Introduction à la science ouverte

09 décembre 2025 Formation Introduction à la science ouverte 2Formation Science Ouverte 25 mars 2024 | La science ouverte, qu’est ce que c’est pour vous ? 3Formation science ouverte 07 avril 2025 | AgroParisTech La science ouverte désigne l’ensemble des principes et des actions qui facilitent l’ouverture et la libre dissémination, à destination de l’ensemble de la société, des productions de la recherche scientifique, ainsi que la transparence et l’ouverture des processus de la recherche. INRAE La Science Ouverte (Open Science) est un mouvement qui consiste à ouvrir le processus de recherche à tous types d’acteurs (partenaires, citoyens) et à rendre accessibles et réutilisables les produits de la recherche (publications scientifiques, données, logiciels, etc.) par la communauté scientifique et la société. Partager les résultats de recherche, non seulement entre scientifiques, mais aussi avec la société, est en effet le meilleur moyen de faire progresser la connaissance et de développer des relations de confiance avec les différents acteurs. CNRS «L’Open Science est une nouvelle approche transversale de l’accès au travail scientifique, des visées et du partage du résultat de la science mais aussi une nouvelle façon de FAIRE de la science, en ouvrant les processus, les codes et les méthodes. […] L’Open Science, champ beaucoup plus profond que l’Open access limité à la seule publication, désigne tout l’éventail des voies et moyens d’enrichissement du travail scientifique apportés par le numérique. » Plan national pour la science ouverte v2 - MESRI (2021) «La science ouverte est la diffusion sans entrave des résultats, des méthodes et des produits de la recherche scientifique. Elle s’appuie sur l’opportunité que représente la mutation numérique pour développer l’accès ouvert aux publications et –autant que possible –aux données, aux codes sources et aux méthodes de la recherche. » 4Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte, une nouvelle approche de la recherche Source: UNESCO, Recommandation sur une science ouverte, 2021 UNESCO, Understanding open science, 2022 5Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte, jusqu’où ? « Aussi ouvert que possible, aussi fermé que nécessaire » Une ouverture raisonnée, respectueuse des situations où la confidentialité est requise : secrets, accords avec des partenaires privés, données sensibles, dépôt de brevet, etc. Mais évolution vers un principe d’ouverture par défaut,où l’accessibilité et la réutilisabilité deviennent la norme et où les limites sont définies par des critères objectifs. Une ouverture modulable, dès lors que la situation l’impose : confidentialité temporaire, accès à des utilisateurs spécifiques, etc. 6Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte, un principe soutenu par des politiques de plus en plus fermes 7Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte, un principe soutenu par des politiques de plus en plus fermes Politiques nationales Politiques des agences de financement publique Politiques institutionnelles 8Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte, un enjeu de plus en plus politique https://www.nature.com/articles/d41586-025-00780-2 Implémenter une stratégie de science ouverte dans un projet de recherche David Gasparotto, Gaëlle Jaouen, Eva Legras 16 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Le nerf de la guerre : l’anticipation ! – Partie scientifique Quelles données ? Existe-t-il déjà des données publiées utiles à mon projet ? La collecte de nouvelles données est-elle nécessaire ? - Produire de nouvelles données peut coûter cher, être complexe (protocole, équipements nécessaires, etc.) ou encore avoir un impact environnemental à considérer - Produire de nouvelles données peut poser d’importantes questions éthiques : expérimentation animale par exemple (principe de minimisation) Quel protocole de recherche ? Existe-t-il déjà un protocole de recherche publié utile à mon projet ? - Très classique en médecine, en développement dans les autres domaines - Permet la reproductibilité, la capitalisation de recherches existantes, facilite la comparaison/confrontation des recherches 17 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Le nerf de la guerre : l’anticipation ! – Partie scientifique Quelles données ? Existe-t-il déjà des données publiées utiles à mon projet ? La collecte de nouvelles données est-elle nécessaire ? - Produire de nouvelles données peut coûter cher, être complexe (protocole, équipements nécessaires, etc.) ou encore avoir un impact environnemental à considérer - Produire de nouvelles données peut poser d’importantes questions éthiques : expérimentation animale par exemple (principe de minimisation) Quel protocole de recherche ? Existe-t-il déjà un protocole de recherche publié utile à mon projet ? - Très classique en médecine, en développement dans les autres domaines - Permet la reproductibilité, la capitalisation de recherches existantes, facilite la comparaison/confrontation des recherches Quelle bibliographie ? Existe-t-il des références scientifiques librement accessibles ? - Toute référence indiquée dans de futures publications doit pouvoir être accessible sans barrière à n’importe quel lecteur pour faciliter la relecture et la vérification des faits 18 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Outil : le Plan de Gestion des Données = Pense-bête synthétique, collaboratif et itératif pour la gestion des données : production, documentation, organisation, stockage, partage, protection, ouverture, archivage, moyens humains et financiers Objectifs : •Soulever les points à discuter pour le bon déroulement du projet •Eviter les mauvaises surprises et les oublis •Prévoir les moyens et ressources nécessaires, anticiper les coûts •Se mettre d’accord au sein du projet, fixer les règles Plusieurs trames disponibles (ANR, Horizon Europe, institutionnelles, Trames AgroParisTech Projet et Entité) rassemblées sur DMP Opidor Précautions : •Lister les types de données et leur volume prévisionnel pour anticiper leurs particularités et les précautions à prendre (cadre juridique, infrastructures…) •Désigner un/des responsable(s) du PGD dans le projet Fiche pratique : Plan de gestion de données 19 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Outil : le Protocole pré-enregistré ▪Renforcer la robustesse des recherches publiées, réduire les biais favorisant les résultats positifs : résultats publiés quelle que soit l’issue de l’expérimentation, y compris les résultats négatifs ▪Améliorer la qualité des protocoles de recherche ▪Faciliter leur réutilisation par d’autres équipes de recherche ▪Pour aller plus loin : Center for Open Science ; PCI Registered Reports ; ressources complémentaires https://www.cos.io/initiatives/registered-reports 20 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Publier Archiver Communiquer Formulation d’une hypothèse Définition d’un protocole de recherche Collecte de données Analyse des données Valorisation des résultats Anticiper Plan de gestion de données Préenregistrement du protocole Pairs scientifiques Partenaires socioéconomiques Décideurs publics Associations Journalistes Etc. Réutilisation de données ouvertes Co-construction avec des acteurs nonacadémiques Outils et matériaux ouverts Réutilisation d’un protocole ouvert Organiser, Documenter, Contrôler, Collaborer 21 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Publier Archiver Communiquer Formulation d’une hypothèse Définition d’un protocole de recherche Collecte de données Analyse des données Valorisation des résultats Anticiper Organiser, Documenter, Contrôler, Collaborer Plan de gestion de données Préenregistrement du protocole Pairs scientifiques Partenaires socioéconomiques Décideurs publics Associations Journalistes Etc. Réutilisation de données ouvertes Co-construction avec des acteurs nonacadémiques Outils et matériaux ouverts Réutilisation d’un protocole ouvert 22 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Focus sur un enjeu clé : reproductibilité / réplicabilité Plusieurs orientations possibles : ▪Analyser les données et codes sources ouverts d’une étude Arrive-t-on aux mêmes conclusions ? ▪Reproduire la méthode d’une étude dans les mêmes conditions Produit-on les mêmes résultats ? ▪Reproduire la méthode d’une étude dans différents contextes Exemple : initiative Agile Reproducibility https://www.nature.com/articles/533452a 23 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Focus sur un enjeu clé : reproductibilité / réplicabilité ! 24 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Focus sur un enjeu clé : reproductibilité / réplicabilité https://www.inshs.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/replication-reproductibilitereutilisation-concepts-et-enjeux 25 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Focus sur un enjeu clé : reproductibilité / réplicabilité ▪Pas de définition consensuelle ▪Sujet complexe ! Dépend des disciplines, des méthodes, etc. ▪Mais de vrais enjeux autour de la qualité et de la robustesse des recherches menées 32 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Outil : les Principes FAIR Qu’est-ce que c’est ? Encore un pense-bête! 4 ensembles de précautions à prendre pour que les données de la recherche soient Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables et Réutilisables (utile à appliquer à tout élément de la recherche !) À quoi ça sert ? Standardiser (formats libres et ouverts, vocabulaires, unités…), documenter (métadonnées), tracer (identifiant pérenne…) Principes FAIR ≠ouverture obligatoire : des données FAIR peuvent être confidentielles Les gros avantages ? Facilite la conservation, la traçabilité, la publication, les collaborations pour l’ouverture et même avant! Les précautions à prendre ? Respecter les standards ! Fiche pratique : Principes FAIR 33 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Bonnes pratiques de gestion des fichiers et des données Ensemble de règles et réflexes pour optimiser : •La gestion des fichiers et des données à l’intérieur des fichiers •La collaboration (formats ouverts, outils collaboratifs) •La limitation des risques de confusions, d’erreurs, de pertes de données (sécurité du stockage, politique de sauvegardes) Gagner du temps et… éviter les catastrophes ! Les précautions à prendre : •Rester réalistes et tenir compte des moyens disponibles (humains, techniques, financiers) •Tous les membres du projet suivent les mêmes règles pour que tout le monde se comprenne ! •Documenter autant que possible pour être transparents et accessibles aux nouveaux collaborateurs Fiche pratique : Bonnes pratiques de gestion 34 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Organisation des fichiers Fiche pratique : Bonnes pratiques de gestion Bien organiser son arborescence Bien nommer ses fichiers de données https://www.explainxkcd.com/wiki/index.php/1459:_Documents 35 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Métadonnées Tous les éléments de description des données de la recherche (DR) = Carte d’identité d’un jeu de données : •contexte d’acquisition (pourquoi, comment, auteur(s)…) •unité de mesure •dates de collecte, de révision •format de fichier •Etc. Pour assurer la compréhension et la réutilisabilité éclairée des DR, conserver les informations de genèse des DR, faciliter les collaborations Les précautions à prendre : Choisir un standard de métadonnées (Dublin Core, Darwin core, EML, DataCite…) adapté au projet et à la communauté scientifique, avoir des métadonnées les plus riches possibles Ressources :RDAlliance ;DCC ; FairSharing Fiche pratique : Métadonnées 36 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Contrôle qualité des données •Quelles mesures de contrôle de la qualité des données ? •Ne jamais modifier les données brutes! •Standardiser, homogénéiser (unités, valeurs, notations…), compléter (valeurs nulles?) •Contrôler les valeurs quantitatives (contrôles statistiques, bornes, réalisme, précision) •Contrôler les variables qualitatives (uniformité des valeurs, des formats, contrôle logique, sémantique (référentiels/thésaurus/ontologies), liste bornée de valeurs) Globalement : Ecrire et partager toutes les conventions et règles choisies Fiche pratique : Bonnes pratiques de gestion 37 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Outils : Documenter ses données au quotidien Fichier README: •Document accompagnant à terme les jeux de données dans les entrepôts •Description de tous éléments relatifs à leur contexte de production et leur organisation pour permettre leur réutilisation en confiance •Complémentaire d’autres outils de documentation des données Recherche Data Gouv, Modèle de README, 2023 38 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Outils : Documenter ses données au quotidien Dictionnaire des données : •Liste détaillée des données manipulées dans le projet avec leurs significations, leurs caractéristiques (unités, gamme de valeurs, format...), leur origine •Toutes spécifications nécessaires à leur utilisation et leur compréhension Jaouen, Gaëlle; Dourdain, Aurélie; Derroire, Géraldine, 2021, "Guyafor Data Dictionary", https://doi.org/10.18167/DVN1/B8FHHA, CIRAD Dataverse, V7 39 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Outils : Documenter ses données au quotidien Outils de rédaction dynamique / « carnets de code » : •Rédaction basée sur du code intégrant les analyses de données •Quelques exemples : R markdown, Jupyter notebook etc. 40 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Outils : Documenter ses données au quotidien Cahier de laboratoire électronique : •Répertoire de toutes les manipulations et des paramétrages utilisés dans les manips •Facilite l’attribution de métadonnées •Permet une conservation et un partage plus aisés que leur équivalent papier •Peut servir de base pour le Plan de Gestion de Données Solution en cours de déploiement ou déjà déployée à INRAE, CNRS, Université de Lorraine https://www.elabftw.net/ 41 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Publier Archiver Communiquer Formulation d’une hypothèse Définition d’un protocole de recherche Collecte de données Analyse des données Valorisation des résultats Anticiper Organiser, Documenter, Contrôler, Collaborer Plan de gestion de données Préenregistrement du protocole Pairs scientifiques Partenaires socioéconomiques Décideurs publics Associations Journalistes Etc. Réutilisation de données ouvertes Co-construction avec des acteurs nonacadémiques Outils et matériaux ouverts Réutilisation d’un protocole ouvert Protocole de contrôle qualité des données Description des métadonnées Plan d’organisation des dossiers et fichiers Règles de nommage Description des données 48 Formation science ouverte 07 avril 2025 | https://www.nature.com/articles/d41586-020-02610-z De l’importance de bien archiver ses publications même quand elles sont publiées en accès ouvert … 49 Formation science ouverte 25 mars 2024 | Publier ses résultats : un droit français protecteur ! Loi pour une République numérique, art. 30 (8/10/2016) https://scienceouverte.couperin.org/la-loi-numerique/ Si : ▪Votre recherche est financée à au moins 50%par des fonds publics ▪Vous soumettez votre écrit à une publication périodique (au moins une fois par an) Alors : ▪Le dépôt du manuscrit auteur accepté pour publication (postprint) en archive ouverte est autorisé … …avec un embargo maximum de : ✓6 mois pour les STEM (Sciences, Technologie, Ingénierie, Mathématiques) ✓12 mois pour les SHS (Sciences Humaines et Sociales) Pour une utilisation sans exploitation commerciale. Et ce, quelle que soit la politique de votre éditeur ! Si votre éditeur demande un embargo inférieur ou publie directement en Open Access, n’attendez pas le délai indiqué dans la loi ! 50 Gestion et Ouverture des Données de la Recherche 2024 | Qu’est-ce que c’est ? Outil juridique pour spécifier publiquement les formes de diffusion et de réutilisation autorisées par le détenteur des droits d’un contenu À quoi ça sert ? A choisir ce qu’on autorise une fois pour toutes avec les productions (article, données, codes) publiées (reproduction, réutilisation, transformation…) Les gros avantages ? Synthétise les conditions, gratuit, facile d’utilisation. Protège les producteurs de données. Les précautions à prendre ? Vérifier les particularités des productions, les accords des partenaires, les conditions demandées par les financeurs du projet Licences courantes à l’international : Creative Commons –licences spécifiques pour les codes Pour le droit français (à privilégier) : https://www.data.gouv.fr/fr/licences Fiche pratique : Licences de diffusion Outil : les Licences de Diffusion le lus ouvert le oi s ouvert arta e arta e odi ier co ercial arta e odi ier P tous droits réservés 51 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Dépôt en archive ouverte avant publication/peer review Dépôt en archive ouverte de la version finale Dépôt et versions de fichier 52 Formation science ouverte 25 mars 2024 || Dépôt des publications en accès ouvert : des financeurs exigeants ▪Engagement contractuel des auteurs : Accès ouvert immédiat, sous licence libre CC-BY ▪Deux voies de publication possibles : -Publication dans une revue sous abonnement : oDépôt dans HAL du manuscrit auteur sous licence CC-BY dès publication de la version finale dans la revue + mention de la référence du projet ANR, Europe ou autre financeur -Publication en accès ouvert sous licence CC-BY par la revue : oRevue nativement en accès ouvert : frais de publication pris en charge oDépôt dans HAL du fichier éditeur sous licence CC-BY dès publication de la version finale dans la revue + mention de la référence du projet ANR, Europe ou autre financeur 53 Formation science ouverte 25 mars 2024 || “This research was u ded, i whole or i art, by [Organisation name, Grant #]. A CC BY or equivalent licence is applied to [the AAM/ the VoR] arising ro this sub issio , i accorda ce with the ra t’s o e access co ditio s’’. https://journalcheckertool.org/ 54 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Publier ses résultats : définir son budget en une image Fiche pratique : Définir sa stratégie de publication Modèle hybride Voie diamant Voie doréeAbonnement 55 Formation science ouverte 25 mars 2024 | Publier ses résultats : L’évolutio des structures et des services Source : Alejandro Posada, George Chen. Inequality in Knowledge Production: The Integration of Academic Infrastructure by Big Publishers. ELPUB 2018, Jun 2018, Toronto, Canada. ⟨10.4000/proceedings.elpub.2018.30⟩. ⟨hal-01816707⟩ CC-BY cteurs co erciaux : de l’éditio scie ti ique à u e o re de services e loba te 56 Formation science ouverte 25 mars 2024 | https://www.timeshighereducation.com/news/ai-summarytrashed-authors-work-and-took-weeks-be-corrected Publishing your results: the evolution of stakeholders and services Editeurs et IA : le rôle traditionnel des revues scientifiques en question 57 Formation science ouverte 25 mars 2024 | Publier ses résultats : L’évolutio des structures et des services cteurs à but o lucrati : le dévelo e e t d’u écosystè e ouvert de la ublicatio Bourguet, Denis, Facon, Benoit, Guillemaud, Thomas, & Hamelin, Marjolaine. (2020, May 4). Peer Community in in one slide. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.5764565 64 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Publier Archiver Communiquer Formulation d’une hypothèse Définition d’un protocole de recherche Collecte de données Analyse des données Valorisation des résultats Anticiper Organiser, Documenter, Contrôler, Collaborer Plan de gestion de données Préenregistrement du protocole Préprint Pairs scientifiques Partenaires socioéconomiques Décideurs publics Associations Journalistes Etc. Réutilisation de données ouvertes Protocole de contrôle qualité des données Co-construction avec des acteurs nonacadémiques Open Peer Review Outils et matériaux ouverts Description des métadonnées Plan d’organisation des dossiers et fichiers Règles de nommage Données Codes sources, algorithmes Résultats positifs Article Data Paper Résultats négatifs Ouvrage Acte de colloque Etc. Method/Pro tocol Paper Open Peer Review Description des données Méthodes, modèles, protocoles Réutilisation d’un protocole ouvert 65 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Publier Archiver Communiquer Formulation d’une hypothèse Définition d’un protocole de recherche Collecte de données Analyse des données Valorisation des résultats Anticiper Organiser, Documenter, Contrôler, Collaborer Pairs scientifiques Partenaires socioéconomiques Décideurs publics Associations Journalistes Etc. 66 Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte, quelques enjeux Pratique de la recherche : construction d’hypothèses, collecte de données, évaluation par les pairs …Au-delà de la diffusion de résultats, qu’implique concrètement la prise en compte de l’ouverture dans la construction de la recherche et ses méthodes ? Quelles déclinaisons dans les différentes spécificités disciplinaires ? Evaluation de la recherche et construction de carrière : comment passer d’un modèle valorisant des métriques quantitatives de publications et de citations à un modèle valorisant davantage la collaboration et le partage de ses résultats ? Cf. les travaux de COARA (coalition for advancing research assessment) Quel écosystème de science ouverte ? Différents acteurs, différentes stratégies. Question des modèles économiques et de la gouvernance des infrastructures construisant l’écosystème de la SO. Recherche et attentes de la société : quelle place pour la recherche publique face aux grands enjeux du XXIe siècle (santé, environnement, etc.), et au paysage informationnel actuel (traitement de la science dans les médias, désinformation/fake news, figure de l’expert dans l’espace public, etc.) ? Eva Legras, chargée de mission science ouverte et données de la recherche, [email protected] Gaëlle Jaouen, ingénieure de recherche en écologie forestière, chargée de mission données de la recherche, [email protected] David Gasparotto, direction de la documentation et du patrimoine culturel, [email protected] 68 Formation Science Ouverte 25 mars 2024 | Lectures complémentaires 69 Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte s’entend comme un concept inclusif qui englobe différents mouvements et pratiques visant à rendre les connaissances scientifiques multilingues, librement accessibles à tous et réutilisables par tous, à renforcer la collaboration scientifique et le partage des informations au profit de la science et de la société, ainsi qu’à ouvrir les processus de création, d’évaluation et de diffusion des connaissances scientifiques aux acteurs de la société au-delà de la communauté scientifique traditionnelle. Elle inclut toutes les disciplines scientifiques et tous les aspects des pratiques savantes, y compris les sciences fondamentales et appliquées, les sciences naturelles et les sciences sociales et humaines, et repose sur les piliers essentiels suivants : les connaissances scientifiques ouvertes ; les infrastructures de la science ouverte ;la communication scientifique ;la participation ouverte des acteurs de la société ;et le dialogue ouvert avec les autres systèmes de connaissances. UNESCO, Recommandation sur une science ouverte,2021 70 Formation science ouverte 07 avril 2025 | La science ouverte, quelles valeurs ? UNESCO, Recommandations sur la science ouverte, 2021, Licence CC BY-SA 3.0 IGO, https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000379949_fre 71 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Quelques politiques dans l’écosystème de recherche d’AgroParisTech AgroParisTech : ▪Politiques science ouverte (2020) et données de la recherche (2021) https://www.agroparistech.fr/recherche/science-ouverte https://www.agroparistech.fr/recherche/donnees-recherche ▪10 orientations pour une recherche plus ouverte et accessible à la société ▪Chargée de mission SO, deux chargées de mission DR ▪Dépôt dans HAL requis dès lors que le cadre juridique l’autorise (Loi république numérique notamment) ▪Accompagnement et formation Université Paris-Saclay : ▪Politique science ouverte (2022) https://www.universite-paris-saclay.fr/recherche/science-ouverte ▪8 objectifs pour l’ouverture de la science ▪VP adjoint science ouverte, comité de pilotage, DiBiSO ▪Dépôt des publications dans HAL ▪Atelier de la donnée ▪Accompagnement et formation INRAE : ▪Politiques science ouverte et données de la recherche https://www6.inrae.fr/dipso/La-science-ouverte-a-INRAE https://www.inrae.fr/actualites/plan-donnees-pour-la-science ▪Direction dédiée à la SO : la DipSO ▪Dépôt des publications dans HAL depuis la migration de ProdInra achevée en 2020 ▪Entrepôt de données : Data Inrae (désormais Recherche Data Gouv) ▪Accompagnement et formation CNRS : ▪Feuilles de route science ouverte (2019) et données de la recherche (2020) https://www.cnrs.fr/sites/default/files/press_info/201911/Plaquette_ScienceOuverte.pdf https://www.cnrs.fr/sites/default/files/pdf/Plaquette_PlanDDOR_N ov20.pdf ▪Direction des données ouvertes de la recherche (DDOR) ▪Dépôt des publications dans HAL requis, lien au CRAC ▪Services : https://www.inist.fr/ 72 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Interopérabilité (capacité de systèmes à opérer ensemble) - Favoriser les échanges des métadonnées à différents niveaux Ex : métadonnées descriptives des entrepôts, des structures des jeux de données - formats d’échanges /standards (disciplinaires) ouverts Moissonnage (OAI-PMH : Open Archive Initiative –Protocol for Metadata Harvesting) - Automatisation de l’échange de métadonnées via des protocoles. Mise à disposition d’entrepôt de métadonnées - Permet le signalement secondaire des métadonnées (exemple pour les métadonnées d’une thèse : ADUM / Star -> SUDOC /theses.fr /tel, etc.) Objectif final : interopérabilité et moissonnage 73 Formation science ouverte 25 mars 2024 | électio er u e revue : critères usuels et re iers oi ts d’atte tio Quelle est la cible attendue ? Généraliste ? Disciplinaire ? Cette revue est -elle reconnue dans ma communauté proche ? Attention àl’utilisation des indicateurs métriques (type IF etc.). Cf. COARA. La qualité de cette revue est -elle reconnue ? Comment est géré le système de relecture ? Attention aux délais trop réduits de publication : la qualité de relecture prend du temps Quel est le modèle économique ? Est -il demandé aux auteurs de payer des frais de publication ? (soumission, figures couleur, etc .) Est -il demandé de payer des frais de publication pour de l’accès ouvert ? Quels seront mes droits après publication ? Il faut penser aux licences creative commons ou ne pas hésiter à négocier ses droits. 80 Formation Science Ouverte 25 mars 2024 | Contexte général et définitions 81 Formation science ouverte 07 avril 2025 | «La valorisation de la recherche est une activité qui consiste à augmenter la valeur des résultats de R&D » «La valorisation est le moyen de rendre utilisables ou commercialisables les résultats, les connaissances et les compétences de la recherche » La mission première de la valorisation passe par la mise en relation du monde de la recherche avec le monde socioéconomique avec comme point central les équipes de recherche Le but de la valorisation est, littéralement, de donner de la valeur aux résultats de la recherche Définition(s) de la valorisation de la recherche (1/3) 82 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Définition(s) de la valorisation de la recherche (3/3) o u auté scie ti ique Publicatio s, do ées, colloques, co rès ul arisatio , o u icatio , édiatio echerche arte ariale, P , créatio d e tre rises o ées ésultats avoirs o éte ces L T L Pairs scie ti iques ra d ublic cteurs socio éco o iques ypes de valorisation Cibles 83 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Définition(s) de la valorisation de la recherche (3/3) o u auté scie ti ique Publicatio s, do ées, colloques, co rès ul arisatio , o u icatio , édiatio echerche arte ariale, P , créatio d e tre rises o ées ésultats avoirs o éte ces Pairs scie ti iques ra d ublic cteurs socio éco o iques ypes de valorisation Cibles alorisation non économique alorisation économique alorisation de la recherche 84 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Innovation-tra s ert : u roblè e d’i ter ace 85 Formation Science Ouverte 25 mars 2024 | Protection ? Confidentialité ? Ouverture ? 86 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Deux branches de la propriété intellectuelle Donnée, partenariat et innovation dans un contexte de science ouverte, Fiche INRAE Zone de flou 87 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Pourquoi protéger/breveter mon invention ? - Stratégie offensive : breveter pour défendre un monopole -Stratégie d’image : breveter pour montrer qu’on est innovant - Stratégie partenariale : breveter pour collaborer - Stratégie marchande : breveter pour vendre des technologies - Stratégie défensive : breveter pour miner le terrain -Stratégie ouverte : breveter pour libérer des technologies -Stratégie interne : motivation, articulation… 88 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Une (plus grande) ouverture est-elle possible ? (1/3) Les choses ava ce t… - En 2016, le CNRS a publié un livre blanc intitulé « Une Science ouverte dans une République numérique » très clairement en faveur de l’Open Access, de l’Open Source et de l’Open Data. -Publication récente d’une fiche INRAE « Donnée, partenariat et innovation dans un contexte de science ouverte » -open data = levier d’une nouvelle forme de valorisation économique des données publiques, en permettant leur mise à disposition gratuite -La protection des résultats n’empêche pas l’ouverture des données -Adoption d’une politique d’établissement en matière de science ouverte (2020) et pour la gestion et l’ouverture des données de la recherche (2021) à AgroParis ech 89 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Une (plus grande) ouverture est-elle possible ? (2/3) … ais la questio des brevets/de la P reste délicate : ➔L’open science et l’open data n’éteignent pas les possibilités de protection et de valorisation des données et résultats de recherche et ne doivent pas faire obstacle aux enjeux économiques de la recherche La mise à disposition des données scientifiques sur des plateformes open science ne doit pas aller à l’encontre de la valorisation des données notamment par brevet ; du respect des secrets et des règles contractuelles de confidentialité. Principe du « aussi ouvert que possible, aussi fermé que nécessaire » 96 Formation science ouverte 07 avril 2025 | 3. Sciences et recherches participatives « formes de production de connaissances scientifiques auxquelles participent, avec des chercheurs, des acteurs de la société civile, à titre individuel ou collectif, de façon active et délibérée » Charte des Sciences participatives en France, 2017. citizen science –collaborative science –public engagement –participatory research –community based research –crowdsourcing –crowdcrafting –participatory –experiments –collective intelligence - volunteer computing –human sensing Liste non-exhaustive de termes utilisés en anglais : Francois Houllier, Jean-Baptiste Merilhou-Goudard. Les sciences participatives en France. [0] 2016, 63 p. ⟨hal-02801940⟩ 97 Formation science ouverte 07 avril 2025 | •Différents niveau d’implication de la société 3. Sciences et recherches participatives Une plateforme en ligne est-elle nécessaire pour la collecte, l’analyse, la visualisation de données ? La société peut-elle collecter des données fiables ? Peutelle intentionnellement ou non influencer les résultats ? Mesure-t-on réellement ce qu’on souhaite mesurer ? Open data et propriété intellectuelle Gestion des données Qualité et fiabilité des données Un exemple : https://www.zooniverse.org/ Question de la complexité du protocole Tester le protocole de collecte des données, former les participants, définir de critères de validation des données, process de vérification des données utiliser des licences du type Creative Commons Acquisition d’images, quel type de licence ? Quelle diffusion ? https://doi.org/10.5281/zenodo.10119036 "Les données et les métadonnées produites lors de projets de sciences participatives sont ouvertes et, si possible, les résultats sont publiés en accès libre." ECSA 2015. Ten Principles of Citizen Science. Berlin. http://doi.org/10.17605/OSF.IO/XPR2N 98 Formation science ouverte 07 avril 2025 | •Accompagnement dans l’identification de soutiens financiers, la conception de projets S&S et leur réalisation •Relai vers des formations proposées en lien avec la vulgarisation et la médiation scientifiques •A votre disponibilité pour accompagner vos initiatives de vulgarisation, médiation scientifique… 3. Un accompagnement dédié S&S à AgroParisTech Une question ? Pour plus d’informations contactez nous : [email protected] 100 Formation science ouverte 07 avril 2025 | Contacts AgroParisTech : ▪Montage projets européens : [email protected] ▪Montage projets nationaux : [email protected] ▪Science ouverte / données de la recherche : [email protected] & [email protected] ▪Cellule d’appui données de la recherche : donneesrecherc[email protected] ▪Cellule d’appui HAL : [email protected] ▪Cellule d’appui Publication scientifique : [email protected] ▪Sciences et société : [email protected] ▪Innovation : [email protected] & [email protected] Université Paris-Saclay : ▪Science ouverte : [email protected] ▪Données de la recherche (atelier de la donnée) : donnees-recherch[email protected]r Université de Lorraine : ▪Données de la recherche (atelier de la donnée) : [email protected] Université de Montpellier : ▪Données de la recherche (atelier de la donnée) : https://ecodor.libanswers.com/form?queue_id=3267