Estimación de las relaciones genéticas entre razas caprinas españolas y criollas utilizando microsatélites

P.J. Azo e al. ITEA (2008), Vol. 104 (2), 323-327 323 Es imación de las elaciones gené icas en e azas cap inas españolas y c iollas u ilizando mic osa éli es P.J. Azo *, M. Vale a**, J. Sa ia***, J.P. A ilez****, J. Nahed*****, M. Delgado-Pe íñez**, J.M. Cas el** * Dp o. de Gené ica. Uni e sidad de Có doba. Edi . Mendel, Pl baja. Campus de Rabanales. C a. Mad id- Cádiz, (N-IV) km 396ª 14071 Có doba. España. ** Dp o. de Ciencias Ag o o es ales (EUITA) Uni e sidad de Se illa. C a. de U e a, km 1. 41013 Se illa. *** Facul ad de Zoo ecnia. Uni e sidad Nacional Ag a ia La Molina. Lima. Pe ú. **** Facul ad de Recu sos Na u ales. Escuela Medicina Ve e ina ia. Uni e sidad Ca ólica de Temuco. Temuco. Chile. ***** Di isión de Sis emas de P oducción Al e na i os, El Colegio de la F on e a Su , Ca e e a paname i- cana y pe i é ico su s/n, 29290 San C is óbal de Las Casas, Chiapas, México E-mail: [email p o ec ed] Resumen Se han analizado gené icamen e es poblaciones cap inas C iollas de Pe ú, México y Chile u ilizando ma cado es de ADN de ipo mic osa éli e y se han compa ado con las azas españolas Mu ciano G a- nadina y Malagueña. Se ha encon ado un núme o medio de alelos po locus simila en odas las poblaciones (7,3) excep o la población C iolla Chilena que ha mos ado un alo de 5,1, siendo és a la que ha p esen ado el alo in e io an o de he e ocigosidad obse ada (Ho) (0,53) como de espe ada (He) (0,59), habiendo sido la C iolla Pe uana la que ha p esen ado los mayo es alo es (0,70 y 0,71 es- pec i amen e). Se ha encon ado un escaso ni el de di e enciación gené ica en e las poblaciones (FST = 0,069) siendo las di e encias encon adas debidas a los indi iduos como consecuencia al c uzamien- o indisc iminado con o as azas. La población cap ina C iolla de Pe ú es la que más se ap oxima gené- icamen e a las 2 azas españolas analizadas, seguida de la C iolla Mexicana, po úl imo la población c iolla Chilena es la que p esen a la mayo lejanía gené ica con el es o de poblaciones es udiadas. Palab as cla e: Cap ino C iollo, Ca ac e ización Gené ica, Mic osa éli es Summa y Es ima ion o gene ic ela ionships be ween Spanish and C eole goa b eeds using mic osa elli e ma ke s We ha e analyzed h ee C eole goa popula ions om Pe u, Mexico and Chile using mic osa elli e ma ke s. We ha e also analyzed he gene ic ela ionship be ween hem and Mu ciano-G anadina and Malagueña Spanish goa b eeds. The a e age numbe o alleles pe locus was simila in all popula ions (7.3) excep he Chilean C eole (5.1). This C eole goa popula ion has p esen ed he lowes alue o obse ed (Ho) (0.53) and expec ed (He) he e ozygosis (0.59). The Pe u ian C eole has p esen ed he highes alues o Ho (0.70) and He (0.71). We ha e ound a sca ce le el o gene ic di e en ia ion be ween goa popula ions (FST= 0.069) being mo e impo an he indi idual gene ic di e ences due o c ossb eed wi h se e al b eeds. The Pe u ian C eole was closed o analyzed Spanish b eeds, ollowed by Mexican C eole. Finally he Chilean C eole was he mos dis an o he o he s popula ions. Key wo ds: C eole Goa , Gene ic Cha ac e iza ion, Mic osa elli e ma ke s In oducción El ganado cap ino se o iginó en la cuenca medi e ánea y desde ahí de dis ibuyó po odo el e i o io, exis iendo animales de es a especie en p ác icamen e odo el mundo con excepción de las zonas pola es y ópicos muy húmedos. Los países de mayo pobla- ción de cab as son la India y China, que poseen nume osos ebaños de pequeño amaño. Las cab as ue on in oducidas en Amé ica po los españoles y po ugueses al ededo del siglo XVI (A biza Agui e, 1986; Schapi o y Ba ahona, 1997). Va ios siglos de c ía descon olada y de selección na u al han dado luga a un ipo no bien ca ac e izado de ganado cap ino conocido como C iollo. En é minos gene ales el cap ino c iollo es polic ómico y polimó ico a iando según las egiones. Es un animal ús ico que se adap a a una g an a iedad de ambien es con condiciones climá icas ex emas (Deza e al., 2003). Su p oduc i i- dad puede es a limi ada po azones nu i- cionales y de manejo (Ba ioglio e al., 1997) y en algunas zonas y ganade ías ambién po azones gené icas (FAO, 1987). En el caso de Pe ú la población de ganado cap ino global es á al ededo de 1.950.000 animales. La aza cap ina p edominan e en el país es la C iolla, sin emba go en los úl i- mos años se han in oducido di e en es azas de ap i ud ca nice a y de doble ap i- ud como la Anglo Nubiana que han se ido pa a mejo a la p oduc i idad del cap ino c iollo. El cap ino C iollo es ús ico, se adap- a a una amplia gama de ambien es pe o es de bajo ni el p oduc i o. México es el p ime p oduc o de cap ino de Amé ica La ina con más de 9 millones de cabezas, seguido de B asil. Se es ima que ap oximadamen e 150.000 p oduc o es a ni el nacional dependen o al o pa cialmen- e de es a especie. El eno ipo p edominan- e en la zona es el c iollo que p o iene del c uzamien o de los animales c iollos con las azas Anglo-Nubiana y Alpina (Med ano, 2000). En Chile, el 80% de los cap inos co espon- de a animales c iollos p o enien es de c u- ces con cab as o igina ias de España y o as cab as de o igen eu opeo. Es a si uación hace que exis a una g an a iabilidad, incluso en animales de un mismo ebaño. En gene al, se a a de animales de a ios colo es de capas y con p oducciones muy a iables de ca ne y leche. En e las azas o ipos de cab as que pueden encon a se en Chile, des acan la C iolla, con al ededo del 80% del censo. En el p esen e abajo analizamos el ni el de a iabilidad gené ica y las elaciones gené icas exis en es de las p incipales azas cap inas españolas de p oducción de leche, Mu ciano G anadina y Malagueña, con las poblaciones c iollas de Pe ú, México y Chile u ilizando ma cado es de ADN de ipo mic osa éli e. Ma e ial y mé odos Se han ob enido mues as de sang e median- e punción de la ena yugula a 25 animales de la aza cap ina Mu ciano G anadina y a 25 de la aza Malagueña. Se han ob enido mues as de pelo de 18 animales de una población c iolla de Pe ú, de 16 animales de una población c iolla de México y 15 de o a de Chile. El ADN se ex ajo a pa i de san- g e u ilizando el mé odo p opues o po Mille e al. (1988) u ilizando p o einasa k pa a la diges ión. En el caso de las mues as de pelo se u ilizó además enol-Clo o o mo. Se han ampli icado 10 mic osa éli es de ADN ( abla 1) median e PCR en un e moci- clado en los 99 animales mues eados. Los agmen os ampli icados ue on analizados en un secuenciado au omá ico capila ABI 324 P.J. Azo e al. ITEA (2008), Vol. 104 (2), 323-327 P.J. Azo e al. ITEA (2008), Vol. 104 (2), 323-327 325 3130 (Applied Biosys ems). Los alelos ue on ipi icados con el so wa e GeneMappe 3.7. El análisis es adís ico de los da os se ha ealizado u ilizando el p og ama in o má i- co Molkin 3.0 (Gu ié ez e al., 2005) y Gene ix 4.05 (Belkhi e al., 2001). Los es a- dís icos F de W igh (1965) ue on calcula- dos según la me odología p opues a po Wei y Cocke ham (1984). Se ha calculado la dis ancia gené ica de Reynolds (Reynolds e al., 1983) en e las 5 azas analizadas y se ha ep esen ado la ma iz de dis ancias con el paque e in o má ico Phylip 3.65 u ilizando el algo i mo UPGMA. Resul ados y discusión Los alo es de he e ocigosidad de cada uno de los ma cado es analizados en las 5 pobla- ciones cap inas se mues an en la abla 1. Todos han sido polimó icos a pesa del bajo alo de he e ocigosis mos ado po el mic o- sa éli e ETH225. El ma cado CSSRM66 ha sido el que ha mani es ado los mayo es alo- es de he e ocigosis (89%) y de Con enido de In o mación Polimó ico (PIC) (0,88) ( abla 1). Todas las poblaciones cap inas es udiadas han mos ado un núme o medio de alelos po locus simila (7,3) excep o la población C iolla Chilena que ha mos ado un alo de 5,1 ( abla 2). De la misma o ma ha sido la población cap ina C iolla de Chile la que ha p esen ado el alo in e io an o de Ho (0,53) como de He (0,59), siendo la C iolla Pe uana la que ha p esen ado los mayo es alo es (0,70 y 0,71 espec i amen e). Al es udia la a iabilidad gené ica den o y en e poblaciones median e los es adís icos F de W igh hemos ob enido un alo pa a el pa áme o FIS de 0,087 ( abla 3). Es e alo nos indica el ni el de a iabilidad exis en e den o de azas. Cuando es e alo se ap oxi- ma a 1 es a íamos an e una población con- sanguínea. Es e alo ha oscilado en e 0,004 de la población c iolla Pe uana y 0,137 de la C iolla Mexicana ( abla 2). El alo del pa á- me o FIT ha sido de 0,112 indica i o del ni el de a iabilidad en las 5 poblaciones en conjun- o. El coe icien e de di e enciación gené ica ha Tabla 1. Mic osa éli es analizados, he e ocigosidad obse ada (Ho) y Con enido de In o mación Polimó ica (PIC) po mic osa éli e Table 1. Mic osa elli e ma ke s analyzed, obse ed he e ozygosis (Ho) and Polomo phic Cn o ma ion Con en (PIC) in each mic osa elli e Locus Ho PIC BMS356 0,767 0,728 BMS975 0,685 0,655 HMH1R 0,814 0,791 ILSTS011 0,728 0,689 INRA026 0,879 0,867 MCM527 0,798 0,773 TGLA53 0,611 0,584 CSRM60 0,766 0,735 ETH225 0,228 0,216 CSSRM66 0,893 0,884 326 P.J. Azo e al. ITEA (2008), Vol. 104 (2), 323-327 sido del 0,0269, lo que indica que el 2,7 % de la a iabilidad gené ica o al se debe a di e en- cias en e las poblaciones, el es o es debida a di e encias en e indi iduos. Es e bajo ni el de di e enciación gené ica exis en e en e las poblaciones es debido a la g an a iabilidad exis en e an o eno ípica como gené ica en las poblaciones c iollas debido al c uzamien o indisc iminado con o as azas sin unos obje- i os bien de inidos de selección (Med ano, 2000; Deza e al., 2003). Al ep esen a g á icamen e las dis ancias gené icas en un á bol ( igu a 1) obse amos la mayo p oximidad gené ica en e las azas españolas (Mu ciano-G anadina y Malagueña). La población cap ina C iolla de Pe ú es la que más se ap oxima gené ica- men e a las 2 azas españolas analizadas, seguida de la C iolla Mexicana, po úl imo la población c iolla Chilena es la que p esen a la mayo lejanía gené ica con el es o de poblaciones es udiadas. Tabla 2. Núme o medio de alelos po locus (Na), he e ocigosidad obse ada (Ho) y espe ada (He) y alo es de FIS en cada una de las poblaciones analizadas Table 2. A e age numbe o allele pe locus (Na), obse ed (Ho) and expec ed he e ozygosis (He) and FIS alues in each analyzed b eed nNaHoHeF IS C iolla Pe uana 18 7,3000 0,7076 0,7133 0,004 C iolla Mejicana 16 7,2000 0,5904 0,6828 0,137 C iolla Chilena 15 5,1000 0,5382 0,5935 0,076 Malagueña 25 7,4000 0,6452 0,6946 0,070 Mu ciano-G anadina 25 7,3000 0,6812 0,7065 0,034 Tabla 3. Es adís icos F de W igh en e las 5 azas cap inas analizadas Table 3. W igh ´ F-s a is ic in i e goa popula ions analyzed En e poplaciones FIS FIT FST Es adís icos F 0,0879 0,1124 0,0269 In e alo de con ianza al 95% -0,0121-0,1871 0,0220-0,2085 0,0114-0,0489 P.J. Azo e al. ITEA (2008), Vol. 104 (2), 323-327 327 Bibliog a ía A biza Agui e SI, 1986. P oducción de cap inos. AGT. EDITOR S.A. México, 695 pp. Ba ioglio C, Deza C, A ias M, Va ela L, Bona di C, Villa M, 1997. 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Donde: CRP: C iolla Pe uana, CRM: C iolla Mexicana, CCH: C iolla Chilena, MG: Mu ciano G anadina, MA: Malagueña Whe e: CRP: C iolla Pe uana, CRM: C iolla Mexicana, CCH: C iolla Chilena, MG: Mu ciano G anadina, MA: Malagueña