Les vocabulaires contrôlés
Abstract
Définition des termes du spectre des artefacts sémantiques : lexique, nomenclature, thésaurus, vocabulaire contrôlé, ontologie, taxonomie, registre. En quoi l'utilisation de ces artefacts répond aux principes FAIR, pourquoi faut-il les utiliser ? Exemple du vocabulaire mis en place par Data Terra, qui s'appuie sur différents vocabulaires (GCMD, GEMET, OZCAR-Theia, SI-Eau ...). Fédération de portails de vocabulaires : EarthPortal, AgroPortal ... reposant sur OntoPortal.
Full text
Journées GEDEOP –SIST25 –La Rochelle 09 septembre 2025 JOURNÉES GEDEOP - SIST25 LES VOCABULAIRES CONTRÔLÉS Hélène Bressan 9 septembre 2025
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 2 QUELLES DIFFÉRENCES ENTRE « LEXIQUES », « NOMENCLATURES », « THESAURUS », « VOCABULAIRES »
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 3 Lexiques & nomenclatures Nomenclature Instance de classification (code, tableau, liste, règles d'attribution d'identité...) faisant autorité et servant de référence dans un domaine donné (activité professionnelle, industrielle, discipline, …) Lexique Ensemble de mots assimilés à un glossaire
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 4 Lexiques & nomenclatures Nomenclature Instance de classification (code, tableau, liste, règles d'attribution d'identité...) faisant autorité et servant de référence dans un domaine donné (activité professionnelle, industrielle, discipline, …) Lexique Ensemble de mots assimilés à un glossaire Nomenclature des parties d'ouvrages d'art en béton armé et précontraint © 1976 SETRA-LCPC Exemple d’une nomenclature du BTP
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 5 Lexiques & nomenclatures Nomenclature Instance de classification (code, tableau, liste, règles d'attribution d'identité...) faisant autorité et servant de référence dans un domaine donné (activité professionnelle, industrielle, discipline, …) Lexique Ensemble de mots assimilés à un glossaire Nomenclature des parties d'ouvrages d'art en béton armé et précontraint © 1976 SETRA-LCPC Exemple d’une nomenclature du BTP Exemple nomenclature composés organiques
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 6 Lexiques & nomenclatures Nomenclature Instance de classification (code, tableau, liste, règles d'attribution d'identité...) faisant autorité et servant de référence dans un domaine donné (activité professionnelle, industrielle, discipline, …) Lexique Ensemble de mots assimilés à un glossaire Nomenclature des parties d'ouvrages d'art en béton armé et précontraint © 1976 SETRA-LCPC Exemple d’une nomenclature du BTP Exemple nomenclature composés organiques Exemple codes NAF
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Thesaurus et Taxonomie Thesaurus Recueil de termes contrôlés et normalisés d’un domaine et les organisant entre eux. Le thesaurus sert notamment à indexer des contenus ou des ressources avec des mots-clefs, facilitant la recherche. Considéré comme peu formel Taxonomie Terme très utilisé dans le monde anglo-saxon, désignant la « science de la classification », en pratique permettant de classifier hiérarchiquement des contenus ou des ressources, complètement adapté par exemple à classifier les taxons.
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Thesaurus et Taxonomie Source : http://accidental-taxonomist.blogspot.com/2020/11/what-it-thesaurus-and-what-is-it-good.html Thesaurus Recueil de termes contrôlés et normalisés d’un domaine et les organisant entre eux. Le thesaurus sert notamment à indexer des contenus ou des ressources avec des mots-clefs, facilitant la recherche. Considéré comme peu formel Taxonomie Terme très utilisé dans le monde anglo-saxon, désignant la « science de la classification », en pratique permettant de classifier hiérarchiquement des contenus ou des ressources, complètement adapté par exemple à classifier les taxons. Source : https://sist.cnrs.fr/sist22/ (cf. Atelier Vocabulaires contrôles et thésaurus)
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Thesaurus et Taxonomie Source : http://accidental-taxonomist.blogspot.com/2020/11/what-it-thesaurus-and-what-is-it-good.html Thesaurus Recueil de termes contrôlés et normalisés d’un domaine et les organisant entre eux. Le thesaurus sert notamment à indexer des contenus ou des ressources avec des mots-clefs, facilitant la recherche. Considéré comme peu formel Taxonomie Terme très utilisé dans le monde anglo-saxon, désignant la « science de la classification », en pratique permettant de classifier hiérarchiquement des contenus ou des ressources, complètement adapté par exemple à classifier les taxons. Source : https://sist.cnrs.fr/sist22/ (cf. Atelier Vocabulaires contrôles et thésaurus) « Vocabulaires »
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 16 Règles et principes d’un vocabulaire FAIR Ten simple rules for making a vocabulary FAIR (https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009041) Rule 1. Déterminer les modalités de gouvernance et le garant du vocabulaire Rule 2.Vérifiez que la licence du vocabulaire autorise la réutilisation et préférer une licence ouverte Rule 3. Vérifier l'exhaustivité et la cohérence des termes et des définitions dans le vocabulaire Rule 4. Établir la traçabilité et l’historique du contenu du vocabulaire Rule 5. Attribuer un identifiant unique et pérenne au vocabulaire et à chaque terme/Concept du vocabulaire Rule 6. Créer des représentations lisibles par machine des termes du vocabulaire Rule 7. Ajouter des métadonnées au vocabulaire Rule 8. Enregistrer et déclarer le vocabulaire dans un “Semantic Repository” Rule 9. Rendre le vocabulaire accessible aux humains et aux machines Rule 10. Mettre en œuvre un processus de publication des révisions du vocabulaire
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 17 VOCABULAIRES ET USAGES
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 18 Utilisation des vocabulaires - Partager le même langage J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Mispickel (FeAsS), près de Beaulieu Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur Beaulieu, alors, As, Fe, Pb, … Tiens, en creusant ici j’ai trouvé du fer ! J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Arsenopyrite What a great dalarnite ! Structuration Création ou collecte Traitement AnalyseConservation Accès Découverte et Réutilisation
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 19 Utilisation des vocabulaires - Partager le même langage J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Mispickel (FeAsS), près de Beaulieu Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur Beaulieu, alors, As, Fe, Pb, … Tiens, en creusant ici j’ai trouvé du fer ! J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Arsenopyrite What a great dalarnite ! Comprendre pour décrire des données et trouver les éléments similaires Structuration Création ou collecte Traitement AnalyseConservation Accès Découverte et Réutilisation
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 20 Utilisation des vocabulaires - Partager le même langage J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Mispickel (FeAsS), près de Beaulieu Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur Beaulieu, alors, As, Fe, Pb, … Tiens, en creusant ici j’ai trouvé du fer ! J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Arsenopyrite What a great dalarnite ! Comprendre pour décrire des données et trouver les éléments similaires Observations et mesures Structuration Création ou collecte Traitement AnalyseConservation Accès Découverte et Réutilisation
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 21 Utilisation des vocabulaires - Partager le même langage J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Mispickel (FeAsS), près de Beaulieu Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur Beaulieu, alors, As, Fe, Pb, … Tiens, en creusant ici j’ai trouvé du fer ! J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Arsenopyrite What a great dalarnite ! Comprendre pour décrire des données et trouver les éléments similaires Lieux Observations et mesures Structuration Création ou collecte Traitement AnalyseConservation Accès Découverte et Réutilisation
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 22 Utilisation des vocabulaires - Partager le même langage J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Mispickel (FeAsS), près de Beaulieu Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur Beaulieu, alors, As, Fe, Pb, … Tiens, en creusant ici j’ai trouvé du fer ! J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Arsenopyrite What a great dalarnite ! Comprendre pour décrire des données et trouver les éléments similaires Lieux minéraux Observations et mesures Structuration Création ou collecte Traitement AnalyseConservation Accès Découverte et Réutilisation
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 23 Utilisation des vocabulaires - Partager le même langage J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Mispickel (FeAsS), près de Beaulieu Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur Beaulieu, alors, As, Fe, Pb, … Tiens, en creusant ici j’ai trouvé du fer ! J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Arsenopyrite What a great dalarnite ! Comprendre pour décrire des données et trouver les éléments similaires Lieux minéraux Compositions chimiques Objet en fer Observations et mesures Structuration Création ou collecte Traitement AnalyseConservation Accès Découverte et Réutilisation
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 24 Utilisation des vocabulaires - Partager le même langage J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Mispickel (FeAsS), près de Beaulieu Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur Beaulieu, alors, As, Fe, Pb, … Tiens, en creusant ici j’ai trouvé du fer ! J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle Arsenopyrite What a great dalarnite ! Comprendre pour décrire des données et trouver les éléments similaires Lieux minéraux Compositions chimiques Objet en fer Observations et mesures Analysons les métaux lourds dans cet échantillon prélevé sur https://environment.data.gov.uk/c atchmentplanning/WaterBody/GB52070420 1400, alors, https://data.geoscience.fr/ncl/Obj ParSubs/3183, https://data.geoscience.fr/ncl/Obj ParSubs/3177, Pb, … J’observe dans sur cet affleurement, la présence potentielle https://data.geoscience.fr/ncl/Minls/22 (FeAsS), près de http://id.insee.fr/geo/commune/15020 J‘ai trouvé du https://data.ge oscience.fr/ncl /AnthroMat/62 J’observe sur cet affleurement, la présence potentielle https://data.geoscience.f r/ncl/Minls/22 What a great https://data.geoscie nce.fr/ncl/Minls/22 ! Structuration Création ou collecte Traitement AnalyseConservation Accès Découverte et Réutilisation
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 25 Point qualité A : - Identifiant : A - Nom : Qualité en aval - Localisation : Aval barrage d’Argentat - Observations : [NO3-], [PO43-], [O2 dissout] - Qualité chimique : Mauvaise Point qualité B : - Identifiant : B - Nom : Qualité en amont ville - Localisation : Beaulieu sur Dordogne - Observations : [NO3-], [PO43-], [O2 dissout], [Atrazine] , E.Coli - Qualité chimique : Bonne Utilisation des vocabulaires – harmoniser la structuration des données Point qualité C : - Identifiant : C - Nom : Apport Affluent la Cère - Localisation : Brétenoux - Observations : [NO3-], [PO43-], [O2 dissout], IBGN, Indice Diatomées - Qualité chimique : Très Bonne Jeu de données : qualité des eaux du bassin versant de la Dordogne
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 32 La « colonne vertébrale des vocabulaires » : structurée autour de l’observation https://terra-vocabulary.org/ncl/ Type de feature Variables Plateforme Type de capteurs Observation (ISO 19156 &SSN SOSA) Décrite par Portant sur « un objet du monde réel défini par » Obtenue en utilisant Acquise via https://vocab.aeris-data.fr/instrument https://vocab.aeris-data.fr/parameter https://vocab.aeris-data.fr/parameter https://vocab.aeris-data.fr/platform AERIS https://service.poleterresolide.fr/voc/platform https://service.poleterresolide.fr/voc/instrument https://service.poleterresolide.fr/voc/variable https://service.poleterresolide.fr/voc/foi FormaTerre https://vocab.nerc.ac.uk/collection/OD1/current/ ODATIS https://w3id.org/ozcar-theia/variables OZCAR-THEIA https://gcmd.earthdata.nasa.gov/
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 33 FOCUS SUR QUELQUES VOCABULAIRES
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Le GCMD (Global Change Master Directory Keywords) Définition : Les mots clefs du GCDM constituent un ensemble hiérarchique de vocabulaires contrôlés en sciences de la Terre. Ils contribuent à garantir une description cohérente et exhaustive des données, services et variables liés aux sciences de la Terre, et permettent une recherche précise des métadonnées et leur récupération ultérieure. Lancée il y a plus de vingt ans, le GCMD a un processus défini pour analyser régulièrement son contenu, en vérifier la pertinence et permettre son enrichissement en fonction des besoins des utilisateurs. Identification : https://gcmd.earthdata.nasa.gov/kms/concepts/root Version : 22.0 Périmètre d’application : Le GCMD est un thesaurus de haut niveau, largement partagé et utilisé par de nombreuses communautés. Gouvernance et administration : Un guide, The GCMD Keyword Governance and Community Guide Document version 1 a été publié en 2016 et permet de fournir les process de gouvernance et d’administration du vocabulaire Limites : Absence de définition pour certains termes Deux termes, même définition, identifiants différents et hiérarchie différente. (exemple : Soil Temperature)
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Le Thesaurus Pascal Définition : Vocabulaire contrôlé "Sciences de la Terre" utilisé pour l'indexation des références bibliographiques de la base de données PASCAL (1972 à 2015, http://pascal-francis.inist.fr/). Cette ressource comprend 10822 entrées regroupées en 60 collections. Identification : https://dx.doi.org/10.13143/lotr.7743 Version : 1.1 Périmètre d’application : Les terminologiques disponibles dans Loterre peuvent répondre à des besoins de fouille de texte, d’annotation sémantique, de recherche d’information ou de traduction. L’accès aux ressources de Loterre est ouvert à tous, l’utilisation ultérieure de chacune d’elle étant liée à la licence qui la régit. Gouvernance et administration : Documentation non retrouvée Limites : Absence de définition pour chacun des concepts Absence de lien vers d’autres thesaurus similaires
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 GEMET (GEneral Multilingual Environmental Thesaurus) Définition : GEMET, le Thésaurus général multilingue de l'environnement, est développé depuis 1995 comme outil d'indexation, de recherche et de contrôle pour le Centre thématique européen sur le catalogue des sources de données (CTE/CDS) et l'Agence européenne pour l'environnement (AEE). Il a été conçu comme un thésaurus « général », visant à définir un langage commun, un noyau de terminologie générale pour l'environnement. Identification : http://www.vocabularyserver.com/gemet/ Version : 4.2 Périmètre d’application : Utilisé pour la description des jeux de données, (on retrouve notamment les thèmes INSPIRE), facilite l’indexation et l’interrogation de documents, de jeux de données. Gouvernance et administration : L'AEE et Eionet, le réseau environnemental institutionnel de près de 40 pays européens, s'engagent à mettre à jour GEMET afin qu'il constitue une source de terminologie commune et pertinente. Les mises à jour sont établies selon des processus et principes définis. Des nouveaux concepts sont identifiés tous les deux ans en analysant les publications de l’Agence Européenne pour l’Environnement. (cf. https://www.eionet.europa.eu/gemet/fr/about/) Limites : thesaurus généraliste
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Vocabulaires définis dans le Système d’Information sur l’Eau Définition : Les jeux de données de référence établis par le Service d'administration nationale des données et référentiels sur l'eau (Sandre) sont des données alphanumériques ou géographiques régulièrement évolutives. Les vocabulaires du SIE correspondent aux données alphanumériques qui sont des listes de codes (par exemple, les codes des paramètres comme la demande en Chlore (1397), les méthodes, les intervenants, les nomenclatures , les stations de mesure...). Identification : Les vocabulaires établis par le Sandre sont accessibles via une httpsURI construite selon le pattern suivant : https://id.eaufrance.fr/{ID_Ref} Un concept spécifique est accessible via son httpsURI construite selon le pattern suivant https://id.eaufrance.fr/{ID_Ref}/{idConcept} Version : spécifique du vocabulaire sélectionné Périmètre d’application : Tout échange de données sur l’eau entrant dans le cadre du Système d’information sur l’Eau français et des Systèmes d’Informations Fédérateurs portés par l’Office Français de la Biodiversité. Le Schéma National des Données sur l'Eau (SNDE) définit le système des données publiques de l’eau et fonde sur celui-ci le SIE, son service d’information Eaufrance, en organise la gouvernance, décrit son référentiel technique et les modalités de son approbation. Il s’inscrit dans la démarche de modernisation de l’action publique engagée par l’Etat. Gouvernance et administration : Administration et gouvernance assurées par le Service d'administration nationale des données et référentiels sur l'eau (SANDRE). Limites : Périmètre d’application. La structuration et la sémantique des référentiels de données du SIE est spécifique à son domaine. (cf. Analyse FAIR établie dans le cadre du PC8 OneWaterData du PEPR OneWater et analyse réalisée dans le cadre du Pôle Inside)
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Thesaurus OZCAR/Theia Définition : Le Thésaurus Theia/OZCAR , créé en 2018, est un vocabulaire contrôlé décrivant des noms de variables et des objets d'intérêt utiles pour les sciences de l’environnement et la zone critique. Il a été développé pour soutenir des services efficaces de découverte de données et d'interopérabilité. Ses objectifs sont de rendre possible un service de découverte de données convivial grâce à des noms simplifiés de variables, d’offrir des descriptions précises des observations grâce à des noms détaillés de variables et de permettre la mise en œuvre de services standardisés d'échange de données d'observations de capteurs ou d’échantillon nécessitant de faire référence à des concepts dont l'observation fait l‘objet (variable observée et objets d‘intérêt) ou impliqués dans l’acte d’observation (type de capteur). Des alignements avec des termes d'autres thésaurus disciplinaires internationaux sont présents (EnvThes et GEMET). Identification : https://w3id.org/ozcar-theia/ Version : dernière modification en janvier 2024 Périmètre d’application : le thésaurus Theia/OZCAR, a été développé pour soutenir des services efficaces de découverte de données et d'interopérabilité. Compte tenu de la formalisation des variables en s’appuyant sur l’ontologie I-Adopt, ces concepts peuvent aussi être utilisés pour de la structuration de données. Gouvernance et administration : Thesaurus mis à jour par les auteurs. Absence de document sur l’administration et la gouvernance (cf. analyse FAIR du thesaurus établie dans le cadre du PC8 OneWaterData du PEPR OneWater) Limites : La traçabilité ainsi que l’historique du contenu du vocabulaire peuvent être renforcé, car à ce jour, le suivi des évolutions n’est pas disponible. Seule la dernière mise à jour est visible, sans possibilité d’identifier les modifications spécifiques apportées.
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 39 VOCABULAIRES ET CYCLE DE VIE
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 Création, évolution Formalisation Vérification thématique et sémantique Validation Publication et diffusion Découverte et Réutilisation 40 Thématiciens Thématiciens Thématiciens Experts métiers et sémantiques administrateur des vocabulaires Outil de gestion des évolutions du vocabulaire Outil de diffusion du vocabulaire Connexion - information EarthPortal Outil externe : Onto-Portal Evolution des vocabulaires – cycle de vie - outils https://earthportal.eu/
Journées GEDEOP – SIST25 – La Rochelle 09 septembre 2025 41 [email protected] Merci de votre attention