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[en] (orig)
Zur Ernährungsweise von Isopoden
in Trinkwasserverteilungssystemen
vorgelegt von
Diplom-Biologe
Michael Mayer
aus Paderborn
von der Fakultät III – Prozesswissenschaften
der Technischen Universität Berlin
zur Erlangung des akademischen Grades
Doktor der Naturwissenschaften
– Dr. rer. nat. –
genehmigte Dissertation
Promotionsausschuss:
Vorsitzender: Prof. Dr. rer. nat. Wolfgang Rotard, TU Berlin
Gutachter: Prof. Dr. rer. nat. Ulrich Szewzyk, TU Berlin
Gutachter: Prof. Dr. rer. nat. Hans-Curt Flemming, Universität Duisburg-Essen
Gutachter: Prof. Dr.-Ing. Hans-Joachim Warnecke, Universität Paderborn
Tag der wissenschaftlichen Aussprache: 30. September 2013
Paderborn 2013
D83
Die vorliegende Arbeit entstand in Kooperation der Technischen Universität Berlin,
Fachgebiet Umweltmikrobiologie, Prof. Dr. rer. nat. Ulrich Szewzyk mit der Universität
Paderborn, Technische Chemie und Chemische Verfahrenstechnik, Prof. Dr.-Ing. Hans-
Joachim Warnecke.
Hiermit möchte ich mich sehr herzlich bei Herrn Prof. Ulrich Szewzyk für die biolo-
gische/mikrobiologische Betreuung und die Möglichkeit zum experimentellen Arbeiten
in den Laborräumen des Fachgebietes Umweltmikrobiologie bedanken.
Bei Herrn Prof. Hans-Curt Flemming bedanke ich mich herzlich für die Übernahme des
Zweitgutachtens.
Herrn Prof. Hans-Joachim Warnecke danke ich aus ganzem Herzen für die langjährige
Betreuung und Begleitung ‒ und vor allem für die unzähligen fachlichen und aufmun-
ternden Gespräche, die jederzeit sehr gute Zusammenarbeit sowie die Zukunftsper-
spektive.
Danke an Josephin Schröder, Burga Braun, Susan Mattke, Felix Mildner und Heinz
Danner für die stete Hilfsbereitschaft.
Bei Sandra habe ich mich für Ihre unendliche Geduld zu bedanken!
i
Kurzfassung
Wasserasseln sind „Allesfresser“, doch welche Nahrungsquellen werden im primär
nährstoffarmen Trinkwasser genutzt, welche werden präferiert? Um diese Fragen beant-
worten zu können, wurden Isopoden aus unterschiedlichen deutschen Trinkwasserver-
teilungssystemen über Hydrantenspülungen gesammelt und parallel hierzu Tiere im La-
bor unter definierten Bedingungen gehältert und mit unterschiedlichen Nahrungsquellen
gefüttert. Die Darminhalte der Asseln wurden molekularbiologisch auf Basis der 16S
und 18S rDNA untersucht und charakterisiert.
Die aus Trinkwassersystemen gesammelten Tiere konnten eindeutig den Taxa Asellus
aquaticus (LINNÉ, 1758) und Proasellus cavaticus (LEYDIG, 1871) zugeordnet werden.
Die Fressversuche weisen darauf hin, dass Pilzmyzelien, Bakterienzellen und selbst tote
Artgenossen geeignete Nahrungsquellen für Wasserasseln darstellen ‒ Schimmelpilze
werden hierbei präferiert.
Die Ergebnisse der durchgeführten DNA-Analysen zeigen, dass Wasserasseln bei ihrer
Nahrungssuche in Trinkwasserverteilungssystemen Bodensedimente in Stagnationsbe-
reichen bevorzugt aufsuchen. Dabei stellen neben unterschiedlichen Bakterientaxa auch
Protozoen und insbesondere Schlauchpilze (Ascomycota) bevorzugte Futterquellen dar.
Ein Nachweis hygienisch relevanter Mikroorganismen im Trinkwasser ist über die in
dieser Arbeit vorgestellte Untersuchungsmethode möglich. Molekularbiologische Un-
tersuchungen der Darminhalte von Wasserasseln aus Trinkwasserverteilungssystemen
ermöglichen eine Charakterisierung der Biozönosen und somit eine biologische Beur-
teilung dieser geschlossenen Ökosysteme. Auch können hierüber Veränderungen der
Rohwasserzusammensetzung, Lecks im Rohrsystem oder Fremdwassereinspeisungen
erkannt, bzw. die Effektivität von Rohrnetzspülungen überprüft werden. Wasserasseln,
die bei massenhaftem Vorkommen stets auf eine Störung, wie z. B. erhöhte Nährstoff-
konzentrationen hinweisen, sind somit gute Indikatororganismen zur Beurteilung der je-
weiligen Trinkwasserqualität und erlauben zudem eine frühzeitige Erkennung von tech-
nischen Problemen in Versorgungsnetzen.
ii
Abstract
Fresh water isopods are omnivore. But which food sources do they use in primary
oligotroph drinking-water, which do they prefer? To answer these questions fresh water
isopods were collected from different German drinking-water distribution systems by
hydrant flushing. Additionally individuals were reared in the laboratory under defined
conditions and fed with different food sources. The contents of the isopods guts were
examined and characterized based on 16S und 18S rDNA analysis.
The collected animals are definitely allocated to the taxa Asellus aquaticus (LINNÉ,
1758) and Proasellus cavaticus (LEYDIG, 1871). The feeding experiments indicate that
mycelia, bacteria and even dead individuals of the same species constitute convenient
food sources for fresh water isopods whereas moulds are preferred.
The results of the DNA-analysis show that fresh water isopods prefer to stay for
foraging in soil sediments of stagnation areas in the pipes. Beside bacteria also protozoa
and especially ascomycetes are preferred food sources. The research method developed
in this thesis shows evidence of hygienic relevant micro-organisms in the drinking-
water. Molecularbiological investigations of the contents of the guts are a profound base
to characterize the biocenosis and thereby assess biologically the closed ecosystems.
Furthermore changes in the composition of raw water, leaks in the pipe system or
infiltrations can be recognized. Thus the efficiency of flushing can be evaluated. On one
hand the occurrence of fresh water isopods indicate a disturbance of the ecosystem like
increased food concentration. On the other hand they are a useful indicator to assess the
drinking-water quality and allow for early detection of technical problems in public
water supplies.
iii
Inhaltsverzeichnis
Seite:
1 Einleitung 1
1.1 Lebensraum Trinkwasserverteilungssystem 1
1.2 Wasserasseln in Trinkwasserverteilungssystemen 2
1.3 Fragestellung und Zielsetzung 3
2 Material und Methoden 5
2.1 Material 5
2.1.1 Isopoda 5
2.1.2 Fungi und Schwarzerlenblätter 7
2.1.3 Prokaryota 8
2.2 Methoden 8
2.2.1 Probenahme 9
2.2.2 Hälterung der Isopoden 10
2.2.3 Fressversuche 11
2.2.3.1 Fungi 11
2.2.3.2 Schwarzerlenblätter 12
2.2.3.3 Prokaryota 12
2.2.3.4 Fungi und Prokaryota 12
2.2.4 Morphologische Artbestimmung 13
2.2.5 Abtöten und Präparation der Tiere 14
2.2.6 Rasterelektronenmikroskopische EDX Untersuchungen 15
2.2.7 Lichtmikroskopische Untersuchungen 17
2.2.8 Chemikalien 17
2.2.9 DNA-Extraktion 18
2.2.9.1 DNA-Extraktion der Proben 18
2.2.9.2 Quantifizierung der DNA 18
2.2.10 Polymerase-Kettenreaktion (PCR) 19
2.2.10.1 Amplifikation der 16S rDNA 19
2.2.10.2 Amplifikation der 18S rDNA 20
iv
2.2.10.2.1 Laborfressversuche Asellus aquaticus
/ Cladosporium herbarum 20
2.2.10.2.2 Freilandproben Asellus auqaticus
und Proasellus cavaticus 21
2.2.10.3 Überprüfung der PCR-Produkte 21
2.2.11 DNA-Sequenzierung 22
2.2.11.1 Sequenzierung der 16S rDNA 22
2.2.11.2 Sequenzierung der 18S rDNA 22
2.2.12 Auswertung der Sequenzierungsergebnisse 23
3 Ergebnisse 24
3.1 Probenahme 24
3.2 Morphologische Artbestimmung 26
3.3 Fressversuche 30
3.3.1 Prokaryota 30
3.3.2 Prokaryota und Fungi 31
3.4 Rasterelektronenmikroskopische EDX Untersuchungen 38
3.4.1 Freilandindividuum Proasellus cavaticus (Probe E1) 38
3.4.2 Freilandindividuum Asellus aquaticus (Probe Br1) 38
3.4.3 Hungerversuch Asellus aquaticus (Probe 12) 39
3.4.4 Freilandindividuum Proasellus cavaticus (Probe E45) 39
3.5 Molekularbiologische Untersuchungen 48
3.5.1 Fressversuch Asellus aquaticus /Cladosporium herbarum 48
3.5.1.1 Probe 10P 48
3.5.1.2 Probe 11P 49
3.5.1.3 Probe 10E 50
3.5.1.4 Probe 11E 50
3.5.2 Hungerversuch 51
3.5.2.1 Probe 12P 51
3.5.2.2 Probe 13P 52
3.5.3 Fressversuch Asellus aquaticus / Schwarzerlenblätter 52
3.5.3.1 Probe B1P 53
v
3.5.3.2 Probe B2P 54
3.5.3.3 Probe B1E 55
3.5.3.4 Probe B2E 55
3.5.4 Freilandprobe Asellus aquaticus 55
3.5.4.1 Probe Br1P 55
3.5.4.2 Probe Br1E 56
3.5.5 Freilandproben Proasellus cavaticus 56
3.5.5.1 Probe E1P 56
3.5.5.2 Probe EIP 57
3.5.5.3 Probe EIIP 58
3.5.5.4 Probe E45P 58
3.5.5.5 Probe EIIIP 59
3.5.5.6 Probe EIVP 59
3.5.5.7 Probe E1E 60
3.5.5.8 Probe EVE 60
3.5.5.9 Probe EVIE 61
3.5.5.10 Probe E45E 62
3.5.5.11 Probe EVIIE 62
3.5.5.12 Probe EVIIIE 62
3.5.6 Zusammenfassende Darstellungen der DNA-Analysen 63
4 Diskussion 66
4.1 Morphologische Artbestimmung 66
4.2 Isopoden in Trinkwasserverteilungssystemen 67
4.3 Rasterelektronenmikroskopische EDX Untersuchungen 68
4.4 Fressversuche 70
4.4.1 Prokaryota 71
4.4.2 Prokaryota und Fungi 72
4.5 Molekularbiologische Untersuchungen 73
4.5.1 Laborversuche 73
4.5.1.1 Fressversuche Asellus aquaticus /
Cladosporium herbarum 74
vi
4.5.1.2 Fressversuche Asellus aquaticus /
Schwarzerlenblätter 76
4.5.1.3 Hungerversuch Asellus aquaticus 77
4.5.2 Freilandproben 78
4.5.2.1 Freilandprobe Asellus aquaticus 78
4.5.2.2 Freilandproben Proasellus cavaticus 79
4.5.3 Fazit 80
5 Zusammenfassung 82
6 Literaturverzeichnis 85
7 Anhang 95
7.1 Streubereiche & Mittelwerte der maximalen Identitäten 96
7.2 Sequenzlängen & maximale Identitäten 99
7.3 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern 116
7.4 Originalsequenzen der ermittelten Taxa 130
7.5 Verzeichnis der Abbildungen 174
7.6 Verzeichnis der Tabellen 179
7.7 Liste der Abkürzungen 185
1
1 Einleitung
In §4 der Trinkwasserverordnung wird definiert, dass Wasser für den menschlichen Ge-
brauch frei von Krankheitserregern, genusstauglich und rein sein muss (TrinkwV 2001).
Viele Endverbraucher denken daher, dass unser wichtigstes Grundnahrungsmittel steril
und somit frei von Mikroorganismen und anderen Lebewesen ist. Doch Trinkwasser ist
kein unbelebtes Medium, sondern ein belebtes, in seiner Gänze jedoch noch immer we-
nig erforschtes System.
1.1 Lebensraum Trinkwasserverteilungssystem
Alle Systeme zur Gewinnung, Aufbereitung und Verteilung von Trinkwasser sind von
Organismen besiedelt (RATHSACK & MICHELS 2006). Schätzungsweise 95 % der ge-
samten Biomasse in Trinkwasserverteilungssystemen befinden sich nach FLEMMING et
al. (2002) auf den Rohroberflächen. Die Mikroorganismen sind hierbei in einer Matrix
aus extrazellulären polymeren Substanzen (EPS) eingebettet, die von ihnen selbst pro-
duziert werden (FLEMMING & WINGENDER 2010). Das Zusammenleben in solchen Bio-
filmen bietet nach FLEMMING (2009) den unterschiedlichsten Taxa zahlreiche ökolo-
gische Vorteile, so dass beinahe alle Mikroorganismen in biofilmähnlichen Aggregaten
leben. KEINÄNEN et al. (2004) geben an, dass die Zusammensetzung der mikrobiellen
Gemeinschaft eines Biofilms im Trinkwasserverteilungsnetz von ganz unterschiedlichen
Parametern, wie z. B. der chemischen Zusammensetzung des Rohwassers, der Art der
Wasseraufbereitung, der Wassertemperatur aber auch dem Material und der Beschaffen-
heit der verbauten Rohre abhängt. VAN DER KOOIJ (1999) beschreibt, dass schon ge-
ringste Konzentrationen biologisch abbaubarer Substanzen im Trinkwasser eine erheb-
liche Biofilmbildung verursachen können. Die wichtigste Maßnahme zur Vermeidung
einer übermäßigen Biofilmbildung stellt somit sicherlich eine Limitierung von Nähr-
stoffen im System dar. Daher sollten auch alle in Trinkwasserverteilungsnetzen ver-
wendeten Materialien, die mit dem Wasser in Kontakt kommen, nicht biologisch ver-
wertbar sein. Neben den in Biofilmen gebundenen oder im Wasserkörper frei suspen-
dierten Bakterien sind in diesen Ökosystemen auch bakterienfressende Protozoen und
selbst kleine Metazoen, wie zum Beispiel Rädertiere, „Würmer“ (Anneliden, Nemato-
den und Plathelminthen) und Kleinkrebse (Cladoceren, Copepoden, Ostracoden und
Isopoden) anzutreffen (VAN LIVERLOO et al. 2012). Eine Aufkonzentration von Biomas-
2
se in Biofilmen kann als Nahrungsquelle für bakterienfressende Taxa fungieren und ge-
gebenenfalls eine Massenentwicklung dieser Organismen nach sich ziehen – auch die
von Wasserasseln.
Aktuell werden bei standardisierten mikrobiologischen Trinkwasseruntersuchungen
nach Trinkwasserverordnung lediglich die zum Zeitpunkt der Probenahme in der Was-
serphase befindlichen und durch anschließende Kultivierung nachweisbaren Bakterien
erfasst. Hygienisch ebenfalls relevante Taxa, wie pathogene Bakterien oder Mikroorga-
nismen fäkalen Ursprungs, die auf Grenzflächen oder in Zwischenräumen ansiedeln und
persistieren können (z. B. MORITZ et al. 2010; BRESSLER et al. 2009; FEAZEL et al.
2009; DONLAN 2002; SZEWZYK et al. 2000), bleiben hierdurch jedoch zumeist uner-
kannt. RATHSACK und MICHELS (2006) weisen zudem darauf hin, dass einheitliche Ver-
fahren zur Beprobung und Bewertung von tierischen Organismen im Trinkwasser sogar
gänzlich fehlen. Detaillierte Kenntnisse über die Lebensgemeinschaften in diesen Habi-
taten geben jedoch nicht nur Aufschluss über die Nährstoffsituation im Verteilungssys-
tem, sie stellen gleichzeitig auch ein geeignetes Mittel dar, um mögliche technische
und/oder hygienische Probleme rechtzeitig erkennen, bewerten und beheben zu können.
1.2 Wasserasseln in Trinkwasserverteilungssystemen
Asseln (Isopoden) bilden eine artenreiche Gruppe innerhalb der Krebstiere und besie-
deln sehr unterschiedliche Biotope. Es gibt einige rein terrestrische Formen, doch die
meisten Taxa leben im Meer oder im Süßwasser. Auch Trinkwasserverteilungssysteme
stellen geeignete Lebensräume für Wasserasseln dar. Obwohl bei Rohrspülungen oft-
mals keine lebenden oder toten Individuen gefunden werden, kann über deren Aus-
scheidungsprodukte, kleine rostbraune Pellets, auf die Anwesenheit der Tiere geschlos-
sen werden. Über das Vorkommen von Wasserasseln in Trinkwasserverteilungssys-
temen existieren zahlreiche, wenn auch zumeist ältere Berichte (z. B. MITCHAM &
SHELLY 1980; BEGER et al. 1966; SCHWARZ et al. 1966; ENGLISH 1958; HOLLAND 1956;
TURNER 1956; HEUSDEN 1948 und KEMPER 1933a, b). Einige aktuellere Fachbeiträge
zum Thema liegen aus Holland (VAN LIEVERLOO et al. 2004), Dänemark (CHRISTENSEN
et al. 2011b; 2012) und Deutschland (GUNKEL & SCHEIDELER 2011) vor. Zumeist han-
delt es sich bei den dokumentierten Tieren um Individuen der Art Asellus aquaticus
(LINNÉ, 1758), welche in der populärwissenschaftlichen deutschen Literatur oftmals als
3
„Gemeine Wasserassel“ bezeichnet wird. Das Taxon ist in Europa weit verbreitet und
besiedelt ein breites Spektrum unterschiedlicher Lebensräume. Populationen sind in
kleinen Teichen, im Uferbereich von Seen aber auch in der Uferzone fließender Ge-
wässer und vereinzelt sogar in unterirdischen Gewässern vorzufinden (z. B. HENRY &
MAGNIEZ 1995, HENRY et al. 1994, SCHMALFUSS & SCHAWALLER 1984; DEELEMAN-
REINHOLD 1965). Asellus aquaticus lässt sich im Labor problemlos hältern und eignet
sich daher sehr gut für unterschiedlichste Versuche und Untersuchungen.
Als wichtigste Eintragsquellen für Wasserasseln in Trinkwasserrohrsysteme führt
CHRISTENSEN (2011a) den Weg über das Rohwasser, Rohrbrüche und Baumaßnahmen
im Verteilungsnetz an. Die ersten dokumentierten Funde rein unterirdisch lebender Iso-
poden im Trinkwasser stammen von FUHLROTT (1849) aus einem Brunnen bei Elberfeld
(heutiger Stadtteil Wuppertals). Zur heimischen Stygofauna zählt WÄGELE (2007) die
Arten Proasellus cavaticus (LEYDIG, 1871), Proasellus coxalis (DOLLFUS, 1892),
Proasellus slavus (REMY, 1948), Proasellus nolli (KARAMAN, 1952) und Proasellus
walteri (CHAPPUIS, 1948). HENRY (1976) und GRUNER (1965) charakterisien die ge-
nannten Taxa als bodenlebende und schlecht schwimmende Kleinkrebse.Die ökolo-
gischen und morphologischen Beschreibungen der Grundwasserarten sind jedoch noch
immer überwiegend unvollständig und teilweise als sehr lückenhaft zu werten. Gründe
hierfür sind in der schlechten Zugänglichkeit subterraner, aquatischer Lebensräume und
in den daraus resultierenden technischen Problemen bei der Probeentnahme zu suchen.
Massenvorkommen von sogenannten „Grundwasserasseln“ in Trinkwasserverteilungs-
netzen wurden bislang nicht dokumentiert.
1.3 Fragestellung und Zielsetzung
Wasserasseln können sich als „Allesfresser“ von Bakterien, Pilzen, Pflanzen und Tieren
ernähren (WÄGELE 2007). Doch welche Nahrungsquellen werden im primär nährstoff-
armen Trinkwasser genutzt, welche werden präferiert? Um diese Fragen beantworten zu
können, wurden Isopoden aus unterschiedlichen deutschen Trinkwasserverteilungssys-
temen über Hydrantenbeprobungen gesammelt und parallel hierzu Tiere im Labor unter
definierten Bedingungen gehältert und mit unterschiedlichen Nahrungsquellen gefüttert.
Die Darminhalte ausgewählter Asseln wurden molekularbiologisch auf Basis der 16S
4
und 18S rDNA untersucht und charakterisiert. Ergänzend hierzu wurden elektronen-
und lichtmikroskopische Untersuchungen durchgeführt.
Ziel der vorliegenden Arbeit ist es zu klären, ob über diese innovative Untersuchungs-
methode neue Erkenntnisse zur Ernährungsweise von Wasserasseln in Trinkwassersys-
temen und gleichzeitig detailliertere Informationen über die komplexen Lebensgemein-
schaften, einschließlich der für den Menschen hygienisch relevanten Taxa, in diesen ab-
geschlossenen Ökosystemen gewonnen werden können. Auch soll geklärt werden, ob
sich Isopoden als mögliche Indikatororganismen zur Beurteilung der jeweiligen Trink-
wasserqualität eignen.
5
2 Material und Methoden
2.1 Material
In diesem Kapitel werden die verwendeten Organismen vorgestellt und die zoologi-
schen Fachtermini definiert.
2.1.1 Isopoda
Wasserasseln wurden zwischen September 2010 und November 2012 aus unterschied-
lichen deutschen Trinkwasserverteilungssystemen über Hydrantenspülungen entnom-
men (Abschn. 2.2.1) und deren Darminhalte molekularbiologisch untersucht (Abschn.
2.2.9-2.2.12). Parallel hierzu wurden aus diesen Proben stammende Individuen von
Asellus aquaticus (Abb. 1) an der Universität Paderborn unter definierten Bedingungen
gehältert (Abschn. 2.2.2), in unterschiedlichen Fressversuchen eingesetzt (Abschn.
2.2.3) und hieraus stammende Darminhalte ebenfalls molekularbiologisch analysiert.
Ergänzend hierzu wurden an ausgewählten Darmpräparaten rasterelektronenmikrosko-
pische Untersuchungen durchgeführt (Abschn. 2.2.6).
Abb. 1: Habitus eines männlichen Individuums von Asellus aquaticus
(Lateralansicht)
Detaillierte Kenntnisse zur Morphologie von Isopoden stellen die wichtigste Grundlage
für eine exakte Artbestimmung und erfolgreiche Präparation der Asseldärme dar. Am
Beispiel der Habituszeichnung eines Individuums von Asellus aquaticus (Abb. 2) wird
der typische Körperbau heimischer Wasserasseln nachfolgend beschrieben. Die in die-
6
ser Arbeit verwendeten zoologischen
Fachbegriffe und Abkürzungen werden in Tab. 1
definiert.
Abb. 2: Habitus von Asellus aquaticus, ♀ (Dorsalansicht); Original in
Anlehnung an G. O. S
ARS
, 1897; modifizierte Vorlage nach
G
RUNER
(1965)
Adulte männliche Tiere von Asellus aquaticus erreichen Körperlängen zwischen 12 und
20 mm, weibliche Individuen solche zwischen 8 und 15 mm (G
RUNER
1965). Der Kör-
per oberirdisch lebender Populationen ist meist dunkelbraun oder graubraun gefärbt, le-
diglich an den Muskelansatzstellen der Extremitäten sind hellere Flecken erkennbar
(Abb. 1). W
ÄGELE
(2007) beschreibt, dass Tiere aus unterirdischen Gewässern weniger
oder nicht pigmentiert sind. Der Kopf ist etwa doppelt so breit wie lang, wobei der Vor-
derrand konkav ausgebuchtet und dabei wesentlich kürzer als der Hinterrand ist. Der
lang-ovale Körper ist etwa 2,5- bis 3-mal so lang wie breit und hat seine größte Breite
am 4. und 5. Thorakomer. An den Seitenrändern der Segmente und des Pleotelsons be-
finden sich kurze Borsten. Seitlich am Kopf besitzen die Tiere kleine schwarze Augen
(Abb. 2, Pfeil).
Begriff Abkürzung Erklärung
Antenna a2 zweite Extremität der Euarthropoden, Antenne 2
Antenulla a1 erste Extremität der Euarthropoden, Antenne 1
Cephalothorax
Crustacea
distal
cth
spezieller Terminus für die Erweiterung des Kopfes von Crustaceen
unter Einbezug und Spezialisierung weiterer Körpersegmente und
den entsprechenden Extremitäten
Krebse, Krebstiere, Krustentiere
vom Körper entfernt
Endopodit en Innenast der Euarthropoden-Extremität
Exopodit
Euarthropoda
ex
Außenast der Euarthropoden-Extremität
„Echte“ Arthropoda (Gliederfüßer)
7
Genitalpapille gen. pap. am Übertrag der Spermaflüssigkeit an die Pleopoden 1 beteiligt
Gonopode
lateral/laterad
Maxilla
Maxillula
medial
Pleon
Pleomer
mx2
mx1
Extremität zur sexuellen Fortpflanzung, bei Isopoda Pleopod 2
an der Außenseite / nach außen
Maxille 2 = 5., ursprünglich erstes Rumpfbein des Euarthropoden-
körpers, in der Stammlinie zu den Eucrustacea zum letzten Kopf-
bein werdend, aber erst innerhalb der Eucrustacea in einigen Taxa
als Mundwerkzeug differenziert
Maxille 1 = 4. Bein des Euarthropodenkopfes, Mundwerkzeug
zur Mitte hin, an der Innenseite
hinterer Teil des Thorax der Malacostraca = Thorax II
Pleonsegment
Pleopod plp Schwanzbein des Pleon
Pleotelson plt Körperabschnitt aus einem oder mehrerer Pleomeren und dem
Telson bestehend
Protopodit
proximal
Telson
prot
tel
basaler Abschnitt der Euarthropoden-Extremität, primär vermutlich
ungegliedert oder dreigliedrig
in der Nähe des Körpers
konischer Endabschnitt der Crustacea, davor die Sprossungszone,
am Ende der After und ventroterminal die Insertionsorte der Furkal-
äste
Thorakomer ths beintragendes Rumpfsegment der Eucrustacea
Thorakopod thp nachmaxillare Extremität der Eucrustacea
Uropod urp speziell umgebildeter letzter (6.) Pleopod
Tab. 1: Terminologie Crustacea
2.1.2 Fungi und Schwarzerlenblätter
Bei Voruntersuchungen zu dieser Arbeit konnte im Juli 2010 das zu den Schlauchpilzen
zählende Taxon Cladosporium herbarum in der Wasserphase einiger deutscher Trink-
wasserverteilungssysteme nachgewiesen werden (Abb. 3). GRAÇA et al. (1993a, b;
1994) beschreiben, dass in Oberflächengewässern der Pilzaufwuchs von Blättern, z. B.
Schwarzerlenblättern, eine wichtige Nahrungsquelle für Asellus aquaticus darstellt. Um
abzuklären, ob auch in Trinkwassersystemen Pilze von Wasserasseln gefressen werden
(Abschn. 2.2.3.1), wurde eine Reinkultur von Cladosporium herbarum (DSM-Nr.
63422) über die Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH
(Leibnitz-Institut, Braunschweig) bezogen. Parallel hierzu wurden im August 2010
Schwarzerlenblätter (Alnus glutinosa) für begleitende Fressversuche (Abschn. 2.2.3.2)
im Freiland gesammelt.
8
Abb. 3: Cladosporium herbarum aus einem deutschen Trinkwasserver-
teilungssystemen (Kt: Konidienträger, K: Konidien, D: Detritus)
2.1.3 Prokaryota
Ausgewählten Wasserasseln wurden in verschiedenen Fressversuchen Kulturen der von
K
ALMBACH
et al. (1999) aus Biofilmen des Berliner Trinkwassersystems beschriebenen
Bakterienart Aquabacterium commune und dem aus einem deutschen Tagebau-Brunnen
isolierten Actinobacterium Marmoricola spec. (S
CHRÖDER
2011, persönliche Mittei-
lung) angeboten (Abschn. 2.2.3.3 und 2.2.3.4). Die Flüssigkulturen wurden von der FG
Umweltmikrobiologie, TU Berlin zur Verfügung gestellt.
2.2 Methoden
In diesem Kapitel werden die Probenahme (Abschn. 2.2.1), die Hälterung der Isopoden
(Abschn. 2.2.2), die Versuchsbedingungen bei den unterschiedlichen Freßversuchen
(Abschn. 2.2.3), die morphologische Artbestimmung der Asseln (Abschn. 2.2.4), das
Abtöten und Präparieren der Krebse (Abschn. 2.2.5) sowie die rasterelektronenmikros-
kopischen EDX Untersuchungen (Abschn. 2.2.6) und die lichtmikroskopischen Unter-
suchungen (Abschn. 2.2.7) beschrieben. Anschließend werden die verwendeten Chemi-
kalien (Abschn. 2.2.8) dargestellt und die DNA-Extraktion (Abschn. 2.2.9) sowie die
Versuchsbedingungen für die Amplifikation der DNA (Abschn. 2.2.10) mit nachfol-
gender Sequenzierung (Abschn. 2.2.11) und Auswertung der Ergebnisse (Abschn.
2.2.12) erläutert.
9
2.2.1 Probenahme
Da eine direkte Beprobung der Rohroberflächen von Trinkwasserverteilungssystemen
nicht oder nur mit sehr hohem technischen Aufwand realisiert werden kann, wurde im
gewählten Netzabschnitt eine ausreichend hohe Fließgeschwindigkeit erzeugt über de-
ren hydraulischen Wirkung Isopoden von den Rohrinnenwandungen abgelöst, aber
möglichst unbeschädigt in die Wasserphase überführt und über spezielle 25 µm- und
100 µm-Edelstahl-Filtergazen (Abb. 4B) gesammelt wurden. Der jeweilige zu bepro-
bende Hydrant wurde hierzu über ein Standrohr mit einem C-Schlauch an einer spezi-
ellen Beprobungs- und Filterapparatur (Scheideler Verfahrenstechnik GmbH, Haltern)
angeschlossen (Abb. 4A). Für den Transport wurden die Isopoden in mit 500 ml Lei-
tungswasser gefüllte 1-Liter-Polyethylen-Weithalsflaschen überführt und in einer Kühl-
box gelagert.
Abb. 4: A. Mobile Beprobungs- und Filterapparatureinheit der Firma
Scheideler Verfahrenstechnik GmbH
B. Roter Pfeil markiert die Position der 100 µm-Filtereinheit
10
In dieser Arbeit wird auf Wunsch der Betreiber der beteiligten Wasserwerke und Trink-
wasserverteilungssysteme keine Nennung der Probenahmestandorte vorgenommen. Die
verwendeten Probenbezeichnungen lassen somit keine Rückschlüsse auf die Entnahme-
stellen zu.
2.2.2 Hälterung der Isopoden
Individuen von Asellus aquaticus wurden nach der Probenahme für ca. 2 Sekunden in
20 %-igem Propanol und anschließend für ca. 5 Sekunden in VE-Wasser gewaschen.
Danach wurden die Tiere in mit 2,5 Liter 0,2 µl-sterilfiltriertem Leitungswasser gefüllte
Glas-Exsikkatoren überführt (Abb. 5). Täglich wurden mit einer sterilen Pipette Kot-
pellets vom Boden der Gefäße abgesammelt und danach ca. 30 % des Wassers in den
Reaktoren durch frisches, sterilfiltriertes Leitungswasser ersetzt. Um eine möglichst
konstante, kühle Wassertemperatur in den Zuchtreaktoren gewährleisten zu können,
wurde ein abgedunkelter Kellerraum an der Universität Paderborn als Labor genutzt.
Sauerstoff wurde über handelsübliche Aquarien-Luftpumpen (Firma Eheim) in die ge-
schlossenen Systeme eingebracht. Sämtliche verwendeten Schläuche und andere in den
Reaktoren befindliche Bauteile wurden vor Versuchsbeginn autoklaviert. Die Wasser-
qualität wurde täglich auf die Parameter Sauerstoffgehalt, pH, elektrische Leitfähigkeit
und Wassertemperatur hin untersucht. In Tab. 2 sind die über die Versuchsdauer ge-
messenen Werte dargestellt. Um die Ergebnisse der Fressversuche nicht zu verfälschen,
verblieben die Tiere für 6 Wochen in diesen Exsikkatoren und wurden bis zur Überfüh-
rung in die jeweiligen Versuchsreaktoren nicht gefüttert. Nach H
ENRY
(1976) überleben
Wasserasseln bis zu 18 Monate im Labor ohne Nahrung.
Abb. 5: Hälterungs- und Versuchsreaktor
11
Parameter Wert Einheit
Sauerstoffgehalt 8,9 bis 9,7 mg/l
pH-Wert 7,3 bis 7,6 ‒
elektrische Leitfähigkeit 529 bis 573 µS/cm
Wassertemperatur 9,9 bis 12,8 °C
Tab. 2: Physikalische Wasserparameter während der Hälterung
der Isopoden in den Reaktoren
2.2.3 Fressversuche
Die für die unterschiedlichen Fressversuche verwendeten Reaktoren entsprachen im
Aufbau den unter Abschn. 2.2.2 beschriebenen Hälterungsreaktoren. Jeder Exsikkator
war auch hier mit jeweils 2,5 Liter 0,2 µl-sterilfiltriertem Leitungswasser gefüllt. Das
Wasser wurde während der jeweiligen Versuchsdauer nicht ausgetauscht.
2.2.3.1 Fungi
Die von der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen bezogene
Reinkultur von Cladosporium herbarum (Abschn. 2.1.2) wurde auf gebrauchsfertigen
90 mm Agarplatten (VWR International GmbH, Darmstadt; Tab. 3) im Brutschrank bei
einer von S
CHUBERT
et al. (2007) empfohlenen optimalen Wachstumstemperatur von 25
°C für 9 bis 11 Wochen kultiviert.
Abb. 6: Myzel von Cladosporium herbarum auf Agar;
nach 10 Wochen bei 25 °C im Brutschrank
12
Danach wurden die Myzelien (Abb. 6) flächig mit einem sterilen, breiten Laborspatel
(100 x 20 mm) vorsichtig vom Nährboden abgetragen und in einen Reaktor überführt.
Zum Start des Versuchsansatzes wurden 20 adulte Individuen von Asellus aquaticus in
den Reaktor eingesetzt, nach 10 Tagen wieder entnommen, bis auf Artniveau bestimmt
und danach deren Därme präpariert.
2.2.3.2 Schwarzerlenblätter
Die im Freiland gesammelten Schwarzerlenblätter (Abschn. 2.1.2) wurden in mit 400
ml 0,2 µl-sterilfiltriertem Leitungswasser gefüllten und zuvor autoklavierten 0,5-Liter-
Weithalsflaschen eingelegt und dort für die Dauer von 6 Wochen quellen gelassen. Da-
nach wurden 4 6x6 cm große Blattstücke ausgeschnitten und diese in einen Versuchs-
reaktor überführt. Auch zum Start dieses Versuchsansatzes wurden 20 adulte Individu-
en von Asellus aquaticus in den Reaktor eingesetzt. Nach 10 Tagen wurden die Tiere
aus dem Versuchsgefäß entnommen, bis auf Artniveau bestimmt und die Därme präpa-
riert.
2.2.3.3 Prokaryota
Die in jeweils 1000 ml Flüssignährmedium vorliegenden stationären Reinkulturen von
Aquabacterium commune und Marmoricola spec. (Abschn. 2.1.3) wurden über eine
Wasserstrahlpumpe auf den entsprechenden Cellulose-Acetatfilter (Sartorius GmbH,
Göttingen; Durchmesser 48 mm) mit einer Porengröße von 0,45 µm aufgetragen. An-
schließend wurden beide Filter zusammen mit einem unpräparierten Filter als Kontrolle
in einen Versuchsreaktor überführt (Abschn. 3.3.1), 10 Individuen von A. aquaticus
mittig zwischen den Filtern eingesetzt und dort für die Zeitdauer von 5 Tagen belassen.
An den ersten 4 Tagen wurde die Versuchsanordnung jeweils täglich um 7 Uhr und um
17 Uhr und am 5. Tag abschließenden um 7 Uhr per Digitalkamera dokumentiert.
2.2.3.4 Fungi und Prokaryota
In weiteren Fressversuchen wurden jeweils 10 Individuen von Asellus aquaticus Myze-
lien von Cladosporium herbarum (Abschn. 2.1.2) und eine Bakterienreinkultur des Ta-
xons Marmoricola spec. (Abschn. 2.1.3) als Nahrungsquelle angeboten. Hierzu wurden
die Myzelien vorsichtig, wie in Abschn. 2.2.3.1 beschrieben, vom Nährmedium abge-
13
tragen, in 500 ml 0,2 µl-sterilfiltriertes Leitungswasser überführt und anschließend die
sich in dieser Suspension befindlichen Pilzfäden über eine Wasserstrahlpumpe auf die
Oberfläche eines Cellulose-Acetatfilters (Durchmesser 48 mm) mit einer Porengröße
von 0,45 µm aufgetragen. Über denselben Arbeitsschritt wurde auch eine in 1000 ml
Flüssignährmedium befindliche stationäre Reinkultur von Marmoricola spec. auf eine
Filteroberfläche überführt. Um den Fütterungsversuch parallel zweimal durchführen zu
können, wurden die Filter jeweils mit einer autoklavierten Metallschere halbiert. Über
einen Zeitraum von 9 Tagen wurden dabei täglich um 7 und 19 Uhr die Versuchsan-
ordnungen per Digitalkamera dokumentiert (Abschn. 3.3.2).
2.2.4 Morphologische Artbestimmung
Zur exakten morphologischen Artbestimmung der unterschiedlichen Isopodentaxa ist
die Präparation und mikroskopische Identifikation der ventral am Pleotelson befind-
lichen 2. Pleopoden der männlichen Tiere das aktuell verlässlichste Bestimmungsmerk-
mal (Abb. 7).
Abb. 7: Lage des Pleopoden 2 (plp 2) am Pleotelson (plt) von Asellus
aquaticus, ♂ (Ventralansicht); Cephalothorax und Thorakopoden
wurden abpräpariert; mit Nahrungsbrei gefüllter Darm
Lage und Aufbau dieser spezialisierten, im Dienste der Reproduktion stehenden Pleo-
poden 2 ist in Abb. 8 am Beispiel der „Gemeinen Wasserassel“ dargestellt. Bei Asellus
aquaticus ist die Protopodit (gelb) der Gonopoden jeweils vergrößert, der Exopodit
(blau) zweigliedrig und mit einem breiten, gerundeten 2. Glied versehen. Der Endopodit
(grün) besitzt einen für die Art charakteristischen langen Sporn, der zur Bauchseite ge-
14
richtet ist. Da nach W
ÄGELE
(2007) in Deutschland Verwechslungen von A. aquaticus
mit Proasellus meridianus (R
ACOVITZA
, 1919), einer Art, die auch Augen besitzt,
pigmentiert sein kann und an einigen Orten zusammen mit Asellus aquaticus vorkommt,
möglich sind, wurden für die durchgeführten Untersuchungen ausschließlich adulte
männliche Tiere verwendet.
Abb. 8: A. Detailszeichnung Pleotelson von Asellus aquaticus, ♂ (Ventralansicht); modifizierte Vor-
lage nach R
ACOVITZA
(1919)
B. Detailszeichnung Pleopod 2 von Asellus aquaticus, ♂ (grau = Strukturen/Elemente unsi-
cherer Zuordnung), modifizierte Vorlage nach S
TAMMER
(1932)
2.2.5 Abtöten und Präparation der Tiere
Die im Rahmen der molekularbiologischen, rasterelektronenmikroskopischen, lichtmi-
kroskopischen und fotografischen Untersuchungen verwendeten Tiere wurden nach der
Probenahme oder nach Beendigung der jeweiligen Freßversuche in 70 %-igem Propanol
abgetötet und bis zur Präparation der Gonopoden und des Darmrohrs in kleinen
Schnappdeckelgläschen aufbewahrt, welche mit einem Zahlencode versehen waren, um
die Tiere später zuordnen zu können. Die Pleopoden 2 aller untersuchten männlichen
Tiere wurden unter einer Stereolupe (Elvar der Firma Leitz, Wetzlar) mit Hilfe einer
Kaltlichtquelle (KL 1500 der Firma Schott) als Oberlicht präpariert und anschließend
unter dem Lichtmikroskop (DM 2500 der Firma Leica) charakterisiert und mit einer
Mikroskopkamera (DFC 425 der Firma Leica) digital dokumentiert. Zur Darmpräpara-
tion wurde den Tieren zunächst der Cephalothorax und die Thorakopoden entfernt. An-
schließend wurde das Darmrohr vorsichtig freigelegt (Abb. 9). Bis zur DNA-Extrak-
tion wurden die Asseldärme bei -20 °C im Tiefkühlschrank kurzfristig gelagert. Die im
15
Rahmen der rasterelektronenmikroskopischen Untersuchungen verwendeten Isopoden-
därme wurden bis zur Weiterbearbeitung in 70 %-igem Propanol konserviert.
Abb. 9: Darmpräparation bei Asellus aquaticus (Ventralansicht)
2.2.6 Rasterelektronenmikroskopische EDX Untersuchungen
Eine qualitative chemische Charakterisierung biologischer Proben im mikroskopischen
Maßstab kann am Rasterelektronenmikroskop (REM) mittels Energiedispersiver Rönt-
genanalyse (EDX) zerstörungsfrei durchgeführt werden. Hierbei werden die Atome im
Untersuchungsobjekt durch einen Elektronenstrahl einheitlicher Energie angeregt, wo-
raufhin die Atome instantan Röntgenstrahlung einer für das jeweilige Element spezi-
fischen Energie aussenden. Diese charakteristische Röntgenstrahlung gibt Aufschluss
über die Elementzusammensetzung der Probe, wobei chemische Elemente ab der Ord-
nungszahl 6 (Kohlenstoff) bestimmt werden können. Die Auswertung der Ergebnisse
erfolgt über EDX-Spektren (Absch. 3.4). Die Kritisch-Punkt-Trocknung der Assel-
därme wurde in der Zentralen Einrichtung Elektronenmikroskopie an der Universität
Ulm durchgeführt, das Bedampfen des Materials sowie alle rasterelektonischenmikros-
kopischen EDX-Untersuchungen an der Zentraleinrichtung Elektronenmikroskopie
(ZELMI) der Technischen Universität Berlin. Vor der Kritisch-Punkt-Trocknung wur-
den ausgewählte Asseldärme in eine Alkoholreihe überführt. Hierbei wurden sie lang-
sam über 80 %-iges und 90 %-iges in 100 %-iges Propanol überführt. Die geringe Grö-
ße der Asseldärme und damit die Gefahr eines Verlustes der Präparate bei der Kritisch-
Punkt-Trocknung erforderte die Anfertigung spezieller Trocknungsgefäße (Abb. 10).
Handelsüblichen Eppendorf-Gefäßen wurden zu diesem Zweck die Spitze entfernt und
16
das somit offene Ende mit einer 55-µm-Gazeschicht verschlossen. Der innere Deckel-
bereich der Eppendorf-Gefäße wurde mit einer Lochzange ausgestanzt und ebenfalls
mit 55-µm-Gaze versehen.
Abb. 10: Trocknungsgefäß
Nachdem die Proben in die Trocknungsgefäße überführt waren, wurde das Material in
einem Kritisch-Punkt-Trockner (CPD 030 der Firma Balzers Union) mit flüssigem Koh-
lendioxid getrocknet. Um Verwechslungen ausschließen zu können befand sich immer
nur ein Asseldarm in einem Gefäß. Die getrockneten Proben wurden unter der Stereo-
lupe und Zuhilfenahme eines auf einen Glimmspan geklebten Haares auf einen mit
einem Leit-Tab versehenen Aluminium-Probenteller (Durchmesser = 12 mm der Firma
Plano GmbH, Wetzlar) aufgebracht. Die Lage der einzelnen Asseldärme auf dem Pro-
benteller wurde mittels digitaler Fotografien dokumentiert (Abb. 11).
Abb. 11: Getrocknete Asseldärme auf einem Probenteller
17
In einer Aufdampfanlage (E12E2 der Firma Edwards) wurden die Proben mit einer ca. 8
nm dicken Kohlenstoffschicht versehen. Anschließend wurden die Därme bei 15 bis 20
kV und unterschiedlichen Blendeneinstellungen unter einem digitalen Rasterelek-
tronenmikroskop (S-400 der Firma Hitachi) betrachtet und digitalisiert (Abschn. 3.4).
2.2.7 Lichtmikroskopische Untersuchungen
Die 2. Pleopoden aller im Rahmen der verschiedenen Untersuchungen verwendeten Iso-
poden wurden an einem Lichtmikroskop bei unterschiedlichen Vergrößerungsstufen be-
trachtet und über eine Mikroskopkamera digital dokumentiert. Die mikroskopischen
Untersuchungen wurden an der Universität Paderborn durchgeführt (Abschn. 2.2.5).
2.2.8 Chemikalien
Im Folgenden sind die in dieser Arbeit eingesetzten Chemikalien aufgelistet (Tab. 3, 4
und 5).
Chemikalie Menge
Pepton aus Kasein 15 g/L
Soja-Pepton 5 g/L
NaCl 5 g/L
Agar 15 g/L
Tab. 3: Zusammensetzung der gebrauchs-
fertigen Agarplatten für die Kulti-
vierung von Cladosporium herbarum
Name Chemikalie Menge
50x TAE Tris 242 g
Eisessig 57,1 ml
0,5 M EDTA (pH 8,0) 100 ml
Demineralisiertes Wasser (VE) ad 1l
Gelladepuffer Bromphenolblau 0,25 Vol.-%
Xylencyanol 0,25 Vol.-%
Glycerin in H2O 30 Gew.-%
Tab. 4: Puffer und Lösungen für die Gelelektrophorese
18
Chemikalie Hersteller
Agarose NEEO Ultra-Qualität
Bromphenolblau
EDTA
Eisessig
Ethidiumbromid
EURx GeneMATRIX Soil DNA Purification Kit
Glycerin
PCR-Wasser
Roth, Karlsruhe
Merck, Darmstadt
Merck, Darmstadt
Merck, Darmstadt
Sigma, Steinheim
Roboklon, Berlin
Roth, Karlsruhe
Fluka, Buchs (CH)
PerfectTM 100 bp DNA Ladder Roboklon, Berlin
Primer 1387r (5´ GGG CGG WGT GTA CAA GGC 3´)
Primer 63f (5´ CAG GCC TAA CAC ATG CAA GTC 3´)
Primer Ami6F2 (5´ CCA GCT CCA AGA GTG TAT ATT 3´)
Primer Ami9R (5´ GTT GAG TCG AAT TAA GCC GC 3´)
Primer LR1 (5´ GGT TGG TTT CTT TCC T 3´)
Primer SR6R (5´ AAG TAG AAG TCG TAA CAA GG 3´)
2-Propanol
TAE, 50x, pH 8
TIP MOLBIOL, Berlin
TIP MOLBIOL, Berlin
TIP MOLBIOL, Berlin
TIP MOLBIOL, Berlin
TIP MOLBIOL, Berlin
TIP MOLBIOL, Berlin
Merck, Darmstadt
Bio-Rad Laboratories, München
Taq PCR MasterMix
Tris
Xylencyanol FF
Roboklon, Berlin
Bio-Rad Laboratories, München
Merck, Darmstadt
Tab. 5: Chemikalien für die Präparation der Isopoden, die PCR und die Gelelektrophorese
2.2.9 DNA-Extraktion
2.2.9.1 DNA-Extraktion der Proben
Die in den unterschiedlichen Proben befindliche DNA wurde mit dem zur Klonierung
von Umweltproben geeigneten EURx GeneMATRIX Soil DNA Purification Kit (Robo-
klon, Berlin) nach den Anweisungen des Herstellers extrahiert, in 50 µl des im Kit ent-
haltenen Puffers eluiert und abschließend bei -20 °C gelagert.
2.2.9.2 Quantifizierung der DNA
Die Konzentration der extrahierten DNA wurde mit dem Nano Drop 2000c UV-Vis
Spektrophotometer (Thermo Scientific, Wilmington, USA) gemessen. Zur Messung
wurde jeweils 1 µl Probe eingesetzt. Als Nullprobe wurde der Elutionspuffer aus dem
EURx GeneMATRIX Soil DNA Purification Kit (Roboklon, Berlin) verwendet.
19
2.2.10 Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
Die PCR ist eine molekularbiologische Methode, bei der DNA in vitro und unter Ver-
wendung eines Enzyms, einer thermostabilen DNA-Polymerase, sowie zwei passenden
Oligonukleotidprimer, Pufferlösung und Nukleotiden über unterschiedliche Reaktions-
temperaturen und -zeiten vervielfältigt wird. In den folgenden Abschnitten werden die
Versuchsbedingungen der PCRs für die Klonierung der 16S und 18S rDNA (Abschn.
2.2.10.1 bis 2.2.10.2) und die Überprüfung der PCR-Produkte (Abschn. 2.2.10.3) be-
schrieben.
2.2.10.1 Amplifikation der 16S rDNA
Zur Vervielfältigung der aus den unterschiedlichen Darminhaltsproben (Tab. 7; Proka-
ryota) extrahierten DNA wurde die 16S rDNA mit dem von MARCHESI et al. (1998) pu-
blizierten Vorwärts-Primer 63f und Rückwärts-Primer 1387r (Tab. 5) mittels PCR am-
plifiziert. Jeder PCR-Ansatz enthielt bei einem Endvolumen von 50 µl jeweils 25 µl Taq
PCR MasterMix (Roboklon, Berlin; Tab. 6), 1,5 µl Primer 63f, 1,5 µl Primer 1387r,
zwischen 2 und 5 µl Template sowie zwischen 17 und 20 µl H20. Einige Proben wurden
verdünnt (Tab. 7).
Reagenz Endkonzentration
1x Pol Puffer B 1x
MgCl2 1,5 mM
OptiTaq DNA Polymerase 1,25 U
dNTP 0,2 mM (je dNTP)
Tab. 6: Zusammensetzung Taq PCR MasterMix
Probe Verdünnung Template
(µl)
H20
(µl)
Taq PCR
Master Mix
(µl)
Primer
63f
(µl)
Primer
1387r
(µl)
10P – 2 20 25 1,5 1,5
11P – 2 20 25 1,5 1,5
12P 1:100 2 20 25 1,5 1,5
13P – 2 20 25 1,5 1,5
B1P
B2P
Br1P
E1P
EIP
EIIP
1:50
1:50
–
–
–
–
2
2
2
2
2
2
20
20
20
20
20
20
25
25
25
25
25
25
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
20
E45P – 2 20 25 1,5 1,5
EIIIP – 2 20 25 1,5 1,5
EIVP – 2 20 25 1,5 1,5
Tab 7: Zusammensetzung der PCR-Ansätze für die Vervielfältigung der prokary-
otischen DNA-Sequenzen
Für die PCR wurde der Thermocycler peqSTAR 96 Universal Gradient (PEQLAB
Biotechnologie GmbH, Erlangen) verwendet. Nach einem 2-minütigem initialen Dena-
turierungsschritt bei 95 °C wurden 35 Zyklen bei 95 °C für 20 s, 55 °C für 30 s und 72
°C für 2 min durchgeführt. Die PCR wurde mit einer finalen Elongation für 10 min bei
72 °C abgeschlossen und dann auf 8 °C abgekühlt. Bei jeder PCR wurde ein Ansatz
ohne DNA als Negativkontrolle mitgeführt.
2.2.10.2 Amplifikation der 18S rDNA
2.2.10.2.1 Laborfressversuche Asellus aquaticus / Cladosporium herbarum
Zur Vervielfältigung der aus den Darminhaltsproben (Tab. 8; Eukaryota, Fungi) extra-
hierten DNA wurde die 18S rDNA mit dem von GAMS & MEYER (1998) publizierten
und für Pilz-DNA optimierten Vorwärts-Primer LR1 und Rückwärts-Primer SR6R
(Tab. 5) mittels PCR amplifiziert. Jeder PCR-Ansatz enthielt bei einem Endvolumen
von 50 µl jeweils 25 µl Taq PCR MasterMix (Roboklon, Berlin; Tab. 6), 1,5 µl Primer
LR1, 1,5 µl Primer SR6R, 2 µl Template und 20 µl H20 (Tab. 8).
Probe Verdünnung Template
(µl)
H20
(µl)
Taq PCR
Master Mix
(µl)
Primer
63f
(µl)
Primer
1387r
(µl)
10E – 2 20 25 1,5 1,5
11E – 2 20 25 1,5 1,5
Tab. 8: Zusammensetzung der PCR-Ansätze für die Vervielfältigung der eukary-
otischen DNA-Sequenzen (Fressversuche mit Cladosporium herbarum, Fungi)
Für die PCR wurde der Thermocycler peqSTAR 96 Universal Gradient (PEQLAB
Biotechnologie GmbH, Erlangen) verwendet. Nach einem 2-minütigem initialen Dena-
turierungsschritt bei 94 °C wurden 30 Zyklen bei 94 °C für 1 min, 50 °C für 1 min und
74 °C für 1,5 min durchgeführt. Die PCR wurde mit einer finalen Elongation für 7 min
21
bei 74 °C abgeschlossen und dann auf 4 °C abgekühlt. Bei jeder PCR wurde ein Ansatz
ohne DNA als Negativkontrolle mitgeführt.
2.2.10.2.2 Freilandproben Asellus aquaticus und Proasellus cavaticus
Zur Vervielfältigung der aus den Darminhaltsproben (Tab. 9; Eukaryota) extrahierten
DNA wurde die 18S rDNA mit dem von THOMAS et al. (2006) publizierten Vorwärts-
Primer Ami6F2 und Rückwärts-Primer Ami9R (Tab. 5) mittels PCR amplifiziert. Jeder
PCR-Ansatz enthielt bei einem Endvolumen von 50 µl jeweils 25 µl Taq PCR Master-
Mix (Roboklon, Berlin; Tab. 6), 1,5 µl Primer Ami6F2, 1,5 µl Primer Ami9R, 2 µl
Template und 20 µl H20. Einige Proben wurden verdünnt (Tab. 9).
Probe Verdünnung Template
(µl)
H20
(µl)
Taq PCR
Master Mix
(µl)
Primer
Ami6F2
(µl)
Primer
Ami9R
(µl)
B1E
B2E
Br1E
E1E
EVE
EVIE
1:50
1:50
–
–
–
–
2
2
2
2
2
2
20
20
20
20
20
20
25
25
25
25
25
25
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
E45E
EVIIE
EVIIIE
–
–
–
2
2
2
20
20
20
25
25
25
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
1,5
Tab. 9: Zusammensetzung des PCR-Ansatzes für die Vervielfältigung der eukary-
otischen DNA-Sequenzen (Freilandproben)
Für die PCR wurde der Thermocycler peqSTAR 96 Universal Gradient (PEQLAB
Biotechnologie GmbH, Erlangen) verwendet. Nach einem 5-minütigen initialen Dena-
turierungsschritt bei 94 °C wurden 40 Zyklen bei 94 °C für 1 min, 55 °C für 30 s und 72
°C für 2 min durchgeführt. Die PCR wurde mit einer finalen Elongation für 10 min bei
72 °C abgeschlossen und dann auf 8 °C abgekühlt. Bei jeder PCR wurde ein Ansatz
ohne DNA als Negativkontrolle mitgeführt.
2.2.10.3 Überprüfung der PCR-Produkte
Die erfolgreiche Amplifikation der PCRs wurde mittels Gelelektrophorese in einem
1%-igen Agarose-Gel (Roth, Karlsruhe) nachgewiesen. Als Gelpuffer wurde 1x TAE
und als Laufpuffer 0,5x TAE verwendet. Es wurden jeweils 8 µl PCR-Produkt mit 2 µl
22
6x Gelladepuffer versetzt und auf das Gel aufgetragen. Für die Amplifikate wurde als
Größenstandard 5 µl des PerfectTM 100 bp DNA Ladder (Roboklon, Berlin) eingesetzt.
Die Auftrennung der DNA-Moleküle erfolgte für die PCR-Produkte der Prokaryonten-
Ansätze bei 100 V für 60 min und für die PCR-Produkte der Eukaryonten-Ansätze bei
100 V für 90 min. Zur Detektion wurde das Agarosegel im Ethidiumbromidbad (1 µg/L
in VE H20) für 20 min gefärbt und mit der Geldokumentation MultiImageTM Light
Cabinet, AlphaImager® EC (Alpha Innotech, USA) fotografiert.
2.2.11 DNA-Sequenzierung
2.2.11.1 Sequenzierung der 16S rDNA
Die DNA-Sequenzierung wurde von der Firma Macrogen Inc. (Seoul, Südkorea) durch-
geführt. Hierfür wurde der Primer 63f (Tab. 5) verwendet und pro Probe 48 Klone er-
stellt (Tab. 10; Prokaryota).
2.2.11.2 Sequenzierung der 18S rDNA
Die DNA-Sequenzierung wurde von der Firma Macrogen Inc. (Seoul, Südkorea) unter
Verwendung des Primer LR1 (Tab. 5 und Tab. 10; Eukaryota, Fungi) oder Ami6F2
(Tab. 5 und Tab. 10; Eukaryota) durchgeführt. Pro Probe wurden 24 oder 48 Klone er-
stellt (Tab. 10).
Probe Nachweis Primer Klone
10P Prokaryota 63f 48
11P Prokaryota 63f 48
10E Eukaryota, Fungi LR1 24
11E Eukaryota, Fungi LR1 24
12P Prokaryota 63f 48
13P Prokaryota 63f 48
B1P Prokaryota 63f 48
B2P Prokaryota 63f 48
B1E Eukaryota Ami6F2 48
B2E
Br1P
Br1E
Eukaryota
Prokaryota
Eukaryota
Ami6F2
63f
Ami6F2
48
48
48
E1P
EIP
EIIP
Prokaryota
Prokaryota
Prokaryota
63f
63f
63f
48
48
48
E1E Eukaryota Ami6F2 48
23
EVE
EVIE
Eukaryota
Eukaryota
Ami6F2
Ami6F2
48
48
E45P
EIIIP
EIVP
Prokaryota
Prokaryota
Prokaryota
63f
63f
63f
48
48
48
E45E
EVIIE
EVIIIE
Eukaryota
Eukaryota
Eukaryota
Ami6F2
Ami6F2
Ami6F2
48
48
48
Tab. 10: Zuordnung der verwendeten Primer und An-
zahl der Klone für die DNA-Sequenzierung
2.2.12 Auswertung der Sequenzierungs-Ergebnisse
Die Ergebnisse der DNA-Sequenzierungen wurden mit dem Computerprogramm
BioEdit Sequence Alignment Editor (Ibis Biosciences, USA) bearbeitet und anschlie-
ßend unter Verwendung des Internet-Tools BLAST1 über die jeweilige Sequenzabfolge
das zum Zeitpunkt der Bearbeitung am nächsten verwandte Taxon gesucht.
1http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
24
3 Ergebnisse
3.1 Probenahme
Bei Hydrantenspülungen an ausgewählten Standorten in deutschen Trinkwasservertei-
lungssystemen wurden an mehreren Entnahmepunkten Isopoden nachgewiesen und ge-
sammelt. Das untersuchte Wasservolumen betrug dabei jeweils 1 m³. Charakteristisch
für die Anwesenheit von Asseln war an allen Standorten eine gewisse Trübung und
Braunfärbung der über einen 25 µm-Filter aufkonzentrierten Wasserproben (Abb. 12).
Die Proben bestanden dabei bis zu 70 % aus Asselkot-Pellets (Abb. 13).
Abb. 12: Aufkonzentrierte (25 µm) Trinkwasserproben von einer Ent-
nahmestelle über einen Zeitraum von 12 Monaten (A.-E.)
25
Tabelle 11 zeigt exemplarisch die Untersuchungsergebnisse einer 384 m langen Grau-
guss-Rohrstrecke (d = 80 mm), welche von März 2012 bis März 2013 insgesamt fünf-
mal beprobt wurde. Die Proben wiesen stets Asseln auf. Neben den Assel-Individuen-
dichten wurden auch organoleptische, physikalische und chemische Parameter, sowie
das Vorkommen von Detrituspartikeln und Asselkot-Pellets (Abb. 13) dokumentiert.
Als Detritus wird die Summe der überwiegend aus Organismenresten bestehenden
Schweb- und Sinkstoffe in aquatischen Lebensräumen bezeichnet. Darminhalte der hier
im März 2012, September 2012 und November 2012 gesammelt Isopoden wurden zu-
sätzlich molekularbiologisch untersucht (Abschn. 3.5.5).
Probenahmezeitraum 03.2012 07.2012 09.2012 11.2012 03.2013
Probenbezeichnung
DNA-Sequenzierung
E1P / E1E ‒ EIP / EVE EIIP / EVIE ‒
Trübung Wasserprobe sehr stark stark stark schwach stark
Färbung Wasserprobe dunkelbraun dunkelbraun bräunlich schwach
bräunlich
bräunlich
Geruch Wasserprobe stark modrig modrig schwach
modrig
sehr schwach
modrig schwach
modrig
Wassertemperatur (°C) 8,7 15,6 13,2 10,4 10,7
pH 7,5 7,4 7,5 7,6 7,6
Leitfähigkeit (µS/cm) 460 486 473 514 480
Sauerstoffgehalt (mg/l) 9,3 8,1 9,5 10,0 9,9
PO4-P (mg/l) 0,36 0,3 0,09 < 0,01 0,08
NO3-N (mg/l) 1,4 1,7 1,9 2,2 2,3
Fe (mg/l) 2,89 1,31 0,73 0,13 0,71
Detrituspartikel (H) massenhaft massenhaft viel mäßig viel
Asselkot-Pellets (H) massenhaft massenhaft viel mäßig viel
P. cavaticus (I) 588 236 196 16 57
Tab. 11: Ergebnisse der organoleptisch-physikalisch-chemischen und biologischen Trinkwasseruntersu-
chungen (H = Häufigkeit, I = Indivdiuendichte)
Die Trübung, Bräunfärbung und der modriger Geruch der einzelnen Wasserproben, so-
wie die ermittelten Eisen- und Gesamt-Phosphat-Phosphorkonzentrationen nahmen von
März 2012 bis November 2012 kontinuierlich ab und zeigten sich im März 2013 auf
den der September-Untersuchung entsprechenden Niveaus. Die Wassertemperaturen la-
gen zwischen 8,7-15,6 °C, die pH- und Leitfähigkeitswerte in Bereichen zwischen 7,4-
7,6 und 460-514 µS/cm. Die ermittelten Nitrat-Stickstoffgehalte zeigten sich insgesamt
mäßig, nahmen von März 2012 bis März 2013 dabei jedoch geringfügig zu. Detritus-
Partikel und Asselkot-Pellets wurden im März und Juli 2012 massenhaft in den Proben
vorgefunden. Bis November 2012 nahm deren Anzahl dann stetig ab und stieg im März
2013 wieder leicht an. Isopoden waren in allen Proben vorzufinden, wobei maximal 588
26
Tiere pro m³ Spülvolumen gesammelt wurden. Asselkot-Pellets konnten mittels Licht-
mikroskopie sicher von Detrituspartikeln unterschieden werden (Abb. 13). Insbesonde-
re die dichte Struktur der zylinderförmigen Ausscheidungsprodukte und die unter-
schiedlich braun gefärbten Banden in den Pellets dienen als sicheres Abgrenzungs-
merkmal gegenüber anderen organischen Partikeln.
Abb. 13: Lichtmikroskopische Aufnahme Asselkot-Pellet
(blauer Pfeil) und Detritus (schwarzer Pfeil)
3.2 Morphologische Artbestimmung
Die zwischen September 2010 und November 2012 bei Hydrantenspülungen in deut-
schen Trinkwasserverteilungssystemen gesammelten Individuen von Asellus aquaticus
(Abb. 14) konnten über die Präparation und Identifikation des entsprechenden 2. Pleo-
poden (Abschn. 2.2.4, Abb. 8) sicher bis auf Artniveau bestimmt werden.
Abb. 14: Asellus aquaticus (Dorsalansicht)
27
Bei der lichtmikroskopischen Betrachtung der Extremität ist der lange, nach ventral ge-
richtete Sporn am Endopoditen ein besonders markantes Bestimmungsmerkmal (Abb.
15, Pfeil).
Abb. 15: Lichtmikroskopische Aufnahme des 2. Pleopoden
von Asellus aquaticus (♂); charakteristischer Sporn
am Endopoditen (Pfeil)
An einigen Probenahmepunkten wurden anstelle der vermuteten Gemeinen Wasseras-
sel Individuen der Isopodenart Proasellus cavaticus (L
EYDIG
, 1871) vorgefunden und
gesammelt (Abb. 16).
Abb. 16: Hydrantenspülung; Proasellus cavaticus, Detritus und Rostpartikel
28
Auch die gesammelten Individuen von Proasellus cavaticus konnten nach der Präpara-
tion und Identifikation der 2. Pleopoden (Abb. 17) sicher bis auf Artniveau bestimmt
werden. Der Protopodit ist bei diesem Taxon schwach trapezförmig und zeigt an seinem
Medialrand zwei lange, befiederte Borsten (Abb. 17, schwarze Pfeile). Der Exopodit ist
zweigliedrig. Das erste Glied ist distal verbreitert und überragt so den inneren und äu-
ßeren proximalen Teil des zweiten Gliedes. Distolateral am zweiten Glied befinden sich
zwei befiederte Borsten. Das zweite, eichelförmige Glied ist schmaler und länger als
das erste und trägt am Außenrand bis zu 11 Fiederborsten und distal einen feinen Här-
chensaum (Abb. 17, blaue Pfeile). Der Endopodit ist etwas länger als der Exopodit, be-
sitzt jedoch nicht wie bei Asellus aquaticus einen langen proximalen Sporn (Abb. 15),
sondern an dessen Stelle einen kurzen, stumpf-kegelförmigen Fortsatz. Der Medialrand
des Endopoditen ist konvex, der gegenüberliegende Rand des Gliedes nahezu gerade.
An der Spitze des Innenastes befinden sich zwei Zipfel. Am proximalen Zipfel, der
laterad gebogen ist, ist an der Spitze die feine Öffnung des Samenbehälters lokalisiert
(Abb. 17, rote Pfeile). Der zweite Zipfel ist flach lappenartig und ragt distal weiter her-
vor als der erste (Abb. 17, grüne Pfeile).
Abb. 17: A. Detailzeichnung Pleopod 2 von Proasellus cavaticus, ♂; modifizierte Vorlage nach H
ENRY
(1974); B. Mikroskopisches Präparat des plp2 von P. cavaticus, ♂; A. & B. → schwarze
Pfeile: lange, befiederte Borsten am prot, rote Pfeile: proximaler Zipfel am en mit Öffnung des
Samenbehälters, grüne Pfeile: flacher, lappenartiger Zipfe am en, blaue Pfeile: feiner Härchen-
saum distal auf dem zweiten Glied des ex
29
Der Habitus der bei den Probenahmen gesammelten geschlechtsreifen Individuen von
Proasellus cavaticus ist in Abb. 18 am Beispiel zweier Tiere fotografisch dokumentiert
und nachfolgend beschrieben.
Abb. 18: A. Makroskopische Aufnahme von Proasellus cavaticus, ♂
(Dorsalalansicht)
B. Makroskopische Aufnahme von P. cavaticus, ♂ (Lateralansicht)
Die Körper der untersuchten Asseln waren vom Vorderrand des Cephalothorax bis zum
Hinterende des Pleotelsons maximal 7 mm lang. Die Längen der Antennen und Uropo-
den wurden hierbei nicht mit berücksichtigt. Der unpigmentierte, weißlich schimmernde
Körper der augenlosen Tiere ist etwa viermal so lang wie breit und die Seitenränder ver-
30
laufen fast parallel. Der Kopf ist annähernd doppelt so breit wie lang und das Pleotelson
ist länger als breit und fast rechteckig mit gerundeten Kanten. Die Uropoden sind bei-
nahe so lang wie das Pleotelson. Die ersten Antennen sind kurz, die zweiten wesentlich
länger.
3.3 Fressversuche
Die Wasserasseln wurden im Rahmen der durchgeführten Fressversuche nur zum
Zwecke der fotografischen Dokumentation täglich um 7 und 19 Uhr für jeweils maxi-
mal 5 Minuten künstlichem Licht ausgesetzt. Ansonsten blieb das Kellerlabor für die
gesamte Dauer der unterschiedlichen Fütterungsversuche abgedunkelt.
3.3.1 Prokaryota
Zum Versuchsstart wurden, wie unter Abschn. 2.2.3.3 beschrieben, drei Cellulose-Ace-
tatfilter in einen Versuchsreaktor eingesetzt. Auf einer Filteroberfläche befand sich die
aufgetragen Reinkultur von Marmoricola spec. (Abb. 19.1 und 19.2 A.-I., braun-rötlich
gefärbter Filter zwischen 14 und 16 Uhr-Position) und auf der Oberfläche eines zweiten
Filters die Reinkultur von Aquabacterium commune (Abb. 19.1 und 19.2 A.-I., weißer
Filter zwischen 17.30 und 19 Uhr-Position). Ein dritter unpräparierter Cellulose-Acetat-
filter diente als Kontrollfläche (Abb. 19.1 und 19.2 A.-I., weißer Filter mit blauer Mar-
kierung „N.“, zwischen 21 und 23 Uhr-Position). Nach dem Einsetzen der 10 Individu-
en von Asellus aquaticus am Tag 1 der Versuchsreihe um 6 Uhr mittig zwischen die
drei Filter wurde um 7 Uhr das erste Foto gemacht. Die verwendeten Wasserasseln
saßen dabei auf dem Marmoricola-Filter (6 Individuen; 14 Uhr-Position), dem
Aquabakterium-Filter (3 Individuen; 17.30 Uhr-Position) und dem Kontrollfilter „N.“ (3
Individuen; 22 Uhr-Position). Eine Assel befand sich dabei nicht auf, sondern in der Nä-
he des Aquabakterium-Filters, wurde in der Auswertung aber dennoch hierzu gezählt.
Um 19 Uhr desselben Tages zeigten sich 3 Tiere auf dem unpräparierter Filter und 7 In-
dividuen auf dem Marmoricola-Filter. An den Tagen 2, 3 und 4 hielten sich jeweils alle
Isopoden zu beiden Dokumentationszeitpunkten ausnahmslos auf dem Marmoricola-
Filter auf. Erst am letzten Versuchstag um 7 Uhr zeigten sich 2 Tiere am, bzw. in der
Nähe des Kontrollfilters. Die vorliegenden Bilder dokumentieren, dass die Populations-
dichte der auf den Marmoricola-Filter aufgebrachten Bakterienkultur, welche zu Ver-
31
suchsbeginn die Filteroberfläche flächig rot-braun färbte, während des Versuchs täglich
an Volumen verlor. Gleichzeitig war eine deutliche Zunahme der Menge an Asselkot-
Pellets am, bzw. um den Marmoricola-Filter optisch sichtbar. Der Filter mit der aufge-
brachten Reinkultur von A. commune wurde ab dem 1. Versuchstag um 19 Uhr von den
Tieren gänzlich gemieden.
3.3.2 Prokaryota und Fungi
Wie unter Abschn. 2.2.3.4 beschrieben, wurde dieser Fütterungsversuch parallel zwei-
mal durchgeführt. Zum Versuchsstart wurde daher jeweils ein halber Cellulose-Acetat-
filter mit den aufgetragenen Myzelien von Cladosporium herbarum, bzw. Individuen
der Bakterienart Marmoricola spec. in den entsprechenden Versuchsreaktor eingesetzt.
Zusätzlich diente je ein halber, unpräparierter Cellulose-Acetatfilter als Kontrollober-
fläche. Nachfolgend werden die Ergebnisse der fotografischen Dokumentation für einen
der beiden Fressversuche besprochen (Abb. 20.1-20.3, A-R). Nach dem Einsetzen der
10 Individuen von Asellus aquaticus am 1. Tag der Versuchsreihe um 6 Uhr mittig zwi-
schen die drei Filtern wurde um 7 Uhr das erste Foto der Anordnung gemacht. Die Tiere
waren hierbei auf den Kontrollfilter (= Position N; 4 Individuen), den Bakterien-Filter
(= Position 1; 2 Individuen) und den Pilz-Filter (= Position 2; 4 Individuen) verteilt. Um
19 Uhr desselben Tages zeigten sich 2 Tiere auf der Position 1 und 8 Tiere an der Posi-
tion 2, wobei sich eine Assel unter dem Pilz-Filter versteckt hielt (Abb. 20.1 B; schwar-
zer Pfeil). Am Tag 2 um 7 Uhr befanden sich 9 Individuen auf der Position 2 und 1 In-
dividuum auf der Position N. Die Verteilung der Tiere in der Versuchsanordnung am
Tag 2 um 19 Uhr und am Tag 3 um 7 Uhr war identisch. Jeweils alle 10 Wasserasseln
verweilten an der Position 2, wobei sich auf beiden Bildern ein Tier unter dem Filter
versteckte (Abb. 20.1 D und E; schwarzer Pfeil). Am Tag 3 um 19 Uhr zeigten sich 9
Tiere auf der Position 2 und 1 Tier, welches sich unter Kontrollfilter versteckte (Abb.
20.1 F; schwarzer Pfeil). Am Tag 4 um 7 Uhr zeigten sich 9 Tiere an Position 2 und 1
Tier auf Position 1, wobei sich eine Assel an Position 2 unter dem Filter versteckt hatte
(Abb. 20.2 G; schwarzer Pfeil). Das Bild des 4. Tages um 19 Uhr dokumentiert alle 10
Isopoden an, bzw. in der Nähe der Position 2. Auch hier versteckte sich ein Tier unter
dem Filter (Abb. 20.2 H; schwarzer Pfeil). Am Tag 5 befand sich um 7 Uhr 1 Individu-
um auf Position 1, die restlichen Tiere verweilten an Position 2, wobei ein Individuum
erneut unter den Filter gekrochen war (Abb. 20.2 I; schwarzer Pfeil). Am Tag 5 um 19
32
Uhr und am darauf folgenden 6. Tag um 7 Uhr hielten sich jeweils 9 Isopoden auf, bzw.
in der Nähe der Position 2 und jeweils 1 Isopode auf der Position 1 auf. Das Bild des 6.
Tages um 19 Uhr dokumentiert 7 Asseln auf der Position 2, 2 Asseln an der Position 1
und 1 Individuum auf dem Kontrollfilter. An Position 1 versteckte sich dabei 1 Tier un-
ter dem Filter (Abb. 20.2 L; schwarzer Pfeil). Am Tag 7 um 7 Uhr verweilten 6 Asseln
auf der Position 1 und 4 Isopoden auf der Position 2. Das Bild der Versuchsanordnung
des 7. Tages um 19 Uhr zeigt alle 10 Tiere an der Position 2, wobei ein Tier tot auf dem
Filter lag (Abb. 20.3 N; blauer Pfeil) und sich, wie auch am Tag 8 zu beiden Aufnahme-
zeitpunkten und am Tag 9 morgens, jeweils ein Isopode unter dem Filter versteckt hielt
(Abb. 20.3 N, O, P und Q; schwarze Pfeile). Am Tag 8 um 7 und 19 Uhr zeigten sich je-
weils 3 Tiere an, bzw. in der Nähe der Position 1, 1 Individuum auf dem Kontrollfilter
und 6 Tiere an der Position 2. Das Foto zum 8. Tag um 19 Uhr dokumentiert, dass die
tote Wasserassel von einem Artgenossen angefressen wurde (Abb. 20.3 P; blauer Pfeil).
Am Tag 9 um 7 Uhr befanden sich 3 Tiere auf der Position 1 und 6 Individuen an der
Position 2. Von der toten Assel waren nur noch Reste des Cephalothorax und der Extre-
mitäten im Versuchsreaktor vorzufinden (Abb. 20.3 Q; blaue Pfeile). Der Fressversuch
wurde am Tag 9 um 19 Uhr beendet. 3 Tiere befanden sich hierbei auf der Position 1, 5
Tiere auf bzw. in der Nähe der Position 2 und 1 Tier an der Position N. Extremitäten-
reste und Teile des Cephalothorax befanden sich noch immer im Reaktor (Abb. 20.3 R;
blaue Pfeile). Als bevorzugte Position der Asseln ab dem 1. Versuchstag um 19 Uhr
konnte der Filter mit den aufgetragenen Pilzmyzelien identifiziert werden. Erst ab dem
6. Versuchstag wanderten die Tiere vermehrt im gesamten Reaktor umher. Die ab dem
6. Tag um 19 Uhr tot im Becken liegende Assel war bis zum Morgen des 9. Tages bis
auf Reste des Cephalothorax und Extremitätenteile aufgefressen. Mit der Dauer des
Versuches nahmen die Trübung des Wasserkörpers und die Menge an Asselkot-Pellets
im Reaktor zu. Das Wasser wurde, wie unter Abschn. 2.2.3 beschrieben, während der
gesamten Laufzeit des Fressversuches nicht ausgetauscht. Die Ergebnisse der fotogra-
fischen Dokumentation der 2., parallel durchgeführten und analog konzipierten Ver-
suchsanordnung sind den hier besprochenen Ergebnissen nahezu identisch. Auch hier
hielten sich die Tiere bis zum 5. Tage bevorzugt auf der mit Pilzhyphen präparierten
Filteroberfläche auf. Als auffälligster Unterschied zum besprochenen Ansatz ist das
Überleben aller alle 10 Asseln bis zum Versuchsende zu nennen.
33
Abb. 19.1: Fressversuch mit Asellus aquaticus; A.: Filter links oben = Kontrollfilter („N.“), Filter rechts
oben = Marmoricola spec., Filter mittig unten = Aquabacterium commune
34
Abb. 19.2: Fressversuch mit Asellus aquaticus; G.: Filter oben = Kontrollfilter („N.“), Filter rechts
= Marmoricola spec., Filter links unten = Aquabacterium commune
35
Abb. 20.1: Fressversuch mit Asellus aquaticus; N = Kontrollfilter, 1 = Filter mit aufgetragener Reinkul-
tur des Bakterientaxons Marmoricola spec., 2 = Filter mit aufgetragenen Myzelien des Pilz-
taxons Cladosporium herbarum; schwarzer Pfeil = Individuum versteckt sich unter dem Fil-
ter
36
Abb. 20.2: Fressversuch mit Asellus aquaticus; N = Kontrollfilter, 1 = Filter mit aufgetragener Reinkul-
tur des Bakterientaxons Marmoricola spec., 2 = Filter mit aufgetragenen Myzelien des Pilz-
taxons Cladosporium herbarum; schwarzer Pfeil = Individuum versteckt sich unter dem Fil-
ter
37
Abb. 20.3: Fressversuch mit Asellus aquaticus; N = Kontrollfilter, 1 = Filter mit aufgetragener Reinkul-
tur des Bakterientaxons Marmoricola spec., 2 = Filter mit aufgetragenen Myzelien des Pilz-
taxons Cladosporium herbarum; schwarzer Pfeil = Individuum versteckt sich unter dem Fil-
ter, blauer Pfeil = totes Individuum oder Reste eines toten Individuums
38
3.4 Rasterelektronenmikroskopische EDX Untersu-
chungen
Im Folgenden werden in den Abb. 21, 24, 28 und 31 die rasterelektronenmikrosko-
pischen Bilder unterschiedlicher Wasserasseldarmpräparate wiedergegeben und ausge-
wertet. Die dicken roten Pfeile kennzeichnen dabei die jeweilige Lage des gewählten
Detailausschnittes, die dünnen roten Pfeile markieren die mittels Energiedispersiver
Röntgenanalyse (EDX; Abschn. 2.2.6) untersuchten Bereiche. Die gewählten Quer-
schnittsflächen stammten dabei stets aus dem vorderen Drittel des jeweiligen Darm-
rohres. Die EDX-Spektren (Abb. 22, 23, 25, 26, 27, 29, 30 und 32) bestehen aus ele-
mentspezifischen Peaks und einem breiten unspezifischen Untergrund. Auf der X-Ach-
se der Spektren ist die Energie der Röntgenquanten in Kiloelektronenvolt (keV) aufge-
tragen, in Y-Richtung werden die detektierten Röntgenquanten (cnts = counts) gezählt.
3.4.1 Freilandindividuum Proasellus cavaticus (Probe E1)
Die Abb. 21A und 21B zeigen den Nahrungsbrei im Darmrohr eines Individuums von
Proasellus cavaticus. Das Darmmaterial bestand aus stark komprimierten, klumpigen
Flocken. In den EDX-Spektren (Abb. 22 und 23) zeigen sich die Elemente Kohlenstoff,
Sauerstoff, Calzium und Eisen mit Werten zwischen 470 und 990 cnts, Silizium und
Phosphor mit Werten zwischen 190 und 440 cnts sowie Aluminium, Schwefel und
Mangan mit Zählwerten unter 180 cnts.
3.4.2 Freilandindividuum Asellus aquaticus (Probe Br1)
Der aufgelockerte Nahrungsbrei zeigt im rasterelektronenmikroskopsichen Bild (Abb.
24A und 24B) deutlich gefaltetete Strukturen und weiße, kantige Partikel. Im Detail-
bild (Abb. 24B, Pfeil 3) fallen insbesondere ca. 1 µm kleine, teils abgerundete Struk-
turen auf. Am Messpunkt 1 weist das Element Calzium einen Wert von rund 770 cnts
auf (Abb. 25). Kohlenstoff und Sauerstoff zeigen Werte von 590, bzw. 560 cnts. Am
Messpunkt 2 (Abb. 26) überragt der Kohlenstoffpeak mit 1890 gezählten Röntgenquan-
ten die anderen Elemente deutlich. Sauerstoff liegt auf einem Wert um 350 cnts, die
Elemente Phosphor, Schwefel und Calzium auf Werten jeweils unter 120 cnts. Das Ele-
ment Eisen zeigte am Messpunkt 3 mit 295 cnts den deutlichsten Peak (Abb. 27).
39
Kohlenstoff und Sauerstoff bewegen sich auf Werten zwischen 160 und 180 cnts, die
Elemente Silizium, Phosphor, Schwefel und Calzium stets unter 65 cnts.
3.4.3 Hungerversuche Asellus aquaticus (Probe 12)
Der Darminhalt eines Individuums von Asellus aquaticus, welches über eine Zeitdauer
von 6 Wochen nicht gefüttert wurde (Absch. 2.2.2) zeigt einen feinen, lockeren Nah-
rungsbrei (Abb. 28A und 28B). Am Messpunkt 1 (Abb. 29) ist der Kohlenstoff mit 4720
cnts das dominierende Element. Sauerstoff zeigt sich mit 1000 cnts, Calzium mit rund
340 cnts. Die Elemente Phosphor, Schwefel und Mangan liegen stets unter einem Wert
von 220 cnts. Am Messpunkt 2 (Abb. 30) zeigt sich der Calzium-Peak mit einem Wert
von rund 1450 cnts deutlich erhöht gegenüber den Elementen Kohlenstoff (rund 450
cnts), sowie Sauerstoff und Schwefel (jeweils unter 200 cnts).
3.4.4 Freilandindividuum Proasellus cavaticus (Probe E45)
Der vordere Darmabschnitt eines Indivduums von Proasellus cavaticus wurde unter
dem Rasterelektronenmikroskop fotografisch dokumentiert (Abb. 31) und die Darm-
außenwandung mittels Energiedispersiver Röntgenanalyse (EDX) untersucht. Das Ele-
ment Kohlenstoff zeigt hier mit rund 1100 cnts den deutlichsten Peak (Abb. 32). Sauer-
stoff, Phopsphor, Schwefel und Calzium lagen jeweils unter einem Werte von 250 cnts.
40
Abb. 21: Rasterelektronenmikroskopische Darmquerschnittsbilder, Proasellus cavaticus
(Netzspülung, Probe E1)
A. Roter Pfeil markiert die Lage des gewählten Detailausschnitts (Abb. 21B)
B. Detailausschnitt; Rote Pfeile 1-2 = Messpunkte 1 (Abb. 22) und 2 (Abb. 23)
41
Abb. 22: EDX-Spektrum Probe E1, Messpunkt 1 (Abb. 21B, Pfeil 1)
Abb. 23: EDX-Spektrum Probe E1, Messpunkt 2 (Abb. 21B, Pfeil 2)
keV
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
08.000
Al
Mn
Si
Fe
Fe
Fe
Ca
P
S
Ca
O
C
cnts
keV
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
08.000
Al Mn
Si
Fe
Fe
Fe
Ca
P
S
Ca
O
C
cnts
42
Abb. 24: Rasterelektronenmikroskopische Darmquerschnittsbilder, Asellus aquaticus
(Netzspülung, Probe Br1)
A. Roter Pfeil markiert die Lage des gewählten Detailausschnitts (Abb. 24B)
B. Detailausschnitt; Rote Pfeile 1-3 = Messpunkte 1 (Abb. 25), 2 (Abb. 26) und
3 (Ab.. 27)
43
Abb. 25: EDX-Spektrum Probe Br1, Messpunkt 1 (Abb. 24B, Pfeil 1)
Abb. 26: EDX-Spektrum Probe Br1, Messpunkt 2 (Abb. 24B, Pfeil 2)
C
Ca
Ca
keV
0
100
200
300
400
500
600
700
800
010.00
O
cnts
C
O
P S Ca
keV
0
500
1000
1500
010.00
cnts
44
Abb. 27: EDX-Spektrum Probe Br1, Messpunkt 3 (Abb. 24B, Pfeil 3)
C
O
Si
P S Ca
Fe
Fe
Fe
keV
0
50
100
150
200
250
300
010.00
cnts
45
Abb. 28: Rasterelektronenmikroskopische Darmquerschnittsbilder, Asellus aquaticus
(Hungerversuch, Probe 12)
A. Roter Pfeil markiert die Lage des gewählten Detailausschnitts (Abb. 28B)
B. Detailausschnitt; Rote Pfeile 1-2 = Messpunkte 1 (Abb. 29) und 2 (Abb. 30)
46
Abb. 29: EDX-Spektrum Probe 12, Messpunkt 1 (Abb. 28B, Pfeil 1)
Abb. 30: EDX-Spektrum Probe 12, Messpunkt 2 (Abb. 28B, Pfeil 2)
keV
0
500
1000
1500
2000
08.000
4720cts
Mn
Ca
Ca
S
P
O
C
cnts
keV
0
500
1000
1500
08.000
Ca
S
Ca
O
C
cnts
47
Abb. 31: Rasterelektronenmikroskopische Aufnahme eines Darmrohrs (vorderes Drittel)
von Proasellus cavaticus (Netzspülung, Probe E45); Roter Pfeil markiert die Lage
des Messpunkts (Abb. 32)
Abb. 32: EDX-Spektrum Probe E45, Messpunkt in Abb. 31, Pfeil
C
O P S
Ca
keV
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
1100
010.00
cnts
48
3.5 Molekularbiologische Untersuchungen
Die Ergebnisse der im Rahmen der molekularbiologischen Darminhaltsuntersuchungen
durchgeführten DNA-Analysen (Abschn. 2.2.9-2.2.12) werden in diesem Kapitel darge-
stellt. Nachfolgend steht der Buchstabe „P“ (Prokaryota) als letztes Kürzel in der je-
weiligen Probenbezeichnung für eine durchgeführte 16S rDNA-Untersuchung und der
Buchstabe „E“ (Eukaryota) entsprechend für eine 18S rDNA-Untersuchung. Die Streu-
bereiche der ermittelten maximalen Identitäten und die hierzu berechneten Mittelwerte
sind im Abschn. 7.1 tabellarisch aufgeführt. Die Übersichtsdiagramme zu allen 1104
bearbeiteten Sequenzlängen und maximalen Identitäten, sowie die Zuordnungstabellen
der ermittelten Taxa zu den entsprechenden Klonen und die Darstellung der Originalse-
quenzen dieser Taxa in alphabetischer Reihenfolge sind in den Abschn. 7.2-7.4 abge-
bildet. Die digitalen Dateien aller 1104 von der Firma Macrogen Inc. erstellten DNA-
Sequenzen (Abschn. 2.2.11.2) wurden nach der Bearbeitung mit dem Computerpro-
gramm BioEdit Sequence Alignment Editor (Abschn. 2.2.12) auf unterschiedlichen
Datenträgern zur Archivierung gespeichert. Zur qualitativen Beurteilung der ermittelten
maximalen Identitäten der Sequenzen wird im weiteren Text der Schwellenwert für
Arten nach STACKEBRANDT & GEOBEL (1994) mit x ≥ 97 % und der Schwellenwert für
Gattungen nach KONSTANTINIDIS & TIEDJE (2007) mit x ≥ 95 % verwendet. Nachfol-
gend steht das Kürzel bp für Basenpaare.
3.5.1 Fressversuch Asellus aquaticus / Cladosporium herbarum
Die aus Fressversuchen von Asellus aquaticus mit Myzelien der Pilzart Cladosporium
herbarum als Nahrungsquelle stammenden Därme (Abschn. 2.2.3.1) wurden nach der
Präparation jeweils in einen vorderen und in einen hinteren Abschnitt geteilt. Die In-
halte von 10 vorderen Darmhälften bildeten dabei jeweils eine Probe mit der Bezeich-
nung „10“ und die Inhalte von 10 hinteren Darmhälften jeweils eine Probe mit der Be-
zeichnung „11“.
3.5.1.1 Probe 10P
Den 48 ermittelten Sequenzen können Vertreter der Actinobakterien (Micrococcus
spec.), Bacteroidetes (Flavobacterium denitrificans, Flavobacterium resistens und
Flavobacterium spec.), Alphaproteobakterien (Sphingomonas spec.) und Gammaproteo-
49
bakterien (Pseudomonas spec. und Stenotrophomonas spec.) zugeordnet werden (Abb.
33 und 48). Die zu den Gammaproteobakterien zählende Gattung Pseudomonas spec. ist
mit einem prozentualen Anteil von 34 % das dominante Taxon. Der Mittelwert der 48
Sequenzlängen beträgt 916 bp (siehe Abb. 53), der aller maximalen Identitäten 98,2 %
(Abb. 54). Sämtliche Sequenzen zeigen sich mit den ermittelten Identitäten auf oder
liegen über dem Schwellenwert für Arten oder Gattungen.
Abb. 33: Fressversuch Asellus aquaticus / Cladosporium herbarum (10P):
I. Micrococcus spec. (8 %); II. Flavobacterium spec. (6 %); III.
Flavobacterium denitrificans (6 %); IV. Flavobacterium resistens
(19 %); V. Sphingomonas spec. (19 %); VI. Pseudomonas spec.
(34 %); VII. Stenotrophomonas spec. (8 %)
3.5.1.2 Probe 11P
In der vorliegenden Probe können als nächste kultivierte Verwandte Actinobakterien
(Microbacterium oxydans, Micrococcus spec. und Mycobacterium spec.), Bacteroidetes
(Flavobacterium denitrificans, Flavobacterium resistens und Flavobacterium spec.),
Alphaproteobakterien (Caulobacter spec., Rhodobacter megalophilus, Sphingomonas
spec.), Betaproteobakterien (Acidovorax spec.) und Gammaproteobakterien (Aeromonas
hydrophila, Pseudomonas spec.) ermittelt werden (Abb. 34 und 48). Die Proteobakte-
rien-Klasse Bacteroidetes ist hierbei das dominante Taxon, Flavobacterium resistens
mit einem prozentualen Anteil von 36 % die dominante Art. Der Mittelwert der 48 Se-
quenzlängen beträgt 1030 bp (Abb. 55), der aller maximalen Identitäten 98,3 % (Abb.
56). Bis auf eine analysierte Sequenz (Klon-Nr. 17), die mit einer max. Identität von 96
% als nächsten kultivierten Verwandten die Art Rhodobacter megalophilus anzeigt,
50
liegen alle übrigen Sequenzen mit den ermittelten Identitäten oberhalb des Schwellen-
werts für Arten oder Gattungen.
Abb. 34: Fressversuch Asellus aquaticus / Cladosporium herbarum (11P):
I. Micrococcus spec. (13 %); II. Microbacterium oxydans (2 %);
III. Mycobacterium spec. (4 %); IV. Flavobacterium spec. (11 %);
V: Flavobacterium denitrificans (8 %); VI. Flavobacterium resistens
(36 %); VII. Caulobacter spec. (2 %); VIII. Rhodobacter megalophilus
(6 %); IX. Sphingomonas spec. (6 %); X. Acidovorax spec. (2 %);
XI. Aeromonas hydrophila (4 %); XII. Pseudomonas spec. (6 %)
3.5.1.3 Probe 10E
Für 33 % der sequenzierten Klone kann als nächster bekannter Verwandter das Iso-
poden-Taxon Asellus aquaticus und für 67 % der Klone das Fungi-Taxon Davidiella
tassiana (anamorph: Cladosporium herbarum) bestimmt werden (Abb. 48). Thallus-
teile, welche ohne Kernphasenwechsel vegetativ Vermehrungskeime (Mitosporen, Ko-
nidien etc.) bilden, werden bei den Pilzen Nebenfruchtform oder Anamorphe genannt
(B
RESINSKY
et al. 2008). Der Mittelwert der Klon-Sequenzlängen beträgt 966 bp (Abb.
57), der aller maximalen Identitäten 99,7 % (Abb. 58). Alle Sequenzen liegen mit den
ermittelten Identitäten oberhalb des Schwellenwerts für Arten.
3.5.1.4 Probe 11E
Für 62 % der sequenzierten Klone werden als nächster bekannter Verwandter die Assel-
art Asellus aquaticus und für 38 % der Klone das Fungi-Taxon Davidiella tassiana
(anamorph: Cladosporium herbarum) nachgewiesen (Abb. 48). Der Mittelwert der Se-
quenzlängen beträgt 1002 bp (Abb. 59), der aller maximalen Identitäten 99,4 % (Abb.
51
60). Alle Sequenzen liegen mit den ermittelten Identitäten oberhalb des Schwellenwerts
für Arten.
3.5.2 Hungerversuch
10 Individuen von Asellus aquaticus wurden über die Dauer von 6 Wochen ohne Nah-
rung in einem Reaktor gehältert (Abschn. 2.2.2). Die Inhalte von 10 vorderen Darm-
hälften bildeten dabei eine Probe mit der Bezeichnung „12“ und die Inhalte von 10
hinteren Darmhälften eine Probe mit der Bezeichnung „13“. Um Informationen über die
Zusammensetzung der bakterielle Darmflora zu erhalten, wurden lediglich Primer zum
Nachweis der 16S rDNA eingesetzt. Ein Nachweis der 18S rDNA wurde hier nicht
durchgeführt
3.5.2.1 Probe 12P
In der vorliegenden Probe dominieren Gammaproteobakterien (Aeromonas spec.,
Enterobacter cloacae subsp. cloacae, Enteropacter spec., Pseudomonas putida und
Pseudomonas spec.) mit einem prozentualen Anteil von 96 %. Vertreter der Actino-
bakterien (Arthrobacter oxydans) und Alphaproteobakterien (Afipia spec.) zeigen sich
seltener (Abb. 35 und 49). Innerhalb der Gammaproteobakterien sind die Gattung
Pseudomonas spec. und die Art Pseudomonas putida die dominanten Taxa. Der Mit-
telwert der 48 Sequenzlängen beträgt 1024 bp (Abb. 61), der aller maximalen Identi-
täten 98,7 % (Abb. 62). Sämtliche Sequenzen liegen mit den ermittelten Identitäten
oberhalb des Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
Abb. 35: Hungerversuch Asellus aquaticus (12P): I. Arthrobacter oxydans
52
(2 %); II. Afipia spec. (2 %); III. Aeromonas spec. (8 %); IV.
Enterobacter spec. (19 %); V: Enterobacter cloacae subsp.
cloacae (2 %); VI. Pseudomonas spec. (34 %); VII. Pseudomonas
putida (33 %)
3.5.2.2 Probe 13P
Auch in dieser Probe dominieren mit einem Anteil von 92 % Gammaproteobakterien
(Aeromonas spec., Enterobacter cloacae subsp. cloacae, Enteropbacter spec.,
Pseudomonas putida und Pseudomonas spec.) deutlich. Vertreter der Betaproteobak-
terien (Achromobacter spec. und Chitinibacter spec.) zeigen sich anteilsmäßig unauf-
fällig (Abb. 36 & 49). Innerhalb der Gammaproteobakterien sind die Art Pseudomonas
putida, gefolgt von der Gattung Pseudomonas spec., die beiden dominanten Taxa. Der
Mittelwert der 48 Sequenzlängen beträgt 1067 bp (Abb. 63), der aller maximalen Identi-
täten 98,9 % (Abb. 64). Sämtliche Sequenzen liegen auch hier mit den ermittelten Iden-
titäten oberhalb des Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
Abb. 36: Hungerversuch Asellus aquaticus (13P): I. Achromobacter spec. (6 %); II.
Chitinibacter spec. (2 %); III. Aeromonas sobria (15 %); IV. Enterobacter
spec. (6 %); V: Enterobacter cloacae (2 %); VI. Pseudomonas spec. (23 %);
VII. Pseudomonas putida (42 %); VIII: Stenotrophomonas rhizophila (4 %)
3.5.3 Fressversuch Asellus aquaticus / Schwarzerlenblätter
Auch die Asseldärme, welche aus Fressversuchen von Asellus aquaticus mit gequol-
lenen Schwarzerlenblättern als angebotene Nahrungsquelle stammten (Abschn. 2.2.3.2),
wurden nach der Präparation jeweils in einen vorderen und einen hinteren Abschnitt se-
53
pariert. Die Inhalte von 10 vorderen Darmhälften bilden dabei jeweils eine Probe mit
der Bezeichnung „B1“ und die Inhalte von 10 hinteren Darmhälften jeweils eine Probe
mit der Bezeichnung „B2“.
3.5.3.1 Probe B1P
In der Probe B1P wird eine klare Dominanz an Gammaproteobakterien (Aeromonas
salmonicida, Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida, Crenothrix polyspora,
Enterovibrio spec., Photobacterium spec., Pseudomonas mandelii und Pseudomonas
spec.) festgestellt. Alphaproteobakterien (Caulobacter spec., Hyphomicrobium facile
subsp. tolerans, Hyphomicrobium vulgare und Methylocapsa aurea) zeigen sich hier
mit einem prozentualen Anteil von 10 % (Abb. 37 und 50). Innerhalb der Gamma-
proteobakterien dominieren die Gattung Enterovibrio spec. und die Art Aeromonas
salmonicida. Der Mittelwert der 48 Sequenzlängen beträgt 960 bp (Abb. 65), der aller
maximalen Identitäten 96,6 % (Abb. 66). 18 ermittelte Sequenzen, welche den Taxa
Hyphomicrobium vulgare (Klon-Nr. 24), Crenothrix polyspora (Klon-Nr. 45),
Enterovibrio spec. (Klon-Nr. 1, 2, 6, 10, 11, 22, 28, 29, 31 und 33) und Photobacterium
spec. (Klon-Nr. 4, 8, 15, 16, 42 und 46) zugeordnet werden können, liegen unterhalb
des Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
Abb. 37: Fressversuch Asellus aquaticus / Schwarzerlenblätter (B1P): I. Caulobacter
spec. (2 %); II. Hyphomicrobium facile subsp. tolerans (2 %); III.
Hyphomicrobium vulgare (4 %); IV. Methylocapsa aurea (2 %); V: Aeromonas
salmonicida (25 %); VI. Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida (11 %);
VII. Crenothrix polyspora (2 %); VIII. Enterovibrio spec. (29 %); IX.
Photobacterium spec. (13 %); X. Pseudomonas spec. (2 %); XI. Pseudomonas
mandelii (8 %)
54
3.5.3.2 Probe B2P
Den ermittelten Sequenzen können Vertreter der Actinobakterien (Gaiella occulta),
Bacteroidetes (Flavobacterium hercynium), Alphaproteobakterien (Hyphomicrobium
facile subsp. tolerans, Hyphomicrobium vulgare, Methylobacterium zatmanii,
Methylocapsa aurea, Methylocystis echinoides, Methylosinus trichosporium,
Pedomicrobium fusiforme, Pedomicrobium manganicum, Rhizobiales bacterium,
Rhodobacter spec., Sphingomonas spec. und Sphingopyxis spec.), Deltaproteobakterien
(Geobacter metallireducens) und Gammaproteobakterien (Aeromonas hydrophila
subsp. hydrophila, Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida, Ectothiorhodospira
spec., Enterovibrio spec. und Pseudomonas fluorescens) zugeordnet werden (Abb. 38
und 50). Dominant sind auch hier die Gammaproteobakterien mit einem prozentualen
Anteil von 62 %. Der Mittelwert der 48 Sequenzlängen beträgt 1046 bp (Abb. 67), der
aller maximalen Identitäten 97,5 % (Abb. 68). 9 ermittelte Sequenzen, die den Taxa
Ectothiorhodospira spec. (Klon-Nr. 7), Flavobacterium hercynium (Klon-Nr. 24, 27
und 28), Gaiella occulta (Klon-Nr. 2), Geobacter metallireducens (Klon-Nr. 13),
Hyphomicrobium vulgare (Klon-Nr. 31), Methylocapsa aurea (Klon-Nr. 48) und
Rhizobiales bacterium (Klon-Nr. 18) zugeordnet werden können, liegen unterhalb des
Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
Abb. 38: Fressversuch Asellus aquaticus / Schwarzerlenblätter (B2P): I. Gaiella occulta
(2 %); II. Flavobacterium hercynium (6 %); III. Hyphomicrobium facile subsp.
tolerans (2 %); IV. Hyphomicrobium vulgare (2 %); V. Methylobacterium
zatmanii (2 %); VI: Methylocapsa aurea (6 %); VII. Methylocystis echinoides
(2 %); VIII. Methylosinus trichosporium (2 %); IX. Rhizobiales bacterium
(2 %); X. Rhodobacter spec. (2 %); XI. Pedomicrobium fusiforme (2 %); XII.
Pedomicrobium manganicum (4 %); XIII. Sphingomonas spec. (2 %); XIV.
Sphingopyxis spec. (2 %); XV. Geobacter metallireducens (2 %); XVI.
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila (6 %); XVII. Aeromonas salmonicida
55
subsp. salmonicida (48 %); XVIII. Ectothiorhodospira spec. (2 %); XIX.
Enterovibrio spec. (2 %); XX. Pseudomonas fluorescens (2 %)
3.5.3.3 Probe B1E
In der Probe B1E wird nur DNA von Asellus aquaticus nachgewiesen (Abb. 50). Der
Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 1055 bp (Abb. 69), der aller maximalen Identi-
täten 99,0 % (Abb. 70). Alle Sequenzen liegen mit den ermittelten Identitäten oberhalb
des Schwellenwerts für Arten.
3.5.3.4 Probe B2E
Auch in der Probe B2E kann nur DNA von Asellus aquaticus nachgewiesen werden
(Abb. 50). Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 1027 bp (Abb. 71), der aller
maximalen Identitäten 99,0 % (Abb. 72). Sämtliche Sequenzen liegen mit den ermit-
telten Identitäten oberhalb des Schwellenwerts für Arten.
3.5.4 Freilandprobe Asellus aquaticus
20 über eine Hydrantenspülung gesammelten Individuen von Asellus aquaticus wurden
nach der Artbestimmung die Därme präpariert und anschließend jeweils der Nahrungs-
brei von 10 ganzen Därmen molekularbiologisch untersucht.
3.5.4.1 Probe Br1P
In der vorliegenden Probe können Vertreter der Alphaproteobakterien (Haematobacter
massiliensis, Rhodobacter spec.) und Gammaproteobakterien (Arenimonas spec.,
Erwinia persicina) ermittelt werden (Abb. 39 und 49). Dominant ist hierbei mit einem
prozentualen Anteil von 83 % die zu den Gammaproteobakterien zählende Gattung
Arenimonas spec.. Der Mittelwert der 48 Sequenzlängen beträgt 934 bp (Abb. 73), der
aller maximalen Identitäten 95,4 % (Abb. 74). 8 ermittelte Sequenzen, die als nächste
kultivierte Verwandte die Gattung Arenimonas spec. (Klon-Nr. 20 und 43) und die Art
Haematobacter massiliensis (Klon- Nr. 4, 9, 10, 21, 24 und 25) anzeigen, liegen unter-
halb des Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
56
Abb. 39: Freilandprobe Asellus aquaticus (Br1P): I. Haematobacter massiliensis (13 %);
II. Rhodobacter spec. (2 %); III. Erwinia persicina (2 %); IV. Arenimonas
spec. (83 %)
3.5.4.2 Probe Br1E
In der Probe Br1E wird nur DNA von Asellus aquaticus nachgewiesen (Abb. 49). Der
Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 961 bp (Abb. 75), der aller maximalen Identitäten
99,0 % (Abb. 76). Alle Sequenzen liegen mit den ermittelten Identitäten oberhalb des
Schwellenwerts für Arten.
3.5.5 Freilandproben Proasellus cavaticus
Individuen von Proasellus cavaticus wurden über Hydrantenspülungen an zwei Probe-
nahmepunkten in einem deutschen Trinkwasserverteilungssystem im März 2012 (Hy-
drant 1: Proben-Nr. = E1; Hydrant 2: Proben-Nr. E45), im September 2012 (Hydrant 1:
Proben-Nr. = EI und EV; Hydrant 2: Proben-Nr. EIII und EVII) und im November 2012
(Hydrant 1: Proben-Nr. = EII und EVI; Hydrant 2: Proben-Nr. EIV und EVIII) gesam-
melt und pro Analyse jeweils der Nahrungsbrei von 10 ganzen Därmen untersucht.
3.5.5.1 Probe E1P
Den ermittelten Sequenzen der vorliegenden Probe können Vertreter der Actinobakte-
rien (Aciditerrimonas spec., Microbacterium lacus und Microbacterium oxydans),
Bacteroidetes (Flavobacterium spec.), Firmicutes (Exiguobacterium undae), Alpha-
proteobakterien (Afipia spec., Brevundimonas bullata, Caulobacter vibrioides,
57
Haematobacter massiliensis, Pseudorhodobacter spec. und Rhizobium spec.), Beta-
proteobakterien (Rastonia picketii) und Gammaproteobakterien (Arenimonas spec.,
Pantoea agglomerans und Pseudomonas denitrificans) zugeordnet werden (Abb. 40
und 51). Dominant ist hierbei die zu den Gammaproteobakterien zählende Gattung
Arenimonas spec. mit einem prozentualen Anteil von 67 %. Der Mittelwert der 48 Se-
quenzlängen beträgt 748 bp (Abb. 77), der aller maximalen Identitäten 96,2 % (Abb.
78). 5 der ermittelten DNA-Sequenzen, die als nächste kultivierte Verwandte die Taxa
Aciditerrimonas spec. (Klon-Nr. 26), Arenimonas spec. (Klon-Nr. 28), Haematobacter
massiliensis (Klon-Nr. 20 und 47) und Pseudomonas denitrificans (Klon-Nr. 25) an-
zeigen, liegen unterhalb des Schwellenwerts für Arten oder Gattungen. Die Gattung
Arenimonas spec. unterschreitet hierbei nur für eine Sequenz und um 1 % diesen in der
Literatur beschriebenen Schwellenwert.
Abb. 40: Freilandprobe Proasellus cavaticus (E1P): I. Pantoea agglomerans (2 %); II.
Pseudomonas denitrificans (2 %); III. Aciditerrimonas spec. (2 %); IV.
Microbacterium lacus (2 %); V: Microbacterium oxydans (2 %); VI.
Flavobacterium spec. (2 %); VII. Exiguobacterium undae (2 %); VIII.
Brevundimonas bullata (2 %); IX. Caulobacter vibrioides (2 %); X. Afipia
spec. (2 %); XI. Rhizobium spec. (2 %); XII. Haematobacter massiliensis
(2 %); XIII. Pseudorhodobacter spec. (5 %); XIV. Rastonia picketii (4 %); XV.
Arenimonas spec. (67 %)
3.5.5.2 Probe EIP
In der Probe EIP werden ausschließlich Betaproteobakterien (Acidivorax spec. und
Pelomonas saccharophila) nachgewiesen (Abb. 41 und 51). Das vorherrschende Taxon
ist hierbei die Gattung Acidovorax spec.. Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt
1131 bp (Abb. 79), der aller maximalen Identitäten 98,9 % (Abb. 80). Alle Sequenzen
58
liegen mit den ermittelten Identitäten oberhalb des Schwellenwerts für Arten oder
Gattungen.
Abb. 41: Freilandprobe Proasellus cavaticus (EIP): I. Pelomonas saccharophila (4 %);
II. Acidovorax spec. (96 %)
3.5.5.3 Probe EIIP
Sämtliche ermittelte Sequenzen können der Betaproteobakterien-Gattung Acidovorax
spec. zugeordnet werden (Abb. 51). Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 1046 bp
(Abb. 81), der aller maximalen Identitäten 98,7 % (Abb. 82). Alle Sequenzen liegen mit
den ermittelten Identitäten oberhalb des Schwellenwerts für Gattungen.
3.5.5.4 Probe E45P
In der vorliegenden Probe können Vertreter der Actinobakterien (Microbacterium
paraoxydans), Bacteroidetes (Flavobacterium spec.), Firmicutes (Exiguobacterium
undae), Alphaproteobakterien (Haematobacter massiliensis, Rhodobacter changlensis,
Rhodobacter ovatus, Rhodobacter spec. und Pseudorhodobacter spec.) und Gamma-
proteobakterien (Acinetobacter johnsonii, Arenimonas spec., Erwinia rhapontici,
Pseudomonas spec., Steroidobacter denitrificans und Steroidobacter spec.) nachge-
wiesen werden (Abb. 42 und 52). Auch in dieser Freilandprobe ist die Gattung
Arenimonas spec. mit einem prozentualen Anteil von 54 % das dominante Taxon. Der
Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 819 bp (Abb. 83), der aller maximalen Identi-
täten 96,0 % (Abb. 84). 9 ermittelte Sequenzen, die als nächste kultivierte Verwandte
die Taxa Arenimonas spec. (Klon-Nr. 5, 13, 38 und 42), Haematobacter massiliensis
59
(Klon-Nr. 4 und 17), Pseudomonas spec. (Klon-Nr. 41), Steroidobacter denitrificans
(Klon-Nr. 1) und Steroidobacter spec. (Klon-Nr. 16) anzeigen, liegen unterhalb des
Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
Abb. 42: Freilandprobe Proasellus cavaticus (E45P): I. Microbacterium paraoxydans
(2 %); II. Flavobacterium spec. (4 %); III. Exiguobacterium undae (11 %);
IV. Haematobacter massiliensis (4 %); V: Rhodobacter changlensis (7 %);
VI. Rhodobacter spec. (4 %); VII. Rhodobacter ovatus (2 %); VIII.
Pseudorhodobacter spec. (2 %); IX. Erwinia rhapontici (2 %); X.
Acinetobacter johnsonii (2 %); XI. Pseudomonas spec. (2 %); XII.
Steroidobacter denitrificans (2 %); XIII. Steroidobacter spec. (2 %); XIV.
Arenimonas spec. (54 %)
3.5.5.5 Probe EIIIP
In der Probe EIIIP können Vertreter der Actinobakterien (Mycobacterium spec.; pro-
zentueller Anteil = 2%), Alphaproteobakterien (Bradyrhizobium spec.; prozentueller
Anteil = 2%) und Betaproteobakterien (Acidovorax spec.) ermittelt werden (Abb. 52).
Die Gattung Acidovorax spec. ist mit einem prozentualen Anteil von 96 % das vorherr-
schende Taxon. Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 999 bp (Abb. 85), der aller
maximalen Identitäten 98,8 % (Abb. 86). Sämtliche Sequenzen liegen mit den ermit-
telten Identitäten oberhalb des Schwellenwerts für Gattungen.
3.5.5.6 Probe EIVP
In der Probe EIVP können die 48 ermittelten Sequenzen Vertretern der Alphaproteo-
bakterien (Hyphomicrobium spec.) und Betaproteobakterien (Acidovorax spec.) zuge-
ordnet werden (Abb. 52). Auch hier dominiert die Gattung Acidovorax spec. mit einem
60
prozentualen Anteil von 96 %. Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 1022 bp (Abb.
87), der aller maximalen Identitäten 98,7 % (Abb. 88). Bis auf eine Klon-Sequenz
(Hyphomicrobium spec., Klon-Nr. 35) zeigen sich die ermittelten Identitäten auf oder
über dem Schwellenwert für Arten oder Gattungen.
3.5.5.7 Probe E1E
Den 48 ermittelten Sequenzen der Probe E1E können Vertreter der Amoebozoa
(Protacanthamoeba bohemica), Heterolobosea (Naegleria spec.), Fungi (Acremonium
strictum, Gibberella moniliformis und Pichia spec.) und Crustacea (Proasellus
cavaticus) zugeordnet werden (Abb. 43 und 51). Der Mittelwert der Sequenzlängen
beträgt 1000 bp (Abb. 89), der aller maximalen Identitäten 99,0 % (Abb. 90). Sämtliche
ermittelte Sequenzen zeigen sich oberhalb des Schwellenwerts für Arten oder Gat-
tungen.
Abb. 43: Freilandprobe Proasellus cavaticus (E1E): I. Protacanthamoeba bohemica
(2 %); II. Naegleria spec. (11 %); III. Gibberella moniliformis (23 %); IV.
Acremonium strictum (8 %); V. Pichia spec. (2 %); VI. Proasellus cavaticus
(54 %)
3.5.5.8 Probe EVE
Den 48 Sequenzen der Probe EVE können unterschiedliche Pilz-Taxa (Cladosporium
spec., Fusarium spec., Gibberella moniliformis, Phoma spec.) und ein Isopoden-Taxon
(Proasellus cavaticus) zugeordnet werden (Abb. 44 und 51). Der Mittelwert der
Sequenzlängen beträgt 1092 bp (Abb. 91), der aller maximalen Identitäten 98,9 % (Abb.
61
92). Sämtliche ermittelte Sequenzen zeigen sich oberhalb des Schwellenwerts für Arten
oder Gattungen.
Abb. 44: Freilandprobe Proasellus cavaticus (EVE): I. Cladosporium spec. (4 %); II:
Fusarium spec. (8 %); III: Gibberella moniliformis (36 %); Phoma spec. (4 %);
V. Proasellus cavaticus (48 %)
3.5.5.9 Probe EVIE
Den Sequenzen der Probe EVIE können zwei unterschiedliche Pilz-Taxa (Aspergillus
spec. und Gibberella moniliformis) und die Isopoden-Art Proasellus cavaticus zuge-
ordnet werden (Abb. 45 und 51). Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 1081 bp
(Abb. 93), der aller maximalen Identitäten 98,9 % (Abb. 94). Sämtliche ermittelte Se-
quenzen zeigen sich oberhalb des Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
Abb. 45: Freilandprobe Proasellus cavaticus (EVIE): I. Aspergillus spec. (29 %); II:
Gibberella moniliformis (29 %); III: Proasellus cavaticus (42 %)
62
3.5.5.10 Probe E45E
Den 48 ermittelten Sequenzen der Probe E45E können Vertreter der Amoebozoa
(Protacanthamoeba bohemica), Heterolobosea (Naegleria spec.), Fungi (Gibberella
moniliformis und Sarocladium kiliense) und Isopoden (Proasellus cavaticus) zuge-
ordnet werden (Abb. 46 und 52). Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 1025 bp
(Abb. 95), der aller maximalen Identitäten 98,9 % (Abb. 96). Sämtliche ermittelte
Sequenzen zeigen sich oberhalb des Schwellenwerts für Arten oder Gattungen.
Abb. 46: Freilandprobe Proasellus cavaticus (E45E): I. Protacanthamoeba bohemica
(6 %); II. Naegleria spec. (40 %); III. Gibberella moniliformis (17 %); IV.
Sarocladium kiliense (4 %); V. Proasellus cavaticus (33 %)
3.5.5.11 Probe EVIIE
Den 48 Sequenzen der Probe EVIIE können eine Pilz- (Gibberella moniliformis; pro-
zentualer Anteil = 19 %) und eine Assel-Art (Proasellus cavaticus; prozentualen Anteil
= 81 %) zugeordnet werden (Abb. 52). Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt 1050
bp (Abb. 97), der aller maximalen Identitäten 98,9 % (Abb. 98). Sämtliche ermittelte
Sequenzen zeigen sich oberhalb des Schwellenwerts für Arten.
3.5.5.12 Probe EVIIIE
Auch den 48 Sequenzen der Probe EVIIIE können eine Pilz- (Gibberella moniliformis;
prozentualer Anteil = 27 %) und eine Assel-Art (Proasellus cavaticus; prozentualer An-
teil = 73 %) zugeordnet werden (Abb. 52). Der Mittelwert der Sequenzlängen beträgt
63
hier 1066 bp (Abb. 99), der aller maximalen Identitäten 98,9 % (Abb. 100). Keine der
ermittelten Sequenzen zeigt sich unterhalb des Schwellenwerts für Arten.
3.5.6 Zusammenfassende Darstellungen der DNA-Analysen
Nachfolgend werden die unter Abschn. 3.5.1-3.5.5 beschriebenen Ergebnisse der mole-
kularbiologischen Untersuchungen ergänzend in inhaltlich verdichteten Übersichtsdia-
grammen dargestellt (Abb. 48-52). Die in den Darminhaltsproben ermittelten Arten und
Gattungen werden hierzu jeweils dem übergeordneten Taxon zugeordnet. Für die Pro-
karyonten ist eine Aufteilung in Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria, Alphaproteo-
bacteria, Betaproteobacteria, Deltaproteobacteria und Gammaproteobacteria ‒ für die
Eukaryonten eine in Amoebozoa, Heterolobosea, Ascomycote und Isopoda vorgenom-
men worden. In Abb. 47 sind die für die unterschiedlichen Taxa verwendeten Farb-
codes dargestellt.
Abb. 47: Farbcodierung der übergeordneten Taxa
64
Abb. 48: Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse Proben 10 und 11
Abb. 49: Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse Proben 12, 13 und Br1
Abb. 50: Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse Proben B1
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
10P 11P 10E 11E
Anzahl Taxa [%]
Proben-Nr.
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
12P 13P Br1P Br1E
Anzahl Taxa [%]
Proben-Nr.
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
B1P B2P B1E B2E
AnzahlTaxa[%]
Proben-Nr.
65
Abb. 51: Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse Proben E1, EI, EII, EV, EVI
Abb. 52: Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse Proben E45, EIII, EIV, EVII, EVIII
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
E1P EIP EIIP E1E EVE EVIE
Anzahl Taxa [%]
Proben-Nr.
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
E45P EIIIP EIVP E45E EVIIE EVIIIE
Anzahl Taxa [%]
Proben-Nr.
66
4 Diskussion
In der vorliegenden Arbeit wurden Aspekte zur Ernährungsweise von Wasserasseln in
Trinkwasserverteilungssystemen untersucht. Im Folgenden werden die Ergebnisse be-
wertet und diskutiert. Es wurden Isopoden aus unterschiedlichen deutschen Trinkwas-
serverteilungsnetzen über Hydrantenspülungen gesammelt (Abschn. 4.2) und parallel
hierzu Tiere im Labor unter definierten Bedingungen gehältert und mit unterschied-
lichen Nahrungsquellen gefüttert (Abschn. 4.4). Die Darminhalte ausgewählter Asseln
wurden molekularbiologisch auf Basis der 16S und 18S rDNA untersucht und charak-
terisiert (Absch. 4.5). Ergänzend hierzu wurden elektronenmikroskopische- und licht-
mikroskopische Untersuchungen (Abschn. 4.3 und 4.1) durchgeführt.
4.1 Morphologische Artbestimmung
Da eine eindeutige Artbestimmung der heimischen Wasserasseln momentan nur über
die Betrachtung der Gonopoden möglich ist, wurden alle im Rahmen dieser Arbeit un-
tersuchten Individuen entsprechend lichtmikroskopisch identifiziert. Die über Hy-
drantenspülungen gesammelten Tiere konnten so eindeutig den Taxa Asellus aquaticus
(Abb. 15) und Proasellus cavaticus (Abb. 17) zugeordnet werden. Doch allein für
Proasellus cavaticus nennt HENRY (1976) insgesamt 11 Unterarten, die jeweils nur über
minimale Variationen im Bau der Gonopoden, vor allem in der Ausprägung des lappen-
artigen Zipfels und der Öffnung des Samenbehälters am Endopoditen, unterscheidbar
seien (Abb. 17; grüne und rote Pfeile). So wurde auf seinen Vorschlag hin die ehemals
als cavaticus-Unterart beschriebene Form „walteri (CHAPPUIS, 1948)“ als eigenständige
Art anerkannt. Nachweise dieser Isopodenart liegen für Deutschland aus einem Brunnen
in Freiburg vor (STEENKEN 1998). WÄGELE (2007) wertet die existierenden Beschrei-
bungen der genannten Unterarten jedoch als sehr mangelhaft und weist darauf hin, dass
eine Abgrenzung von Populationen hierüber kaum nachvollziehbar sei. Weiter erwartet
er, dass angesichts der weiten Verbreitung der cavaticus-Gruppe ein ausgeprägter Poly-
morphismus vorkommt. Da bis heute der Status vieler Asseltaxa ungeklärt ist, kann
künftig nur eine Kombination aus klassischen, morphologischen Artbeschreibungen und
modernen, genetischen Populationsanalysen zur Klärung der Verwandtschaftsverhält-
nisse beitragen. Voraussetzungen hierfür sind neben detaillierteren Kenntnissen über die
67
Verbreitungsareale der Taxa auch die Zugänglichkeit dieser Lebensräume für eine Be-
probung.
4.2 Isopoden in Trinkwasserverteilungssystemen
WÄGELE (2007) nennt als natürliche Habitate von Proasellus cavaticus verschiedene
Typen unterirdischer Gewässer, wie Höhlen und Karstgewässer, sowie grobsubstratige
Lückensysteme am Rand von Fließgewässern. Für Deutschland zählen WÄCHTLER
(1937) und er folgende Fundstätten auf: Leine bei Gronau, Brunnen an der Oker bei
Braunschweig, Ufergrundwasser der Weser zwischen Hameln und Holzminden, Klaus-
thaler Gruben und Grumbacher Stollen im Harz, Kluterthöhle bei Ennepetal in West-
falen, Erdmannshöhle in Baden, Ufergrundwasser des Rheins und der Sieg zwischen
Bonn und Siegburg, Höhlen des Siebengebirges, Hilgerhäuser Höhle in Hessen-Nassau,
im Einzugsgebiet der Saale bei Bad Langensalza, Falkensteiner Höhle bei Urach in
Württemberg sowie Brunnen bei Aschaffenburg, Biberach, Freiburg im Breisgau,
Tübingen, München, Idstein im Taunus, Elberfeld, Bonn, Hameln, Holzminden und
Breisach am Rhein. Die von HUSSON & DAUM (1955) in einer Erzgrube in Lothringen
gefundenen Individuen von Proasellus cavaticus hielten sich bei einer Wassertempe-
ratur von 12,6 °C bevorzugt im ruhigen, stagnierenden Wasser auf, wobei der Unter-
grund des 20 bis 40 cm tiefen Gewässers aus faustgroßen Geröllbrocken, Resten alter
Grubenstempel und fauligem Kalkschlamm bestand. Auch die im Rahmen dieser Arbeit
gesammelten Individuen von Proasellus cavaticus zeigten sich in Trinkwasserrohrlei-
tungsabschnitten mit Stagnationsbereichen besonders individuenstark, was über den
Austrag großer Mengen flockigen, eisenhaltigen Bodensediments bei den Hydranten-
spülungen dokumentiert werden konnte (Abb. 12 und 16). Bei den in Tab. 11 darge-
stellten Untersuchungsergebnisse einer 384 m langen Grauguss-Rohrstrecke, welche
von März 2012 bis März 2013 insgesamt fünfmal beprobt wurde, fällt auf, dass der Trü-
bungsgrad der Proben von März 2012 bis November 2012 stetig abnimmt, im März
2013 dann aber wieder leicht ansteigt. Analog hierzu zeigten sich die Verläufe der do-
kumentierten Detrituspartikel-, Asselkot-Pellet- und Eisenkonzentrationen, sowie die
Individuendichten von Proasellus cavaticus. Bekannt ist, dass die Art pro Jahr oft nur
eine Brut, bestehend aus 5 bis über 60 Eiern produziert und die Embryonalentwicklung
unter den Temperaturbedingungen des Grundwassers (11 °C) ca. 2,5 Monate dauert
(WÄGELE 2007). Nach GRUNER et al. (1993) werden trächtige Weibchen dabei zwi-
68
schen Oktober und März angetroffen. Ein Anstieg der Populationsdichten über die Win-
termonate entspricht somit dem natürlichen Entwicklungszyklus dieser Asselart. Im Ge-
gensatz zu Proasellus cavaticus ist Asellus aquaticus über ganz Deutschland weit ver-
breitet. WÄGELE (2007) nennt als Fundorte Uferbereiche von Seen, kleine Teiche,
Randzonen von Fließgewässern sowie Gräben und selbst, wenn auch selten, unterir-
dische Gewässer und das Grundwasser. Als wichtigste Eintragsquellen für Wasserasseln
in Trinkwasserverteilungssysteme führt CHRISTENSEN (2011a) den Weg über das Roh-
wasser, Rohrbrüche und Baumaßnahmen in Verteilungsnetzen auf. Da der Terminus
„Wasserassel“ in vielen, vor allem populärwissenschaftlichen Arbeiten, jedoch fälsch-
licherweise als Synonym für das Taxon Asellus aquaticus, die Gemeine Wasserassel,
verwendet wird, muss hier zukünftig genauer differenziert werden. Für Arten, die wie
A. aquaticus primär in Oberflächengewässern anzutreffen sind, stellen in der Tat Lecka-
gen und Rohr-Reparaturstellen wohl präferierte Eintragswege dar. Doch Taxa, welche
bislang vor allem in unterirdischen Habitaten angetroffen wurden und morphologisch
wie ökologisch optimal an diese Lebensräume angepasst sind, werden wohl eher über
das Grundwasser in Trinkwasserverteilungsnetze eingespült.
4.3 Rasterelektronenmikroskopische EDX Untersu-
chungen
Am Rasterelektronenmikroskop (REM) können mittels Energiedispersiver Röntgen-
analyse (EDX) in einem Bereich von ca. 1 µm um den gewählten Messpunkt chemische
Elemente ab der Ordnungszahl 6 (Kohlenstoff) bestimmt werden. Zur Aussendung ihrer
charakteristischen Röntgenstrahlung müssen die Atome hierfür über einen Elektronen-
strahl angeregt werden. Der Strahldurchmesser betrug bei den im Rahmen dieser Arbeit
durchgeführten Untersuchungen je nach Vergrößerungsstufe zwischen 20 und 50 nm. In
den EDX-Spektren (Abb. 22, 23, 25, 26, 27, 29, 30 und 32) dominieren je nach Wahl
der Messpunkte in den Darmquerschnitten die Elemente Kohlenstoff (C), Sauerstoff
(O), Calzium (Ca) und Eisen (Fe). Einige REM-Bilder zeigen deutliche, sowohl farb-
liche als auch strukturelle Unterschiede zwischen dem jeweils einheitlich dunkel ge-
färbten organischen Nahrungsbrei und den darin eingestreuten helleren, abgerundeten
bis kantigen Partikeln. Vor allem in zwei EDX-Spektren (Abb. 26 und 29) charakteri-
sieren hierbei die detektierten Röntgenquanten des Elements Kohlenstoff mit Werten
zwischen 1890 und 4720 counts besonders deutlich organisches Material als Haupt-
69
komponente der Darminhalte (Abb. 24B-Pfeil 2 und Abb. 28B-Pfeil 1), wohingegen die
hellen Partikel im Nahrungsbrei als Calziumcarbonat (CaCO3, Kalk; Abb. 24B-Pfeil 1,
Abb. 25, Abb. 28B-Pfeil 2 und Abb. 30) oder eisenhaltiges Material (Abb. 24B-Pfeil 3
und Abb. 27) identifiziert werden können. Es ist bekannt, dass Krebse ihre Cuticula mit
Kalkeinlagerungen inkrustieren ‒ daher auch die umgangssprachliche Bezeichnung
Krustentiere. Vor der für alle Arthropoden typischen Häutung wird zumindest ein Teil
des Kalks resorbiert und in verschiedenen Körperorganen für den Aufbau der nächsten
Cuticula gespeichert, der restliche Kalk wird über die Nahrung oder direkt aus dem
Wasser aufgenommen (GRUNER et al. 1993). Abb. 24 zeigt im Darmquerschnitt eines
Individuums von Asellus aquaticus aus einem Trinkwasserverteilungssystem (Probe
Br1) deutlich abgegrenzte, große Kalkpartikel mit Kantenlängen von bis zu 14 µm. Die
Gesamthärte des Wassers betrug zum Probenahmezeitpunkt 13,4 °dH. Vergleichend
hierzu dokumentiert Abb. 21 den Darmquerschnitt eines adulten, männlichen Tieres von
Proasellus cavaticus aus einem anderen Trinkwasserverteilungssystem (Probe E1) mit
einer Wasserhärte von 13,5 °dH. Die EDX-Spektren zeigen hier an den Messpunkten
zwar Calziumcarbonat an (Abb. 22 und 23), doch der Nahrungsbrei stellt sich insge-
samt, sowohl farblich als auch strukturell, sehr homogen dar ‒ deutlich abgegrenzte
Kalkpartikel sind hier nicht erkennbar. Im rasterelektronenmikroskopischen Darmquer-
schnittsbild eines Individuums von Asellus aquaticus aus einem definierten Hälterungs-
versuch ohne Nahrungszugabe (Abschn. 2.2.2; Probe 12) zeigen sich wenige, in den
organischen Nahrungsbrei eingestreute, maximal 1 µm große Kalkpartikel (Abb. 28B-
Pfeil 2; Gesamtwasserhärte 13,5 °dH). Faktoren, welche die Menge und Größe der
Kalkpartikel in den Asseldärmen beeinflussen können, sind wahrscheinlich vor allem in
der Verfügbarkeit der Elemente Calzium, Kohlenstoff und Sauerstoff im Wasser, sowie
der Ökologie der einzelnen Isopodentaxa zu suchen. Da primär grundwasserbewoh-
nende Wasserasseln, wie die untersuchte Art Proasellus cavaticus, in ihren Lebens-
räumen zumeist die größten Organsimen darstellen und somit keinem großen Feind-
druck ausgesetzt sind, ist die Ausbildung einer besonders dicken Cuticula, einhergehend
mit der Einlagerung entsprechender Mengen an Kalk, nicht notwendig. Bei Taxa, wel-
che wie Asellus aquaticus vor allem Oberflächengewässer besiedeln und somit einem
steten Räuberdruck unterliegen, stellen stärker sklerotisierte Körperhüllen hingegen eine
wichtige Überlebensstrategie dar. Auch das Element Eisen zeigt in einigen EDX-Spek-
tren (Abb. 22, 23 und 27) deutliche Peaks an. An beiden Messpunkten in Abb. 21B
(Pfeile 1 und 2) zeigt sich der Nahrungsbrei hierbei jedoch nur wenig kontrastiert, wo-
70
hingegen in Abb. 24B (Pfeil 3) am Detektionspunkt kleine, maximal 1 µm lange, hell
kontrastierte Partikel erkennbar sind. Entsprechende eisenhaltige Teilchen könnten se-
lektiv über das Fressen eisenoxidierender Mikroorganismen, wie z. B. der Bakterienart
Leptothrix ochracea aufgenommen worden sein. Die Energie beziehen diese Prokary-
onten über die Oxidation von Fe2+ zu Fe3+. Aus dem in fester Form ausfallenden Fe3+
bilden die Bakterien Scheiden, in welchen sich die einzelnen Procyten frei bewegen
können und der Stoffaustausch mit der Umwelt somit nicht unterbrochen wird
(SCHLEGEL & JANNASCH 2006). Bei den im Rahmen dieser Arbeit durchgeführten
Hydrantenspülungen korrelierten die dokumentierten Massenvorkommen von Isopoden
in Graugussrohrleitungen stets mit großen Austragsmengen eisenhaltiger Bodensedi-
mente, was ein Indiz dafür sein könnte, dass Isopoden Eisenpartikel unselektiv bei der
Nahrungssuche in Stagnationsbereichen in Form verfrachteter Reste eisenoxidierender
Mikroorganismen oder stark zerkleinerter Graugussbruchstücke aufnehmen. Grauguss
oder Gusseisen ist eine Eisenlegierung mit einem hohen Anteil an Kohlenstoff und
Silikon sowie Mangan, Chrom oder Nickel.
Die durchgeführten rasterelektronenmikroskopischen EDX Untersu-
chungen eignen sich als ergänzende Methode zur Charakterisierung von Asseldarmin-
halten. Eisenhaltige Partikel im Nahrungsbrei von Isopoden könnten Verockerungen
und/oder Stagnationsbereiche in Graugussrohrabschnitten anzeigen. Detailliertere Infor-
mationen über die Zusammensetzung der Darminhalte, bzw. eine konkrete Nennung der
aufgenommenen Nahrung, sind hierüber jedoch nicht möglich. Zur Klärung dieser Frau-
ge wurden definierte Fütterungsversuche und molekularbiologische Untersuchungen
von Asseldarminhalten durchgeführt (Absch. 4.4 und 4.5).
4.4 Fressversuche
Ausgehend von zahlreichen ökologischen Beobachtungen an Asellus aquaticus und
Proasellus cavaticus (z. B. HENRY 1976; GRUNER 1965) weist WÄGELE (2007) darauf
hin, dass beide Taxa primär omnivor sind. Von einer überwiegend vegetarischen Er-
nährung, bei der die Asseln verrottendes Laub mit den Mundwerkzeugen zerbeißen,
könne seiner Meinung nach jedoch ausgegangen werden. Diese Vermutung setzt jedoch
voraus, dass in den Lebensräumen pflanzliches Material stets verfügbar ist. Ergänzend
hierzu nennt der Autor als geeignete Nahrungsquelle für in Minen lebende Populati-
71
onen von Proasellus cavaticus Pilze, welche auf faulenden Stützhölzern wachsen. Hin-
gegen würden in sauberen Felsgewässern Cyanobakterien und Kieselalgen bevorzugt.
Für GRAÇA et al. (1993a, b; 1994) sind nicht die Pflanzenzellen von Blättern an sich als
Nahrung für Wasserasseln anzusehen, vielmehr würden die Tiere, zumindest in Ober-
flächengewässern, vor allem die auf den Blattoberflächen wachsenden und die Blatt-
masse zersetzenden Pilze abweiden. Um detaillierte Informationen zur Ernährungsweise
von in Trinkwasserverteilungssystemen lebenden Isopodenpopulationen zu erhalten,
wurden im Rahmen dieser Arbeit Individuen von Asellus aquaticus in definierten Fress-
versuchen Pilzmyzelien (Cladosporium herbarum) und Bakterienreinkulturen
(Aquabakterium commune und Marmoricola spec.) als Nahrung angeboten (Abschn.
2.1.2, 2.1.3, 2.2.3, 3.3). Das eingesetzte, zu den Schlauchpilzen zählende Taxon
Cladosporium herbarum, ist eine weltweit verbreitete Schimmelpilzart, die unter ande-
rem auf sich zersetzenden Blättern krautiger und holziger Pflanzen (SCHUBERT et al.
2007), auf Oberflächen gesunder Blätter (SCHUBERT 2005), im Boden (DOMSCH et al.
1980), in marinen Wasserproben (PRABHAKARAN & RANU GUPTA 1990) und auf ab-
sedimentierten, langsam verrottenden Blattresten in limnischen Oberflächengewässern
(BASCHIEN et al. 2009) anzutreffen ist. Bei den im Rahmen dieser Arbeit durchge-
führten Hydrantenspülungen konnten Individuen dieser Pilzart in mehreren Trinkwas-
serverteilungssystemen nachgewiesen werden (Abschn. 2.1.2). Die Betaproteobak-
terienart Aquabacterium commune wurde von KALMBACH et al. (1999) aus Trinkwas-
serbiofilmen isoliert und beschriebenen. Populationen der Gattung Marmoricola spec.
kommen unter anderem in Tagebau-Brunnen vor (SCHRÖDER 2011, persönliche Mittei-
lung). Von einem verbreiteten Vorkommen beider Bakterientaxa in deutschen Trink-
wasserverteilungssystemen ist auszugehen und begründet deren Verwendung in den
durchgeführten Fressversuchen.
4.4.1 Prokaryota
In einem unter definierten Versuchsbedingungen durchgeführten Fressversuch (Abschn.
2.2.3.3 und 3.3.1) wurden die beiden Bakterientaxa Aquabacterium commune und
Marmoricola spec. 5 Tage lang 10 Individuen von Asellus aquaticus als Nahrungsquelle
angeboten. Wie Abb. 19.1A zeigt, färbten die beiden über eine Wasserstrahlpumpe auf
den entsprechenden Cellulose-Acetatfilter aufgetragenen Bakterienpopulationen die je-
weilige Filteroberfläche dabei unterschiedlich an ‒ Marmoricola spec. deutlich braun-
72
rot, Aquabacterium commune hingegen schwach weiß-rosa. Auf den Bildern (Abb. 19.1
und 19.2) ist deutlich erkennbar, dass sich die Wasserasseln vom 2. bis zum 4. Ver-
suchstag zum Zeitpunkt der fotografischen Dokumentation ausschließlich auf oder um
den „Marmoricola-Filter“ aufhielten. Der Deckungsgrad an aufgetragener Bakterienbio-
masse nahm dabei täglich ab, wohingegen die Anzahl an Asselkot-Pellets auf, bzw. um
den Filter kontinuierlich zunahm. Am letzten Versuchstag war die gesamte Biomasse an
Marmoricola-Zellen von der Filteroberfläche verschwunden. Die rötlichen Partikel auf
und um den Filter konnten mittels Lichtmikroskop eindeutig als Asselkot-Pellets identi-
fiziert werden. Auf dem mit Individuen der Bakterienart Aquabacterium commune prä-
parierten Filter hielten sich ab dem ersten Versuchstag zum jeweiligen Zeitpunkt der
fotografischen Dokumentation keine Asseln auf. Ein schwach weiß-rosafarbener Bakte-
rienfilm war jedoch über die gesamte Versuchsdauer auf der Filteroberfläche erkennbar.
Asselkot-Pellets zeigten sich auf diesem Filter, wie auch auf dem Kontrollfilter, nur ver-
einzelt. Ob die stäbchenförmigen Zellen der Bakterienart A. commune mit einer Länge
von nur 2-4 µm und einem Durchmesser von ca. 0,5 µm beim Auftragen auf die Filter-
oberfläche mittels Wasserstrahlpumpe eventuell zu stark in das Gewebe eingepresst
werden und den Isopoden somit als Nahrung nicht zur Verfügung stehen, konnte im
Rahmen dieser Untersuchung nicht abschließend geklärt werden. Im Fokus zukünftiger
Arbeiten sollte daher vor allem die Suche nach geeigneten Materialoberflächen sein, die
einen definierten Bakterienbewuchs erlauben. So produzierte Biofilme könnten dann in
Fressversuchen Isopoden als potentielle Nahrungsquelle angeboten werden. Des Wei-
teren wäre eine Infrarot-Videoüberwachung der Versuchsanordnung als ergänzende Un-
tersuchungsmethode zum Fressverhalten von Isopoden geeignet. In der hier beschrie-
benen Versuchsanordnung wurde das Bakterientaxon Marmoricola spec. von Asellus
aquaticus bevorzugt gefressen.
4.4.2 Prokaryota und Fungi
In einem zweiten Fressversuch wurde überprüft, ob Asellus aquaticus Pilzmyzelien
(Cladosporium herbarum) oder Bakterienzellen (Marmoricola spec.) als Nahrungsquel-
le bevorzugt (Abschn. 2.2.3.4 und 3.3.2). Zwar dokumentieren Abb. 20.1-20.3 für den
jeweiligen Bildaufnahmezeitpunkt zumeist den „Cladosporium-Filter“ als bevorzugten
Aufenthaltsort der Wasserasseln, doch auch die Biomasse auf dem „Marmoricola-Fil-
ter“ nahm im Verlauf der ersten 4 Versuchstage stetig ab. Zudem zeigten sich Assel-
73
kot-Pellets über die gesamte Versuchsanordnung verstreut. Es ist daher davon auszuge-
hen, dass sich die Tiere im Tagesverlauf auch auf dem „Bakterien-Filter“ aufhielten und
diese Biomasse, wie auf dem „Pilz-Filter“, aktiv abgefressen haben. Ab dem 5. Ver-
suchstag waren beide Filteroberflächen fast vollständig abgeweidet und die Isopoden
begannen nun verstärkt damit, im Versuchsansatz umherzuwandern. Am 7. Tag wurde
eine tote Assel im Reaktor aufgefunden. 24 Stunden später war das Tier bis auf Extre-
mitätenfragmente und Teile des Cephalothorax vollständig aufgefressen. WÄGELE
(2007) beschreibt, dass Wasserasseln bei der Hälterung in Aquarien auch Aas fressen.
Doch im Gegensatz zu anderen Krebstaxa würden sie nicht aktiv von Aas angelockt.
Die Ergebnisse des durchgeführten Fressversuchs zeigen, dass Pilzmyzelien, Bakte-
rienzellen und selbst tote Artgenossen geeignete Nahrungsquellen für Wasserasseln dar-
stellen. Um noch detailliertere Informationen über die Ernährungsweise von Isopoden in
Trinkwasserverteilungssystemen zu erhalten, werden im Abschn. 4.5 die Ergebnisse der
durchgeführten molekularbiologischen Darminhaltsuntersuchungen (Abschn. 2.2.9-
2.2.12 und 3.5) diskutiert.
4.5 Molekularbiologische Untersuchungen
Im Folgenden werden die Ergebnisse der im Rahmen der molekularbiologischen Unter-
suchungen durchgeführten DNA-Analysen der unterschiedlichen Darminhaltsproben
(Abschn. 3.5) diskutiert.
4.5.1 Laborversuche
Um grundlegende Erkenntnisse über mögliche Nahrungspräferenzen von Wasserasseln
zu gewinnen, wurden Individuen von Asellus aquaticus unter definierten Versuchsbe-
dingungen unterschiedliche Futterquellen angeboten und anschließend die Nahrungs-
breie molekularbiologisch untersucht (Abschn. 4.5.1.1 und 4.5.1.2).
GRUNER et al. (1993) weisen darauf hin, dass Isopoden eine reiche Darm-
flora besitzen, die aus aeroben und fakultativ anaeroben Mikroorganismen besteht. Bei
Untersuchungen an Landasseln (Trachelipus rathkii) seien hierbei die Bakterientaxa
Pseudomonas spec. und Flavobacterium spec. dominant gewesen. Um detaillierte Infor-
mationen über die mikrobielle Intestinalflora von Wasserasseln zu erhalten, wurden
74
über Hydrantenspülungen gesammelte Isopoden für die Dauer von 6 Wochen nicht ge-
füttert und danach die Darminhalte molekularbiologisch untersucht (Abschn. 4.5.1.3).
4.5.1.1 Fressversuch Asellus aquaticus / Cladosporium herbarum
Um zu überprüfen, ob Wasserasseln Schimmelpilze als Nahrung nutzen und inwiefern
die Zugabe einer definierten Futterquelle ergänzende Informationen über die Zusam-
mensetzung der bakteriellen Intestinalflora der Versuchstiere liefert, wurden Myzelien
von Cladosporium herbarum unter definierten Versuchsbedingungen Individuen von
Asellus aquaticus als Nahrung angeboten (Abschn. 2.2.3.1) und die Darminhalte dieser
Isopoden nach Versuchsende molekularbiologisch untersucht (Abschn. 3.5.1). Die 18S
rDNA-Untersuchungen zeigen in den vorderen Darmabschnitten (Probe 10E) für 67 %
und in den hinteren Darmabschnitten (Probe 11E) für 38 % der ermittelten Sequenzen
als nächsten bekannten Verwandten die angebotene Nahrungsquelle Cladosporium
herbarum an. Da die Pilzart im Rahmen dieser Arbeit bei Probenahmen in unterschied-
lichen Trinkwassersystemen nachgewiesen werden konnte (Abschn. 2.1.2) und die
durchgeführten Fressversuche (Abschn. 3.3.2) sowie die dargestellten molekularbiolo-
gischen Darminhaltsuntersuchungen belegen, dass Individuen von Asellus aquaticus
Myzelien dieses Pilzes aktiv von Oberflächen abweiden, könnte Cladosporium
herbarum eine natürlich genutzte Nahrungsquelle für Wasserasseln in Trinkwasserver-
teilungssystemen darstellen. Da auch in den hinteren Darmabschnitten noch Pilz-DNA
vorzufinden war, ist davon auszugehen, dass Isopoden bei Futterüberschuss nicht den
gesamten Nahrungsbrei physiologisch aufschließen und resorbieren. Ob und wie viel
Nahrung hierbei unverdaut wieder ausgeschieden wird könnte über molekularbiolo-
gische Untersuchungen frischer Asselkot-Pellets geklärt werden. Die restlichen, im
Rahmen der durchgeführten 18S rDNA-Untersuchungen ermittelten und analysierten
DNA-Sequenzen in den vorderen und hinteren Darmabschnitten zeigen jeweils als
nächstes bekannte Taxon Asellus aquaticus selbst an. Darmepithelzellen, welche even-
tuell beim Ausstreichen der Nahrungsbreie aus den Därmen mit in die DNA-Extrakti-
onsproben überführt werden, könnten herfür eine Erklärung sein. Doch auch die von
WÄGELE (2007) beschriebene kannibalische, aasfressende Ernährungsweise von Was-
serasseln stellt eine mögliche Aufnahmequelle arteigener DNA dar. Da bei der Durch-
führung dieses Fressversuches jedoch alle Versuchstiere bis zum Ende überlebten, ist
eine Herkunft der nachgewiesenen Eigen-DNA aus den Darmepithelien der Tiere als
75
wahrscheinlich anzunehmen. Die 16S rDNA-Untersuchung der vorderen Darmab-
schnitte (Probe 10P) zeigt für 71 % aller ermittelten Sequenzen als jeweils nächstes
bekannte Taxon die als mikrobielle Darmflora von Isopoden (GRUNER et al. 1993) und
anderen Euarthropoden (HUANG et al. 2012; ZHOU et al. 2010) beschriebenen Bakteri-
engattungen und -arten Pseudomonas spec., Flavobacterium spec., Flavobacterium
denitrificans, Flavobacterium resistens und Stenotrophomonas spec. an. Die 5 aufge-
führten Taxa gehören zu den Bacteroidetes und Gammaproteobacteria. Für die Gat-
tungen Sphingomonas spec. liegen Nachweise aus finnischen und schwedischen Bio-
filmen in Trinkwasserverteilungssystemen (KOSKINEN et al. 2000) und für Micrococcus
spec. aus Trinkwasserproben (SUTHAR et al. 2009) vor. Die beiden zuletzt genannten
Gattungen gehören zu den Alphaproteobacteria und Actinobacteria. Auch in den hinte-
ren Darmabschnitten (Probe 11P) zeigen sich bei der 16S rDNA-Untersuchung für 71 %
aller ermittelten Sequenzen als nächste bekannte Verwandte die schon in den vorderen
Darmabschnitten identifizierten Bakterientaxa Pseudomonas spec., Flavobacterium
spec., Flavobacterium denitrificans und Flavobacterium resistens. Daneben wurden mit
Rhodobacter megalophilus und Aeromonas hydrophila auch zwei von WANG et al.
(2007) als symbiotische Bakterien der Mitteldarmdrüsen von Asellus aquaticus be-
schriebene Arten dokumentiert. Die restlichen 29 % der ermittelten Sequenzen zeigen
hier als nächste bekannte Verwandte folgende aus Trinkwasserproben beschriebenen
Bakterientaxa an: Sphingomonas spec., Micrococcus spec., Microbacterium oxydans
(WANG et al. 2009), Mycobacterium spec. (MARSHALL et al. 2011), Caulobacter spec.
(JUNGFER et al. 2007) und Acidovorax spec. (GIÃO et al. 2011).
Vor allem die dokumentierten Vertreter der Gammaproteobacteria und
Bacteroidetes scheinen in den hier untersuchten Darmabschnitten den Großteil an bakte-
rieller Intestinalflora auszumachen, wohingegen die restlichen Taxa wohl eher als Be-
siedler von Trinkwasserbiofilmen definiert werden können. Da das in den Hälterungs-
und Fütterungsreaktoren verwendete Trinkwasser über einen 0,2 µl-Filter sterilfiltriert
wurde ist davon auszugehen, dass vermeintliche Trinkwasserbakterien über andere
Eintragswege in die Versuchsanordnungen gelangten. So stellen die Körperoberflächen
von Wasserasseln ‒ obwohl die Versuchstiere vor dem Einsetzen in die Exsikkatoren
für ca. 2 Sekunden in 30 %-igem Propanol und anschließend für ca. 5 Sekunden in VE-
Wasser gewaschen wurden ‒ Orte steter mikrobieller Besiedlung dar. Im Rahmen dieser
Arbeit konnte zudem beobachtet werden, dass frische Häutungsexuvien von Isopoden
aktiv gefressen werden, wodurch die Nachweise von Trinkwasserbakterien in den
76
Darminhalten der Tier erklärbar sind. Gezielte Untersuchungen der bakteriellen Be-
siedlung der Körperoberflächen von Süßwasserasseln könnten hierüber zukünftig detail-
liertere Informationen liefern.
4.5.1.2 Fressversuch Asellus aquaticus / Schwarzerlenblätter
Um zu überprüfen, ob wie von GRAÇA et al. (1993a, b; 1994) beschreiben, der Pilzauf-
wuchs von Schwarzerlenblättern eine wichtige Nahrungsquelle für Asellus aquaticus
darstellt, wurden Laubblätter im Freiland gesammelt, für die Dauer von 6 Wochen in
0,2 µl-sterilfiltriertem Wasser quellen gelassen und anschließend ausgewählten Indivi-
duen von Asellus aquaticus als Futter angeboten (Abschn. 2.2.3.2). Die 18S rDNA-Un-
tersuchungen zeigen in den vorderen und hinteren Darmabschnitten (Probe B1E und
B2E) jeweils nur Eigen-DNA der Krebsart an. DNA-Sequenzen, welche Schimmelpilz-
taxa zugeordnet werden könnten, wurden nicht ermittelt. Da die Schwarzerlenblätter je-
doch direkt vom Baum gepflückt und anschließend zum Quellen in sterilfiltriertes Was-
ser überführt wurden, waren die Blattoberflächen eventuell frei von Pilzsporen, bzw.
Pilzmyzelien. Die nachgewiesene Eigen-DNA könnte, wie schon in Abschn. 4.5.1.1 dis-
kutiert, von Darmepithelzellen stammen, welche beim Ausstreichen der Nahrungsbreie
mit in die PCR-Tubes überführt worden sind. Bei der 16S rDNA-Untersuchung domi-
nieren in den vorderen Darmabschnitte (Probe B1P) mit 88 % aller ermittelten Se-
quenzen als nächste bekannte Verwandte die Gammaproteobacteria mit den Taxa
Aeromonas salmonicida, Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida, Enterovibrio
spec., Photobacterium spec., Pseudomonas spec. und Pseudomonas mandelii. Eine Zu-
ordnung dieser Taxa zur Intestinalflora von Wasserasseln ist wahrscheinlich. Daneben
wurden mit den Taxa Caulobacter spec., Hyphomicrobium facile subsp. facile,
Hyphomicrobium vulgare, Methylocapsa aurea und Crenothrix polyspora Bakterien-
taxa identifiziert, die entweder über die Schwarzerlenblätter oder über die Körperober-
flächen der Tiere mit in den Reaktor eingeführt wurden. Auch in den hinteren Darmab-
schnitten (Probe B2P) zeigen sich mit den ermittelten Taxa Flavobacterium hercynium,
Rhodobacter spec., Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila, Aeromonas salmonicida
subsp. salmonicida, Pseudomonas spec. und Enterovibrio spec. Bakterientaxa, welche
vermutlich Bestandteile der Darmflora von Wasserasseln sind. Die genannten Arten und
Gattungen entsprechen 60 % aller ermittelten Sequenzen und können den Gamma-
proteobacteria, Bacteroidetes und Alphaprotebacteria zugeordnet werden. Die restlichen
77
identifizierten Bakterientaxa gelangten wahrscheinlich über die Schwarzerlenblätter
oder die Körperoberflächen der Tiere mit in den Reaktor. Einige ermittelte DNA-Se-
quenzen lagen bei den durchgeführten 16S rDNA-Untersuchungen unterhalb des
Schwellenwerts für Arten oder Gattungen, womit eine sichere Zuordnung dieser Se-
quenzen nicht möglich ist (Abschn. 3.5.3).
4.5.1.3 Hungerversuch Asellus aquaticus
Um ergänzende Informationen über die Zusammensetzung der bakteriellen Darmflora
von Wasserasseln zu erhalten, wurden in einem weiteren definierten Versuch Individu-
en von Asellus aquaticus für die Dauer von 6 Wochen nicht gefüttert und anschließend
deren Darminhalte molekularbiologisch untersucht (Abschn. 3.5.2). In den vorderen
Darmabschnitten (Probe 12P) zeigen sich bei der 16S rDNA-Untersuchung für 96 %
aller ermittelten Sequenzen als nächste bekannte Verwandte Bakteriengattungen und
Bakterienarten, welche von unterschiedlichen Autoren zur Intestinalflora von Euarth-
ropoden gezählt werden und ausnahmslos dem Taxon Gammaproteobacterium zuge-
ordnet werden können: Pseudomonas putida für landlebende Isopoda (KOSTANJŠEK et
al. 2002), Enterobacter spec. und Enterobacter cloacae subsp. cloacae für landlebende
Insecta (ADAMS & BOOPATHY 2005) sowie die im Abschn. 4.5.1 als symbiotische Bak-
terien in den Mitteldarmdrüsen von Asellus aquaticus beschriebenen Gattungen
Pseudomonas spec. und Aeromonas spec.. Das aus Trinkwasserproben beschriebene Ta-
xon Afipia spec. (ZHANG et al. 2009) und die Bakterienart Arthrobacter oxidans, welche
aktuell keine klare ökologische Zuordnung zulässt, zeigen sich zusammen mit einem
prozentualen Anteil von 4 % aller ermittelten Sequenzen. Auch in den hinteren Darm-
abschnitten (Probe 13P) dominieren mit einem Anteil von 92 % die in der Fachliteratur
als Bestandteile der Darmflora von Euarthropoden genannten Gammaproteobakterien
Aeromonas sobria, Enterobacter cloacae, Enterobacter spec., Pseudomonas putida,
Pseudomonas spec. und Stenotrophomonas rhizophila. Das Taxon Chitinibacter spec.
zählt zu den chitinzersetzenden Bakterien (CHERN et al. 2004) und wird wahrscheinlich
über das Fressen von Häutungsexuvien von den Tieren aufgenommen. Für die Gattung
Achromobacter spec. konnte in der Literatur keine eindeutige ökologische Zuordnung
gefunden werden.
78
4.5.2 Freilandproben
Um neue Erkenntnisse zur Ernährungsweise von Wasserasseln in Trinkwasservertei-
lungssystemen und gleichzeitig detailliertere Informationen über die komplexen Le-
bensgemeinschaften in diesen abgeschlossenen Ökosystemen zu gewinnen, wurden aus
unterschiedlichen deutschen Trinkwassersystemen über Hydrantenspülungen Individuen
von Asellus aquaticus und Proasellus cavaticus entnommen und deren Darminhalte
molekularbiologisch untersucht (Abschn. 3.5.4-3.5.6).
4.5.2.1 Freilandprobe Asellus aquaticus
Die 18S rDNA-Untersuchung der gesamten Darminhalte ausgewählter Individuen von
Asellus aquaticus (Probe Br1E) zeigen für 100 % der ermittelten Sequenzen als nächs-
tes bekannte Taxon die artspezifische DNA der Tiere an. Ob die nachgewiesene DNA
von den Darmepithelzellen der Asseln selbst oder von gefressenen, toten Artgenossen
stammt bleibt jedoch ungeklärt. Die 16S rDNA-Untersuchung (Probe Br1P) zeigt 4 un-
terschiedliche Taxa an, wobei die Gattung Rhodobacter spec. als symbiotisches Bakte-
rium der Mitteldarmdrüsen von Asellus aquaticus beschrieben ist. Für das Taxon
Arenimonas spec., welches sich mit einem prozentuellen Anteil von 83 % aller ermit-
telten DNA-Sequenzen zeigt, liegen Artbeschreibungen aus unterschiedlichen asia-
tischen Habitaten vor: Arenimonas oryziterrae aus einem koreanischen Reisfeld
(ASLAM et al. 2009), A. donghaensis aus koreanischem Meeressand (KWON et al. 2007),
A. aquaticum aus einem koreanischen Süßwasserreservoir (KIM et al. 2012), A. metalli
aus einer chinesischen Eisenmiene (CHEN et al. 2012), A. daechungensis aus dem Sedi-
ment eines eutrophen Süßwasserreservoirs (HUY et al. 2013) und A. daejeonensis aus
Kompost (JIN et al. 2012). Bei den genannten Arten handelt es sich stets um gram-nega-
tive, aerobe Bakterien. Eventuell stellen auch Bodensedimente in Stagnationsbereichen
von Trinkwasserverteilungssystemen bevorzugte Habitate für Arenimonas spec. dar und
Wasserasseln nutzen diese Nahrungsquellen. Auch hier lagen einige ermittelte DNA-
Sequenzen bei den durchgeführten 16S rDNA-Untersuchungen unterhalb des Schwel-
lenwerts für Arten oder Gattungen, womit eine sichere Zuordnung dieser Sequenzen
nicht möglich ist (Abschn. 3.5.4.1).
79
4.5.2.2 Freilandproben Proasellus cavaticus
Individuen von Proasellus cavaticus wurden an zwei Probenahmestellen eines Trink-
wasserverteilungssystems im März 2012, September 2012 und November 2012 gesam-
melt (Abschn. 2.2.1). Die Ergebnisse der 18S rDNA-Untersuchungen der Darminhalte
aus beiden März-Proben (Proben E1E und E45E) zeigen dabei ähnliche Zusammenset-
zungen der ermittelten eukaryotischen Taxa an: Fungi, Amoebozoa, Heterolobosea und
arteigene DNA von Proasellus cavaticus. In den Ergebnissen der September- (Proben
EVE und EVIIE) und November-Proben (Proben EVIE und EVIIIE) fehlen hingehen
Protozoen gänzlich. Innerhalb der auch in Süßwasserhabitaten und feuchter Erde le-
benden amöboiden Amoebozoa (hier Protacanthamoeba bohemica) und der teils
flagellaten Heterolobosea (hier Naegleria spec.) sind neben vielen gesundheitlich un-
bedenklichen, bakterienfressenden oder endosymbiontisch lebenden Taxa auch patho-
gene Formen bekannt (z. B. DYKOVÁ et al. 2005; MACLEAN et al. 2004; HAUSMANN et
al. 2003). Auch die Ergebnisse der 16S rDNA-Untersuchungen zeigen für beide März-
Proben (Proben E1P und E45P) ähnliche Zusammensetzungen der ermittelten prokary-
otischen Taxa an. Die Gattung Arenimonas spec. ist hierbei mit einem prozentuellen
Anteil von 67 %, bzw. 54 % das dominante Taxon. In den Ergebnissen der September-
(Proben EIP und EIIIP) und November-Proben (Proben EIIP und EIVP) fehlen hinge-
gen Nachweise von Arenimonas spec. gänzlich. Stattdessen dominiert hier in allen Pro-
ben das zu den Betaproteobacteria zählende Taxon Acidovorax spec. mit einem prozen-
tualen Anteil von 96 % bis 100 % aller ermittelten Sequenzen deutlich. Die Ergebnisse
der molekularbiologischen Untersuchungen lassen darauf schließen, dass über die im
März 2012 durchgeführten Spülmaßnahmen in diesem Trinkwasserverteilungssystem
eine veränderte Nahrungsgrundlage für die hier lebende Population von Proasellus
cavaticus geschaffen wurde. Es kann angenommen werden, dass der dokumentierte
Austrag großer Mengen flockigen, eisenhaltigen Bodensediments während der Probe-
nahme (Abschn. 3.1) das Verschwinden von Taxa wie Arenimonas spec., Naegleria
spec. oder Protacanthamoeba bohemica impliziert, welche wahrscheinlich bevorzugt
diese Lebensräume besiedeln. Aufgrund ihrer omnivoren Ernährungsweise können
Wasserasseln jedoch auch andere Futterquellen nutzen ‒ auch Biofilme mit den darin
eingebetteten Bakterien, wie Acidovorax spec. und anderen Taxa.
80
4.5.3 Fazit
Bei der Auswertung von DNA-Sequenzierungs-Ergebnissen ist zu berücksichtigen, dass
die Zuordnung einer Sequenzabfolge zum nächsten verwandten Taxon stets nur dem
Aktualisierungstand des verwendeten Datensatzes zum Zeitpunkt der Bearbeitung ent-
spricht. Unbekannte oder in die Datenbank noch nicht aufgenommene Taxa werden
folglich bei der Auswertung nicht berücksichtigt. Eine kritische Prüfung der Daten auf
Plausibilität ist daher mit entscheidend.
Wie die Ergebnisse der durchgeführten DNA-Analysen zeigen, scheinen
Wasserasseln bei ihrer Nahrungssuche in Trinkwasserverteilungssystemen Bodensedi-
mente in Stagnationsbereichen bevorzugt aufzusuchen. Dabei stellen neben unterschied-
lichen Bakterientaxa auch Protozoen und insbesondere Schlauchpilze (Ascomycota)
eine bevorzugte Futterquelle dar. Ein Nachweis hygienisch relevanter Taxa im Trink-
wasser ist über die hier vorgestellte, innovative Untersuchungsmethode möglich. Die im
Nahrungsbrei der Tiere vorgefundene Eigen-DNA stammt entweder von Darmepithel-
zellen der Tiere selbst oder weist auf die teilweise kannibalische, aasfressende Ernäh-
rungswiese der Tiere hin. Wie die unterschiedlichen Laborversuche zeigen, setzt sich
die bakterielle Intestinalflora der Tiere überwiegend aus Vertretern der Taxa Gamma-
proteobacteria und Bacteroidetes zusammen. Die auf den Körperoberflächen der Asseln
lebenden Mikroorganismen scheinen über die Wanderbewegungen der Tiere im System
verbreitet zu werden. Molekularbiologische Untersuchungen der Darminhalte von Was-
serasseln aus Trinkwasserverteilungssystemen ermöglichen eine Charakterisierung der
Biozönosen und somit eine biologische Beurteilung dieser geschlossenen Ökosysteme.
Auch können hierüber Veränderungen der Rohwasserzusammensetzung, Lecks im
Rohrsystem oder Fremdwassereinspeisungen erkannt, bzw. die Effektivität von Rohr-
netzspülungen überprüft werden. Wasserasseln stellen somit gute Indikatororganismen
zur Beurteilung der jeweiligen Trinkwasserqualität dar und erlauben zudem eine früh-
zeitige Erkennung von technischen Problemen in Versorgungsnetzen.
Zentrales Ergebnis der vorliegenden Arbeit ist, dass molekularbiolo-
gische Untersuchungen von Tieren, hier der Darminhalte von Asseln, geeignet sind,
neue Erkenntnisse zur Ernährungsweise von Wasserasseln in Trinkwassersystemen zu
gewinnen. Die im Nahrungsbrei von Wasserasseln ermittelten Pro- und Eukaryonten be-
81
legen, dass die Methode geeignet ist, diese zu identifizieren und damit Belastungen im
Trinkwasser zu erkennen und zu bewerten.
Diese neue, innovative Vorgehensweise bedarf noch der weiteren Absicherung.
Da die Frage der prinzipiellen Machbarkeit im Fokus stand, war die Analyse potenzi-
eller Fehlerquellen zunächst nachrangig. Dies ist Aufgabe nachfolgender Arbeiten, wo-
bei vor allem folgende Fehlerpotenziale statistisch zu analysieren sind:
Art der Rohrleitungen (Werkstoffeigenschaften, Wartung, Zustand, Alter, Stag-
nationszonen)
Herkunft und Beschaffenheit des Rohwassers (Kontaminationsquellen)
Physikalische und chemische Parameter des Trinkwassers
Art der Probenahme (Dauer und Häufigkeit der Spülungen)
Nährstoffeintrag
Saisonale Populationsdynamik
Der Einfluss dieser Faktoren konnte im Verlaufe der vorliegenden Arbeit wegen ihrer
gegebenen Variationsbreite und Nicht-Beeinflussbarkeit nicht analysiert werden.
82
5 Zusammenfassung
Wasserasseln können sich als „Allesfresser“ von Bakterien, Pilzen, Pflanzen und Tieren
ernähren (WÄGELE 2007). Doch welche Nahrungsquellen werden im primär nährstoff-
armen Trinkwasser genutzt, welche werden präferiert? Um diese Fragen beantworten zu
können, wurden Isopoden aus unterschiedlichen deutschen Trinkwasserverteilungssys-
temen über Hydrantenspülungen gesammelt und parallel hierzu Tiere im Labor unter
definierten Bedingungen gehältert und mit unterschiedlichen Nahrungsquellen gefüttert.
Die Darminhalte ausgewählter Asseln wurden molekularbiologisch auf Basis der 16S
und 18S rDNA untersucht und charakterisiert. Ergänzend hierzu wurden rasterelek-
tronenmikroskopische EDX-Untersuchungen durchgeführt. Ziel der vorliegenden Arbeit
war es zu klären, ob über diese Untersuchungsmethoden neue Erkenntnisse zur Ernäh-
rungsweise von Wasserasseln in Trinkwassersystemen und gleichzeitig detailliertere In-
formationen über die komplexen Lebensgemeinschaften, einschließlich der für den
Menschen hygienisch relevanten Taxa, in diesen abgeschlossenen Ökosystemen ge-
wonnen werden können. Auch sollte geklärt werden, ob sich Isopoden als mögliche
Indikatororganismen zur Beurteilung der jeweiligen Trinkwasserqualität eignen.
→ Die Anwesenheit von Isopoden und anderen Metazoen in Trinkwasserverteilungs-
systemen ist allgemein bekannt, aber wenig untersucht. Oftmals steht sie mit der Was-
serqualität in Zusammenhang, denn das Massenvorkommen von Wasserasseln zeigt
stets eine Störung, wie z. B. erhöhte Nährstoffkonzentrationen im System an.
→ Da eine eindeutige Artbestimmung der heimischen Wasserasseln momentan nur über
die Betrachtung der Gonopoden möglich ist, wurden alle im Rahmen dieser Arbeit un-
tersuchten Individuen entsprechend lichtmikroskopisch identifiziert. Die hier aus Trink-
wassersystemen gesammelten Tiere konnten so eindeutig den Taxa Asellus aquaticus
(LINNÉ, 1758) und Proasellus cavaticus (LEYDIG, 1871) zugeordnet werden. Da jedoch
allein für Proasellus cavaticus etliche Unterarten angenommen werden (HENRY 1976),
die sich lediglich über minimale Variationen im Körperbau voneinander unterscheiden,
kann nur eine Kombination aus klassischen, morphologischen Artbeschreibungen und
modernen, genetischen Populationsanalysen zur Klärung der Verwandtschaftsverhält-
nisse innerhalb dieser Taxa beitragen. Voraussetzungen hierfür sind neben detail-
lierteren Kenntnissen über die Verbreitungsareale der Taxa auch die Zugänglichkeit
dieser Lebensräume für eine Beprobung. Als Eintragswege von Isopoden in Trinkwas-
83
serverteilungssysteme können unterschiedliche Quellen angenommen werden. Für
Arten, die wie Asellus aquaticus primär in Oberflächengewässern anzutreffen sind, stel-
len wohl Leckagen und Rohr-Reparaturstellen präferierte Eintragswege dar. Doch Taxa,
welche wie Proasellus cavaticus bislang vor allem in unterirdischen Habitaten ange-
troffen wurden und morphologisch wie ökologisch optimal an diese Lebensräume an-
gepasst sind, werden wohl eher über das Grundwasser in Trinkwasserverteilungsnetze
eingespült.
→ Ein dichotomer Bewertungsschlüssel könnte zukünftig Wasserwerkern dabei helfen,
über die Ökologie der unterschiedlichen Taxa die jeweilige Trinkwasserqualität noch
umfassender zu beurteilen, bzw. Störungen im Rohrnetz effektiver zu erkennen. So lässt
sich z. B. über die Körperfärbung von Asellus aquaticus auf die Herkunft der Tiere
schließen. Oberirdisch lebende Populationen sind meist dunkelbraun oder graubraun ge-
färbt, wohingegen Individuen aus unterirdischen Gewässern meist weniger oder nicht
pigmentiert sind und zudem stark zurückgebildete Augen besitzen. D. h. über die Mor-
phologie der Taxa lässt sich auf den Einfluss eutrophen Oberflächenwassers oder oligo-
trophen Grundwassers schließen. Der Umgang mit so einem Bewertungsschlüssel setzt
jedoch eine exakte morphologische Bestimmung der Tiere voraus.
→ Die durchgeführten rasterelektronenmikroskopischen EDX-Untersuchungen eignen
sich als ergänzende Methode zur Charakterisierung von Asseldarminhalten. Eisenhal-
tige Partikel im Nahrungsbrei von Isopoden können somit auf Verockerungen und/oder
Stagnationsbereiche in Graugussrohrabschnitten hinweisen. Detailliertere Informationen
über die Zusammensetzung der Darminhalte, bzw. eine konkrete Nennung der aufge-
nommenen Nahrung, sind hierüber jedoch nicht möglich.
→ Fressversuche weisen darauf hin, dass Pilzmyzelien, Bakterienzellen und selbst tote
Artgenossen geeignete Nahrungsquellen für Wasserasseln darstellen ‒ Schimmelpilze
werden hierbei präferiert.
→ Die Ergebnisse der durchgeführten DNA-Analysen zeigen, dass Wasserasseln bei
ihrer Nahrungssuche in Trinkwasserverteilungssystemen Bodensedimente in Stagnati-
onsbereichen bevorzugt aufsuchen. Dabei stellen neben unterschiedlichen Bakterien-
taxa auch Protozoen und insbesondere Schlauchpilze (Ascomycota) bevorzugte Futter-
quellen dar.
84
→ Ein Nachweis hygienisch relevanter Mikroorganismen im Trinkwasser ist über die in
dieser Arbeit vorgestellte, innovative Untersuchungsmethode möglich.
→ Wie die unterschiedlichen Laborversuche zeigen, setzt sich die bakterielle Intestinal-
flora der Krebstiere überwiegend aus Vertretern der Taxa Gammaproteobacteria und
Bacteroidetes zusammen.
→ Molekularbiologische Untersuchungen der Darminhalte von Wasserasseln aus Trink-
wasserverteilungssystemen ermöglichen eine Charakterisierung der Biozönosen und so-
mit eine biologische Beurteilung dieser geschlossenen Ökosysteme. Auch können hierü-
ber Veränderungen der Rohwasserzusammensetzung, Lecks im Rohrsystem oder
Fremdwassereinspeisungen erkannt, bzw. die Effektivität von Rohrnetzspülungen über-
prüft werden.
→ Wasserasseln stellen gute Indikatororganismen zur Beurteilung der jeweiligen Trink-
wasserqualität dar und erlauben zudem eine frühzeitige Erkennung von technischen
Problemen in Versorgungsnetzen. So können z. B. über die beschriebenen Darminhalts-
untersuchungen Organsimen, welche über das Rohwasser in das Verteilungssystem ein-
gebracht werden identifiziert und somit mögliche Störungen im Rohwasserweg erkannt,
zurückverfolgt und behoben werden. Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurde die
praktische Anwendbarkeit dieser Methode an mehreren Beispielen erfolgreich über-
prüft. Eine Beschreibung der durchgeführten Untersuchungen ist jedoch aus rechtlichen
Gründen nicht möglich.
→ Das Konzept der vorliegenden Arbeit, über die Nahrung der Isopoden Lebensge-
meinschaften in Trinkwasserverteilungssystemen zu charakterisieren, könnte in nach-
folgenden Arbeiten auf weitere Makroinvertebraten übertragen werden. Insbesondere
Brunnenkrebse (Bathynellacea), Flohkrebse (Amphipoda) und Milben (Acari), welche
in Trinkwassersystemen angetroffen werden können und dabei gut präparierbar sind,
stellen hierfür geeignete Untersuchungsobjekte dar.
85
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95
7 Anhang
Im Abschn. 7.1 sind für alle genannten Taxa der jeweilige Streubereich der ermittelten
maximalen Identitäten und der hieraus berechnete Mittelwert tabellarisch dargestellt.
Die Übersichtsdiagramme im Abschn. 7.2 zeigen für jede Einzelprobe die Sequenzlän-
gen und maximalen Identitäten aller insgesamt 1104 bearbeiteten DNA-Sequenzen. Die
Zuordnungen der im Abschnitt 7.2 verwendeten Klon-Sequenz-Nummern zu den ent-
sprechenden Taxa sind über die Tab. 14-37 im Abschn. 7.3 möglich. Die Originalse-
quenzen der über die Datenbank BLAST (Abschn. 2.2.12) ermittelten Art- und Gat-
tungsnamen sind im Abschn. 7.4 alphabetisch sortiert dargestellt.
96
7.1 Streubereiche und Mittelwerte der maximalen Identi-
täten
Anzahl Klone nächster Verwandter Accession-Nr. Identität Identität x
Probe 10P
4 Micrococcus spec. JQ658423.1 95-99 % 96,8 %
3 Flavobacterium spec. HE612094.1 99 % 99,0 %
3 Flavobacterium denitrificans EU599190.1 96-98 % 97,0 %
9 Flavobacterium resistens NR_044292.1 97-99 % 98,2 %
9 Sphingomonas spec. FJ581440.1 98-99 % 98,9 %
16 Pseudomonas spec. AB685628.1 97-99 % 98,4 %
4 Stenotrophomonas spec. JQ435720.1 96-99 % 97,8 %
Probe 11P
6 Micrococcus spec. JQ658423.1 96-99 % 98,2 %
1 Microbacterium oxydans JQ890539.1 97 % 97,0 %
2 Mycobacterium spec. FJ544445.1 97 % 97,0 %
5 Flavobacterium spec. JQ928691.1 96-99 % 97,6 %
4 Flavobacterium denitrificans EU599190.1 98-99 % 98,3 %
17 Flavobacterium resistens NR_044292.1 98-99 % 98,9 %
1 Caulobacter spec. AJ227762.1 97 % 97,0 %
3 Rhodobacter megalophilus JQ692104.1 96-97 % 96,7 %
3 Sphingomonas spec. JQ014557.1 98-99 % 98,7 %
1 Acidovorax spec. GU372408.1 99 % 99,0 %
2 Aeromonas hydrophila JX029046.1 99 % 99,0 %
3 Pseudomonas spec. AB685628.1 99 % 99,0 %
Probe 12P
1 Arthrobacter oxydans AB648980.1 99 % 99,0 %
1 Afipia spec. GU377117.1 99 % 99,0 %
1 Aeromonas spec. (c55(2012)) JQ781549.1 99 % 99,0 %
3 Aeromonas spec. (156B) JF444782.1 98-99 % 98,3 %
8 Enteropbacter spec. (S6BB) AB428448.1 96-99 % 98,5 %
1 Enteropbacter spec. (HWE-103) JQ723720.1 98 % 98,0 %
1 Enterobacter cloacae subsp. cloacae CP003737.1 98 % 98,0 %
15 Pseudomonas spec. (JCM 5415) AB685628.1 96-99 % 98,7 %
1 Pseudomonas spec. (R-41390) FR682933.1 99 % 99,0 %
16 Pseudomonas putida JX237836.1 97-100 % 99,0 %
Probe 13P
3 Achromobacter spec. JQ746486.1 99 % 99,0 %
1 Chitinibacter spec. JN981166.1 98 % 98,0 %
7 Aeromonas sobria JQ795757.1 97-99 % 98,7 %
2 Enteropbacter spec. (S6BB) AB428448.1 99 % 99,0 %
1 Enteropbacter spec. (HWE-103) JQ723720.1 98 % 98,0 %
1 Enterobacter cloacae JQ038222.1 99 % 99,0 %
8 Pseudomonas spec. (JCM 5415) AB685628.1 98-99 % 98,8 %
3 Pseudomonas spec. (R-41390) FR682933.1 99 % 99,0 %
1 Pseudomonas putida (strain CY04) JX082200.1 99 % 99,0 %
3 Pseudomonas putida (strain SXMAs-6) JN606325.1 99-100 % 99,3 %
10 Pseudomonas putida (strain MPV2) JX237836.1 98-100 % 99,0 %
6 Pseudomonas putida (strain MC4) JF825523.2 99 % 99,0 %
2 Stenotrophomonas rhizophila JQ890538.1 99 % 99,0 %
Probe B1P
1 Caulobacter spec. AM940947.1 99 % 99,0 %
1 Hyphomicrobium facile subsp. tolerans NR_027611.1 97 % 97,0 %
2 Hyphomicrobium vulgare AB543807.2 95-97 % 96,0 %
1 Methylocapsa aurea FN433469.1 97 % 97,0 %
5 Aeromonas salmonicida (strain E84) JF683662.1 99 % 99,0 %
7 Aeromonas salmonicida (strain ZHYYZ-5) JN106379.1 99 % 99,0 %
5 Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida AB680308.1 99-100 % 99,2 %
1 Crenothrix polyspora DQ295890.1 93 % 93,0 %
14 Enterovibrio spec. HM566000.1 93-95 % 94,1 %
6 Photobacterium spec. AB038032.1 93-94 % 93,5 %
1 Pseudomonas spec. FJ984605.1 99 % 99,0 %
4 Pseudomonas mandelii JQ317812.1 99 % 99,0 %
Probe B2P
1 Gaiella occulta JF423906.1 93 % 93,0 %
3 Flavobacterium hercynium AM177627.1 95-96 % 95,3 %
1 Hyphomicrobium facile subsp. tolerans NR_027611.1 98 % 98,0 %
1 Hyphomicrobium vulgare AB543807.2 96 % 96,0 %
97
1 Methylobacterium zatmanii NR_041031.1 99 % 99,0 %
3 Methylocapsa aurea FN433469.1 95-97 % 96,3 %
1 Methylocystis echinoides AJ458502.1 97 % 97,0 %
1 Methylosinus trichosporium AJ431385.2 98 % 98,0 %
1 Rhizobiales bacterium JQ773444.1 94 % 94,0 %
1 Rhodobacter spec. FJ195995.1 96 % 96,0 %
1 Pedomicrobium fusiforme Y14313.1 97 % 97,0 %
2 Pedomicrobium manganicum GU269549.1 97 % 97,0 %
1 Sphingomonas spec. EU131005.1 96 % 96,0 %
1 Sphingopyxis spec. FN386734.1 96 % 96,0 %
1 Geobacter metallireducens CP000148.1 91 % 91,0 %
2 Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila AB680394.1 99 % 99,0 %
23 Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida AB680308.1 99 % 99,0 %
1 Ectothiorhodospira spec. EU252492.1 91 % 91,0 %
1 Enterovibrio spec. HM566000.1 95 % 95,0 %
1 Pseudomonas fluorescens FJ226759.1 98 % 98,0 %
Probe Br1P
6 Haematobacter massiliensis DQ342308.1 94 % 94,0 %
1 Rhodobacter spec. FR691419.1 98 % 98,0 %
1 Erwinia persicina JN167937.1 100 % 100 %
40 Arenimonas spec. JN033774.1 94-96 % 95,4 %
Probe E1P
1 Pantoea agglomerans JN084142.1 99 % 99,0 %
1 Pseudomonas denitrificans JQ612512.1 91 % 91,0 %
1 Aciditerrimonas spec. JN033775.1 93 % 93,0 %
1 Microbacterium lacus FR691402.1 99 % 99,0 %
1 Microbacterium oxydans JN411364.1 99 % 99,0 %
1 Flavobacterium spec. FR682719.1 98 % 98,0 %
1 Exiguobacterium undae AB334767.1 99 % 99,0 %
1 Brevundimonas bullata JF276904.1 99 % 99,0 %
1 Caulobacter vibrioides JQ675297.1 97 % 97,0 %
1 Afipia spec. FM998728.1 100 % 100 %
1 Rhizobium spec. AY599702.1 99 % 99,0 %
2 Haematobacter massiliensis DQ342309.1 94-95 % 94,5 %
2 Pseudorhodobacter spec. HQ825033.1 98 % 98,0 %
2 Rastonia picketii JQ689181.1 99-100 % 99,5 %
31 Arenimonas spec. JN033774.1 94-96 % 95,4 %
Probe EIP
2 Pelomonas saccharophila AB681917.1 99 % 99,0 %
46 Acidivorax spec. AY093698.1 95-100 % 98,8 %
Probe EIIP
48 Acidivorax spec. AY093698.1 96-100 % 98,7 %
Probe E45P
1 Microbacterium paraoxydans EU714356.1 99 % 99,0 %
2 Flavobacterium spec. HM776981.1 96 % 96,0 %
5 Exiguobacterium undae AB334767.1 99 % 99,0 %
2 Haematobacter massiliensis DQ342308.1 94 % 94,0 %
3 Rhodobacter changlensis NR_042564.1 98-99 % 98,3 %
1 Rhodobacter spec. (CCBAU 10883) HQ437162.1 97 % 97,0 %
1 Rhodobacter spec. (R-36943) FR691419.1 98 % 98,0 %
1 Rhodobacter ovatus AM690348.2 97 % 97,0 %
1 Pseudorhodobacter spec. HQ825033.1 99 % 99,0 %
1 Erwinia rhapontici U80206.1 99 % 99,0 %
1 Acinetobacter johnsonii FJ976603.1 99 % 99,0 %
1 Pseudomonas spec. JQ762269.1 92 % 92,0 %
1 Steroidobacter denitrificans NR_044309.1 91 % 91,0 %
1 Steroidobacter spec. AB548216.1 91 % 91,1 %
26 Arenimonas spec. JN033774.1 94-96 % 95,3 %
Probe EIIIP
1 Mycobacterium spec. HE575946.1 99 % 99,0 %
1 Bradyrhizobium spec. FM998034.1 99 % 99,0 %
46 Acidivorax spec. AY093698.1 97-100 % 98,8 %
Probe EIVP
2 Hyphomicrobium spec. FJ711209.1 94-96 % 95,0 %
46 Acidivorax spec. AY093698.1 97-100 % 98,9 %
Tab. 12: Streubereiche und Mittelwerte der maximalen Identitäten (Prokaryota); Proben 10P, 11P,
12P, 13P, B1P, B2P, Br1P, E1P, EIP, EIIP, E45P, EIIIP, EIVP
98
Anzahl Klone nächster Verwandter Accession-Nr. Identität Identität x
Probe 10E
8 Asellus aquaticus AJ287055.1 99 % 99,0 %
16 Davidiella tassiana HQ533794.1 100 % 100 %
Probe 11E
15 Asellus aquaticus AJ287055.1 99 % 99,0 %
9 Davidiella tassiana HQ533794.1 100 % 100 %
Probe B1E
48 Asellus aquaticus AJ287055.1 99 % 99,0 %
Probe B2E
48 Asellus aquaticus AJ287055.1 99 % 99,0 %
Probe Br1E
48 Asellus aquaticus AJ287055.1 99 % 99,0 %
Probe E1E
1 Protacanthamoeba bohemica AY960120.1 98 % 98,0 %
5 Naegleria spec. DQ768723.1 99 % 99,0 %
11 Gibberella moniliformis AM946177.1 98-99 % 98,9 %
4 Acremonium strictum HM216184.1 99 % 99,0 %
1 Pichia spec. EF119340.1 99 % 99,0 %
26 Proasellus slavus (cavaticus) AF496662.1 99 % 99,0 %
Probe EVE
2 Cladosporium spec. JX273057.1 99 % 99,0 %
4 Fusarium spec. JQ934487.1 99 % 99,0 %
17 Gibberella moniliformis AM946177.1 98-99 % 98,7 %
2 Phoma spec. JQ838011.1 99 % 99,0 %
23 Proasellus slavus (cavaticus) AF496662.1 98-99 % 98,9 %
Probe EVIE
14 Aspergillus spec. AB713913.1 99 % 99,0 %
14 Gibberella moniliformis AM946177.1 98-99 % 98,9 %
20 Proasellus slavus (cavaticus) AF496662.1 98-99 % 98,9 %
Probe E45E
3 Protacanthamoeba bohemica AY960120.1 98 % 98,0 %
19 Naegleria spec. DQ768723.1 99 % 99,0 %
8 Gibberella moniliformis AM946177.1 99 % 99,0 %
2 Sarocladium kiliense HQ232198.1 99 % 99,0 %
16 Proasellus slavus (cavaticus) AF496662.1 98-99 % 98,8 %
Probe EVIIE
9 Gibberella moniliformis AM946177.1 98-99 % 98,8 %
39 Proasellus slavus (cavaticus) AF496662.1 98-99 % 98,9 %
Probe EVIIIE
13 Gibberella moniliformis AM946177.1 98-99 % 98,9 %
35 Proasellus slavus (cavaticus) AF496662.1 98-99 % 98,9 %
Tab. 13: Streubereiche und Mittelwerte der maximalen Identitäten (Eukaryota); Proben 10E, 11E,
B1E, B2E, Br1E, E1E, EVE, EVIE, E45E, EVIIE, EVIIIE
99
7.2 Sequenzlängen und maximale Identitäten
Abb. 53: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 10P
Abb. 54: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 10P
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
100
Abb. 55: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 11P
Abb. 56: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 11P
Abb. 57: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-24; Probe 10E
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
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maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
101
Abb. 58: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-24; Probe 10E
Abb. 59: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-24; Probe 11E
Abb. 60: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-24; Probe 11E
90
91
92
93
94
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97
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maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
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94
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maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
102
Abb. 61: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 12P
Abb. 62: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 12P
Abb. 63: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 13P
500
550
600
650
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
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600
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700
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
103
Abb. 64: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 13P
Abb. 65: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B1P
Abb. 66: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B1P
90
91
92
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94
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97
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maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
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900
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1000
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
104
Abb. 67: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B2P
Abb. 68: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B2P
Abb. 69: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B1E
500
550
600
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
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1100
1150
1200
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1300
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
105
Abb. 70: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B1E
Abb. 71: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B2E
Abb. 72: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B2E
90
91
92
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94
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99
100
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maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
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1350
1400
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
106
Abb. 73: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe Br1P
Abb. 74: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe Br1P
Abb. 75: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe Br1E
500
550
600
650
700
750
800
850
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1000
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
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1100
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
107
Abb. 76: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe Br1E
Abb. 77: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E1P
Abb. 78: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E1P
90
91
92
93
94
95
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97
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99
100
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maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
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900
950
1000
1050
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
108
Abb. 79: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIP
Abb. 80: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIP
Abb. 81: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIIP
500
550
600
650
700
750
800
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900
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1000
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
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1400
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Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
109
Abb. 82: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIIP
Abb. 83: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E45P
Abb. 84: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E45P
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
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maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
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900
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1000
1050
1100
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1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
110
Abb. 85: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIIIP
Abb. 86: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIIIP
Abb. 87: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIVP
500
550
600
650
700
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850
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1000
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1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
111
Abb. 88: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIVP
Abb. 89: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E1E
Abb. 90: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E1E
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
112
Abb. 91: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVE
Abb. 92: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVE
Abb. 93: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVIE
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
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1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
113
Abb. 94: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVIE
Abb. 95: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E45E
Abb. 96: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E45E
90
91
92
93
94
95
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97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
114
Abb. 97: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVIIE
Abb. 98: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVIIE
Abb. 99: Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVIIIE
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
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1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
Sequenzlänge [bp]
Klon-Sequenz-Nr.
115
Abb. 100: maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVIIIE
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
maximale Identität [%]
Klon-Sequenz-Nr.
116
7.3 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern
Klon-Nr.: 10_1,3,41,43
nächster bekannter Verwandter:
Stenotrophomonas spec. DD7 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ435720.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas
Klon-Nr.: 10_2,12,24,30
nächster bekannter Verwandter:
Micrococcus spec. HEXBA04 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ658423.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Micrococcaceae; Micrococcus
Klon-Nr.: 10_4,5,7,8,9,13,19,21,23,26,29,34,35,42,44,45
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. JCM 5415 gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB685628.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 10_6,18,22,25,36,38,40,47,48
nächster bekannter Verwandter:
Sphingomonas spec. Q5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ581440.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Sphingomonadales; Sphingomonadaceae; Sphingomonas
Klon-Nr.: 10_10,11,16,17,27,28,31,32,33
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium resistens strain BD-b365 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_044292.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: 10_14,15,20
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium denitrificans strain JS14-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU599190.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: 10_37,39,46
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium spec. 1126-1H-08 partial 16S rRNA gene, strain 1126-1H-08
Acessions-Nr.: HE612094.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Tab. 14: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe 10P
Klon-Nr.: 10_8,9,10,12,17,18,19,24
nächster bekannter Verwandter:
Asellus aquaticus 18S rRNA gene
Acessions-Nr.: AJ287055.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Asellus
Klon-Nr.: 10_1,2,3,4,5,6,7,11,13,14,15,16,20,21,22,23
nächster bekannter Verwandter:
Davidiella tassiana strain UFMGCB 3684 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
(anamorph: Cladosporium herbarum)
Acessions-Nr.: HQ533794
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Dothideomycetes; Dothideomycetidae; Capnodiales;
Davidiellaceae; Davidiella
Tab. 15: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe 10E
Klon-Nr.: 11_12,22,25,31,41,46
nächster bekannter Verwandter:
Micrococcus spec. HEXBA04 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ658423.1
117
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Micrococcaceae; Micrococcus
Klon-Nr.: 11_6,10,30
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. JCM 5415 gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB685628.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 11_3,4,5,16,20,24,28,29,32,33,37,39,40,42,43,44,45
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium resistens strain BD-b365 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_044292.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: 11_1,8,34,47
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium denitrificans strain JS14-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU599190.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: 11_2,27
nächster bekannter Verwandter:
Mycobacterium spec. S061 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ544445.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Corynebacterineae; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Klon-Nr.: 11_7,13,17
nächster bekannter Verwandter:
Rhodobacter megalophilus strain R6W-5-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ692104.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Klon-Nr.: 11_9,14,48
nächster bekannter Verwandter:
Sphingomonas spec. LC435 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ014557.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Sphingomonadales; Sphingomonadaceae; Sphingomonas
Klon-Nr.: 11_11,35
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas hydrophila strain QDC01 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX029046.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: 11_15,18,21,23,38
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium spec. R7Sb-3-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ928691.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: 11_19
nächster bekannter Verwandter:
Caulobacter spec. DNA for 16S ribosomal RNA, strain FWC08
Acessions-Nr.: AJ227762.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Caulobacter
Klon-Nr.: 11_26
nächster bekannter Verwandter:
Acidovorax spec. S4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: GU372408.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Acidovorax
Klon-Nr.: 11_36
nächster bekannter Verwandter:
Microbacterium oxydans strain O-5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ890539.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Tab. 16: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe 11P
118
Klon-Nr.: 11_1,2,5,8,9,10,12,13,15,17,18,19,21,22,24
nächster bekannter Verwandter:
Asellus aquaticus 18S rRNA gene
Acessions-Nr.: AJ287055.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Asellus
Klon-Nr.: 11_3,4,6,7,11,14,16,20,23
nächster bekannter Verwandter:
Davidiella tassiana strain UFMGCB 3684 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
(anamorph: Cladosporium herbarum)
Acessions-Nr.: HQ533794
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Dothideomycetes; Dothideomycetidae; Capnodiales;
Davidiellaceae; Davidiella
Tab. 17: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe 11E
Klon-Nr.: 12_1,2,3,6,8,9,14,20,22,26,29,31,34,41,47
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. JCM 5415 gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB685628.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 12_4,10,11,12,16,17,18,23,24,25,30,36,37,38,39,42
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas putida strain MPV2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX237836.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 12_5,7,15,21,32,33,44,45
nächster bekannter Verwandter:
Enterobacter spec. S6BB gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB428448.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter
Klon-Nr.: 12_13,27,48
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas spec. 156B 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF444782.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: 12_19
nächster bekannter Verwandter:
Arthrobacter oxydans gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: S32219
Acessions-Nr.: AB648980.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Micrococcaceae; Arthrobacter
Klon-Nr.: 12_28
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. R-41390 partial 16S rRNA gene, strain R-41390
Acessions-Nr.: FR682933.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 12_35
nächster bekannter Verwandter:
Enterobacter spec. HWE-103 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ723720.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter
Klon-Nr.: 12_40
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas spec. c55(2012) 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ781549.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: 12_43
nächster bekannter Verwandter:
Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01, complete genome
Acessions-Nr.: CP003737.1
Taxonomie:
119
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter; Enterobacter
cloacae complex
Klon-Nr.: 12_46
nächster bekannter Verwandter:
Afipia spec. sptzw29 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: GU377117.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Afipia
Tab. 18: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe 12P
Klon-Nr.: 13_2,8,18,30,41,44,45
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas sobria strain M-T-TSA 98 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ795757.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: 13_5,6,29
nächster bekannter Verwandter:
Achromobacter spec. CCUG 3353 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ746486.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Alcaligenaceae; Achromobacter
Klon-Nr.: 13_7
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas putida strain CY04 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX082200.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 13_15,27,28
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas putida strain SXMAs-6 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN606325.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 13_4,12,13,14,21,22,46,47
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. JCM 5415 gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB685628.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 13_9,11,16,20,25,26,33,34,35,38
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas putida strain MPV2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX237836.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 13_17,19,36,39,40,48
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas putida strain MC4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF825523.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 13_24,32
nächster bekannter Verwandter:
Stenotrophomonas rhizophila strain N-2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ890538.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas
Klon-Nr.: 13_37
nächster bekannter Verwandter:
Enterobacter cloacae strain MS-27 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ038222.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter; Enterobacter
cloacae complex
Klon-Nr.: 13_43
nächster bekannter Verwandter:
Chitinibacter spec. SK16 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN981166.1
Taxonomie:
120
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Chitinibacter
Klon-Nr.: 13_10,23
nächster bekannter Verwandter:
Enterobacter spec. S6BB gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB428448.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter
Klon-Nr.: 13_1,31,42
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. R-41390 partial 16S rRNA gene, strain R-41390
Acessions-Nr.: FR682933.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: 13_3
nächster bekannter Verwandter:
Enterobacter spec. HWE-103 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ723720.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter
Tab. 19: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe 13P
Klon-Nr.: B1_1,2,6,10,11,13,21,22,28,29,31,33,34,36
nächster bekannter Verwandter:
Enterovibrio spec. 09BSKS-4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HM566000.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales; Vibrionaceae; Enterovibrio
Klon-Nr.: B1_4,8,15,16,42,46
nächster bekannter Verwandter:
Photobacterium spec. HAR72 gene for 16S rRNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB038032.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales; Vibrionaceae; Photobacterium
Klon-Nr.: B1_5,14,40,48
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas mandelii strain McBRA2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ317812.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Proben: B1_7,12,17,18,25
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas salmonicida strain E84 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF683662.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: B1_9,20,26,30,32,37,43
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas salmonicida strain ZHYYZ-5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN106379.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: B1_19
nächster bekannter Verwandter:
Hyphomicrobium facile subsp. tolerans strain IFAM I-551 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_027611.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
Klon-Nr.: B1_23
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. gyq9 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ984605.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: B1_3,24
nächster bekannter Verwandter:
Hyphomicrobium vulgare gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB543807.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
Klon-Nr.: Br1_27
121
nächster bekannter Verwandter:
Caulobacter spec. ECN-2008 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: AM940947.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Caulobacter
Klon-Nr.: B1_35,38,39,41,44
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: NBRC 12659
Acessions-Nr.: AB680308.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: B1_45
nächster bekannter Verwandter:
Crenothrix polyspora clone 23 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ295890.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Methylococcales; Crenotrichaceae; Crenothrix
Klon-Nr.: B1_47
nächster bekannter Verwandter:
Methylocapsa aurea partial 16S rRNA gene, type strain KYGT
Acessions-Nr.: FN433469.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Beijerinckiaceae; Methylocapsa
Tab. 20: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe B1P
Klon-Nr.: B1_1 bis B1_48
nächster bekannter Verwandter:
Asellus aquaticus 18S rRNA gene
Acessions-Nr.: AJ287055.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Asellus
Tab. 21: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe B1E
Klon-Nr.: B2_1
nächster bekannter Verwandter:
Rhodobacter spec. ZS2-22 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ195995.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Klon-Nr.: B2_2
nächster bekannter Verwandter:
Gaiella occulta strain F2-233 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF423906.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Rubrobacteridae; Gaiellales; Gaiellaceae; Gaiella
Klon-Nr.: B2_3,4,6,9,10,11,15,16,17,21,23,32,33,34,36,37,38,41,42,43,44,45,46
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: NBRC 12659
Acessions-Nr.: AB680308.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: B2_5
nächster bekannter Verwandter:
Methylosinus trichosporium 16S rRNA gene, strain KS21
Acessions-Nr.: AJ431385.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Methylocystaceae; Methylosinus
Klon-Nr.: B2_7
nächster bekannter Verwandter:
Ectothiorhodospira spec. AM4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU252492.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Chromatiales; Ectothiorhodospiraceae; Ectothiorhodospira
Klon-Nr.: B2_8
122
nächster bekannter Verwandter:
Enterovibrio spec. 09BSKS-4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HM566000.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales; Vibrionaceae; Enterovibrio
Klon-Nr.: B2_12
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas fluorescens strain EvS4-B1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ226759.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: B2_13
nächster bekannter Verwandter:
Geobacter metallireducens GS-15, complete genome
Acessions-Nr.: CP000148.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Deltaproteobacteria; Desulfuromonadales; Geobacteraceae; Geobacter
Klon-Nr.: B2_14
nächster bekannter Verwandter:
Hyphomicrobium facile subsp. tolerans strain IFAM I-551 16S ribosom
Acessions-Nr.: NR_027611.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
Klon-Nr.: B2_18
nächster bekannter Verwandter:
Rhizobiales bacterium SK12 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ773444.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales
Klon-Nr.: B2_19,30
nächster bekannter Verwandter:
Pedomicrobium manganicum strain ATCC 33121 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: GU269549.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Pedomicrobium
Klon-Nr.: B2_20
nächster bekannter Verwandter:
Pedomicrobium fusiforme partial 16S rRNA gene, strain DSM 5304 (Organsim: Filomicrobium fusiforme)
Acessions-Nr.: Y14313.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Filomicrobium
Klon-Nr.: B2_22,25,48
nächster bekannter Verwandter:
Methylocapsa aurea partial 16S rRNA gene, type strain KYGT
Acessions-Nr.: FN433469.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Beijerinckiaceae; Methylocapsa
Klon-Nr.: B2_24,27,28
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium hercynium partial 16S rRNA gene, strain WB 4.2-78
Acessions-Nr.: AM177627.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: B2_26,35
nächster bekannter Verwandter:
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: NBRC 13286
Acessions-Nr.: AB680394.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Klon-Nr.: B2_29
nächster bekannter Verwandter:
Methylocystis echinoides partial 16S rRNA gene, strain 2
Acessions-Nr.: AJ458502.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Methylocystaceae; Methylocystis
Proben: B2_31
nächster bekannter Verwandter:
Hyphomicrobium vulgare gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB543807.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
123
Klon-Nr.: B2_39
nächster bekannter Verwandter:
Methylobacterium zatmanii strain DSM 5688 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_041031.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Methylobacteriaceae; Methylobacterium
Klon-Nr.: B2_40
nächster bekannter Verwandter:
Sphingopyxis spec. Sco-B12 partial 16S rRNA gene, strain Sco-B12
Acessions-Nr.: FN386734.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Sphingomonadales; Sphingomonadaceae; Sphingopyxis
Klon-Nr.: B2_47
nächster bekannter Verwandter:
Sphingomonas spec. BAC151 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU131005.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Sphingomonadales; Sphingomonadaceae; Sphingomonas
Tab. 22: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe B2P
Klon-Nr.: B2_1 bis B2_48
nächster bekannter Verwandter:
Asellus aquaticus 18S rRNA gene
Acessions-Nr.: AJ287055.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Asellus
Tab. 23: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe B2E
Klon-Nr.: Br1_1,2,3,6,7,8,11,12,13,14,15,16,17,19,20,22,23,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,
45,46,47,48
nächster bekannter Verwandter:
Arenimonas spec. CH15-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN033774.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Arenimonas
Klon-Nr.: Br1_4,9,10,21,24,25
nächster bekannter Verwandter:
Haematobacter massiliensis strain H2136 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ342308.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Haematobacter
Klon-Nr.: Br1_5
nächster bekannter Verwandter:
Erwinia persicina strain mskrs1ap 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN167937.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Erwinia
Klon-Nr.: Br1_18
nächster bekannter Verwandter:
Rhodobacter spec. R-36943 partial 16S rRNA gene, strain R-36943
Acessions-Nr.: FR691419.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Tab. 24: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe Br1P
Klon-Nr.: Br1_1 bis Br1_48
nächster bekannter Verwandter:
Asellus aquaticus 18S rRNA gene
Acessions-Nr.: AJ287055.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Asellus
Tab. 25: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe Br1E
124
Klon-Nr.:E1_1,4,5,7,8,9,10,12,13,14,15,16,17,18,23,24,27,28,31,32,33,34,35,36,37,40,42,43,44,45,46
nächster bekannter Verwandter:
Arenimonas spec. CH15-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN033774.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Arenimonas
Klon-Nr.: E1_2
nächster bekannter Verwandter:
Afipia spec. BALT12-S13 16S rRNA gene, isolate BALT12-S13
Acessions-Nr.: FM998728.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Afipia
Klon-Nr.: E1_3,48
nächster bekannter Verwandter:
Pseudorhodobacter spec. KOPRI 25878 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HQ825033.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Pseudorhodobacter
Klon-Nr.: E1_6
nächster bekannter Verwandter:
Microbacterium lacus partial 16S rRNA gene, strain R-43968
Acessions-Nr.: FR691402.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Klon-Nr.: E1_11
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium spec. R-36233 partial 16S rRNA gene, strain R-36233
Acessions-Nr.: FR682719.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: E1_19
nächster bekannter Verwandter:
Brevundimonas bullata strain BW56UT1570 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF276904.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Brevundimonas
Klon-Nr.: E1_20,47
nächster bekannter Verwandter:
Haematobacter massiliensis strain CCUG 47968 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ342309.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Haematobacter
Klon-Nr.: E1_21
nächster bekannter Verwandter:
Microbacterium oxydans strain IARI-K-83 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN411364.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Klon-Nr.: E1_22
nächster bekannter Verwandter:
Exiguobacterium undae gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB334767.1
Taxonomie:
Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillales Family XII. Incertae Sedis; Exiguobacterium
Klon-Nr.: E1_25
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas denitrificans strain KH-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ612512.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: E1_26
nächster bekannter Verwandter:
Aciditerrimonas spec. CH22-21 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN033775.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Acidimicrobidae; Acidimicrobiales; Acidimicrobineae; Aciditerrimonas
Klon-Nr.: E1_29,38
nächster bekannter Verwandter:
Ralstonia pickettii strain B1RO1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ689181.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Ralstonia
125
Klon-Nr.: E1_30
nächster bekannter Verwandter:
Rhizobium spec. TB2-10-I 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: AY599702.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Rhizobium
Klon-Nr.: E1_39
nächster bekannter Verwandter:
Pantoea agglomerans strain CE21 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN084142.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Pantoea
Klon-Nr.: E1_41
nächster bekannter Verwandter:
Caulobacter vibrioides strain JCT-7 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ675297.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Caulobacter
Tab. 26: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe E1P
Klon-Nr.: E1_2,5,6,7,8,10,11,13,14,15,16,17,19,20,22,24,25,26,29,33,34,35,38,40,44,46
nächster bekannter Verwandter:
Proasellus slavus 18S ribosomal RNA gene, complete sequence (= Proasellus cavaticus)
Acessions-Nr.: AF496662.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota; Aselloidea;
Asellidae; Proasellus
Klon-Nr.: E1_1,3,18,23,27,28,39,41,45,47,48
nächster bekannter Verwandter:
Gibberella moniliformis p450-4 gene for ent-kaurene oxidase, exons 1-4, strain A-00149
Acessions-Nr.: AM946177.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; Gibberella
Klon-Nr.: E1_4,21,32,37,43
nächster bekannter Verwandter:
Naegleria spec. SUM3V/I small subunit ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ768723.1
Taxonomie:
Eukaryota; Heterolobosea; Schizopyrenida; Vahlkampfiidae; Naegleria; unclassified Naegleria
Klon-Nr.: E1_9,31,36,42
nächster bekannter Verwandter:
Acremonium strictum strain DS1bioAY4a 18S ribosomal RNA gene, partial sequence (= Sarocladium strictum)
Acessions-Nr.: HM216184.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
mitosporic Hypocreales; Sarocladium
Klon-Nr.: E1_12
nächster bekannter Verwandter:
Pichia spec. LHY1 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EF119340.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes; Saccharomycetales; Pichiaceae; Pichia
Klon-Nr.: E1_30
nächster bekannter Verwandter:
Protacanthamoeba bohemica small subunit ribosomal RNA gene, complete sequence
Acessions-Nr.: AY960120.1
Taxonomie:
Eukaryota; Amoebozoa; Centramoebida; Acanthamoebidae; Protacanthamoeba
Tab. 27: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe E1E
Klon-Nr.: E45_1
nächster bekannter Verwandter:
Steroidobacter denitrificans strain FS 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_044309.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Sinobacteraceae; Steroidobacter
Klon-Nr.: E45_2
126
nächster bekannter Verwandter:
Erwinia rhapontici 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: U80206.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Erwinia
Klon-Nr.: E45_3,5,6,9,10,12,13,14,18,19,21,24,25,27,31,32,33,36,37,38,39,40,42,43,45,47
nächster bekannter Verwandter:
Arenimonas spec. CH15-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN033774.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Arenimonas
Klon-Nr.: E45_4,17
nächster bekannter Verwandter:
Haematobacter massiliensis strain H2136 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ342308.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Haematobacter
Klon-Nr.: E45_7,22,26,28,48
nächster bekannter Verwandter:
Exiguobacterium undae gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB334767.1
Taxonomie:
Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillales Family XII. Incertae Sedis; Exiguobacterium
Klon-Nr.:E45_8,35
nächster bekannter Verwandter:
Flavobacterium spec. HME6120 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HM776981.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Klon-Nr.: E45_11
nächster bekannter Verwandter:
Rhodobacter ovatus partial 16S rRNA gene, type strain JA234T
Acessions-Nr.: AM690348.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Klon-Nr.: E45_15
nächster bekannter Verwandter:
Pseudorhodobacter spec. KOPRI 25878 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HQ825033.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Pseudorhodobacter
Klon-Nr.: E45_16
nächster bekannter Verwandter:
Steroidobacter spec. ZUMI 37 gene for 16S rRNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB548216.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Sinobacteraceae; Steroidobacter
Klon-Nr.: E45_20
nächster bekannter Verwandter:
Rhodobacter spec. CCBAU 10883 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HQ437162.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Klon-Nr.: E45_23,34,44
nächster bekannter Verwandter:
Rhodobacter changlensis strain : JA139 16S ribosomal RNA, complete sequence
Acessions-Nr.: NR_042564.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Klon-Nr.: E45_29
nächster bekannter Verwandter:
Microbacterium paraoxydans strain 3200 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU714356.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Klon-Nr.: E45_30
nächster bekannter Verwandter:
Rhodobacter spec. R-36943 partial 16S rRNA gene, strain R-36943
Acessions-Nr.: FR691419.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
127
Klon-Nr.: E45_41
nächster bekannter Verwandter:
Pseudomonas spec. NEAU-ST5-5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ762269.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Klon-Nr.: E45_46
nächster bekannter Verwandter:
Acinetobacter johnsonii 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ976603.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Moraxellaceae; Acinetobacter
Tab. 28: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe E45P
Klon-Nr.: E45_1,2,6,9,13,17,18,30,34,36,38,42,43,44,47,48
nächster bekannter Verwandter:
Proasellus slavus 18S ribosomal RNA gene, complete sequence (= Proasellus cavaticus)
Acessions-Nr.: AF496662.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota; Aselloidea;
Asellidae; Proasellus
Klon-Nr.: E45_4,7,10,15,19,24,39,40
nächster bekannter Verwandter:
Gibberella moniliformis p450-4 gene for ent-kaurene oxidase, exons 1-4, strain A-00149
Acessions-Nr.: AM946177.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; Gibberella
Klon-Nr.: E45_5,11,12,16,20,21,22,23,25,27,29,31,32,33,35,37,41,45,46
nächster bekannter Verwandter:
Naegleria spec. SUM3V/I small subunit ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ768723.1
Taxonomie:
Eukaryota; Heterolobosea; Schizopyrenida; Vahlkampfiidae; Naegleria; unclassified Naegleria
Klon-Nr.: E45_3,8,26
nächster bekannter Verwandter:
Protacanthamoeba bohemica small subunit ribosomal RNA gene, complete sequence
Acessions-Nr.: AY960120.1
Taxonomie:
Eukaryota; Amoebozoa; Centramoebida; Acanthamoebidae; Protacanthamoeba
Klon-Nr.: E45_14,28
nächster bekannter Verwandter:
Sarocladium kiliense strain CBS 122.29 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HQ232198.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
mitosporic Hypocreales; Sarocladium
Tab. 29: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe E45E
Klon-Nr.:EI_1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,35,36,37,38,
39,40,41,42,43,44,46,47,48
nächster bekannter Verwandter:
Acidovorax spec. 'smarlab 133815' 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: AY093698.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Acidovorax
Klon-Nr.: EI_34,45
nächster bekannter Verwandter:
Pelomonas saccharophila gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: NBRC 103037
Acessions-Nr.: AB681917.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Pelomonas
Tab. 30: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EIP
Klon-Nr.: EV_2,3,5,12,15,16,18,21,27,30,32,35,37,38,44,45,48
nächster bekannter Verwandter:
Gibberella moniliformis p450-4 gene for ent-kaurene oxidase, exons 1-4, strain A-00149
128
Acessions-Nr.: AM946177.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; Gibberella
Klon-Nr.: EV_1,4,6,7,8,9,10,13,20,22,23,25,26,28,29,31,33,36,39,40,41,42,43
nächster bekannter Verwandter:
Proasellus slavus 18S ribosomal RNA gene, complete sequence = Proasellus cavaticus
Acessions-Nr.: AF496662.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Proasellus
Klon-Nr.: EV_11,14,17,47
nächster bekannter Verwandter:
Fusarium spec. ZLH-X6 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ934487.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; mitosporic Nectriaceae; Fusarium
Klon-Nr.: EV_19,34
nächster bekannter Verwandter:
Cladosporium spec. 2 FW1PhC3-1 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX273057.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Dothideomycetes; Dothideomycetidae; Capnodiales;
Davidiellaceae; mitosporic Davidiellaceae; Cladosporium
Klon-Nr.: EV_24,46
nächster bekannter Verwandter:
Phoma spec. ZHA 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ838011.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Dothideomycetes; Pleosporomycetidae; Pleosporales;
Pleosporineae; Didymellaceae; mitosporic Didymellaceae; Phoma
Tab. 31: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EVE
Klon-Nr.: EII_1 bsi EOII_48
nächster bekannter Verwandter:
Acidovorax spec. 'smarlab 133815' 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: AY093698.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Acidovorax
Tab. 32: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EIIP
Klon-Nr.: EVI_3,4,5,6,7,13,14,16,20,22,25,26,43,47
nächster bekannter Verwandter:
Gibberella moniliformis p450-4 gene for ent-kaurene oxidase, exons 1-4, strain A-00149
Acessions-Nr.: AM946177.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; Gibberella
Klon-Nr.: EVI_1,2,8,10,12,15,17,19,21,32,33,34,35,36,39,40,42,45,46,48
nächster bekannter Verwandter:
Proasellus slavus 18S ribosomal RNA gene, complete sequence = Proasellus cavaticus
Acessions-Nr.: AF496662.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Proasellus
Klon-Nr.: EVI_9,11,18,23,24,27,28,29,30,31,37,38,41,44
nächster bekannter Verwandter:
Aspergillus spec. han-1 gene for 16S rRNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB713913.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Eurotiomycetes; Eurotiomycetidae; Eurotiales;
Trichocomaceae; mitosporic Trichocomaceae; Aspergillus
Tab. 33: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EVIE
Klon-Nr.: EIII_1,2,3,5,6,7,8,9,10,11,12,13,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,
39,40,41,42,43,44,45,46,47,48
nächster bekannter Verwandter:
129
Acidovorax spec. 'smarlab 133815' 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: AY093698.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Acidovorax
Klon-Nr.: EIII_4
nächster bekannter Verwandter:
Bradyrhizobium spec. RS-46 partial 16S rRNA gene, strain RS-46
Acessions-Nr.: FM998034.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Bradyrhizobium
Klon-Nr.: EIII_14
nächster bekannter Verwandter:
Mycobacterium spec. 12/13.28 AW partial 16S rRNA gene, strain 12/13.28 AW
Acessions-Nr.: HE575946.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Corynebacterineae; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Tab. 34: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EIIIP
Klon-Nr.: EVII_10,12,15,24,28,30,36,46,48
nächster bekannter Verwandter:
Gibberella moniliformis p450-4 gene for ent-kaurene oxidase, exons 1-4, strain A-00149
Acessions-Nr.: AM946177.1
Taxonomie: Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae;
Hypocreales; Nectriaceae; Gibberella
Klon-Nr.: EVII_1,2,3,4,5,6,7,8,9,11,13,14,16,17,18,19,20,21,22,23,25,26,27,29,31,32,33,34,35,37,38,39,40,41,42,43,44,
45,47
nächster bekannter Verwandter:
Proasellus slavus 18S ribosomal RNA gene, complete sequence = Proasellus cavaticus
Acessions-Nr.: AF496662.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Proasellus
Tab. 35: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EVIIE
Klon-Nr.:EIV_1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,28,29,30,31,32,33,34,36,37,38,39,
40,41,42,43,44,45,46,47,48
nächster bekannter Verwandter:
Acidovorax spec. 'smarlab 133815' 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: A8Y093698.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Acidovorax
Klon-Nr.: EIV_27,35
nächster bekannter Verwandter:
Hyphomicrobium spec. KC-IT-W2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ711209.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
Tab. 36: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EIVP
Klon-Nr.: EVIII_1,3,7,11,15,33,34,36,38,40,41,44,45
nächster bekannter Verwandter:
Gibberella moniliformis p450-4 gene for ent-kaurene oxidase, exons 1-4, strain A-00149
Acessions-Nr.: AM946177.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; Gibberella
Klon-Nr.:EVIII_2,4,5,6,8,9,10,12,13,14,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,35,37,39,42,43,46,47,48
nächster bekannter Verwandter:
Proasellus slavus 18S ribosomal RNA gene, complete sequence = Proasellus cavaticus
Acessions-Nr.: AF496662.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Proasellus
Tab. 37: Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entsprechenden Taxa; Probe EVIIIE
130
7.4 Originalsequenzen der ermittelten Taxa
Achromobacter spec. CCUG 3353 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ746486.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Alcaligenaceae; Achromobacter
Origin:
1 gtggcgagtg gcgaacgggt gagtaatgta tcggaacgtg cctagtagcg ggggataact
61 acgcgaaagc gtagctaata ccgcatacgc cctacggggg aaagcagggg atcgcaagac
121 cttgcactat tagagcggcc gatatcggat tagctagttg gtggggtaac ggctcaccaa
181 ggcgacgatc cgtagctggt ttgagaggac gaccagccac actgggactg agacacggcc
241 cagactccta cgggaggcag cagtggggaa ttttggacaa tgggggaaac cctgatccag
301 ccatcccgcg tgtgcgatga aggccttcgg gttgtaaagc acttttggca ggaaagaaac
361 gtcatgggct aataccccgt gaaactgacg gtacctgcag aataagcacc ggctaactac
421 gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa
481 gcgtgcgcag gcggttcgga aagaaagatg tgaaatccca gagcttaact ttggaactgc
541 atttttaact accgagctag agtgtgtcag agggaggtgg aattccgcgt gtagcagtga
601 aatgcgtaga tatgcggagg aacaccgatg gcgaaggcag cctcctggga taacactgac
661 gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcccta
721 aacgatgtca actagctgtt ggggccttcg ggccttggta gcgcagctaa cgcgtgaagt
781 tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca
841 caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa aaaccttacc tacccttgac
901 atgtctggaa ttccgaagag atttggaagt gctcgcaaga gaaccggaac acaggtgctg
961 catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc
1021 cttgtcatta gttgctacga aagggcactc taatgagact gccggtgaca aaccggagga
1081 aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttatgggta gggcttcaca cgtcatacaa
1141 tggtcgggac agagggtcgc caacccgcga gggggagcca atcccagaaa cccgatcgta
1201 gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg tgaagtcgga atcgctagta atcgcggatc
1261 agcatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtca
Tab. 38: DNA-Sequenz von Achromobacter spec. CCUG 3353 aus der Datenbank BLAST
Aciditerrimonas spec. CH22-21 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN033775.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Acidimicrobidae; Acidimicrobiales; Acidimicrobineae; Aciditerrimonas
Origin:
1 gacgaacgct ggcggcgtgc ctaacacatg caagtcgaac gaggtccatc ctttgggaga
61 agacctagtg gcgaacgggt gagtaacacg tgaagaacct gccccgaaga ccgggataac
121 cctccgaaag gagagctaat accggatacc cccaccgagc cgcatggttt ggtgaggaaa
181 tggattccgc ttcgggaggg cttcgcggcc tatcagctag ttggtggggt aacggcccac
241 caaggcatcg acgggtagct ggtctgagag gacgatcagc cacactggga ctgagacacg
301 gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatcttgcg caatgggcga aagcctgacg
361 cagcaacgcc gcgtggggga tgaaggctct cgggttgtaa acccctttca gcagggacga
421 atcaagacgg tacctgcaga agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaaca
481 cgtagggggc aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag agctcgtagg tggctgagta
541 agtcggatgt taaatcccca ggctcaacct gggacaccac ccgatactgc tctggctaga
601 gtccggtagg ggagcgtgga attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat atcaggagga
661 acaccagcgg cgaaggcggc gctctgggcc ggtactgaca ctgaggagcg aaagcgtggg
721 tagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgttgggca ctaggtgtgg
781 ggtctattca acggactccg tgccgtagct aacgcattaa gtgccccgcc tggggagtac
841 ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcagc ggagcatgtt
901 gcttaattcg aggcaacgcg aagaacctta cctgggtttg acatgtagag aaaagccata
961 gagatatggt gtccttcggg gttctacaca ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc
1021 gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt gtcctatgtt gccagcacgt
1081 catggtgggg actcgtagga gactgccggg gtcaactcgg aggaaggtgg ggacgacgtc
1141 aaatcatcat gccccttata tccagggctg caaacatgct acaatggccg gtacaaaggg
1201 ctgcgaaacc gcgaggtgga gcgaatccca gaaagccggt ctcagttcgg attggagtct
1261 gcaactcgac tccatgaagc tggagttgct agtaatcccg gatcagcaac gccggggtga
1321 atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gaaagttgga aacgcccgaa
1381 gccagtggcc gaacccgcaa gggacggagc tgtcgaaggt ggaatcagcg attagggtg
Tab. 39: DNA-Sequenz von Aciditerrimonas spec. CH22-21 aus der Datenbank BLAST
Acidovorax spec. 'smarlab 133815' 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: AY093698.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Acidovorax
Origin:
1 ttgatcctgg ctcagattga acgctggcgg catgccttac acatgcaagt cgaacggtaa
61 caggtcttcg gatgctgacg agtggcgaac gggtgagtaa tacatcggaa cgtgcccgag
121 agtgggggat aacgaagcga aagctttgct aataccgcat acgatctcag gatgaaagca
181 ggggaccgca aggccttgcg ctcacggagc ggccgatggc agattaggta gttggtggga
241 taaaagctta ccaagccgac gatctgtagc tggtctgaga ggacgaccag ccacactggg
301 actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgg acaatgggcg
131
361 caagcctgat ccagccatgc cgcgtgcagg atgaaggcct tcgggttgta aactgctttt
421 gtacggaacg aaaagactcc ttctaataaa gggggtccat gacggtaccg taagaataag
481 caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag ggtgcgagcg ttaatcggaa
541 ttactgggcg taaagcgtgc gcaggcggtg atgtaagaca gatgtgaaat ccccgggctc
601 aacctgggaa ctgcatttgt gactgcatcg ctggagtgcg gcagaggggg atggaattcc
661 gcgtgtagca gtgaaatgcg tagatatgcg gaggaacacc gatggcgaag gcaatcccct
721 gggcctgcac tgacgctcat gcacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg
781 tagtccacgc cctaaacgat gtcaactggt tgttgggtct tcactgactc agtaacgaag
841 ctaacgcgtg aagttgaccg cctggggagt acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt
901 gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg tggtttaatt cgatgcaacg cgaaaaacct
961 tacccacctt tgacatgtac ggaatccttt agagatagag gagtgctcga aagagagccg
1021 taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg
1081 caacgagcgc aacccttgcc attagttgct acgaaagggc actctaatgg gactgccggt
1141 gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttata ggtggggcta
1201 cacacgtcat acaatggctg gtacagaggg ttgccaaccc gcgaggggga gccaatccca
1261 caaagccagt cgtagtccgg atcgcagtct gcaactcgac tgcgtgaagt cggaatcgct
1321 agtaatcgcg gatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg
1381 tcacaccatg ggagcgggtt ctgccagaag tagttagcct aaccgcaagg agggcgatta
1441 ccacggcagg gttcgtgact ggggtgaagt cgtaacaagg ta
Tab. 40: DNA-Sequenz von Acidovorax spec. 'smarlab 133815' aus der Datenbank BLAST
Acidovorax spec. S4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: GU372408.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Acidovorax
Origin:
1 ctacctgcag tcgacggtaa caggtcttcg gatgctgacg agtggcgaac gggtgagtaa
61 tacatcggaa cgtgcccgag agtgggggat aacgaggcga aagctttgct aataccgcat
121 acgatctcag gatgaaagca ggggaccgca aggccttgcg ctcacggagc ggccgatggc
181 agattaggta gttggtggga taaaagctta ccaagccgac gatctgtagc tggtctgaga
241 ggacgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg
301 ggaattttgg acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc cgcgtgcagg atgaaggcct
361 tcgggttgta aactgctttt gtacggaacg aaaagactcc ttctaataaa gggggtccat
421 gacggtaccg taagaataag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag
481 ggtgcgagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgtgc gcaggcggtt atataagaca
541 gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcatttgt gactgtatag ctagagtacg
601 gcagaggggg atggaattcc gcgtgtagca gtgaaatgcg taaatatgcg gaggaacacc
661 gagggcgaag gcaatcccct gggcctgtac tgacgctcat gcacgaaagc gtggggagca
721 aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat gtcaactggt tgttgggtct
781 tcactgactc agtaacgaag ctaacgcgtg aagttgaccg cctggggagt acggccgcaa
841 ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg tggtttaatt
901 cgatgcaacg cgaaaaacct tacccacctt tgacatgtat ggaatccttt agagatagag
961 gagtgctcga aagagagcca taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg
1021 agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgcc attagttgct acgaaagggc
1081 actctaatgg gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat
1141 ggcccttata ggtggggcta cacacgtcat acaatggctg gtacagaggg ttgccaaccc
1201 gcgaggggga gccaatccca taaagccagt cgtagtccgg atcgcagtct gcaactcgac
1261 tgcgtgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg
1321 ggtctgtaca caccaaccgt cacaccatgg gagcgggttc tgccagaagt agtagctaac
1381 cgcaggaggc gtacccg
Tab. 41: DNA-Sequenz von Acidovorax spec. S4 aus der Datenbank BLAST
Acinetobacter johnsonii 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ976603.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Moraxellaceae; Acinetobacter
Origin:
1 gcgcggctta cacatgcaag tcgagcgggg aagggtagct tgctacctga cctagcggcg
61 gacgggtgag taatgcttag gaatctgcct attagtgggg gacaacattc cgaaaggaat
121 gctaataccg catacgccct acgggggaaa gcaggggatc ttcggacctt gcgctaatag
181 atgagcctaa gtcagattag ctagttggtg gggtaaaggc ctaccaaggc gacgatctgt
241 agcgggtctg agaggatgat ccgccacact gggactgaga cacggcccag actcctacgg
301 gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgaaagcct gatccagcca tgccgcgtgt
361 gtgaagaagg ccttttggtt gtaaagcact ttaagcgagg aggaggctac cgagattaat
421 actcttggat agtggacgtt actcgcagaa taagcaccgg ctaactctgt gccagcagcc
481 gcggtaatac agagggtgcg agcgttaatc ggatttactg ggcgtaaagc gtgcgtaggc
541 ggctttttaa gtcggatgtg aaatccctga gcttaactta ggaattgcat tcgatactgg
601 gaagctagag tatgggagag gatggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga
661 tctggaggaa taccgatggc gaaggcagcc atctggccta atactgacgc tgaggtacga
721 aagcatgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgccgtaaa cgatgtctac
781 tagccgttgg ggcctttgag gctttagtgg cgcagctaac gcgataagta gaccgcctgg
841 ggagtacggt cgcaagacta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga
901 gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggtcttgaca tagtaagaac
961 tttccagaga tggattggtg ccttcgggaa cttacataca ggtgctgcat ggctgtcgtc
1021 agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt ttccttattt
132
1081 gccagcgggt taagccggga actttaagga tactgccagt gacaaactgg aggaaggcgg
1141 ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggtcg
1201 gtacaaaggg ttgctaccta gcgataggat gctaatctca aaaagccgat cgtagtccgg
1261 attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagaatg
1321 ccgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgaca caccgaaaac tggcgcaaat tgataccctg
1381 cctttgggg
Tab. 42: DNA-Sequenz von Acinetobacter johnsonii aus der Datenbank BLAST
Acremonium strictum strain DS1bioAY4a 18S ribosomal RNA gene, partial sequence (= Sarocladium strictum)
Acessions-Nr.: HM216184.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
mitosporic Hypocreales; Sarocladium
Origin:
1 gcaattatac agcgaaactg cgaatgagct cattatataa gttatcgttt atttgatagt
61 gccttactac ttggataacc gtggtaattc tagagctaat acatgctaaa aaccccgact
121 tcggaagggg tgtatttatt agatacaaaa ccaatgccct tcggggctcc ttggtgattc
181 atgataacta tacgaatcgc acggccttgc gccggcgatg gttcattcaa atttcttccc
241 tatcaacttt cgatgtttgg gtattggcca aacatggttg caacgggtaa cggagggtta
301 gggctcgacc ccggagaagg agcctgagaa acggctacta catccaagga aggcagcagg
361 cgcgcaaatt acccaatccc gactcgggga ggtagtgaca ataaatactg atacagggcc
421 ctttcgggcc ttgtaattgg aatgagtaca atttaaatcc cttaacgagg aacaattgga
481 gggcaagtct ggtgccagca gccgcggtaa ttccagctcc aatagcgtat attaaagttg
541 ttgtggttaa aaagctcgct agttgaacct tgggcctggc tggccggtcc gcctcaccgc
601 gtgcactggt ccggccgggc ctttccctct gtggaacccc atacccttca ctgggcgtgg
661 cggggaaaca ggacatttac tttgaaaaaa ttagagtgct ccaggcaggc ctatgctcga
721 atacattagc atggaataat aaaataggac gcgcggttct attttgttgg tttataggac
781 cgccgtaatg attaataggg acagtcgggg gcatcagtat tcaactgtca gaggtgaaat
841 tcttggatca gttgaagact aactactgcg aaagcatttg ccaaggatgt tttcattaat
901 caggaacgaa agttagggga tcgaagacga tcagataccg tcgtagtctt aaccataaac
961 tatgccgact agggatcgga cggtgttatt catgacccgt tcggcacctt acgagaaatc
1021 aaagtgcttg ggctccaggg ggagtatggt cgcaaggctg aaacttaaag aaattgacgg
1081 aagggcacca ccaggggtgg agcctgcggc ttaatttgac tcaacacggg gaaactcacc
1141 aggtccagac acaataagga ttgacagatt gagagctctt tcttgatttt gtgggtggtg
1201 gtgcatggcc gttcttagtt ggtggggtga cttgtctgct taattgcgat aacgaacgag
1261 accttaacct gctaaatagc ccgcattgct ccggcagtgc gctggcttct tagagggact
1321 ttcggctc
Tab. 43: DNA-Sequenz von Acremonium strictum DS1bioAY4a aus der Datenbank BLAST
Aeromonas hydrophila strain QDC01 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX029046.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Origin:
1 cdstcaatgg gggcgggcct tacacatgca agtcgagcgg cagcgggaaa gtagcttgct
61 acttttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgcctgg gaaattgccc agtcgagggg
121 gataacagtt ggaaacgact gctaataccg catacgccct acgggggaaa gcaggggacc
181 ttcgggcctt gcgcgattgg atatgcccag gtgggattag ctagttggtg aggtaatggc
241 tcaccaaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgat cagccacact ggaactgaga
301 cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct
361 gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg
421 aggaaaggtt gatgcctaat acgtatcaac tgtgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc
481 taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg
541 gcgtaaagcg cacgcaggcg gttggataag ttagatgtga aagccccggg ctcaacctgg
601 gaattgcatt taaaactgtc cagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta
661 gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa
721 gactgacgct caggtgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca
781 cgccgtaaac gatgtcgatt tggaggctgt gtccttgaga cgtggcttcc ggagctaacg
841 cgttaaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg
901 ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg
961 gccttgacat gtctggaatc ctgcagagat gcgggagtgc cttcgggaat cagaacacag
1021 gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc
1081 gcaacccctg tcctttgttg ccagcacgta atggtgggaa ctcaagggag actgccggtg
1141 ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacgg ccagggctac
1201 acacgtgcta caatggcgcg tacagagggc tgcaagctag cgatagtgag cgaatcccaa
1261 aaagcgcgtc gtagtccgga tcggagtctg caactcgact ccgtgaagtc ggaatcgcta
1321 gtaatcgcaa atcagaatgt tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt
1381 cacaccatgg gagtgggttg caccagaagt agatagctta accttcggga gggcgttacc
1441 acggttatac gttgg
Tab. 44: DNA-Sequenz von Aeromonas hydrophila QDC01 aus der Datenbank BLAST
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: NBRC 13286
Acessions-Nr.: AB680394.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
133
Origin:
1 attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggcagcggga aagtagcttg
61 ctacttttgc cggcgagcgg cggacgggtg agtaatgcct ggggatctgc ccagtcgagg
121 gggataacag ttggaaacga ctgctaatac cgcatacgcc ctacggggga aaggagggga
181 ccttcgggcc tttcgcgatt ggatgaaccc aggtgggatt agctagttgg tggggtaatg
241 gctcaccaag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctggaactga
301 gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggggaaacc
361 ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca ctttcagcga
421 ggaggaaagg ttggcgccta atacgtgtca actgtgacgt tactcgcaga agaagcaccg
481 gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact
541 gggcgtaaag cgcacgcagg cggttggata agttagatgt gaaagccccg ggctcaacct
601 gggaattgca tttaaaactg tccagctaga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg
661 tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca
721 aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc
781 cacgccgtaa acgatgtcga tttggaggct gtgtccttga gacgtggctt ccggagctaa
841 cgcgttaaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg
901 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc
961 tggccttgac atgtctggaa tcctgcagag atgcgggagt gccttcggga atcagaacac
1021 aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga
1081 gcgcaacccc tgtcctttgt tgccagcacg taatggtggg aactcaaggg agactgccgg
1141 tgataaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac ggccagggct
1201 acacacgtgc tacaatggcg cgtacagagg gctgcaagct agcgatagtg agcgaatccc
1261 aaaaagcgcg tcgtagtccg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag tcggaatcgc
1321 tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc
1381 gtcacaccat gggagtgggt tgcaccagaa gtagatagct taaccttcgg gagggcgttt
1441 accacggtgt gattcatgac tggggtgaag
Tab. 45: DNA-Sequenz von Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila NBRC 13286 a. d. D. BLAST
Aeromonas salmonicida strain E84 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF683662.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Origin:
1 gacgggtgag taatgcctgg ggatctgccc agtcgagggg gataacagtt ggaaacgact
61 gctaataccg catacgccct acgggggaaa ggaggggacc ttcgggcctt tcgcgattgg
121 atgaacccag gtgggattag ctagttggtg gggtaatggc tcaccaaggc gacgatccct
181 agctggtctg agaggatgat cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg
241 gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct gatgcagcca tgccgcgtgt
301 gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgagg aggaaaggtt ggcgcctaat
361 acgtgtcaac tgtgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg
421 cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg
481 gttggataag ttagatgtga aagccccggg ctcaacctgg gaattgcatt taaaactgtc
541 cagctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat
601 ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa
661 agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcgatt
721 tggaggctgt gtccttgaga cgtggcttcc ggagctaacg cgttaaatcg accgcctggg
781 gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag
841 catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttacctg gccttgacat gtctggaatc
901 ctgtagagat acgggagtgc cttcgggaat cagaacacag gtgctgcatg gctgtcgtca
961 gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaacccctg tcctttgttg
1021 ccagcacgta atggtgggaa ctcaagggag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg
1081 gatgacgtca agtcatcatg gcccttacgg ccagggctac acacgtgcta caatggcgcg
1141 tacagagggc tgcaagctag cgatagtgag cgaatcccaa aaagcgcgtc gtagtccgga
1201 tcggagtctg caactcgact ccgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcga atcagaatgt
1261 cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcc
Tab. 46: DNA-Sequenz von Aeromonas salmonicida E84 aus der Datenbank BLAST
Aeromonas salmonicida strain ZHYYZ-5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN106379.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Origin:
1 gtgcatgcgc agactaccat gcaagtcgag cggcagcggg aaagtagctt gctacttttg
61 ccggcgagcg gcggacgggt gagtaatgcc tggggatctg cccagtcgag ggggataaca
121 gttggaaacg actgctaata ccgcatacgc cctacggggg aaaggagggg accttcgggc
181 ctttcgcgat tggatgaacc caggtgggat tagctagttg gtggggtaat ggctcaccaa
241 ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat gatcagccac actggaactg agacacggtc
301 cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggggaaac cctgatgcag
361 ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg gttgtaaagc actttcagcg aggaggaaag
421 gttggcgcct aatacgtgtc aactgtgacg ttactcgcag aagaagcacc ggctaactcc
481 gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa
541 gcgcacgcag gcggttggat aagttagatg tgaaagcccc gggctcaacc tgggaattgc
601 atttaaaact gtccagctag agtcttgtag aggggggtag aattccaggt gtagcggtga
661 aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac
721 gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta
134
781 aacgatgtcg atttggaggc tgtgtccttg agacgtggct tccggagcta acgcgttaaa
841 tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc
901 acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctggccttga
961 catgtctgga atcctgcaga gatgcgggag tgccttcggg aatcagaaca caggtgctgc
1021 atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc
1081 ctgtcctttg ttgccagcac gtaatggtgg gaactcaagg gagactgccg gtgataaacc
1141 ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta cggccagggc tacacacgtg
1201 ctacaatggc gcgtacagag ggctgcaagc tagcgatagt gagcgaatcc caaaaagcgc
1261 gtcgtagtcc ggatcggagt ctgcaactcg actccgtgaa gtcggaatcg ctagtaatcg
1321 cgaatcagaa tgtcgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca
1381 tgggagtggg ttgcac
Tab. 47: DNA-Sequenz von Aeromonas salmonicida ZHYYZ-5 aus der Datenbank BLAST
Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: NBRC 12659
Acessions-Nr.: AB680308.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Origin:
1 attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggcagcggga aagtagcttg
61 ctacttttgc cggcgagcgg cggacgggtg agtaatgcct ggggatctgc ccagtcgagg
121 gggataacag ttggaaacga ctgctaatac cgcatacgcc ctacggggga aaggagggga
181 ccttcgggcc tttcgcgatt ggatgaaccc aggtgggatt agctagttgg tggggtaatg
241 gctcaccaag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctggaactga
301 gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggggaaacc
361 ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca ctttcagcga
421 ggaggaaagg ttggcgccta atacgtgtca actgtgacgt tactcgcaga agaagcaccg
481 gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact
541 gggcgtaaag cgcacgcagg cggttggata agttagatgt gaaagccccg ggctcaacct
601 gggaattgca tttaaaactg tccagctaga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg
661 tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca
721 aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc
781 cacgccgtaa acgatgtcga tttggaggct gtgtccttga gacgtggctt ccggagctaa
841 cgcgttaaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg
901 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc
961 tggccttgac atgtctggaa tcctgtagag atacgggagt gccttcggga atcagaacac
1021 aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga
1081 gcgcaacccc tgtcctttgt tgccagcacg taatggtggg aactcaaggg agactgccgg
1141 tgataaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac ggccagggct
1201 acacacgtgc tacaatggcg cgtacagagg gctgcaagct agcgatagtg agcgaatccc
1261 aaaaagcgcg tcgtagtccg gatcggagtc tgcaactcga ctccgtgaag tcggaatcgc
1321 tagtaatcgc gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc
1381 gtcacaccat gggagtgggt tgcaccagaa gtagatagct taaccttcgg gagggcgttt
1441 accacggtgt gattcatgac tggggtgaag
Tab. 48: DNA-Sequenz von Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida NBRC 12659 a. d. D. BLAST
Aeromonas sobria strain M-T-TSA 98 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ795757.1
Taxonomie: Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Origin:
1 tcatggctca gattgaacgc tggcggcagg cctaacacat gcaagtcgag cggcagcggg
61 aaagtagctt gctacttttg ccggcgagcg gcggacgggt gagtaatgcc tggggatctg
121 cccagtcgag ggggataaca gttggaaacg actgctaata ccgcatacgc cctacggggg
181 aaaggagggg accttcgggc ctttcgcgat tggatgaacc caggtgggat tagctagttg
241 gtggggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat gatcagccac
301 actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa
361 tgggggaaac cctgatgcag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg gttgtaaagc
421 actttcagcg aggaggaaag gttggcagct aatatctgtc agctgtgacg ttactcgcag
481 aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa
541 tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggttggat aagttagatg tgaaagcccc
601 gggctcaacc tgggaattgc atttaaaact gttcagctag agtcttgtag aggggggtag
661 aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg
721 ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata
781 ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtcg atttggaggc tgtgtccttg agacgtggct
841 tccggagcta acgcgttaaa tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa
901 atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga
961 agaaccttac ctggccttga catgtctgga atcctgtaga gatacgggag tgccttcggg
1021 aatcagaaca caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag
1081 tcccgcaacg agcgcaaccc ctgtcctttg ttgccagcac gtaatggtgg gaactcaagg
1141 gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta
1201 cggccagggc tacacacgtg ctacaatggc gcgtacagag ggctgcaagc tagcgatagt
1261 gagcgaatcc caaaaagcgc gtcgtagtcc ggatcggagt ctgcaactcg actccgtgaa
1321 gtcggaatcg ctagtaatcg caaatcagaa tgttgcggtg aatacgttcc cgggccttgt
1381 acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaccaga agtagatagc ttaaccttcg
1441 ggagggcgt
Tab. 49: DNA-Sequenz von Aeromonas sobria M-T-TSA 98 aus der Datenbank BLAST
135
Aeromonas spec. c55(2012) 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ781549.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Origin:
1 tgcaagtcga gcggcagcgg gaaagtagct tgctactttt gccggcgagc ggcggacggg
61 tgagtaatgc ctgggaaatt gcccagtcga gggggataac agttggaaac gactgctaat
121 accgcatacg ccctacgggg gaaagcaggg gaccttcggg ccttgcgcga ttggatatgc
181 ccaggtggga ttagcttgtt ggtgaggtaa tggctcacca aggcgacgat ccctagctgg
241 tctgagagga tgatcagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca
301 gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca gccatgccgc gtgtgtgaag
361 aaggccttcg ggttgtaaag cactttcagc gaggaggaaa ggttgatgcc taatacgcat
421 cagctgtgac gttactcgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa
481 tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcacgca ggcggttgga
541 taagttagat gtgaaagccc cgggctcaac ctgggaattg catttaaaac tgtccagcta
601 gagtcttgta gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggag
661 gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga cgctcaggtg cgaaagcgtg
721 gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt aaacgatgtc gatttggagg
781 ctgtgtcctt gagacgtggc ttccggagct aacgcgttaa atcgaccgcc tggggagtac
841 ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg
901 gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctggccttg acatgtctgg aatcctgcag
961 agatgcggga gtgccttcgg gaatcagaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt
1021 gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cctgtccttt gttgccagca
1081 cgtaatggtg ggaactcaag ggagactgcc ggtgataaac cggaggaagg tggggatgac
1141 ttcaagtcat catggccctt acggccaggg ctacacacgt gctacaatgg cgcgtacaga
1201 gggctgcaag ctaccgatag tgaacgaatc ccaaaaagcg cgtcgtagtc cggatcggag
1261 tctgcaactc
Tab. 50: DNA-Sequenz von Aeromonas spec. c55(2012) aus der Datenbank BLAST
Aeromonas spec. 156B 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF444782.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales; Aeromonadaceae; Aeromonas
Origin:
1 gccggcgagc ggcggacggg tgagtaatgc ctggggatct gcccagtcga gggggataac
61 agttggaaac gactgctaat accgcatacg ccctacgggg gaaaggaggg gaccttcggg
121 cctttcgcga ttggatgaac ccaggtggga ttagctagtt ggtggggtaa tggctcacca
181 aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga tgatcagcca cactggaact gagacacggt
241 ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggggaaa ccctgatgca
301 gccatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg ggttgtaaag cactttcagc gaggaggaaa
361 ggttggcagc taatatctgt cagctgtgac gttactcgca gaagaagcac cggctaactc
421 cgtgccagca gccgcggtaa tacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa
481 agcgcacgca ggcggttgga taagttagat gtgaaagccc cgggctcaac ctgggaattg
541 catttaaaac tgttcagcta gagtcttgta gaggggggta gaattccagg tgtagcggtg
601 aaatgcgtag agatctggag gaataccggt ggcgaaggcg gccccctgga caaagactga
661 cgctcaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt
721 aaacgatgtc gatttggagg ctgtgtcctt gagacgtggc ttccggagct aacgcgttaa
781 atcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg
841 cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctggccttg
901 acatgtctgg aatcctgtag agatacggga gtgccttcgg gaatcagaac acaggtgctg
961 catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc
1021 cctgtccttt gttgccagca cgtaatggtg ggaactcaag ggagactgcc ggtgataaac
1081 cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acggccaggg ctacacacgt
1141 gctacaatgg cgcgtacaga gggctgcaag ctagcgatag tgagcgaatc ccaaaaagcg
1201 cgtcgtagtc cggatcggag tctgcaactc gactccgtga agtcggaatc gctagtaatc
1261 gcaaatcaga atgttgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacanc
1321 catgggagtg ggttgcacca gaagtagata gcttaacc
Tab. 51: DNA-Sequenz von Aeromonas spec. 156B aus der Datenbank BLAST
Afipia spec. BALT12-S13 16S rRNA gene, isolate BALT12-S13
Acessions-Nr.: FM998728.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Afipia
Origin:
1 catgcaagtc gagcggtccc ttcgggggca gcggcggacg ggtgagtaac gcgtgggaac
61 gtgccctttg gtacggaaca actgagggaa acttcagcta ataccgtatg tgcccttcgg
121 gggaaagatt tatcgccatt ggagcggccc gcgttggatt aggtagttgg tgaggtaaag
181 gctcaccaag cctacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca ctgggactga
241 gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtagggaat cttgcgcaat gggcgaaagc
301 ctgacgcagc catgccgcgt gaatgatgaa ggtcttagga ttgtaaaatt ctttcaccgg
361 ggacgataat gacggtaccc ggagaagaag ccccggctaa cttcgtgcca gcagccgcgg
421 taatacgaag ggggctagcg ttgctcggaa ttactgggcg taaagggagc gtaggcggat
481 agtttagtca gaggtgaaag cccagggctc aaccttggaa ttgcctttga tactggctat
541 cttgagtatg gaagaggtat gtggaactcc gagtgtagag gtgaaattcg tagatattcg
601 gaagaacacc agtggcgaag gcgacatact ggtccattac tgacgctgag gctcgaaagc
136
661 gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat gagtgctagt
721 tgtcggcatg catgcatgtc ggtgacgcag ctaacgcatt aagcactccg cctggggagt
781 acggtcgcaa gattaaaact caaaggaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg
841 tggtttaatt cgaagcaacg cgcagaacct taccaccttt tgacatgccc ggaccaccag
901 agagatctgg ctttcccttc ggggactggg acacagtgct gcatggctgt cgtcagctcg
961 tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcac gagcgcaacc cacgccatta gttgccatca
1021 tttagttggg cactctaatg ggaccg
Tab. 52: DNA-Sequenz von Afipia spec. BALT12-S13 aus der Datenbank BLAST
Afipia spec. sptzw29 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: GU377117.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Afipia
Origin:
1 ttaccatgca gtcgacgggc atcttcggat gctagtggca gacgggtgag taacacgtgg
61 gaacgtacct ttcggttcgg aataatacag ggaaacttgt actaataccg gatacgccct
121 tcgggggaaa gatttatcgc cgatagatcg gcccgcgtct gattagctag ttggtgaggt
181 aatggctcac caaggcgacg atcagtagct ggtctgagag gatgatcagc cacactggga
241 ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatgggcga
301 aagcctgatc cagccatgcc gcgtgtgtga tgaaggcctt agggttgtaa agcacttttg
361 tccgggaaga taatgactgt accggaagaa taagccccgg ctaacttcgt gccagcagcc
421 gcggtaatac gaagggggct agcgttgctc ggaatcactg ggcgtaaagg gcgcgtaggc
481 ggactcttaa gtcgggggtg aaagcccagg gctcaaccct ggaattgcct tcgatactga
541 gagtcttgag ttcggaagag gttggtggaa ctgcgagtgt agaggtgaaa ttcgtagata
601 ttcgcaagaa caccagtggc gaaggcggcc aactggtccg atactgacgc tgaggcgcga
661 aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgaatgc
721 cagccgttgg ggtgcatgca cctcagtggc gcagctaacg ctttaagcat tccgcctggg
781 gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag
841 catgtggttt aattcgaagc aacgcgcaga accttaccag cttttgacat gtccggtttg
901 atcggcagag atgcctttct tcagttcggc tggccggaac acaggtgctg catggctgtc
961 gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcggcaac cctcgcccct
1021 agttgccatc attcagttgg gaactctagg gggactgccg gtgataagcc gcgaggaagg
1081 tggggatgac gtcaagtcct catggccctt acaggctggg ctacacacgt gctacaatgg
1141 cggtgacaat gggcagcgaa ggagcgatcc ggtgctaatc ccaaaaagcc gtctcagttc
1201 agattgcact ctgcaactcg agtgcatgaa ggtggaatcg ctagtaatcg tggatcagca
1261 tgccacggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg
1321 gtttacccga aggcgtcgcg ctaaccgcaa ggaggcaggc gaccacggta ggctcagcga
1381 ctggggtgaa gc
Tab. 53: DNA-Sequenz von Afipia spec. sptzw29 aus der Datenbank BLAST
Arenimonas spec. CH15-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN033774.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Arenimonas
Origin:
1 acggcagcac agcagtagca atactgtggg tggcgagtgg cggacgggtg aggaatacat
61 cggaatctac cttgtcgtgg gggataacgt agggaaactt acgctaatac cgcatacgaa
121 ctatggttga aagcggcgga ccgcaaggcg tcgcgcgatt ggatgagccg atgtccgatt
181 agctagttgg cggggtaaag gcccaccaag gcgacgatcg gtagctggtc tgagaggatg
241 atcagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat
301 attggacaat gggcgcaagc ctgatccagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg
361 ttgtaaagca cttttgttgg ggaagaaaag ccgctggtta atacccggtg gtcatgacgg
421 tacccaaaga ataagcaccg gctaacttcg tgccagcagc cgcggtaata cgaagggtgc
481 aagcgttact cggaattact gggcgtaaag cgtgcgtagg tggttcgtta agtctgtcgt
541 gaaagccccg ggctcaacct gggaatggcg atggatactg gcgggctaga gtgcggtaga
601 ggagagtgga attcccggtg tagcagtgaa atgcgtagag atcgggagga acatcagttg
661 cgaaggcggc tctctggacc agcactgaca ctgaggcacg aaagcgtggg gagcaaacag
721 gattagatac cctggtagtc cacgccctaa acgatgcgaa ctggacgttg ggagcaatta
781 ggctctcagt gtcgaagcta acgcgttaag ttcgccgcct ggggagtacg gtcgcaagac
841 tgaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagtatgtgg tttaattcga
901 tgcaacgcgc agaaccttac ctggccttga catccacgga atccttgaga gatcagggag
961 tgccttcggg aaccgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg
1021 ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtccttag ttgccagcga gtaatgtcgg
1081 gaactctaag gagactgccg gtgacaaacc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc
1141 atggccctta cggccagggc tacacacgta ctacaatggt ggggacagag ggtcgcgaag
1201 ccgcgaggcg gagccaatcc cagaaacccc atcttagtcc ggatcggagt ctgcaactcg
1261 actccgtgaa gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca ttgccgcggt gaatacgttc
1321 ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagttt gttgcaccag aagcaggtag
1381 cttaaccgca aggggggcgc ttgccacggt gtggccgatg actggggtga agtcgtaaa
Tab. 54: DNA-Sequenz von Arenimonas spec. CH15-1 aus der Datenbank BLAST
Arthrobacter oxydans gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: S32219
Acessions-Nr.: AB648980.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Micrococcaceae; Arthrobacter
137
Origin:
1 gagtttgatc ctggctcagg atgaacgctg gcggcgtgct taacacatgc aagtcgaacg
61 atgatgccag cttgctggtg gattagtggc gaacgggtga gtaacacgtg agtaacctgc
121 ccttaactct gggataagcc tgggaaactg ggtctaatac cggatatgac tcctcatcgc
181 atggtggggg gtggaaagct ttattgtggt tttggatgga ctcgcggcct atcagcttgt
241 tggtgaggta atggctcacc aaggcgacga cgggtagccg gcctgagagg gtgaccggcc
301 acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac
361 aatgggcgaa agcctgatgc agcgacgccg cgtgagggat gacggccttc gggttgtaaa
421 cctctttcag tagggaagaa gcgaaagtga cggtacctgc agaagaagcg ccggctaact
481 acgtgccagc agccgcggta atacgtaggg cgcaagcgtt atccggaatt attgggcgta
541 aagagctcgt aggcggtttg tcgcgtctgc cgtgaaagtc cggggctcaa ctccggatct
601 gcggtgggta cgggcagact agagtgatgt aggggagact ggaattcctg gtgtagcggt
661 gaaatgcgca gatatcagga ggaacaccga tggcgaaggc aggtctctgg gcattaactg
721 acgctgagga gcgaaagcat ggggagcgaa caggattaga taccctggta gtccatgccg
781 taaacgttgg gcactaggtg tgggggacat tccacgtttt ccgcgccgta gctaacgcat
841 taagtgcccc gcctggggag tacggccgca aggctaaaac tcaaaggaat tgacgggggc
901 ccgcacaagc ggcggagcat gcggattaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttaccaaggc
961 ttgacatgaa ccggaaayac ctggaaacag gtgccccgct tgcggtcggt ttacaggtgg
1021 tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa
1081 ccctcgttct atgttgccag cgcgttatgg cggggactca taggagactg ccggggtcaa
1141 ctcggaggaa ggtggggacg acgtcaaatc atcatgcccc ttatgtcttg ggcttcacgc
1201 atgctacaat ggccggtaca aagggttgcg atactgtgag gtggagctaa tcccaaaaag
1261 ccggtctcag ttcggattgg ggtctgcaac tcgaccccat gaagtcggag tcgctagtaa
1321 tcgcagatca gcaacgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa
1381 gtcacgaaag ttggtaacac ccgaagccgg tggcctaacc ccttgtggga gggagctgtc
1441 gaaggtggga ctggcgattg ggactaagtc gtaacaaggt agcc
Tab. 55: DNA-Sequenz von Arthrobacter oxydans S32219 aus der Datenbank BLAST
Asellus aquaticus 18S rRNA gene
Acessions-Nr.: AJ287055.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota;
Aselloidea; Asellidae; Asellus
Origin:
1 aacctggttg atcctgccag tagtcatatg cttgtctcaa agattaagcc atgcatgtct
61 cagtacaggc ctttctaagg cgaaaccgcg aatggctcat taaatcagtc atgattcatt
121 ggattaagcc aagaatttac ttggataact gtggtaattc tagagctaat acacgcaact
181 gagctccgac ccggtcgtca gactggggaa gggcgcattt attagatcaa aaaccgatcg
241 gactccggtc cgtctcaaat gagctgtgat gactctgaat aacttagccg agcgctacgg
301 tcttcgtacc ggcgccgtat ctttcaagtg tctgccttat cagctttcga ttgtaggtta
361 tacgcctaca atggctgtaa cgggtaacgg ggaatcaggg ttcgattccg gagagggagc
421 ctgagaaacg gctaccacat ctaaggaagg cagcaggcac gcaaattacc cactcccggc
481 ccggggaggt agtgacgaaa aataacgatg cgggactctt ccgaggcctc gcaatcggaa
541 tgagttcagt ttaaatcctt ggacgaggat ccattggagg gcaagtctgg tgccagcagc
601 cgcggtaatt ccagctccaa tagcgtatat taaagttgct gcggttaaaa agctcgtagt
661 tggatctctg attcggaccg gcggcccact caaggatcgc cctcgctgaa aatggtggat
721 gcttttcgcc cctttcgtgc cgtcgcgaac gtcgcgggtc ctcttcgggg gtcgctcgcg
781 ggttagcttc ggaacaacgc gtccgggacg tgggcgctgc tacaggtggg taagcgatct
841 cggtggttaa ctgaccggct ccggattgaa aatgccgtcg gctcgcacgg ggtgctcttc
901 accgagtgtc ccgcgcggcc gacaagttca ctttgaaaaa attagagtgc tcaaagcagg
961 caacaactca cgcctgaatg gtgttgcatg gaatgatgga acaggacctc ggttctgtcc
1021 ttttcattgg ttttaagaac ccgaggtaat gattaacggg aacagacggg ggcattagta
1081 ttgcgacgct agaggtgaaa ttcttggacc gtcgcaagac taactactgc gaaagcattt
1141 gccaagaatg ttttcattaa tcaagaacga aagttagagg atcgaaggcg atcagatacc
1201 gccctagttc taaccataaa cgatgctaac tggcgatccg tcggcgtcat tcccacgact
1261 cgacggggag cccccgggaa accaaagtct ttgagttccg ggggaagtat ggttgcaaag
1321 ctgaaactta aaggaattga cggaagggca ccaccaggag tggagctgcg gcttaatttg
1381 actcaacacg ggaaacctca ccaggcccgg acaccgaaag gattgacaga ttgagagctc
1441 tttcttgatt cggtgggtgg tggtgcatgg ccgttcttag ttggtggagc gatctgtctg
1501 gttgattccg ataacgaacg agactctacc ctgctaacta gtcggcgaat cgtctcccga
1561 gagggggcct tcccgaggtt aacgcttccc cctcgcccca gcgtcgttgt cggttcgtcg
1621 gcgcgtcgtt tggtaagcga aggatggcgt cctcgcggtt ggttccaact aggggcgttc
1681 gtcgcaacat cttcttagag ggatcagcgg cgtccagccg cacgaaaaag agcaataaca
1741 ggtctgtgat gcccttagat cctctgggcc gcacgcgcgc tacaatgaag ggatcagcgt
1801 gctttccccc tccgaaagga gcgggtaacc cgatgaaacc ccttcccgat tgggattggg
1861 gcttgcaagt gtttcccatg aacgaggaat tcccagtaag cgcaagtcat cagcttgcgt
1921 tgattacgtc cctgcccttt gtacacaccg cccgtcgcta ctaccgattg aatgattcag
1981 tgagggcatc ggactgtcgc cttcggttgt cccgcgctaa cgccacgagc gcctttggct
2041 gacggaaaga tgtccgaact tgatcattta gaggaagtaa aagtcgtaac aaggtttccg
2101 taggtgaacc tgcggaagga tca
Tab. 56: DNA-Sequenz von Asellus aquaticus aus der Datenbank BLAST
Aspergillus spec. han-1 gene for 16S rRNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB713913.1
Taxonomie:
138
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Eurotiomycetes; Eurotiomycetidae; Eurotiales;
Trichocomaceae; mitosporic Trichocomaceae; Aspergillus
Origin:
1 gcactttata ctgtgaaact gcgaatggct cattaaatca gttatcgttt atttgatagt
61 accttactac atggatacct gtggtaattc tagagctaat acatgctaaa aacctcgact
121 tcggaagggg tgtatttatt agataaaaaa ccaatgccct tcggggctcc ttggtgattc
181 ataataactt aacgaatcgc atggccttgc gccggcgatg gttcattcaa atttctgccc
241 tatcaacttt cgatggtagg atagtggcct accatggtgg caacgggtaa cggggaatta
301 gggttcgatt ccggagaggg agcctgagaa acggctacca catccaagga aggcagcagg
361 cgcgcaaatt acccaatccc gacacgggga ggtagtgaca ataaatactg atacggggct
421 cttttgggtc tcgtaattgg aatgagtaca atctaaatcc cttaacgagg aacaattgga
481 gggcaagtct ggtgccagca gccgcggtaa ttccagctcc aatagcgtat attaaagttg
541 ttgcagttaa aaagctcgta gttgaacctt gggtctggct ggccggtccg cctcaccgcg
601 agtactggtc cggctggacc tttccttctg gggaacctca tggccttcac tggctgtggg
661 gggaaccagg acttttactg tgaaaaaatt agagtgttca aagcaggcct ttgctcgaat
721 acattagcat ggaataatag aataggacgt gcggttctat tttgttggtt tctaggaccg
781 ccgtaatgat taatagggat agtcgggggc gtcagtattc agctgtcaga ggtgaaattc
841 ttggatttgc tgaagactaa ctactgcgaa agcattcgcc aaggatgttt tcattaatca
901 gggaacgaaa gttaggggat cgaagacgat cagataccgt cgtagtctta accataaact
961 atgccgacta gggatcgggc ggtgtttcta tgatgacccg ctcggcacct tacgagaaat
1021 caaagttttt gggttctggg gggagtatgg tcgcaaggct gaaacttaaa gaaattgacg
1081 gaagggcacc acaaggcgtg gagcctgcgg cttaatttga ctcaacacgg ggaaactcac
1141 caggtccaga caaaataagg attgacagat tgagagctct ttcttgatct tttggatggt
1201 ggtgcatggc cgttcttagt tggtggagtg atttgtctgc ttaattgcga taacgaacga
1261 gacctcggcc cttaaatagc ccggtccgcg tttgcgggcc gctggct
Tab. 57: DNA-Sequenz von Aspergillus spec. aus der Datenbank BLAST
Bradyrhizobium spec. RS-46 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: FM998034.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Bradyrhizobium
Origin:
1 ggctcagagc gaacgctggc ggcaggctta acacatgcaa gtcgagcggg cgtagcaata
61 cgtcagcggc agacgggtga gtaacgcgtg ggaacgtacc ttttggttcg gaacaacaca
121 gggaaacttg tgctaatacc ggataagccc ttacggggaa agatttatcg ccgaaagatc
181 ggcccgcgtc tgattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcgac gatcagtagc
241 tggtctgaga ggatgatcag ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag
301 gcagcagtgg ggaatattgg acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc cgcgtgagtg
361 atgaaggccc tagggttgta aagctctttt gtgcgggaag ataatgacgg taccgcaaga
421 ataagccccg gctaacttcg tgccagcagc cgcggtaata cgaagggggc tagcgttgct
481 cggaatcact gggcgtaaag ggtgcgtagg cgggtcttta agtcaggggt gaaatcctgg
541 agctcaactc cagaactgcc cttgatactg aggatcttga gttcgggaga ggtgagtgga
601 actgcgagtg tagaggtgaa attcgtagat attcgcaaga acaccagtgg cgaaggcggc
661 tcactggccc gatactgacg ctgaggcacg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac
721 cctggtagtc cacgccgtaa acgatgaatg ccagccgttg gaaagtttac ttttcagtgg
781 cgcagctaac gctttaagca ttccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag
841 gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgacg caacgcgcag
901 aaccttacca gcccttgaca tcccggtcgc ggtttccaga gatggattcc ttcagttcgg
961 ctggaccggt gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta
1021 agtcccgcaa cgagcgcaac ccccgtcctt agttgctacc atttagttga gcactctaag
1081 gagactgccg gtgataagcc gcgaggaagg tggggatgac gtcaagtcct catggccctt
1141 acgggctggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacaat gggacgctaa ggggcaaccc
1201 ttcgcaaatc tcaaaaagcc gtctcagttc ggattgggct ctgcaactcg agcccatgaa
1261 gttggaatcg ctagtaatcg tggatcagca tgccacggtg aatacgttcc cgggccttgt
1321 acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ttttaccgaa gacggtgcgc taaccgaaag
1381 ggggcagccg gccacggta
Tab. 58: DNA-Sequenz von Bradyrhizobium spec. RS-46 aus der Datenbank BLAST
Brevundimonas bullata strain BW56UT1570 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF276904.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Brevundimonas
Origin:
1 ggcctaacac atgcaagtcg aacggaccct tcggggttag tggcggacgg gtgagtaaca
61 cgtgggaacg tgcctttagg ttcggaatag ctcctggaaa cgggtggtaa tgccgaatgt
121 gcccttcggg ggaaagattt atcgccttta gagcggcccg cgtctgatta gctagttggt
181 gaggtaatgg ctcaccaagg cgacgatcag tagctggtct gagaggatga ccagccacat
241 tgggactgag acacggccca aactcctacg ggaggcagca gtggggaatc ttgcgcaatg
301 ggcgaaagcc tgacgcagcc atgccgcgtg aatgatgaag gtcttaggat tgtaaaattc
361 tttcaccggg gacgataatg acggtacccg gagaagaagc cccggctaac ttcgtgccag
421 cagccgcggt aatacgaagg gggctagcgt tgctcggaat tactgggcgt aaagggcgcg
481 taggcggaca tttaagtcag gggtgaaatc ccagagctca actctggaac tgcctttgat
541 actgggtgtc ttgagtgtga gagaggtatg tggaactccg agtgtagagg tgaaattcgt
601 agatattcgg aagaacacca gtggcgaagg cgacatactg gctcattact gacgctgagg
661 cgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg
139
721 attgctagtt gtcgggctgc atgcagttcg gtgacgcagc taacgcatta agcaatccgc
781 ctggggagta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg
841 tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt accacctttt gacatgcctg
901 gaccgccacg gagacgtggc tttctcttcg gagactagga cacaggtgct gcatggctgt
961 cgtcagctcg tgtc
Tab. 59: DNA-Sequenz von Brevundimonas bullata strain BW56UT1570 aus der Datenbank BLAST
Caulobacter vibrioides strain JCT-7 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ675297.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Caulobacter
Origin:
1 gtcgaacgga tccttcggga ttagtggcgg acgggtgagt aacacgtggg aacgtgccct
61 ttggttcgga acaactcagg gaaacttgag ctaataccgg atgtgccctt cgggggaaag
121 atttatcgcc attggagcgg cccgcgtctg attagctagt tggtggggta aaggcccacc
181 aaggcgacga tcagtagctg gtctgagagg atgatcagcc acattgggac tgagacacgg
241 cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatcttgcgc aatgggcgaa agcctgacgc
301 agccatgccg cgtgaatgat gaaggtctta ggattgtaaa attctttcac cggggacgat
361 aatgacggta cccggagaag aagccccggc taacttcgtg ccagcagccg cggtaatacg
421 aagggggcta gcgttgctcg gaattactgg gcgtaaaggg agcgtaggcg gactgttaag
481 ttagaggtga aagcccaggg ctcaaccttg gaattgcctt tgatactggc agtcttgagt
541 acggaagagg tatgtggaac tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaagaac
601 accagtggcg aaggcgacat actggtccgt tactgacgct gaggctcgaa agcgtgggga
661 gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgagtgct agttgtcggc
721 atgcatgcat gtcggtgacg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacggtcg
781 caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta
841 attcgaagca acgcgcagaa ccttaccacc ttttgacatg cctggaccgc cacagagatg
901 tggttttccc ttcggggact gggacat
Tab. 60: DNA-Sequenz von Caulobacter vibrioides JCT-7 aus der Datenbank BLAST
Caulobacter spec. DNA for 16S ribosomal RNA, strain FWC08
Acessions-Nr.: AJ227762.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Caulobacter
Origin:
1 agcgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac ggatccttcg ggattagtgg
61 cggacgggtg agtaacacgt gggaacgtgc cctttggttc ggaacaactc agggaaactt
121 gagctaatac cggatgtgcc cttcggggga aagatttatc gccattggag cggcccgcgt
181 ctgattagct agttggtgag gtaaaggctc accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag
241 aggatgatca gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagtg
301 gggaatcttg cgcaatgggc gaaagcctga cgcagccatg ccgcgtgaat gatgaaggtc
361 ttaggattgt aaaattcttt caccggggac gataatgacg gtacccggag aagaagcccc
421 ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg ctagcgttgc tcggaattac
481 tgggcgtaaa gggagcgtag gcggactgtt tagtcagagg tgaaagccca gggctcaacc
541 ttggaattgc ctttgatact ggcagtcttg agtacggaag aggtatgtgg aactccgagt
601 gtagaggtga aattcgtaga tattcggaag aacaccagtg gcgaaggcga catactggtc
661 cgttactgac gctgaggctc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt
721 ccacgccgta aacgatgagt gctagttgtc ggcatgcatg catgtcggtg acgcagctaa
781 cgcattaagc actccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg
841 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc
901 accttttgac atgcccggac cacctcagag atgaggcttt cccttcgggg actgggacac
961 aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga
1021 gcgcaaccct cgcgattagt tgccatcagg tttggctggg cactctaatc gtactgccgg
1081 agttaatccg gaggaaggcg gggatgacgt caagtcctca tggcccttac aaggtgggct
1141 acacacgtgc tacaatggcg actacagagg gctgcaatcc cgcgaggggg agccaatccc
1201 taaaagtcgt ctcagttcgg attgttctct gcaactcgag agcatgaagt tggaatcgct
1261 agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg
1321 tcacaccatg ggagttggct ttacccgaag gcgctgcgct aactcgcaag agaggcaggc
1381 gaccacggta gggtcagcga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta ggggaacctg
1441 c
Tab. 61: DNA-Sequenz von Caulobacter spec. FWC08 aus der Datenbank BLAST
Caulobacter spec. ECN-2008 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: AM940947.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Caulobacterales; Caulobacteraceae; Caulobacter
Origin:
1 ggcaggccta acacatgcaa gtcgaacgga tccttcggga ttagtggcgg acgggtgagt
61 aacacgtggg aacgtgcctt ttggttcgga acaacgcaga gaaatttgcg ctaataccga
121 atgtgccctt cgggggaaag atttatcgcc attagagcgg cccgcgtctg attagctagt
181 tggtgaggta aaggctcacc aaggctacga tcagtagctg gtctgagagg atgatcagcc
241 acattgggac tgagacacgg cccaaactcc tacgggaggc agcagtgggg aatcttgcgc
301 aatgggcgaa agcctgacgc agccatgccg cgtgaatgat gaaggtctta ggattgtaaa
361 attctttcac cggggacgat aatgacggta cccggagaag aagccccggc taacttcgtg
421 ccagcagccg cggtaatacg aagggggcta gcgttgctcg gaattactgg gcgtaaaggg
140
481 agcgtaggcg gatagtttag tcagaggtga aagcccaggg ctcaaccttg gaattgcctt
541 tgatactggc tatcttgagt ttgggagagg tgagtggaac tccgagtgta gaggtgaaat
601 tcgtagatat tcggaagaac accagtggcg aaggcgactc actggcccaa tactgacgct
661 gaggctcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac
721 gatgagtgct agttgtcggc atgcatgcat gtcggtgacg cagctaacgc attaagcact
781 ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa
841 gcggtggagc atgtggttta attcgaagca acgcgcagaa ccttaccacc ttttgacatg
901 cctggaccgc tgcagagatg cagttttccc ttcggggacc aggacacagg tgctgcatgg
961 ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccacgc
1021 ctttagttgc catcatttag ttgggcactc taaagggacc gccggtggta agccggagga
1081 aggtgtggat gacgtcaagt cctcatggcc cttacagggt gggctacaca cgtgctacaa
1141 tggcgactac agagggttgc aagccagcga tggtgagcca atccctaaaa gtcgtctcag
1201 ttcggattgt tctctgcaac tcgagagcat gaagttggaa tcgctagtaa tcgcggatca
1261 gcatgccgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca ccatgggagt
1321 tggttctacc cgaagcgatg cgctaaccgc aaggaggcag tcgaccacgg tagggtcagc
1381 gactggggt
Tab. 62: DNA-Sequenz von Caulobacter spec. ECN-2008 aus der Datenbank BLAST
Chitinibacter spec. SK16 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN981166.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Chitinibacter
Origin:
1 gctgctgctg ctttaacatg cagtcgaacg gcagcacgga cttcggtctg gtggcgagtg
61 gcgaacgggt gagtaataca tcggaacgta cccagtaatg ggggataact atccgaaagg
121 atagctaata ccgcatacgc cctacggggg aaagaggggg atcgcaagac ctcttgttat
181 tggagcggcc gatggctgat tagctagttg gtagggtaaa ggcctaccaa ggcaacgatc
241 agtagcgggt cttagaggac gatccgccac actggaactg agacacggtc cagactccta
301 cgggaggcag cagtggggaa tcttggacaa tgggcgcaag cctgatccag caatgccgcg
361 tgcgtgaaga aggccttcgg gttgtaaagc gcttttgtca gggagcaaat ccttgtggct
421 aatacccacc ggggatgaga gtacctgaag aataaggacc ggctaactac gtgccagcag
481 ccgcggtaat acgtagggtc caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgtgcgcag
541 gtggtttgtt aagcacgatg tgaaatcccc gagctcaact tgggaattgc attgtgaact
601 ggctaactag agtacggcag aggggggtgg aattccacgt gtagcagtga aatgcgtaga
661 gatgtggagg aacaccgatg gcgaaggcaa ccccctgggc tgatactgac actcatgcac
721 gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtct
781 actagttgtt gggcttttcg gagcttagta acgcagctaa cgcgtgaagt agaccgcctg
841 gggagtacgg tcgcaagact aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg
901 atgatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa aaaccttacc tggtcttgac atgtacggaa
961 tcctttagag atagaggagt gccttcggga accgtaacac aggtgctgca tggctgtcgt
1021 cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgccactagt
1081 tgctaccatt cagttgagca ctttagtggg actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg
1141 gatgacgtca agtcctcatg gcccttatga ccagggcttc acacgtcata caatggtcgg
1201 tacagagggt cgctaacccg cgagggggtg ccaatctcac aaaaccgatc gtagtccgga
1261 ttgcactctg caactcgagt gcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgg atcagcatgt
1321 cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtgggttt
1381 caccagaagt aggtaggcta accgtaagga ggccgcttac cacggtggga ttcatgactg
1441 gggtgaagtc gaacaaggag cgagg
Tab. 63: DNA-Sequenz von Chitinibacter spec. SK16 aus der Datenbank BLAST
Cladosporium spec. 2 FW1PhC3-1 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX273057.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Dothideomycetes; Dothideomycetidae; Capnodiales;
Davidiellaceae; mitosporic Davidiellaceae; Cladosporium
Origin:
1 gtctaagtat aagcaactat acggtgaaac tgcgaatggc tcattaaatc agttatcgtt
61 tatttgatag taccttacta catggataac cgtggtaatt ctagagctaa tacatgctaa
121 aaacctcgac ttcggaaggg gtgtatttat tagataaaaa accaatgccc ttcggggctc
181 cttggtgaat cataataact taacgaatcg catggccttg cgccggcgat ggttcattca
241 aatttctgcc ctatcaactt tcgatggtag gatagtggcc taccatggta tcaacgggta
301 acggggaatt agggttcgac tccggagagg gagcctgaga aacggctacc acatccaagg
361 aaggcagcag gcgcgcaaat tacccaatcc cgacacgggg aggtagtgac aataaatact
421 gatacagggc tcttttgggt cttgtaattg gaatgagtac aatttaaatc ccttaacgag
481 gaacaattgg agggcaagtc tggtgccagc agccgcggta attccagctc caatagcgta
541 tattaaagtt gttgcagtta aaaagctcgt agttgaacct tgggcctggc tggccggtcc
601 gcctcaccgc gtgtactggt ccggccgggc ctttccttct ggggaacctc atgcccttca
661 ctgggcgtgt tggggaacca ggacttttac tttgaaaaaa ttagagtgtt caaagcaggc
721 ctttgctcga atacattagc atggaataat agaataggac gtgtggttct attttgttgg
781 tttctaggac cgccgtaatg attaataggg atagtcgggg gcatcagtat tcaatcgtca
841 gaggtgaaat tcttggattg attgaagact aactactgcg aaagcatttg ccaaggatgt
901 tttcattaat cagtgaacga aagttagggg atcgaagacg atcagatacc gtcgtagtct
961 taaccataaa ctatgccgac tagggatcgg acggtgttag tattttgacc cgttcggcac
1021 cttacgagaa atcaaagttt ttgggttctg gggggagtat ggtcgcaagg ctgaaactta
1081 aagaaattga cggaagggca ccaccaggcg tggagcctgc ggcttaattt gactcaacac
141
1141 ggggaaactc accaggtcca gacacaataa ggattgacag attgagagct ctttcttgat
1201 tttgtgggtg gtggtgcatg gccgttctta gttggtggag tgatttgtct gcttaattgc
1261 gataacgaac gagaccttaa cctgctaaat agccaggccc gctttggcgg gtcgccggct
1321 tcttagaggg actatcggct caagccgatg gaagtttgag gcaataacag gtctgtgatg
1381 cccttagatg ttctgggccg cacgcgcgct acactgacag agccaacgag ttcatttcct
1441 tagccgaaag gtttgggtaa tcttgttaaa ctctgtcgtg ctggggatag agcattgcaa
1501 ttattgctct tcaacgagga atgcctagta agcgcatgtc atcagcatgc gttgattacg
1561 tccctgccct ttgtacacac cgcccgtcgc tactaccgat tgaatggctc ggtgaggcct
1621 tcggactggc ccagggaggt cggcaacgac cacccagggc cggaaagttg gtcaaacccg
1681 gtcatttaga ggaagtaaaa gtcgtaacaa ggt
Tab. 64: DNA-Sequenz von Cladosporium spec. 2 FW1PhC3-1 aus der Datenbank BLAST
Crenothrix polyspora clone 23 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ295890.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Methylococcales; Crenotrichaceae; Crenothrix
Origin:
1 agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggtatgc ttaacacatg caagtcgaac
61 ggtagcaggc cttcgggcgc tgacgagtgg cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctgc
121 ctgttagtgg gggacaacgt gtggaaacgc acgctaatac cgcatacgcc ctacggggga
181 aaggggggga ccttcgggcc tttcgctaac agatgagcct gcgttggatt agctagttgg
241 tagggtaaag gcctaccaag gcgacgatcc atagctggtc tgagaggacg atcagccaca
301 ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat
361 gggcgcaagc ctgatccagc aataccgcgt gtgtgaagaa ggccttaggg ttgtaaagca
421 ctttcaatgg ggaggaaaaa ggcaagccca atacgtttgc ccttgacatt acccatacaa
481 gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgca agcgttaatc
541 ggaattactg ggcgtaaagc gtgcgtaggc ggcctgttaa gtcagatgtg aaagccccgg
601 gcttaacctg ggaactgcat ttgaaactgg caggctagag ttgggtagag gggagtggaa
661 tttcaggtgt agcggtgaaa tgcgtagata tctgaaggaa caccagtggc gaaggcgact
721 ccctggaccc aaactgacgc tgaggcacga aagcgtgggt agcaaacagg attagatacc
781 ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtcgac tagccgttgg gtccttttag ggtttagtgg
841 cgcagctaac gcattaagtc gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat
901 gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag
961 aaccttacct acccttgaca tgtctgaaat ccctgagaga ttggggagtg ccttcgggaa
1021 tcagaacaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc
1081 ccgtaacgag cgcaaccctt gtccttagtt gccagcgcgt aatggcggga actctaggga
1141 gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttatg
1201 ggtagggcta cacacgtgct acaatggccg gtacagaggg ctgcgaactt gcgaaagtaa
1261 gccaatccca gaaagccggt cccagtccgg attggagtct gcaactcgac tccatgaagt
1321 cggaatcgct agtaatcgcg aatcagaatg tcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac
1381 acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagtct aaccgcaagg
1441 agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg tagcc
Tab. 65: DNA-Sequenz von Crenothrix polyspora aus der Datenbank BLAST
Davidiella tassiana strain UFMGCB 3684 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
(anamorph: Cladosporium herbarum)
Acessions-Nr.: HQ533794
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Dothideomycetes; Dothideomycetidae; Capnodiales;
Davidiellaceae; Davidiella
Origin:
1 cgccgggctt ggcctggtta tcataaccct ttgttgtcga ctctgttgct ccggggcgac
61 ctgccttcgg gcgggggctc cgggtggaca cttcaaactc ttgcgtaact ttgcagtctg
121 agtaaactta ttaataaatt aaaactttta acaacggatc tcttggttct ggcatcgatg
181 aagaacgcag cgaaatgcga taagtaatgt gaattgcaga attcagtgaa tcatcgaatc
241 tttgaacgca cattgcgccc cctggtattc cggggggcat gcctgttcga gcgtcatttc
301 accactcaag cctcgcttgg tattgggcaa cgcggtccgc gcgtgctcaa tcgtccggct
361 gggtcttctg t
Tab. 66: DNA-Sequenz von Davidiella tassiana UFMGCB 3684 aus der Datenbank BLAST
Ectothiorhodospira spec. AM4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU252492.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Chromatiales; Ectothiorhodospiraceae; Ectothiorhodospira
Origin:
1 gattagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctggcggc atgcttaaca catgcaagtc
61 gaacggtaac aggccttcgg gcgctgacga gtggcggacg ggtgagtaac gcgtaggaat
121 ctgcctggta gtgggggaca acccggggaa actcgggcta ataccgcata cgccctaagg
181 gggaaagcgg gggctcttcg gacctcgcgc tatcagatga gcctgcgtcc gattagctag
241 ttggtggggt aatggcccac caaggcgacg atcggtagct ggtctgagag gatgatcagc
301 cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga
361 caatgggcgc aagcctgatc cagcaatgcc gcgtgtgtga agaaggcctg cgggttgtaa
421 agcactttca gtggggagga aaagcgggtg cctaatacgt gcctgacttg acgttaccca
481 cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg gtgcaagcgt
541 taatcggaat tactgggcgt aaagcgcacg taggtggtga tgtcagtcag atgtgaaagc
142
601 cctgggctca acctgggaac tgcatctgat actgcatggc tagagtttgg tagaggagag
661 tggaatttcc ggtgtagcgg tgaaatgcgt agatatcgga aggaacacca gtggcgaagg
721 cgactctctg gactaaaact gacactgagg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag
781 ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg agaactagcc gttgggaggg tttaacctct
841 tagtggcgca gcaaacgcgt taagttctcc gcctggggag tacggccgca aggttgaaac
901 tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgatgcaac
961 gcgaagaacc ttacctgccc ttgacatcct cggaatcctg cagagatgtg ggagtgcctt
1021 cgggaaccga gtgacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt
1081 taagtcccgc aacgagcgca acccttgtcc ctagttgcca acactttggg tgggaactct
1141 agggagactg ccggtgacaa accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatggccc
1201 ttatgggcag ggctacacac gtgctacaat ggccagtaca gtgggttgcc aagccgcgag
1261 gtggagctaa tcccaaaaag ctggtcgtag tccggattgg agtctgcaac tcgactccat
1321 gaagtcggaa tcgctagtaa tcgcagatca gcattgctgc ggtgaatacg ttcccgggcc
1381 ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag ttggctgcac cagaagtgga tagtccaacc
1441 ttcgggagga cgttcaccac ggtgtggtca atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc
1501 cgt
Tab. 67: DNA-Sequenz von Ectothiorhodospira spec. AM4 aus der Datenbank BLAST
Enterobacter cloacae strain MS-27 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ038222.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter; Enterobacter
cloacae complex
Origin:
1 ccttgcggca gctacacatg caagtcgaac ggtagcacag agagcttgct ctcgggtgac
61 gagtggcgga cgggtgagta atgtctggga aactgcctga tggaggggga taactactgg
121 aaacggtagc taataccgca taacgtcgca agaccaaaga gggggacctt cgggcctctt
181 gccatcagat gtgcccagat gggattagct agtaggtggg gtaacggctc acctaggcga
241 cgatccctag ctggtctgag aggatgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac
301 tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg
361 ccgcgtgtat gaagaaggcc ttcgggttgt aaagtacttt cagcggggag gaaggtgttg
421 tggttaataa ccgcagcaat tgacgttacc cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc
481 agcagccgcg gtaatacgga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca
541 cgcaggcggt ctgtcaagtc ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcattcg
601 aaactggcag gctagagtct tgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc
661 gtagagatct ggaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca
721 ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga
781 tgtcgacttg gaggttgtgc ccttgaggcg tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac
841 cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag
901 cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctact cttgacatcc
961 agagaactta gcagagatgc tttggtgcct tcgggaactc tgagacaggt gctgcatggc
1021 tgtcgtcagc tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc
1081 ctttgttgcc agcggtccgg ccgggaactc aaaggagact gccagtgata aactggagga
1141 aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgagta gggctacaca cgtgctacaa
1201 tggcgcatac aaagagaagc gaactcgcga gagcaagcgg acctcataaa gtgcgtcgta
1261 gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgtagatc
1321 agaatgctac ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag
1381 tgggttgcaa aagaagtagg tagcttaacc ttcgggaggg cgcttaccac tttggatcag
1441 atg
Tab. 68: DNA-Sequenz von Enterobacter cloacae MS-27 aus der Datenbank BLAST
Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01, complete genome
Acessions-Nr.: CP003737.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter; Enterobacter
cloacae complex
Origin: ‒
Complete genome:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/400173048?report=genbank&log$=nucltop&blast_rank=19&RID=MB9HUZYZ01
4 (Stand: 20.08.2012)
Tab. 69: DNA-Sequenz von Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01 aus der Datenbank BLAST
Enterobacter spec. HWE-103 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ723720.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter
Origin:
1 gggctcagag tgcactgtgg cgacaggcat cacacacaca tctagcgcta tcgcacgaaa
61 actttctctt cgggtgacga gcggcggacg ggtgagtaat gtctgggaaa ctgcctgatg
121 gagggggata actactggaa acggtagcta ataccgcata acgtcgcaag accaaagagg
181 gggaccttcg ggcctcttgc catcagatgt gcccagatgg gattagctag taggtggggt
241 aacggctcac ctaggcgacg atccctagct ggtctgagag gatgaccagc cacactggaa
301 ctgagacacg gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc
361 aagcctgatg cagccatgcc gcgtgtatga agaaggcctt cgggttgtaa agtactttca
421 gcgaggagga aggcattgtg gttaataacc gcagtgattg acgttactcg cagaagaagc
143
481 accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aatacggagg gtgcaagcgt taatcggaat
541 tactgggcgt aaagcgcacg caggcggtct gtcaagtcgg atgtgaaatc cccgggctca
601 acctgggaac tgcattcgaa actggcaggc tagagtcttg tagagggggg tagaattcca
661 ggtgtagcgg tgaaatgcgt agagatctgg aggaataccg gtggcgaagg cggccccctg
721 gacaaagact gacgctcagg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt
781 agtccacgcc gtaaacgatg tcgacttgga ggttgttccc ttgaggagtg gcttccggag
841 ctaacgcgtt aagtcgaccg cctggggagt acggccgcaa ggttaaaact caaatgaatt
901 gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgatgcaacg cgaagaacct
961 tacctactct tgacatccac agaatttagc agagatgctt tagtgccttc gggaaccgtg
1021 agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa atgttgggtt aagtcccgca
1081 acgagcgcaa cccttatcct ttgttgccag cggttcggcc gggaactcaa aggagactgc
1141 cagtgataaa ctggaggaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacgagtagg
1201 gctacacacg tgctacaatg gcgcatacaa agagaagcga cctcgcgaga gcaagcggac
1261 ctcataaagt gcgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact cgactccatg aagtcggaat
1321 cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg
1381 cccgtcacac catgg
Tab. 70: DNA-Sequenz von Enterobacter spec. HWE-103 aus der Datenbank BLAST
Enterobacter spec. S6BB gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB428448.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Enterobacter
Origin:
1 gcctaacaca tgcaagtcga gcggtagcac agagagcttg ctctcgggtg acgagcggcg
61 gacgggtgag taatgtctgg gaaactgcct gatggagggg gataactact ggaaacggta
121 gctaataccg cataacgtcg caagaccaaa gagggggacc ttcgggcctc ttgccatcag
181 atgtgcccag atgggattag ctagtaggtg gggtaatggc tcacctaggc gacgatccct
241 agctggtctg agaggatgac cagccacact ggaactgaga cacggtccag actcctacgg
301 gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcca tgccgcgtgt
361 atgaagaagg ccttcgggtt gtaaagtact ttcagcgagg aggaaggcat tgtggttaat
421 aaccacagtg attgacgtta ctcgcagaag aagcaccggc taactccgtg ccagcagccg
481 cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgcaggcg
541 gtctgtcaag tcggatgtga aatccccggg ctcaacctgg gaactgcatt cgaaactggc
601 aggctagagt cttgtagagg ggggtagaat tccaggtgta gcggtgaaat gcgtagagat
661 ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacaaa gactgacgct caggtgcgaa
721 agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgtcgact
781 tggaggttgt tcccttgagg agtggcttcc ggagctaacg cgttaagtcg accgcctggg
841 gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag
901 catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta ctcttgacat ccagagaact
961 tagcagagat gctttggtgc cttcgggaac tctgagacag gtgctgcatg gctgtcgtca
1021 gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctta tcctttgttg
1081 ccagcggttc ggccgggaac tcaaaggaga ctgccagtga taaactggag gaaggtgggg
1141 atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca cacgtgctac aatggcatat
1201 acaaagagaa gcgacctcgc gagagcaagc ggacctcaca aagtatgtcg tagtccggat
1261 cggagtctgc aactcgactc cgtgaagtcg gaatcgctag taatcgtaga tcagaatgct
1321 acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggttgc
1381 aaaagaagta ggtagcttaa ccttcgggag ggcgcttacc actttgtgat tcatgactgg
1441 ggtgaagtcg taacaaggta gcca
Tab. 71: DNA-Sequenz von Enterobacter spec. S6BB aus der Datenbank BLAST
Enterovibrio spec. 09BSKS-4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HM566000.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales; Vibrionaceae; Enterovibrio
Origin:
1 gagcttgctt ttgaagatga cgagcggcgg acgggtgagt aatggctggg aacctgccct
61 gacgtggggg ataacagttg gaaacgactg ctaataccgc atgatgtcta cggaccaaag
121 agggggatct tcggacctct cgcgtcggga tgggcccagt tgggattagc tagttggtga
181 ggtaatggct caccaaggcg acgatcccta gctggtttga gaggatgatc agccacactg
241 gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg
301 cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttcgggttg taaagcactt
361 tcagcagtga ggaaggttgg tacgttaata gcgtattgat ttgacgttag ctgcagaaga
421 agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcgag cgttaatcgg
481 aattactggg cgtaaagcgc atgcaggcgg tttgttaagc aagatgtgaa agccccgggc
541 tcaacctggg aaccgcattt tgaactggca ggctagagtc ttgtagaggg gggtagaatt
601 tcaggtgtag cggtgaaatg cgtagagatc tgaaggaata ccggtggcga aggcggcccc
661 ctggacaaag actgacgctc agatgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct
721 ggtagtccac gctgtaaacg atgtctactt ggaggttgtg gcctagagcc gtggcttccg
781 gagctaacgc gttaagtaga ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa actcaaatga
841 attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgatgca acgcgaagaa
901 ccttacctac tcttgacatc cacagaattc gctagagata gcttagtgcc ttcgggaact
961 gtgagacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgttgt gaaatgttgg gttaagtccc
1021 gcaacgagcg caacccttat ccttgtttgc cagcgagtaa tgtcgggaac tccagggaga
1081 ctgccggtga taaaccggag gaaggtgggg acgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgag
1141 tagggctaca cacgtgctac aatggcgtat acagagggca gcaagaccgc gaggtggagc
144
1201 gaatcccaga aagtacgtcg tagtccggat cggagtctgc aactcgactc cgtgaagtcg
1261 gaatcgctag taatcgtgga tcagaatgcc acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac
1321 accgcccgtc acaccatggg agtgggctgc accagaag
Tab. 72: DNA-Sequenz von Enterovibrio spec. 09BSKS-4 aus der Datenbank BLAST
Erwinia persicina strain mskrs1ap 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN167937.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Erwinia
Origin:
1 acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct gggaaactgc
61 ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt cttcggacca
121 aagtggggga ccttcgggcc tcacaccatc ggatgtgccc agatgggatt agctagtagg
181 tggggtaatg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg accagccaca
241 ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcacaat
301 gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtatgaagaa ggccttcggg ttgtaaagta
361 ctttcagcgg ggaggaaggc gataaggtta ataaccttgt cgattgacgt tacccgcaga
421 agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat
481 cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcagatgt gaaatccccg
541 ggcttaacct gggaactgca tttgaaactg gcaggctaga gtcttgtaga ggggggtaga
601 attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc
661 cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac
721 cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt
781 ccggagctaa cgcgttaagt cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa
841 tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat gcaacg
Tab. 73: DNA-Sequenz von Erwinia persicina mskrs1ap aus der Datenbank BLAST
Erwinia rhapontici 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: U80206.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Erwinia
Origin:
1 aacacatgca agtcgaacgg tagcacagag gagcttgctc tctgggtgac gagtggcgga
61 cgggtgagta atgcctggga aactgcccga tggaggggga taactactgg aaacggtagc
121 taataccgca taacgtcttc ggaccaaagt gggggacctt cgggcctcac accatcggat
181 gtgcccaggt gggattagct agtaggtggg gtaatggctc acctaggcga cgatccctag
241 ctggtctgag aggatgacca gccacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga
301 ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagccatg ccgcgtgtat
361 gaagaaggcc ttcgggttgt aaagtacttt cagtggggag gaaggcgatg aggttaatag
421 cctcgtcgat tgacgttacc cgcagaagaa gcaccggcta actccgtgcc agcagccgcg
481 gtaatacgga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt
541 ctgtcaagtc ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcattcg aaactggcag
601 actagagtct tgtagagggg ggtagaattc caggtgtagc ggtgaaatgc gtagagatct
661 ggaggaatac cggtggcgaa ggcggccccc tggacaaaga ctgacgctca ggtgcgaaag
721 cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcgacttg
781 gaggttgtgc ccttgaggcg tggcttccgg agctaacgcg ttaagtcgac cgcctgggga
841 gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca
901 tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttacctggc cttgacatcc acggaattcg
961 gcagagatgc cttagtgcct tcgggaaccg tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc
1021 tcgtgttgtg aaatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttatc ctttgttgcc
1081 agcgagtaat gtcgggaact caaaggagac tgccggtgat aaaccggagg aaggtgggga
1141 tgacgtcaag tcatcatggc ccttacggcc agggctacac acgtgctaca atggcgcata
1201 caaagagaag cgacctcgcg agagcaagcg gacctcataa agtgcgtcgt agtccggatc
1261 ggagtctgca actcgactcc gtgaagtcgg aatcgctagt aatcgtagat cagaatgcta
1321 cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca
1381 aaagaagtag gtagcttaac cttcgggagg gcgcttacca ctttgtgatt catgactggg
1441 gtgaagtcgt aacaaggt
Tab. 74: DNA-Sequenz von Erwinia rhapontici aus der Datenbank BLAST
Exiguobacterium undae gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB334767.1
Taxonomie:
Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillales Family XII. Incertae Sedis; Exiguobacterium
Origin:
1 agagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgagc
61 gcaggaagct cacggaactc ttcggaggga agtgaaggga atgagcggcg gacgggtgag
121 taacacgtaa ggaacctgcc ccaaggattg ggataactcc gagaaatcgg agctaatacc
181 gaatagttct tcagaccgca tggtctgatg atgaaaggcg ctncggcgtc accttgggat
241 ggccttgcgg tgcattagct agttggtggg gtaacggctc accaaggcga cgatgcatag
301 ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga
361 ggcagcagta gggaatcttc cacaatggac gaaagtctga tggagcaacg ccgcgtgagt
421 gatgaaggtt ttcggatcgt aaaactctgt tgtaagggaa gaacaagtac gagaggtaat
481 gctcgtacct tgacggtacc ttgcgagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg
541 gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagcgcg cgcaggcggc
601 cttttaagtc tgatgtgaaa gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactggaag
145
661 gcttgagtac agaagagaag agtggaattc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt
721 ggaggaacac cagtggcgaa ggcgactctt tggtctgtaa ctgacgctga ggcgcgaaag
781 cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctag
841 gtgttggggg gtttccgccc ctcagtgctg aagctaacgc attaagcact ccgcctgggg
901 agtacggccg caaggctgaa actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggagc
961 atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccaac tcttgacatc cccttgaccg
1021 cttgagagat caagttttcc cttcggggac aagggtgaca ggtggtgcat ggttgtcgtc
1081 agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atccttagtt
1141 gccagcattt agttgggcac tctagggaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg
1201 atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgag ttgggctaca cacgtgctac aatggacggt
1261 acaaagggca gcgagaccgc gaggtggagc caatcccaga aagccgttcc cagttcggat
1321 tgcaggctgc aactcgcctg catgaagtcg gaatcgctag taatcgcagg tcagcatact
1381 gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccacgag agtttgcaac
1441 acccgaagcc ggtgaggtaa ccgnaaggag ccagccgtcg aaggtggggt agatgattgg
1501 ggtgaagtcg taacaaggta acc
Tab. 75: DNA-Sequenz von Exiguobacterium undae aus der Datenbank BLAST
Flavobacterium denitrificans strain JS14-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU599190.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Origin:
1 tgcaagtcga ggggtagggc acttcggtgc ttgagaccgg cgcacgggtg cgtaacgcgt
61 atgcaatctg cctttcacag agggatagcc cagagaaatt tggattaata cctcatagca
121 ttacgggatg gcatcatcct gcaattaaag tcacaacggt gaaagatgag catgcgtccc
181 attagctagt tggtaaggta acggcttacc aaggcaacga tgggtagggg tcctgagagg
241 gagatccccc acactggtac tgagacacgg accagactcc tacgggaggc agcagtgagg
301 aatattggtc aatgggcgca agcctgaacc agccatgccg cgtgcaggat gacggtccta
361 tggattgtaa actgcttttg tacgggaaga aacactcctt cgtgaaggag cttgacggta
421 ccgtaagaat aaggatcggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gaggatccaa
481 gcgttatccg gaatcattgg gtttaaaggg tccgtaggcg gtctggtaag tcagtggtga
541 aagcccatcg ctcaacggtg gaacggccat tgatactgct ggacttgaat tactgggaag
601 caactagaat atgtagtgta gcggtgaaat gcttagagat tacatggaat accaattgcg
661 aaggcaggtt gctaccagtg gattgacgct gatggacgaa agcgtgggta gcgaacagga
721 ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatggatact agctgttggg agcaatctca
781 gtggctaagc gaaagtgata agtatcccac ctggggagta cgttcgcaag aatgaaactc
841 aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgatacgc
901 gaggaacctt accaaggctt aaatgcagac tgaccgattt ggaaacagat ctttcgcaag
961 acagtttaca aggtgctgca tggttgtcgt cagctcgtgc cgtgaggtgt caggttaagt
1021 cctataacga gcgcaacccc tgttgttagt tgccagcgag tagtgtcggg aactctaaca
1081 agactgccag tgcaaactgt gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca cggcccttac
1141 gccttgggct acacacgtgc tacaatggcc ggtacagaga gcagccacct cgcgaggggg
1201 agcgaatcta taaagccggt cacagttcgg atcggagtct gcaactcgac tccgtgaagc
1261 tggaatcgct agtaatcgga tatcagccat gatccggtga atacgttccc gggccttgta
1321 cacaccgccc gtcaagccat ggaagctggg ggtgcctgaa gtcggtgacc gcaaggagc
Tab. 76: DNA-Sequenz von Flavobacterium denitrificans JS14-1 aus der Datenbank BLAST
Flavobacterium hercynium partial 16S rRNA gene, strain WB 4.2-78
Acessions-Nr.: AM177627.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Origin:
1 tggctcagga tgaacgctag cggcaggctt aacacatgca agtcgagggg tagagtagca
61 atacttgaga ccggcgcacg ggtgcgtaac gcgtatgcaa tctacctttt acagagggat
121 agcccagaga aatttggatt aatacctcat agtattatag aatggcatca ttttataatt
181 aaagtcacaa cggtaaaaga tgagcatgcg tcccattagc tagttggtaa ggtaacggct
241 taccaaggct acgatgggta ggggtcctga gagggagatc ccccacactg gtactgagac
301 acggaccaga ctcctacggg aggcagcagt gaggaatatt ggacaatggg cgcaagcctg
361 atccagccat gccgcgtgca ggatgacggt cctatggatt gtaaactgct tttatacgag
421 aagaaacact acttcgtgaa gtagcttgac ggtatcgtaa gaataaggat cggctaactc
481 cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggat ccaagcgtta tccggaatca ttgggtttaa
541 agggtccgta ggcggtttag taagtcagtg gtgaaagccc atcgctcaac ggtggaacgg
601 ccattgatac tgctgaactt gaattattag gaagtaacta gaatatgtag tgtagcggtg
661 aaatgcttag agattacatg gaataccaat tgcgaaggca ggttactact aattgattga
721 cgctgatgga cgaaagcgtg ggtagcgaac aggattagat accctggtag tccacgccgt
781 aaacgatgga tactagctgt tgggagcaat ctcagtggct aagcgaaagt gataagtatc
841 ccacctgggg agtacgttcg caagaatgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa
901 gcggtggagc atgtggttta attcgatgat acgcgaggaa ccttaccaag gcttaaatgt
961 agtttgaccg atttggaaac agatctttcg caagacaaat tacaaggtgc tgcatggttg
1021 tcgtcagctc gtgccgtgag gtgtcaggtt aagtcctata acgagcgcaa cccctgttgt
1081 tagttgccag cgagtcatgt cgggaactct aacaagactg ccagtgcaaa ctgtgaggaa
1141 ggtggggatg acgtcaaatc atcacggccc ttacgccttg ggctacacac gtgctacaat
1201 ggccggtaca gagagcagcc actgggcgac caggagcgaa tctataaaac cggtcacagt
1261 tcggatcgga gtctgcaact cgactccgtg aagctggaat cgctagtaat cggatatcag
1321 ccatgatccg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaag ccatggaagc
146
1381 tgggggtgcc tgaagtcggt gaccgcaagg agctgcctag ggtaaaactg gtaactaggg
1441 ctaagtcgta acaaggtagc cgtaccggaa ggtgcggctg gatcacctcc t
Tab. 77: DNA-Sequenz von Flavobacterium hercynium WB 4.2-78 aus der Datenbank BLAST
Flavobacterium resistens strain BD-b365 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_044292.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Origin:
1 agagtttgat catggctcag gatgaacgct agcggcaggc ttaacacatg caagtcgagg
61 ggtatagttc ttcggagcta gagaccggcg cacgggtgcg taacgcgtat gcaatctacc
121 tttcacagag ggatagccca gagaaatttg gattaatacc tcatagtatt acgacccggc
181 atcgggatgt aattaaagtc acaacggtga aagatgagca tgcgtcccat tagctagttg
241 gtaaggtaac ggcttaccaa ggcaacgatg ggtaggggtc ctgagaggga gatcccccac
301 actggtactg agacacggac cagactccta cgggaggcag cagtgaggaa tattggtcaa
361 tgggcgcaag cctgaaccag ccatgccgcg tgcaggatga cggtcctatg gattgtaaac
421 tgcttttgta cgagaagaaa caacattacg tgtaatgtct tgacggtatc gtaagaataa
481 ggatcggcta actccgtgcc agcagccgcg gtaatacgga ggatccaagc gttatccgga
541 atcattgggt ttaaagggtc cgtaggcggt ttagtaagtc agtggtgaaa gcccatcgct
601 caacggtgga acggccattg atactgctga acttgaatta ttaggaagta actagaatat
661 gtagtgtagc ggtgaaatgc ttagagatta catggaatac caattgcgaa ggcaggttac
721 tactaatgga ttgacgctga tggacgaaag cgtgggtagc gaacaggatt agataccctg
781 gtagtccacg ccgtaaacga tggatactag ctgttggggg caacttcagt ggctaagcga
841 aagtgataag tatcccacct ggggagtacg ttcgcaagaa tgaaactcaa aggaattgac
901 gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgatacgcga ggaaccttac
961 caaggcttaa atgtagattg accggtttgg aaacagatct ttcgcaagac aatttacaag
1021 gtgctgcatg gttgtcgtca gctcgtgccg tgaggtgtca ggttaagtcc tataacgagc
1081 gcaacccctg ttgttagttg ccagcgagtc atgtcgggaa ctctaacaag actgccagtg
1141 caaactgtga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcacg gcccttacgc cttggggcta
1201 cacacgtgct acaatggccg gtacagagag cagccactgg gtgaccagga gcgaatctac
1261 aaagccggtc acagttcgga tcggagtctg caactcgact ccgtgaagct ggaatcgcta
1321 gtaatcggat atcagccatg atccggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg
1381 tcaagccatg gaagctgggg gtgcctgaag tcggtgaccg caaggagctg cctagggtaa
1441 aactggtaac tagggctaag tcgtaacaag gtaaccgta
Tab. 78: DNA-Sequenz von Flavobacterium resistens BD-b365 aus der Datenbank BLAST
Flavobacterium spec. HME6120 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HM776981.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Origin:
1 cggcagctta ccatgcagtc gaggggtata ggttttcgga cctagagacc ggcgcacggg
61 tgcgtaacgc gtatgcaatc tacctttcac agagggatag cccagagaaa tttggattaa
121 tacctcatag tatatcgagt tggcatcaac atgatattaa agatttatcg gtgaaagatg
181 agcatgcgtc ccattagcta gttggtatgg taacggcata ccaaggctac gatgggtagg
241 ggtcctgaga gggagatccc ccacactggt actgagacac ggaccagact cctacgggag
301 gcagcagtga ggaatattgg acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc cgcgtgcagg
361 atgacggtcc tatggattgt aaactgcttt tatacgagaa gaaacactcc ttcgtgaagg
421 agcttgacgg tatcgtaaga ataaggatcg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata
481 cggaggatcc aagcgttatc cggaatcatt gggtttaaag ggtccgtagg cggtttagta
541 agtcagtggt gaaagcccat cgctcaacgg tggaacggcc attgatactg ctagacttga
601 attattagga agtaactaga atatgtagtg tagcggtgaa atgcttagag attacatgga
661 ataccaattg cgaaggcagg ttactactaa ttgattgacg ctgatggacg aaagcgtggg
721 tagcgaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatggata ctagctgttg
781 ggagcaattt cagtggctaa gcgaaagtga taagtatccc acctggggag tacgaacgca
841 agtttgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat
901 tcgatgatac gcgaggaacc ttaccaaggc ttaaatgtag attgaccggt ttggaaacag
961 acttttcgca agacaattta caaggtgctg catggttgtc gtcagctcgt gccgtgaggt
1021 gtcaggttaa gtcctataac gagcgcaacc cctgttgtta gttgccagcg agtcatgtcg
1081 ggaactctaa cgagactgcc agtgcaaact gtgaggaagg tggggatgac gtcaaatcat
1141 cacggccctt acgccttggg ctacacacgt gctacaatgg ccggtacaga gagcagccac
1201 tgggtgacca ggagcgaatc tacaaaaccg gtcacagttc ggatcggagt ctgcaactcg
1261 actccgtgaa gctggaatcg ctagtaatcg gatatcagcc atgatccggt gaatacgttc
1321 ccgggccttg tacacaccgc ccgtcaagcc atggaagctg ggggtgcctg aagtcggtga
1381 ccgcaaggag ctgcctaggt aa
Tab. 79: DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. HME6120 aus der Datenbank BLAST
Flavobacterium spec. R-36233 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: FR682719.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Origin:
1 gatgaacgct agcggcaggc ttaacacatg caagtcgagg ggtatagtag caatactaga
61 gaccggcgca cgggtgcgta acgcgtatgc aatctacctt tcacagaggg atagcccaga
121 gaaatttgga ttaatacctc atagtattat agaatggcat cattttataa ttaaagtcac
147
181 aacggtgaaa gatgagcatg cgtcccatta gttagttggt aaggtaacgg cttaccaaga
241 ctacgatggg taggggtcct gagagggaga tcccccacac tggtactgag acacggacca
301 gactcctacg ggaggcagca gtgaggaata ttggacaatg ggcgcaagcc tgatccagcc
361 atgccgcgtg caggatgacg gtcctatgga ttgtaaactg cttttgcaca ggaagaaaca
421 acattacgtg taatgtcttg acggtactgt gagaataagg atcggctaac tccgtgccag
481 cagccgcggt aatacggagg atccaagcgt tatccggaat cattgggttt aaagggtccg
541 taggcggtct tataagtcag tggtgaaatc tccccgctca acggggaaac ggccattgat
601 actgtaggac ttgaattatt aggaagtaac tagaatatgt agtgtagcgg tgaaatgctt
661 agagattaca tggaatacca attgcgaagg caggttacta ctaatggatt gacgctgatg
721 gacgaaagcg tgggtagcga acaggattag ataccctggt agtccacgcc gtaaacgatg
781 gatactagct gttgggcgca agttcagtgg ctaagcgaaa gtgataagta tcccacctgg
841 ggagtacgaa cgcaagtttg aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga
901 gcatgtggtt taattcgatg atacgcgagg aaccttacca aggcttaaat gtagattgac
961 cggtttggaa acagactttt cgcaagacaa tttacaaggt gctgcatggt tgtcgtcagc
1021 tcgtgccgtg aggtgtcagg ttaagtccta taacgagcgc aacccctgtt gttagttgcc
1081 agcgagtgaa gtcgggaact ctaacgagac tgccagtgca aactgagagg aaggtgggga
1141 tgacgtcaaa tcatcacggc ccttacgcct tgggctacac acgtgctaca atggccggta
1201 cagagagcag ccactgggcg accaggagcg aatctacaaa accggtcaca gttcggatcg
1261 gagtctgcaa ctcgactccg tgaagctgga atcgctagta atcggatatc agccatgatc
1321 cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca agccatggaa gctgggggtg
1381 cctgaagtcg gtgaccgcaa ggagctgcct agggtaaaac tggtaactag ggctaagtcg
1441 taacaaggta gccgtaccgg aagg
Tab. 80: DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. R-36233 aus der Datenbank BLAST
Flavobacterium spec. R7Sb-3-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ928691.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Origin:
1 tgcagtcgag gggtagggca cttcggtgct tgagaccggc gcacgggtgc gtaacgcgta
61 tgcaatctgc ctttcacaga gggatagccc agagaaattt ggattaatac ctcatagcat
121 tatcggatgg catcatctga taattaaagt cacaacggtg aaagatgagc atgcgtccca
181 ttagctagtt ggtaaggtaa cggcttacca aggcgacgat gggtaggggt cctgagaggg
241 agatccccca cactggtact gagacacgga ccagactcct acgggaggca gcagtgagga
301 atattggtca atgggcgcaa gcctgaacca gccatgccgc gtgcaggatg acggtcctat
361 ggattgtaaa ctgcttttgt acgggaagaa acactccttc gtgaaggagc ttgacggtac
421 cgtaagaata aggatcggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg aggatccaag
481 cgttatccgg aatcattggg tttaaagggt ccgtaggcgg tttgataagt cagtggtgaa
541 agcccatcgc tcaacggtgg aacggccatt gatactgtca aacttgaatt actgggaagt
601 aactagaata tgtagtgtag cggtgaaatg cttagagatt acatggaata ccaattgcga
661 aggcaggtta ctaccggtgg attgacgctg atggacgaaa gcgtgggtag cgaacaggat
721 tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atggatacta gctgttgggc gcaagttcag
781 tggctaagcg aaagtgataa gtatcccacc tggggagtac gaacgcaagt ttgaaactca
841 aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgatacgcg
901 aggaacctta ccaaggctta aatgcagact gaccgatttg gaaacagatc tttcgcaaga
961 cagtttacaa ggtgctgcat ggttgtcgtc agctcgtgcc gtgaggtgtc aggttaagtc
1021 ctataacgag cgcaacccct gttgttagtt gccagcgagt gatgtcggga actctaacaa
1081 gactgccagt gcaaactgtg aggaaggtgg ggatgacgtc aaatcatcac ggcccttacg
1141 ccttgggcta cacacgtgct acaatggccg gtacagagag cagccacctc gcgaggggga
1201 gcgaatctat aaagccggtc acagttcgga tcggagtctg caactcgact ccgtgaagct
1261 ggaatcgcta gtaatcggat atcagccatg atccggtgaa tacgttcccg ggccttgtac
1321 acaccgcccg tcaagccatg gaagctgggg gtgcctgaag tcggtgaccg caa
Tab. 81: DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. R7Sb-3-1 aus der Datenbank BLAST
Flavobacterium spec. 1126-1H-08 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: HE612094.1
Taxonomie:
Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium
Origin:
1 gtttgatcat ggctcaggat gaacgctagc ggcaggctta acacatgcaa gtcgaggggt
61 atatgtcttc ggatatagag accggcgcac gggtgcgtaa cgcgtatgca atctaccttt
121 tacagaggga tagcccagag aaatttggat taatacctca tagtatagct ctaccgcatg
181 gtagtactat taaagtcaca acggtaaaag atgagcatgc gtcccattag ctagttggta
241 aggtaacggc ttaccaaggc aacgatgggt aggggtcctg agagggagat cccccacact
301 ggtactgaga cacggaccag actcctacgg gaggcagcag tgaggaatat tggacaatgg
361 gcgcaagcct gatccagcca tgccgcgtgc aggatgacgg tcctatggat tgtaaactgc
421 ttttgtacga gaagaaacac tgcttcgtga agcagcttga cggtatcgta agaataagga
481 tcggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggagga tccaagcgtt atccggaatc
541 attgggttta aagggtccgt aggcggttta gtaagtcagt ggtgaaagcc catcgctcaa
601 cggtggaacg gccattgata ctgctgaact tgaattatta ggaagtaact agaatatgta
661 gtgtagcggt gaaatgctta gagattacat ggaataccaa ttgcgaaggc aggttactac
721 taattgattg acgctgatgg acgaaagcgt ggggagcgaa caggattaga taccctggta
781 gtccacgccg taaacgatgg atactagctg ttgggagcaa tctcagtggc taagcgaaag
841 tgataagtat cccacctggg gagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg aattgacggg
901 ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatga tacgcgagga accttaccaa
148
961 ggcttaaatg tagattgacc ggtttggaaa cagatctttc gcaagacaat ttacaaggtg
1021 ctgcatggtt gtcgtcagct cgtgccgtga ggtgtcaggt taagtcctat aacgagcgca
1081 acccctgttg ttagttgcca gcgagtcatg tcgggaactc taacaagact gccagtgcaa
1141 actgtgagga aggtggggat gacgtcaaat catcacggcc cttacgcctt gggctacaca
1201 cgtgctacaa tggccggtac agagagcagc cactgggcga ccaggagcga atctataaaa
1261 ccggtcacag ttcggatcgg agtctgcaac tcgactccgt gaagctggaa tcgctagtaa
1321 tcggatatca gccatgatcc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcaa
1381 gccatggaag ctgggggtgc ctgaagtcgg tgaccgcaag gagctgccta gggtaaaaca
1441 ggtaactagg gctaagt
Tab. 82: DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. 1126-1H-08 aus der Datenbank BLAST
Fusarium spec. ZLH-X6 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ934487.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; mitosporic Nectriaceae; Fusarium
Origin:
1 gctattatac agctgaaact gcgaatggct cattatataa gttatcgttt atttgatagt
61 accttactac ttggataacc gtggtaattc tagagctaat acatgctaaa aatcccgact
121 tcggaaggga tgtatttatt agattaaaaa ccaatgccct ccggggctca ctggtgattc
181 atgataactt ctcgaatcgc atggccttgc gccggcgatg gttcattcaa atttcttccc
241 tatcaacttt cgatgtttgg gtattggcca aacatggttg caacgggtaa cggagggtta
301 gggctcgacc ccggagaagg agcctgagaa acggctacta catccaagga aggcagcagg
361 cgcgcaaatt acccaatccc gactcgggga ggtagtgaca ataaatactg atacagggct
421 cttttgggtc ttgtaattgg aatgagtaca atttaaatcc cttaacgagg aacaattgga
481 gggcaagtct ggtgccagca gccgcggtaa ttccagctcc aatagcgtat attaaagttg
541 ttgtggttaa aaagctcgta gttgaacctt gggcctggct ggccggtccg cctcaccgcg
601 tgtactggtc cggccgggcc tttccctctg tggaacccca tgcccttcac tgggtgtggc
661 ggggaaacag gacttttact gtgaaaaaat tagagtgctc caggcaggcc tatgctcgaa
721 tacattagca tggaataata gaataggacg tgtggttcta ttttgttggt ttctaggacc
781 gccgtaatga ttaataggga cagtcggggg catcagtatt caattgtcag aggtgaaatt
841 cttggattta ttgaagacta actactgcga aagcatttgc caaggatgtt ttcattaatc
901 aggaacgaaa gttaggggat cgaagacgat cagataccgt cgtagtctta accataaact
961 atgccgacta gggatcggac gatgttatat tttgactcgt tcggcacctt acgagaaatc
1021 aaagtgcttg ggctccaggg ggagtatggt cgcaaggctg aaacttaaag aaattgacgg
1081 aagggcacca ccaggggtgg agcctgcggc ttaatttgac tcaacacggg gaaactcacc
1141 aggtccagac acaatgagga ttgacagatt gagagctctt tcttgatttt gtgggtggtg
1201 gtgcatggcc gttcttagtt ggtggagtga tttgtctgct taattgcgat aacgaacgag
1261 accttaacct gctaaatagc ccgtattgct tggcagtacg c
Tab. 83: DNA-Sequenz von Fusarium spec. ZLH-X6 aus der Datenbank BLAST
Gaiella occulta strain F2-233 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF423906.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Rubrobacteridae; Gaiellales; Gaiellaceae; Gaiella
Origin:
1 tgagtttgat cctggctcag gacgaacgct ggcggcgcgc ttaacacatg caagtcgagc
61 gagaaccggg acttcggtcc tggggacagc ggcgaacggg tgagtaacac gtgggtaatc
121 tgccctcgat tctgggatag cccggggaaa cccggattaa taccggatag cctttcgagc
181 tccagggccc ggaagaaaag gtagcttcgg cctccgatcg aggatgagcc cgcggtggat
241 tagcttgttg gcggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatc catagctggt ctgagaggac
301 gatcagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa
361 tcttgcgcaa tgggcgaaag cctgacgcag cgacgccgcg tgggggaaga aggccttcgg
421 gttgtaaacc tctttcaggt gggacgaagc cactcgggtg aatagcccag agggtgacgg
481 taccaccaga agaagccccg gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggggc
541 aagcgttgtc cggatttatt gggcgtaaag agcgtgtagg cggccaggta ggtcggttgt
601 gaaaactgga ggctcaacct tcagacgtcg accgaaaccc cctggctaga gtccggaaga
661 ggagaatgga attcctggtg tagcggtgaa atgcgcagat atcaggaaga acacccgtgg
721 cgaaagcggt tctctgggac ggtactgacg ctgagacgcg aaagcgtggg gagcgaacag
781 gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgggtg ctaggtgtgg ggggtgtcga
841 ctccccccgt gccgaagcta acgcattaag caccccgcct ggggagtacg gccgcaaggc
901 taaaactcaa aggaattgac gggggcccgc acaagcagcg gagcatgtgg tttaattcga
961 cgcaacgcga agaaccttac caaggcttga catgcacttg aaaagcgtag aaatacgttc
1021 cctcttcgga gcaagtgcac aggtggtgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt
1081 tgggttaagt cccgcaacga gcgcaacccc tgtcctatgt tgccagcgag tgatgtcggg
1141 gactcatagg agactgccgg tgacaaatcg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca
1201 tgccccttat gtcttgggct acacacgtgc tacattggcc ggtacaaagg gctgcaaacc
1261 tgcgagggtg agcgaatccc aaaaagccgg tcccggttcg gattggaggc tgaaactcgc
1321 ctccatgaag gcggagttgc tagtaatcgc gaatcagcaa cgtcgcggtg aatacgttcc
1381 cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca cgaaagtcgg caatacccga agccggtggg
1441 ctaacccgca agggaggcag ccgtcgaagg tagggtcgat gattggggtg aagtcgtaac
1501 aaggtagccg tagcggaagc tgcggctgga tcacctcctt tcta
Tab. 84: DNA-Sequenz von Gaiella occulta F2-233 aus der Datenbank BLAST
149
Geobacter metallireducens GS-15, complete genome
Acessions-Nr.: CP000148.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Deltaproteobacteria; Desulfuromonadales; Geobacteraceae; Geobacter
Complete genome: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/78192483?report=genbank&log$=nucltop&blast_rank=15&RI
D=MB984R1Z01R (Stand: 13.08.2012)
Tab. 85: DNA-Sequenz von Geobacter metallireducens GS-15 aus der Datenbank BLAST
Gibberella moniliformis p450-4 gene for ent-kaurene oxidase, exons 1-4, strain A-00149
Acessions-Nr.: AM946177.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
Nectriaceae; Gibberella
Origin:
1 aaggcggaca ggtatccggt aagcggcagg gtcggaacag gagagcgcac gagggagctt
61 ccagggggaa acgcctggta tctttatagt cctgtcgggt ttcgccacct ctgacttgag
121 cgtcgatttt tgtgatgctc gtcagggggg cggagcctat ggaaaaacgc cagcaacgcg
181 gcctttttac ggttcctggc cttttgctgg ccttttgctc acatgttctt tcctgcgtta
241 tcccctgatt ctgtggataa ccgtattacc gcctttgagt gagctgatac cgctcgccgc
301 agccgaacga ccgagcgcag cgagtcagtg agcgaggaag cggaagagcg cccaatacgc
361 aaaccgcctc tccccgcgcg ttggccgatt cattaatgca gctggcacga caggtttccc
421 gactggaaag cgggcagtga gcgcaacgca attaatgtga gttagctcac tcattaggca
481 ccccaggctt tacactttat gcttccggct cgtatgttgt gtggaattgt gagcggataa
541 caatttcaca caggaaacag ctatgaccat gattacgcca agcttggtac cgagctcgga
601 tccactagta acggccgcca gtgtgctgga attcgccctt ggctccagcc ttctaatggg
661 ctagtacttg tgttcactaa cagctggttc gtctgtcact gaccctcact gactcacaag
721 cgcatgagca aacagtgccg tttgcgcctc agccacgaga ccggactgcc attggttaat
781 gatttgactt atgccagtgc cagaagattt caagttcact gccaaaagca cagcccttgt
841 tgtcccatct ctctgctttc gacctcccaa gagcctttct ttcctcacca tcttcatttc
901 agaaagctcg cacacaagaa gttcccaaca ttgacgattt tctctcatca tctggacctg
961 caacttaccg tcgtctctca ccagtcacca tcaacaacac tcttaactac tggtcatcgt
1021 ctctgccctc gtccttggcc atctgtcaac cgcgactttc aaatatcgtc aagtgtgtcg
1081 tgattttgac atcaatagta agtagaaagc tctgattctc ttctactaca gtctcaggct
1141 aacctcaata ccgtcagttc acaaaccaca taccgtgtcc ctccattatc ccgcgtcttc
1201 tttcgacaca cctcataatc agagaaccgt gagaggcagg caaaagactt tcgctctcat
1261 catataccga cgcccaagat gacaggtctt gggttactgg atcttcccgt ggagattcta
1321 atcaaaatta tccagttggc gattcctccg atggtcctcc cagtaatgtc ccatgatcca
1381 cttgataccg cttatgagga gagtctacca ttcgaaacaa gctttaccgt cgcccaagag
1441 ctaggatctc tttgggaaat tggccttgtc attgagactg ctccagggtg gtatatcaac
1501 tcttttcagc agtttggccc gtcacaacaa agcaaactcg tagcccacaa tatttctcgt
1561 cccctcctgt caactaccta caccagtctc cattgactcc caccaactat cagcaaaaca
1621 caatgaataa gttcaacagc atgaacaata ccattaatga aacgctgctc cgacagctcg
1681 tctcgggtct tgatgaaata cctctaatgg atattcactg gctaatctac gttgcctttg
1741 gcgcttggtt atgctcatat gtcatccacc tcctttcatc cccttctaca gtcaatgtgc
1801 cttttgtagg ataccgaagc gtctttgagc ctacatggtt tcttcgttta cgttttgtct
1861 gggaaggggg atctatcatc agccaaggct acagtaaagt aagcagtccc ccctacaact
1921 gctcgctgtg tctcatacat ttcagttcaa agactccatc ttccaggtga gaaagcttgg
1981 taccgatatc gtcatcatac cgccaaacta catcgatgaa gtccggaagc tatctcagga
2041 caaaactcgt tcggtcgagc ccttcatcaa tgactttgct ggcgattaca cgcgaggcat
2101 ggtgtttctc caaagtgatc tgcagaaccg tgtgattcag cagcggttga cgccgaagct
2161 cgtgtcgttg actaaggtga tgaaggagga acttgactat gcattgacta aagggatgcc
2221 tgatatgaaa ggtaatactc tcgcagctgc ttgagctggg ttcataaatg ctgataattg
2281 ttagatgacg aatgggttga agccgatatt gcttccatca tggtcaggct catatcacgc
2341 atctcagcca gagtgtttct cggcccagag cactgccgca atcaggaatg gttgacgacc
2401 acagcagagt atagcgagag cctcttcatg actggtttta tcctccgcgt tgttccccat
2461 atcctaagac cattcgtagc tccgttgcta ccatcttaca gaacactact tcgcagcgtg
2521 tcatctggcc gtaaagttat aggtgacatc attcgctccc agcaaggtag tgagaacgag
2581 gacatcctct cgtggatggt agaagctgcg actggggagg agaaacaggt tgacaatatt
2641 gctcagcgga tgcttatcct gagtctcgca tctattcaca ctacggcaat gaccatgacg
2701 catgctatgt atgacttgtg tgctcgccct gagtatacaa agcctcttag agaggaggtc
2761 aaaggcgttg ttggtgctag tggatgggac aagacggcgt tgaatcgact tcataaactc
2821 gacagttttc tcaaagagtc gcaacgtttc aaccccgtgt ttctctgtaa gtctttcttc
2881 accttctgtt tatctggatc ccgactcaac cttccagtaa cattcaatcg catctaccac
2941 caaccaatga cactatcaga cggcaccaat ctcccatcag gcactcgcat tgccgtcccc
3001 tctcacgcga tgcttcagga ctcagcacat gtcccagggc cagcgccacc aactgatttt
3061 gacggattta gatactcaaa gatccgctca gactcaaatt atgcacagaa gtacctcttc
3121 tcaatgactg attctagtaa catggcgttt gggtatggga aatatgcttg ccctgggcgt
3181 ttctatgcat ctaatgaaat gaagctgact ttagcaatcc ttctactaca atttgagttc
3241 aagttgcctg atggaaaggg gagaccacgg aatatcacga ttgatagtga catggtacct
3301 gatccgagag ccaggctgtg cgttaggaag cgatcactga gggaagagta atgagcagta
3361 tgatacatag ggctggaaat agtcctctgg tacagatttt caatttttat cctgatatca
3421 ttctgaatga ttcaaagtga ctttgaagta gttctaggtc atgtctgtca atacgatcta
3481 cactatcctc ccctagatgt cagcgatttc taacttgact caatatcaat caaattagtt
3541 tgttcccaaa tgaaag
Tab. 86: DNA-Sequenz von Gibberella moniliformis A-00149 aus der Datenbank BLAST
150
Haematobacter massiliensis strain H2136 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ342308.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Haematobacter
Origin:
1 aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc gaggacttcg gtcctagcgg
61 cggacgggtg agtaacgcgt gggaacgtgc cctttgcttc ggaatagcct tgggaaactg
121 ggagtaatac cggatgagcc ctttggggga aagatttatc ggcgaaggat cggcccgcgt
181 tggattaggt agttggtggg gtaatggcct accaagccga cgatccatag ctggtttgag
241 aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg
301 gggaatctta gacaatgggg gaaaccctga tctagccatg ccgcgtgagc gatgaaggcc
361 ttagggttgt aaagctcttt cagctgggaa gataatgacg gtaccagcag aagaagcccc
421 ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg ctagcgttgt tcggaattac
481 tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggattgga aagtcagagg tgaaatccca gggctcaacc
541 ctggaactgc ctttgaaact cccagtcttg aggtcgagag aggtgagtgg aattccgagt
601 gtagaggtga aattcgtaga tattcggagg aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggct
661 cgatactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt
721 ccacgccgta aacgatgaat gccagtcgtc gggtagcatg ctattcggtg acacacctaa
781 cggattaagc attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg
841 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc
901 aacccttgac atggggatcg cggttacgag agatcgtttc cttcagttcg gctggatccc
961 acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttcggtt aagtccggca
1021 acgagcgcaa cccacactct tagttgccag cattcagttg ggcactctag gagaactgcc
1081 gatgataagt cggaggaagg tgtggatgac gtcaagtcct catggccctt acgggttggg
1141 ctacacacgt gctacaatgg tagtgacaat gggttaatcc ccaaaagcta tctcagttcg
1201 gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgc gtaacagcac
1261 gacgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagttggg
1321 tttacccgaa ggcggtgcgc caaccagcaa tggaggcagc cgaccacggt gagctcagcg
1381 actggggtg
Tab. 87: DNA-Sequenz von Haematobacter massiliensis H2136 aus der Datenbank BLAST
Hyphomicrobium facile subsp. tolerans strain IFAM I-551 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_027611.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
Origin:
1 gaacgctggc ggcaggctta acacatgcaa gtcgaacgcc ccgcaagggg agtggcagac
61 gggtgagtaa cacgtgggaa ccttccctat agtacggaat agcccaggga aacttggagt
121 aataccgtat acgcccgaaa ggggaaagaa ttttcgctat aggatgggcc cgcgtaggat
181 tagctagttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc cttagctggt ttgagagaac
241 gaccagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa
301 tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgagtgatga aggccttagg
361 gttgtaaagc tcttttgccg gggacgataa tgacggtacc cggagaataa gtcccggcta
421 acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa ggggactagc gttgttcgga atcactgggc
481 gtaaagcgca cgtaggcgga tttgtaagtc aggggtgaaa tcccggggct caacctcgga
541 actgcctttg atactgcgaa tcttgagtcc gatagaggtg ggtggaattc ctagtgtaga
601 ggtgaaattc gtagatatta ggaagaacac cggtggcgaa ggcggcccac tggatcggta
661 ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg
721 ccgtaaacga tggatgctag ccgtcggata gcttgctatt cggtggcgca gctaacgcat
781 taagcatccc gcctggggag tacggccgca aggttaaaac tcaaaggaat tgacgggggc
841 ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc ttaccagctc
901 ttgacattca ctgatcgcct ggagagatcc gggaattcca gcaatggaca gtgggacagg
961 tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg
1021 caaccctcgc cattagttgc catcatttag ttgggcactc tagtgggact gccggtgata
1081 agccggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgggct gggctacaca
1141 cgtgctacaa tggcggtgac aatgcgcagc cacctagcaa tagggagcta atcgcaaaaa
1201 gccgtctcag ttcagattga ggtctgcaac tcgacctcat gaagtcggaa tcgctagtaa
1261 tcgcgcatca gcatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca
1321 ccatgggagt tggtcttacc ctaaaacggt gcgctaaccg caaggaggca gccggccacg
1381 gtaaggtcag cgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gta
Tab. 88: DNA-Sequenz von Hyphomicrobium facile subsp. tolerans IFAM I-551 a. d. Datenbank BLAST
Hyphomicrobium vulgare gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB543807.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
Origin:
1 aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac gctgtagcaa tacagagtgg
61 cagacgggtg agtaacacgt gggaatcttc ctatcggtac ggaatagctc agggaaactt
121 ggggtaatac cgcatacgcc cttcggggga aagatttatc gccgatagat gagcccgcgt
181 ctgattagct agttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag
241 aggatgacca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg
301 gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgagt gacgaaggtc
361 ttcggattgt aaagctcttt tggcggggac gataatgacg gtacccgcag aataagcccc
421 ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg ctagcgttgt tcggaattac
151
481 tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggatttgt aagtcagggg tgaaatcccg gggctcaacc
541 tcggaactgc ctttgatact gcaagtcttg agtccggaag aggtgagtgg aattcctagt
601 gtagaggtga aattcgtaga tattaggaag aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggtc
661 cggtactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt
721 ccacgccgta aactatggat gctagccgtc ggcaagcttg cttgtcggtg gcgcagctaa
781 cgctttaagc atcccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa ggaattgacg
841 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgac gcaacgcgaa gaaccttacc
901 agctcttgac atgtcaggtc ggtttccaga gatggattcc tcccagcaat gggcctgaac
961 acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac
1021 gagcgcaacc ctcgccatta gttgccatca ttcagttggg cactctagtg ggactgccgg
1081 tgataagccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca tggcccttac gggctgggct
1141 acacacgtgc tacaatggcg gtgacaatgg gcagcaacac agcaatgtga agctaatctc
1201 aaaaagccgt ctcagttcgg attgggctct gcaactcgag cccatgaagt tggaatcgct
1261 agtaatcgcg catcagcacg gcgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg
1321 tcacaccatg ggagttggct ttacccgaag acggtgcgct aaccgcaagg aggcagccgg
1381 ccacggtaag gtcagcgact ggggtg
Tab. 89: DNA-Sequenz von Hyphomicrobium vulgare aus der Datenbank BLAST
Hyphomicrobium spec. KC-IT-W2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ711209.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Hyphomicrobium
Origin:
1 ctcagaacga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt cgaacgctgt agcaatacag
61 agtggcagac gggtgagtaa cacgtgggaa tcttcctatc ggtacggaat agctcaggga
121 aacttggggt aataccgcat acgcccttcg ggggaaagat ttatcgccga tagatgagcc
181 cgcgtctgat tagctagttg gtgaggtaac ggctcaccaa ggcgacgatc agtagctggt
241 ctgagaggat gatcagccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag
301 cagtggggaa tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgagtgacga
361 aggtcttcgg attgtaaagc tcttttggcg gggacgataa tgacggtacc cgcagaataa
421 gccccggcta acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa gggggctagc gttgttcgga
481 attactgggc gtaaagcgca cgtaggcgga tttgttagtc aggggtgaaa tcccggggct
541 caacctcgga actgcctttg atactgcaag tctcgagtcc ggaagaggtg agtggaattc
601 ctagtgtaga ggtgaaattc gtagatatta ggaagaacac cagtggcgaa ggcggctcac
661 tggtccggta ctgacgctga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg
721 gtagtccacg ccgtaaacta tggatgctag ccgtcggcaa gcttgcttgt cggtggcgca
781 gctaacgctt taagcatccc gcctggggag tacggccgca aggttaaaac tcaaaggaat
841 tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat tcgacgcaac gcgaagaacc
901 ttaccagctc ttgacatgtc aggtcggttt ccagagatgg gatcctccca gcaatgggtc
961 tgaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc
1021 gcaacgagcg caaccctcgc cattagttgc catcattcag ttgggcactc tagtgggact
1081 gccggtgata agccggagga aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacgggct
1141 gggctacaca cgtgctacaa tggcggtgac aatgggcagc aacacagcaa tgtgaagcta
1201 atctcaaaaa gccgtctcag ttcggattgg gctctgcaac tcgagcccat gaagttggaa
1261 tcgctagtaa tcgcgcatca gcatggcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc
1321 gcccgtcaca ccatgggagt tggctttacc cgaagacggt gcgctaaccg caaggaggca
1381 gccggccacg gtaaggtcag cgactggggt gaagtcgtaa caa
Tab. 90: DNA-Sequenz von Hyphomicrobium spec. KC-IT-W2 aus der Datenbank BLAST
Methylobacterium zatmanii strain DSM 5688 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_041031.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Methylobacteriaceae; Methylobacterium
Origin:
1 cgaacgctgg cggcaggctt aacacatgca agtcgaacgg gcaccttcgg gtgtcagtgg
61 cagacgggtg agtaacacgt gggaacgtgc ccttcggttc ggaataactc agggaaactt
121 gagctaatac cggatacgcc cttctgggga aaggtttact gccgaaggat cggcccgcgt
181 ctgattagct tgttggtggg gtaacggcct accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag
241 aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg
301 gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagccatg ccgcgtgagt gatgaaggcc
361 ttagggttgt aaagctcttt tgtccgggac gataatgacg gtaccggaag aataagcccc
421 ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg ctagcgttgc tcggaatcac
481 tgggcgtaaa gggcgcgtag gcggccgatt aagtcggggg tgaaagcctg tggctcaacc
541 acagaattgc cttcgatact ggttggcttg agaccggaag aggacagcgg aactgcgagt
601 gtagaggtga aattcgtaga tattcgcaag aacaccagtg gcgaaggcgg ctgtctggtc
661 cggttctgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt
721 ccacgccgta aacgatgaat gccagccgtt ggcctgcttg caggtcagtg gcgccgctaa
781 cgcattaagc attccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg
841 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc
901 atcccttgac atggcatgtt acctcgggag accggggatc ctcttcggag gcgtgcacac
961 aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga
1021 gcgcaaccca cgtccttagt tgccatcatt cagttgggca ctctagggag actgccggtg
1081 ataagccgcg aggaaggtgt ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttacg ggatgggcta
1141 cacacgtgct acaatggcgg tgacagtggg acgcgaaacc gcgaggtcga gcaaatcccc
1201 aaaaaccgtc tcagttcgga ttgcactctg caactcgggt gcatgaaggc ggaatcgcta
152
1261 gtaatcgtgg atcagcacgc cacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt
1321 cacaccatgg gagttggtct tacccgacgg cgctgcgcca accgcaagga ggcaggcgac
1381 cacggtaggg tcagcgactg gggtgaagtc gtaacaaggt agccgtaggg gaacc
Tab. 91: DNA-Sequenz von Methylobacterium zatmanii strain DSM 5688 aus der Datenbank BLAST
Methylocapsa aurea partial 16S rRNA gene, type strain KYGT
Acessions-Nr.: FN433469.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Beijerinckiaceae; Methylocapsa
Origin:
1 aacgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac gccgtagcaa tacggagtgg
61 cagacgggtg agtaacacgt gggaacatac ccttcggttc ggaataactc agggaaactt
121 gtgctaatac cggatacgtc cgcaaggaga aagatttatc gccgaaggat tggcccgcgt
181 ctgattagct tgttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgatcagtag ctggtctgag
241 aggatgatca gccacattgg gactgagaca cggcccaaac tcctacggga ggcagcagtg
301 gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagccatg ccgcgtgagt gatgaaggcc
361 ttagggttgt aaagctcttt tacctgggaa gataatgacg gtaccaggag aataagcccc
421 ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaaggggg ctagcgttgt tcggatttac
481 tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggatcttt aagtcagggg tgaaatcccg gggctcaacc
541 tcggaactgc ctttgatact ggagatcttg agtccgggag aggtgagtgg aactgcgagt
601 gtagaggtga aattcgtaga tattcgcaag aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggcc
661 cggtactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt
721 ccacgccgta aacgatggat gctagccgtt aggcagcttg ctgcttagtg gcgcagttaa
781 cgctttaagc atcccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg
841 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc
901 agctcttgac atgtctcgtt tggttaccag agatggtttc cttcacttcg ggtggcgaga
961 acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca
1021 acgagcgcaa ccctcgccct tagttgccat catttagttg ggcactctag ggggactgcc
1081 ggtgataagc cgagaggaag gtggggatga cgtcaagtcc tcatggccct tacgggctgg
1141 gctacacacg tgctacaatg gcggtgacag tgggacgcga aggggtgacc ccgagcaaat
1201 ctcaaaaagc cgtctcagtt cggattgcac tctgcaactc gagtgcatga aggtggaatc
1261 gctagtaatc gtagatcaga acgctacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc
1321 ccgtcacacc atgggagttg gttctacccg aaggcgtttt gctaaccgca aggaggcagg
1381 cgaccacggt agggtcagcg actggggtg
Tab. 92: DNA-Sequenz von Methylocapsa aurea KYGT aus der Datenbank BLAST
Methylocystis echinoides partial 16S rRNA gene, strain 2
Acessions-Nr.: AJ458502.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Methylocystaceae; Methylocystis
Origin:
1 acgaacgctg gcggcaggcc taacacatgc aagtcgaacg ccctagcaat agggagtggc
61 agacgggtga gtaacgcgtg ggaacgtacc cttcggtctg gaataaccca gggaaacttg
121 ggctaatacc ggatacgtgc gagagcagaa agatttatcg ccgaaggatc ggcccgcgtc
181 cgattagcta gttggtgagg taaaagctca ccaaggcgac gatcggtagc tggtctgaga
241 ggatgatcag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg
301 ggaatattgg acaatgggcg aaagcctgat ccagccatgc cgcgtgagtg atgaaggccc
361 tagggttgta aagctctttc gccagggacg ataatgacgg tacctggata agaagccccg
421 gctaacttcg tgccagcagc cgcggtaata cgaagggggc tagcgttgtt cggatttact
481 gggcgtaaag cgcacgtagg cggattttta agtcaggggt gaaatcccaa ggctcaacct
541 tggaactgcc tttgatactg gaagtctcga gtccgggaga ggtgagtgga actgcgagtg
601 tagaggtgaa attcgtagat attcgcaaga acaccagtgg cgaaggcggc tcactggccc
661 ggtactgacg ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc
721 cacgccgtaa actatggatg ctagccgttg ggcagcttgc tgttcagtgg cgcagctaac
781 gctttaagca tcccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta aaactcaaag gaattgacgg
841 gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgcag aaccttacca
901 gcttttgaca tgcccggtat gatcgccaga gatggctttc ttcccgcaag gggccggtgc
961 acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac
1021 gagcgcaacc ctcgccctta gttgccatca ttaagttggg cactctaggg ggactgccgg
1081 tgataagccg cgaggaaggt ggggatgacg tcaagtcctc atggccctta caggctgggc
1141 tacacacgtg ctacaatggc ggtgacaatg ggatgcggaa gggcgacctc gagcaaatct
1201 caaaaagccg tctcagttcg gattgcactc tgcaactcga gtgcatgaag gtggaatcgc
1261 tagtaatcgc agatcagcac gctgcggtga atacgttccc gggccttgta cacaccgccc
1321 gtcacaccat gggagttggt tttacccgaa ggcgtttcgc caaccgcaag gaggcaggcg
1381 accacggtag ggt
Tab. 93: DNA-Sequenz von Methylocystis echinoides 2 aus der Datenbank BLAST
Methylosinus trichosporium 16S rRNA gene, strain KS21
Acessions-Nr.: AJ431385.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Methylocystaceae; Methylosinus
Origin:
1 gaacgctggc ggcaggctta acacatgcaa gtcgaacgcc ccgcaagggg agtggcagac
61 gggtgagtaa cgcgtgggaa cgtgcccttc ggttcggaat aactcaggga aacttgagct
121 aataccggat acgtgcgaga gcagaaagat ttatcgccga aggatcggcc cgcgtccgat
153
181 tagctagttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc ggtagctggt ctgagaggat
241 gatcagccac attgggactg agacacggcc caaactccta cgggaggcag cagtggggaa
301 tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgagtgatga aggccctagg
361 gttgtaaagc tctttcgcca gggacgataa tgacggtacc tggataagaa gccccggcta
421 acttcgtgcc agcagccgcg gtaatacgaa gggggctagc gttgttcgga atcactgggc
481 gtaaagcgca cgtaggcgga tctttaagtc aggggtgaaa tcccgaggct caacctcgga
541 actgcctttg atactggagg tctcgagtcc gggagaggtg agtggaactt gcgagtgtag
601 aggtgaaatt cgtagatatt cgcaagaaca ccagtggcga aggcggctca ctggcccgga
661 actgacgctg aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac
721 gccgtaaacg atggatgcta gccgttgggg agcttgctct tcagtggcgc agctaacgct
781 ttaagcatcc cgcctgggga gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg
841 cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgcagaac cttaccagct
901 tttgacatgt ccagtatggt cgccagagat ggcttccttc ccgcaagggg ctggaacaca
961 ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag
1021 cgcaaccctc gcccttagtt gccatcattc agttgggcac tctaggggga ctgccggtga
1081 taagccgcga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg gcccttacag gctgggctac
1141 acacgtgcta caatggcggt gacaatggga tgctaagggg cgaccctgcg caaatctcaa
1201 aaagccgtct cagttcggat tgcactctgc aactcgagtg catgaaggtg gaatcgctag
1261 taatcgcaga tcagcacgct gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc
1321 acaccatggg agttggcttt acccgaaggc gtttcgctaa ccgcaaggag gcagacgacc
1381 acggtagggt cagcgactgg ggtg
Tab. 94: DNA-Sequenz von Methylosinus trichosporium KS21 aus der Datenbank BLAST
Microbacterium lacus partial 16S rRNA gene, strain R-43968
Acessions-Nr.: FR691402.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Origin:
1 gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaaagag agcttgctct
61 ctggatcagt ggcgaacggg tgagtaacac gtgagcaatc tgcccctgac tctgggataa
121 gcgctggaaa cggcgtctaa taccggatac gagctgcgaa ggcatcttca gcagctggaa
181 agaacttcgg tcagggatga gctcgcggcc tatcagctag ttggtgaggt aatggctcac
241 caaggcgtcg acgggtagcc ggcctgagag ggtgaccggc cacactggga ctgagacacg
301 gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca caatgggcgc aagcctgatg
361 cagcaacgcc gcgtgaggga cgacggcctt cgggttgtaa acctctttta gcagggaaga
421 agcgaaagtg acggtacctg cagaaaaagc accggctaac tacgtgccag cagccgcggt
481 aatacgtagg gtgcaagcgt tatccggaat tattgggcgt aaagagctcg taggcggttt
541 gtcgcgtctg ctgtgaaaac tgggggctca acccccagcc tgcagtgggt acgggcagac
601 tagagtgcgg taggggagat tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg
661 aggaacaccg atggcgaagg cagatctctg ggccgtaact gacgctgagg agcgaaaggg
721 tggggagcaa acaggcttag ataccctggt agtccacccc gtaaacgttg ggaactagtt
781 gtggggtcca ttccacggat tccgtgacgc agctaacgca ttaagttccc cgcctgggga
841 gtacggccgc aaggctaaaa ctcaaaggaa ttgacgggga cccgcacaag cggcggagca
901 tgcggattaa ttcgatgcaa cgcgaagaac cttaccaagg cttgacatat acgagaacgg
961 gccagaaatg gtcaactctt tggacactcg taaacaggtg gtgcatggtt gtcgtcagct
1021 cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca accctcgttc tatgttgcca
1081 gcacgtaatg gtgggaactc atgggatact gccggggtca actcggagga aggtggggat
1141 gacgtcaaat catcatgccc cttatgtctt gggcttcacg catgctacaa tggccggtac
1201 aaagggctgc aataccgtaa ggtggagcga atcccaaaaa gccggtccca gttcggattg
1261 aggtctgcaa ctcgacctca tgaagtcgga gtcgctagta atcgcagatc agcaacgctg
1321 cggtgaatac gttcccgggt cttgtacaca ccgcccgtca agtcatgaaa gtcggtaaca
1381 cctgaagccg gtggcccaac ccttgtggag ggagccgtcg aaggtgggat cggtaattag
1441 gactaagtcg taacaaggta gccgtaccgg aagg
Tab. 95: DNA-Sequenz von Microbacterium lacus R-43968 aus der Datenbank BLAST
Microbacterium oxydans strain IARI-K-83 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN411364.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Origin:
1 gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagcaa cctgcccctg actctgggat aagcgctgga
61 aacggcgtct aatactggat atgtgacgtg accgcatggt ctgcgtctgg aaagaatttc
121 ggttggggat gggctcgcgg cctatcagct tgttggtgag gtaatggctc accaaggcgt
181 cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg gccacactgg gactgagaca cggcccagac
241 tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gcaagcctga tgcagcaacg
301 ccgcgtgagg gacgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt tagcagggaa gaagcgaaag
361 tgacggtacc tgcagaaaaa gcgccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta
421 gggcgcaagc gttatccgga attattgggc gtaaagagct cgtaggcggt ttgtcgcgtc
481 tgctgtgaaa tccggaggct caacctccgg cctgcagtgg gtacgggcag actagagtgc
541 ggtaggggag attggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca ggaggaacac
601 cgatggcgaa ggcagatctc tgggccgtaa ctgacgctga ggagcgaaag ggtggggagc
661 aaacaggctt agataccctg gtagtccacc ccgtaaacgt tgggaactag ttgtggggtc
721 cattccacgg attccgtgac gcagctaacg cattaagttc cccgcctggg gagtacggcc
781 gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg gacccgcaca agcggcggag catgcggatt
841 aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat atacgagaac gggccagaaa
154
901 tggtcaactc tttggacact cgtaaacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt
961 gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcgt tctatgttgc cagcacgtaa
1021 tggtgggaac tcatgggata ctgccggggt caactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa
1081 atcatcatgc cccttatgtc ttgggcttca cgcatgctac aatggccggt acaaagggct
1141 gcaataccgc gaggtggagc gaatcccaaa aagccggtcc cagttcggat tgaggtctgc
1201 aactcgacct catgaagtcg gagtcgctag taatcgcaga tcagcaacga tgcggtgaat
1261 acgttcccgg gtcttgtaca caccgcccgt cttttcatga aa
Tab. 96: DNA-Sequenz von Microbacterium oxydans IARI-K-83 aus der Datenbank BLAST
Microbacterium oxydans strain O-5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ890539.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Origin:
1 cggtgaacac ggagcttgct ctgtgggatc agtggcgaac gggtgagtaa cacgtgagca
61 acctgcccct gactctggga taagcgctgg aaacggcgtc taatactgga tatgtgacgt
121 gaccgcatgg tctgcgtctg gaaagaattt cggttgggga tgggctcgcg gcctatcagc
181 ttgttggtga ggtaatggct caccaaggcg tcgacgggta gccggcctga gagggtgacc
241 ggccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt
301 gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcaac gccgcgtgag ggacgacggc cttcgggttg
361 taaacctctt ttagcaggga agaagcgaaa gtgacggtac ctgcagaaaa agcgccggct
421 aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggcgcaag cgttatccgg aattattggg
481 cgtaaagagc tcgtaggcgg tttgtcgcgt ctgctgtgaa atccggaggc tcaacctccg
541 gcctgcagtg ggtacgggca gactagagtg cggtagggga gattggaatt cctggtgtag
601 cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca ccgatggcga aggcagatct ctgggccgta
661 actgacgctg aggagcgaaa gggtggggag caaacaggct tagataccct ggtagtccac
721 cccgtaaacg ttgggaacta gttgtggggt ccattccacg gattccgtga cgcagctaac
781 gcattaagtt ccccgcctgg ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg
841 ggacccgcac aagcggcgga gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca
901 aggcttgaca tatacgagaa cgggccagaa atggtcaact ctttggacac tcgtaaacag
961 gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc
1021 gcaaccctcg ttctatgttg ccagcacgta atggtgggaa ctcatgggat actgccgggg
1081 tcaactcgga ggaaggtggg gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc
1141 acgcatgcta caatggccgg tacaaagggc tgcaataccg cgaggtggag cgaatcccaa
1201 aaagccggtc ccagttcgga ttgaggtctg caactcgacc tcatgaagtc ggagtcgcta
1261 gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg
1321 tcaagtcatg aaagtcggta acacctgaag ccggtggcct aacc
Tab. 97: DNA-Sequenz von Microbacterium oxydans strain O-5 aus der Datenbank BLAST
Microbacterium paraoxydans strain 3200 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EU714356.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Microbacteriaceae; Microbacterium
Origin:
1 gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac ggtgaacacg gagcttgctc
61 tgtgggatca gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagcaa cctgcccctg actctgggat
121 aagcgctgga aacggcgtct aatactggat atgtgacgtg accgcatggt ctgcgtttgg
181 aaagattttt cggttgggga tgggctcgcg gcctatcagc ttgttggtga ggtaatggct
241 caccaaggcg tcgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagac
301 acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg
361 atgcagcaac gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg taaacctctt ttagcaggga
421 agaagcgaaa gtgacggtac ctgcagaaaa agcgccggct aactacgtgc cagcagccgc
481 ggtaatacgt agggcgcaag cgttatccgg aattattggg cgtaaagagc tcgtaggcgg
541 tttgtcgcgt ctgctgtgaa atcccgaggc tcaacctcgg gcctgcagtg ggtacgggca
601 gactagagtg cggtagggga gattggaatt cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc
661 aggaggaaca ccgatggcga aggcagatct ctgggccgta actgacgctg aggagcgaaa
721 gggtggggag caaacaggct tagataccct ggtagtccac cccgtaaacg ttgggaacta
781 gttgtggggt ccattccacg gattccgtga cgcagctaac gcattaagtt ccccgcctgg
841 ggagtacggc cgcaaggcta aaactcaaag gaattgacgg ggacccgcac aagcggcgga
901 gcatgcggat taattcgatg caacgcgaag aaccttacca aggcttgaca tatacgagaa
961 cgggccagaa atggtcaact ctttggacac tcgtaaacag gtggtgcatg gttgtcgtca
1021 gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg ttctatgttg
1081 ccagcacgta atggtgggaa ctcatgggat actgccgggg tcaactcgga ggaaggtggg
1141 gatgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg
1201 tacaaagggc tgcaataccg tgaggtggag cgaatcccaa aaagccggtc ccagttcgga
1261 ttgaggtctg caactcgacc tcatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg
1321 ctgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcaagtcatg aaagtcggta
1381 acacctgaag ccggtggcct aacccttgtg gagggagctg tcgaaggtgg gatcggtaat
1441 taggactaag tcgtaacaag gtagccgtac cggaagg
Tab. 98: DNA-Sequenz von Microbacterium paraoxydans 3200 aus der Datenbank BLAST
Micrococcus spec. HEXBA04 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ658423.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Micrococcineae; Micrococcaceae; Micrococcus
155
Origin:
1 aggatgaacg ctggcggcgt gcttaacaca tgcaagtcga acgatgaagc ccagcttgct
61 gggtggatta gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgagtaa cctgccctta actctgggat
121 aagcctggga aactgggtct aataccggat aggagcgtcc accgcatggt gggtgttgga
181 aagatttatc ggttttggat ggactcgcgg cctatcagct tgttggtgag gtaatggctc
241 accaaggcga cgacgggtag ccggcctgag agggtgaccg gccacactgg gactgagaca
301 cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg cacaatgggc gaaagcctga
361 tgcagcgacg ccgcgtgagg gatgacggcc ttcgggttgt aaacctcttt cagtagggaa
421 gaagcgaaag tgacggtacc tgcagaagaa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg
481 gtaatacgta gggtgcgagc gttatccgga attattgggc gtaaagagct cgtaggcggt
541 ttgtcgcgtc tgtcgtgaaa gtccggggct taaccccgga tctgcggtgg gtacgggcag
601 actagagtgc agtaggggag actggaattc ctggtgtagc ggtggaatgc gcagatatca
661 ggaggaacac cgatggcgaa ggcaggtctc tgggctgtaa ctgacgctga ggagcgaaag
721 catggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccatg ccgtaaacgt tgggcactag
781 gtgtggggac cattccacgg tttccgcgcc gcagctaacg cattaagtgc cccgcctggg
841 gagtacggcc gcaaggctaa aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggcggag
901 catgcggatt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccaa ggcttgacat gttctcgatc
961 gccgtagaga tacggtttcc cctttggggc gggttcacag gtggtgcatg gttgtcgtca
1021 gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc gcaaccctcg ttccatgttg
1081 ccagcacgta atggtgggga ctcatgggag actgccgggg tcaactcgga ggaaggtgag
1141 gacgacgtca aatcatcatg ccccttatgt cttgggcttc acgcatgcta caatggccgg
1201 tacaatgggt tgcgatactg tgaggtggag ctaatcccaa aaagccggtc tcagttcgga
1261 ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg
1321 ctgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcaagtcacg aaagttggta
1381 acacccgaag ccggtggcct aacccttgtg gggggagccg tcgaa
Tab. 99: DNA-Sequenz von Micrococcus spec. HEXBA04 aus der Datenbank BLAST
Mycobacterium spec. S061 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ544445.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Corynebacterineae; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Origin:
1 cgaacgctgg cggcgtgctt aacacatgca agtcgaacgg taaggccctt cggggtacac
61 gagtggcgaa cgggtgagta acacgtgggt gatctgccct gcacttcggg ataagcctgg
121 gaaactgggt ctaataccgg atatgaccat gcgcttcacg gtgtgtggtg gaaagctttt
181 gcggtgtggg atgggcccgc ggcctatcag cttgttggtg gggtaatggc ctaccaaggc
241 gacgacgggt agccggcctg agagggtgtc cggccacact gggactgaga tacggcccag
301 actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgcaagcct gatgcagcga
361 cgccgcgtgg gggatgacgg ccttcgggtt gtaaacctct ttcagtaggg acgaagcgca
421 agtgacggta cctacagaag aagcaccggc caactacgtg ccagcagccg cggtaatacg
481 tagggtgcga gcgttgtccg gaattactgg gcgtaaagag ctcgtaggtg gtttgtcgcg
541 ttgttcgtga aatctcacag cttaactgtg agcgtgcgag cgatacgggc agactggagt
601 actgcagggg agactggaat tcctggtgta acggtggaat gcgcagatat caggaggaac
661 accggtggcg aaggcgggtc tctgggcagt aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga
721 gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac ggtgggtact aggtgtgggt
781 ttccttcctt gggatccgtg ccgtagctaa cgcattaagt accccgcctg gggagtacgg
841 ccgcaaggct aaaactcaaa gaaattgacg ggggcccgca caagcnacgg agcatgggat
901 taattngatg gaaggcgaaa
Tab. 100: DNA-Sequenz von Mycobacterium spec. S061 aus der Datenbank BLAST
Mycobacterium spec. 12/13.28 AW partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: HE575946.1
Taxonomie:
Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales; Corynebacterineae; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Origin:
1 aacgctggcg gcgtgcttaa cacatgcaag tcgaacggaa aggcccttcg gggtactcga
61 gtggcgaacg ggtgagtaac acgtgggtga tctgccctgc actttgggat aagcctggga
121 aactgggtct aataccggat atacctcatg gactgcatgg tttgtggggg aaagcttttg
181 cggtgtggga tgggcccgcg gcctatcagc ttgttggtga ggttatggct taccaaggcg
241 acgacgggta gccggcctga gagggtgacc ggccacactg ggactgagat acggcccaga
301 ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg cgcaagcctg atgcagcgac
361 gccgcgtgag ggatgacggc cttcgggttg taaacctctt tcagcaggga cgaagcgcaa
421 gtgacggtac ctgtagaaga aggaccggcc aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt
481 agggtccgag cgttgtccgg aattactggg cgtaaagagc tcgtangtgg tttgtcgcgt
541 tgttcgtgaa aactcacagc tcaactgtgg gcgtgcgggc gataccggca gacttgagta
601 ctgcagggga gactggaatt cctggtgtag cggtggaatg cgcagatatc aggaggaaca
661 ccggtggcga aggcgggtct ctgggcagta actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag
721 cgaacaggat tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg gtgggtacta ggtgtgggtt
781 tccttccttg ggatccgtgc cgtagctaac gcattaagta ccccgcctgg ggagtacggc
841 cgcaaggcta aaactcaaag aaattgacgg gggcccgcac aagcggcgga gcatgtggat
901 taattcgatg caacgcgaag aaccttacct gggtttgaca tgcacaggac gtgcctagag
961 ataggtattc ccttgtggcc tgtgtgcagg tggtgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt
1021 gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttat cttatgttgc cagcgcgtaa
1081 tggcggggac tcgtgagaga ctgccggggt caactcggag gaaggtgggg atgacgtcaa
1141 gtcatcatgc cccttatgtc cagggcttca cacatgctac aatggccggt acaaagggct
156
1201 gcgatgccgt gaggtggagc gaatcctttc aaagccggtc tcagttcgga tcggggtctg
1261 caactcgacc ccgtgaagtc ggagtcgcta gtaatcgcag atcagcaacg ctgcggtgaa
1321 tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacgtcatg aaagtcggta acacccgaag
1381 ccggtggcct aaccccttgt gggagggagc cgtcgaaggt gggat
Tab. 101: DNA-Sequenz von Mycobacterium spec. 12/13.28 AW aus der Datenbank BLAST
Naegleria spec. SUM3V/I small subunit ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: DQ768723.1
Taxonomie:
Eukaryota; Heterolobosea; Schizopyrenida; Vahlkampfiidae; Naegleria; unclassified Naegleria
Origin:
1 acctggttga tcctgccagt actatatgct tgtctcaaag cctaagccat gcaaatctaa
61 gatcaatcat atgtggtttc ggccatgtat aatgatagtc tgtggaaggc tcattataac
121 agttatacac ctagccactg gaaagtttac aaggatacca ccgttaactg cagcgataat
181 acttgttccc ttcggggtgg taatagtata tgtgctgaag cctagctatt gtaactcagt
241 ttttctggat gtggcaacat attcagggtg attgggaatc gaccgctagc aggtgcccgc
301 aagggcgcgg gaaagtgaat taacaaggtt ttcataaggc ctttcaggtt tgctttttct
361 agtggccagg cagaggtgtt tcttacctat cagctcgttg tttgtttaaa ggacaaacca
421 gctatgacg ggtacgggga atcagtgttc gattccggag agggagcctg agaaatcgct
481 accacatcta aggacggcag caggcgcgca aattacccaa tcccaatacg gggaggtagt
541 gacaagctat agtgtctcca cacccttagg tggggaggta ttatcatctg ataattttcc
601 atgatttggg tgtagataac ccttagagca gccattggag gaaaagtctg gtgaattgtc
661 gccagaaata gtgatccagt aatggagagc tagtcgcaat gaccacgggt gatcctcgtg
721 ctagcggcga aacgaccaaa ttgcgggaag cgcttcttta aagcctaaca gtaccgttct
781 tgtttacaag aactatgaca ggagaaaagc ctgtaggatg gtaacaatct gttaggtgta
841 gcgtaatccg cagccaagct ttttggtgat caaatccctg ttattggagg atattgaagt
901 catgcgatgg ggtttatact tttatttgcc aaaacgggac ctctgttgag gtatagatct
961 cgcaagaggt tgaatattcc gtactaagga tctctgatcc ggaaagtcta gagactacac
1021 ggcaaagcca tagtggctag tataaatgga tagtccctag ttaaccatct aggcatccca
1081 tacaaaatgg tttcaataaa acagaaaatc gcaagatttc aaaagaaggt gaaaactttc
1141 aaaagtgtga cactttctcc tccgcaaaca ataacagttc aaatcaatcg taattcgttt
1201 aaagacggct atgatcctct aattgagaca atcgattatg gttatagcag tatgggtgcg
1261 gttcatgtta gtgatagcga tcaaattgct aaaattaacc aaggaactca agccagaaat
1321 gtctttaatg agtggctaac tactcacaaa ggagataaag gaagatctgg taagcagata
1381 ccttttatca tagacagact cagcaaggta aatgtttgta agcacgaatt tggcgaatgc
1441 ctgattggtg tagcaaataa gaccactgct ggttttaagg tccgttttat gaataaaaag
1501 ggttccgatt cgtatgtgca ccacgtagcg gtccttgcga actctaaaca caaagattgt
1561 atccatagct tggatatgat cagaactgtt tcgagtacga aaaagggcag tggagctaga
1621 acgatttctc atatttgtgg taatggaggc tgtgctagac caggtcattt aaagattgag
1681 tccaaaacag taaatgatga acgtactcac tgtcattttt tactgcgtaa gtctcaatct
1741 gaccatcaat cagaaatgat taggctagcc tgtcctcaca ctccaaagtg ttttgtaaat
1801 atatacaaaa taaacacacc gtattactaa ttgatagcgt ttgattccga aagaaaggtt
1861 cagagactag atggttgttg gcagagtttg tagctttgct taaggtatag tccaaaccca
1921 ctcgatgaca aagagtgtgt caatcgcaag gtactaatca taccccagga ttgatgttcg
1981 gtagaattgg ccagcacccg cggtaattcc agctccaaga gcgtatatta atactgctgt
2041 agttaaaacg cccgtagtat acctaagagt gcgcatgtag taattagttc tatcaagaga
2101 tggttgggga gagtttataa cccttctttg cctacttttg gtaaacttca gtcgggcagg
2161 gccttacggt tctcgtctga cagttgctgc gtgtacactt gtccacggtt catccgtgag
2221 gcccctttgg gttgcaactg taaataaatc gttgtgctta aagcgggcta tgatactctg
2281 ccagagcgat ttagcatggg actgcagagt agctgtattt gagtgaaacc tggacctcgg
2341 tttgggcgta gcttggtaca gcgcttgtaa tggagctcag ggtgaggccc cgggtaccat
2401 gaggctagag gtgaaattct gagaccctca tgtgaccaac taaggcgaaa gctgtcgtgg
2461 gccaaccaca agctcgtcta tcagggacga aagttggggg atcgaagacg atcagatacc
2521 gtcgtagtcc caactataaa cgataccaac cgagtatttg ggaagacact atcccagcga
2581 tcttctcaga actcaaggga aaccttaagt ctttgggttc tggggggagt atagtcgcaa
2641 gaccgaaact taaaggaatt gacggaaagg caccaccagg agtggagtct gcggcttaat
2701 tcgactcaac acggggaaac tcaccaggtc aggacacaag tttgattgac aggttaatag
2761 ccctttcttg attgtgtggt gggtagtgca tggccgtttc cagttcgtgg agtgatctgt
2821 cttgttaatt cagataacga acgagaccta agcctttaac tagccgtagg ccctttcctt
2881 cggggaaggg ttagtttatc gggactggct tttggccttt tccaaaacct acgtgacttt
2941 tgtcagcttc ttaaagggac ttcattcgtt ctagtagaat gaggaagatt taggccataa
3001 caggtctgtg atgctcttag atgtcctggg ctgcacgcgt actacaataa cggtaccagc
3061 gagcgctatg gttttataac cccttatcct aataggattg ggaaaacttt tcaaacaccg
3121 ttatgacagg gatcgaggat tggaacatcc tcgtgaacga ggaattccta gtaagcgtgg
3181 ttcatcatac cacattgatt acgtccctgc cttttgtaca caccgcccgt cgctcctacc
3241 gatgggacga agagatgaac ctggcggacc gagccgcaag gcaagggaaa ccagttaaat
3301 ctcttcgtct gtaggaagga aaagtcgtaa caaggtctcc gtaggtgaac cagcggaag
Tab. 102: DNA-Sequenz von Naegleria spec. SUM3V/I aus der Datenbank BLAST
Pantoea agglomerans strain CE21 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN084142.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Pantoea
Origin:
1 gggtgacgag tggcggacgg gtgagtaatg tctggggatc tgcccgatag agggggataa
157
61 ccactggaaa cggtggctaa taccgcataa cgtcgcaaga ccaaagaggg ggaccttcgg
121 gcctctcact atcggatgaa cccagatggg attagctagt aggcggggta atggcccacc
181 taggcgacga tccctagctg gtctgagagg atgaccagcc acactggaac tgagacacgg
241 tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc
301 agccatgccg cgtgtatgaa gaaggccttc gggttgtaaa gtactttcag cggggaggaa
361 ggcgacgggg ttaataaccg cgtcgattga cgttacccgc agaagaagca ccggctaact
421 ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta
481 aagcgcacgc aggcggtctg ttaagtcaga tgtgaaatcc ccgggcttaa cctgggaact
541 gcatttgaaa ctggcaggct tgagtcttgt agaggggggt agaattccag gtgtagcggt
601 gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg
661 acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg
721 taaacgatgt cgacttggag gttgttccct tgaggagtgg cttccggagc taacgcgtta
781 agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc
841 gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt
901 gacatccagc gaacttagca gagatgcttt ggtgccttcg ggaacgctga gacaggtgct
961 gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac
1021 ccttatcctt tgttgccagc gattcggtcg ggaactcaaa ggagactgcc ggtgataaac
1081 cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acgagtaggg ctacacacgt
1141 gctacaatgg cgcatacaaa gagaagcgac ctcgcgagag caagcggacc tcacaaagtg
1201 cgtcgtagtc cggatcggag tctgcaactc gactccgtga agtcggaatc gctagtaatc
1261 gtggatcaga atgccacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc
1321 atgggagtgg gttgcaaaag aagtaggtag c
Tab. 103: DNA-Sequenz von Pantoea agglomerans CE21 aus der Datenbank BLAST
Pedomicrobium fusiforme partial 16S rRNA gene, strain DSM 5304 (Organsim: Filomicrobium fusiforme)
Acessions-Nr.: Y14313.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Filomicrobium
Origin:
1 cagaacgaac gctggcggca ggcctaacac atgcaagtcg aacgccctag caatagggag
61 tggcagacgg gtgagtagcg cgtgggaacc tacctattgg tacggaataa ctcggggaaa
121 cccgtgctaa taccgtataa gcccgagagg ggaaagattt atcgccatta gatgggcccg
181 cgtcggatta gctagttggt gaggtaatgg ctcaccaagg cgacgatccg tagctggtct
241 gagaggatga tcagccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca
301 gtggggaata ttggacaatg ggcgaaagcc tgatccagcc atgccgcgtg agtgacgaag
361 gccttagggt tgtaaagctc ttttggcggg gacgataatg acggtacccg cagaataagc
421 cccggctaac ttcgtgccag cagccgcggt aatacgaagg gggctagcgt tgttcggaat
481 cactgggcgt aaagcgcacg taggcggatt tgttagtcag gggtgaaatc ccggggctca
541 acctcggaac tgcctctgat actgcaagtc tcgagtccga gagaggtgag tggaattcct
601 agtgtagagg tgaaattcgt agatattagg aagaacacca gtggcgaagg cggctcactg
661 gctcggtact gacgctgaag tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt
721 agtccacgcc gtaaacgatg gatgctagcc gtcggcaagc ttgcttgtcg gtggcgcagc
781 taacgcatta agcatcccgc ctggggagta cggccgcaag gttaaaactc aaaggaattg
841 acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaagaacctt
901 accagctctt gacattcact gaccgtttcc agagatggat tcatcctagc aataggcagt
961 gggacaggtg ctgcatggct gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc
1021 aacgagcgca accctcgcca ttagttgcca gcatttagtt gggcactcta gtgggactgc
1081 cggtgataag ccggaagaag gtggggatga cgtcaagtca tcatggccct tacgggctgg
1141 gctacacacg tgctacaatg gcagtgacaa tgggttaatc ccaaaaaact gtctcagttc
1201 ggattggttt ctgcaactcg aaaccatgaa gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca
1261 tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg
1321 ttttacccga agacggtgcg ctaacccgca agggaggcag cctgccacgg taaggtcagc
1381 gactggggtg aagtcgtaac aaggtagccg
Tab. 104: DNA-Sequenz von Pedomicrobium fusiforme DSM 5304 aus der Datenbank BLAST
Pedomicrobium manganicum strain ATCC 33121 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: GU269549.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Hyphomicrobiaceae; Pedomicrobium
Origin:
1 tcatggctca gaacgaacgc tggcggcagg cctaacacat gcaagtcgaa cgctccagca
61 atggagagtg gcagacgggt gagtaacgcg tgggaacctt ccctatggtt cggaatagct
121 cagggaaacc tggggtaata ccggataagc ccttcggggg aaagatttat cgccattgga
181 tgggcccgcg taggattagc tagttggtga ggtaacggct caccaaggcg acgatcctta
241 gctggtctga gaggatgatc agccacactg ggactgagac acggcccaga ctcctacggg
301 aggcagcagt ggggaatatt ggacaatggg cgaaagcctg atccagccat gccgcgtgag
361 tgacgaaggc cttagggttg taaagctctt ttggcgggga agataatgac ggtacccgca
421 gaataagctc cggctaactt cgtgccagca gccgcggtaa tacgaaggga gctagcgttg
481 ttcggaatca ctgggcgtaa agcgcacgta ggcggattgt ttagtcaggg gtgaaatccc
541 ggggctcaac ctcggaactg cctttgatac tggcaatctc gagtccgata gaggtgggtg
601 gaattcctag tgtagaggtg aaattcgtag atattaggaa gaacaccggt ggcgaaggcg
661 gcccactgga tcggtactga cgctgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat
721 accctggtag tccacgccgt aaacgatgga tgctagccgt cagcaagcat gcttgttggt
781 ggcgcagcta acgcattaag catcccgcct ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa
841 aggaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga cgcaacgcga
158
901 agaaccttac cagcccttga catgcccgga cggtttccag agatggattc ctcctagcaa
961 taggtcggga cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta
1021 agtcccgcaa cgagcgcaac cctcgccatt agttgccatc atttagttgg gcactctagt
1081 gggactgccg gtgataagcc ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc atggccctta
1141 cgggctgggc tacacacgtg ctacaatggc ggtgacagtg ggcagccacc cagcgatggg
1201 gagctaatca caaaaagccg tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag
1261 tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcac gccgcggtga atacgttccc gggccttgta
1321 cacaccgccc gtcacaccat gggagttggt tttacccgaa gacggtgcgc taaccgcaag
1381 gaggcagccg gccacggtaa
Tab. 105: DNA-Sequenz von Pedomicrobium manganicum ATCC 33121 aus der Datenbank BLAST
Pelomonas saccharophila gene for 16S rRNA, partial sequence, strain: NBRC 103037
Acessions-Nr.: AB681917.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Comamonadaceae; Pelomonas
Origin:
1 attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac ggtaacaggt taagctgacg
61 agtggcgaac gggtgagtaa tatatcggaa cgtgcccagt cgtgggggat aactgctcga
121 aagagcagct aataccgcat acgacctgag ggtgaaagcg ggggatcgca agacctcgcg
181 cgattggagc ggccgatatc agattaggta gttggtgggg taaaggccca ccaagccaac
241 gatctgtagc tggtctgaga ggacgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact
301 cctacgggag gcagcagtgg ggaattttgg acaatgggcg caagcctgat ccagccatgc
361 cgcgtgcggg aagaaggcct tcgggttgta aaccgctttt gtcagggaag aaaaggttct
421 ggttaatacc tgggactcat gacggtacct gaagaataag caccggctaa ctacgtgcca
481 gcagccgcgg taatacgtag ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgtgc
541 gcaggcggtt atgcaagaca gaggtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcctttgt
601 gactgcatag ctagagtacg gtagaggggg atggaattcc gcgtgtagca gtgaaatgcg
661 tagatatgcg gaggaacacc gatggcgaag gcaatcccct ggacctgtac tgacgctcat
721 gcacgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat
781 gtcaactggt tgttgggagg gtttcttctc agtaacgtag ctaacgcgtg aagttgaccg
841 cctggggagt acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg
901 gtggatgatg tggtttaatt cgatgcaacg cgaaaaacct tacctaccct tgacatgcca
961 ggaatcctga agagatttgg gagtgctcga aagagaacct ggacacaggt gctgcatggc
1021 cgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc
1081 attagttgct acgaaagggc actctaatga gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg
1141 ggatgacgtc aggtcatcat ggcccttatg ggtagggcta cacacgtcat acaatggccg
1201 ggacagaggg ctgccaaccc gcgaggggga gctaatccca gaaacccggt cgtagtccgg
1261 atcgtagtct gcaactcgac tgcgtgaagt cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcttg
1321 ccgcggtgaa tacgttcccg ggtcttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagcgggtt
1381 ctgccagaag tagttagcct aaccgcaagg agggcgatta ccacggcagg gttcgtgact
1441 ggggtgaag
Tab. 106: DNA-Sequenz von Pelomonas saccharophila NBRC 103037 aus der Datenbank BLAST
Phoma spec. ZHA 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ838011.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Dothideomycetes; Pleosporomycetidae; Pleosporales;
Pleosporineae; Didymellaceae; mitosporic Didymellaceae; Phoma
Origin:
1 tgccatgtct agtataagca ttataccgtg aaactgcgaa tggctcatta aatcagttat
61 cgtttatttg atagtacctt actacttgga taaccgtggt aattctagag ctaatacatg
121 ctgaaaaccc caacttcggg aggggtgtat ttattagata aaaaaccaac gcccttcggg
181 gcttcttggt gattcatgat aacttcacgg atcgcatggc cttgcgccgg cgacggttca
241 ttcaaatttc tgccctatca actttcgatg gtaaggtatt ggcttaccat ggtttcaacg
301 ggtaacgggg aattagggtt cgattccgga gagggagcct gagaaacggc taccacatcc
361 aaggaaggca gcaggcgcgc aaattaccca atcccgacac ggggaggtag tgacaataat
421 tactgataca gggctctttt gggtcttgta attggaatga gtacaattta aacctcttaa
481 cgaggaacaa ttggagggca agtctggtgc cagcagccgc ggtaattcca gctccaatag
541 cgtatattaa agttgttgca gttaaaaagc tcgtagttga aacttgggcc tggctggcag
601 gtccgcctca ccgcgtgtac ttgtccggcc gggcctttcc ttctggagaa cctcatgccc
661 ttcactgggt gtgttgggga accaggactt ttactttgaa aaaattagag tgttcaaagc
721 aggcctttgc tcgaatacgt tagcatggaa taatagaata ggacgtgcgg tcctattttg
781 ttggtttcta ggaccgccgt aatgattaat agggacagtc gggggcatca gtattcaatt
841 gtcagaggtg aaattcttgg atttattgaa gactaactac tgcgaaagca tttgccaagg
901 atgttttcat taatcagtga acgaaagtta ggggatcgaa gacgatcaga taccgtcgta
961 gtcttaaccg taaactatgc cgactaggga tcgggcgatg ttctttttct gactcgctcg
1021 gcaccttacg agaaatcaaa gtttttgggt tctgggggga gtatggtcgc aaggctgaaa
1081 cttaaagaaa ttgacggaag ggcaccacca ggcgtggagc ctgcggctta atttgactca
1141 acacggggaa actcaccagg tccagatgaa ataaggattg acagattgag agctctttct
1201 tgatttttca ggtggtggtg catggccgtt cttagttggt ggagtgattt gtctgcttaa
1261 ttgcgataac gaacgagacc ttaacctgct aaatagccag gctagctttg gctggtcgcc
1321 ggcttcttag agggactatc ggctcaagcc gatggaagtt tgaggcaata acaggtctgt
1381 gatgccctta gatgttctgg gccgcacgcg cgctacactg acagagccaa cgagttattc
1441 accttggccg gaaggtctgg gtaatcttgt taaactctgt cgtgctgggg atagagcatt
1501 gcaattattg ctcttcaacg aggaatgcct agtaagcgca tgtcatcagc atgcgttgat
159
1561 tacgtccctg ccctttgtac acaccgcccg tcgctactac cgattgaatg gctcagtgag
1621 gcctccggac tggctcgaag aggttggcaa cgaccacttc gagccggaaa gctggtcaaa
1681 ctcggtcatt agagaaataa aaattttt
Tab. 107: DNA-Sequenz von Phoma spec. ZHA aus der Datenbank BLAST
Photobacterium spec. HAR72 gene for 16S rRNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB038032.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales; Vibrionaceae; Photobacterium
Origin:
1 aagagtttga tcatggctca gattgaacgc tggcggcagg cctaacacat gcaagtcgag
61 cggtaacaga aaagagcttg ctcttttgct gacgagcggc ggacgggtga gtaatgcctg
121 ggaatatgcc ctgatgtggg ggataactat tggaaacgat agctaatacc gcataatctc
181 ttcggagcaa agagggggac cttcgggcct ctcgcgtcag gattagccca ggtgggatta
241 gctagttggt ggggtaatgg ctcaccaagg cgacgatccc tagctggtct gagaggatga
301 tcagccacac tggaactgag acacggtcca gactcctacg ggaggcagca gtggggaata
361 ttgcacaatg ggggaaaccc tgatgcagcc atgccgcgtg tatgaagaag gccttcgggt
421 tgtaaagtac tttcagttgt gaggaaggcg ttggagttaa tagcttcagc gtttgacgtt
481 agcaacagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggtgcg
541 agcgttaatc ggaattactg ggcgtaaagc gcatgcaggc ggtctgttaa gcaagatgtg
601 aaagcccggg gctcaacctc ggaacagcat tttgaactgg cagactagag tcttgtagag
661 gggggtagaa tttcaggtgt agcggtgaaa tgcgtagaga tctgaaggaa taccggtggc
721 gaaggcggcc ccctggacaa agactgacgc tcagatgcga aagcgtgggg agcaaacagg
781 attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtctac ttggaggttg tggccttgag
841 ccgtggcttt cggagctaac gcgttaagta gaccgcctgg ggagtacggt cgcaagatta
901 aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg
961 caacgcgaag aaccttacct actcttgaca tccagagaat tcgctagaga tagcttagtg
1021 ccttcgggaa ctctgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt
1081 gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctt atccttgttt gccagcacgt aatggtggga
1141 actccaggga gactgccggt gataaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat
1201 ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcgt atacagaggg ctgcaagcta
1261 gcgatagtga gcgaatccca caaagtacgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac
1321 tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgtg aatcagaatg tcacggtgaa tacgttcccg
1381 ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggct gcaccagaag tagatagctt
1441 aaccttcggg agggcgttta ccacggtgtg gttcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg
1501 ta
Tab. 108: DNA-Sequenz von Photobacterium spec. HAR72 aus der Datenbank BLAST
Pichia spec. LHY1 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: EF119340.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes; Saccharomycetales; Pichiaceae; Pichia
Origin:
1 atgaaaaatc atgcttcggg ctcttgattg attcataata ctagtcgaat cgcatggctt
61 acgcccggcg atgatgcatt caaattctgc cctatcaact gtcgatggta ggatagtggc
121 ctaccatg
[gap 100 bp] Expand Ns
229 gc agcaggcgcg
241 caaattaccc aatcctaatt cagggaggta gtgacaataa ataacgatac agggcccttc
301 tgggtcttgt aattggaatg agtacaatgt aaatacctta acgaggaaca attggagggc
361 aagtctggtg ccagcagccg cggtaattcc agctccaata gcgtatatta aagttgttgc
421 agttaaaaag ctcgtagttg aactttgggc ctggcaggcc ggtccgcttt ttggcgagta
481 ctgaccctgc cgggcctttc cttctggcta acctcccctc tggagaggcg aaccaggact
541 tttactttga aaaaattaga gtgttcaaag caggcctttg ctcgaatata ttagcatgga
601 ataatagaat aggacgtttg gttctatttt gttggtttct aggaccatcg taatgattaa
661 tagggacggt cgggggcatc agtattcagt tgtcagaggt gaaattcttg gatttactga
721 agactaacta ctgcgaaagc atttgccaag gacgttttca ttaatcaaga acgaaagtta
781 ggggatcgaa gatgatcaga taccgtcgta gtcttaacca taaactatgc cgactaggga
841 tcgggtgttg tttttataat gactcactcg gcaccttacg agaaatcaaa gtctttgggt
901 tctgggggga gtatggtcgc aaggctgaaa cttaaaggaa ttgacggaag ggcaccacca
961 ggagtggagc ctgcggctta atttgactca acacggggaa actcaccagg tccagacaca
1021 ataaggattg acagattgag agctctttct tgattttgtg ggtggtggtg catggccgtt
1081 cttagttggt ggagtgattt gtctgcttaa ttgcgataac gaacgagacc ttaacctact
1141 aaatagcgcg actagctttt gctggtgctg acgcttctta gagggactat cgatttcaag
1201 tcgatggaag tttgaggcaa taacaggtct gtgatgccct tagacgttct gggccgcacg
1261 cgcgctacac tgacggagcc agcgagtcta gccttggccg agaggtcatg ggtaatcttg
1321 tgaaactccg tcgtgctggg gatagaccat tgcaattatt gctcttcaac gaggaattcc
1381 tagtaagcgc aagtcatcag cttgcgttga ttacgtccct gccctttgta cacaccgccc
1441 gtcgctacta ccgattgaat ggcttagtga ggcttcagga ttggcttatg gcgggaggcg
1501 actcctccct ggagccgaga atctagtcaa acttggtcat ttagaggaag taaaagtcgt
1561 aacaaggttt ccgtaggtga acctgcggaa ggatcattag agaacctggg cctgcgctac
1621 ttgcgcggct ccaaccaata cacagtgtgt tatacttctc ttgctttggc tctgccaaag
1681 gttttaaaca cagaaattta ttttctttaa gaacagtcaa tttgaaattt aatcttcaaa
1741 cttcaaca
Tab. 109: DNA-Sequenz von Pichia spec. LHY1 aus der Datenbank BLAST
160
Proasellus slavus 18S ribosomal RNA gene, complete sequence (= Proasellus cavaticus)
Acessions-Nr.: AF496662.1
Taxonomie:
Eukaryota; Metazoa; Arthropoda; Crustacea; Malacostraca; Eumalacostraca; Peracarida; Isopoda; Asellota; Aselloidea;
Asellidae; Proasellus
Origin:
1 gancctgcca gtngtcatat gcttgtctca aagattaagc catgcatgtc tcagtacagg
61 cctttctaag gcgaaaccgc gaatggctca ttaaatcagt catgattcat tagattaagc
121 caaaaattta cttggataac tgtggtaatt ctagagctaa tacatgcaac tgagctccga
181 cccggccgtc agactgggga agggcgcttt tattagatca aaaaccaatc ggacctcggt
241 ccgtctcaaa tgagttgtgg tgactctgaa taactttagc cgagcgctac ggtcttagta
301 ccggcgccgt atctttcaag tgtctgcctt atcagctttc gattgtaggt tatacgccta
361 caatggctgt aacgggtaac ggggaatcag ggttcgattc cggagaggga gcctgagaaa
421 cggctaccac atctaaggaa ggcagcaggc acgcaaatta cccactccca gctcggggag
481 gtagtgacga aaaataacga tgcgggactc ttccgaggcc tcgcaatcgg aatgagttca
541 ctttaaatcc ttggacgagg atccactaga gggcaagtct ggtgccagca gccgcggtaa
601 ttccagctct agtagcgtat attaaagttg ctgcggttaa aaagctcgta gttggatctc
661 tgatttggac cggcggccca ctcaaggata gccctcgctg aaaatgggag gcgctctacg
721 ttcgcatcgg cgcctcggac ggkcgcggcc gccctcatcg aggtagtggt cgcgttccga
781 acggggatca aacgccggtg cgtcgtgggc tctcttacag gcgggtaagc gatcccggtg
841 gttcactgtc cggctccgga ttgaaaatgc cgtcggctcg cacggggtgc tcttcaccga
901 gtgtcccgcg tggccgacaa gttcactttg aaaaaattag agtgctcaaa gcaggcaaca
961 actcacgcct gaatggtggt gcatggaatg atggaacagg acctcggttc tgccctttta
1021 attggttttc tgaacccgag gtaatgatta acgggaacag acgggggcat tagtattgcg
1081 acgctagagg tgaaattctt ggaccgtcgc aagactaact actgcgaaag catttgccaa
1141 gaatgttttc attaatcaag aacgaaagtt agaggatcga aggcgatcag ataccgccct
1201 agttctaacc ataaacgatg ctaactggcg atccgtcggc gtcattccca cgactcgacg
1261 gggagccccc gggaaaccaa agtctttgag ttccggggga agtatggttg caaagctgaa
1321 acttaaagga attgacggaa gggcaccacc aggagtggmg cctgcggctt aatttgactc
1381 aacacgggga aactcaccag gcccggacac cgaaaggatt gacagattga gagctctttc
1441 ttgatccggt gggtggtggt gcatggccgt tcttagttgg tggagcgatc tgtctggttg
1501 attccgataa cgaacgagac tctaccctgc taactagtcg tcggatcgtc tcccgcgggg
1561 gaccatcccg aggttaacgc ctccccgtag cccccgcgcg tttgtcggct cgtcggcggc
1621 gcgtgggtca agttacgggt ggcgtcctcg cggttggttc atcctagggg cgtccgtcgc
1681 agtatcttct tagaggaatc agcggcgtcc agccgcacga aatagagcaa taacaggtct
1741 gtgatgccct tagatgttct gggccgcacg cgcgctacaa tgaaggattc agcgtgcttt
1801 ccccgtctga aaagatcggg taacccgatg aaactccttc ccgattggga ttggggcttg
1861 caattgtttc ccatgaacga ggaattccca gtaagcgcaa gtcatcagct tgcgttgatt
1921 acgtccctgc cctttgtaca caccgcccgt cgctactacc gattgaatga ttcagtgagg
1981 gcatcggact ggcgccttcg gttgtctcgt ggcttacgtc tcgagcgcct taggctgacg
2041 gaaagatgtc cgaacttgat catttagagg aagtaaaagt cgtaacaagg tttccgtagt
2101 gaacctgcgg aagga
Tab. 110: DNA-Sequenz von Proasellus slavus / Proasellus cavaticus aus der Datenbank BLAST
Protacanthamoeba bohemica small subunit ribosomal RNA gene, complete sequence
Acessions-Nr.: AY960120.1
Taxonomie:
Eukaryota; Amoebozoa; Centramoebida; Acanthamoebidae; Protacanthamoeba
Origin:
1 gtagtcatat gcttgtctca aagattaagc catgcatgtc taagtataaa cgagattata
61 cagtgagact gcggatggct cattaaatca gttatagttt atttgatggt tcctttttct
121 tttccgctac ttggataacc gtagtaatcc tagagctaat acatgccaac gaccccaact
181 aagggggggt ggaggcgggc gggggcaact ccgttcgtct tcatcccgct cacccttcgg
241 aaggggcgta tttattagat aaaaaaccga cacagggcac ttgtgccctg gacctcggcg
301 agtcacggta actcgatcgg atcgcatcca acggctcttc tcttcggggg ggagccggcg
361 acgattcatt caaattcctg ccctatcaac tctcgatggt aggatagagg cctaccatgg
421 tcgcaacggg taacggggaa ttagggttcg attccggaga gggagcctga gagatggcta
481 ccacttctaa ggaaggcagc aggcgcgcaa attacccaat cccgacacgg gggaggtagt
541 gacaataaat aacgatgcgg gtctcgacaa gagcctcgca atcggaatga gcacggctca
601 aaccccctaa cgagtagcga ttggagggca agtctggtgc cagcagccgc ggtaattcca
661 gctccaatag cgtatattaa agttgttgca gttaaaaagc tcgtagttgg atctcggggt
721 gaggcgagcc cggtccgccg cgagctcggc gagcaccggc ccgcccacct cctccctccg
781 gcgccccgcc ccccccgttg actcgggtcg ggggcgtcga aaggggggga gggaggggtg
841 ggggcaactc catctctctc ttctcctggg gcccggacct tttaccttga ggaaattaga
901 gtgttcaaag cgggcgcgaa tctttctcgc cgttgaatac gtcagcatgg gataatggaa
961 taggaccccg ctcctatttc cgttggtttc cgggagcggg gtaatgattg atagggatag
1021 ttgggggcat cgatatttaa ttgtcagagg tgaaattctt ggatttatga aagatcgact
1081 tccgcgaaag catttgccaa ggatgttttc attaatcaag aacgaaagtt aggggatcga
1141 agacgatcag ataccgtcgt agtcttaacc ataaaccgtg ccgaccagcg atcgggagac
1201 gtcgcatgga tgactccccc ggcagcttgt gagaaatcac aagtctttgg gttccggggg
1261 gagtatggtc gcaaggctga aacttaaagg aattgacgga agggcaccac caggagtgga
1321 gcctgcggct taatttgact caacacgggg aaacttacca ggtccagaca taatgaggat
1381 tgacagattg agagctcttt cttgattcta tgggtggtgg tgcatggccg ttcttagttg
1441 gtggagcgat ttgtctggtt aattccgtta acgaacgaga cctcggcctg ctaaatagct
1501 acgccgaccc cgctatccaa aacctggcgg cggagagccg gtcccgtcct gggcgagggg
1561 ggcaaccctt tcgttcggcg ctcggggccc ctccccgtca ggcggtcggg tcggcggcca
161
1621 cgcttcttag agggactgcc ggcatccagc cgacggaggt tcgaggcaat aacaggtctg
1681 tgatgccctt agatgttctg ggccgcacgc gcgctacact gatcgagaca gcgagtccct
1741 ccgcctcggc cgaagggtcc gggcaacctc gtcagcctcg atcgtgctgg ggatagaccg
1801 ttgcaactgt cggtctcgaa cgaggaattc ctagtaagcg cgggtcatca gcccgcgctg
1861 attacgtccc tgccctttgt acacaccgcc cgtcgctcct accgatcgaa cggtccggcg
1921 aagccctcgg agctcgaccc gctcgcgatc cgggcaaccg ggtcgcgggg tcggacgaag
1981 tcggctgaac cttaccgttt agaggaagga gaagtcgtaa caaggttt
Tab. 111: DNA-Sequenz von Protacanthamoeba bohemica aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas denitrificans strain KH-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ612512.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 gtcgagcgga agaagggagc ttgctcccgg attcagcggc ggacgggtga gtagcagcct
61 gggaatctgc ctggtagtgg gggataacgt tccgaaagga acgctaatac cgcgtacgtc
121 ctacgggaga aagcagggga tcttcggacc ttgcgctatc agatgagccc aggtcggatt
181 agctagtagg tggggtaaag gctcacctag gcgacgatcc gtaactggtc tgagaggatg
241 atcagtcaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat
301 attggacaat gggggaaacc ctgatccagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggtcttcgga
361 ttgtaaagca ctttaagttg ggaggaaggg ttgttggcta atatccagca attttgacgt
421 taccgacaga ataagcaccg gctaactctg tgccagcagc cgcggtaata cagagggtgc
481 aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcgcgtagg tggttcagta agatgggtgt
541 gaaatccccg ggcttaacct gggaactgct ttcataactg ctgagctaga gtacggtaga
601 gggtagtgga atttcctgtg tagcggtgaa atgcgtagat ataggaagga acaccagtgg
661 cgaaggcgac tacctggact gatactgaca ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag
721 gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcaa ctagccgttg gaatccttga
781 gattttagtg gcgcagctaa cgcactaagt tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt
841 aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa
901 gcaacgcgaa gaaccttacc tggccttgac atgctgagaa ctttccagag atggattggt
961 gccttcggga gctcagacac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt
1021 tgggttaagt cccgtaacga gcgcaaccct tgtccctagt taccagcggg ttaagccggg
1081 cactctaggg agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca
1141 tggcccttac ggccagggct acacacgtgc tacaatgggg gatacaaagg gttgccaagc
1201 cgcgaggtgg agctaatccc ataaagtctc tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga
1261 ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc
1321 gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaccagaa gtagctagtc
1381 taacct
Tab. 112: DNA-Sequenz von Pseudomonas denitrificans strain KH-1 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas fluorescens strain EvS4-B1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ226759.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 tgnggngncn nncncnngat nngcggcgga cgggtgagta atgcctagga atctgcctgg
61 tagtggggga caacgtttcg aaaggaacgc taataccgca tacgtcctac gggagaaagc
121 aggggacctt cgggccttgc gctatcagat gagcctaggt cggattagct agttggtgag
181 gtaatggctc accaaggcga cgatccgtaa ctggtctgag aggatgatca gtcacactgg
241 aactgagaca cggtccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc
301 gaaagcctga tccagccatg ccgcgtgtgt gaagaaggtc ttcggattgt aaagcacttt
361 aagttgggag gaagggttgt agattaatac tctgcaattt tgacgttacc gacagaataa
421 gcaccggcta actctgtgcc agcagccgcg gtaatacaga gggtgcaagc gttaatcgga
481 attactgggc gtaaagcgcg cgtaggtggt tcgttaagtt ggatgtgaaa tccccgggct
541 caacctggga actgcattca aaactgtcga gctagagtat ggtagagggt ggtggaattt
601 cctgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatag gaaggaacac cagtggcgaa ggcgaccacc
661 tggactgata ctgacactga ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg
721 gtagtccacg ccgtaaacga tgtcaactag ccgttgggag ccttgagctc ttagtggcgc
781 agctaacgca ttaagttgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa
841 ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac
901 cttaccaggc cttgacatcc aatgaacttt ccagagatgg attggtgcct tcgggaacat
961 tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg
1021 taacgagcgc aacccttgtc cttagttacc agcacgttat ggtgggcact ctaaggagac
1081 tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaag tcatcatggc ccttacggcc
1141 tgggctacac acgtgctaca atggtcggta caaagggttg ccaagccgcg aggtggagct
1201 aatcccataa aaccgatcgt agtccggatc gcagtctgca actcgactgc gtgaagtcga
1261 atcgctagta tcgnaatcaa atcccnt
Tab. 113: DNA-Sequenz von Pseudomonas fluorescens EvS4-B1 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas mandelii strain McBRA2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ317812.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 agcggcggac gggtgagtaa tgcctaggaa tctgcctggt agtgggggat aacgctcgga
162
61 aacggacgct aataccgcat acgtcctacg ggagaaagca ggggaccttc gggccttgcg
121 ctatcagatg agcctaggtc ggattagcta gttggtgagg taatggctca ccaaggcgac
181 gatccgtaac tggtctgaga ggatgatcag tcacactgga actgagacac ggtccagact
241 cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatgggcg aaagcctgat ccagccatgc
301 cgcgtgtgtg aagaaggtct tcggattgta aagcacttta agttgggagg aagggcagtt
361 acctaatacg tatctgtttt gacgttaccg acagaataag caccggctaa ctctgtgcca
421 gcagccgcgg taatacagag ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcgc
481 gtaggtggtt tgttaagttg gatgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcattcaa
541 aactgacaag ctagagtatg gtagagggtg gtggaatttc ctgtgtagcg gtgaaatgcg
601 tagatatagg aaggaacacc agtggcgaag gcgaccacct ggactgatac tgacactgag
661 gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat
721 gtcaactagc cgttgggagc cttgagctct tagtggcgca gctaacgcat taagttgacc
781 gcctggggag tacggccgca aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc
841 ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggcc ttgacatcca
901 atgaactttc cagagatgga ttggtgcctt cgggaacatt gagacaggtg ctgcatggct
961 gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgt aacgagcgca acccttgtcc
1021 ttagttacca gcacgtaatg gtgggcactc taaggagact gccggtgaca aaccggagga
1081 aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacggcct gggctacaca cgtgctacaa
1141 tggtcggtac agagggttgc caagccgcga ggtggagcta atcccagaaa accgatcgta
1201 gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg tgaagtcgga atcgctagta atcgcgaatc
1261 agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag
1321 tgggttgc
Tab. 114: DNA-Sequenz von Pseudomonas mandelii McBRA2 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas putida strain CY04 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX082200.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 tttgatgggc ggcggctaca catgcagtcg agcggatgag aagagcttgc tcttcgattc
61 agcggcggac gggtgagtaa tgcctaggaa tctgcctggt agtgggggac aacgtttcga
121 aaggaacgct aataccgcat acgtcctacg ggagaaagca ggggaccttc gggccttgcg
181 ctatcagatg agcctaggtc ggattagcta gttggtgggg taatggctca ccaaggcgac
241 gatccgtaac tggtctgaga ggatgatcag tcacactgga actgagacac ggtccagact
301 cctacgggag gcagcagtgg ggaatattgg acaatgggcg aaagcctgat ccagccatgc
361 cgcgtgtgtg aagaaggtct tcggattgta aagcacttta agttgggagg aagggcagta
421 agttaatacc ttgctgtttt gacgttaccg acagaataag caccggctaa ctctgtgcca
481 gcagccgcgg taatacagag ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgcgc
541 gtaggtggtt tgttaagttg gatgtgaaag ccccgggctc aacctgggaa ctgcatccaa
601 aactggcaag ctagagtacg gtagagggtg gtggaatttc ctgtgtagcg gtgaaatgcg
661 tagatatagg aaggaacacc agtggcgaag gcgaccacct ggactgatac tgacactgag
721 gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cgtaaacgat
781 gtcaactagc cgttggaatc cttgagattt tagtggcgca gctaacgcat taagttgacc
841 gcctggggag tacggccgca aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggc ccgcacaagc
901 ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgaagaacc ttaccaggcc ttgacatgca
961 gagaactttc cagagatgga ttggtgcctt cgggaactct gacacaggtg ctgcatggct
1021 gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgt aacgagcgca acccttgtcc
1081 ttagttacca gcacgttatg gtgggcactc taaggagact gccggtgaca aaccggagga
1141 aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacggcct gggctacaca cgtgctacaa
1201 tggtcggtac agagggttgc caagccgcga ggtggagcta atctcacaaa accgatcgta
1261 gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg tgaagtcgga atcgctagta atcgcgaatc
1321 agaatgtcgc ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag
1381 tgggttgcac cagaagtagc tagtctaacc ttcgggagga cggtaccacg gtggatcata
1441 agc
Tab. 115: DNA-Sequenz von Pseudomonas putida CY04 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas putida strain MC4 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JF825523.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggatgatgag agcttgctct
61 ctgattcagc ggcggacggg tgagtaatgc ctaggaatct gcctggtagt gggggacaac
121 gtctcgaaag ggacgctaat accgcatacg tcctacggga gaaagcaggg gaccttcggg
181 ccttgcgcta tcagatgagc ctaggtcgga ttagctagtt ggtgaggtaa tggctcacca
241 aggcgacgat ccgtaactgg tctgagagga tgatcagtca cactggaact gagacacggt
301 ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca
361 gccatgccgc gtgtgtgaag aaggtcttcg gattgtaaag cactttaagt tgggaggaag
421 ggcagtaaat taatactttg ctgttttgac gttaccgaca gaataagcac cggctaactc
481 tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa
541 agcgcgcgta ggtggtttgt taagttggat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg
601 cattcaaaac tgacaagcta gagtatggta gagggtggtg gaatttcctg tgtagcggtg
661 aaatgcgtag atataggaag gaacaccagt ggcgaaggcg accacctgga ctgatactga
721 cactgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt
781 aaacgatgtc aactagccgt tgggagcctt gagctcttag tggcgcagct aacgcattaa
163
841 gttgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg
901 cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggccttg
961 acatccaatg aactttccag agatggattg gtgccttcgg gaacattgag acaggtgctg
1021 catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgtaac gagcgcaacc
1081 cttgtcctta gttaccagca cgtaatggtg ggcactctaa ggagactgcc ggtgacaaac
1141 cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acggcctggg ctacacacgt
1201 gctacaatgg tcggtacaga gggttgccaa gccgcgaggt ggagctaatc ccataaaacc
1261 gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga agtcggaatc gctagtaatc
1321 gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc
1381 atgggagtgg gttgcaccag aagtagctag tctaaccttc gggaggacgg ttaccacggt
1441 gtgattcatg actggggtg
Tab. 116: DNA-Sequenz von Pseudomonas putida MC4 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas putida strain MPV2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JX237836.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 agattgaacg ctggcggcag gcctaacaca tgcaagtcga gcggatgacg ggagcttgct
61 ccttgattca gcggcggacg ggtgagtaat gcctaggaat ctgcctggta gtgggggaca
121 acgtttcgaa aggaacgcta ataccgcata cgtcctacgg gagaaagcag gggaccttcg
181 ggccttgcgc tatcagatga gcctaggtcg gattagctag ttggtggggt aatggctcac
241 caaggcgacg atccgtaact ggtctgagag gatgatcagt cacactggaa ctgagacacg
301 gtccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatgggcga aagcctgatc
361 cagccatgcc gcgtgtgtga agaaggtctt cggattgtaa agcactttaa gttgggagga
421 agggcagtaa gctaatacct tgctgttttg acgttaccga cagaataagc accggctaac
481 tctgtgccag cagccgcggt aatacagagg gtgcaagcgt taatcggaat tactgggcgt
541 aaagcgcgcg taggtggttt gttaagttgg atgtgaaagc cccgggctca acctgggaac
601 tgcatccaaa actggcaagc tagagtacgg tagagggtgg tggaatttcc tgtgtagcgg
661 tgaaatgcgt agatatagga aggaacacca gtggcgaagg cgaccacctg gactgatact
721 gacactgagg tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc
781 gtaaacgatg tcaactagcc gttggaatcc ttgagatttt agtggcgcag ctaacgcatt
841 aagttgaccg cctggggagt acggccgcaa ggttaaaact caaatgaatt gacgggggcc
901 cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgaagcaacg cgaagaacct taccaggcct
961 tgacatgcag agaactttcc agagatggat tggtgccttc gggaactctg acacaggtgc
1021 tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgta acgagcgcaa
1081 cccttgtcct tagttaccag cacgttatgg tgggcactct aaggagactg ccggtgacaa
1141 accggaggaa ggtggggatg acgtcaagtc atcatggccc ttacggcctg ggctacacac
1201 gtgctacaat ggtcggtaca gagggttgcc aagccgcgag gtggagctaa tctcacaaaa
1261 ccgatcgtag tccggatcgc agtctgcaac tcgactgcgt gaagtcggaa tcgctagtaa
1321 tcgcgaatca gaatgtcgcg gtgaatacgt tcccgggcct tgtacacacc gcccgtcaca
1381 ccatgggagt gggttgcacc agaagtagct agtctaacct tcggggggac ggttaccacg
1441 gtgtgattca tgactggggt gaagtcgtaa caaggtagcc gtagggga
Tab. 117: DNA-Sequenz von Pseudomonas putida MPV2 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas putida strain SXMAs-6 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JN606325.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 tgcagtcgag cggatgagaa gagcttgctc ttcgattcag cggcggacgg gtgagtaatg
61 cctaggaatc tgcctggtag tgggggacaa cgtttcgaaa ggaacgctaa taccgcatac
121 gtcctacggg agaaagcagg ggaccttcgg gccttgcgct atcagatgag cctaggtcgg
181 attagctagt tggtgaggta atggctcacc aaggcgacga tccgtaactg gtctgagagg
241 atgatcagtc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg
301 aatattggac aatgggcgaa agcctgatcc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggtcttc
361 ggattgtaaa gcactttaag ttgggaggaa gggcattaac ctaatacgtt agtgttttga
421 cgttaccgac agaataagca ccggctaact ctgtgccagc agccgcggta atacagaggg
481 tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcgcgt aggtggtttg ttaagttgga
541 tgtgaaagcc ccgggctcaa cctgggaact gcatccaaaa ctggcaagct agagtacggt
601 agagggtggt ggaatttcct gtgtagcggt gaaatgcgta gatataggaa ggaacaccag
661 tggcgaaggc gaccacctgg actgatactg acactgaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa
721 caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgt caactagccg ttggaatcct
781 tgagatttta gtggcgcagc taacgcatta agttgaccgc ctggggagta cggccgcaag
841 gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc
901 gaagcaacgc gaagaacctt accaggcctt gacatgcaga gaactttcca gagatggatt
961 ggtgccttcg ggaactctga cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga
1021 tgttgggtta agtcccgtaa cgagcgcaac ccttgtcctt agttaccagc acgttatggt
1081 gggcactcta aggagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca
1141 tcatggccct tacggcctgg gctacacacg tgctacaatg gtcggtacag agggttgcca
1201 agccgcgagg tggagctaat ctcacaaaac cgatcgtagt ccggatcgca gtctgcaact
1261 cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgcgaatcag aatgtcgcgg tgaatacgtt
1321 cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcacca gaagtagcta
1381 gtctaacctt cgggaggacg gt
Tab. 118: DNA-Sequenz von Pseudomonas putida SXMAs-6 aus der Datenbank BLAST
164
Pseudomonas spec. gyq9 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ984605.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 cggctaaaac tgttagagag agcgatccta gagaaacttg cttctcttga gagcggcgga
61 cgggtgagta atgcctagga atctgcctgg tagtggggga taacgttcgg aaacggacgc
121 taataccgca tacgtcctac gggagaaagc aggggacctt cgggccttgc gctatcagat
181 gagcctaggt cggattagct agttggtgag gtaatggctc accaaggcga cgatccgtaa
241 ctggtctgag aggatgatca gtcacactgg aactgagaca cggtccagac tcctacggga
301 ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gaaagcctga tccagccatg ccgcgtgtgt
361 gaagaaggtc ttcggattgt aaagcacttt aagttgggag gaagggcagt tacctaatac
421 gtgattgttt tgacgttacc gacagaataa gcaccggcta actctgtgcc agcagccgcg
481 gtaatacaga gggtgcaagc gttaatcgga attactgggc gtaaagcgcg cgtaggtggt
541 tagttaagtt ggatgtgaaa tccccgggct caacctggga actgcattca aaactgactg
601 actagagtat ggtagagggt ggtggaattt cctgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatag
661 gaaggaacac cagtggcgaa ggcgaccacc tggactgata ctgacactga ggtgcgaaag
721 cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgtcaactag
781 ccgttgggag ccttgagctc ttagtggcgc agctaacgca ttaagttgac cgcctgggga
841 gtacggccgc aaggttaaaa ctcaaatgaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca
901 tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgaagaac cttaccaggc cttgacatcc aatgaacttt
961 ctagagatag attggtgcct tcgggaacat tgagacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc
1021 tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg taacgagcgc aacccttgtc cttagttacc
1081 agcacgttat ggtgggcact ctaaggagac tgccggtgac aaaccggagg aaggtgggga
1141 tgacgtcaag tcatcatggc ccttacggcc tgggctacac acgtgctaca atggtcggta
1201 cagagggttg ccaagccgcg aggtggagct aatcccagaa aaccgatcgt agtccggatc
1261 gcagtctgca actcgactgc gtgaagtcgg aatcgctagt aatcgcgaat cagaatgtcg
1321 cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga gtgggttgca
1381 ccagaagtag ctagtctaca atcggggcgt cggtacacat cagagttttc cggc
Tab. 119: DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. gyq9 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas spec. JCM 5415 gene for 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB685628.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggtagagaga agcttgcttc
61 tcttgagagc ggcggacggg tgagtaatgc ctaggaatct gcctggtagt gggggataac
121 gctcggaaac ggacgctaat accgcatacg tcctacggga gaaagcaggg gaccttcggg
181 ccttgcgcta tcagatgagc ctaggtcgga ttagctagtt ggtggggtaa tggctcacca
241 aggcgacgat ccgtaactgg tctgagagga tgatcagtca cactggaact gagacacggt
301 ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca
361 gccatgccgc gtgtgtgaag aaggtcttcg gattgtaaag cactttaagt tgggaggaag
421 ggcagtaacc taatacgttg ctgtcttgac gttaccgaca gaataagcac cggctaactc
481 tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa
541 agcgcgcgta ggtggtttgt taagttggat gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg
601 cattcaaaac tgacaagcta gagtatggta gagggtggtg gaatttcctg tgtagcggtg
661 aaatgcgtag atataggaag gaacaccagt ggcgaaggcg accacctgga ctgatactga
721 cactgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt
781 aaacgatgtc aactagccgt tgggagcctt gagctcttag tggcgcagct aacgcattaa
841 gttgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg
901 cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggccttg
961 acatccaatg aactttccag agatggattg gtgccttcgg gaacattgag acaggtgctg
1021 catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgtaac gagcgcaacc
1081 cttgtcctta gttaccagca cgtaatggtg ggcactctaa ggagactgcc ggtgacaaac
1141 cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acggcctggg ctacacacgt
1201 gctacaatgg tcggtacaga gggttgccaa gccgcgaggt ggagctaatc ccacaaaacc
1261 gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga agtcggaatc gctagtaatc
1321 gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc
1381 atgggagtgg gttgcaccag aagtagctag tctaaccttc gggaggacgg ttaccacggt
1441 gtgattcatg actggggtg
Tab. 120: DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. JCM 5415 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas spec. NEAU-ST5-5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ762269.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 tgcagtcgag cggatgaagg gagcttgctc tctgattcag cggcggacgg gtgagtaatg
61 cctaggaatc tgcctggtag tgggggacaa cgtttcgaaa ggaacgctaa taccgcatac
121 gtcctacggg agaaagcagg ggaccttcgg gccttgcgct atcagatgag cctaggtcgg
181 attagctagt tggtgaggta aaggctcacc aaggcgacga tccgtaactg gtctgagagg
241 atgatcagtc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg
301 aatattggac aatgggcgaa agcctgatcc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggtcttc
361 ggattgtaaa gcactttaag ttgggaggaa gggcagtaag ctaatacctt gctgttttga
165
421 cgttaccgac agaataagca ccggctaact tcgtgccagc agccgcggta atacgaaggg
481 tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcgcgt aggtggttcg ttaagttgga
541 tgtgaaagcc ccgggctcaa cctgggaact gcatccaaaa ctggcgagct agagtatggc
601 agagggtggt ggaatttcct gtgtagcggt gaaatgcgta gatataggaa ggaacaccag
661 tggcgaaggc gaccacctgg gctaatactg acactgaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa
721 caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatgt cgactagccg ttgggatcct
781 tgagatctta gtggcgcagc taacgcatta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag
841 gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc
901 gaagcaacgc gaagaacctt accaggcctt gacatgcaga gaactttcca gagatggatt
961 ggtgccttcg ggaactctga cacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga
1021 tgttgggtta agtcccgtaa cgagcgcaac ccttgtcctt agttaccagc acgttaaggt
1081 gggcactcta aggagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca
1141 tcatggccct tacggcctgg gctacacacg tgctacaatg gtcggtacaa agggttgcca
1201 agccgcgagg tggagctaat cccataaaac cgatcgtagt ccggatcgca gtctgcaact
1261 cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgtgaatcag aatgtcacgg tgaatacgtt
1321 cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgctcca gaagtagcta
1381 gtct
Tab. 121: DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. NEAU-ST5-5 aus der Datenbank BLAST
Pseudomonas spec. R-41390 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: FR682933.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas
Origin:
1 attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggatgaagag agcttgctct
61 ctgattcagc ggcggacggg tgagtaatgc ctaggaatct gcctggtagt gggggacaac
121 gtttcgaaag gaacgctaat accgcatacg tcctacggga gaaagcaggg gaccttcggg
181 ccttgcgcta tcagatgagc ctaggtcgga ttagctagtt ggtgaggtaa tggctcacca
241 aggcgacgat ccgtaactgg tctgagagga tgatcagtca cactggaact gagacacggt
301 ccagactcct acgggaggca gcagtgggga atattggaca atgggcgaaa gcctgatcca
361 gccatgccgc gtgtgtgaag aaggtcttcg gattgtaaag cactttaagt tgggaggaag
421 ggcagtaagc gaataccttg ctgttttgac gttaccgaca gaataagcac cggctaactc
481 tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa
541 agcgcgcgta ggtggtttgt taagttggat gtgaaagccc cgggctcaac ctgggaactg
601 cattcaaaac tgacaagcta gagtatggta gagggtggtg gaatttcctg tgtagcggtg
661 aaatgcgtag atataggaag gaacaccagt ggcgaaggcg accacctgga ctgatactga
721 cactgaggtg cgaaagcgtg gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccgt
781 aaacgatgtc aactagccgt tgggagcctt gagctcttag tggcgcagct aacgcattaa
841 gttgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg
901 cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg aagcaacgcg aagaacctta ccaggccttg
961 acatccaatg aactttccag agatggattg gtgccttcgg gaacattgag acaggtgctg
1021 catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgtaac gagcgcaacc
1081 cttgtcctta gttaccagca cgttatggtg ggcactctaa ggagactgcc ggtgayaaac
1141 cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acggcctggg ctacacacgt
1201 gctacaatgg tcggtacaga gggttgccaa gccgcgaggt ggagctaatc ccataaaacc
1261 gatcgtagtc cggatcgcag tctgcaactc gactgcgtga agtcggaatc gctagtaatc
1321 gcgaatcaga atgtcgcggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc
1381 atgggagtgg gttgcaccag aagtagctag tctaaccttc gggaggacgg ttaccacggt
1441 gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt aggggaacc
Tab. 122: DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. R-41390 aus der Datenbank BLAST
Pseudorhodobacter spec. KOPRI 25878 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HQ825033.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Pseudorhodobacter
Origin:
1 tgcaagtcga acgggtcctt cgggactagt ggcggacggg tgagtaacgc gtgggaacat
61 accctttggt acggaatagc ctcgggaaac tgagagtaat accgtatgtg cccttcgggg
121 gaaagattta tcgccaaagg attggcccgc gttggattag gtagttggtg gggtaatggc
181 ctaccaagcc gacgatccat agctggtttg agaggatgat cagccacact gggactgaga
241 cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatct tagacaatgg gggaaaccct
301 gatctagcca tgccgcgtga tcgatgaagg ccttagggtt gtaaagatct ttcagatggg
361 aagataatga cggtaccatc agaagaagcc ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta
421 atacggaggg ggctagcgtt attcggaatt actgggcgta aagcgcacgt aggcggatta
481 gaaagtcaga ggtgaaatcc cagggctcaa ccttggaact gcctttgaaa ctcctagtct
541 tgaggtcgag agaggtgagt ggaattccga gtgtagaggt gaaattcgta gatattcgga
601 ggaacaccag tggcgaaggc ggctcactgg ctcgatactg acgctgaggt gcgaaagcgt
661 ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga atgccagtcg
721 tcgggtagca tgctattcgg tgacacacct aacggattaa gcattccgcc tggggagtac
781 ggccgcaagg ttaaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg
841 gtttaattcg aagcaacgcg cagaacctta ccaacccttg acatggatat cgcggctctg
901 gagacagagc tttcagttcg gctggatatc acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc
961 gtgtcgtgag atgttcggtt aagtccggca acgagcgcaa cccacatttt tagttgccag
1021 cattcagttg ggcactctag aaaaactgcc ggtgataagc cggaggaagg tgtggatgac
1081 gtcaagtcct catggccctt acgggttggg ctacacacgt gctacaatgg tggtgacaat
166
1141 gggttaatcc caaaaagcca tctcagttcg gattggggtc tgcaactcga ccccatgaag
1201 tcggaatcgc tagtaatcgc gtaacagcat gacgcggtga atacgttccc gggccttgta
1261 cacaccgccc gtcacaccat gggaattgga tctacccgaa ggtggtgcgc caacctgcaa
1321 a
Tab. 123: DNA-Sequenz von Pseudorhodobacter spec. KOPRI 25878 aus der Datenbank BLAST
Ralstonia pickettii strain B1RO1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ689181.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Ralstonia
Origin:
1 catgcaagtc gaacggcagc atgatctagc ttgctagatt gatggcgagt ggcgaacggg
61 tgagtaatac atcggaacgt gccctgtagt gggggataac tagtcgaaag attagctaat
121 accgcatacg acctgagggt gaaagtgggg gaccgcaagg cctcatgcta taggagcggc
181 cgatgtctga ttagctagtt ggtgaggtaa aggctcacca aggcgacgat cagtagctgg
241 tctgagagga cgatcagcca cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca
301 gcagtgggga attttggaca atgggcgaaa gcctgatcca gcaatgccgc gtgtgtgaag
361 aaggccttcg ggttgtaaag cacttttgtc cggaaagaaa tggctctggt taatacctgg
421 ggtcgatgac ggtaccggaa gaataaggac cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa
481 tacgtagggt ccaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgtgcgca ggcggttgtg
541 caagaccgat gtgaaatccc cgagcttaac ttgggaattg cattggtgac tgcacggcta
601 gagtgtgtca gaggggggta gaattccacg tgtagcagtg aaatgcgtag agatgtggag
661 gaataccgat ggcgaaggca gccccctggg ataacactga cgctcatgca cgaaagcgtg
721 gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgccct aaacgatgtc aactagttgt
781 tggggattca tttccttagt aacgtagcta acgcgtgaag ttgaccgcct ggggagtacg
841 gtcgcaagat taaaactcaa aggaattgac ggggacccgc acaagcggtg gatgatgtgg
901 attaattcga tgcaacgcga aaaaccttac ctacccttga catgccacta acgaagcaga
961 gatgcattag gtgctcgaaa gagaaagtgg acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc
1021 gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccttgtctc tagttgctac
1081 gaaagggcac tctagagaga ctgccggtga caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa
1141 gtcctcatgg cccttatggg tagggcttca cacgtcatac aatggtgcat acagagggtt
1201 gccaagccgc gaggtggagc taatcccaga aaatgcatcg tagtccggat cgtagtctgc
1261 aactcgacta cgtgaagctg gaatcgctag taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata
1321 cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc acaccatggg agtgggcttt accagaagta
1381 gttagcctaa ccgcaaggag ggcgatacca cggtagt
Tab. 124: DNA-Sequenz von Ralstonia pickettii B1RO1 aus der Datenbank BLAST
Rhizobiales bacterium SK12 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ773444.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales
Origin:
1 agagtttgat cctggctcag aacgaacgct ggcggcaggc ttaacacatg caagtcgaac
61 gcaccttcgg gtgagtggca gacgggtgag taacgcgtgg gaacgtgcct ttcggtctgg
121 aataacccag ggaaacttgg gctaataccg gatacgccct ccgggggaaa gatttatcgc
181 cgaaagatcg gcccgcgtcg gattagcttg ttggtggggt aatggcctac caaggctacg
241 atccgtagct ggtctgagag gatgatcagc cacactggga ctgagacacg gcccagactc
301 ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatggggga aaccctgatc cagccatgcc
361 gcgtgagtga agaaggcctt agggttgtaa agctctttca gcggggaaga taatgacggt
421 acccgcagaa gaagccccgg ctaactccgt gccagcagcc gcggtaatac ggagggggct
481 agcgttgttc ggaattactg ggcgtaaagc gcgcgtaggc ggactttcaa gtcaggggtg
541 aaatcccgag gcttaacctc ggaactgcct ttgatactgt tggtcttgag tccgggagag
601 gtgagcggaa ttcctagtgt agaggtgaaa ttcgtagata ttaggaagaa caccagtggc
661 gaaggcggct cactggcccg gtactgacgc tgaggcgcga aagcgtgggg agcaaacagg
721 attagatacc ctggtagtcc acgccgtaaa cgatggatgc tagccgtcgg tcagcatgct
781 gatcggtggc gcagctaacg cattaagcat cccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa
841 aactcaaagg aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaggc
901 aacgcgaaga accttaccag cccttgacat cccggtttgg ggaccagaga tggaccccat
961 ttaacgccgg tgacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt
1021 aagtcccgca acgagcgcaa cccctaccat tagttgccag cattaagttg ggcactctag
1081 tgggactgcc ggtgataagc cggaggaagg tggggatgag gtcaagtcat catggccctt
1141 acgggctggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacaga gggcagccac tcggcgacga
1201 ggagctaatc cctaaaaacc gtctcagttc ggattgttct ctgcaactcg agagcatgaa
1261 gtcggaatcg ctagtaatcg cggatcagca tgccgcggtg aatacgttcc cgggccttgt
1321 acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ctttacccga agacggtgcg ctaacctcgc
1381 aagaggaggc agccggccac ggtagggtca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtaat
1441 ctgc
Tab. 125: DNA-Sequenz von Rhizobiales bacterium SK12 aus der Datenbank BLAST
Rhizobium spec. TB2-10-I 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: AY599702.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Rhizobium
Origin:
1 cgaacgctgg cggcaggctt aacacatgca agtcgagcgc cccgcaaggg gagcggcaga
167
61 cgggtgagta acgcgtggga atctacccat ctctacggaa taactcaggg aaacttgtgc
121 taataccgta tacgccctta gggggaaaga tttatcggag atggatgagc ccgcgttgga
181 ttagctagtt ggtggggtaa aggcctacca aggcgacgat ccatagctgg tctgagagga
241 tgatcagcca cattgggact gagacacggc ccaaactcct acgggaggca gcagtgggga
301 atattggaca atgggcgcaa gcctgatcca gccatgccgc gtgtgtgatg aaggccttag
361 ggttgtaaag cactttcacc ggagaagata atgacggtat ccggagaaga agccccggct
421 aacttcgtgc cagcagccgc ggtaatacga agggggctag cgttgttcgg aattactggg
481 cgtaaagcgc acgtaggcgg atcgatcagt caggggtgaa atcccagagc tcaactctgg
541 aactgccttt gatactgtcg atctagagta tggaagaggt gagtggaatt ccgagtgtag
601 aggtgaaatt cgtagatatt cggaggaaca ccagtggcga aggcggctca ctggtccatt
661 actgacgctg aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac
721 gccgtaaacg atgaatgtta gccgtcgggt agtttactat tcggtggcgc agctaacgca
781 ttaaacattc cgcctgggga gtacggtcgc aagattaaaa ctcaaaggaa ttgacggggg
841 cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa cgcgcagaac cttaccagct
901 cttgacatcc cgatcgcgga cagtggagac attgtccttc agttaggctg gatcggtgac
961 aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga
1021 gcgcaaccct cgcccttagt tgccagcatt cagttgggca ctctaagggg actgccggtg
1081 ataagccgag aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttacg ggctgggcta
1141 cacacgtgct acaatggtgg tgacagtggg cagcgagacc gcgaggtcga gctaatctcc
1201 aaaagccatc tcagttcgga ttgcactctg caactcgagt gcatgaagtt ggaatcgcta
1261 gtaatcgcag atcagcatgc tgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt
1321 cacaccatgg gagttggttt tacccgaagg tagtgcgcta accgcaagga ggcagctaac
1381 cacggtaggg tca
Tab. 126: DNA-Sequenz von Rhizobium spec. TB2-10-I aus der Datenbank BLAST
Rhodobacter changlensis strain : JA139 16S ribosomal RNA, complete sequence
Acessions-Nr.: NR_042564.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Origin:
1 acctgcggcg gcctaccatg caagtcgaac gggaccttcg ggtctagtgg cggacgggtg
61 agtaacgcgt gggaacatgc ccaaaggtac gggatagcct cgggaaactg ggtgtaatac
121 cgtatgtgcc cttcggggga aagatttatc gcctttggat tggcccgcgt tggattaggt
181 agttggtggg gtaatggcct accaagccga cgatccatag ctggtttgag aggatgatca
241 gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaatctta
301 gacaatgggg gaaaccctga tctagccatg ccgcgtgatc gatgaaggcc ttagggttgt
361 aaagatcttt cagtggggaa gataatgacg gtacccacag aagaagcccc ggctaactcc
421 gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg ctagcgttat tcggaattac tgggcgtaaa
481 gcgcacgtag gcggatcgga aagttggggg tgaaatccca gggctcaacc ctggaactgc
541 cttcaaaact cccggtcttg aggtcgagag aggtgagtgg aattccgagt gtagaggtga
601 aattcgtaga tattcggagg aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggct cgatactgac
661 gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgccgta
721 aacgatgaat gccagtcgtc gggtagcatg ctattcggtg acacacctaa cggattaagc
781 attccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca
841 caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc aacccttgac
901 atggcagtga ccgttccaga gatggtcctt tctcgtaaga gacactgcac acaggtgctg
961 catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttcggttaa gtccggcaac gagcgcaacc
1021 cacgtcctta gttgccagca ttcagttggg cactctaggg aaactgccgg tgataagccg
1081 gaggaaggtg tggatgacgt caagtcctca tggcccttac gggttgggct acacacgtgc
1141 tacaatggta gtgacaatgg gttaatccca aaaagctatc tcagttcgga ttggggtctg
1201 caactcgacc ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgt aacagcatga cgcggtgaat
1261 acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gaattggttc tacccgaagg
1321 cggtgcgcca accagcaatg gaggcagccg accacggtag gatcagtgac tggggtagtt
Tab. 127: DNA-Sequenz von Rhodobacter changlensis JA139 aus der Datenbank BLAST
Rhodobacter megalophilus strain R6W-5-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ692104.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Origin:
1 ggactagtgg cggacgggtg agtaacgcgt gggaacgtac cttttgcttc ggaatagcct
61 cgggaaactg ggagtaatac cgaatgtgcc ctacggggga aagatttatc ggcaaaagat
121 cggcccgcgt tggattaggt agttggtggg gtaatggcct accaagccga cgatccatag
181 ctggtttgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga
241 ggcagcagtg gggaatctta gacaatgggc gcaagcctga tctagccatg ccgcgtgatc
301 gatgaaggcc ttagggttgt aaagatcttt cgtgggggaa gataatgacg gtaccccaag
361 aagaagcccc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg ctagcgttat
421 tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggattgga aagtcagagg tgaaatccca
481 gggctcaacc ttggaactgc ctttgaaact cccagtcttg aggtcgagag aggtgagtgg
541 aattccgagt gtagaggtga aattcgtaga tattcggagg aacaccagtg gcgaaggcgg
601 ctcactggct cgatactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata
661 ccctggtagt ccacgccgta aacgatgaat gccagtcgtc gggtagcatg ctattcggtg
721 acacacctaa cggattaagc attccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa
781 ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca
841 gaaccttacc aacccttgac atgggtatcg cgggatcaga gatggtcctt tcagttcggc
168
901 tggataccac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttcggttaa
961 gtccggcaac gagcgcaacc cacattttca gttgccatca ttcagttggg cactctggag
1021 aaactgccgg tgataagccg gaggaaggtg tggatgacgt caagtcctca tggcccttac
1081 gggttgggct acacacgtgc tacaatggtg gtgacaatgg gttaatccca aaaagccatc
1141 tcagttcgga ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgt
1201 aacagcatga cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg
1261 gaattggatc tacccgaagg tggtgctgc
Tab. 128: DNA-Sequenz von Rhodobacter megalophilus R6W-5-1 aus der Datenbank BLAST
Rhodobacter ovatus partial 16S rRNA gene, type strain JA234T
Acessions-Nr.: AM690348.2
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Origin:
1 tacagctgcc tgacacatgc aagtcgagcg aagtcttcgg acttagcggc ggacgggtga
61 gtaacgcgtg ggaacatacc caaaggtacg gaatagccct gggaaactgg gagtaatacc
121 gtatgtgccc ttcgggggaa agatttatcg cctttggatt ggcccgcgtt ggattaggta
181 gttggtgggg taatggccta ccaagccgac gatccatagc tggtttgaga ggatgatcag
241 ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag gcagcagtgg ggaatcttag
301 acaatgggcg caagcctgat ctagccatgc cgcgtgatcg atgaaggcct tagggttgta
361 aagatctttc aggtgggaag ataatgacgg taccaccaga agaagccccg gctaactccg
421 tgccagcagc cgcggtaata cggagggggc tagcgttatt cggaattact gggcgtaaag
481 cgcacgtagg cggattggaa agtcagaggt gaaatcccag ggctcaacct tggaactgcc
541 tttgaaactc ccagtcttga ggtcgagaga ggtgagtgga attccgagtg tagaggtgaa
601 attcgtagat attcggagga acaccagtgg cgaaggcggc tcactggctc gatactgacg
661 ctgaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa
721 acgatgaatg ccagtcgtcg ggcagcatgc tgttcggtga cacacctaac ggattaagca
781 ttccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaag gaattgacgg gggcccgcac
841 aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgcag aaccttacca acccttgaca
901 tgggtatcgc gggaccagag atggtccttt cagttcggct ggataccaca caggtgctgc
961 atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttcggttaag tccggcaacg agcgcaaccc
1021 acgtccttag ttgccagcat tcagttgggc actctaggga aactgccggt gataagccgg
1081 aggaaggtgt ggatgacgtc aagtcctcat ggcccttacg ggttgggcta cacacgtgct
1141 acaatggcag tgacaatggg ttaatcccaa aaagctgtct cagttcggat tggggtctgc
1201 aactcgaccc catgaagtcg gaatcgctag taatcgcgta acagcatgac gcggtgaata
1261 cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg aattggttct acccgaaggc
1321 ggtgcgccaa cctcgcaaga ggaggcagcc gaccacggta ggatcagtga ctggggtgag
1381 c
Tab. 129: DNA-Sequenz von Rhodobacter ovatus JA234T aus der Datenbank BLAST
Rhodobacter spec. CCBAU 10883 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HQ437162.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Origin:
1 tcttcggact tagcggcgga cgggtgagta acgcgtggga acatacccaa aggtacggaa
61 tagcctcggg aaactgggag taataccgta tgtgcccttc gggggaaaga tttatcgcct
121 ttggattggc ccgcgttgga ttaggtagtt ggtggggtaa tggcctacca agccgacgat
181 ccatagctgg tttgagagga tgatcagcca cactgggact gagacacggc ccagactcct
241 acgggaggca gcagtgggga atcttagaca atgggcgcaa gcctgatcta gccatgccgc
301 gtgatcgatg aaggccttag ggttgtaaag atctttcagc tgggaagata atgacggtac
361 cagcagaaga agccccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggggctag
421 cgttgttcgg aattactggg cgtaaagcgc acgtaggcgg attggaaagt cagaggtgaa
481 atcccagggc tcaaccttgg aactgccttt gaaactccca gtcttgagtt cgagagaggt
541 gagtggaatt ccgagtgtag aggtgaaatt cgtagatatt cggaggaaca ccagtggcga
601 aggcggctca ctggctcgat actgacgctg aggtgcgaaa gcgtggggag caaacaggat
661 tagataccct ggtagtccac gccgtaaacg atgaatgcca gacgtcgggc agcatgctgt
721 tcggtgtcac acctaacgga ttaagcattc cgcctgggga gtacggccgc aaggttaaaa
781 ctcaaaggaa ttgacggggg cccgcacaag cggtggagca tgtggtttaa ttcgaagcaa
841 cgcgcagaac cttaccaacc cttgacatgt ggatcgcgga accggagacg gttctttcag
901 ttcggctgga tccaacacag gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttc
961 ggttaagtcc ggcaacgagc gcaacccacg cctttagttg ccatcaggtt atgctgggca
1021 ctctaaagga actgccggtg ataagccgga ggaaggtgtg gatgacgtca agtcctcatg
1081 gcccttacgg gttgggctac acacgtgcta caatggtggt gacaatgggt taatcccaaa
1141 aagccatctc agttcggatt ggggtctgca actcgacccc atgaagtcgg aatcgctagt
1201 aatcgcgtaa cagcatgacg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca
1261 caccatggga attgggtcta cccgaaggcg gtgcgccaac cagcaatgga
Tab. 130: DNA-Sequenz von Rhodobacter spec. CCBAU 10883 aus der Datenbank BLAST
Rhodobacter spec. R-36943 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: FR691419.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Origin:
169
1 aatgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac gggtccttcg ggactagtgg
61 cggacgggtg agtaacgcgt gggaacatac cctttggtac gggatagcct cgggaaactg
121 ggtgtaatac cgtatgtgcc cttcggggga aagatttatc gccaaaggat tggcccgcgt
181 tggattaggt agttggtggg gtaatggcct accaagccga cgatccatag ctggtttgag
241 aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg
301 gggaatctta gacaatgggg gaaaccctga tctagccatg ccgcgtgatc gatgaaggcc
361 ttagggttgt aaagatcttt cagctgggaa gataatgacg gtaccagcag aagaagcccc
421 ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggaggggg ctagcgttat tcggaattac
481 tgggcgtaaa gcgcacgtag gcggatcgga aagtcagagg tgaaatccca gggctcaacc
541 ttggaactgc ctttgaaact cccggtcttg aggtcgagag aggtgagtgg aattccgagt
601 gtagaggtga aattcgtaga tattcggagg aacaccagtg gcgaaggcgg ctcactggct
661 cgatactgac gctgaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt
721 ccacgccgta aacgatgaat gccagacgtc gggcagcatg ctgttcggtg tcacacctaa
781 cggattaagc attccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa ggaattgacg
841 ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgca gaaccttacc
901 aacccttgac atggcagtga ccgttccaga gatggttctt tctcgtaaga gacactgcac
961 acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttcggttaa gtccggcaac
1021 gagcgcaacc cacgtcctta gttgccatca ttcagttggg cactctaggg aaactgccgg
1081 tgataagccg gaggaaggtg tggatgacgt caagtcctca tggcccttac gggttgggct
1141 acacacgtgc tacaatggca gtgacaatgg gttgatccca aaaagctgtc tcagttcgga
1201 ttggggtctg caactcgacc ccatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgcgt aacagcatga
1261 cgcggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gaattggttc
1321 tacccgaagg cggtgcgcca acctcgcaag aggaggcagc cgaccacggt aggatcagtg
1381 actggggtga agtcgtaaca aggtagccgt aggggaacc
Tab. 131: DNA-Sequenz von Rhodobacter spec. R-36943 aus der Datenbank BLAST
Rhodobacter spec. ZS2-22 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ195995.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter
Origin:
1 agagtttgat cctggctcag aatgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgaac
61 gagcccttcg gggttagtgg cggacgggtg agtaacgcgt gggaacatac ccaaaggtac
121 ggaatagtct cgggaaactg ggggtaatac cgtatgtgcc cttatgctgt agtggtgtaa
181 ggggaaagat ttatcgcctt tggattggcc cgcgttggat taggtagttg gtggggtaat
241 ggcctaccaa gccgacgatc catagctggt ttgagaggat gatcagccac actgggactg
301 agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tcttagacaa tgggcgcaag
361 cctgatctag ccatgccgcg tgatcgatga aggccttagg gttgtaaaga tctttcagat
421 gggaagataa tgacggtacc atcagaagaa gccccggcta actccgtgcc agcagccgcg
481 gtaatacgga gggggctagc gttattcgga attactgggc gtaaagcgca cgtaggcgga
541 tcagaaagtt ggaggtgaaa tcccagggct caaccttgga acggccttca aaactcctgg
601 tcttgagttc gagagaggtg agtggaattc cgagtgtaga ggtgaaattc gtagatattc
661 ggaggaacac cagtggcgaa ggcggctcac tggctcgata ctgacgctga ggtgcgaaag
721 cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgaatgccag
781 tcgtcagcaa gcatgcttgt tggtgacaca cctaacggat taagcattcc gcctggggag
841 tacggccgca aggttaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc ggtggagcat
901 gtggtttaat tcgaagcaac gcgcagaacc ttaccaaccc ttgacatgga tatcgcggac
961 ctggagacag gtctttcagt tcggctggat atcacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag
1021 ctcgtgtcgt gagatgttcg gttaagtccg gcaacgagcg caacccacac tcttagttgc
1081 cagcattcag ttgggcactc taggagaact gccggtgata agccggagga aggtgtggat
1141 gacgtcaagt cctcatggcc cttacgggtt gggctacaca cgtgctacaa tggtagtgac
1201 aatgggttaa tcccaaaaag ctatctcagt tcggattggg gtctgcaact cgaccccatg
1261 aagtcggaat cgctagtaat cgcgtaacag catgacgcgg tgaatacgtt cccgggcctt
1321 gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt ggttctaccc gacgacgctg cgctaacccg
1381 taagggaggc aggcggccac ggtaggatca gcgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc
1441 cgta
Tab. 132: DNA-Sequenz von Rhodobacter spec. ZS2-22 aus der Datenbank BLAST
Sarocladium kiliense strain CBS 122.29 18S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: HQ232198.1
Taxonomie:
Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Pezizomycotina; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreales;
mitosporic Hypocreales; Sarocladium
Origin:
1 tgtagtcata tgcttgtctc aaagattaag ccatgcatgt ctaagtataa gcaattatac
61 agcgaaactg cgaatggctc attatataag ttatcgttta tttgatagtg ccttactact
121 tggataaccg tggtaattct agagctaata catgctaaaa accccgactt cggaaggggt
181 gtatttatta gatacaaaac caatgccctt cggggctctt tggtgattca tgataactat
241 acgaatcgca cggccttgcg ccggcgatgg ttcattcaaa tttcttccct atcaactttc
301 gatgtttggg tattggccaa acatggttgc aacgggtaac ggagggttag ggctcgaccc
361 cggagaagga gcctgagaaa cggctactac atccaaggaa ggcagcaggc gcgcaaatta
421 cccaatcccg actcggggag gtagtgacaa taaatactga tacagggccc tttcgggcct
481 tgtaattgga atgagtacaa tttaaatccc ttaacgagga acaattggag ggcaagtctg
541 gtgccagcag ccgcggtaat tccagctcca atagcgtata ttaaagttgt tgtggttaaa
601 aagctcgtag ttgaaccttg ggcctggctg gccggtccgc ctcaccgcgt gcactggtcc
170
661 ggccgggcct ttccctctgt ggaaccccat acccttcact gggcgtggcg gggaaacagg
721 acatttactt tgaaaaaatt agagtgctcc aggcaggcct atgctcgaat acattagcat
781 ggaataataa aataggacgc gcggttctat tttgttggtt tataggaccg ccgtaatgat
841 taatagggac agtcgggggc atcagtattc aactgtcaga ggtgaaattc ttggatcagt
901 tgaagactaa ctactgcgaa agcatttgcc aaggatgttt tcattaatca ggaacgaaag
961 ttaggggatc gaagacgatc agataccgtc gtagtcttaa ccataaacta tgccgactag
1021 ggatcggacg gtgttattca tgacccgttc ggcaccttac gagaaatcaa agtgcttggg
1081 ctccaggggg agtatggtcg caaggctgaa acttaaagaa attgacggaa gggcaccacc
1141 aggggtggag cctgcggctt aatttgactc aacacgggga aactcaccag gtccagacac
1201 aataaggatt gacagattga gagctctttc ttgattttgt gggtggtggt gcatggccgt
1261 tcttagttgg tggggtgact tgtctgctta attgcgataa cgaacgagac cttaacctgc
1321 taaatagccc gcattgctcc ggcagtgcgc tggcttctta gagggacttt cggctcaagc
1381 cgaaggaagt ttgaggcaat aacaggtctg tgatgccctt agatgttctg ggccgcacgc
1441 gcgctacact gacggggtca gcgagttcct tggccgaaag gcccgggtaa tcttgttagc
1501 ccccgtcgtg ctggggatag agcattgcaa ttattgctct tcaacgagga atccctagta
1561 agcgcaagtc atcagcttgc gttgattacg tccctgccct ttgtacacac cgcccgtcgc
1621 tactaccgat tgaatggctc agtgaggcgt ccggactggc ccagggaggt gggcaactac
1681 cacccagggc cggaaagttc tccaaactcg gtcatttaga ggaagtaaaa gtcgtaacaa
1741 ggtctccgtt ggtgaaccag cggaggg
Tab. 133: DNA-Sequenz von Sarocladium kiliense CBS 122.29 aus der Datenbank BLAST
Sphingomonas spec. LC435 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ014557.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Sphingomonadales; Sphingomonadaceae; Sphingomonas
Origin:
1 tgcaagtcga acgaactctt cggagttagt ggcgcacggg tgcgtaacgc gtgggaatct
61 gcccttgggt acggaataac tcagagaaat ttgtgctaat accgtataat gacttcggtc
121 caaagattta tcgcccaagg atgagcccgc gtaagattag ctagttggtg gggtaaaagc
181 ctaccaaggc gacgatcttt agctggtctg agaggatgat cagccacact gggactgaga
241 cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg gcgaaagcct
301 gatccagcaa tgccgcgtga gtgatgaagg ccttagggtt gtaaagctct tttacccggg
361 atgataatga cagtaccggg agaataagct ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta
421 atacggaggg agctagcgtt gttcggaatt actgggcgta aagcgcgcgt aggcggtttt
481 ttaagtcaga ggtgaaagcc cggggctcaa ccccggaatt gcctttgaaa ctggaaaact
541 tgaatcttgg agaggtcagt ggaattccga gtgtagaggt gaaattcgta gatattcgga
601 agaacaccag tggcgaaggc gactgactgg acaagtattg acgctgaggt gcgaaagcgt
661 ggggagcaaa caggattaga taccctggta gtccacgccg taaacgatga taactagctg
721 tccgggttca tagaacttgg gtggcgcagc taacgcatta agttatccgc ctggggagta
781 cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acgggggcct gcacaagcgg tggagcatgt
841 ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt accagcgttt gacatcctga tcgcggatta
901 gagagatctt ttccttcagt tcggctggat cagtgacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag
961 ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caaccctcat ccctagttgc
1021 catcattcag ttgggcactc taaggaaact gccggtgata agccggagga aggtggggat
1081 gacgtcaagt cctcatggcc cttacgcgct gggctacaca cgtgctacaa tggcaactac
1141 agtgggcagc aacctcgcga ggggtagcta atctccaaaa gttgtctcag ttcggattgt
1201 tctctgcaac tcgagagcat gaaggcggaa tcgctagtaa tcgcggatca
Tab. 134: DNA-Sequenz von Sphingomonas spec. LC435 aus der Datenbank BLAST
Sphingomonas spec. Q5 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: FJ581440.1
Taxonomie: Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Sphingomonadales; Sphingomonadaceae; Sphingomonas
Origin:
1 gtcgaacgaa ggcttcggcc ttagtggcgc acgggtgcgt aacgcgtggg aatctgcccc
61 ttggttcgga ataacagtta gaaatgactg ctaataccgg atgatgacgt aagtccaaag
121 atttatcgcc aagggatgag cccgcgtagg attagctagt tggtgtggta agagcgcacc
181 aaggcgacga tccttagctg gtctgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg
241 cccagactcc tacgggaggc agcagtgggg aatattggac aatgggcgaa agcctgatcc
301 agcaatgccg cgtgagtgat gaaggcctta gggttgtaaa gctcttttac ccgggatgat
361 aatgacagta ccgggagaat aagctccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg
421 gagggagcta gcgttattcg gaattactgg gcgtaaagcg cacgtaggcg gctttgtaag
481 taagaggtga aagcccagag ctcaactctg gaattgcctt ttagactgca tcgcttgaat
541 catggagagg tcagtggaat tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaagaac
601 accagtggcg aaggcggctg actggacatg tattgacgct gaggtgcgaa agcgtgggga
661 gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca cgccgtaaac gatgataact agctgtccgg
721 ggacttggtc cttgggtggc gcagctaacg cattaagtta tccgcctggg gagtacggcc
781 gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg ggcctgcaca agcggtggag catgtggttt
841 aattcgaagc aacgcgcaga accttaccag cgtttgacat ggtaggacgg cttccagaga
901 tggattcctt cccttcgggg acctacacac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt
961 cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct cgcctttagt taccatcatt
1021 tagttgggta ctctaaagga accgccggtg ataagccgga ggaaggtggg gatgacgtca
1081 agtcctcatg gcccttacgc gctgggctac acacgtgcta caatggcaac tacagtgggc
1141 agcaatcccg cgagggtgag ctaatctcca aaagttgtct cagttcggat tgttctctgc
1201 aactcgagag catgaaggcg gaatcg
Tab. 135: DNA-Sequenz von Sphingomonas spec. Q5 aus der Datenbank BLAST
171
Sphingopyxis spec. Sco-B12 partial 16S rRNA gene
Acessions-Nr.: FN386734.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Sphingomonadales; Sphingomonadaceae; Sphingopyxis
Origin:
1 ggctcagaac gaacgctggc ggcatgctta acacatgcaa gtcgaacgag accttcgggt
61 ctagtggcgc acgggtgcgt aacgcgtggg aatctgccct taggtacgga ataactcaga
121 gaaatttgtg ctaataccgt atgatgtcga aagaccaaag atttatcgcc taaggatgag
181 cccgcgtaag attagcttgt tggtgaggta aaagctcacc aaggcgacga tctttagctg
241 gtctgagagg atgatcagcc acactgggac tgagacacgg cccagactcc tacgggaggc
301 agcagtgggg aatattggac aatgggcgaa agcctgatcc agcaatgccg cgtgagtgat
361 gaaggcctta gggttgtaaa gctcttttac cagggatgat aatgacagta cctggagaat
421 aagctccggc taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggagcta gcgttgttcg
481 gaattactgg gcgtaaagcg tacgtaggcg gttattcaag tcagaggtga aagcctggag
541 ctcaactcca gaactgcctt tgaaactaga tagctagaat cacggagagg ttagtggaat
601 tccgagtgta gaggtgaaat tcgtagatat tcggaagaac accagtggcg aaggcgacta
661 actggacgtg tattgacgct gaggtacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc
721 tggtagtcca cgccgtaaac gatgataact agctgttcgg gctctacgag cctgagtggc
781 gcagctaacg cattaagtta tccgcctggg gagtacggtc gcaagattaa aactcaaagg
841 aattgacggg ggcctgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgcaga
901 accttaccag cgtttgacat cctaatcgcg gttttcagag atgattacct tcagttcggc
961 tggattagtg acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa
1021 gtcccgcaac gagcgcaacc ctcgtcctta gttgccatca ttcagttggg cactctaagg
1081 aaactgccgg tgataagccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttac
1141 acgctgggct acacacgtgc tacaatggcg gtgacagtgg gcagcaaccg ggcgaccggt
1201 agctaatctc caaaaaccgt ctcagttcgg attgttctct gcaactcgag agcatgaagg
1261 cggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg ccgcggtgaa tacgttccca ggccttgtac
1321 acaccgcccg tcacaccatg ggatttggat tcacccgaag gcagtgcgct aaccgcaagg
1381 aggcagctga ccacggtggg tt
Tab. 136: DNA-Sequenz von Sphingopyxis spec. Sco-B12 aus der Datenbank BLAST
Stenotrophomonas rhizophila strain N-2 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ890538.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas
Origin:
1 tgcagtcgaa cggcagcaca gtaagagctt gctcttatgg gtggcgagtg gcggacgggt
61 gaggaataca tcggaatcta ccttttcgtg ggggataacg tagggaaact tacgctaata
121 ccgcatacga ccttcgggtg aaagcagggg accttcgggc cttgcgcgga tagatgagcc
181 gatgtcggat tagctagttg gcggggtaaa ggcccaccaa ggcgacgatc cgtagctggt
241 ctgagaggat gatcagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag
301 cagtggggaa tattggacaa tgggcgcaag cctgatccag ccataccgcg tgggtgaaga
361 aggccttcgg gttgtaaagc ccttttgttg ggaaagaaaa gcagtcggct aatacccggt
421 tgttctgacg gtacccaaag aataagcacc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat
481 acgaagggtg caagcgttac tcggaattac tgggcgtaaa gcgtgcgtag gtggttgttt
541 aagtctgttg tgaaagccct gggctcaacc tgggaattgc agtggatact gggcgactag
601 agtgtggtag agggtagtgg aattcccggt gtagcagtga aatgcgtaga gatcgggagg
661 aacatccatg gcgaaggcag ctacctggac caacactgac actgaggcac gaaagcgtgg
721 ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgcccta aacgatgcga actggatgtt
781 gggtgcaatt tggcacgcag tatcgaagct aacgcgttaa gttcgccgcc tggggagtac
841 ggtcgcaaga ctgaaactca aaggaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagtatgtg
901 gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatgtcgag aactttccag
961 agatggattg gtgccttcgg gaactcgaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt
1021 gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcctta gttgccagca
1081 cgtaatggtg ggaactctaa ggagaccgcc ggtgacaaac cggaggaagg tggggatgac
1141 gtcaagtcat catggccctt acgaccaggg ctacacacgt actacaatgg tagggacaga
1201 gggctgcaaa cccgcgaggg caagccaatc ccagaaaccc tatctcagtc cggattggag
1261 tctgcaactc gactccatga agtcggaatc gctagtaatc gcagatcagc attgctgcgg
1321 tgaatacgtt cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtt tgttgcacca
1381 gaagcaggta gcttaa
Tab. 137: DNA-Sequenz von Stenotrophomonas rhizophila N-2 aus der Datenbank BLAST
Stenotrophomonas spec. DD7 16S ribosomal RNA gene, partial sequence
Acessions-Nr.: JQ435720.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Stenotrophomonas
Origin:
1 gtaggcctaa ctacagcaag tcgaacggca gcacaggaga gcttgctctc tgggtggcga
61 gtggcggacg ggtgaggaat gcatcggaat ctactctttc gtgggggata acgtagggaa
121 acttacgcta ataccgcata cgacctacgg gtgaaagccg gggaccttcg ggcctggcgc
181 gaatgaatga gccgatgccc gattagctag ttggcggggt aagagcccac caaggcgacg
241 atcggtagct ggtctgagag gatgatcagc cacactggaa ctgagacacg gtccagactc
301 ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga caatgggcgc aagcctgatc cagccatacc
361 gcgtgggtga agaaggcctt cgggttgtaa agcccttttg ttgggaaaga aaagcagctg
421 gttaataccc ggttgttctg acggtaccca aagaataagc accggctaac ttcgtgccag
172
481 cagccgcggt aatacgaagg gtgcaagcgt tactcggaat tactgggcgt aaagcgtgcg
541 taggtggttg tttaagtctg tcgtgaaagc cctgggctca acctgggaat tgcgatggaa
601 actgggcgac tagagtgtgg cagaggatag tggaattcct ggtgtagcag tgaaatgcgt
661 agagatcagg aggaacatcc gtggcgaagg cgactgtctg ggccaacact gacactgagg
721 cacgaaagcg tggggagcaa acaggattag ataccctggt agtccacgcc ctaaacgatg
781 cgaactggat gttgggtgca atttggcacg cagtatcgaa gctaacgcgt taagttcgcc
841 gcctggggag tacggtcgca agactgaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc
901 ggtggagtat gtggtttaat tcgatgcaac gcgaagaacc ttacctggcc ttgacatgca
961 cggaactttc cagagatgga ttggtgcctt cgggaaccgt gacacaggtg ctgcatggct
1021 gtcgtcagct cgtgtcgtga gatgttgggt taagtcccgc aacgagcgca acccttgtcc
1081 ttagttgcca gcacgtaatg gtgggaactc taaggagacc gccggtgaca aaccggagga
1141 aggtggggat gacgtcaagt catcatggcc cttacggcca gggctacaca cgtactacaa
1201 tggtggggac agagggctgc aagccggcga cggtaagcca atcccagaaa ccctatctca
1261 gtccggattg gagtctgcaa ctcgactcca tgaagtcgga atcgctagta atcgcagatc
1321 agcattgctg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca caccatggga
1381 gtttgttgca ccagaagcag gtagcttaac cttcgggagg gcgcttgcca cggtgtggcc
1441 gatgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag ccgtatcgga agggcggctg gatcacctcc
1501 tt
Tab. 138: DNA-Sequenz von Stenotrophomonas spec. DD7 aus der Datenbank BLAST
Steroidobacter denitrificans strain FS 16S ribosomal RNA, partial sequence
Acessions-Nr.: NR_044309.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Sinobacteraceae; Steroidobacter
Origin:
1 gctcagattg aacgctggcg gcgtgcctaa cacatgcaag tcgagcggta acaggtgtag
61 caatacatgc tgacgagcgg cggacgggtg agtaacgctt gggaatctgc ctattagtgg
121 gggataactc ggggaaactc gagctaatac cgcatacgca ctacggtgga aagctgggga
181 ccgcaaggcc tggcgctaat agatgagccc aagtcggatt agctagttgg tagggtaatg
241 gcctaccaag gcgacgatcc gtaactggtc tgagaggacg accagtcaca ccggaactga
301 gacacggtcc ggactcctac gggaggcagc agtggggaat attggacaat gggcgaaagc
361 ctgatccagc gacgccgcgt gggtgaagaa ggcctgcggg ttgtaaagcc ctttcagtgg
421 ggaagaaaag cctcgagtga atacctcggg gtcttgacgt aacccataga agaagcaccg
481 gctaactctg tgccagcagc cgcggtaata cagagggtgc gagcgttaat cggaattact
541 gggcgtaaag cgcgcgtagg cggctttgca agtcggatgt gaaatccccg ggctcaacct
601 gggaactgca ttcgagactg cattgctaga gtatgggaga gggaagtgga atttcaggtg
661 tagcggtgaa atgcgtagat atctgaagga acatcagtgg cgaaagcgac ttcctggacc
721 aatactgacg ctcatgtgcg aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc
781 cacgccataa acgatgagaa ctggatgtcg ggagggttct gcctctcggt gtcgtagcta
841 acgcgttaag ttctccgcct ggggagtacg gccgcaaggt tgaaactcaa aggaattgac
901 ggggacccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac
961 ctggtcttga catcccagga atcctgcaga gatgcgggag tgccttcggg aacctggaga
1021 caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg
1081 agcgcaaccc ttgcccttag ttgccagcat tcagttggga actctaaggg gaccgccggt
1141 gacaaaccgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttatg accagggcta
1201 cacacgtgct acaatggcca gtacaaaggg ttgccaaccc gcgaggggga gctaatccca
1261 taaagctggt cgtagtccgg atcgcagtct gcaactcggc tgcgtgaagt cggaatcgct
1321 agtaatcgtg aatcagcatt gtcacggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc
1381 gtcacaccat gggagttgat tgcacca
Tab. 139: DNA-Sequenz von Steroidobacter denitrificans FS aus der Datenbank BLAST
Steroidobacter spec. ZUMI 37 gene for 16S rRNA, partial sequence
Acessions-Nr.: AB548216.1
Taxonomie:
Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Sinobacteraceae; Steroidobacter
Origin:
1 ttttaggaag ggtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcgtgcct aacacatgca
61 agtcgagcgg taacaggtgt agcaatacat gctgacgagc ggcggacggg tgagtaacgc
121 ttgggaatct gcctattagt gggggacaac ccggggaaac tcgggctaat accgcatacg
181 caccatggtg gaaagccggg gaccgcaagg cctggcgcta atagatgagc ccaagtcgga
241 ttagctagtt ggtagggtaa tggcctacca aggctacgat ccgtaactgg tctgagagga
301 cgaccagtca caccggaact gagacacggt ccggactcct acgggaggca gcagtgggga
361 atattggaca atgggggaaa ccctgatcca gcgacgccgc gtgggtgaag aaggcctgcg
421 ggttgtaaag ccctttcagt ggggaagaaa agcctcgagt taacacctcg gggtcttgac
481 gtaacccata gaagaagcac cggctaactc tgtgccagca gccgcggtaa tacagagggt
541 gcgagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgcgcgta ggcggctttg caagtcgggt
601 gtgaaatccc caggcttaac ctgggaactg cattcgagac tgcattgcta gagtatggga
661 gagggaagtg gaatttccgg tgtagcggtg aaatgcgtag atatcggaag gaacatcagt
721 ggcgaaagcg acttcctgga ccaatactga cgctcatgtg cgaaagcgtg gggagcaaac
781 aggattagat accctggtag tccacgccat aaacgatgac aactggatgt cgggagggtc
841 tgcctctcgg tgtcgtagct aacgcgttaa gttgtccgcc tggggagtac ggccgcaagg
901 ttgaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg
961 atgcaacgcg aagaacctta cctggtcttg acatcctagg aatcctgcag agatgcggga
1021 gtgccttcgg gaacctggag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat
1081 gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttaccctta gttgccagca ttaagttggg
173
1141 aactctaagg ggaccgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca
1201 tggcccttat gaccagggct acacacgtgc tacaatggcc ggtacaaagg gttgccaacc
1261 cgcgaggggg agccaatccc aaaaagccgg tcgtagtccg gatcgcagtc tgcaactcgg
1321 ctgcgtgaag tcggaatcgc tagtaatcgt gaatcagcga tgtcacggtg aatacgttcc
1381 cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttga ttgcaccaga agtaggtagc
1441 ctaaccgcaa ggagggcgct taccacggtg tggtcaatga ctggggtgaa gtcgtaacaa
1501 gtagccaa
Tab. 140: DNA-Sequenz von Steroidobacter spec. ZUMI 37 aus der Datenbank BLAST
174
7.5 Verzeichnis der Abbildungen
Seite:
Abb. 1 Habitus eines männlichen Individuums von Asellus
aquaticus (Lateralansicht) 5
Abb. 2 Habitus von Asellus aquaticus, ♀ (Dorsalansicht) 6
Abb. 3 Cladosporium herbarum aus einem deutschen
Trinkwasserverteilungssystemen 8
Abb. 4 Mobile Beprobungs- und Filterapparatureinheit der
Firma Scheideler Verfahrenstechnik GmbH 9
Abb. 5 Hälterungs- und Versuchsreaktor 10
Abb. 6 Myzel von Cladosporium herbarum auf Agar; nach
10 Wochen bei 25 °C im Brutschrank 11
Abb. 7 Lage des Pleopoden 2 (plp 2) am Pleotelson (plt) von
Asellus aquaticus, ♂ (Ventralansicht) 13
Abb. 8 Detailszeichnung Pleotelson von Asellus aquaticus,
♂ (Ventralansicht) und Detailszeichnung Pleopod 2
von Asellus aquaticus, ♂ 14
Abb. 9 Darmpräparation bei Asellus aquaticus (Ventralansicht) 15
Abb. 10 Trocknungsgefäß 16
Abb. 11 Getrocknete Asseldärme auf einem Probenteller 16
Abb. 12 Aufkonzentrierte (25 µm) Trinkwasserproben von einer
Entnahmestelle über einen Zeitraum von 12 Monaten 24
Abb. 13 Lichtmikroskopische Aufnahme Asselkot-Pellet und
Detritus 26
Abb. 14 Asellus aquaticus (Dorsalansicht) 26
Abb. 15 Lichtmikroskopische Aufnahme des 2. Pleopoden von
Asellus aquaticus (♂) 27
Abb. 16 Hydrantenspülung; Proasellus cavaticus, Detritus und
Rostpartikel 27
Abb. 17 Detailzeichnung Pleopod 2 von Proasellus cavaticus, ♂
und mikroskopisches Präparat des plp2 von Proasellus
cavaticus, ♂ 28
Abb. 18 Makroskopische Aufnahme von Proasellus cavaticus, ♂
(Dorsal- und Lateralansicht) 29
Abb. 19.1 Fressversuch mit Asellus aquaticus (Marmoricola spec.
und Aquabacterium commune) 33
175
Abb. 19.2 Fressversuch mit Asellus aquaticus (Marmoricola spec.
und Aquabacterium commune) 34
Abb. 20.1 Fressversuch mit Asellus aquaticus (Marmoricola spec.
und Cladosporium herbarum) 35
Abb. 20.2 Fressversuch mit Asellus aquaticus (Marmoricola spec.
und Cladosporium herbarum) 36
Abb. 20.3 Fressversuch mit Asellus aquaticus (Marmoricola spec.
und Cladosporium herbarum) 37
Abb. 21 Rasterelektronenmikroskopische Darmquerschnittsbilder,
Proasellus cavaticus (Netzspülung, Probe E1) 40
Abb. 22 EDX-Spektrum Probe E1, Messpunkt 1 41
Abb. 23 EDX-Spektrum Probe E1, Messpunkt 2 41
Abb. 24 Rasterelektronenmikroskopische Darmquerschnittsbilder,
Asellus aquaticus (Netzspülung, Probe Br1) 42
Abb. 25 EDX-Spektrum Probe Br1, Messpunkt 1 43
Abb. 26 EDX-Spektrum Probe Br1, Messpunkt 2 43
Abb. 27 EDX-Spektrum Probe Br1, Messpunkt 3 44
Abb. 28 Rasterelektronenmikroskopische Darmquerschnittsbilder,
Asellus aquaticus (Hungerversuch, Probe 12) 45
Abb. 29 EDX-Spektrum Probe 12, Messpunkt 1 46
Abb. 30 EDX-Spektrum Probe 12, Messpunkt 2 46
Abb. 31 Rasterelektronenmikroskopische Aufnahme eines Darm-
rohrs (vorderes Drittel) von Proasellus cavaticus (Netz-
spülung, Probe E45) 47
Abb. 32 EDX-Spektrum Probe E45, Messpunkt 47
Abb. 33 Fressversuch Asellus aquaticus / Cladosporium herbarum
(10P) 49
Abb. 34 Fressversuch Asellus aquaticus / Cladosporium herbarum
(11P) 50
Abb. 35 Hungerversuch Asellus aquaticus (12P) 51
Abb. 36 Hungerversuch Asellus aquaticus (13P) 52
Abb. 37 Fressversuch Asellus aquaticus / Schwarzerlenblätter
(B1P) 53
Abb. 38 Fressversuch Asellus aquaticus / Schwarzerlenblätter
(B2P) 54
176
Abb. 39 Freilandprobe Asellus aquaticus (Br1P) 56
Abb. 40 Freilandprobe Proasellus cavaticus (E1P) 57
Abb. 41 Freilandprobe Proasellus cavaticus (EIP) 58
Abb. 42 Freilandprobe Proasellus cavaticus (E45P) 59
Abb. 43 Freilandprobe Proasellus cavaticus (E1E) 60
Abb. 44 Freilandprobe Proasellus cavaticus (EVE) 61
Abb. 45 Freilandprobe Proasellus cavaticus (EVIE) 61
Abb. 46 Freilandprobe Proasellus cavaticus (E45E) 62
Abb. 47 Farbcodierung der übergeordneten Taxa 63
Abb. 48 Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse
Proben 10 und 11 64
Abb. 49 Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse
Proben 12, 13 und Br1 64
Abb. 50 Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse
Proben B1 64
Abb. 51 Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse
Proben E1, EI, EII, EV, EVI 65
Abb. 52 Übersichtsdarstellung der DNA-Analysenergebnisse
Proben E45, EIII, EIV, EVII, EVIII 65
Abb. 53 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 10P 99
Abb. 54 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 10P 99
Abb. 55 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 11P 100
Abb. 56 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 11P 100
Abb. 57 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-24; Probe 10E 100
Abb. 58 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-24; Probe 10E 101
Abb. 59 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-24; Probe 11E 101
Abb. 60 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-24; Probe 11E 101
Abb. 61 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 12P 102
Abb. 62 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 12P 102
Abb. 63 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe 13P 102
Abb. 64 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe 13P 103
Abb. 65 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B1P 103
177
Abb. 66 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B1P 103
Abb. 67 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B2P 104
Abb. 68 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B2P 104
Abb. 69 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B1E 104
Abb. 70 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B1E 105
Abb. 71 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe B2E 105
Abb. 72 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe B2E 105
Abb. 73 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe Br1P 106
Abb. 74 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe Br1P 106
Abb. 75 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe Br1E 106
Abb. 76 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe Br1E 107
Abb. 77 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E1P 107
Abb. 78 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E1P 107
Abb. 79 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIP 108
Abb. 80 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIP 108
Abb. 81 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIIP 108
Abb. 82 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIIP 109
Abb. 83 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E45P 109
Abb. 84 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E45P 109
Abb. 85 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIIIP 110
Abb. 86 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIIIP 110
Abb. 87 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EIVP 110
Abb. 88 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EIVP 111
Abb. 89 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E1E 111
Abb. 90 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E1E 111
Abb. 91 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVE 112
Abb. 92 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVE 112
Abb. 93 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVIE 112
Abb. 94 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVIE 113
Abb. 95 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe E45E 113
178
Abb. 96 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe E45E 113
Abb. 97 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVIIE 114
Abb. 98 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVIIE 114
Abb. 99 Sequenzlängen [Basenpaare] der Klone 1-48; Probe EVIIIE 114
Abb. 100 maximale Identität [Prozent] der Klone 1-48; Probe EVIIIE 115
179
7.6 Verzeichnis der Tabellen
Seite:
Tab. 1 Terminologie Crustacea 7
Tab. 2 Physikalische Wasserparameter während der Hälterung
der Isopoden in den Reaktoren 11
Tab. 3 Zusammensetzung der gebrauchsfertigen Agarplatten für
die Kultivierung von Cladosporium herbarum 17
Tab. 4 Puffer und Lösungen für die Gelelektrophorese 17
Tab. 5 Chemikalien für die Präparation der Isopoden, PCR und
Gelelektrophorese 18
Tab. 6 Zusammensetzung Taq PCR MasterMix 19
Tab. 7 Zusammensetzung der PCR-Ansätze für die Vervielfäl-
tigung der prokaryotischen DNA-Sequenzen 19
Tab. 8 Zusammensetzung der PCR-Ansätze für die Vervielfäl-
tigung der eukaryotischen DNA-Sequenzen (Fressversu-
che mit Cladosporium herbarum, Fungi) 20
Tab. 9 Zusammensetzung des PCR-Ansatzes für die Vervielfäl-
tigung der eukaryotischen DNA-Sequenzen (Freilandpro-
ben) 21
Tab. 10 Zuordnung der verwendeten Primer und Anzahl der Klone
für die DNA-Sequenzierung 22
Tab. 11 Ergebnisse der organoleptisch-physikalisch-chemischen
und biologischen Trinkwasseruntersuchung 25
Tab. 12 Streubereiche und Mittelwerte der maximalen Identitäten
(Prokaryota) 96
Tab. 13 Streubereiche und Mittelwerte der maximalen Identitäten
(Eukaryota) 98
Tab. 14 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe 10P 116
Tab. 15 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe 10E 116
Tab. 16 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe 11P 116
Tab. 17 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe 11E 118
Tab. 18 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe 12P 118
180
Tab. 19 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe 13P 119
Tab. 20 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe B1P 120
Tab. 21 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe B1E 121
Tab. 22 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe B2P 121
Tab. 23 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe B2E 123
Tab. 24 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe Br1P 123
Tab. 25 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe Br1E 123
Tab. 26 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe E1P 124
Tab. 27 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe E1E 125
Tab. 28 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe E45P 125
Tab. 29 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe E45E 127
Tab. 30 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EIP 127
Tab. 31 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EVE 127
Tab. 32 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EIIP 128
Tab. 33 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EVIE 128
Tab. 34 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EIIIP 128
Tab. 35 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EVIIE 129
Tab. 36 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EIVP 129
Tab. 37 Zuordnungen der Klon-Sequenz-Nummern zu den entspre-
chenden Taxa; Probe EVIIIE 129
181
Tab. 38 DNA-Sequenz von Achromobacter spec. CCUG 3353 130
Tab. 39 DNA-Sequenz von Aciditerrimonas spec. CH22-21 130
Tab. 40 DNA-Sequenz von Acidovorax spec. 'smarlab 133815' 130
Tab. 41 DNA-Sequenz von Acidovorax spec. S4 131
Tab. 42 DNA-Sequenz von Acinetobacter johnsonii 131
Tab. 43 DNA-Sequenz von Acremonium strictum DS1bioAY4a 132
Tab. 44 DNA-Sequenz von Aeromonas hydrophila QDC01 132
Tab. 45 DNA-Sequenz von Aeromonas hydrophila subsp.
hydrophila NBRC 13286 132
Tab. 46 DNA-Sequenz von Aeromonas salmonicida E84 133
Tab. 47 DNA-Sequenz von Aeromonas salmonicida ZHYYZ-5 133
Tab. 48 DNA-Sequenz von Aeromonas salmonicida subsp.
salmonicida NBRC 12659 134
Tab. 49 DNA-Sequenz von Aeromonas sobria M-T-TSA 98 134
Tab. 50 DNA-Sequenz von Aeromonas spec. c55(2012) 135
Tab. 51 DNA-Sequenz von Aeromonas spec. 156B 135
Tab. 52 DNA-Sequenz von Afipia spec. BALT12-S13 135
Tab. 53 DNA-Sequenz von Afipia spec. sptzw29 136
Tab. 54 DNA-Sequenz von Arenimonas spec. CH15-1 136
Tab. 55 DNA-Sequenz von Arthrobacter oxydans S32219 136
Tab. 56 DNA-Sequenz von Asellus aquaticus 137
Tab. 57 DNA-Sequenz von Aspergillus spec. 137
Tab. 58 DNA-Sequenz von Bradyrhizobium spec. RS-46 138
Tab. 59 DNA-Sequenz von Brevundimonas bullata strain
BW56UT1570 138
Tab. 60 DNA-Sequenz von Caulobacter vibrioides JCT-7 139
Tab. 61 DNA-Sequenz von Caulobacter spec. FWC08 139
Tab. 62 DNA-Sequenz von Caulobacter spec. ECN-2008 139
Tab. 63 DNA-Sequenz von Chitinibacter spec. SK16 140
Tab. 64 DNA-Sequenz von Cladosporium spec. 2 FW1PhC3-1 140
Tab. 65 DNA-Sequenz von Crenothrix polyspora 141
Tab. 66 DNA-Sequenz von Davidiella tassiana UFMGCB 3684 141
182
Tab. 67 DNA-Sequenz von Ectothiorhodospira spec. AM4 141
Tab. 68 DNA-Sequenz von Enterobacter cloacae MS-27 142
Tab. 69 DNA-Sequenz von Enterobacter cloacae subsp. cloacae
ENHKU01 142
Tab. 70 DNA-Sequenz von Enterobacter spec. HWE-103 142
Tab. 71 DNA-Sequenz von Enterobacter spec. S6BB 143
Tab. 72 DNA-Sequenz von Enterovibrio spec. 09BSKS-4 143
Tab. 73 DNA-Sequenz von Erwinia persicina mskrs1ap 144
Tab. 74 DNA-Sequenz von Erwinia rhapontici 144
Tab. 75 DNA-Sequenz von Exiguobacterium undae 144
Tab. 76 DNA-Sequenz von Flavobacterium denitrificans JS14-1 145
Tab. 77 DNA-Sequenz von Flavobacterium hercynium WB 4.2-78 145
Tab. 78 DNA-Sequenz von Flavobacterium resistens BD-b365 146
Tab. 79 DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. HME6120 146
Tab. 80 DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. R-36233 146
Tab. 81 DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. R7Sb-3-1 147
Tab. 82 DNA-Sequenz von Flavobacterium spec. 1126-1H-08 147
Tab. 83 DNA-Sequenz von Fusarium spec. ZLH-X6 148
Tab. 84 DNA-Sequenz von Gaiella occulta F2-233 148
Tab. 85 DNA-Sequenz von Geobacter metallireducens GS-15 149
Tab. 86 DNA-Sequenz von Gibberella moniliformis A-00149 149
Tab. 87 DNA-Sequenz von Haematobacter massiliensis H2136 150
Tab. 88 DNA-Sequenz von Hyphomicrobium facile subsp. tolerans
IFAM I-551 150
Tab. 89 DNA-Sequenz von Hyphomicrobium vulgare 150
Tab. 90 DNA-Sequenz von Hyphomicrobium spec. KC-IT-W2 151
Tab. 91 DNA-Sequenz von Methylobacterium zatmanii strain DSM
5688 151
Tab. 92 DNA-Sequenz von Methylocapsa aurea KYGT 152
Tab. 93 DNA-Sequenz von Methylocystis echinoides 2 152
Tab. 94 DNA-Sequenz von Methylosinus trichosporium KS21 152
Tab. 95 DNA-Sequenz von Microbacterium lacus R-43968 153
183
Tab. 96 DNA-Sequenz von Microbacterium oxydans IARI-K-83 153
Tab. 97 DNA-Sequenz von Microbacterium oxydans strain O-5 154
Tab. 98 DNA-Sequenz von Microbacterium paraoxydans 3200 154
Tab. 99 DNA-Sequenz von Micrococcus spec. HEXBA04 154
Tab. 100 DNA-Sequenz von Mycobacterium spec. S061 155
Tab. 101 DNA-Sequenz von Mycobacterium spec. 12/13.28 AW 155
Tab. 102 DNA-Sequenz von Naegleria spec. SUM3V/I 156
Tab. 103 DNA-Sequenz von Pantoea agglomerans CE21 156
Tab. 104 DNA-Sequenz von Pedomicrobium fusiforme DSM 5304 157
Tab. 105 DNA-Sequenz von Pedomicrobium manganicum ATCC
33121 157
Tab. 106 DNA-Sequenz von Pelomonas saccharophila NBRC
103037 158
Tab. 107 DNA-Sequenz von Phoma spec. ZHA 158
Tab. 108 DNA-Sequenz von Photobacterium spec. HAR72 159
Tab. 109 DNA-Sequenz von Pichia spec. LHY1 159
Tab. 110 DNA-Sequenz von Proasellus slavus / Proasellus
cavaticus 160
Tab. 111 DNA-Sequenz von Protacanthamoeba bohemica 160
Tab. 112 DNA-Sequenz von Pseudomonas denitrificans strain KH-1 161
Tab. 113 DNA-Sequenz von Pseudomonas fluorescens EvS4-B1 161
Tab. 114 DNA-Sequenz von Pseudomonas mandelii McBRA2 161
Tab. 115 DNA-Sequenz von Pseudomonas putida CY04 162
Tab. 116 DNA-Sequenz von Pseudomonas putida MC4 162
Tab. 117 DNA-Sequenz von Pseudomonas putida MPV2 163
Tab. 118 DNA-Sequenz von Pseudomonas putida SXMAs-6 163
Tab. 119 DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. gyq9 164
Tab. 120 DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. JCM 5415 164
Tab. 121 DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. NEAU-ST5-5 164
Tab. 122 DNA-Sequenz von Pseudomonas spec. R-41390 165
Tab. 123 DNA-Sequenz von Pseudorhodobacter spec. KOPRI 25878 165
Tab. 124 DNA-Sequenz von Ralstonia pickettii B1RO1 166
184
Tab. 125 DNA-Sequenz von Rhizobiales bacterium SK12 166
Tab. 126 DNA-Sequenz von Rhizobium spec. TB2-10-I 166
Tab. 127 DNA-Sequenz von Rhodobacter changlensis JA139 167
Tab. 128 DNA-Sequenz von Rhodobacter megalophilus R6W-5-1 167
Tab. 129 DNA-Sequenz von Rhodobacter ovatus JA234T 168
Tab. 130 DNA-Sequenz von Rhodobacter spec. CCBAU 10883 168
Tab. 131 DNA-Sequenz von Rhodobacter spec. R-36943 168
Tab. 132 DNA-Sequenz von Rhodobacter spec. ZS2-22 169
Tab. 133 DNA-Sequenz von Sarocladium kiliense CBS 122.29 169
Tab. 134 DNA-Sequenz von Sphingomonas spec. LC435 170
Tab. 135 DNA-Sequenz von Sphingomonas spec. Q5 170
Tab. 136 DNA-Sequenz von Sphingopyxis spec. Sco-B12 171
Tab. 137 DNA-Sequenz von Stenotrophomonas rhizophila N-2 171
Tab. 138 DNA-Sequenz von Stenotrophomonas spec. DD7 171
Tab. 139 DNA-Sequenz von Steroidobacter denitrificans FS 172
Tab. 140 DNA-Sequenz von Steroidobacter spec. ZUMI 37 172
185
7.7 Liste der Abkürzungen
♂ männliches Individuum
♀ weibliches Individuum
µl Mikroliter
µm Mikrometer
µS Mikrosiemens
a1 Antenulla
a2 Antenna
ad lat. „an, zu“
Al Aluminium
bp Basenpaare
C Kohlenstoff
Ca Calzium
CaCO3 Kalziumcarbonat
cm Zentimeter
cnts Counts
cth Cephalothorax
d Durchmesser
D Detritus
DNA Desoxyribonukleinsäure
dNTP Desoxynukleosidtriphosphat
EDTA Ethylendiamintetraessigsäure
EDX Energiedispersive Röntgenanalyse
en Endopodit
EPS Extrazelluläre polymere Substanzen
ex Exopodit
Fe Eisen
g Gramm
186
gen. pap. Genitalpapille
H Häufigkeit
H2O Wasser
I Individuendichte
K Konidie
keV Kiloelektronenvolt
Kt Konidienträger
kV Kilovolt
L Liter
M Molar
m³ Kubikmeter
MgCl2 Magnesiumchlorid
min Minuten
ml Milliliter
mm Millimeter
mM Millimolar
Mn Mangan
mx1 Maxillula
mx2 Maxilla
NaCl Natriumchlorid
nm Nanometer
O Sauerstoff
P Phosphor
PCR Polymerasekettenreaktion
plp Pleopod
plt Pleotelson
prot Protopodit
rDNA ribosomale Desoxyribonukleinsäure
REM Rasterelektronenmikroskop
s Sekunden
187
S Schwefel
S (16S, 18S) Svedberg; Sedimentationskoeffizient
Si Silizium
TAE Tris-Acetat-EDTA
tel Telson
thp Thorakopod
ths Thorakomer
TrinkwV Trinkwasserverordnung
Tris Tris(hydroxymethyl)-aminomethan
U Units
urp Uropod
V Volt
VE H20 vollentsalztes Wasser
x Mittelwert