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Un modelo 1D NPZ de acoplamiento entre la hidrodinámica y los flujos biogeoquímicos en estrechos bicapa. Aplicación a la dinámica mareal en el Estrecho de Gibraltar

Macías Sánchez, Jorge; Castro Díaz, Manuel Jesús; Fernández Nieto, Enrique Domingo

Abstract

Los modelos NPZ (siglas para Nutrientes-Fitoplancton-Zooplancton en ingl es) son com unmente utilizados en estudios de biolog a marina. Este tipo de modelos utiliza un conjunto de ecuaciones diferenciales muy sencillo para de nir la din amica del plancton marino. Las variables de estado de las cuales se modeliza su evoluci on son los nutrientes, el toplancton y el zooplankton, esto se hace en t erminos de su contenido de nitr ogeno, ya que este compuesto el que normalmente limita la producci on primaria en el oc eano. En este trabajo se implementa el acoplado de un modelo NPZ para el modelado de los ujos biogeoqu micos con un modelo de aguas poco profundas bicapa para la hidrodin amica. El objetivo es aplicar este modelo a la simulaci on de ujos biogeoqu micos en el Estrecho de Gibraltar con imposici on de la din amica mareal.

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XXIII Congreso de Ecuaciones Diferenciales y Aplicaciones XIII Congreso de Matem´ atica Aplicada Castell´on, 9-13 septiembre 2013 (pp. 1–8) Un modelo 1D NPZ de acoplamiento entre la hidrodin´amica y los flujos biogeoqu´ımicos en estrechos bicapa. Aplicaci´on a la din´amica mareal en el Estrecho de Gibraltar J. Mac´ ıas1, M.J. Castro1, E. Fern´ andez-Nieto2 1Universidad de M´alaga, Departamento de An´alisis Matem´atico, Facultad de Ciencias, Campus de Teatinos, s/n, 29080-M´alaga. E-mails: [email protected], [email protected]. 2Universidad de Sevilla Departamento de Matem´atica Aplicada I, ETS Arquitectura, Avda. Reina Mercedes, 2, 41012-Sevilla. E-mail: [email protected]. Palabras clave: Modelo NPZ, shallow water bicapa, acoplamiento, flujos biogeoqu´ımicos, Estrecho de Gibraltar Resumen Los modelos NPZ (siglas para Nutrientes-Fitoplancton-Zooplancton en ingl´es) son com´unmente utilizados en estudios de biolog´ıa marina. Este tipo de modelos utiliza un conjunto de ecuaciones diferenciales muy sencillo para definir la din´amica del plancton marino. Las variables de estado de las cuales se modeliza su evoluci´on son los nutrientes, el fitoplancton y el zooplankton, esto se hace en t´erminos de su contenido de nitr´ogeno, ya que este compuesto el que normalmente limita la producci´on primaria en el oc´eano. En este trabajo se implementa el acoplado de un modelo NPZ para el modelado de los flujos biogeoqu´ımicos con un modelo de aguas poco profundas bicapa para la hidrodin´amica. El objetivo es aplicar este modelo a la simulaci´on de flujos biogeoqu´ımicos en el Estrecho de Gibraltar con imposici´on de la din´amica mareal. 1. Introducci´on El Estrecho de Gibraltar es un ´area de nuestros mares y oc´eanos fascinante desde muchos puntos de vista. Su din´amica es muy complicada y energ´etica, y los procesos biol´olgicos asociados de un enorme inter´es socio-econ´omico y ambiental. En la actualidad no existe ning´un modelo f´ısico-biol´ogico completamente acoplado para el Estrecho de Gibraltar. Un primer intento se recoge en [5] donde en primer lugar se integra el modelo hidrodin´amico y tras la simulaci´on se extraen los valores de las variables necesarias para la integraci´on del modelo biol´ogico. En este trabajo proponemos un modelo unidimensional 1 J. Mac´ıas, M.J. Castro, E. Fern´andez-Nieto que acopla la hidrodin´amica y los procesos biol´ogicos en estrechos de secci´on arbitraria y con un flujo bicapa, se pretende as´ı representar la din´amica que se observa en el Estrecho de Gibraltar, que es esencialmente bicapa. La estrategia tanto num´erica como computacional difiere completamente del trabajo anteriormente mencionado. En [6] aplicamos este tipo de estrategias para modelos acoplados con una componente biol´ogica de mucha mayor complejidad que la que aqu´ı se presenta. 2. La componente hidrodin´amica La parte hidrodin´amica del modelo acoplado consiste en un modelo de aguas poco profundas unidimensional de dos capas inmiscibles con superficie libre en un canal de secci´on arbitraria. La deducci´on de este modelo puede encontrarse en [1]. En nuestro caso la primera capa representa la capa de agua atl´antica que penetra en superficie en el Mar de Albor´an, en la cual tienen lugar los procesos biol´ogicos, mientras que la segunda capa est´a formada por el agua mediterr´anea m´as salada y densa que fluye en profundidad en su camino a trav´es del Estrecho hacia en Atl´antico Norte. El sistema de ecuaciones diferenciales que resulta es el siguiente:                                                          ∂A1 ∂t +∂Q1 ∂x = 0, ∂Q1 ∂t +∂ ∂x Q2 1 A1 +g 2σ1 A2 1=−g σ1 A1 ∂A2 ∂x +g 21 σ1x A2 1−gdb dx σb σ1 A1+ g σ1 (I3,1+I3,2)A1, ∂A2 ∂t +∂Q2 ∂x = 0, ∂Q2 ∂t +∂ ∂x Q2 2 A2 +g 2σ2 A2 2=−rg σ1 A2 ∂A1 ∂x +g 21 σ2x A2 2−gdb dx σb σ2 A2+ gr σ1 (I3,1+I3,2) + (1 −r) σ3 I3,2A2, (1) donde el ´ındice 1 denota la capa superficial y el ´ındice 2 la capa m´as profunda. La coordenada xrepresenta la posici´on a lo largo de un eje tranversal al canal, tes el tiempo, gla aceleraci´on de la gravedad, b(x) es la funci´on que define la batimetr´ıa del fondo y σ(x, z) la funci´on anchura que depende de la coordenada vertical. Cada una de las capas se supone que tiene una densidad constante, ρi,i= 1,2 (ρ1< ρ2), siendo r=ρ1 ρ2 la raz´on entre estas densidades. Las variables Ai(x, t), i= 1,2 representan las secciones h´umedas para cada capa y se relacionan con el espesor de la capa, hi(x, t), i= 1,2 mediante las expresiones: A1(x, t) = Zb+h2+h1 b(x)+h2(x,t) σ(x, z)dz, A2(x, t) = Zb(x)+h2(x,t) b(x) σ(x, z)dz. (2) 2 Un modelo 1D de acoplamiento hidrodin´amica-biolog´ıa La inc´ognitas Qi(x, t), i= 1,2 representan el flujo de masa en cada secci´on de coordenada xen el tiempo ty se relacionan con la velocidad media de cada capa mediante la expresi´on: Qi(x, t) = ui(x, t)Ai(x, t), i = 1,2. Los t´erminos I3,1eI3,2que aparecen en las ecuaciones de conservaci´on de momento vienen dados por: I3,1(x, t) = Zb(x)+h1(x,t)+h2(x,t) b(x)+h2(x,t) ∂σ ∂x (x, z)dz, I3,2(x, t) = Zb(x)+h2(x,t) b(x) ∂σ ∂x (x, z)dz. (3) Finalmente, σ1,σ2,σ3yσbest´an definidas por σ1(x, t) = σ(x, b(x) + h2(x, t) + h1(x, t)), σ3(x, t) = σ(x, b(x) + h2(x, t)), σ2(x, t) = σ1σ3 σ1(1 −r) + rσ3 , σb(x) = σ(x, b(x)). El sistema (1) se puede escribir como: ∂wH ∂t +A(σ, wH)∂wH ∂x =S(x, σ, wH, b) (4) donde wH=A1(x, t)Q1(x, t)A2(x, t)Q2(x, t)T, σ=σ1(x, t)σ2(x, t)σ3(x, t)σb(x)T, A(σ, wH) =        0100 g¯ h1−u2 12u1g¯ h10 0001 rgˆ h20g¯ h2−u2 22u2        (5) con ¯ hi=Ai σi , i = 1,2ˆ h2=A2 σ1 (6) y S(x, σ, wH, b) =            0 gA1 σ1Zb+h1+h2 b ∂σ ∂x dz −gA1 σb σ1 db dx 0 −gσb σ2 A2 db dx +gA2r σ1Zb+h1+h2 b ∂σ ∂x dz +1−r σ3Zb+h2 b ∂σ ∂x             .(7) Teniendo en cuenta las definiciones de A1yA2y usando la regla de Leibnitz se tiene que: ∂ ∂x(A1+A2) = Zb+h1+h2 b ∂σ ∂x dz +db dx +∂h1 ∂x +∂h2 ∂x σ1−db dxσb(8) 3 J. Mac´ıas, M.J. Castro, E. Fern´andez-Nieto ∂A2 ∂x =Zb+h2 b ∂σ ∂x dz +db dx +∂h2 ∂x σ3−db dxσb.(9) Ahora, usando (8) y (9), el t´ermino fuente S(x, σ, w, b) se puede reescribir formalmente como: S(x, σ, wH, b) =           0 g¯ h1 ∂ ∂x (A1+A2)−gA1 ∂ ∂x (b+h1+h2) 0 g¯ h2 ∂A2 ∂x +rgˆ h2 ∂A1 ∂x −gA2 ∂ ∂x (b+h2+rh1)           .(10) Los autovalores de A(σ, w) se clasifican en externos (2) e internos (otros 2). Los autovalores externos, λ± ext, est´an relacionados con la velocidad de propagaci´on de las perturbaciones barotr´opicas y los autovalores internos, λ± int, con la velocidad de propagaci´on de la perturbaciones barocl´ınicas. Desafortunadamente no existen expresiones anal´ıticas para estos autovalores, sin embargo, cuando r∼ =1, se tienen las siguientes aproximaciones de primer orden (v´ease [7]): λ± ext =u1¯ h1+u2¯ h2 ¯ h1+¯ h2 ±qg(¯ h1+¯ h2) (11) λ± int =u1¯ h2+u2¯ h1 ¯ h1+¯ h2 ±sg0¯ h1¯ h2 ¯ h1+¯ h21−(u1−u2)2 g0(¯ h1+¯ h2),(12) con g0=g(1 −rˆ h2 ¯ h2). Obs´ervese como, de acuerdo con la expresi´on (12), el sistema (1) es hiperb´olico si F2 I=(u1−u2)2 g0(¯ h1+¯ h2)≤1, siendo F2 Iconocido como n´umero de estabilidad de Froude. En los casos que abordamos en las aplicaciones reales, donde r∼ =1, se tienen las siguientes desigualdades: λ− ext < λ− int < λ+ int < λ+ ext. Dependiendo del valor de los autovalores, el flujo se dice que es subcr´ıtico si los autovalores internos tienen signos distintos, cr´ıtico si uno de estos autovalores es cero y, en otro caso, el flujo se dice supercr´ıtico. De la expresi´on de la matriz A(σ, w) se deduce que las secciones cr´ıtica, subcr´ıtica y supercr´ıtica se caracterizan por ser secciones donde G2= 1, G2>1, G2<1, respectivamente, donde G2=F2 1+F2 2−g0 gF2 1F2 2,(13) y F2 1=u2 1 g0¯ h1 , F2 2=u2 2 g0¯ h2 .(14) En estas expresiones GyFi,i= 1,2 son las definiciones adecuadas para este caso del n´umero de Froude compuesto y el n´umero de Froude interno, respectivamente. 4 Un modelo 1D de acoplamiento hidrodin´amica-biolog´ıa 3. La componente biol´ogica: un modelo NPZ La componente biol´ogica del modelo acoplado es un modelo sencillo NPZ que, b´asicamente, es el mismo que el descrito en [5], pero formulado en variables conservadas. Las tres variables de estado del modelos, N,P,Z, se modelizan usualmente en funci´on de su contenido de nitr´ogeno, al ser el nitr´ogeno el componente que normalmente limita la producci´on primaria. Los cambios temporales en la concentraci´on de los contituyentes vienen dadas por las ecuaciones: ∂(A1N) ∂t +∂(u1A1N) ∂x =−f(I)g(N)A1P+ (1 −β)h(P)A1Z+γ j(Z)A1Z. ∂(A1P) ∂t +∂(u1A1P) ∂x =f(I)g(N)A1P−h(P)A1Z−i(P)A1P, ∂(A1Z) ∂t +∂(u1A1Z) ∂x =β h(P)A1Z−j(Z)A1Z, (15) El primer paso para formular un modelo NPZ consiste en determinar las expresiones para las funciones de transferencia que aparecen en las ecuaciones anteriores. La elecci´on de la forma funcional para estos t´erminos es cr´ıtica para la din´amica del modelo y puede tambi´en restringuir la parametrizaci´on del modelo debido a los coeficientes necesarios para su escritura. En este trabajo consideramos las mismas parametrizaciones para las funciones de transferencia que en [5]. Sin embargo, hemos implementado una versi´on del modelo extremadamente vers´atil que permite a cualquier potencial usuario del modelo, que lo utilice a trav´es de la Plataforma HySEA, escribir y usar cualquier otra expresi´on funcional para las ecuaciones del modelo NPZ particular que desee considerar de forma sencilla. Tambi´en es posible realizar la implementaci´on de otros tipos de modelos biol´ogicos m´as complicados, como el que se presenta en [6]. Las cinco funciones de transferencia que aparecen en un modelo NPZ han sido parametrizadas, en nuestro caso, como se indica a continuaci´on: f(I) = Jes la respuesta del fitoplancton a la luz, siendo una funci´on de la irradiaci´on solar, h1,Py otros par´ametros como latitud, nubosidad, ... g(N) = Qp=µp N k1+N,es el consumo de nutrientes por el fitoplancton donde µp es la tasa m´axima de crecimiento para el fitoplancton, y k1es el valor medio para la saturaci´on del consumo de nitrato. h(P) = Gp=µgP kg+P,parametriza la ingesti´on de fitoplancton por el zooplancton, donde µges la tasa m´axima de consumo de fitoplancton por el zooplancton, y kgel valor medio de saturaci´on. i(P) = mp=µ1P kg+P,es la p´erdida de fitoplancton, donde µ1es la tasa de mortalidad natural m´axima del fitoplancton. 5 J. Mac´ıas, M.J. Castro, E. Fern´andez-Nieto j(Z) es la p´erdida de zooplankton debido a muerte, excreci´on y predaci´on: mz=µzZ kz+Z, donde kzes la mitad del valor de saturaci´on para la mortalidad del zooplancton y µzla tasa m´axima de mortalidad del zooplancton. Finalmente, βes la asimilaci´on de zooplancton y γes la fracci´on de p´erdida de zooplancton en relaci´on a los nutrientes. 3.1. Producci´on debida a los procesos de mezcla Adem´as de la advecci´on, los procesos de mezcla entre la capa superficial de agua atl´antica y la capa profunda mediterr´anea son fundamentales para la compresi´on de los patrones biogeoqu´ımicos en este ´area marina (Mac´ıas et al., 2007). Con el objetivo de evitar el uso de parametrizaciones complejas para los procesos de mezcla interfacial, que adem´as dependen fuertemente en la elecci´on de diversos par´ametros a los que muestran gran sensibilidad, resultando dif´ıciles de ajustar, nosotros hemos considerado el n´umero de estabilidad de Froude, F2 I, para determinar cuando los procesos de mezcla tienen lugar y cuando no, a la vez que para modular su intensidad. Cuando F2 I>1 esto est´a relacionado con la aparici´on de las conocidas como inestabilidades de Kelvin-Helmholtz y, en tal caso, la mezcla juega un papel importante. As´ı pues, podremos parametrizar la mezcla mediante un coeficiente de mezcla a trav´es de la picnoclina que sea constante o bien modularlo en funci´on de este n´umero de estabilidad de Froude. Teniendo todo esto en cuenta, la expresi´on final para el modelo para los flujos biogeoqu´ımico considerado es la siguiente:                    ∂ A1N ∂t +∂(u1A1N) ∂x =kmix (Ndeep −N)−JQpA1P+ (1 −β)GpA1Z+γ mzA1Z, ∂ A1P ∂t +∂(u1A1P) ∂x =−kmix P+JQpA1P−GpA1Z−mpA1P, ∂ A1Z ∂t +∂(u1A1Z) ∂x =−kmix Z+β GpA1Z−mzA1Z, (16) donde Ndeep es la concentraci´on de nitrato en la capa inferior y kmix es el coeficiente o funci´on de mezcla a trav´es de la picnoclina. En nuestro caso, kmix es una funci´on que depende de F2 IyA1. Por ´ultimo el sistema (16) se puede escribir como: ∂wB ∂t +∂FB ∂x (wB, u1) = SB(wB),(17) donde wB=  A1N A1P A1Z , FB(wB, u1) =   u1A1N u1A1P u1A1Z  6 Un modelo 1D de acoplamiento hidrodin´amica-biolog´ıa y SB(wB) =     kmix (Ndeep −N)−JQpA1P+ (1 −β)GpA1Z+γ mzA1Z, −kmix P+JQpA1P−GpA1Z−mpA1P, −kmix Z+β GpA1Z−mzA1Z.     4. Esquema num´erico Las soluciones de (1) y (17) pueden desarrollar discontinuidades, incluso partiendo de datos iniciales suaves. En este trabajo, proponemos un m´etodo de vol´umenes finitos de segundo orden con limitador de flujo, basado en una combinaci´on no lineal adecuada del esquema IFCP (de “Intermediate Field Capturing Parabola”) introducido en [2] y el esquema Lax-Wendroff, con un tratamiento especial para las ecuaciones de transporte del sistema (17). El esquema que resulta se reduce al IFCP para la componente hidrodin´amica y a un esquema tipo upwind con un tratamiento descentrado upwind para las ecuaciones de transporte en las regiones de soluci´on no suave y al m´etodo de Lax-Wendroff en las zonas regulares, consigui´endose orden dos en las regiones suaves. Para ver una descripci´on completa del esquema num´erico v´ease [4]. 5. Tests num´ericos Hemos realizado multitud de test num´ericos para distintas geometr´ıas del canal, imponiendo una diversidad de condiciones de contorno y, en particular, imponiendo el efecto de la luz solar constante o dependiente del tiempo. Como ejemplo m´as complejo hemos considerado la geometr´ıa del Estrecho de Gibraltar (extremadamente abrupta y complicada), sobre la cual hemos hecho una imposici´on realista del efecto de las mareas, al igual que en [1], teniendo en cuenta sus cuatro componentes principales. Hemos realizado varias simulaciones de 10 d´ıas en diferentes ´epocas del a˜no y con una parametrizaci´on adecuada del t´ermino de irradiaci´on solar. Figura 1: Instant´aneas del modelo NPZ en el Estrecho de Gibraltar. 7 J. Mac´ıas, M.J. Castro, E. Fern´andez-Nieto Figura 2: Instant´aneas del modelo NPZ en el Estrecho de Gibraltar. Agradecimientos Este trabajo ha sido parcialmente financiado por el Gobierno de Espa˜na y los fondos FEDER a trav´es del proyecto de investigaci´on DAIFLUID (referencia MTM2012-38383- C02-02) y por la Junta de Andaluc´ıa a trav´es del proyecto de excelencia TESELA (referencia P11- RNM7069). Referencias [1] M.J. Castro, J.A. Garc´ıa-Rodr´ıguez, J.M. Gonz´alez-Vida, J. Mac´ıas y C. Par´es. Numerical simulation of two-layer shallow-water flows through channels with irregular geometry J. Comp. Physics., Vol. 195, (2004), pp. 202-235. [2] E.D. Fern´andez-Nieto, M.J. Castro y C. Par´es. On an intermediate field capturing Riemann solver based on a parabolic viscosity matrix for the two-layer shallow water system J. Sci. Comput., 48(1), (2011), pp. 117-140. [3] P.J. Franks. NPZ models of plankton dynamics: Their construction, coupling to physics, and application. J. Oceanogr., Vol. 58, (2002), pp. 379-387. [4] J. Mac´ıas, M.J. Castro y E.D. Fern´andez-Nieto. 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