Détermination de la structure primaire et de la capacité de codage du génome Molluscum contagiosum virus type 1

Robert Hadasch

Le docteur Med. Détermination de la structure primaire et de la capacité de codage du Molluscum Contagiosum Virus type 1 Genome entre les coordonnées génomiques 0.036 et 0.105 (12953 bp) né le 21.03.1967 à Klosterbrück examen de maturité le 10.06.1986 à Karlsruhe Toutes les tentatives de multiplication du virus effectuées sur des cultures cellulaires ou sur des modèles animaux ont été infructueuses jusqu'à présent et il n'est donc pas possible d'effectuer une étude plus approfondie du MCV par des méthodes virologiques standard.

Pour une caractérisation plus précise de ce virus pathogène humain,

thèse présentée la structure primaire et la capacité de codage du génome viral

de Molluscum Contagiosum Virus type 1 entre les coordonnées génomiques 0.036 et 0.105

(12953 bp) durchgeführt. À partir d'une banque génétique déjà établie de MCV 1, la séquence nucléotide des fragments HindIII Q (1352 bp), R (315bp), C (9513 bp) et M (1780 bp) localisés à l'extrémité gauche du génome viral a d'abord été déterminée selon la méthode décrite par Sanger. Déjà, la teneur en GC de plus de 62% dans l'ADN examiné a montré une différence structurelle notable entre le génome MCV et les autres virus de la variole (contenu en GC du virus Vaccinia et du virus Variola d'environ 34%).

En outre, une multitude de répétitions directes et inversées ainsi que des répétitions palindromes ont été réalisées.

Les structures de séquence sont trouvées. Le plus impressionnant est qu'il s'agissait d'une structure complexe.

La structure des clusters dans le CFragment HindIII entre les coordonnées génomiques 1802 et 2107. Il est composé de trois éléments d'ADN qui se succèdent de façon tandem, avec une boîte de 15 paires de bases (R3) constituée de 6 paires de base (Box R1) et de 9 paires de base (R2) chacune. L'ordre de ces boîtes d'ADN peut être déterminé comme suit: (5xR3) + 2xR2) + 1xR3) + 6xR2) + 1xR3) + 1xR2) + 8xR3).

Les analyses de séquence en fonction de la capacité de codage ont permis d'obtenir des résultats complémentaires grâce à l'assistance informatique.

Des séquences d'ADN qui correspondent aux séquences de promotion précoce et tardive des virus de la variole ont également été trouvées à proximité d'une partie des séquences d'ADN ouvertes de la taille de plus de 40 acides aminés.

Ainsi, il a été démontré que le virus Molluscum contagiosum est très susceptible de

utilise un appareil de reproduction correspondant à celui d'un autre virus de la variole. Aucune des protéines possibles examinées n'a pu être déterminée avec certitude en ce qui concerne son homologie avec les protéines connues jusqu'à présent, en particulier celles des virus du poumon. Au contraire, en raison de l'absence de concordance concernant les séquences de protéines dans les régions terminales du génome MCV, on peut supposer que des protéines sont codées qui déterminent les caractéristiques biologiques particulières de ce virus en ce qui concerne sa spécificité hôte et sa génétique, ainsi que son comportement lors de la réplication.

L'orastre de lecture ouvert (ORF) HM17 est codé par 3525 paires de bases pour une protéine possible de 1175 acides aminés, située dans le fragment HindIII C en 3 directions entre les coordonnées génomiques 3758 et 233. Il est précédé d'une distance de 22 nucléotides, une classique séquence de promotion précoce décrite pour les virus de Vaccinia. Le début de la séquence protéique est caractérisé par sa teneur élevée en seringue, le milieu est caractérisé par une ADN répétitive comprenant environ 130 acides aminés et donc par une séquence d'acides aminés composée exclusivement de glutamine et d'alanine. Dans le cadre de la comparaison de la séquence de protéines, aucune homologie claire n'a encore pu être établie, permettant de conclure une conclusion claire sur la fonction de cette protéine.

Pour la section génomique de MCV 1 étudiée dans le cadre de cette thèse,

Il s'agit donc d'identifier de nombreuses caractéristiques structurelles qui, d'une part, permettent de déterminer l'appartenance

Le virus Molluscum contagiosum appartient à la famille des virus de la variole.

Mais cela montre l'absence d'homologies, tant à l'échelle de l'ADN qu'au niveau des protéines, sur d'autres virus de la variole, le rôle particulier du MCV dans la famille des virus de la variole.