
in e ac s wi h C/EBP-β, which pa icipa es in he ac ion o he immune esponse. The e o e, he
obse ed equencies may be due o an adap a ion o esis ance o mic oo ganisms.
KEY WORDS
Ch omosome 9, na u al selec ion, SNP, GLIS3, diabe es, SMARCA2, immuni y
3
INTRODUCCIÓN
El linaje humano mode no su gió en Á ica hace 300 ka (De Cas o y Ma inón-To es,
2022), y desde en onces se ha expandido po odo el globo. Hace 170.000 años llega on a
P óximo O ien e (He shko i z e al., 2018), y, más a de, hace 80.000 años, se di igie on hacia
el sudes e de Asia siguiendo la u a de la cos a (Liu e al., 2015). 15.000 años más a de, llega on
a Aus alia y se expandie on po Nue a Guinea y las islas más p óximas (Cla kson e al., 2017).
Pa iendo del cen o de Asia, hace 54.000 años llega on a Eu opa (Me z e al., 2023). En cuan o
a la colonización de Amé ica, indi iduos p oceden es de Sibe ia a a esa on el es echo de
Be ing hace en e 15.000 y 20.000 años (Achilli e al., 2013). Es a expansión po los di e en es
con inen es, dio luga a una g an a iabilidad. Dicha di e sidad se ha debido en g an medida a
los mecanismos mic oe olu i os: mu ación, de i a génica, lujo génico y selección na u al.
Si bien el ADN es una molécula al amen e es able que se eplica con una g an exac i ud,
pueden su gi cambios en su es uc u a y e o es en la eplicación. Una mu ación se de ine como
un cambio he edable (ya sean células u o os o ganismos) en la secuencia de la in o mación
gené ica del ADN. Las mu aciones son impo an es po que la capacidad de los o ganismos pa a
adap a se a los cambios ambien ales depende de la p esencia de a iación gené ica (p oducida
p ecisamen e po mu aciones). Desde el pun o de is a e olu i o, se pueden clasi ica en
dis in os ipos: dele é eas (siendo algunas de ellas le ales), neu ales o en ajosas. El e ec o de
la mu ación se da a lo la go de odo el genoma (Jiménez y Espino, 2012; Pie ce, 2023).
Según a qué se deban las mu aciones, pueden da luga a dis in os ipos de
polimo ismos. Los polimo ismos de ADN gene almen e se de inen como a ian es na u ales
pa a las cuales el alelo más común iene una ecuencia de no más del 99%. La g an mayo ía
de los polimo ismos del ADN humano se pueden di idi en dos g upos: los que se basan en
sus i uciones de nucleó idos (comúnmen e llamados "SNP", del inglés single-nucleo ide
polymo phism) y los que se basan en la inse ción o eliminación de uno o más nucleó idos
(indels). Los SNPs son nume osos y se encuen an po odo el genoma, en p omedio uno cada
1 a 2kb. Cabe des aca que la mayo ía de los SNP p esen es en una población se o igina on a
pa i de una única mu ación ocu ida en un c omosoma en pa icula en un indi iduo y se
espa cie on al es o de la población (Pie ce, 2023; Webe e al., 2002).
O a ue za e olu i a que a ec a a las ecuencias génicas poblacionales es la de i a
génica, que se de ine como el cambio en las ecuencias génicas debido al mues eo alea o io
de game os que se p oduce en la ep oducción en poblaciones de censo ini o. Cuan o más
pequeña es la mues a, mayo es la p obabilidad de que su composición se des íe de la del
4
ace o gené ico pa en al. Las causas pueden se a ias: man ene un amaño educido du an e
a ias gene aciones, que se p oduzca un e ec o undado o que se dé un cuello de bo ella. La
de i a génica p oduce un cambio en las ecuencias alélicas den o de una población, así como
la educción de la a iación gené ica den o de las poblaciones, dándose su e ec o a lo la go de
odo el genoma (Jiménez y Espino, 2012; Pie ce, 2023).
O o p oceso que puede causa cambios en las ecuencias alélicas es la en ada de alelos
p o enien es de o as poblaciones, denominado en gene al mig ación o lujo génico. Es o se
debe a que, gene almen e, una población no cons i uye una única unidad panmíc ica, sino que
se encuen a subdi idida en subpoblaciones. La mig ación iene dos e ec os impo an es:
aumen a la simili ud en e los ace os gené icos de las di e en es poblaciones y suma a iación
gené ica a las poblaciones ecep o as. Igual que en el caso an e io , su e ec o se da a lo la go de
odo el genoma (Fon de ila y Moya, 2000; Pie ce, 2023).
Finalmen e, el úl imo mecanismo e olu i o, y en el que se a a p o undiza en es e
es udio, es la selección na u al. Mien as que los o os mecanismos mic oe olu i os a ec an a
odo el genoma, la selección ac úa localmen e y es á es ingida a egiones genómicas
pa icula es (Quin ana-Mu ci, 2016).
La selección na u al iene luga cuando los indi iduos con asgos adap a i os p oducen
un mayo núme o de descendien es que los que no son po ado es de dichos asgos. Cuando
es os asgos ienen una base gené ica, apa ecen en mayo ecuencia en la siguien e gene ación,
lo que hace que las poblaciones se adap en mejo a sus ambien es (Pie ce, 2023).
Desde el pun o de is a de una población, la selección na u al se puede mani es a de
di e en es o mas. La selección pu i icado a, o selección nega i a, se e ie e al p oceso po el
cual las mu aciones dele é eas son eliminadas de la población. Es a selección puede se
di eccional en con a del alelo ecesi o o en con a del alelo dominan e. La selección ambién
puede ocu i cuando una mu ación nue a es a o able, denominada como selección posi i a,
que se c ee que es una de las o mas po las que se da la e olución adap a i a. Asimismo, puede
da se la selección balanceado a ( ambién llamada sob edominancia), en la que el he e ocigo o
iene una ap i ud más al a que la de los dos homocigo os, po lo que ambos alelos son
a o ecidos, y ninguno es eliminado de la población. Finalmen e, la selección di e si icado a
o in adominancia es en la que el he e ocigo o iene meno ap i ud que los dos homocigo os.
La in adominancia induce un equilib io ines able. En es e caso, las ecuencias alélicas no
cambian en an o se man enga el equilib io, pe o si alguna o a ue za e olu i a al e a el pun o
de equilib io, se aleja án del equilib io has a que inalmen e un alelo alcance la ijación (Pie ce,
2023; Quin ana-Mu ci, 2016).
5
Desde el pun o de is a de a ias poblaciones, la selección na u al se puede di e encia
como selección di e si icado a o selección balanceado a. La selección na u al di e si icado a
se e ie e al hecho de que en dos subpoblaciones de una misma especie que i en en di e en es
ambien es se seleccionan di e en es alelos pa a un mismo locus. La selección balanceado a, sin
emba go, ocu e cuando la selección na u al ac úa de igual o ma en ambas subpoblaciones,
dando luga a ecuencias simila es (Masimi embwa e al., 2014).
Dis ingui en e la selección na u al y los p ocesos neu ales, como la de i a génica y el
lujo de génico, es undamen al pa a es e ipo de es udios. En los úl imos años, pa a p oba la
acción de la selección na u al sob e asgos cuan i a i os en poblaciones subdi ididas, se han
u ilizado compa aciones de dos es adís icos: FST y QST. FST o índice de ijación es una medida
de la di e enciación de la población de inida como la elación en e comunidad ep oduc i a y
la a ianza o al del alelo (Mille e al., 2008).
Uno de los obje i os cen ales de la biología es comp ende la elación en e geno ipo y
eno ipo. La secuencia del genoma humano de e e encia (ob enida en 2004) p opo ciona una
base pa a el es udio de la gené ica humana, pe o la in es igación sis emá ica de la a iación
humana equie e un conocimien o más p o undo (The 1000 Genomes P ojec Conso ium,
2010).
Los a ances en la ecnología de secuenciación de ADN han pe mi ido la secuenciación
de genomas indi iduales, iluminando los acíos en la p ime a gene ación de bases de da os
(como el P oyec o In e nacional HapMap) que con ienen en su mayo ía si ios de a ian es
comunes. De es a o ma, el obje i o del P oyec o 1000 Genomas es descub i , geno ipa y
p opo ciona in o mación p ecisa sob e haplo ipos en odas las o mas de polimo ismo del
ADN humano en múl iples poblaciones humanas (The 1000 Genomes P ojec Conso ium,
2010).
HIPÓTESIS Y OBJETIVOS
Se pa e de la hipó esis de que, aunque las ue zas e olu i as que ac úan sob e odo el
genoma (mu ación, de i a génica y lujo génico) han di e enciado a las poblaciones humanas
en cie a medida, la selección na u al hab ía di e enciado algunos genes en mayo medida
debido a di e encias en el e ec o ambien al de dis in as egiones.
El obje i o de es e abajo es de ec a la selección na u al sob e los genes del c omosoma
9 en base a da os de SNPs. Pa a ello se u iliza á la base de da os 1000 genomas de la que se
ob end án los geno ipos. Asimismo, median e el p og ama BayeScan se de ec a á la acción de
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la selección na u al sob e los polimo ismos, y, en a ios de ellos, se a a á de explica cómo
ha ac uado.
MATERIALES Y MÉTODOS
En p ime luga , pa a la ob ención de los da os, se ha u ilizado el buscado del NCBI
pa a accede a la base de da os de 1000 genomas. En es e buscado apa ecen los esul ados del
p oyec o 1000 genomas, que buscaba p opo ciona una desc ipción de la a iación gené ica
humana median e la aplicación de la secuenciación del genoma comple o a un conjun o de
indi iduos de múl iples poblaciones (The 1000 Genomes P ojec Conso ium, 2015). Desde
es a base de da os se puede e la in o mación ace ca de los di e en es SNPs del genoma
humano en las dis in as poblaciones (Anexo).
Se han escogido aquellos pe enecien es al c omosoma 9 que cumplían unos equisi os:
1) ene una MAF ( ecuencia del alelo menos común, Mino Allele F equency en inglés)
mínima del 0,4 pa a ob ene unos esul ados obus os y 2) es a a una dis ancia de 1cM (en
nues a especie ap oximadamen e 7’5·105 pb; Lodish e al., 2012) pa a que los SNPs sean
independien es. Se ha desca gado el geno ipo de los SNPs seleccionados, y se han elabo ado
dos documen os con ellos. En uno de ellos ( o ma o PED) se ha incluido la in o mación de los
indi iduos, así como los alelos ob enidos en cada SNP. En el o o documen o ( o ma o INFO)
se ha incluido el nomb e de cada polimo ismo y su ubicación en el c omosoma.
Pos e io men e, pa a comp oba si los SNPs elegidos es aban ligados o no, se ha
u ilizado el p og ama Haplo iew, que p opo ciona un cálculo de es adís icas de desequilib io
de ligamien o a pa i de da os de geno ipos (al igual que o a in o mación como pa ones de
haplo ipos) (Ba e e al., 2004). Los esul ados se mues an en un g á ico iangula con
cuad ados colo eados según la na u aleza del esul ado (Tabla 1).
Tabla 1. Esquema de colo es ánda que u iliza el p og ama Haplo iew.
D’ < 1
D’ = 1
LOD < 2
Blanco
Azul
LOD ≥ 2
Rosa/Rojo cla o
Rojo in enso
Después, pa a e la ag upación y ce canía de los di e en es indi iduos y poblaciones
conside ando es os polimo ismos, se ha que ido hace un g á ico “S uc u e”. En p ime luga ,
se ha usado el p og ama PGDSpide , un p og ama Ja a que puede lee 27 o ma os de a chi os
y expo a los da os a o os 29. Básicamen e, pe mi e con e i a chi os en e di e en es
p og amas de gené ica de poblaciones (Lische y Exco ie , 2011). De es a o ma, se ha podido
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ob ene un documen o con el o ma o adecuado pa a el análisis. Con ello, se puede ealiza un
p oyec o en el p og ama S uc u e, que u iliza los Mé odos de Mon eca lo basados en cadenas
de Ma ko (MCMC) pa a clasi ica los indi iduos en g upos a pa i de da os de geno ipo
mul ilocus. Básicamen e, asume que odo el ma e ial gené ico de los indi iduos p o iene de
uno o más K (núme o de ag upaciones) g upos no obse ados (Falush e al., 2007). Se han
u ilizado los pa áme os de 5000 Leng h o Bu nin Pe iod y 5000 Numbe o MCMC Reps a e
Bu nin. Además, se han especi icado las g á icas desde K=1 has a K=8, con 10 i e aciones cada
una.
A con inuación, con el obje i o de obse a cuál es la ag upación ( alo de K en el
g á ico S uc u e) más adecuada, se ha u ilizado el p og ama S uc u e Ha es e . És e ecopila
los esul ados gene ados po el p og ama S uc u e y e alúa los alo es de p obabilidad en
múl iples alo es de K y cien os de i e aciones pa a de ec a la can idad de g upos gené icos
que se ajus an mejo a los da os (Ea l y onHold , 2012). Asimismo, hay que ene en cuen a
que se habían ealizado 10 i e aciones, con lo que se ienen 10 g á icos di e en es pa a cada
alo de K debido a 2 enómenos p incipales: “cambio de e ique as” (los g upos que in ie e el
p og ama S uc u e se asignan a bi a iamen e) y “mul imodalidad” (los análisis de da os dan
dos o más soluciones dis in as). De es a o ma, pa a ealiza un g á ico p omedio de los
an e io es, se ha u ilizado el p og ama Clumpak, que elimina el “cambio de e ique a” e
iden i ica conjun os de ejecuciones simila es, gene ando así una solución consenso (Kopelman
e al., 2015).
Po o a pa e, pa a de ec a el e ec o de la selección na u al, se compa an las ecuencias
en e poblaciones median e la FST (índice de ijación) de los di e en es SNPs. Pa a ello, se ha
uel o al documen o que enía el o ma o S uc u e y se ha con e ido en o ma o BayeScan
median e el uso del p og ama PGDSpide . Es e documen o se ha in oducido en el p og ama
BayeScan, que u iliza un mé odo bayesiano pa a es ima la p obabilidad de que cada locus es é
suje o a selección (Foll y Gaggio i, 2008). U ilizando el p og ama RS udio, se ha ealizado un
g á ico con es os esul ados, pa a lo que se ha u ilizado la unción “plo _bayescan”. Además,
de los 3 documen os que de uel e el p og ama Bayescan, se ha u ilizado el que se llama
“Nomb ea chi o_ s ” pa a ob ene una abla en Excel con la que se pueda abaja . De es a abla
se han omado los SNPs con una FST es adís icamen e más al a o más baja que la media (q alo
meno que 0,05).
Finalmen e, se ha ep esen ado su p esencia en las di e en es poblaciones median e el
buscado Geog aphy o Gene ic Va ian s (GGV), que mues a la dis ibución geog á ica de una
a ian e gené ica en un mapa (Ma cus y No emb e, 2016).
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RESULTADOS
T as la búsqueda en la base de da os 1000 Genomas, se selecciona on un o al de 129
SNPs epa idos po odo el c omosoma, a excepción de la zona del cen óme o, que es pob e
en genes. Es os SNPs ienen un MAF mínimo de 0,4, y es án sepa ados po , al menos, 1cM.
Po lo an o, pa a ealiza es e abajo, se han ob enido 323.016 geno ipos.
A con inuación, es os polimo ismos se some ie on a un análisis de desequilib io de
ligamien o, cuyo esul ado se mues a en la Figu a 1. Ya sea a endiendo al colo de cada
cuad ado ( e Tabla 1) o al núme o que apa ece en su in e io , se puede obse a que la
p obabilidad de ligamien o es muy baja en casi odos los casos, sal o alguna excepción pun ual.
Figu a 1. Análisis de desequilib io de ligamien o ealizado median e el p og ama Haplo iew.
En la pa e supe io se indican los nomb es de los SNPs analizados, y debajo se obse a el
esul ado median e un esquema de colo es.
Pos e io men e, median e el p og ama STRUCTURE se ealiza on 80 análisis (desde 1
has a 8 ag upaciones) en los que se mos aba la ag upación y ce canía de los di e en es
indi iduos y poblaciones. Dado que no odos los alo es de K son adecuados, se analiza on los
g á icos pa a e qué can idad de g upos gené icos se ajus an mejo a los da os. Pa a ello, se
usa el alo de del aK, que se calcula como el loga i mo de la p obabilidad de los da os pa a
una K dada en e su a ianza (E anno e al., 2005). En la Figu a 2 se puede e que el mayo
alo de del aK se ob iene pa a K=2, seguido de K=3, po lo que es os son los g á icos más
adecuados.
15
Po o a pa e, en cuan o a la espues a inmune, los mac ó agos adquie en una mayo
capacidad bac e icida y umo icida cuando se ac i an po comple o as su in e acción con
mic oo ganismos o as la es imulación po moléculas, en e las que des acan ci ocinas como el
in e e ón-γ (IFN-γ). IFN-γ es una ci ocina p oducida po las células T y las células na u al
kille , que es undamen al pa a media las unciones an i i ales y an i umo ales, y que induce
la exp esión de C/EBP-β. Además, se han iden i icado a ios ac o es de ansc ipción (en e
los que se incluye C/EBP-β) que pueden desempeña un papel en la egulación del p og ama
de di e enciación y ac i ación de los mac ó agos. Se c ee que C/EBP-β puede se necesa io
pa a la exp esión coo dinada de un g upo de genes especí icos de mac ó agos, así como pa a la
adquisición del eno ipo de mac ó agos (Roy e al., 2000; Tanaka e al., 1995).
Cabe des aca que se ha demos ado la impo ancia de C/EBP-β (en el a ículo se
denomina NF-IL6) median e el uso de a ones C/EBP-β (-/-). Las bac e ias, as se agoci adas
mue en o se inhibe su c ecimien o, pa a lo cual son c í icos IFN-γ y TFNα. Sin emba go, los
a ones C/EBP-β (-/-) ienen de ec os pa a ma a bac e ias y umo es. Asimismo, se ha is o
que es posible que C/EBP-β sea esponsable de la exp esión de componen es del mecanismo
que mejo a la ac i idad bac e icida mediada po NO (Tanaka e al., 1995).
La elación en a la unción inmuni a ia de es e gen y la dis ibución de los alelos es a ía
en que a medida que los humanos salie on de Á ica, las poblaciones se encon a on con
dis in os pa ógenos, y la selección na u al aumen ó la p e alencia de alelos en ajosos pa a los
nue os ecosis emas (Ka lsson e al., 2014). Si bien es cie o que ambién se encon a on con
di e sas condiciones climá icas y nu icionales, los es udios de gené ica de poblaciones han
indicado que la inmunidad y las unciones de de ensa del huésped se encuen an en e las
unciones más ecuen emen e suje as a selección na u al (Quach y Quin ana-Mu ci, 2017). De
hecho, los pa ógenos y las en e medades in ecciosas han sido y siguen siendo las p incipales
amenazas pa a la salud y la supe i encia humanas (Ba ei o y Quin ana-Mu ci, 2009). A
p incipios del siglo XX, du an e el p oceso de indus ialización, las en e medades daban como
esul ado una espe anza de ida p omedio de al ededo de 40 años, llegando a se an sólo de
20 años du an e algunas epidemias (Siddle y Quin ana-Mu ci, 2014)). Hoy en día, exis en
algunas poblaciones como los Ae a que son cazado es- ecolec o es, y que ienen una espe anza
de ida p omedio al nace de 16,5 años (Migliano e al., 2007). Además en la ac ualidad, a pesa
del p og eso médico, las en e medades in ecciosas con inúan siendo una de las p incipales
causas de mo alidad, siendo esponsables del 48% de las mue es de pe sonas meno es de 45
años en odo el mundo (P ugnolle e al., 2005). Sin duda, a lo la go de la his o ia de la especie
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humana, la selección na u al ha modi icado de o ma impo an e la ecuencia alélica de algunos
genes.
Al analiza los genes que a ec an a la inmunidad, es más p obable que se obse en
g adien es de selección di eccional posi i a en poblaciones con al a p e alencia y abundancia
de pa ógenos, mien as que las poblaciones con meno iesgo de in ección pod ían es a suje as
a una selección es abilizado a, o incluso, a una selección di eccional nega i a (Seppälä, 2014).
En cuan o a las causas po las que se ha podido selecciona es e SNP, pueden se
di e sas. Po una pa e, se ha obse ado que las pe sonas de ascendencia a icana gene almen e
mues an una espues a más ue e a la in ección bac e iana que las pe sonas de ascendencia
eu opea, en pa icula pa a los genes de espues a in lama o ia (Quach y Quin ana-Mu ci,
2017). En es e caso, se pod ía deci que el alelo C de es e SNP a o ece una espues a más
ue e a la in ección bac e iana. Debido a que as la salida de los humanos de Á ica és os se
encon a on con o os mic oo ganismos di e en es, se pudo a o ece una espues a menos
in ensa.
Po o a pa e, ambién es posible que la causa de su selección haya sido un
mic oo ganismo conc e o. El modo po el cual el se humano se adap a a los pa ógenos depende
de una g an can idad de ac o es, como el ipo de mic oo ganismo, la di e en e p esencia
empo al y espacial, la pa ogenicidad a iable, la i ulencia, las es a egias de in ección y la
elocidad a la que e olucionan. De es a o ma, di e en es especies y ipos de pa ógenos pueden
impone di e en es p esiones selec i as sob e la unción inmunológica (Ba ei o y Quin ana-
Mu ci, 2017; Sepälä, 2014). Sin emba go, como en muchos o os casos, a pesa de que los
es udios de co elación espaldan i memen e la selección impulsada po pa ógenos, la
iden i icación de aquellos que eje cen p esión sob e genes conc e os sigue siendo a dua (Siddle
y Quin ana-Mu ci, 2014). De es a o ma, pueden se muy a iados los mic oo ganismos que
hayan p o ocado es a selección, especialmen e pa ógenos que han ma ado y ma an a una g an
can idad de pe sonas. En e es os (aunque pueden se muchos o os) se encuen an Plasmodium
que p o oca mala ia en Á ica sub-Saha iana y en el sudes e asiá ico o Ye sinia pes is que
p o oca la pes e neg a. De hecho, en el caso de la pes e neg a, cabe des aca que algunas
bac e ias sob e i en as se agoci adas po los mac ó agos y se p opagan al ganglio lin á ico,
donde se eplican sin con ol (Ba ei o y Quin ana-Mu ci, 2009; Klunk e al., 2022). Como ya
se ha comen ado an e io men e, es e es uno de los esul ados obse ados en el es udio ealizado
po Tanaka e al. (1995).
17
En esumen, se ha demos ado que la selección na u al ha a ec ado al gen SMARCA2 a
lo la go de la his o ia del se humano di e enciando las poblaciones de dis in as egiones, y que
pod ía es a elacionado con una adap ación a la esis encia a mic oo ganismos.
CONCLUSIONES
A pa i de los esul ados ob enidos, se pueden ex ae a ias conclusiones ace ca de los
dos genes que se han analizado más p o undamen e.
En p ime luga , en cuan o a las ecuencias del SNP del gen GLIS3, cabe des aca la
di e encia de las poblaciones de o igen a icano espec o al es o de poblaciones. Es e gen es á
in oluc ado en el desa ollo de células β del pánc eas, y la p esencia de cie os polimo ismos
se ha asociado con la apa ición de diabe es. Es as obse aciones pueden explica se median e la
hipó esis del geno ipo aho ado , que a i ma que la sob ep oducción de insulina es el
mecanismo conse ado de ene gía cuando la inges a de alimen os es i egula . Po lo an o,
pod ía se una adap ación a la die a y escasez de ecu sos del con inen e a icano.
En segundo luga , en cuan o a las ecuencias del SNP del gen SMARCA2, se ha
obse ado que p edomina uno de los alelos en las poblaciones de o igen a icano, mien as que
en las poblaciones eu opeas y de Asia occiden al es e alelo es mino i a io. En Asia o ien al, sin
emba go, se han dado alo es in e medios. Es e gen in e ac úa con C/EBP-β, que pa icipa en
la espues a inmune. A lo la go de la his o ia del se humano, los pa ógenos y las en e medades
in ecciosas han sido las p incipales amenazas pa a la salud y supe i encia, y de hecho lo
siguen siendo. Po ello, es e gen pod ía se una adap ación a la esis encia a mic oo ganismos.
El análisis del genoma y su elación con la selección na u al pueden apo a in o mación
undamen al ace ca de la his o ia e olu i a del se humano. Asimismo, en es e abajo se han
de ec ado o os genes en los que ha ac uado la selección na u al, po lo que se ía de in e és
p o undiza en ellos pa a en ende mejo la e olución del se humano.
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22
ANEXO
Tabla con el código y el núme o de indi iduos geno ipados de cada población.
Código
N
Población
Código
N
Población
ACB
96
Ba bados
IBS
107
España
ASW
61
A oame icanos
ITU
102
India
BEB
86
Bengali, Bangladesh
JPT
104
Japón
CDX
93
Dai, China
KHV
99
Kinh, Vie nam
CEU
99
Eu opeos de Amé ica
LWK
99
Luhya, Kenya
CHB
103
Bejing, China
MSL
85
Mende, Sie a Leona
CHS
105
Han, China
MXL
64
Cali o nia, EEUU
CLM
94
Colombia
PEL
85
Lima, Pe ú
ESN
99
Esan, Nige ia
PJL
96
Punjabi, Pakis án
FIN
99
Finlandia
PUR
104
Pue o Rico
GBR
91
Reino Unido
STU
102
S i Lanka
GIH
103
Guja a i, India
TSI
107
Toscani, I alia
GWD
113
Gambia
YRI
108
Yo uba, Nige ia
