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Probabilidad de detección de pedigrees erróneos mediante polimorfismos bioquímicos en razas caninas españolas

Jordana i Vidal, Jordi; Sánchez Bonastre, Armando; Piedrafita Arilla, Jesús

Abstract

Mediante técnicas convencionales de electroforesis, se realiza un estudio poblacional de once marcadores genéticos sanguíneos -polimorfismos bioquímicos- para un total de 484 individuos, pertenecientes a diez razas caninas españolas. La información aportada a partir de los valores de las frecuencias génicas de los once sistemas polimórficos, nos permite estimar, en cada una de las razas, las probabilidades de detección de errores en el pedigree. Considerando los once polimorfismos conjuntamente, y en el caso de un único individuo analizado por camada, se obtienen unos valores que oscilan entre el 72,02% para la raza Ca de Bestiar y el 83,02% para la raza Mastín Español, con un valor promedio del 78,29% para el conjunto de las razas. La probabilidad de exclusión de falsas filiaciones se incrementa hasta un valor promedio, para las diez razas, del 92,07%, con unos valores extremos del 88,55% para Ca de Bestiar y del 94,68% para Mastín Español, si se analizan cinco descendientes por camada. Se discute asimismo, la relación eficacia/coste de cada uno de los sistemas de detección (electroforesis en gel de almidón, en gel de poliacrilamida y bidimensional) en el protocolo de control de parentesco.

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CLINICA VETERINARIA DE PEQUEÑOS ANIMALES Volumen 10 Núme o 3 Julio/Sep iemb e 1990 J. Jo dana A. Sánchez J. Pied a i a Uni a de Millo a Genè ica Animal, Depa amen de Pa ología i de P oduccióAnimals, Facul ad de Ve e ina ia, Uni e si a Au ónoma de Ba celona. 08193 Bella e a. Ba celona. 151 P obabilidad de de ección de pedig ees e óneos median e polimo ismos bioquímicos en azas caninas españolas RESUMEN PALABRAS ClAVE Median e écnicas con encionales de elec o o esis, se ealiza un es udio poblacional de once ma cado es gené icos sanguíneos -polimo ismos bioquímicos- pa a un o al de 484 indi iduos, pe enecien es a diez azas caninas españolas. La in o mación apo ada a pa i de los alo es de las ecuencias génicas de los once sis emas polimó icos, nos pe mi e es ima , en cada una de las azas, las p obabilidades de de ección de e o es en el pedig ee. Conside ando los once polimo ismos conjun amen e, y en el caso de un único indi iduo analizado po camada, se ob ienen unos alo es que oscilan en e el 72,02% pa a la aza Ca de Bes ia y el 83,02% pa a la aza Mas ín Español, con un alo p omedio del 78,29% pa a el conjun o de las azas. La p obabilidad de exclu- sión de alsas iliaciones se inc emen a has a un alo p omedio, pa a las diez azas, del 92,07%, con unos alo es ex emos del 88,55% pa a Ca de Bes ia y del 94,68% pa a Mas ín Español, si se analizan cinco des- cendien es po camada. Se discu e asimismo, la elación e icacia/cos e de cada uno de los sis emas de de ección (elec o o esis en gel de almidón, en gel de poliac ilamida y bidimen- sional) en el p o ocolo de con ol de pa en esco. 67 Pe o; Polimo ismo; Pedig ee. ABSTRACT A o al o 11 gene ic loci encoding enzymes and o he blood p o eins has been assayed by con en ional echniques al elec opho esis in 484 indiuiduals, belonging o 10 spanisb b eeds c dogs. In each b eed he in o ma ion p o ided by he alues al he allelic equencies in he 11 polymo phic sys ems can be used o assess he p obabili ies o de ec e oneous pedig ees. Using he whole se o be 11 polymo pbisms, and in he case 011 indi idual analyzed pe li e , he alues anged be ween 72,02% o he "Ca de Bes ia " b eed and 83,02% in he "Mas ín Español" b eed, wi h an a e age al 78,29%. The p obabili ies o exclude alse ilia ions inc ease o an a e age 0192, O7% la he 10 b eeds, om 88,55% in "Ca de Bes ia " o 94,68% in "Mas ín Español", i 5 o sp ings a e used pe li e in he analysis. The ela ionship be ween he e iciency and he cos o each sys em o de ec ion (elec opho esis in s a ch J. jo dana A. Sánchez J. Píed a i a 152 gel) in polyac ilamyde gel and bidimensional) in he p o ocol 01 con ol 01 ela ionship is also discussed. KEYWORDS Dog, Polymo phism; Pedig ee. INTROOUCCION El con ol de pa en esco o la iliación inco ec a de un indi iduo espec o a unos de e minados p ogeni o- es, es obje o de c ecien e p eocupación pa a los c ia- do es de pe os, sus o ganismos p o esionales, y en gene al pa a cualquie po encial comp ado que desee un de e minado animal de pedig ee con as ado. La c ecien e impo ancia socio-económica que es án ad- qui iendo de e minadas azas caninas, en e ellas algu- nas españolas, es mo i o su icien e pa a dedica una a ención especial al ema en cues ión. Aunque hoy en día, desde el pun o de is a écnico, exis e una me odología adecuada pa a la e i icación de posibles pa e nidades aducidas en la especie cani- na O-6J, su u ilización de o ma u ina ia es á lejos de se una ealidad en nues o país. El p incipio de odas las p uebas de exclusión de pa e nidad, con la ayuda de ma cado es gené icos -po- limo ismos bioquímicos-, se basa en que cualquie alelo cuyo p oduc o de ec emos en un indi iduo, debe es a p esen e al menos en uno de los pad es. Cuando es o sucede, el pa en esco supues o es compa ible -po- sible-, en caso con a io es incompa ible. Aunque los polí no ísmos bioquímicos no pueden da nos la p ueba i e u able de que un de e minado macho es de hecho el e dade o p ogeni o del indi i- duo, ya que siemp e exis e la posibilidad de que uno also pueda posee , debido al aza , una combinación de genes compa ible con el pa en esco, sin emba go, cuando el núme o de ma cado es gené icos aumen a, la p obabilidad de asigna una alsa pa e nidad, debida al aza , disminuye. Las p obabilidades de exclusión no ienen po qué coincidi en di e en es azas, siendo po an o inap o- piado ex apola los esul ados ob enidos en una de e - minada población hacia o as. Pa a cada aza la in o - mación apo ada po un de e minado polimo ismo puede se dis in a, ya que depende del núme o de P obabilidad de de ección de pedig ees e óneos median e polimo ismos bioquímicos en azas caninas españolas alelas exis en es y de los alo es de las ecuencias génicas de los mismos. Un locus génico apo a á el máximo de in o mación cuan o mayo sea el núme o de alelas de ec ados y cuando las ecuencias génicas de dichos alelas omen alo es in e medios. Es po es o que p esen amos aquí los esul ados de un p ime es udio ealizado a pa i de la in o mación apo ada po once ma cado es gené icos sanguíneos de diez azas caninas españolas. MATERIAL Y METOOOS Se han es imado las ecuencias génicas e e en es a once polimo ismos bioquímicos, median e écnicas con encionales de elec o o esis -elec o o esis en gel de almidón, poliac ilamida y aga osa-poliac ilamida (bidimensional), con las modi icaciones opo unas pa- a cada caso' , en diez poblaciones caninas españolas: Gas d'A u a, con una mues a in eg ada po 93 anima- les, Mas ín de los Pi ineos (55), Mas ín Español (45), Pe digue o de Bu gos (42), Galgo Español (31), Sabue- so Español (53), Ca de Bes ia (46), Podenco Ibicenco (71), Podenco Cana io (IS) y Podenco Ibé ico (33). Los once sis emas polimó icos analizados han sido los siguien es: Supe óxido dismu asa (Sod), Leucin aminopep idasa (Lap), Manosa os a o isome asa (MPI), Albúmina (Alb), Pep idasa-D (Pep-D), T ans e- ina (TD, alB-Glicop o eína ( xl B), ccl-P o easa inhi- bido (Pi-1), P e ans e ina-l (P -L), P e ans e ina-2 (P -2) y Pos albúmina-l (Pa-I). La exp esión ' que pe mi e es ima la p obabilidad p omedio de exclui la p esun a pa e nidad de un ma- cho, median e un único sis ema compues o de dos alelas codominan es (A y B) es la siguien e: P AE = pAqa (I-pAqa) donde pA y qs son las ecuencias génicas de A y B espec i amen e. Exis e asimísmow una ó mula gene al aplicable a sis emas con "n" alelas codominan es. P; =~ pll-pY - Li>i(piPi)2 • [4-3(pi + Pi)] siendo Pi,j las ecuencias alélicas de los genes i y j espec i amen e. Si se u ilizan "m" sis emas, se puede calcula la p o- babilidad o al o combinada a pa i de la siguien e exp esión: P T = I - (I-p¡)(I-P2) 'oo (I-Pi) oo. (I-Pm,) Es as ó mulas son álidas pa a exclusiones de pa- 68 CLINICA VETERINARIA DE PEQUEÑOS ANIMALES Volumen lO Núme o3 Julio/Sep iemb e 1990 P obabilidad de de ección de pedíg ees e óneos median e polimo ismos bioquímicos en azas caninas españolas 153 (N) co esponde al amaño de mues a analizado e nidad a pa i de un único descendien e, y pueden usa se como con ol de u ina en azas de especies unípa as. Sin emba go, en las especies mul ípa as, como el pe o, podemos ob ene una in o mación adicional u ilizando más de un descendien e po camada. La p obabilidad de exclusión es unción del núme o de cacho os analizados. Dicha p obabilidad se op imiza cuando se dispone de cinco descendien es, a pa i de es e núme o los inc emen os de p obabilidad son mí- 69 ].Jo dana A. Sánchez ]. Pied a i a 154 Tabla 2 MPm=l m=5 MEm=l m=5 SEm=l m=5 ¡CBm=l m=5 10,14 17,25 0,00 0,00 0,00 0,00 Plm=l 4,11 0,00 1;83 m=5 7,72 0,00 nímos'>. Pa a es e amaño de camada la exp esión a u iliza se ía: P, = 1 + L¡[p2¡C2-p0]2-2[L¡p2¡(2-p0]2 + 4 CL¡p3¡)2- 4L¡p6¡ simpli icándose la ó mula pa a un loeus génico con dos alelas a: Pn = 2pq - 5p2q2 + 6p3q3 RESULTADOS Y DISCUSION En la Tabla 1 se p esen an, pa a cada aza, con el análisis de los once polimo ismos bioquímicos, los alo es de las ecuencias génicas ob enidos. A pa i P obabilidad de de ección de pedig ees e óneos median e polimo ismos bioquímicos en azas caninas españolas de dichos alo es se calculan las p obabilidades p o- medio de de ec a e o es de pedig ee con cada uno de dichos sis emas y la p obabilidad o al combinada pa a cada una de las azas. Asimismo se ealizan los cálculos pa a la exclusión de pa e nidad en el caso de que se disponga de cinco cacho os pe enecien es a la misma camada, al como mues an las Tablas 2 y 3. Lógicamen e, los sis emas que apo an más in o ma- ción son aquellos con ecuencias génicas in e medias y con un ele ado núme o de alelas. Sin emba go, en la u ilización de los polimo ismos bioquímicos como mé- odo de u ina pa a la de ección de iliaciones e óneas, debemos p ocu a que su elación e icacia/cos e sea la 70 CLINICA VETERINARIA DE PEQUEÑOS ANIMALES Volumen 10 Núme o3 Julio/Sep iemb e 1990 P obabilidad de de ección de pedig ees e óneos median e polimo ismos bioquímicos en azas caninas españolas 155 (A) P obabilidad combinada cuando se analizan los once sis emaspolimói icos. (B) P obabilidad combinada cuando se analizan los cinco sis emas de ec ables median e elec o o esis bidimensional (Pi-L, o.l-B, P -L y Pa-L). (C) P obabilidad combinada cuando se ealiza elec o o esis bidimensional (opción B) y además elec o o esis en gel de poliac ilamida que nos de ec a el sis ema T ans e ina. mayo posible. En la Tabla 3, se dan las p obabilidades combinadas de exclusión en los casos de alsas iliacio- nes, u ilizando: a) Los once sis emas polimó icos. b) Los cinco sis emas de ec ables a pa i de una sola écnica, la elec o o esis bidimensional en gel de aga- osa-políac ilamída (Pi-l, alB, Pa-l, P -l y P -2). c) Además de la elec o o esis bidimensional, la elec- o o esis en gel de poliac ilamida, que nos pe mi e de ec a el sis ema T ans e ina (TO. De las es opciones, c eemos más adecuada la e - ce a, ya que el sis ema T apo a una in o mación sus ancial en la mayo ía de las azas, y aunque el gel de poliac ilamida sólo nos si a pa a de ec a un nue o sis ema en elación a la elec o o esis bidimensional, es impo an e señala que al pode se isualiza pe ec a- men e los sis emas alB y Pi-I, dispond íamos de un doble con ol pa a dichos laci. O a en aja adicional se ía la écnica común de inción que poseen los seis sis emas en cues ión, ápida y ela i amen e económi- ca. La p obabilidad p omedio, pa a el conjun o de las diez azas, de de ec a una iliación inco ec a se si úa en o no al 66,47%, oscilando en e unos alo es que an del 58,59% pa a la aza Ca de Bes ia has a el 72,24% pa a Podenco Ibé ico, en el caso de que sólo dispon- 71 gamos de un indi iduo po camada. Si se pueden analiza cinco descendien es po camada, dicha p oba- bilidad se inc emen a has a el 83,30%, con unos alo es ex emos del 77,22% pa a Ca de Bes ia y del 88,00% pa a Podenco Ibé ico. U ilizando odos los sis emas disponibles, esul a ob io que la p obabilidad de de ección aumen a. Si sólo disponemos de un único descendien e, la p oba- bilidad p omedio se si úa en o no al 78,29% (72,02% pa a Ca de Bes ia y 83,02% pa a Mas ín Español), y u ilizando cinco descendien es se ele a has a un 92,07% (88,55% pa a Ca de Bes ia y 94,68% pa a Mas ín Español). Sin emba go, los cinco sis emas no incluidos en la opción C (Sod, Lap, MPI, Alb y Pep-D), equie en la u ilización de una nue a écnica elec o o é ica -elec- o o esis en gel de almidón-, y cada sis ema su p opia écnica especí ica an o a ni el de co ido elec o o é i- ca como a ni el de inción, lo que enca ece de mane a ap eciable los cos es. Además, sólo dos sis emas, Albú- mina (Alb) y Manosa os a o isome asa (MPI) pa ecen apo a de mane a ap eciable su icien e in o mación pa a que pudie an se omados en cuen a, aunque en el sis ema MPI se añade un incon enien e adicional, al se sólo dicho sis ema de ec able en las células blancas de la sang e, lo que implica ía una di e en e, más p e- j.jo dana A.Sánchez J. Pied a i a 156 cisa y cos osa ecogida de mues as, así como una dis in a me odología labo a o ial pa a el p ocesado y almacenaje de dichas mues as. Como comen a io inal des aca la impo ancia que pod ía ene la c eación de un "Cen o de Iden i icación y Ve i icación de Pedig ees Caninos". Iden i icación gené ica de cada uno de los animales en los egis os de los u u os Lib os Genealógicos y e i icación, en su caso, de posibles pa e nidades aducidas, p incipalmen- e pa a ep oduc o es de g an alo . P obabilidad de de ección de pedig ees e óneos median e polimo ismos bioquímicos en azas caninas españolas AGRADECIMIENTOS A Gallina Blanca Pu ina, po la concesión de una ayuda, ob enida en el I G an P emio Pu ina 1985, con la cual se inanció pa cialmen e la pues a en ma cha de la Tesis Doc o al i ulada "Relaciones Gené icas en Cá- nidos Españoles". B iLIOGRAFIA Ge a d, Ch.; B aun, J. P.; Da e, R.; Rico, A. G.: Con ole de ilia ion chez le chien: U ilisa ion p a ique des albumines e pos -albuminez chez le colley. Rec. Méd. Vé ., 163, 12, 1139-1141 (1979) 2 Gundel, H.; Ree z, 1.: Exclusion p obabili ies ob ainable by bio- che nícal poly no phísms in dogs. Anim. Blood G ps biochem. Gene ., 12,123-132 (1981). 3 jamieson, A.: The gene ics o ans e ins in ca le. 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