Explorarea tendintelor temporo-spatiale ale cheilor de cautare pentru cercetarea biomedicala folosind baza de date Medline/PubMed

REVISTA DE POLITICA ¸STIIN¸TEI ¸SI SCIENTOMETRIE — SERIE NOU˘ A Vol. 1, No. 4, Decembrie 2012, p. 281–292 Explorarea tendin¸telor temporo-spa¸tiale ale cheilor de c˘ autare pentru cercetarea biomedical˘ a folosind baza de date Medline/PubMed. (Exploring the temporo-spatial trends of keyword occurence using the Medline/Pubmed database) ALEXANDRU DAN CORLAN Spitalul Universitar de Urgen¸t˘a Bucure¸sti We announce a new version of the online data mining tool “Medline Trend” (http://dan.corlan.net/medlinetrend.html) that extends the yearly trends with spatial (geographic) statistics. In a nutshell, the user introduces a normal query, such as the name of a disease, and obtains counts of PubMed entries (papers) for each country and time interval. The country of origin is detected from the address (AD) field. In contrast with the date of publication, the presence and significance of at least one recognisable country name in the address field is more variable and the address field itself seems to only have been introduced in Medline about 20 years ago. For example, at the date of writing, in the 2008–2012 interval, only about 3.34 million entries out of 4.052 million had a recognisable country name. For earlier years, the rate is even lower. In this paper, we propose a number of indices that are not directly influenced by the address field variability. They are based on the relative value of one spatial index to others, computed for the same time interval or region. The annualised rate of change of the number of papers for a keyowrd and region over a time interval is the compund anual rate of change of the number of entries fulfilling the search criteria fitted to the actually observed counts. The relative interest is the proportion of entries on a topic (such as ‘tuberculosis’) in a geographical region and over a specified time interval compared to all entries originating from that region during the same time interval. We found that, at least for tuberculosis, there is a strong and consistent log-log relationship between the relative interest and the prevalence of the disease in that area and period. The interest–size corelation index is the Spearman (ρ) correlation between the absolute output of a country and the relative interest for a given keyword. It might grossly indicate whether a topic attracts more interest in countries with more rather than less developed scientific systems. It is for example 0.26 for ‘echocardiography’, -0.48 for ‘tuberculosis’, 0.72 for ‘stem cell’, 0.15 for ‘diabetes’, -0.06 for ‘malaria’. Spatiotemporal trends might sometimes provide insightful clues into the quantitative mechanisms that lead to adoption of a particular research thematic, but their application requires attension to numerous limitations and caveats, in addition to the usual limitations of paper count statistics. 1 Introducere În aceast˘ a lucrare prezent˘ am o nou˘ a versiune a unei aplica¸tii web de explorare cantitativ˘ a a informa¸tiilor din baza de date PubMed [1], varianta de Internet a bazei de date Medline. Aplica¸tia se nume¸ste “Tendin¸te Temporo-Spa¸tiale Medline” ¸si extinde statisticile anuale ale aplica¸tiei “Tendin¸te MedLine” (Medline Trend [2]), cu statistici pe ¸t˘ ari. Statisticile temporale au aplica¸tii cum ar fi dinamica r˘ aspândirii unor practici sau metode, sau evaluarea oportunit˘ a¸tilor de investi¸tii în cercetare ¸si în industrie [3–11]. Versiunea ‘spa¸tio-temporal˘ a’ diferen¸tiaz˘ a rezultatele (¸si) dup˘ a loca¸tia geografic˘ a a autorilor, men¸tionat˘ a în câmpul de adres˘ a al înregistr˘ arii Medline. În varianta curent˘ a, loca¸tia geografic˘ a este identificat˘ a prin ¸tara de origine. Principalul scop al lucr˘ arii prezente este s˘ a ghideze cititorul în interpretarea rezultatelor ob¸tinute cu acest instrument ¸si în evitarea unor erori comune. Vom începe cu o prezentare a bazei de date PubMed ¸si a particularit˘ a¸tilor tehnice ale con¸tinutului acesteia, precum ¸si ale interfe¸tei noastre, care sunt de natur˘ a s˘ a influen¸teze semnifica¸tia c˘ aut˘ arilor. Vom da câteva exemple de utiliz˘ ari ¸si vom discuta concluziile care se pot sau care nu se pot extrage din date de acest fel. 282 Alexandru Dan Corlan 2 Baza de date Medline/PubMed Baza de date PubMed [1] este gestionat˘ a de c˘ atre Biblioteca Na¸tional˘ a de Medicin˘ a din cadrul autorit˘ a¸tii federale de finan¸tare a cercetarii biomedicale din Statele Unite, “National Institutes of Health” ¸si include publica¸tiile biomedicale, ini¸tial începând cu anii ’50. Recent, a început extinderea sa retrospectiv˘ a pân˘ a la publica¸tiile din secolul al XIX-lea (de exemplu, ale revistei British Medical Journal), care sunt scanate ¸si f˘ acute accesibile online. 2.1 Con¸tinut PubMed cuprinde titluri, autori, rezumate ¸si afilia¸tii, iar recent ¸si informa¸tii despre cit˘ ari. Toate datele sunt accesibile public, gratuit. O propor¸tie important˘ a dintre articole sunt accesibile online integral, multe dintre ele în site-ul asociat “PubMedCentral”, în care depunerea manuscriselor care au primit finan¸tare public˘ a în SUA ¸si în alte ¸t˘ ari este obligatorie prin lege [13]. Pentru anii ’60, aproape jumatate dintre rezumate sunt ale unor lucr˘ ari în limba englez˘ a, cealalt˘ a jum˘ atate reprezentând titluri/rezumate în limba englez˘ a ale unor lucrari ap˘ arute în alte limbi [12]. De-a lungul anilor, propor¸tia înregistr˘ arilor de articole în limba englez˘ a a crescut progresiv, ajungând la aproape 90% în anii 2000, în vreme ce prezen¸ta celor în alte limbi a sc˘ azut continuu, cu excep¸tia celor în limba chinez˘ a, care încep s˘ a fie incluse tot mai frecvent de la mijlocul anilor ’90. Revistele sunt din domeniul “biomedical”, dar sensul termenului este foarte larg, incluzând toate domeniile ¸stiin¸telor fundamentale, disciplinelor inginere¸sti ¸si socio-umane care au o leg˘ atur˘ a cu medicina sau s˘ an˘ atatea precum ¸si reviste multidisciplinare. Întâlnim ¸si reviste ca “Journal of Physical Chemistry” sau “IEEE Transactions on Biomedical Engineering”. Cele mai multe sunt prezente ¸si în “Web Of Science” dar exist˘ a ¸si numeroase excep¸tii—prezente doar în PubMed. Din România sunt indexate câteva zeci de periodice. 2.2 Particularit˘ a¸ti ale c˘ aut˘ arii Datele pot fi extrase în mai multe formate, atât prin interfa¸ta de browser obi¸snuit˘ a, cât ¸si printr-o interfa¸t˘ a mai u¸sor de automatizat. Fiecare înregistrare (intrare, articol) este format˘ a dintr-un set de campuri identificate prin dou˘ a sau patru litere. Fiecare câmp con¸tine text, într-un format în general liber. C˘ aut˘ arile se pot face într-un limbaj destul de avansat, cu expresii logice care combin˘ a cuvinte (A) (B) Figura 1: (A). Propor¸tia înregistr˘ arilor PubMed care au un nume de ¸tar˘ a recognoscibil la adres˘ a, în procente, în func¸tie de anul public˘ arii. (B). Evolu¸tia num˘ arului total de înregistr˘ ari în PubMed (linia mai groas˘ a continu˘ a) ¸si respectiv a celor care au o men¸tiune recognoscibil˘ a a numelui de ¸tar˘ a (linia mai groas˘ a întrerupt˘ a), în func¸tie de anul public˘ arii. Dreptele ro¸sii (sau gri) reprezint˘ a regresia exponen¸tial˘ a pe intervalul 2001–2011. Anul apare pe abscis˘ a; num˘ arul de înregistr˘ ari, în mii, apare pe ordonat˘ a care este logaritmic˘ a. Se observ˘ a legea de cre¸stere exponen¸tial˘ a, cu minime fluctua¸tii, din ultimul deceniu. Explorarea tendin¸telor spa¸tio-temporale în PubMed 283 cheie pentru care se poate specifica ¸si o restric¸tie la un anumit câmp. Motorul de c˘ autare înlocuie¸ste termenii cheie introdu¸si de utilizator cu expresii mai complexe, care rezult˘ a din analiza semantic˘ a a fiec˘ arui termen. De exemplu, dac˘ a introducem acronimul ’QALY’, acesta este înlocuit prin formula detaliat˘ a: "quality-adjusted life years"[MeSH Terms] OR ("quality-adjusted"[All Fields] AND "life"[All Fields] AND "years"[All Fields]) OR "quality-adjusted life years"[All Fields] OR "qaly"[All Fields] formul˘ a care este prezentat˘ a ¸si utilizatorului, ¸si care, în general, face mult mai probabil ca rezultatele c˘ aut˘ arii s˘ a corespund˘ a inten¸tiilor sale. “MeSH Terms” (Medical Subject Headings) se refer˘ a la un dic¸tionar “ontologic” de cuvinte cheie pentru domeniul biomedical, dezvoltat de c˘ atre Biblioteca Na¸tional˘ a de Medicin˘ a în ultimele decenii. Pentru a c˘ auta numai articole publicate in anul 2003, de exemplu, introducem solicitarea “2003[dp]” (dp însemnând “date of publication”). Pentru a c˘ auta articole care men¸tioneaz˘ a la adres˘ a “România”, introducem “Romania[ad]”. Dac˘ a am introduce doar “Romania” am ob¸tine articole care men¸tioneaz˘ a “Romania” fie la adres˘ a, fie oriunde altundeva în text. Câmpul AD pare s˘ a fi fost introdus la sfâr¸situl anilor ’80 ¸si nu este completat la toate articolele. Înregistr˘ arile anterioare nu au câmpul AD. Adresa reprezint˘ a, în general, adresa de coresponden¸t˘ a a autorilor, a¸sa cum a fost specificat˘ a de ace¸stia. În ultimii ani (dupa 2009 probabil), tot mai multe înregistr˘ ari PubMed includ la câmpul AD mai multe din, sau toate, adresele men¸tionate la afilia¸tii, f˘ ar˘ a a indica îns˘ a ¸si asocierea cu fiecare autor în parte. Numele ¸t˘ arii din cadrul afilierii nu este întotdeauna prezent în adres˘ a. Mai exact, pentru cele 120 de ¸t˘ ari actuale pe care le lu˘ am în considera¸tie, la momentul scrierii acestor rânduri, sunt men¸tionate adrese pentru 10 milioane de articole, adic˘ a aproximativ jum˘ atate din înregistr˘ arile din toate timpurile. Figura 1A prezint˘ a procentul de lucr˘ ari care men- ¸tioneaz˘ a la câmpul de adres˘ a ¸tara, într-una din formele folosite de noi, fa¸t˘ a de num˘ arul total de lucr˘ ari dintr-un an. Am luat o list˘ a de 120 de ¸t˘ ari care sunt prezente în statisticile Scopus [14] ¸si am num˘ arat (automatizat) prezen¸ta numelor acestora. Suma num˘ arului de articole prezente, pe ani, raportat˘ a la suma tuturor articolelor din anul respectiv, este reprezentat˘ a prin fiecare bar˘ a de culoare închis˘ a ¸si respectiv prin bara de culoare deschis˘ a. Se observ˘ a c˘ a au avut loc dou˘ a modific˘ ari ale politicilor de înregistrare în aceast˘ a privin¸t˘ a, una prin 1988, când datele despre adrese au fost probabil introduse sistematic, ¸si una în 1995, de când datele, inclusiv ¸tara, au fost introduse în cele mai multe cazuri, posibil printr-o m˘ asur˘ a activ˘ a cum ar fi corectarea de c˘ atre curatorii bazei de date. Se observ˘ a c˘ a aceast˘ a propor¸tie s-a îmbun˘ at˘ a¸tit progresiv, dar în 2012 scade pu¸tin. Atribuim ipotetic aceast˘ a sc˘ adere duratei procesului de verificare ¸si corectare manual˘ a a ultimelor rezumate primite (este vorba probabil de rezumatele “in process”) pentru care înc˘ a nu s-a rezolvat satisf˘ ac˘ ator câmpul AD. Foarte multe adrese includ ini¸tial numai ora¸sul, eventual statul (în Statele Unite), dar f˘ ar˘ a numele ¸t˘ arii. 2.3 Num˘ arul total de înregistr˘ ari Num˘ arul total de înregistr˘ ari PubMed, anual, precum ¸si num˘ arul anual al celor cu un nume recognoscibil de ¸tar˘ a în câmpul [AD] este prezentat in figura 1B. Pentru perioada 2001–2011, datele au fost modelate prin regresie exponen¸tial˘ a, rezultând rate medii anuale compuse de cre¸stere de 6.4% ¸si respectiv 7.3%. Diferen¸ta între cei doi coeficien¸ti se explic˘ a prin includerea mai sistematic˘ a a indicatorilor de ¸tar˘ a în ultimii ani, motiv pentru care vom lua în considerare cel din urm˘ a coeficient ca rat˘ a medie compus˘ a de cre¸stere. 3 Indicatori structurali (relativi) Prin indicator structural în¸telegem aici o statistic˘ a rezultat˘ a din raportarea rezultatelor a dou˘ a c˘ aut˘ ari una fa¸t˘ a de alta, cum ar fi raportarea rezultatelor dintr-un an fa¸t˘ a de anul anterior sau a altor indicatori ai aceleia¸si ¸t˘ ari, în aceea¸si perioad˘ a de timp. Num˘ arul absolut de lucr˘ ari dintr-o ¸tar˘ a exprim˘ a în mare m˘ asur˘ a dimensiunea popula¸tiei ¸si a sistemului ¸stiin¸tific din ¸tara respectiv˘ a, precum ¸si aspecte mai subtile ¸si mai dificil de m˘ asurat, cum ar fi obiceiul de a publica în anumite tipuri de reviste spre deosebire, de exemplu, de practica pantent˘ arii sau public˘ arii de monografii. De asemenea, acest num˘ ar prezint˘ a fluctua¸tii datorate practicilor de men¸tionare sau nu a numelui ¸t˘ arii la adres˘ a precum ¸si altor cauze. În schimb, raportând între ele dou˘ a statistici privitoare la aceea¸si ¸tar˘ a, presupunem c˘ a într-o m˘ asur˘ a corect˘ am pentru aceste diferen¸te. De exemplu, rata de cre¸stere anual˘ a nu va fi influen¸tat˘ a de dimensiunea unei ¸t˘ ari, în primul rând, ci de prezen¸ta unor condi- ¸tii stimulative pentru cre¸sterea activit˘ a¸tilor de cercetare ¸si pentru interac¸tiunea cu sistemul ¸stiin¸tific interna¸tional, la scara corespunz˘ atoare ¸t˘ arii respective. Astfel, putem da exemple de rate înalte în ¸t˘ ari mai mari (China, Brazilia, Iran, Spania, Pakistan) sau mai mici (Albania, Tunisia, Serbia), de rate moderate în ¸t˘ ari mari (SUA, Fran¸ta, Japonia) sau mici (Ungaria, 284 Alexandru Dan Corlan Tabelul 1: Num˘ arul total de înregistr˘ ari PubMed din fiecare ¸tar˘ a, pe ani, în ordinea ratei anuale medii de cre¸stere (partea întâi) Tara 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 % Iran 273 404 565 876 1161 1636 2424 3747 4178 4737 5814 7092 35.28 Bosnia Herz. 5 15 23 39 76 85 104 126 114 160 201 183 33.95 Serbia 72 67 110 173 374 575 606 731 852 1057 1098 1320 33.69 Tunisia 66 93 99 172 205 269 372 558 739 877 1020 1102 31.54 Cambodia 4 1 8 9 23 21 27 28 25 35 33 39 28.93 Qatar 10 28 22 30 54 73 71 81 96 120 172 192 26.71 Algeria 22 25 19 30 46 48 77 83 134 156 144 165 24.37 Pakistan 177 195 264 341 378 562 630 733 963 1161 1378 1451 22.65 China 8279 10515 13519 18040 22619 29474 34816 40186 48629 57487 66440 76884 22.52 Montenegro 1 3 2 67 298 459 403 105 31 21 17 19 22.14 Mongolia 20 18 25 22 42 31 62 57 93 108 122 127 21.89 Albania 3 4 12 8 4 9 6 12 17 16 34 35 21.16 Cyprus 39 25 26 35 45 62 72 87 95 139 145 189 19.95 Malaysia 349 332 403 384 564 634 710 776 1215 1437 1875 2266 19.89 Nepal 52 70 68 151 129 162 276 287 270 302 332 341 19.51 Romania 184 172 233 259 310 322 409 493 595 759 1013 1162 19.22 Mali 6 14 22 23 22 32 43 44 38 42 56 73 18.83 R. of Korea 4033 4622 5201 6504 7826 9412 10644 12583 14959 17030 20672 24016 17.91 Portugal 823 888 1060 1206 1473 1799 2160 2487 2900 3220 3750 4525 17.3 Viet Nam 5 14 21 17 13 13 14 22 24 36 51 53 16.93 FRY Macedonia 23 59 51 36 43 82 103 110 124 108 125 168 16.27 Morocco 78 103 109 122 119 147 168 225 272 299 337 443 16.18 India 4702 5554 6258 7058 7737 9585 11151 13124 15244 17178 20507 24161 15.99 Brazil 3358 3826 4616 5261 6733 7898 9671 10811 12222 12924 14529 16193 15.96 Nicaragua 6 3 7 5 12 16 19 7 17 20 20 19 15.71 Azerbaijan 8 4 12 13 5 8 8 14 22 20 22 36 15.47 Colombia 186 193 279 279 302 380 477 512 590 674 784 851 15.44 Bangladesh 110 115 111 131 140 152 174 260 279 336 415 436 15.1 Peru 54 69 85 103 102 111 167 177 199 189 273 241 14.92 Egypt 608 745 727 852 866 996 1136 1373 1577 1910 2326 2746 14.28 Cameroon 41 57 67 74 77 83 115 127 124 155 167 214 14.26 Sri Lanka 64 67 88 104 121 133 119 149 200 237 234 257 13.92 Zambia 23 27 24 17 20 24 53 56 51 56 75 72 13.83 Syria 18 22 19 25 25 39 26 36 40 50 69 84 13.82 Luxembourg 41 52 48 44 65 90 74 79 103 120 145 185 13.75 Uganda 61 89 100 85 97 130 125 144 162 209 243 316 13.68 Libya 15 17 15 14 9 15 26 28 39 42 50 34 13.01 Singapore 1117 1117 1301 1512 1937 2328 2425 2575 2872 3126 3616 3986 12.94 Iraq 43 33 48 49 35 67 93 91 108 107 121 106 12.77 Sudan 30 44 51 54 66 74 70 86 101 110 110 137 12.70 Bolivia 12 12 13 8 5 15 21 27 29 28 28 26 12.35 Turkey 2840 3738 5081 6240 7561 8832 9383 10294 10522 10516 10471 11329 12.3 Nigeria 449 521 618 587 697 846 980 1095 1200 1359 1393 1550 12.26 Tanzania 72 91 86 79 92 107 163 165 170 212 208 221 11.88 Thailand 916 1047 1182 1221 1382 1891 2083 2215 2328 2467 2789 3080 11.86 Ghana 68 51 80 73 91 96 114 120 118 149 189 211 11.84 Taiwan 3681 4290 4577 5090 6100 7157 8031 8520 9571 10132 11339 12385 11.81 Greece 1858 2201 2429 2739 3289 3949 4794 5112 5474 5604 5644 5840 11.8 Ethiopia 71 86 112 108 106 118 114 149 181 208 250 261 11.77 Lithuania 74 94 203 342 380 380 371 379 318 314 341 339 11.45 Croatia 461 530 520 610 664 859 863 917 1039 1177 1372 1498 11.4 Ireland 1542 1616 1607 1764 2120 2242 2553 2944 3203 3553 4036 4420 10.85 Estonia 134 167 144 153 215 214 261 301 268 327 381 399 10.74 Jordan 205 221 285 266 315 367 391 443 479 559 571 552 10.36 Czech R. 1133 1212 1326 1496 1666 1939 2198 2423 2612 2702 2985 3047 10.29 Indonesia 104 85 102 104 103 123 165 155 153 214 248 250 10.25 Norway 1824 1999 1980 2236 2385 2900 3207 3475 3809 4149 4633 5066 10.24 Monaco 9 18 23 20 26 17 20 17 26 40 36 42 9.994 Oman 80 113 93 125 122 120 130 158 186 228 215 238 9.862 Ecuador 27 19 33 47 40 44 47 43 55 58 72 66 9.836 Yemen 18 19 18 22 24 31 23 26 30 42 60 40 9.727 Tr. Tobago 28 32 31 31 27 56 40 55 53 64 60 73 9.42 Tara 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 % Explorarea tendin¸telor spa¸tio-temporale în PubMed 285 Tabelul 2: Num˘ arul total de înregistr˘ ari PubMed din fiecare ¸tar˘ a, pe ani, în ordinea ratei anuale medii de cre¸stere (partea a doua) Tara 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 % Chile 617 614 700 789 828 1015 1051 1237 1253 1355 1367 1569 9.381 Slovakia 199 229 216 226 263 310 362 403 427 453 488 452 9.377 Spain 7942 9063 10254 10456 11746 13717 14902 15888 16933 18272 19835 21350 9.276 Gabon 21 20 24 25 29 35 31 29 32 46 49 60 9.239 Australia 8983 9682 9950 10858 12027 13371 15023 16357 17544 18911 20695 22873 9.154 Kenya 135 177 201 223 259 246 247 300 323 372 372 386 9.076 Philippines 68 70 98 108 89 117 96 128 156 151 162 187 8.919 U.A. Emirates 112 138 113 125 144 170 183 168 228 217 247 294 8.74 Latvia 33 46 44 44 50 50 60 56 65 63 76 121 8.675 Lebanon 367 433 385 461 508 574 679 678 747 792 822 848 8.555 Poland 2403 2931 3153 3770 4077 4523 4908 4943 5185 5380 5879 6628 8.533 South Africa 1175 1221 1182 1253 1352 1577 1741 1902 2165 2151 2370 2753 8.52 Uruguay 125 128 135 154 165 196 200 218 245 227 272 298 8.433 New Zealand 1617 1602 1712 1894 2163 2437 2511 2660 2944 3141 3368 3752 8.393 R. Moldova 9 4 6 16 8 14 10 10 11 12 18 15 8.162 Netherlands 8866 8989 9495 9873 10997 12673 13631 14351 15355 16852 18267 19619 8.077 Puerto Rico 131 148 133 198 205 188 247 245 270 286 297 275 8.05 Canada 14009 14550 15274 16635 17753 20107 22227 23807 25206 26841 27990 29480 7.648 Italy 14051 15708 16283 17775 19190 21137 22967 24906 26539 27513 29268 31072 7.57 Slovenia 536 469 466 514 530 682 703 746 824 872 916 989 7.455 Mexico 2254 2367 2644 2852 3164 3450 3856 3963 4433 4354 4432 4846 7.449 Denmark 3406 3584 3619 4092 4331 4545 4921 5069 5417 5747 6845 7512 7.137 Switzerland 5018 5186 5294 5729 6212 6854 7541 7944 8369 8861 9516 10307 7.136 Argentina 1572 1741 1883 1800 1874 1976 2316 2469 2550 2805 3197 3421 7.071 Belgium 3907 4337 4412 4736 5161 5806 6140 6536 6841 7194 7676 8169 6.973 Saudi Arabia 790 706 808 794 841 856 860 900 976 1139 1394 1795 6.792 Panama 37 46 49 44 58 51 51 64 83 67 67 84 6.518 Greenland 6 22 14 15 32 16 15 23 19 21 27 20 6.51 Paraguay 31 38 33 33 30 50 60 61 51 52 53 60 6.468 Togo 34 22 19 18 21 18 18 24 36 33 40 52 6.414 Germany 22962 24610 27189 26136 27886 31112 33036 35148 36069 38224 40565 42912 5.8 Austria 2783 3062 3148 3517 3611 3782 4058 4312 4389 4526 4917 5448 5.718 UK 36795 38654 39040 40849 43663 47840 51029 53777 56468 58368 61120 64337 5.53 France 16897 17440 18380 18039 19278 21254 22242 23509 26125 26670 27914 28891 5.47 Kuwait 176 194 232 248 255 306 287 302 320 296 315 344 5.443 Costa Rica 42 94 66 68 115 87 75 76 111 107 97 99 5.073 Hungary 1278 1404 1381 1528 1636 1791 1939 1973 1984 1990 2053 2191 4.963 USA 149k 153k 158k 166k 178k 191k 201k 204k 212k 217k 224k 231k 4.353 Bulgaria 302 326 351 388 393 425 478 547 509 448 463 437 4.065 Sweden 7063 7341 7344 7685 7892 8915 9232 9547 9563 9749 10078 10492 3.88 Israel 5186 5373 5664 6050 6335 6659 7020 7122 7183 7336 7566 7871 3.828 Botswana 28 31 28 27 27 30 35 29 26 40 40 45 3.626 Finland 3380 3553 3401 3563 3771 3883 4190 4294 4517 4480 4697 4724 3.477 Japan 35995 35970 36650 37530 38583 40439 40714 42390 43561 44255 45313 48896 2.765 Cuba 236 265 231 302 314 295 304 298 291 317 289 367 2.671 Gambia 36 42 29 31 36 34 45 37 44 40 45 45 2.635 Armenia 51 49 65 42 49 44 60 45 58 38 66 90 2.42 Senegal 97 85 91 101 70 127 88 104 106 84 97 147 2.214 Iceland 163 177 196 177 222 185 198 170 191 211 227 231 2.205 Madagascar 45 45 30 40 20 26 27 33 46 39 49 44 1.619 Kazakhstan 9 12 17 17 10 4 10 9 12 14 12 14 — Kyrgyzstan 0 0 1 2 1 6 4 4 1 6 4 7 — Uzbekistan 18 32 24 34 20 15 9 20 18 28 24 23 -0.8716 Russia 2850 2887 3019 3236 2354 1955 1898 2050 2350 2446 2481 2531 -2.14 Ukraine 432 479 485 452 297 332 314 305 326 328 367 378 -2.831 Belarus 125 113 143 117 105 91 92 72 88 95 73 74 -5.145 Zimbabwe 133 95 84 72 49 63 69 56 56 44 71 60 -5.661 Tara 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 % 286 Alexandru Dan Corlan Tabelul 3: Indicele de interes (la 1000 de articole) pentru “WARFARIN” în perioada 2008–2012. List˘ a par¸tial˘ a. În 46 de ¸t˘ ari nu a ap˘ arut niciun articol cu Warfarina în aceast˘ a perioada. Alte 24 de ¸t˘ ari nu sunt prezentate în tabel Tara N Nqi.int Azerbaijan 112 1 8.929 Oman 995 6 6.030 Yemen 189 1 5.291 Tr. Tobago 256 1 3.906 Puerto Rico 1246 4 3.210 Iceland 976 3 3.074 Indonesia 1014 3 2.959 Nepal 1352 4 2.959 Peru 1040 3 2.885 Bosnia Hz. 744 2 2.688 Ghana 750 2 2.667 Lebanon 3594 9 2.504 New Zealand 14719 35 2.378 Canada 120579 251 2.082 Ireland 16418 34 2.071 Serbia 4984 10 2.006 Pakistan 5518 11 1.993 Israel 32630 63 1.931 Turkey 45962 88 1.915 USA 955706 1685 1.763 Bangladesh 1722 3 1.742 Jordan 2310 4 1.732 Croatia 5639 9 1.596 Saudi Arabia 6434 10 1.554 Sweden 43181 66 1.528 Norway 19433 29 1.492 Finland 19659 29 1.475 Qatar 682 1 1.466 Singapore 15485 22 1.421 Italy 125759 176 1.400 UK 262440 367 1.398 Australia 89075 121 1.358 Lithuania 1510 2 1.325 Japan 198592 251 1.264 Malaysia 8092 10 1.236 Mexico 20137 24 1.192 Greece 23857 27 1.132 Portugal 16390 18 1.098 Denmark 28468 30 1.054 Slovakia 1996 2 1.002 Ethiopia 1004 1 0.996 Czech R. 12392 12 0.968 Romania 4161 4 0.961 ... ... ... ... France 119460 70 0.586 China 287473 163 0.567 ... ... ... ... Netherlands 76398 39 0.510 Germany 172564 88 0.510 ... ... ... ... Spain 84278 36 0.427 ... ... ... ... TOTAL 3403046 4190 1.231 Bulgaria) ¸si de rate sc˘ azute în ¸t˘ ari mari (Rusia) sau mici (Madagascar). În ¸t˘ arile cu productivitate foarte redus˘ a, atunci când numitorul unui indicator este un num˘ ar mic, indicatorii relativi vor suferi fluctua¸tii importante, sau mai exact fluctua¸tiile num˘ ar˘ atorului se vor traduce în fluctua¸tii substan¸tiale ale indicatorului. Interpretarea datelor trebuie f˘ acut˘ a ¸tinând cont de acest efect posibil. 4 Num˘ arul de înregistr˘ ari ¸si dinamica acestuia pe ¸t˘ ari Tabelele 1 ¸si 2 prezint˘ a num˘ arul anual de înregistr˘ ari PubMed pentru fiecare dintre ¸t˘ arile considerate, sortate în ordinea ratei anuale medii de cre¸stere (sau sc˘ adere) compus˘ a pe perioada 2000–2011. Aproape toate¸t˘ arile au o cre¸stere anual˘ a a num˘ arului de înregistr˘ ari. Chiar ¸si ¸t˘ ari cu volume mari de publica¸tii, cum sunt Statele Unite, Marea Britanie sau Japonia, prezint˘ a cre¸steri anuale de 3–4%. România se num˘ ar˘ a între primele 20 de ¸t˘ ari din lume sub aspectul acestei cre¸steri, cu 19% în medie, în special datorit˘ a dubl˘ arii num˘ arului de articole între 2008 ¸si 2010. ¸T˘ arile din spa¸tiul fostei Iugoslavii au, de asemenea, cre¸steri foarte rapide, plauzibil datorit˘ a restaur˘ arii sistemului de cercetare dup˘ a tulbur˘ arile din cursul r˘ azboiului de la începutul anilor 2000. Pentru unele titulaturi de ¸t˘ ari, se impun îndoieli asupra clasific˘ arii pe baza identific˘ arii în înregistrarea de adres˘ a, motiv pentru care a trebuit, de exemplu, s˘ a nu includem în aceast˘ a statistic˘ a Georgia— multe dintre articolele care con¸tin “Georgia” la adres˘ a provenind, de fapt, din statul american Georgia. Un alt caz discutabil, care este inclus în tabel, este cel al statului Muntenegru, care într-o perioad˘ a a f˘ acut parte din statul numit ‘Serbia ¸si Muntenegru’ devenind ulterior independent. Din acest motiv, unele articole sunt num˘ arate ¸si la Serbia ¸si la Muntenegru în perioada 2003–2007, de unde rezultatul neobi¸snuit de mare pentru Muntenegru în aceast˘ a perioad˘ a. Explorarea tuturor acestor chestiuni de denumire a statelor ar necesita un efort de documentare istoric˘ a deosebit. Situa¸tii similare, dar mai pu¸tin frapante, ar putea afecta întrucâtva ¸si statisticile altor state din fosta Jugoslavie. 5 Indicele de interes Indicele de interes este raportul între num˘ arul de înregistr˘ ari care con¸tin un cuvânt cheie tematic (Nq) ¸si num˘ arul total de înregistr˘ ari pentru acela¸si interval Explorarea tendin¸telor spa¸tio-temporale în PubMed 287 Tabelul 4: Indicele de interes (la 1000 de articole) pentru “ACENOCOUMAROL” în perioada 2008– 2012. List˘ a complet˘ a Tara N Nqi.int Bosnia Hz. 744 2 2.688 Senegal 486 1 2.058 Morocco 1565 1 0.639 Greece 23857 15 0.629 Serbia 4984 3 0.602 Lebanon 3594 2 0.556 Bulgaria 1984 1 0.504 Netherlands 76398 33 0.432 Chile 6009 2 0.333 Poland 25767 8 0.310 Spain 84278 25 0.297 Romania 4161 1 0.240 Hungary 8892 1 0.112 Austria 20896 2 0.096 Belgium 32704 3 0.092 France 119460 9 0.075 Sweden 43181 3 0.069 Italy 125759 8 0.064 Mexico 20137 1 0.050 Switzerland 41181 2 0.049 India 87441 2 0.023 UK 262440 3 0.011 Germany 172564 1 0.006 US 955706 4 0.004 TOTAL 3403046 133 0.039 de timp în ¸tara respectiv˘ a (N), înmul¸tit aici cu 1000 pentru aprecierea mai facil˘ a. De exemplu, s˘ a consider˘ am tratamentele anticoagulante orale cumarinice, medicamente care se administreaz˘ a pentru prevenirea trombozelor ¸si a infarctelor consecutive, la pacien¸ti care au un risc crescut pentru astfel de evenimente. Trei preparate sunt mai folosite: Warfarina, Acenocumarolul (la noi comercializat ca Sintrom sau Trombostop) ¸si Fenprocumonul. Aproximativ 1% din popula¸tie prime¸ste, la un moment dat, unul din aceste medicamente în ¸t˘ arile cu sisteme de s˘ an˘ atate mai avansate ¸si în care vârsta medie este mai înaintat˘ a. Cea mai frecvent˘ a indica¸tie a anticoagulantelor, fibrila¸tia atrial˘ a—o boal˘ a a vârtei a treia—are o prevalen¸t˘ a mai ridicat˘ a în aceste ¸t˘ ari. Fiind medicamente cu indice terapeutic îngust, adic˘ a înregistrând o rat˘ a crescut˘ a de reac¸tii nedorite, chiar la doze terapeutice—în cazul acesta este vorba despre hemoragii—este necesar un control strict ¸si individualizat al dozelor ¸si regimului de administrare. Datorit˘ a complexit˘ a¸tii acestei probleme, este costisitoare antrenarea sistemului medical în controlul mai Tabelul 5: Indicele de interes (la 1000 de articole) pentru “PHENPROCOUMON” în perioada 2008– 2012. List˘ a complet˘ a Tara N Nqi.int Nepal 1352 1 0.740 Austria 20896 7 0.335 Germany 172564 47 0.272 Netherlands 76398 20 0.262 Denmark 28468 3 0.105 Greece 23857 1 0.042 Belgium 32704 1 0.031 Switzerland 41181 1 0.024 Sweden 43181 1 0.023 UK 262440 5 0.019 Spain 84278 1 0.012 France 119460 1 0.008 Canada 120579 1 0.008 Italy 125759 1 0.008 USA 955706 5 0.005 Japan 198592 1 0.005 China 287473 1 0.003 TOTAL 3403046 98 0.029 multor anticoagulante simultan. Astfel, în fiecare ¸tar˘ a s-a format, de-a lungul timpului, o ¸scoal˘ a care s-a focalizat în general pe unul dintre produse. Obiceiurile de utilizare se reflect˘ a ¸si în interesul pentru studierea fiec˘ aruia dintre medicamente. Warfarina este de departe cea mai bine studiat˘ a ¸si utilizat˘ a pe plan mondial, fiind introdus˘ a în practic˘ a înc˘ a din anii ’60. În perioada 2008–2012 s-au publicat studii despre Warfarin˘ a din 74 de ¸t˘ ari (tabelul 3), cele mai multe provenind din lumea anglosaxon˘ a. Indicele general de interes general este de 1.23 la mie, adic˘ a 0.123% din toate studiile biomedicale trateaz˘ a o chestiune conex˘ a cu Warfarina. Totu¸si, din 46 de ¸t˘ ari ale lumii nu s-a publicat în ultimii 5 ani niciun articol privitor la Warfarin˘ a ¸si (dup˘ a cum vom vedea) nici la alte anticoagulante. Acenocumarolul (Tabelul 4) ¸si Fenprocumonul (Tabelul 5) sunt în schimb studiate aproape exclusiv în Europa continental˘ a, cel din urm˘ a doar în nordul continentului, r˘ aspândire care se potrive¸ste, anecdotic, cu interesul local privind administrarea ¸si controlul acestuia. Men¸tion˘ am c˘ a în România se folosesc practic exclusiv preparatele care con¸tin Acenocumarol. Studiul local al acestor medicamente, ca ¸si al altora, este relevant deoarece profilul genetic ¸si patologic al unei popula¸tii influen¸teaz˘ a foarte mult r˘ aspunsul la tratament ¸si chiar ¸tintele terapeutice. Extrapolarea direct˘ a a rezultatelor ob¸tinute, de exemplu, pe o 288 Alexandru Dan Corlan Tabelul 6: Indicele de interes (la 1000 de articole) pentru “ECHOCARDIOGRAHY” în perioada 2008– 2012. List˘ a par¸tial˘ a din 101 ¸t˘ ari cu indice peste 0. ¸Tara N Nqi.int Kyrgyzstan 25 2 80.000 Monaco 153 11 71.895 Uzbekistan 95 4 42.105 Turkey 45962 1529 33.267 Montenegro 100 3 30.000 Bosnia Hz. 744 18 24.194 Romania 4161 96 23.071 Senegal 486 11 22.634 Yemen 189 4 21.164 Serbia 4984 85 17.055 Qatar 682 11 16.129 Oman 995 16 16.080 Poland 25767 395 15.330 Greece 23857 359 15.048 Italy 125759 1882 14.965 Cyprus 685 10 14.599 Egypt 9377 124 13.224 Luxembourg 652 8 12.270 Morocco 1565 19 12.141 Sudan 502 6 11.952 Nigeria 6054 71 11.728 Iran 24854 288 11.588 Saudi Arabia 6434 73 11.346 Lithuania 1510 17 11.258 Norway 19433 217 11.167 Nepal 1352 15 11.095 Gabon 193 2 10.363 Netherlands 76398 779 10.197 Israel 32630 328 10.052 Belgium 32704 318 9.724 Portugal 16390 159 9.701 Czech R. 12392 111 8.957 Azerbaijan 112 1 8.929 France 119460 1054 8.823 Japan 198592 1732 8.721 UAE 1056 9 8.523 Denmark 28468 242 8.501 Hungary 8892 75 8.435 Switzerland 41181 346 8.402 Croatia 5639 47 8.335 ... ... ... ... Slovakia 1996 16 8.016 R. of Korea 86627 690 7.965 Uruguay 1137 9 7.916 Mali 253 2 7.905 Albania 127 1 7.874 Germany 172564 1356 7.858 Iraq 535 4 7.477 ... ... ... ... Canada 120579 769 6.378 USA 955706 6076 6.358 ... ... ... ... UK 262440 1394 5.312 ... ... ... ... TOTAL 3403046 25818 7.587 Tabelul 7: Indicele de interes (la 1000 de articole) pentru “"MEDICAL PHYSICS"” în perioada 2008– 2012. List˘ a par¸tial˘ a, din 65 de ¸t˘ ari cu valori peste 0. ¸Tara N Nqi.int Ukraine 1626 19 11.685 Oman 995 10 10.050 Greece 23857 183 7.671 Ireland 16418 113 6.883 Iran 24854 150 6.035 Austria 20896 106 5.073 Canada 120579 541 4.487 Bosnia Hz. 744 3 4.032 Germany 172564 606 3.512 Armenia 300 1 3.333 Romania 4161 13 3.124 Cyprus 685 2 2.920 Belarus 364 1 2.747 Norway 19433 42 2.161 UK 262440 556 2.119 Italy 125759 248 1.972 USA 955706 1845 1.931 Belgium 32704 59 1.804 Denmark 28468 48 1.686 Sweden 43181 71 1.644 Hungary 8892 14 1.574 Luxembourg 652 1 1.534 Bulgaria 1984 3 1.512 Netherlands 76398 109 1.427 Cuba 1406 2 1.422 Australia 89075 117 1.313 Jordan 2310 3 1.299 New Zealand 14719 19 1.291 Switzerland 41181 51 1.238 Poland 25767 29 1.125 Lebanon 3594 4 1.113 Spain 84278 87 1.032 United Arab Emirates 1056 1 0.947 Taiwan 47476 39 0.821 Japan 198592 161 0.811 Puerto Rico 1246 1 0.803 India 87441 64 0.732 France 119460 81 0.678 Estonia 1490 1 0.671 Morocco 1565 1 0.639 Israel 32630 18 0.552 Mexico 20137 11 0.546 Slovenia 3956 2 0.506 Republic of Korea 86627 43 0.496 South Africa 10644 5 0.470 Saudi Arabia 6434 3 0.466 Serbia 4984 2 0.401 Malaysia 8092 3 0.371 Pakistan 5518 2 0.362 Colombia 3257 1 0.307 Brazil 61919 19 0.307 Argentina 13127 4 0.305 China 287473 79 0.275 ... ... ... ... TOTAL 3403046 5628 1.654 Explorarea tendin¸telor spa¸tio-temporale în PubMed 289 popula¸tie din Statele Unite la o popula¸tie din Asia de sud-est s-ar face cu o eroare, care se traduce în rate crescute de e¸sec al tratamentului ¸si de reac¸tii adverse [16]. Extrapolarea concluziilor privind un medicament (cum este Warfarina) la alt medicament (cum este Acenocumarolul) este, de asemenea, riscant˘ a. În sfâr¸sit, deprinderile de administrare ¸si control pentru medica¸tia anticoagulant˘ a se formeaz˘ a ideal sub coordonarea unor centre de standardizare ¸si monitorizare a practicii care î¸si construiesc, în principiu, competen¸ta prin cercetare. Pare plauzibil s˘ a presupunem c˘ a existen¸ta ¸si anvergura activit˘ a¸tii acestor centre ar fi m˘ asurabile ¸si prin volumul de publica¸tii. Ra¸tionamentele de mai sus sunt valabile în principiu pentru orice alt˘ a metod˘ a terapeutic˘ a sau diagnostic˘ a. Ne-am a¸stepta ca indicele de interes s˘ a fie corelat ¸si cu importan¸ta epidemiologic˘ a a bolilor ¸si a mijloacelor diagnostice ¸si terapeutice corespunz˘ atoare. Tabelul 6 prezint˘ a indicele de interes, pe ¸t˘ ari, pentru termenul de c˘ autare “ECHOCARDIOGRAPHY”, termen asociat unei metode larg folosite în cardiologie, de mai multe decenii. Aceast˘ a metod˘ a necesit˘ a o anumit˘ a capacitate de investi¸tii în dotarea tehnic˘ a. Este unul dintre exemplele de domenii în care indicele de interes în România se afl˘ a mult peste medie, fapt care se explic˘ a probabil prin inciden¸ta crescut˘ a a bolilor cardiovasculare la noi ¸si capacitatea relativ˘ a de investi¸tie în aceast˘ a aparatur˘ a. Un alt exemplu (Tabelul 7) este reprezentat de fizica medical˘ a. Termenul de “indice de interes” sugereaz˘ a o m˘ asur˘ a a interesului pentru un anumit subiect, dar acela¸si indicator—prevalen¸ta unei anumite c˘ aut˘ ari printre înregistr˘ arile provenind din aceea¸si ¸tar˘ a—poate fi folosit ¸si pentru determin˘ ari cu alt˘ a semnatic˘ a. Tabelul 8 prezint˘ a, ca un exemplu, prevalen¸ta articolelor care au men¸tionat˘ a o surs˘ a specific˘ a de finan¸tare (alta decât finan¸tarea implicit˘ a prin fonduri institu¸tionale), de exemplu printr-un grant. Vom numi acest indicator “indicele de finan¸tare competitiv˘ a”. Observ˘ am c˘ a România se situeaz˘ a departe de nivelul mediu mondial, de 489, fiind înspre extrema intervalului care caracterizeaz˘ a ¸tarile din Uniunea European˘ a, de¸si pare a converge c˘ atre nivelul mediu: acela¸si indicator a fost 211,7 în perioada 1998–2002 ¸si 214,2 în perioada 2003–2007. Observ˘ am c˘ a acest indicator a fost mai sc˘ azut doar în Grecia. Indicele de finan¸tare competitiv˘ a ar putea fi, ipotetic, influen¸tat de mai mul¸ti factori, cum ar fi: (1) balan¸ta între finan¸tarea institu¸tional˘ a ¸si cea specific˘ a (pe proiecte) din ¸tara respectiv˘ a; (2) m˘ asura în care finan¸t˘ arile prin competi¸tie au drept rezultat publicarea de articole; (3) capacitatea institu¸tiilor de cercetare de a atrage fonduri “extramurale”, adic˘ a fonduri care nu provin din bugetul de baz˘ a al institu¸tiei, indicele caracterizând împreun˘ a finan¸tarea din fonduri na¸tionale ¸si interna¸tionale, publice ¸si private. 6 Corela¸tia interesului cu gradul de dezvoltare Corela¸tia neparametric˘ a (indicele Spearman ρ) între interesul relativ ¸si num˘ arul total de înregistr˘ ari dintr-o ¸tar˘ a indic˘ a probabil cât de mult atrage un termen cheie interesul în ¸t˘ ari cu sisteme ¸stiin¸tifice mai dezvoltate fa¸t˘ a de ¸t˘ ari cu sisteme mai pu¸tin dezvoltate. Câteva exemple, pentru intervalul 2008–2012, sunt: -0.48 pentru ‘tuberculosis’; -0.29—HIV; -0.06 pentru ‘malaria’; 0.03—‘SPSS’; 0.15—‘diabetes’; 0.26—‘echocardiography’; 0.27—‘filariosis’; 0.42— ‘acenocoumarol’; 0.49—‘cancer’, ‘SAS package’; 0.53 pentru ‘warfarin’ sau ‘phenprocoumon’; 0.54— ‘pharmacogenetics’; 0.55—‘QALY’; 0.63—‘medical physics’, ‘R package’; 0.69—‘dabigatran’, ‘speckle tracking echocardiography’; 0.71—‘action potential’, ‘patch clamp’; 0.72—‘stem cell’; 0.73—‘ventricular repolarization’ sau ‘body surface potential mapping’. Termeni privind sistemul de cercetare: 0.16— ‘academy[ad]’; 0.21—‘research support’; 0.22—‘institute[ad]’; 0.23—‘foundation[ad]; 0.34—‘university[ad]’ sau ‘hospital[ad]’; 0.517—‘company[ad]’; 0.56—‘bibliometric’; 0.64—‘corporation[ad]. Valori mai apropiate de -1 indic˘ a un interes mai mare în ¸t˘ ari cu sisteme mai pu¸tin dezvoltate, în vreme ce spre 1 sunt subiecte de mai mare interes în ¸t˘ ari mai dezvoltate. Uneori, aceast˘ a asociere este influen¸tat˘ a în mod evident de diferen¸tele în profilul patologic ¸si demografic asociate dezvolt˘ arii sistemului ¸stiin¸tific, care este corelat ¸si cu dezvoltarea socioeconomic˘ a. 7 Corela¸tii cu indicatori nebibliometrici Clarificarea semnifica¸tiei descriptive sau predictive a indicatorilor bibliometrici necesit˘ a în general explorarea ¸si modelarea asocierii acestora cu indicatori nebibliometrici. În Figura 2 prezent˘ am rela¸tia între indicele de interes pentru c˘ autarea “TUBERCULOSIS” din fiecare ¸tar˘ a într-o perioad˘ a de 5 ani din jurul anului 2000 ¸si respectiv 2010 ¸si prevalen¸ta tuberculozei în anul 2000 ¸si respectiv 2010 în acea ¸tar˘ a (datele furnizate de Organiza¸tia Mondial˘ aaS˘ an˘ at˘ a¸tii [17]). Cu variabilele logaritmate, imaginea prezint˘ a o corela¸tie consistent˘ a, a¸steptat˘ a, între prevalen¸t˘ a ¸si interesul relativ pentru boala în cauz˘ a.