Desarrollo e implementacion en Django deuna plataforma en la nube para la gestion ymonitorizacion de maquinas de analiticaclinica

ESCUELA DE INGENIERIA DE TELECOMUNICACION Y ELECTRONIC A • TRABAJO FIN DE GRADO "Desarrollo e implementacion en Django de una plataforma en la nube para la gestion y monitorizacion de maquinas de analitica clinica" Titulacion: Grado en Ingenieria en Tecnologias de la Telecomunicacion Mencion: Telematica Autor: D. Luis Pellicer Collado Tutor: Dr. D. Alfonso Medina Escuela Fecha: Julio 2016 G OAD Of LAS PALMAS DE GRAN CA ARIA ESCUELA DE INGENIERIA DE TELECOMUNICACION Y ELECTRONICA • TRABAJO FIN DE GRADO "Desarrollo e implemcntacion en Django de una plataforma en la nube para la gestion y monitorizacion de maquinas de analitica clinica" HOJA DE FIR,MAS Alumno/a Flo.: O. Lui ' P('l\i c<. 'r Co ll ado Fecha: Julio 2016 T utor/a Fd o. : D r. D. A lf olls ~ 1 ( 'd i nH E. c ll ciH ESCUELA DE INGENIERIA DE TELECOMUNICACION Y ELECTRONIC A • TRABAJO FIN DE GRADO "Desarrollo e implementacion en Django de una plataforma en la nube para la gestion y monitorizacion de maquinas de anaHtica cHnica" HOJA DE EVALUACION Calificacion: --------------------------- Presidente Vocal Secretario / a Fdo.: Fdo.: Fdo.: Fecha: Junio 2016 E      Amazon Resource Name (ARN). @@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@ @ WARNING: UNPROTECTED PRIVATE KEY FILE! @ @@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@ Permissions 0664 for 'ParClavesAWS.pem' are too open. It is required that your private key files are NOT accessible by others. This private key will be ignored. bad permissions: ignore key: ParClavesAWS.pem Permission denied (publickey). chmod 400 ParClavesAWS.pem ssh -i "ParClavesAWS.pem" [email protected]       SELECT * FROM "autores_autor" INNER JOIN "autor_libro" ON ("autores_autor"."id" = "autores_libro"."autor_id") INNER JOIN "autores_libro_librerias" ON ("autores_libro"."id" = "autores_libro_librerias"."libro_id") INNER JOIN "autores_libreria" ON ("autores_libro_librerias"."libreria_id" = "autores_libreria"."id") WHERE "autores_libreria"."nombre" = "La Cultura" Autor.objects.filter(libros__libreria__nombre = "La Cultura") biosensor www-data /biosensor. virtualenv /biosensor/biosensor_env/ cd /biosensor/biosensor_env/ source bin/activate pip install django django-admin.py startproject biosensor biosensor ├── biosensor │ ├── __init__.py │ ├── settings.py │ ├── urls.py │ └── wsgi.py └── manage.py        biosensor_api biosensor_app cd biosensor django-admin.py startapp biosensor_api django-admin.py startapp biosensor_app biosensor_api biosensor_app INSTALLED_APPS = [ 'django.contrib.admin', 'django.contrib.auth', 'django.contrib.contenttypes', 'django.contrib.sessions', 'django.contrib.messages', 'django.contrib.staticfiles', 'biosensor_app', 'biosensor_api', ] python manage.py runserver python manage.py migrate python manage.py createsuperuser ROOT_URLCONF = 'biosensor.urls' LANGUAGE_CODE = 'es-es' pip install djangorestframework INSTALLED_APPS = [ 'django.contrib.admin', 'django.contrib.auth', 'django.contrib.contenttypes', 'django.contrib.sessions', 'django.contrib.messages', 'django.contrib.staticfiles', 'biosensor_app', 'biosensor_api', 'rest_framework', ] REST_FRAMEWORK = { 'DEFAULT_PAGINATION_CLASS': 'rest_framework.pagination.PageNumberPagination', 'PAGE_SIZE': 10 } urlpatterns = [ url(r'^api-auth/', include('rest_framework.urls', namespace='rest_framework')) ] class Experimento(models.Model): usuario = models.ForeignKey('auth.User', related_name='experimento') nombre = models.CharField(max_length=50) descripcion = models.CharField(blank=True,max_length=300) laser_encendido = models.BooleanField(default=False) bomba_peristaltica_sentido = models.CharField(max_length=10) bomba_peristaltica_velocidad = models.IntegerField() bomba_impulsional_ch1 = models.IntegerField() bomba_impulsional_ch2 = models.IntegerField() selector_viales_ch1 = models.IntegerField() selector_viales_ch2 = models.IntegerField() valvula_inyeccion_ch1 = models.IntegerField() valvula_inyeccion_ch2 = models.IntegerField() timestamp = models.DateTimeField(auto_now_add=True,auto_now=False) class MuestraCurvaAngular(models.Model): usuario = models.ForeignKey('auth.User', related_name='muestra_ca') experimento = models.ForeignKey('Experimento', on_delete=models.CASCADE, related_name='muestra_ca') numero = models.IntegerField() angulo = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) ch1 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) ch2 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) class MuestraCineticaQuimica(models.Model): usuario = models.ForeignKey('auth.User', related_name='muestra_ccq') experimento = models.ForeignKey('Experimento', on_delete=models.CASCADE, related_name='muestra_ccq') numero = models.IntegerField() tiempo = models.DecimalField(max_digits=10, decimal_places=6) ch1 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) ch2 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) class MuestraCAViewSet(viewsets.ModelViewSet): queryset = MuestraCurvaAngular.objects.all() serializer_class = MuestraCASerializer permission_classes = (permissions.IsAuthenticatedOrReadOnly, IsOwnerOrReadOnly) class MuestraCCQViewSet(viewsets.ModelViewSet): queryset = MuestraCineticaQuimica.objects.all() serializer_class = MuestraCCQSerializer permission_classes = (permissions.IsAuthenticatedOrReadOnly, IsOwnerOrReadOnly) class ExperimentoViewSet(viewsets.ModelViewSet): queryset = Experimento.objects.all() serializer_class = ExperimentoSerializer permission_classes = (permissions.IsAuthenticatedOrReadOnly, IsOwnerOrReadOnly) class MuestraCASerializer(serializers.ModelSerializer): usuario = serializers.ReadOnlyField(source='usuario.username') class Meta: model = MuestraCurvaAngular fields = ( 'id', 'numero', 'experimento', 'usuario', 'numero', 'angulo', 'ch1', 'ch2',) class MuestraCCQSerializer(serializers.ModelSerializer): usuario = serializers.ReadOnlyField(source='usuario.username') class Meta: model = MuestraCineticaQuimica fields = ( 'id', 'numero', 'experimento', 'usuario', 'numero', 'tiempo', 'ch1', 'ch2',) class ExperimentoSerializer(serializers.ModelSerializer): usuario = serializers.ReadOnlyField(source='usuario.username') class Meta: model = Experimento fields = ( 'id', 'nombre', 'usuario', 'descripcion', 'laser_encendido', 'bomba_peristaltica_sentido', 'bomba_peristaltica_velocidad', 'bomba_impulsional_ch1', 'bomba_impulsional_ch2', 'selector_viales_ch1', 'selector_viales_ch2', 'valvula_inyeccion_ch1', 'valvula_inyeccion_ch2',) bootstrap/ ├── css/ │ ├── bootstrap.css │ ├── bootstrap.css.map │ ├── bootstrap.min.css │ ├── bootstrap.min.css.map │ ├── bootstrap-theme.css │ ├── bootstrap-theme.css.map │ ├── bootstrap-theme.min.css │ └── bootstrap-theme.min.css.map ├── js/ │ ├── bootstrap.js │ └── bootstrap.min.js └── fonts/ ├── glyphicons-halflings-regular.eot ├── glyphicons-halflings-regular.svg ├── glyphicons-halflings-regular.ttf ├── glyphicons-halflings-regular.woff └── glyphicons-halflings-regular.woff2           <script src="{% static 'js/loader.js' %}"></script>  graficas.html drawCurveA() drawCurveCQ() var data = new google.visualization.DataTable(); var chart = new google.visualization.ChartWrapper(...); var control = new google.visualization.ControlWrapper(...); var dashboard = new google.visualization.Dashboard(document.querySelector('#dashboard_div')); data DataTable, data chart control  <div id="chart_div_ccq" style="width=100%; height=100%;"></div> { "numero": 1, "experimento": 1, "angulo": "58.000000", "ch1": "80.965714", "ch2": "83.305714" } #!/bin/bash tail -n +6 Jul25-m01.dat | tr ',' '.' >> TIME.txt USER="biosensor" PASS="passfalsa" EXPERIMENTO="1" MUESTRA=1 while read TIEMPO CH1 CH2 do curl --request POST \ --url 'http://biosensor.io/api/muestras-ccq/' \ --user $USER:$PASS \ --header 'Content-Type: application/json' \ --data '{"numero":'$((MUESTRA++))',"experimento":'$EXPERIMENTO',"tiempo":"'$TIEMPO'","ch1":"'$C H1'","ch2":"'${CH2//$'\r'}'"}' done < TIME.txt rm TIME.txt #!/bin/bash tail -n +6 Jul31-c01.dat | tr ',' '.' >> ANG.txt USER="biosensor" PASS="passfalsa" EXPERIMENTO="1" MUESTRA=1 while read ANGULO CH1 CH2 do curl --request POST \ --url 'http://biosensor.io/api/muestras-ca/' \ --user $USER:$PASS \ --header 'Content-Type: application/json' \ --data '{"numero":'$((MUESTRA++))',"experimento":'$EXPERIMENTO',"angulo":"'$ANGULO'","ch1":"'$C H1'","ch2":"'${CH2//$'\r'}'"}' done < ANG.txt rm ANG.txt 𝐻 = 𝐶𝑡∙74,88 ∙ 𝐻𝑛+ 𝐶𝑡∙96,72 ∙ 𝐻𝑒 - 𝐻 - 𝐻𝑛 - 𝐻𝑒 - 𝐶𝑡 𝐶𝑡 𝐻 = 0,6 ∙ 74,88 ∙300 + 𝐶𝑡∙96,72 ∙ 0 = 13.478,40 € 𝑅 = 0,07 ∙ 𝑃 ∙ 𝐶𝑛 - - 𝐶𝑛 𝑅 = 0,07 ∙13.637,56 ∙ 1 = 957,04 € 𝑉 = 0,006 ∙ 𝑃 ∙ 𝐶𝑣 - 𝑃 - 𝐶𝑣 𝑉 = 0,006 ∙14.690,00 ∙ 1 = 88,14 € def perform_create(self, serializer): serializer.save(usuario=self.request.user) class UserViewSet(viewsets.ReadOnlyModelViewSet): queryset = User.objects.all() serializer_class = UserSerializer @api_view(['GET']) def api_root(request, format=None): return Response({ 'users': reverse('user-list', request=request, format=format) }) from rest_framework import serializers from biosensor_api.models import Experimento, MuestraCurvaAngular,MuestraCineticaQuimica from django.contrib.auth.models import User from rest_framework.reverse import reverse class MuestraCASerializer(serializers.ModelSerializer): usuario = serializers.ReadOnlyField(source='usuario.username') class Meta: model = MuestraCurvaAngular fields = ( 'id', 'numero', 'experimento', 'usuario', 'numero', 'angulo', 'ch1', 'ch2',) class MuestraCCQSerializer(serializers.ModelSerializer): usuario = serializers.ReadOnlyField(source='usuario.username') class Meta: model = MuestraCineticaQuimica fields = ( 'id', 'numero', 'experimento', 'usuario', 'numero', 'tiempo', 'ch1', 'ch2',) class ExperimentoSerializer(serializers.ModelSerializer): usuario = serializers.ReadOnlyField(source='usuario.username') class Meta: model = Experimento fields = ( 'id', 'nombre', 'usuario', 'descripcion', 'laser_encendido', 'bomba_peristaltica_sentido', 'bomba_peristaltica_velocidad', 'bomba_impulsional_ch1', 'bomba_impulsional_ch2', 'selector_viales_ch1', 'selector_viales_ch2', 'valvula_inyeccion_ch1', 'valvula_inyeccion_ch2',) class UserSerializer(serializers.ModelSerializer): class Meta: model = User fields = ('id', 'username') from rest_framework import permissions class IsOwnerOrReadOnly(permissions.BasePermission): def has_object_permission(self, request, view, obj): if request.method in permissions.SAFE_METHODS: return True return obj.usuario == request.user from __future__ import unicode_literals from django.db import models from biosensor_app.models import Experimento, MuestraCurvaAngular, MuestraCineticaQuimica from __future__ import unicode_literals from django.apps import AppConfig class BiosensorApiConfig(AppConfig): name = 'biosensor_api' from django.conf.urls import url from biosensor_app import views urlpatterns = [ url(r'^$', views.home, name='home'), url(r'^experimento/(?P<id_experimento>[0-9]+)/$', views.experimento, name="experimento"), ] # -*- coding: utf-8 -*- from django.shortcuts import render from django.contrib.auth.decorators import login_required from biosensor_app.forms import LoginForm from models import Experimento, MuestraCurvaAngular, MuestraCineticaQuimica @login_required(login_url="login/") def home(request): experimentos = Experimento.objects.filter(usuario=request.user).order_by('- timestamp')[:20] contexto = { "experimentos": experimentos, } if experimentos: seleccionado = experimentos[0] muestras_ca = seleccionado.muestra_ca.all() muestras_ccq = seleccionado.muestra_ccq.all() contexto = {"experimentos": experimentos, "seleccionado": seleccionado, "muestras_ca": muestras_ca, "muestras_ccq": muestras_ccq } return render(request, "dash.html", contexto) @login_required(login_url="login/") def experimento(request, id_experimento): experimentos = Experimento.objects.filter(usuario=request.user).order_by('- timestamp')[:20] seleccionado = experimentos.get(id=id_experimento) muestras_ca = seleccionado.muestra_ca.all() muestras_ccq = seleccionado.muestra_ccq.all() contexto = { "experimentos": experimentos, "seleccionado": seleccionado, "muestras_ca": muestras_ca, "muestras_ccq": muestras_ccq } return render(request, "dash.html", contexto) from __future__ import unicode_literals from django.db import models class Experimento(models.Model): usuario = models.ForeignKey('auth.User', related_name='experimento') nombre = models.CharField(max_length=50) descripcion = models.CharField(blank=True,max_length=300) laser_encendido = models.BooleanField(default=False) bomba_peristaltica_sentido = models.CharField(max_length=10) bomba_peristaltica_velocidad = models.IntegerField() bomba_impulsional_ch1 = models.IntegerField() bomba_impulsional_ch2 = models.IntegerField() selector_viales_ch1 = models.IntegerField() selector_viales_ch2 = models.IntegerField() valvula_inyeccion_ch1 = models.IntegerField() valvula_inyeccion_ch2 = models.IntegerField() timestamp = models.DateTimeField(auto_now_add=True,auto_now=False) def __unicode__(self): return self.nombre class MuestraCurvaAngular(models.Model): usuario = models.ForeignKey('auth.User', related_name='muestra_ca') experimento = models.ForeignKey('Experimento', on_delete=models.CASCADE, related_name='muestra_ca') numero = models.IntegerField() angulo = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) ch1 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) ch2 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) def __unicode__(self): return str(self.numero) class MuestraCineticaQuimica(models.Model): usuario = models.ForeignKey('auth.User', related_name='muestra_ccq') experimento = models.ForeignKey('Experimento', on_delete=models.CASCADE, related_name='muestra_ccq') numero = models.IntegerField() tiempo = models.DecimalField(max_digits=10, decimal_places=6) ch1 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) ch2 = models.DecimalField(max_digits=8, decimal_places=6) def __unicode__(self): return str(self.numero) from django.contrib.auth.forms import AuthenticationForm from django import forms class LoginForm(AuthenticationForm): username = forms.CharField(label="Username", max_length=30, widget=forms.TextInput(attrs={'class': 'form-control', 'name': 'username'})) password = forms.CharField(label="Password", max_length=30, widget=forms.TextInput(attrs={'type': 'password', 'class': 'form-control', 'name': 'password'})) from __future__ import unicode_literals from django.apps import AppConfig class BiosensorAppConfig(AppConfig): name = 'biosensor_app' from django.contrib import admin from biosensor_api.models import Experimento, MuestraCurvaAngular, MuestraCineticaQuimica admin.site.register(Experimento) admin.site.register(MuestraCurvaAngular) admin.site.register(MuestraCineticaQuimica) {% load staticfiles %} <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8"> <meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge"> <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1"> <meta name="author" content="Luis Pellicer Collado"> <title>Biosensor </title> <link rel="icon" type="image/png" href="{% static 'img/biosensor_logo.png' %}"> <link href ="{% static 'css/bootstrap.min.css' %}" rel="stylesheet"> <link href="{% static 'css/dashboard.css' %}" rel="stylesheet"> </head> <body> {% include 'navbar.html' %} {% block content %} {% endblock %} <script src ="{% static 'js/jquery.min.js' %}"> </script> <script src 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