Les entrepôts de données

Journées GEDEOP-SIST25 La Rochelle - 09/09/2025 Présentation sur les entrepôts de données de recherche Définitions 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle «Un entrepôt de données de recherche (Research Data Repository ou Data Repository) est une infrastructure destinée à accueillir, conserver, rendre visibles et accessibles des données de recherche. Un entrepôt se distingue d’un catalogue, par sa capacité à assurer l’hébergement, la gestion et la curation des données et pas uniquement le système d’information (catalogage et exposition des métadonnées moissonnées à partir d’autres structures) »–CIRAD «Une infrastructure de stockage et de services facilitant le dépôt, la description, le partage en accès ouvert, la découverte et la réutilisation,par des humains ou des machines, de jeux de données propres à une communauté scientifique. Ces jeux de données sont associés à des métadonnées et sont conservés à moyen ou long terme »- RDG Un entrepôt se distingue d’un catalogue, par sa capacité à assurer l’hébergement, la gestion et la curation des données et pas uniquement le système d’information (catalogage et exposition des métadonnées moissonnées à partir d’autres structures). Acteurs et typologie des entrepôts •Types d'entrepôt de données (internationaux) ❑Thématique : GenBank (séquences d'ADN), UniProt (protéines) ; ❑Disciplinaire : PANGAEA (sciences de la terre et environnementales), Réseau Quetelet (sciences sociales) ; ❑Multidisciplinaire : Figshare, Zenodo (Europe), DRYAD; ❑Institutionnel : Edinburgh DataShare (Royaume-Uni), Open Data LMU (Allemagne), Merritt (Etats-Unis) ; ❑Spécifique d'un projet de recherche : Scientific Drilling Database (Programme continental de forage ICDP) 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle •Quelques acteurs: ❑RDA (International, Europe , France) - https://www.rd-alliance.org/ ❑EOSC (Europe) - https://eosc.eu/ ❑Mesr (France) ❑Institution et centres de recherche (CNRS, IRD, CIRAD, INRA, BRGM, Ifremer, … forte implication des services transversaux scientifiques et techniques) Quelques grands chantiers au niveau national Ouverture du plan national pour la science ouverte –2018 (1 ère édition) et 2021/2024 (2ème édition) La mise en œuvre d’infrastructures, d’entrepôts de données, de services et de formations pour l’ensemble des acteurs de la recherche Aujourd’hui … Un écosystème d’infrastructures et un périmètre parfois difficile à bien comprendre pour les chercheurs, les projets et programmes de recherches. •Disciplinaire : Easy Data (Sciences de la terre et environnement), InDoRES (Environnement et société), … •Institutionnel : DataVerse (INRA, CNRS, IRD, CIRAD, …) •Recherche Data Gouv •.. 1. Ecosystème DataSud (IRD) 2. Easy Data (Data Terra) 3. RDG –Entrepôts thématiques (Coso - MESR) 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle Ecosystème DataSuds : Entrepôts de données Moissonnage dataverse Infrastructure de données géographiques (IDG) ⚫Opensource & interopérable, développée par CampToCamp ⚫Intègre : ✓Catalogue de métadonnées ✓Serveur cartographique diffusant la donnée via des flux standardisés ✓Outil de visualisation cartograhique des données Entrepôts partenaires Identification des datasets avec auteurs IRD (veille) Moissonnage Application DOI2PMH (developpement IRD) Saisie des DOISaisie des DOI 2 entrepôts de données de recherche Collection IRD Entrepôt DataSuds Entrepôt DataSuds-Geo Moissonnage 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle Ecosystème DataSuds : Entrepôts de données DataSuds depuis 2019 −136 collections publiées dont 56 pour des UMR ⚫347 datasets publiés dont 75 % en total libre accès ⚫894 datasets moissonnés (81 issus d’entrepôts partenaires + 813 DataSuds-geo) −+ de 119000 téléchargements de données −+ de 34000 visiteurs uniques (12000 sur l’année 2024) −70 % de visiteurs étrangers en moyenne DataSuds-geo depuis fin 2023 −12 collections dont 8 pour des UMR IRD −1 collection de données patrimoniales de l’IRD (714 datasets) −813 datasets publiés dont 99,8 % libre accès Thématiques scientifques par collection 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle Ecosystème DataSuds : Entrepôts de données Entrepôts DataSuds & DataSuds-Geo Dépôt Relecture Curation Publication DOI Producteur Producteur révision Admin fonctionnel ou Référent données Modification Validation révision Admin fonctionnel ou Référent données conseil conseil ⚫Flux fonctionnel des données vers les entrepôts Les acteurs du dépôt de données: ⚫Les producteurs de données (IRD, partenaires d’UMR IRD, partenaires du Sud) ⚫Les référents données de recherche dans les unités (réseau de référents données IRD) ⚫L’administrateur fonctionnel ( accompagnement des déposants, formation, curation, publication, suivi fonctionnel applicatifs) finalisation Atelier de la donnée Montpellierain : ECODOR Contribuer à mettre en place un dispositif d’accompagnement des producteurs de données des collectifs de recherche de Montpellier: GT1 : « guichet unique » = outil « d’assistance » commun 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle Ecosystème DataSuds : Entrepôts de données Administration des applications Mission Science Ouverte Administrateur Fonctionnel Gestion des droits utilisateurs, tests applicatifs, remontée de bug, demande d’évolutions,... DSI IRD (DDUNI) Administrateurs Systèmes Déploiement, maintenance, montée de version, sécurité, backup,... Entrepôt DataSuds Entrepôt DataSuds-geo copil Groupe de travail inter-tutelles GeOchestra ⚫Partager les compétences ⚫Partager les besoins de développements ⚫Mutualiser les financements (développements CampToCamp) ⚫Avoir une infrastructure similaire Réseau RechercheDataGouv ⚫Echanges techniques avec les administrateurs ⚫Suivi des évolutions pour « s’aligner » ⚫Participation aux séminaires semestriels échanges techniques échanges techniques 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle 9 Une e-Infrastructure de recherche pour observer et comprendre de manière intégrée le système Terre et l’environnement €42m/an +1000 produits & services +15,000 utilisateurs 100,000 TB (2022/2023) DATA TERRA et PNDB centres de référence thématique Système Terre et Environnement 30 Centres de données et de services 32 Consortiums d'expertise scientifique 450 scientifiques, ingénieurs et techniciens 26 Organisations partenaires et universités 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle Sources: Hélène Bressan et Jean Christophe Desconnets Accès à la liste: https://recherche.data.gouv.fr/fr/entrepots Domaines Nombre d’entrepôts Astronomie 2 Biologie 14 Chimie 10 Physique 3 Sciences de l’environnement 7 Sciences humaines et sociales 17 ( dont 6 en archéologie) 52entrepôts au total 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle Pour aller plus loin: https://recherche.data.gouv.fr/fr/entrepots https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiancepour-la-diffusion-des-donnees-de-recherche-note-methodologique/ Nous contacter : [email protected] 09/09/2025 - Journées GEDEOP-SIST25 à la Rochelle Le groupe de travail de la Research Data Alliance Data Repository Attributes Working Group (DRAWG) en 2024 a éditer 17 critères d’attributs principaux (pas de critères d’exclusions, ni de recommandations) https://www.rd-alliance.org/groups/data-repository-attributes-wg/posts/?post=180802 Liens utiles : Journées GEDEOP-SIST25 Merci de votre attention