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CLONACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE LAS ACILTRANSFERASAS LPAAT Y DAGAT IMPLICADAS EN LA SÍNTESIS DE TRIACILGLICÉRIDOS EN SEMILLAS DE GIRASOL ( Helianthus annuus L.) Y OBTENCIÓN DE LÍNEAS CON COMPOSICIÓN MODIFICADA DE LÍPIDOS TESIS DOCTORAL JUAN DIEGO FERNÁNDEZ GARCÍA
DepartamentodeBioquímica VegetalyBiología Molecular FacultaddeBiología DepartamentodeBioquímicay BiologíaMoleculardeProductos Vegetales InstitutodelaGrasa CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNDELAS ACILTRANSFERASASLPAATYDAGATIMPLICADASENLA SÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSENSEMILLASDEGIRASOL (HelianthusannuusL.)YBÚSQUEDADENUEVOS MUTANTES TrabajopresentadoparaoptaralgradodeDoctorpor JuanDiegoFernándezGarcía Trabajodirigidopor Dr.EnriqueMartínezForceDr.RafaelGarcésMancheño Sevilla, 2015
LosDres.EnriqueMartínezForce,InvestigadorCientífico,yRafaelGarcés Mancheño,ProfesordeInvestigacióndelCSIC,emitenelsiguienteinforme: Elpresentetrabajotitulado“Clonaciónycaracterizacióndelasaciltransferasas LPAATyDAGATimplicadasenlasíntesisdetriacilglicéridosensemillasdegirasol (HelianthusannuusL.)ybúsquedadenuevosmutantes”hasidorealizadobajo nuestradirecciónyasesoramientoenloslaboratoriosdelDepartamentode BioquímicayBiologíaMoleculardeProductosVegetalesdelInstitutodelaGrasa (Sevilla)durantelosañosacadémicos2006‐2015,constituyendolaMemoriaque presentaelLcdo.D.JuanDiegoFernándezGarcíaparaoptaralgradodeDoctor. Consideramosqueeltrabajorealizadoesoriginalyhadadolugaravarias publicacionesencomunicacionesencongresos.Laexcelentelaborrealizadapor elLcdo.D.JuanDiegoFernándezGarcía,tantoentareasexperimentalescomoen ladiscusióndelosresultados,acreditaunaadecuadaformaciónparala obtencióndeltítulodeDoctor. ParaqueconsteaefectosdetramitacióndelareferidaTesisDoctoral,firmamos elpresenteinformeenSevilla,a13deOctubrede2015. Dr.EnriqueMartínezForceDr.RafaelGarcésMancheño TutordelaTesisDoctoral: Dr.FranciscoJavierFlorencioBellido CatedráticodelaUniversidaddeSevilla
Amispadres, porsucariñoyapoyoincondicional
II 3.3BIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOS(TAGs)………………………………...……………….…….35 3.3.1Lisofosfatidatoaciltransferasas(LPAATs)……………………………….....……37 3.3.2Diacilglicerolaciltransferasas(DAGATs)…………………………………..……..38 4.LÍPIDOSDEPLANTAS:MODIFICACIÓN…………………………………………….………………43 4.1CRITERIOSDESELECCIÓN…………………………………………………...…………………………..…..44 4.2PROBLEMÁTICAACTUAL…………………………………………………………………………………..….47 4.3MODIFICACIÓNDELCONTENIDOGRASODELASSEMILLAS…………………………..…….49 4.4MODIFICACIÓNDELACALIDADDELOSACEITES……………………………...……………..….52 4.4.1Modificaciónenlacomposicióndeácidosgrasos………………………..52 4.4.1.1ModificaciónenelcontenidodePUFAs…………………………52 4.4.1.2ModificaciónenelcontenidodeMUFAs……………………….53 4.4.1.3ModificaciónenelcontenidodeAGssaturados…...........53 4.4.2ModificaciónenladistribucióndeácidosgrasosenTAGs……….…..56 4.4.2.1CoeficientedeasimetríaαSat……………………...………………….59 5.ACEITEDEGIRASOL…………………………………………………………………………………………...61 5.1CARACTERÍSTICASGENERALES……………………………………………....……………………………61 5.2OBTENCIÓNDEMUTANTESCONCOMPOSICIÓNMODIFICADADEACEITE….……..62 5.2.1LíneadegirasolHOHE(CAS‐15)……………………………………………………….66 5.2.1.1HerenciadelcarácterHOHEyenzimasimplicadas…........67 5.2.1.2ComposicióndeAGsydistribuciónenTAGs……………….….70 OBJETIVOS3‐76 MATERIALESYMÉTODOS77‐154 1.MATERIALES…………………………..…………………..………………………………………………………79 1.1APARATOSYMATERIALES……………………………………………....…………………………..….....79 1.2REACTIVOSYQUÍMICOS……………………………………………....…………………………..…........80 1.3ENZIMASYKITS……………………………………………....…………………………..…......................81 1.4MATERIALBIOLÓGICOYCONDICIONESDECULTIVO…………………………………………..81 1.4.1Escherichiacoli……………………………………………....…………………………..……..81 1.4.1.1Condicionesdecultivo…………………....…………………………..……82 1.4.1.2Recogidadematerialbiológico…………………....………………….82
III 1.4.2Agrobacteriumtumefaciens…………………....……………………………………….82 1.4.2.1Condicionesdecultivo…………………....………………………………..83 1.4.2.2Recogidadematerialbiológico…………………....………………….83 1.4.3Saccharomycescerevisiae…………………....…………………………………………..83 1.4.3.1Condicionesdecultivo…………………....………………………………..84 1.4.3.2Recogidadematerialbiológico…………………....………………….84 1.4.4HelianthusannuusL.…………………....…………………………………………………..85 1.4.4.1Condicionesdecultivo…………………....………………………………..86 1.4.4.2Recogidadematerialbiológico…………………....………………….86 1.4.5Arabidopsisthaliana…………………....……………………………………………………88 1.4.5.1Condicionesdecultivo…………………....………………………………..89 1.4.5.2Recogidadematerialbiológico…………………....………………….91 1.5MEDIOSDECULTIVOYSOLUCIONESNUTRITIVAS…………………....…………………………91 1.5.1E.coli…………………....…………………………………………………………………………….91 1.5.2A.tumefaciens…………………....……………..………………………………………………92 1.5.3S.cerevisiae…………………....………………………………………………………………….92 1.5.4A.thaliana…………………....……………………………………………………………………92 1.6ANTIBIÓTICOS…………………....……………………………………………………………………………….93 1.6.1E.coli…………………....…………………………………………………………………………….93 1.6.2A.tumefaciens…………………....……………………………………………………………..94 1.6.3A.thaliana…………………....……………………………………………………………………95 1.7TAMPONESYSOLUCIONES…………………....……………………………………………………………95 1.7.1BiologíaMolecular…………………....………………………………………………………95 1.7.1.1Ácidosnucleicos…………………....…………………………………………..95 1.7.1.2Preparacióndecélulascompetentes……………………………….96 1.7.1.3Transformacióndecélulas…………………....………………………….96 1.7.1.4Transformacióndeplantas…………………....…………………………96 1.7.1.5Microsomasdelevaduras…………………....…………………………..96 1.7.1.6Stockdecélulas…………………....……………………………………………97 1.7.2Bioquímica…………………....……………………………………………………………………97 1.7.2.1Extraccióndelípidosymetilacióndeácidosgrasos……….97 1.7.2.2EnsayosdeactividadHaDAGATinvitro…………………...……..98 1.8OLIGONUCLEÓTIDOS…………………....……………………………………………………………………..98 1.9PLÁSMIDOSYVECTORESDEEXPRESIÓN…………………....……………………………………….99
IV 2.MÉTODOS…………………………..…………………..…………………………………………………….....102 2.1BIOLOGÍAMOLECULAR…………………....………………………………………………………………..102 2.1.1Extraccióndeácidosnucleicos…………………....…………………………………102 2.1.1.1Protocolosdebacterias…………………....…………………………….102 2.1.1.1.1ExtraccióndeDNAplasmídico……….……102 2.1.1.2Protocolosdelevaduras…………………....……………………………102 2.1.1.2.1AislamientodeRNAtotal…………………….102 2.1.1.2.2SíntesisdelaprimeracadenadecDNA103 2.1.1.2.3ExtraccióndeDNAplasmídico…………….103 2.1.1.3Protocolosdeplantas…………………....………………………………..103 2.1.1.3.1AislamientodeRNAtotal…………………….103 2.1.1.3.2AislamientodemRNA………………………….104 2.1.1.3.3SíntesisdelaprimeracadenadecDNA104 2.1.1.3.4ExtraccióndegDNA……………………………..104 2.1.2Cuantificacióndeácidosnucleicos…………………....………………………….106 2.1.3Reacciónencadenadelapolimerasa(PCR)…………………....……………106 2.1.3.1AmplificacióndeDNAmediantePCR…………………....………106 2.1.3.2AmplificaciónrápidadelosextremosdelcDNA(RACE).108 2.1.3.4AnálisisdeexpresióngénicamediantePCRcuantitativa109 2.1.3.4.1Basesteóricas…………………....…………………109 2.1.3.4.2Aplicacióntécnica…………………....………….111 2.1.3.4.3Eficienciadeamplificación………………….112 2.1.3.4.4CuantificacióndelosproductosdePCR112 2.1.4Separaciónypurificacióndeácidosnucleicos…………………....………..113 2.1.4.1ElectroforesisdeDNAengeldeagarosa………………….......113 2.1.4.2PurificacióndefragmentosdeDNAapartirdegelde agarosa…………………………....……………………………………....……..114 2.1.5TratamientosenzimáticosdelDNA…………………....…………………………114 2.1.5.1DigestióndelDNAconnucleasasderestricción……………114 2.1.5.2DesfosforilacióndeextremosdelDNA…………………....……114 2.1.5.3LigacióndefragmentosdelDNA…………………....………………115 2.1.6Construccionesgénicas…………………....…………………………………………….116 2.1.6.1ClonaciónenplásmidosdeclonaciónenE.coli…………….116 2.1.6.2ClonaciónenvectordeexpresiónenS.cerevisiae……….116
V 2.1.6.3ClonaciónenvectordeexpresiónenA.thaliana………….118 2.1.7SecuenciacióndelDNA…………………....……………………………………………..119 2.1.8Transformacióngénica…………………....……………………………………………..119 2.1.8.1TransformacióngénicaenE.coli…………………....……………..119 2.1.8.1.1Preparacióndecélulascompetentes….119 2.1.8.1.2Transformaciónmediantechoque térmico…………………………………….…………..120 2.1.8.1.3Comprobacióndetransformantes………120 2.1.8.2TransformacióngénicaenA.tumefaciens…………………….122 2.1.8.2.1Preparacióndecélulascompetentes….122 2.1.8.2.2Transformaciónmediantechoque térmico………………….…………………………..…..122 2.1.8.2.3Comprobacióndetransformantes………123 2.1.8.3TransformacióngénicaenS.cerevisiae………………………….123 2.1.8.3.1TransformaciónmedianteLiAc‐PEG……123 2.1.8.3.2Comprobacióndetransformantes………124 2.1.8.4TransformacióngénicaenA.thaliana……………………………124 2.1.8.4.1SeleccióndelíneasKOhomocigotas…..124 2.1.8.4.2Transformaciónmediante A.tumefaciens……………………….……………..125 2.1.8.4.3Selecciónycomprobacióndelíneas transgénicas………………………………………….126 2.1.9Expresiónheterólogadeproteínasrecombinantes……………………..128 2.1.9.1AnálisisfuncionalenS.cerevisiae…………………....…………….128 2.1.9.1.1Induccióndeproteínasrecombinantes128 2.1.9.1.2Obtencióndemicrosomas……………………130 2.1.9.1.3Cuantificacióndeproteínas microsomales………………………….…………....131 2.1.9.2AnálisisfuncionalenA.thaliana…………………....………………131 2.1.9.2.1Análisisfenotípico…………………....………….132 2.1.9.2.2Análisisdeexpresióngénica………………..132 2.1.10Medidasdedensidadópticadecultivos…………………....……………….132 2.1.11Cálculodetasadecrecimientoytiempodegeneraciónde cultivos……………………………………………………………………………………………132
VI 2.2BIOQUÍMICA…………………....………………………………………………………………………………..133 2.2.1Análisisdelípidos…………………....………………………………………………………133 2.2.1.1Extraccióndelípidostotales…………………....…………………….134 2.2.1.1.1Protocolodelevaduras…………………....….134 2.2.1.1.2Protocolodeplantas…………………....……..134 2.2.1.2SeparacióndeTAGsmediantecromatografíaencapa fina(TLC)…………………....…………………………………………………….135 2.2.1.3Obtencióndeésteresmetílicosdeácidosgrasos (FAMEs)…………………....……………………………………………………….137 2.2.1.4SeparacióndeTAGsyFAMEsmediantecromatografía degases(GC)…………………....………………………………………………138 2.2.2CaracterizaciónbioquímicadeHaDAGATs…………………....……………..140 2.2.2.1EnsayodeactividadHaDAGATinvitro…………………....…….140 2.2.2.2Cuantificacióndelaradiactividadydeterminaciónde lacantidaddeTAGsformados…………………....…………………141 2.3BIOINFORMÁTICA…………………....………………………………………………………………………..142 2.3.1AnálisisinformáticodesecuenciasdeDNAyproteínas………………142 2.3.2Análisisinformáticodemuestrasydatos…………………....……………….143 2.4BIOESTADÍSTICA…………………....………………………………………………………………………….144 2.4.1Estadísticadescriptiva…………………....………………………………………………144 2.4.1.1Medidasdetendenciacentraloposición………………….....145 2.4.1.2Medidasdedispersión…………………....………………………………146 2.4.1.3Medidasdeformadeladistribución…………………....……….146 2.4.2Estadísticainferencial…………………....……………………………………………….147 2.4.3Genéticacuantitativa…………………....………………………………………………..150 2.5DISEÑOEXPERIMENTALYCRITERIOSDESELECCIÓNLÍNEAHOHE…………....………150 RESULTADOS135‐252 BLOQUEI:CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARYENZIMÁTICADELAS ACILTRANSFERASASIMPLICADASENLABIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSEN GIRASOL…………………....…………………………………....…………………………………....……………….157
VII 1.CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARYENZIMÁTICADELAS ENZIMASLISOFOSFATIDATOACILTRANSFERASAS1Y2(HaLPAAT1YHaLPAAT2) 1.1CLONACIÓNDELOSGENESHaLPAATs…………………....…………………………………….….157 1.1.1ClonacióndefragmentosinternosdeHaLPAATs…………………....…..157 1.1.2ObtencióndelassecuenciascompletasdecDNAdeHaLPAATs…159 1.2CARACTERIZACIÓNMOLECULARDEHaLPAATs…………………....…………………………..161 1.2.1Característicasfisicoquímicasdelassecuenciaspolipeptídicas deducidasapartirdeloscDNAsdeHaLPAATs…………………....….…..161 1.2.2Análisisfilogenéticodelassecuenciasaminoacídicasderivadas deHaLPAATs……………………………………....…………………………....……………..162 1.2.3PrediccióndeestructurasylocalizaciónsubcelulardeHaLPAATs164 1.3ANÁLISISDEEXPRESIÓNDEHaLPAATsENSEMILLASYTEJIDOSVEGETATIVOS..166 1.4CARACTERIZACIÓNENZIMÁTICADEHaLPAATs…………………....…………………………..168 1.4.1ExpresiónheterólogadeproteínasrecombinantesHaLPAATsen S.cerevisiae…………………....…………………………....………………………….........168 1.4.1.1EfectosobrelatasadecrecimientoenS.cerevisiae……169 1.4.1.2AnálisisdeexpresióndeHaLPAATsenS.cerevisiae……..171 1.4.1.3Análisislipídicoinvivo……………………………………………………..172 1.4.2AnálisisfuncionaldeproteínasrecombinantesHaLPAATsen A.thaliana…………………....…………………………....…………………………....……..172 1.4.2.1AnálisisdeexpresióndeHaLPAATsenA.thaliana..……..173 1.4.2.2Análisisfenotípicodesemillas……....……………………………….174 1.4.2.3Análisislipídicodesemillas……………………………………………..174 1.4.2.3.1AnálisisdelacomposicióndeTAGs…..174 1.4.2.3.2AnálisisdelacomposicióndeFAMEs…174 2.CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARYENZIMÁTICADELAS ENZIMASDIACILGLICEROLACILTRANSFERASAS1A,1BY2(HaDAGAT1A, HaDAGAT1BYHaDAGAT2)…………………………………………………………………………………...175 2.1CLONACIÓNDELOSGENESHaDAGATs…………………....…………………………....…………175 2.1.1ClonacióndefragmentosinternosdeHaDAGATs…………………....….175 2.1.2ObtencióndelassecuenciascompletasdecDNAdeHaDAGATs.176
VIII 2.2CARACTERIZACIÓNMOLECULARDEHaDAGATs…………………....………………………....179 2.2.1Característicasfisicoquímicasdelassecuenciaspolipeptídicas deducidasapartirdeloscDNAsdeHaDAGATs…………………....………179 2.2.2Análisisfilogenéticodelassecuenciasaminoacídicasderivadas deHaDAGATs…………………....…………………………....………………………………180 2.2.3PrediccióndeestructurasylocalizaciónsubcelulardeHaDAGATs184 2.3ANÁLISISDEEXPRESIÓNDEHaDAGATsENSEMILLASYTEJIDOSVEGETATIVOS.189 2.4CARACTERIZACIÓNENZIMÁTICADEHaDAGATs…………………....…………………………191 2.4.1ExpresiónheterólogadeproteínasrecombinantesHaDAGATs enS.cerevisiae……..………………………………………………………………………….191 2.4.1.1EfectosobrelatasadecrecimientoenS.cerevisiae……192 2.4.1.2AnálisisdeexpresióndeHaDAGATsenS.cerevisiae…..195 2.4.1.3Análisislipídicoinvivo…..…………………………………………………196 2.4.1.4EnsayosdeactividadHaDAGATinvitro…..…………………….197 2.4.1.4.1EfectodelpHenlaactividad……………….197 2.4.1.4.2Especificidadpordistintossustratos…..199 2.4.2AnálisisfuncionaldeproteínasrecombinantesHaDAGATsen A.thaliana….……………………………………………………..……………………………..200 2.4.2.1AnálisisdeexpresióndeHaDAGATsenA.thaliana………201 2.4.2.2Análisisfenotípicodesemillas…..…………………………………..202 2.4.2.3Análisislipídicodesemillas……………………………………………..202 2.4.2.3.1AnálisisdelacomposicióndeTAGs…….202 2.4.2.3.2AnálisisdelacomposicióndeFAMEs…202 BLOQUEII:ANÁLISISDETRIACILGLICÉRIDOS(TAGs)ENLÍNEAS MUTAGENIZADASDEGIRASOLALTOOLEICOALTOESTEÁRICO(HOHE)Y SELECCIÓNDENUEVOSCANDIDATOS…..………………………………………………………….…203 1.OBJETIVOYCRITERIOSDESELECCIÓN……………………………….………………….…………203 2.ANÁLISISDESCRIPTIVODEPOBLACIONES(M2‐M5)…………………………….….……...204 2.1GENERACIÓNM2…………………………………………………………………………………………………204 2.2GENERACIÓNM3…………………………………………………………………………………………………204 2.3GENERACIÓNM4…………………………………………………………………………………………………204
IX 2.4GENERACIÓNM5…………………………………………………………………………………………………205 3.ANÁLISISESTADÍSTICODEPOBLACIONES(M2‐M5)…………………….…………..……..206 3.1ANÁLISISPORVARIABLESALOLARGODELASGENERACIONES…..……………………206 3.1.1Contenidoesteárico(E)…..…………………………………………………………...…206 3.1.2ContenidoEOE…..……………………………………………………..……………………..216 3.1.3ContenidoSUS…..……………………………………………………..……………………..226 3.1.4ValorαSat…..……………………………………………………..……………………………..235 3.2ANÁLISISDERELACIÓNDEVARIABLESPORGENERACIONES…..………………………..245 3.2.1GeneraciónM2…..……………………………………………………..……………………..245 3.2.2GeneraciónM3…..……………………………………………………..……………………..249 3.2.1GeneraciónM4…..………………………………………………………………………….…249 3.2.2GeneraciónM5…..……………………………………………………..……………………..249 DISCUSIÓN 53‐288 BLOQUEI:CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARYENZIMÁTICADELAS ACILTRANSFERASASIMPLICADASENLABIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSEN GIRASOL…..……………………………………………………..……..……………………………………………….255 1.CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARDELASENZIMASIMPLICADAS ENLABIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL:HaLPAATsYHaDAGATs 1.1CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNFISICOQUÍMICADEHaLPAATsYHaDAGATs..255 1.2ANÁLISISFILOGENÉTICODEHaLPAATsYHaDAGATs…………………………………………256 1.2.1EvolucióndefamiliasgénicasLPATsyDGATs……………………………….257 1.3PREDICCIÓNDEESTRUCTURASDEHaLPAATsYHaDAGATs………………………………258 1.3.1Estudiocomparativodemotivosconservadosyresiduos aminoacídicos…………………………………………………………………………………..259 1.3.1.1HaLPAATs…………………………………………………………………………….260 1.3.1.2HaDAGATs……………………………………………………………………………261 1.3.2Estudiocomparativodedominiostransmembrana(TMDs)……..…265 1.4LOCALIZACIÓNSUBCELULARDEHaLPAATsYHaDAGATs………………………………….266 1.4.1Localizaciónensubdominiosyrelaciónconotroselementos…….268
X 1.5ESTUDIOCOMPARATIVODEMODELOSTOPOLÓGICOSDEHaLPAATs YHaDAGATs……………………………………………………………………………………………….…….270 1.6ANÁLISISCOMPARATIVODELOSNIVELESDEEXPRESIÓNDEHaLPAATs YHaDAGATs………………………………………………………………………………………………………273 1.6.1LPATs…………………………………………………………………………………………………274 1.6.2DGATs……………………………………………………………………………………………….274 1.6.3RegulacióndelaexpresióndeHaLPAATsyHaDAGATsen semillasendesarrollo………………………………………………………………………275 2.CARACTERIZACIÓNBIOQUÍMICADELASENZIMASIMPLICADASENLA BIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL:HaLPAATsYHaDAGATs…..277 2.1HaLPAATs…………………………………………………………………………………………………………277 2.1.1Nivelcantidad…………………………………………………………………………………..278 2.1.2Nivelcalidad……………………………………………………………………………………..278 2.2HaDAGATs……………………………………………………………………………………………………….281 2.2.1Nivelcantidad…………………………………………………………………………………..281 2.2.2Nivelcalidad……………………………………………………………………………………..285 BLOQUEII:ANÁLISISDETRIACILGLICÉRIDOS(TAGs)ENLÍNEAS MUTAGENIZADASDEGIRASOLALTOOLEICOALTOESTEÁRICO(HOHE)Y SELECCIÓNDENUEVOSCANDIDATOS………………………………………………………………..288 CONCLUSIONES289‐294 BIBLIOGRAFÍA295‐326 APÉNDICES327‐332
XI ÍNDICEDEFIGURAS 1. Radiografíadeplantadegirasol 2. Inflorescenciaysemilladegirasol 3. Distribuciónmundialdelcultivodegirasol 4. Evolucióndelaproducción(Mt)ysuperficiecultivada(Mha)desemillasde girasolenlasúltimasdécadasanivelmundial(FAOSTAT,2015) 5. Comparativadelaevolucióndelaproducción(milesdetoneladas,kt)de aceitedegirasolenlasúltimasdécadasanivelmundialyEspaña(FAOSTAT, 2015) 6. Evolucióndelaproducción(Mt)ysuperficiecultivada(Mha)desemillasde girasolenlasúltimasdécadasenEspaña(FAOSTAT,2015) 7. Ejemplosdelasestructurasrepresentativasparacadacategoríadelípidos (LIPIDMAPS‐ICCNL) 8. Esquemacomparativodelasestructurasdevariosácidosgrasos 9. Estructuradelosacilglicéridos 10. Disposiciónestructuraldelospolimorfismosdelostriacilglicéridosensus formasβyβ’ 11. Representacióngráficadelastresposicionesestereoespecíficasdeácidos grasosenlamoléculadeTAG 12. Estructuradelosfosfolípidos 13. Esquemageneraldelarutadebiosíntesisdelípidosenplantas 14. Diagramaesquemáticodelarutadebiosíntesisdelosácidosgrasos principalessaturados,monoinsaturado(MUFA)ypoliinsaturados(PUFAs)en semillasdeoleaginosas,asícomosuspropiedadesnutritivasyfuncionales 15. Representaciónesquemáticadelosplásmidosyvectoresusadoseneste trabajo 16. CurvadeamplificacióndelaqRT‐PCR 17. MétodorápidoparalaidentificacióndetransformantesA.thalianaempleado enestetrabajo 18. SeleccióndetransformantesA.thalianaresistentesahigromicinaB 19. Separacióndelípidosneutrosporcromatografíaencapafina(TLC) 20. Esterificacióndetriacilglicérido(TAG)ensusésteresmetílicosdeácidosgrasos (FAMEs)
XVIII B.NOMENCLATURADELOSÁCIDOSGRASOS NombrecomúnNombresistemáticoAbreviaturaSímbolo Láurico Dodecanoico 12:0 MirísricoTetradecanoico14:0 PalmíticoHexadecanoico16:0P PalmitoleicoCis‐9‐hexadecenoico16:1ω7c EsteáricoOctadecanoico18:0E OleicoCis‐9‐octadecenoico18:1ω9cO LinoleicoCis,cis‐9,12‐octadecadienoico18:2ω6c,9cL α‐linolénicoCis,cis,cis‐9,12,15‐octadecatrienoico 18:3ω3c,6c,9cLn γ‐linolénicoCis,cis,cis‐6,9,12‐octadecatrienoico18:3ω6c,9c,12c AráquicoEicosanoico20:0 GadoleicoCis‐11‐icosenoico20:1ω9c AraquidónicoEicosatetraenoico20:4ω6A BehénicoDocosanoico22:0B ErúcicoCis‐13‐docosenoico22:1ω9c LignocéricoTetracosanoico24:0 C.NOMENCLATURADELOSACIL‐COAs 18:0‐CoAEstearil‐CoA 18:1‐CoAOleil‐CoA D.NOMENCLATURADELOSTRIACILGLICÉRIDOS SSS Saturado‐Saturado‐Saturado SISSaturado‐Insaturado‐Saturado SIISaturado‐Insaturado‐Insaturado αSatCoeficientedeasimetría
XIX E.NOMENCLATURADELOSAMINOÁCIDOS NombrecomúnAbreviaturaSímboloMW ÁcidoAspartico Ácidoglutámico Alanina Arginina Asparragina Cisteina Fenilalanina Glicina Glutamina Histidina Isoleucina Leucina Lisina Metionina Prolina Serina Tirosina Treonina Triptofano Valina Asp Glu Ala Arg Asn Cys Phe Gly Gln His Ile Leu Lys Met Pro Ser Try Thr Trp Val D E A R N C F G Q H I L K M P S Y T W V 133 147 89 174 132 121 165 75 146 155 131 131 146 149 115 105 181 119 204 117 F.ORGANISMOS NombrecientíficoAbreviaturaNombrecientíficoAbreviatura Agrobacteriumtumefaciens Arabidopsisthaliana Brassica Escherichiacoli Euonymus Glycinemax Helianthusannuus Helianthusciliaris Nicotianatabacum Oleaeuropaea A.tumefaciens At|A.thaliana B Ec|E.coli E Gm|G.max Ha|H.annuus Hc|H.ciliaris Nt|N.tabacum Oe|O.europaea Oryzasativa Perillafrutescens Physcomitrellapatens Piceasitchensis Ricinuscommunis Saccharomycescerevisiae Thermusthermophilus Verniciafordii Zeamays Os|O.sativa Pf|P.frutescens Pp|P.patens Ps|P.sitchensis Rc|R.communis Sc|S.cerevisiae Tt|T.thermophilus Vf|V.fordii Zm|Z.mays
XX G.ENZIMASYSUSTRATOS AbreviaturaEnzima ACAT ACC ACP ACS BCCP CPT DAGAT DGTA DH ELO ENR FAD2 FAD3 FAD6 FAD7/8 FAE FAH FASI FASII FASIII FatA FatB GPAT KAS KCS KR LPAAT LPCAT MCAT MAGAT mtKAS ODS OLE PAP PDAT PPasa SAD TE Acetil‐CoA:ACPtransacilasa Acetil‐CoAcarboxilasa Proteínatransportadoradeacilos Acil‐CoAsintetasa Proteínatransportadoradebiotinacarboxilada Colinafosfotransferasa Diacilglicerolaciltransferasa Diacilglicerol:Diacilgliceroltransacilasa ß‐hidroxiacil‐ACPdehidratasa Elongasadeácidosgrasos(levaduras) Enoil‐ACPreductasa Oleatodesaturasamicrosomal Linoleatodesaturasamicrosomal Oleatodesaturasaplastidial Linoleatodesaturasaplastidial Elongasadeácidosgrasos Oleato‐12‐hidroxilasa(R.communis) ComplejoácidograsosintetasaI ComplejoácidograsosintetasaII ComplejoácidograsosintetasaIII Acil‐ACPtioesterasatipoA Acil‐ACPtioesterasatipoB Glicerol‐3‐fosfatoaciltransferasa ß‐cetoacil‐ACPsintasa ß‐cetoacil‐CoAsintasa ß‐cetoacil‐ACPreductasa Lisofosfatidilaciltransferasa Lisofosfatidilcolinaaciltransferasa Malonil‐CoA:ACPtransacilasa Monoacilglicerolaciltransferasa ß‐cetoacil‐ACPsintasamitocondrial Oleatodesaturasa Δ9desaturasa(levaduras) Fosfatidatofosfatasa Fosfolípido‐diacilglicerolaciltransferasa Fosfatidatofosfatasa Estearatodesaturasaóestearil‐ACPdesaturasa Acil‐ACPtioesterasas
XXI Abreviatura Sustrato ADP AG AGL AMP ATP CoA CoASH DAG DGDG dNTPs G3P LPA LPC MAG MGDG NAD NADP NADPH PA PC PE PI PSer TAG VLCFA Adenosina‐5’‐difostato Ácidosgrasos Ácidosgrasoslibres Adenosina‐5’‐monofosfato Adenosina‐5’‐trifosfato CoenzimaA CoenzimaAcongruposulfhidrilo Diacilglicerol Digalactosildiacilglicerol Desoxirribonucleótidostrifosfato Glicerol‐3‐fosfato Ácidolisofosfatídicoólisofosfatidato Lisofosfatidilcolina Monoacilglicerol Monogalactosildiacilglicerol Nicotinamidaadeninadinucleótido Nicotinamidaadeninadinucleótidofosfato Nicotinamidaadeninadinucleótidotrifosfato Ácidofostatídicoófosfatidato Fosfatidilcolina Fosfatidiletanolamina Fosfatidilinositol Fosfatidilserina Triacilglicéridosótriglicéridos Ácidosgrasosdecadenamuylarga
XXII H.PRODUCTOSQUÍMICOS AbreviaturaProductoquímico BHT BrEt DMP DMSO DTT EDTA EGTA EMS HCL IPTG MES MetOH Ni‐NTA PEG SDS TEMED X‐Gal Butilhidroxitolueno Bromurodeetidio Dimetoxipropano Dimetilsulfóxido Ditiotreitol Ácidoetilendiaminotetraacético Ácidoetilenglicoltetraacétido Etilmetanosulfonato Ácidoclorhídrico Isopropil‐ß‐D‐tiogalactopiranósido Ácido2‐(n‐morfolin)etanosulfónico Metanol Ácidonitrilotriacético‐níquel Polietilenglicol Dodecilsulfatosódico N,N,N’,N’‐tetrametiletilenodiamina 5’‐bromo‐4‐cloro‐3‐indolil‐ß‐D‐galactósido I.GENOTIPOYMARCADORESGENÉTICOS GenotipoymarcadoresgenéticosusadosenlascepasdeE.coli Amp argF bioA cm,cat cro deoR endA F’ Construcciónqueconfiereresistenciaaampicilina Mutaciónenornitinacabamoiltransferasaquebloqueala capacidaddeusararginina Adenosilmetionina‐8‐amino‐7‐oxononanoatoaminotransferasa Construcciónqueconfiereresistenciaacloranfenicol Genquecodificaparaunaproteínadelisistempranaenelfagoλ Genreguladorquepermitelaexpresiónconstitutivadelosgenes desíntesisdedeoxirribosas.Permitelatomadegrandesplásmidos MutaciónenendonucleasanoespecíficaI,eliminandosu actividad,porloquemejoralapreparacióndeplásmidos Plásmidoautotrasmisivoydebajacopiausadoparageneraciónde DNAmonocatenariocuandoseinfectaconelfagoM13;puede contenerunmarcadorderesistenciaquepermitael mantenimientoynormalmentellevalosgenotiposlacIyLacZΔM15
XXIII galK gyrA96 hsd Kan lacI lacY1 lacZ LacZΔM15 mcrA,mcrBComrr mutS phoA phoAB recA relA supE,F Tet thi‐1 Tn10 λcI857 Mutaciónengalactoquinasaquebloqueaelcatabolismodela galactosa.LascélulasquesongalKposeenuncrecimientolentoen presenciadegalactosacomoúnicafuentedecarbono MutaciónenDNAgirasaqueproduceresistenciaalácidonalidixico NombregenéricodeendonucleasasdeE.coli Construcciónqueconfiereresistenciaakanamicina Codificaelrepresorlacquecontrolalaexpresióndepromotores quellevanunoperadorlac.ElIPTGseunealrepresorlacylo desplazadelpromotor;frecuentementeusadoalescanearcélulas blancas/azulesoparaelcontroldeexpresióndegenes recombinantes Mutaciónquebloqueaelusodelactosaviaβ‐D‐galactosidasa Gendelaβ‐D‐galactosidasa;mutacionesenestegenproducen coloniassincolorenpresenciadeX‐Gal Elementorequeridoparacomplementacióndelaβ‐D‐ galactosidasacuandoseempleaX‐Gal;usadoenlabúsquedade recombinantesblancos/azules;normalmentellevadoenelprofago lambdaφ80oF’ MutacionesquepermitenlametilacióndelDNAquenohasido reconocidocomoforáneo;estegenotipoesnecesariocuandose clonaDNAgenómicoocDNAmetilado Mutaciónenelmecanismodereparacióncelular.Permitequeel procesoderecombinaciónnoseaeliminadoporlacélula Mutaciónenfosfatasaalcalina Mutaciónqueimpideelcrecimientocelularenmediomínimosin prolina Mutaciónengenresponsableparalarecombinacióngeneralde DNA ElRNAessintetizadoenausenciadesíntesisproteica(fenotipo relajado).EllocusrelAregulaelacoplamientoentrela transcripciónylatraducción.Enelsilvestre,concentraciones limitantesdeaminoácidosresultanenunacaídadelasíntesisde RNA MutaciónensupresordelRNAtransferentedeglutaminade ambar(supE)(UAG)otirosina(supF) Construcciónqueconfiereresistenciaatetraciclina Mutaciónqueimpideelcrecimientocelularenmediomínimosin tiamina Construcciónqueconfiereresistenciaatetraciclinapormediode untransposóncuandonoseindiquelocontrario RepresortermosensibledelosgenesRedbajoeloperónpL
XXIV GenotipoymarcadoresgenéticosusadosenlascepasdeS.cerevisiae ADE2 ade2‐1 are1‐Δ::HIS3 are2‐Δ::LEU2 can1‐100 dga1‐Δ::KanMX4 his3‐11,15 leu2,3‐112 lro1‐Δ::TRP1 MATα trp1‐1 ura3‐1 Genquecodificalacarboxilasadefosforibosilaminoimidazol implicadaenlasíntesisdeadenina MutaciónenelgenADE2quecodificalacarboxilasade fosforibosilaminoimidazolimplicadaenlasíntesisdeadenina MutaciónenelgenARE1quecodifica,juntoaARE2,laacetil‐CoA aciltransferasaimplicadaenlasíntesisdeésteresdeesterol. MutaciónporinsercióndelgenHIS3 MutaciónenelgenARE2quecodifica,juntoaARE1,laacetil‐CoA aciltransferasaimplicadaenlasíntesisdeésteresdeesterol. MutaciónporinsercióndelgenLEU2 MutaciónenelgenCAN1quecodificaunapermeasaqueconfiere sensibilidadalacanavalina MutaciónenelgenDGA1quecodificaladiacilglicerol aciltransferasaimplicadaenlasíntesisdetriacilglicéridos. MutaciónporinsercióndelgenKanMX4queconfiereresistenciaa kanamicina MutaciónenelgenHIS3quecodificalaimidazolegliceron fosfatasaimplicadaenlasíntesisdehistidina MutaciónenelgenLEU2quecodificalaβ‐Isopropilmalato deshidrogenasaimplicadaenlasíntesisdeleucina MutaciónenelgenLRO1quecodificalafosfolípido:diacilglicerol aciltransferasaimplicadaenlasíntesisdetriacilglicéridos. MutaciónporinsercióndelgenTRP1 TiposexualhaploidedeS.cerevisiae MutaciónenelgenTRP1quecodificalaanthranilatoisomerasa implicadaenlasíntesisdetriptófano MutaciónenelgengenURA3quecodificalaorotidina‐5'‐fosfato descarboxilasaimplicadaenlasíntesisdepirimidina GenotipoymarcadoresgenéticosusadosenlascepasdeA.tumefaciens rpoH+ElgenrpoHcodificanparaelgenhomólogodeE.colisigma32 (heatshocksigmafactor) hrcA+RepresordelatranscripcioninducibleportemperturaHrcA. ReguladornegativodegenesdechoquetérmicodeclaseI (operonesgrpE‐dnaK‐dnaJandgroELS).
XXV J.OTROS AbreviaturaNombre A.C. Aprox BSA CAS C cDNA CO2 Col‐0 Ct C‐terminal DNA DO E.C. EST etal. F F1 F2/M2 FAMEs GC gDNA GLC ICCNL INV IUPAC KM LIPIDMAPS LB MCS Mr mRNA MW Nº/nº N‐terminal ORF PAGE PCR PF AntesdeCristo Aproximadamente Albúminadesuerobovino ColecciónAndaluzadeGirasoles Carbono DNAcomplementario Dióxidodecarbono Columbia Cicloumbral(RT‐PCR) Carboxiloterminal Ácidodesoxirribonucleico Densidadóptica Númeroenzimático(EnzymeCommissionnumber) Marcadordesecuenciaexpresada Ycolaboradores Forward(oligonucleótidos) Primerageneración Segundageneración Ésteresmetílicosdeácidosgrasos Cromatografíadegases DNAgenómico Cromatografíagas‐líquido ComitéInternacionalparalaClasificaciónyNomenclaturadeLípidos Invernadero UniónInternacionaldeQuímicaPurayAplicada Afinidadporsustrato TheLipidMetabolitesandPathwaysStrategy MedioLuriaBertani Sitiodeclonaciónmúltiple Pesomolecularrelativo RNAmensajero Pesomolecular Número Aminoterminal Pautaabiertadelectura Electroforesisengeldepoliacrilamida Reacciónencadenadelapolimerasa Pesofresco
XXVI pH pI qRT‐PCR R RACE RE Rn RNA SC SC‐URA SD SDW sn‐ TM TLC URA UV WT YPD Potencialdehidrógeno Puntoisoeléctrico PCRcuantitativaatiemporeal Reverse(oligonucleótidos) AmplificaciónrápidadelosextremosdelcDNA Retículoendoplásmico Emisióndefluorescencia(RT‐PCR) Ácidoribonucleico Mediomínimo(levaduras) Mediomínimodeselección(levaduras) Desviaciónestándar Aguadestiladaestéril PosiciónestereoespecíficadeacilosenTAG Segmentostransmembranas Cromatografíaencapafina Uracilo Ultravioleta Tiposilvestre Medioenriquecido(levaduras)
INTRODUCCIÓN|1‐72 1.GIRASOL 3 1.1HISTORIA,ORIGENYBOTÁNICA3 1.2MORFOLOGÍAYFISIOLOGÍA4 1.3IMPORTANCIAECONÓMICAYDISTRIBUCIÓNDELCULTIVO9 1.4PRODUCCIÓNYCONSUMO10 1.5MEJORADELCULTIVOYPERSPECTIVASDEFUTURO14 2.LÍPIDOSDEPLANTAS:CLASIFICACIÓNYFUNCIÓN16 2.1ÁCIDOSGRASOS(AGs)19 2.2ACILGLICÉRIDOS25 2.3FOSFOLÍPIDOS30 3.LÍPIDOSDEPLANTAS:BIOSÍNTESIS32 3.1SÍNTESISDENOVO DEÁCIDOSGRASOS(AGs)32 3.2FORMACIÓNDELPOOLDEACIL‐CoAs34 3.3BIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOS(TAGs)35 4.LÍPIDOSDEPLANTAS:MODIFICACIÓN43 4.1CRITERIOSDESELECCIÓN44 4.2PROBLEMÁTICAACTUAL47 4.3MODIFICACIÓNDELCONTENIDOGRASODELASSEMILLAS49 4.4MODIFICACIÓNDELACALIDADDELOSACEITES52 5.ACEITEDEGIRASOL61 5.1CARACTERÍSTICASGENERALES61 5.2OBTENCIÓNDEMUTANTESCONCOMPOSICIÓNMODIFICADADEACEITE62
Introducción 8 Laduracióndelciclodelgirasoldependedelavariedadyelmomentodela siembra.Éstesedivideenvariasetapas(AlbayLlanos,1990): Lagerminaciónyemergenciadiscurrendesdelasiembrahastalaaparicióndelos cotiledones.Enfuncióndelahumedadylatemperaturapuededurarde10‐30 días.Acontinuaciónseproducelaformacióndelasprimerashojas(4‐5pares). Duranteestafaseseproduceunrápidocrecimientodelaraíz,loquecondiciona elposteriorvigordelaplanta.Enestaetapa,ladisponibilidaddeaguaesvital, siendoperjudicialtantolafaltacomoelexcesodeésta.Estafaseduraentre15‐ 25días.Apartirdeestemomentotienelugarlafasedecrecimientomásactivay demáximaabsorcióndemineralesdelsuelo,queseprolongahastaeliniciodela floración. Lafloracióncomprendetodoelperíodoenelquelasfloressevanabriendoy tieneunaduracióndeentre40‐50días.Enestepunto,laplantaesespecialmente sensiblealestréshídrico,asícomoatemperaturasextremas.Lasprimerasflores enabrirsesonlasdelaparteexteriordelcapítuloycontinúaconlaaperturade losanillosexterioreshaciaelcentro(floracióncentrípeta),arazónde1‐5anillos pordía.Lasfloresliguladasquerodeanelcapítulocomienzanasecarseycaen díasdespuésdeabrirselasúltimasfloresdelcentrodelcapítulo.Elprocesotarda encompletarsede10‐12días. Lapolinizaciónyfecundación,llevadaacaboporinsectos,esgeneralmente alegama(fecundacióncruzadaentrefloresdistintas).Losóvulos,unavez fecundados,recibensustanciasdereservahastaqueseconviertenensemilla madura. Lafasedemaduraciónsecompletaunavezalcanzadalamadurezfisiológica,esto es,elmomentoenelquelasemillaalcanzasumáximopesoseco,loque representaelfindelperíododellenado.Estafasesueledurarentre35‐50díasy finalizacuandolasemillatieneaproximadamenteun40%dehumedad, momentoenelque,sisedanlascondicionesadecuadas,vuelveagerminar.
Introducción 9 1.3 IMPORTANCIAECONÓMICAYDISTRIBUCIÓNDELCULTIVO Actualmente,elgirasolesunadelascincoplantasoleaginosasparaconsumo humanomáscultivadasentodoelmundo. Lasrazonesdeléxitodeestecultivopuedenresumirseendos:porunlado,el girasolesunaplantarústicadefácilcultivoytieneunabuenaadaptaciónauna granvariedaddesuelos.Dehecho,lasregionesdemayorproducciónselocalizan muyalejadasdesucentrodeorigen.Porotrolado,poseeunaltoporcentajede aceiteensemilla(38‐52%),aceitequehaencontrado,desdeelprimermomento, unaexcelenteacogidaentrelosconsumidores,científicosydietistas,debidoasu calidaddietéticaysuscualidadesfísico‐químicas.Larelativasencillezdelas técnicasindustrialesparasuextracción,asícomosufácilconservaciónybajo costefrenteaotrosaceites,permiten,además,alcanzaraltosrendimientosensu producción,constituyendounaventajaañadidaparasuindustrializacióny comercio(AlbayLlanos,1990). Elpapelquetieneenlaalimentaciónhumanasecompletatambiénconotros usos,comosonlosforrajerosytécnicos.Latortadegirasol,subproductodela extraccióndelaceitedesemillas,tambiénseempleaenlaproduccióndeharinas proteicasporsualtocontenidoproteico(53‐66%),yaseaparaconsumoanimalo humano(Bauetal.,1983).Recientemente,elaceitedegirasoltambiénseestá utilizandoenlaproduccióndebiolubricantes,permitiendoasíproducir conjuntamenteunalimentoyunproductoindustrial,locualcontribuye decisivamentealarentabilidaddesucultivo.Además,elaceitedegirasol,juntoa otrosaceitesvegetales,seconsideradeparticularinterésparalaindustriade pinturasycosméticos,queconstantementedemandanaceitesconuna composiciónespecíficadeácidosgrasos. LadistribucióndelgirasolocupacasilatotalidaddeAméricadelNorte,desde CanadáhastaelnortedeMéxico,asícomoArgentina,yestápresenteenla mayoríadelospaíseseuropeos,ademásdeRusia.Losfocosdeproducciónse localizanmayoritariamenteendichasregiones(Figura3).
Introducción 10 Figura3.Distribuciónmundialdelcultivodegirasol. Enverdesemarcanlaszonasdecultivo. 1.4PRODUCCIÓNYCONSUMO Enelúltimomediosiglo,elcultivodegirasolhaexperimentadounimportante desarrollo,triplicándoselasuperficiemundialdedicadaasucultivodesde1961 hasta2012,pasandode6,6a25,0millonesdehectáreas(Mha)(FAOSTAT,2015). Suproduccióntambiénsehavistoincrementada,habiéndosequintuplicadocon crecesenelmismoperíodoalpasarde6,8a37,0millonesdetoneladas(Mt) (FAOSTAT,2015).Noobstante,latendenciageneralactualsecaracterizapor períodosascendentesconsignificativosdescensospuntualesenambos parámetros(Figura4). Comoyahemosmencionado,elprincipaldestinodelcultivodegirasolesla elaboracióndeaceiteparaalimentación.Enlaactualidad,elaceitedegirasol representamásdel10%delaproducciónmundialdeaceitesvegetales,loquelo convierteenelcuartoenimportanciadeproducción,tansólosuperadoporlos aceitesdecolza,sojaypalma.
Introducción 11 Tabla1.Principalespaísesproductoresdeaceite degirasolenelmundoenelaño2012 (FAOSTAT,2015). Laproduccióndelaceitedegirasolanivelmundial,expresadaenmilesde toneladas(kt),haidoevolucionandodeformairregular,sibiensehaproducido enlaúltimadécadaunincrementomuysignificativo(Figura5). En2012,laproducciónmundialdeaceitedegirasolsesituóentornoalas15,21 millonesdetoneladas,delosque2,66millonescorrespondíanalconjuntodelos paísesdelaUniónEuropea(UE),cantidadampliamentesuperadaporUcraniay Rusia,principalespaísesproductores(FAOSTAT,2015).EnelsenodelaUE, Alemaniaseerigiócomoprimerproductor,seguidodeFranciayEspaña.Enla Tabla1seresumenlosdoceprincipalespaísesproductoresdeaceitedegirasol enelmundocorrespondienteadichoaño,ordenadosdemayoramenor producción(kt)(FAOSTAT,2015). PaísProducción(kt) Ucrania3937,2 Rusia3632,0 Argentina1541,6 Turquía819,2 China598,1 Alemania492,0 Francia463,0 Hungría373,7 España268,3 Sudáfrica265,8 Rumanía250,4 Holanda215,0 Rusia,quehastaahoraeraconsideradalaprimerapotenciamundial,sehavisto relegadaalsegundopuestograciasalaugeexperimentadoporUcraniaenlos últimosaños.En2011,Ucraniaproducíayaalgomásde3millonesdetoneladas deaceitedegirasol,habiendoexportadomásdel80%deestacifra, convirtiéndoseasíenelprimerpaísproductordeaceitedegirasolyexportador delmundo(FAOSTAT,2015).Escuriosovercómoestepaís,peseasutamaño, producehoydíamásvolumendeaceitedegirasolquetodalaextintaUnión
Introducción 12 Soviética.Estosedebeaquehacemásdeunadécada,Ucraniacomenzóa estimularsuindustriadeproduccióndeaceitepormediodelaintroducciónde losimpuestosdeexportaciónparalassemillas.Además,creóincentivos destacadosparalosproductoresnacionales,queaceleraronlaproducciónde aceitedegirasolanivelnacionalenlugardeexportarelproductoenbrutoalas plantasdeprocesamientodelextranjero.Deestaforma,ydesdeentonces, Ucraniahadescendidodeformagraduallosimpuestosdelasexportaciones.Por otrolado,Indiaseconstituyecomoelprimerpaísimportadordeaceitede girasol,seguidodelejosporTurquíayBélgica,segúndatosobtenidosenelaño 2011(FAOSTAT,2015). España,porsuparte,haexperimentadoundescensopaulatinodelaproducción deaceitedegirasolenlasúltimasdécadas(Figura5).Sinembargo,desdehace unosaños,seobservaunaincipienterecuperacióndelaproducciónque,peseal bruscodescensode2012,sitúaalpaísenelnovenopuestodelosprincipales paísesproductoresdeesteaceite(Tabla1).Estaprontarecuperaciónybrusco descensotambiénsonvisiblesalcompararlosdatosdeproducciónysuperficie cultivadadesemillasdegirasol(Figura6),apesardequeambosparámetrosno handejadodecrecerdesdeelaño2005(FAOSTAT,2015).Noobstante,este cultivosuponemásdel10%delaproduccióntotaldeoleaginosasennuestro país,tansólosuperadoporelcultivodeaceitunas(80%),siendosuinterés indiscutiblehoydía(FAOSTAT,2015).
Introducción 13 Figura6.Evolucióndelaproducción(Mt)ysuperficiecultivada(Mha)desemillasdegirasol enlasúltimasdécadasenEspaña(FAOSTAT,2015). Figura5.Comparativadelaevolucióndelaproducción(milesdetoneladas,kt)deaceitede girasolenlasúltimasdécadasanivelmundialyEspaña(FAOSTAT,2015). Figura4.Evolucióndelaproducción(Mt)ysuperficiecultivada(Mha)desemillasdegirasol enlasúltimasdécadasanivelmundial(FAOSTAT,2015).
Introducción 14 Encuantoalconsumodeaceitedegirasol,laAntiguaRepúblicaYugoslavade Macedoniasecolocacomoelmayorpaísconsumidordelmundo,con16,20 kg/persona/año,seguidadeMontenegrocon13,60yHungríayBulgariacon 12,60kg/persona/añocadauno,segúndatosrecogidosenelaño2009 (FAOSTAT,2015).Enesemismoaño,elaceitedegirasolacaparóenEspañael 34%delacuotademercadosdeaceitescomestibles,conunconsumo aproximadode9,40kg/persona/año,cifraqueloconvierteenelundécimo consumidordeaceitedegirasoldelmundo(FAOSTAT,2015).Elaceitedegirasol, sinembargo,noestanpopularenChina,conunconsumodetansólo0,10 kg/persona/añoenelaño2009.AlgoparecidoocurreenEEUUque,apesarde serelmayorconsumidordeaceitesvegetalesdelmundoycontarconuna importanteAsociaciónNacionaldeProductoresdeGirasol,consumióalrededor de0,10kg/persona/añodeesteaceiteenesemismoaño(FAOSTAT,2015). 1.5MEJORADELCULTIVOYPERSPECTIVASDEFUTURO Enelcultivodegirasolsehaperseguidodesdesusinicioslaobtencióndenuevas variedadesconmejorastalescomounamayorproduccióndesemillasyaceite, unamayorresistenciaaenfermedadesyparásitosyunamayorresistenciaa condicionesdecultivoadversas,comolasequíaolaelevadasalinidaddelos suelos,todasellasencaminadasaincrementarelrendimiento.Paraconseguir estosobjetivossehanestadoutilizandodiversasestrategiasalolargodel tiempo. Laestrategiatradicionalutilizadahasidolamejoradelcultivoaprovechandola variabilidadgenéticanaturalqueposeeelgirasol.Graciasaestacualidad,desde losiniciosdelamejoraclásicaenRusiaafinalesdelsigloXIX,seconsiguióreducir hastaunoelnúmerodecapítulosporplanta,incrementareltamañodelas semillas(Vrânceanu,1977)ypasardevariedadesconuncontenidodeaceitedel 30%(1912‐1926)avariedadesconunrendimientodeaceitedel45‐50%a principiosdelosaños60.Estasmejorasconfirieronaestaplantalaconsideración eimportanciadecultivooleaginosoqueactualmentetiene(Sharmaetal.,2012).
Introducción 15 Posteriormente,sedesarrollólamejoramediantelaobtencióndehíbridos, aprovechandoelfenómenodelaheterosisovigorhíbridodeprimera generación.LamejoramediantelaheterosisdiosusprimerosfrutosenCanadáa mediadosdelsiglopasado,perodebidoaqueseusabaesterilidadgénicayque sobreelparentalfemeninosucedíatantoautopolinizacióncomopolinización cruzada,losporcentajesdehibridacióneranmenoresdel50%(Röbbelenetal., 1989).Esteproblemasesolucionóaprincipiosdelosaños70conlaintroducción enlalíneaparentalfemeninadelcarácterdeandroesterilidadcitoplásmica (CMS).Estecaráctersetransfieredeunageneraciónaotraporvíamaterna,está relacionadoconlaproduccióndeunaproteínamitocondrialalteradaylas plantasqueloposeensonincapacesdeproducirpolen(Köhleretal.,1991).La líneamasculinautilizadaparaobtenerhíbridos,ademásdeproducirpolen,debe contenerlosgenesrestauradoresdelafertilidad,paraqueloshíbridosde primerageneraciónobtenidospuedanproducirpolendemaneranormaly,por tanto,semillas.Así,ydebidoaquesiempreseusanlíneasCMScomoparental femenino,todosloshíbridoscultivadosestánrelacionados,almenosencuantoa sucitoplasma(Friedt,1992). Sinembargo,dadoquetantolavariabilidadgenéticanaturaldelgirasolcomola conseguidamediantelahibridaciónsonenocasionesinsuficientesparaconseguir líneasconunascaracterísticasdeterminadas,esnecesariorecurriraotras técnicas,comolamutagénesisolaingenieríagenética.Esteaspectoserá ampliamentetratadoenIntroducción,4y5. Encuantoalasperspectivasdefuturodelcultivodegirasol,segúnlas estimaciones,laproducciónmundialdesuaceitesemantendrácasisin modificacionesenlaspróximascampañas.Apesardelascondiciones atmosféricasdesfavorablesdelosúltimosañosalasquetuvieronquehacer frentepaísestandestacadoscomoRusiaeIndia,conlaconsecuentepérdidade producción,elaumentodelaproduccióndepaísescomoArgentinayUcrania logrócontrarrestardichaspérdidas,manteniendocasisinmodificacionesla producciónmundialdeaceitedegirasol.Estehecho,juntoalasmedidas adoptadasporlamayoríadelospaísesproductores,encaminadasaampliarlas zonasdecultivoylaproduccióndesemillas,estáfavoreciendolacreacióndeun
Introducción 16 potencialparalaaceleracióndelaproduccióndeaceitedegirasolanivelmundial (FAOSTAT2015). Lospreciosdeunmercadomundialactivo,motivadoporunrápidocrecimiento delconsumogeneralyelaumentodedemandaporpartedenuevospaíses emergentes,tambiénpodríanfavorecerunanotableexpansióndeloscultivosy produccionesmundialeshastanivelessinprecedentes. Porúltimo,laversatilidaddelaceitedegirasolencuantoasususos,asícomola rentabilidaddesucultivoylaaparicióndenuevosaprovechamientos(aceitede girasolaltooleicoparafrituraybiolubricantes,...),estáhaciendoque, actualmente,elaceitedegirasolganepopularidadendetrimentodeotros aceitestradicionalesyaumentenlasperspectivasdecrecimientoparasucultivo. Acontinuaciónseexpondránvariosapartadosdedicadosalaclasificación, función,biosíntesisymodificacióndelípidosdeplantasengeneralnecesarios paracomprenderydesarrollaraspectosdelaceitedegirasolrelacionadoscon éstos,dedicándolesunúltimoapartadoenestaIntroducción. 2.LÍPIDOSDEPLANTAS:CLASIFICACIÓNYFUNCIÓN Entérminosquímicos,loslípidossoncompuestosquesecaracterizanporposeer unaltogradodeinsolubilidadenaguasiendo,encambio,fácilmentesolublesen disolventesorgánicosnopolares(Badui,2006).Aunquequímicamente heterogéneos,todospresentanundenominadorcomúnestructural:latotalidad oalmenosunapartesignificativadesumoléculaesdenaturaleza hidrocarbonaday,portanto,apolar. Laenormediversidaddeloslípidosexistentesdificultacualquierclasificación sistemática.Loscriteriosdeclasificaciónempleadosvaríandetalformaquese hacenecesariaunacontinuarevisióndelosmismos.
Introducción 17 Históricamente,unadelasclasificacionesmáscomunesdividíaaloslípidosen dosgrandescategorías:lípidossaponificables,quecontienenácidosgrasos unidosaalgúnotrocomponente,generalmentemedianteunenlacetipoéster (acilglicéridos,ceras,fosfoglicéridos,glucolípidosyesfingolípidos),ylípidosno saponificables,quenocontienenácidosgrasos,aunquetambiénincluyenalgunos derivadosimportantesdeéstos(terpenos,esteroideseicosanoides).Asuvez,los lípidossaponificablessepuedendividirenbaseasuestructuramolecularen lípidossimples,deestructuraexclusivamentehidrocarbonada(acilglicéridosy ceras);ylípidoscomplejos,cuyaestructurahidrocarbonadapresentaademás otrosgruposfuncionalesquecontienenátomosdenitrógeno,fósforo,azufre,e inclusoglúcidos(fosfoglicéridos,glucolípidosyesfingolípidos). Actualmente,loslípidossecataloganbajoelsistemadeclasificaciónideadopor elComitéInternacional“TheLipidMetabolitesandPathwaysStrategy”(LIPID MAPS),enconjuntoconelComitéInternacionalparalaClasificacióny NomenclaturadeLípidos(ICCNL),basadoenprincipiosquímicosybioquímicos, compatibleconlasbasesdedatosynecesidadesinformáticasactuales(Fahyet al.,2005,2009,2011).Deestamanera,loslípidossedistribuyenenochograndes categorías,cadaunadelascualespresentaasuvezsuspropiassubcategorías. Éstasson:i)ácidosgrasos(AG),ii)glicerolípidos(GL),iii)glicerofosfolípidos(GP), iv)esfingolípidos(SP),v)lípidosesteroles(ST),vi)lípidosprenoles(PR),vii) sacarolípidos(SL)yviii)policétidos(PK)(Figura7).
Introducción 24 Tabla2.Ácidos g rasosmáscomunesenloslí p idosdereserva. Nombre común Nomenclatura Sistemática(IUPAC) Nomenclatura abreviada Fórmula química Punto defusión(ºC)Estructuraquímica LáuricoDodecanoico12:0C 12 H 24 O 2 43,2 Mirístico Tetradecanoico 14:0 C 14 H 28 O 2 58,8 Palmítico Hexadecanoico 16:0 C 16 H 32 O 2 62,8 Palmitoleico Δ9‐cis‐hexadecaenoico 16:1Δ9c C 16 H 30 O 2 ‐0,1 Esteárico Octadecanoico 18:0 C 18 H 36 O 2 68,8 Oleico Δ9‐cis‐octadecaenoico 18:1Δ9c C 18 H 34 O 2 15,2 Linoleico Δ9,12‐cis‐octadecadienoico 18:2Δ9,12c C 18 H 32 O 2 ‐5,0 α‐linolénico Δ9,12,15‐cis‐octadecatrienoico 18:3Δ9,12,15c C 18 H 30 O 2 ‐11,0 γ‐linolénico Δ6,9,12‐cis‐octadecatrienoico 18:3Δ6,9,12c C 18 H 30 O 2 ‐11,0 Araquídico Eicosanoico 20:0 C 20 H 40 O 2 76,0 Gadoleico Δ9‐cis‐eicosaenoico 20:1Δ9c C 20 H 38 O 2 23,5 Behénico Docosanoico 22:0 C 22 H 44 O 2 79,9 Erúcico Δ9‐cis‐docosenoico 22:1Δ9c C 22 H 42 O 2 38,0 Lignocérico Tetracosanoico 24:0 C 24 H 48 O 2 84,2
Introducción 25 Ademásdetodosestosácidosgrasos,existenasuvezotrosconestructuraspoco frecuentes,característicosdedeterminadosgruposoespeciesvegetales.Estos ácidosgrasosinusualespresentandoblesenlacesenposicionespococomunes, triplesenlaces,ramificaciones,sustituyentescomogruposhidroxi,epoxi,anillos deciclopropeno,etc,…yconfierenaloslípidoscaracterísticasdegranvaloren diferentesáreas.Ejemplosdeéstossonlosácidosricinoleico,erúcico, petroselínico,vernólico,etc.(Cahoonetal.,2002;JaworskiyCahoon,2003; KinneyyClemente,2005;Tayloretal.,2011). Porúltimo,mencionarqueenlasgrasasalimentariasnomodificadas,yenla naturalezaengeneral,losdoblesenlacesdelosácidosgrasosinsaturadosse encuentranmayoritariamenteenconfiguracióncis‐.Encuantoalaisomería posicional,aunqueéstospuedensituarseteóricamenteendiferenteslugaresde lacadena,tambiénexistenposicionesfavorecidasporlanaturaleza. 2.2ACILGLICÉRIDOS 2.2.1Definiciónyclasificación Losacilglicéridos,dentrodelosglicerolípidos(GL),sonésteresdeácidosgrasos unidosaunamoléculadeglicerol. Elglicerolpresentatresgruposalcohólicosy,portanto,puedeaparecer esterificadoenuna,dosotresposiciones,dandolugarrespectivamentea monoacilglicéridos,diacilglicéridosytriacilglicéridos(Figura9). Monoacilglicéridos(MAGs):hayunsoloácidograsoesterificandoala moléculadeglicerolenlaposiciónsn‐1,sn‐2osn‐3.Existen,portanto, tresformasisoméricas:los1(3)‐MAGsy2‐MAGs. Diacilglicéridos(DAGs):tienenesterificadasdosposiciones(1,2‐DAG,2,3‐ DAGy1,3‐DAG).Los1,2‐DAGsdeconfiguraciónLsonlosmáscomunes, mientrasquelos2,3‐DAGsy1,3‐DAGssóloseencuentranencantidades trazas.
Introducción 26 Triacilglicéridos(TAGs):tienenesterificadaslastresposicionesdel glicerol.Cuandopresentanunsolotipodeácidograsosedenominan TAGssimplesuhomogéneosysicontienendosomásácidosdiferentesse llamanTAGscompuestosomixtos.Puedenexistirmuchasformas isoméricas. Ensuinmensamayoría,losacilglicéridos,tambiénllamadoslípidosneutros,se presentancomoTAGs,constituyendolaprincipalreservadeenergíaensemillas (OhlroggeyBrowse,1995;OhlroggeyJaworski,1997;AthenstaedtyDaum,2006; Napier,2007;Yenetal.,2008).LosMAGsyDAGs,porsuparte,aparecen ocasionalmentecomointermediariosenlabiosíntesisodegradacióndeTAGso comosegundosmensajeroshormonales(Stobartetal.,1997). CH 2 OCO-R CHOH CH 2 OH CH 2 OCO-R CHOH CH 2 OH 1(3)-MAG CH 2 OCO-R 1 R 2 -COOCH CH 2 OH CH 2 OCO-R 1 R 2 -COOCH CH 2 OH 1,2 (2,3)-DAG CH 2 OCO-R 1 CHOH CH 2 OCO-R 2 CH 2 OCO-R 1 CHOH CH 2 OCO-R 2 1,3-DAG CH 2 OCO-R 1 R 2 -COOCH CH 2 OCO-R 3 CH 2 OCO-R 1 R 2 -COOCH CH 2 OCO-R 3 TAG 2-MAG CH 2 OH R-COOCH CH 2 OH CH 2 OH R-COOCH CH 2 OH Figura9.Estructuradelosacilglicéridos.MAG:monoacilglicérido|DAG:diacilglicérido| TAG:triacilglicérido|R:ácidograso.
Introducción 27 2.2.2Propiedadesfísico‐químicas Lasdiferenciasenlaspropiedadesfísico‐químicasdelosacilglicéridosvienen determinadasporelnúmeroytiposdeácidosgrasosqueloscomponen,así comoladisposiciónoconfiguraciónestereoespecíficadeéstosenlamoléculade glicerol(RodríguezRiveraySimónMagro,2008). Así,losTAGssecomportancomomoléculasmuyhidrofóbicas,alencontrarsetres ácidosgrasosesterificandolamoléculadeglicerol,mientrasquelosMAGsy DAGsmuestrancarácteranfipáticodebidoalapresenciadegruposOHno esterificados.Elpapelquejueganlosdistintostiposdeácidosgrasosfue detalladoenIntroducción,2.1.2.Encuantoalaconfiguraciónestereoespecífica delosdistintosácidosgrasosenlamoléculadeglicerol,éstaseconsiderael factormásinfluyenteenlaspropiedadesfísicasdelosTAGs,yaqueincluyeal restodefactoresmencionados. ElestadocristalinoesunadelaspropiedadesfísicascaracterísticasdelosTAGs. Lostriacilglicéridospresentanpolimorfismo,locualsignificaqueunmismo triacilglicéridopuedetenerdiferentesformascristalinasenfuncióndesu composiciónydelascondicionesdecristalizaciónalasqueestásometido.Las formaspolimórficasmásimportantessonlasβ’,mayormentecompuestaspor unamezcladeAGsdeentreC16‐18,ylasβ,compuestasensutotalidadporAGsde C18(Figura10).Laformaβ’formacristalesenunsistemarómbicoylaformaβlo haceenunsistematriclínico;ambasformaspolimórficassecaracterizanpor formarunbajonúmerodecristalesdegrantamaño. Figura10.Disposiciónestructuraldelospolimorfismosdelostriacilglicéridosensusformas βyβ’.1,2y3representanlastresposicionesestereoespecíficasdelamoléculadeglicerol. . ..... ββ’ 1 23 3 2 1 . ..... ββ’ 1 23 3 2 1
Introducción 28 sn‐1 sn‐2 Figura11.Representacióngráficadelastresposicionesestereoespecíficasdeácidosgrasos enlamoléculadeTAG. ElpuntodefusiónesotradelaspropiedadescaracterísticasdelosTAGs,como asílofueraenelcasodelosácidosgrasos,yestácondicionadológicamentepor lanaturalezadeéstos(Introducción,2.1.2).Además,lapropiaformapolimórfica enqueseencuentrenlosTAGscristalizadostambiéninfluyeenelpuntode fusión,demaneraqueparaunmismotriacilglicérido,ésteesmayorenlaformaβ ymenorenlaβ’. 2.2.3Nomenclatura Comoyasehaindicado,lastresposicionesdeesterificacióndelglicerolpueden aparecercontresácidosgrasosiguales,dosigualesyunodistinto,olostres diferentes.Deestamanera,eltriacilglicéridopuedepresentaruncarbono asimétrico(C2delglicerol),dotandoalamoléculadequiralidadyobservándose esteroisómeros.Asípues,desdeunpuntodevistabioquímico,sedistinguentres posicionesestereoespecíficasenlamoléculadeTAG:posicióncentral correspondientealC2delglicerol(sn‐2)yposicionesprimariascorrespondientes alosC1yC3delglicerol(sn‐1ysn‐3)(Figura11). Paranombrarlosseindicanprimerolosradicalesdeácidosgrasos,seguidode glicerol.Elnombresn‐1estearil,sn‐2oleil,sn‐3palmitilglicerolhacereferencia portantoauntriacilglicéridoconácidoesteárico,ácidooleicoyácidopalmítico enlasposicionessn‐1,sn‐2ysn‐3,respectivamente.
Introducción 29 2.2.4Acilglicéridosmásfrecuentesenlanaturaleza Lostriacilglicéridossonloscomponentesmayoritariosdeloslípidosdereservay estánpresentestantoeneltejidoadiposoanimalcomoenlassemillasyfrutos delasplantasoleaginosas.LosTAGsdeorigenanimalposeenmayorporcentaje deácidosgrasossaturados,porloquesuelensersólidosatemperaturaambiente (grasas).Porelcontrario,losTAGsdeorigenvegetalyanimalesmarinostienen unaltocontenidodeácidosgrasosinsaturadosysonlíquidosatemperatura ambiente(aceites).Losmonoydiacilglicéridosseconsiderancomponentes minoritarios. EnlosTAGsdeaceitesdeorigenvegetal,losAGsinsaturadosoleicoylinoleicose encuentranenmayorproporciónyrepresentanalrededordeun60%deltotal; entrelossaturadoselmásabundanteeselpalmítico,seguidodelesteárico.En cuantoasuposición,porlogeneral,losPUFAs(ácidoslinoleicoylinolénico)se encuentranprincipalmenteenlaposicióncentralsn‐2,mientrasquelosAGs saturadosdecadenalarga(ácidopalmíticoyesteárico)ocupanlasposiciones primariassn‐1ysn‐3.LosAGsmonoinsaturadoscomoelácidooleicose distribuyenentrelastresposicionesestereoespecíficas. EnlasgrasasalimentariasexistentantoTAGshomogéneoscomomixtos,aunque enlasgrasasformadasporunnúmeronomuyelevadodeácidosgrasos(aceites deorigenvegetal)eshabituallapresenciadealtasproporcionesdeTAGs homogéneosquecontienenelácidograsomayoritario(trioleínaenelaceitede oliva,otrilinoleínaenaceitedegirasolomaíz).Sinembargo,engrasascomplejas dondesepresentanunnúmeroelevadodeácidosgrasos(grasalácteayaceites depescado),existeunaltoporcentajedetriacilglicéridosmixtos.
Introducción 30 CH 2 OCO-R 1 R 2 -COOCH CH 2 O P OX OH O Figura12.Estructuradelosfosfolípidos. R:ácidograso|X:alcoholesterificado. 2.3FOSFOLÍPIDOS 2.3.1Definiciónyclasificación Losfosfolípidos,dentrodelosglicerofosfolípidos(GP),sonésteresdedosácidos grasosyunácidofosfóricounidosaunamoléculadeglicerolenlasposiciones C1‐C2yC3,respectivamente.Además,elácidofosfóricosehallaesterificadopor unalcohol,queconstituyeungrupodecabezapolar,confiriéndolecarácter anfipáticoalamolécula(Figura12). Losdistintosfosfolípidossediferencianportamaño,formaycargaeléctricade susgruposdecabezaspolares.Sonloscompuestosmásabundantesenlas membranascelulares,mientrasqueenotraslocalizacionescelularesyengrasasy aceitessóloaparecenenpequeñascantidades.Losmásimportantesson: Ácidofosfatídico(PA):compuestoprimariodelosfosfolípidosquecontieneun grupodecabezanopolar,alnoposeerelalcoholesterificado.Seencuentraen pequeñascantidadesenlascélulas,peroesunintermediarioimportanteenla biosíntesisdelosfosfolípidosyTAGs(Dörmann,2005).PApuedeestar esterificadoaunsegundoalcohol,originandoelrestodefosfolípidos. Fostatidilcolina(PC),fosfatidiletanolamina(PE)yfosfatidilserina(PSer): presentanunsegundoalcoholnitrogenado,colina,etanolaminaoserina, respectivamente.Estoscompuestoscontienenensucabezapolarun aminoalcoholypuedeninterconvertirseentresímediantevariasreacciones
Introducción 31 enzimáticas(Dörmann,2005).LosmásabundantesenplantassonPCyPE, constituyendomásdel50%delosglicerofosfolípidospresentesenlas membranasextraplastidiales.MientrasquePEnoseencuentraenlas membranasplastidiales,PCformaparte,además,delasmembranasdela envueltaexternadelcloroplasto.PSeresunfosfolípidominoritarioenplantas,y, aligualquePE,noseencuentraenmembranascloroplásticas. Fosfatidilinositol(PI):susegundoalcoholesunpolialcoholcíclico,elinositol.Este fosfolípidoformapartedelasmembranasyjuegaunpapelimportanteenla transduccióndeseñalenlascélulas,yaqueeselprecursordelossegundos mensajerosinositoltrifosfatoyDAG.PIsedetectaenpequeñascantidadesen casitodaslasmembranasdelascélulasvegetales.Sinembargo,mientrasquesu presenciaenlasmembranasextraplastidialesestágeneralmenteaceptada,la identificacióndePIenlasmembranastilacoidalesnohasidoconfirmada (Dörmann,2005). Fosfatidilglicerol(PG):susegundoalcoholesotramoléculadeglicerol.Eselúnico fosfolípidopresentetantoenlasmembranastilacoidalescomoenlasmembranas extraplastidiales(Dörmann,2005). Difosfatidilglicerol(DPG)ocardiolipina:enestecaso,elgrupofosfatodelácido fosfatídicoestáesterificadoconotramoléculadefosfatidilglicerol.Suesqueleto contieneasítresmoléculasdeglicerolunidasmediantedospuentesfosfodiéster; losdosgruposhidroxilodelosglicerolesexternossehallanesterificadospor ácidosgrasos.Sulocalizaciónestárestringidaalasmembranasinternas mitocondriales(Dörmann,2005).
Introducción 32 3.LÍPIDOSDEPLANTAS:BIOSÍNTESIS Labiosíntesisdelípidosenplantasesunprocesocomplejoenelqueestás implicadasvariasrutasinterconectadasentresí(Figura13).Enesteapartadose resumelabiosíntesisdeTAGs,lacualpuededividirseentresfasesbien diferenciadas:i)síntesisdenovodeácidosgrasosenelplastidio,ii)formacióndel pooldeacil‐CoAsenelcitosol,yiii)ensamblajedeTAGsperseenelretículo endoplasmáticodesemillasendesarrollo(OhlroggeyJaworski,1997;Baudy Lepiniec,2010;Batesetal.,2013). 3.1SÍNTESISDENOVODEÁCIDOSGRASOS(AGs) Enplantas,labiosíntesisdenovodelosácidosgrasossedesarrollaenlos plastidios(OhlroggeyBrowse,1995)mediantelaaccióncombinadadedos sistemasmultienzimáticos:laacetil‐CoAcarboxilasa(ACC)ylasintasadeácidos grasos(FAS)(Harwood,2005)(Figura13). LaACCcatalizaelprimerpasoenlasíntesisdeácidosgrasos,consistenteenla formacióndemalonil‐CoAapartirdeacetil‐CoA(SasakiyNagano,2004).El malonil‐CoAproducidopasaposteriormenteamalonil‐ACP(AcylCarrierProtein, proteínaportadoradeacilos)mediantelaaccióndelamalonil‐CoA:ACP transacilasa(MAT)(OhlrogeeyBrowse,1995). ElcomplejoFASrealizalaelongacióndelascadenasdeácidosgrasosemergentes atravésdelaadicióndedosunidadesdecarbono,loscualessondonadosporel malonil‐ACP(Slabasetal.,2001).Enplantas,elcomplejoFASesdetipoII,enel quecadaenzimaquelocomponeescodificadaporungenindependientey catalizaunpasoindividualdelaruta(Slabasetal.,2001).Laelongacióndelas cadenasdeaciloimplicaciclosrepetitivosdecondensación,reducción, deshidrataciónyreducciónenlosqueintervienendistintasenzimas(Ohlroggey Browse,1995).Lacondensacióninicial,catalizadaporlaß‐cetoacil‐ACPsintasaIII (KASIII),tienelugarentremalonil‐ACPyacetil‐CoA.AunqueKASIIIpuedecatalizar másreacciones(González‐Melladoetal.,2010),seconsideraquelaß‐cetoacil‐ ACPsintasaI(KASI)ylaß‐cetoacil‐ACPsintasaII(KASII)catalizanlossiguientes
Introducción 33 pasosdecondensacióndesde4:0‐ACPhasta16:0‐ACPy16:0‐ACPa18:0‐ACP, respectivamente(Harwood,2005).Dentrodecadaciclodecondensación,se requierentresreaccionesadicionales(reducción,deshidrataciónyreducción). Estasreaccionesadicionalesestáncatalizadassecuencialmenteporla3‐oxoacil‐ ACPreductasa(KR),hidroxiacil‐ACPdeshidratasa(DH),yenoil‐ACPreductasa(ER) (OhlroggeyJaworski,1997). Enlamayoríadelasplantas,lasíntesisdenovodeácidosgrasosfinalizacuando lascadenasdeaciloalcanzanunalongituddeC16‐18.Partedel16:0‐ACP sintetizadopuedeentrarenlarutaprocariota,enlacapainternadelos plastidios,dondelosacil‐ACPssonusadosdirectamenteporlasaciltransferasas plastidialesparaproducirglicerolípidosyglicerofosfolípidosapartirdePAyDAG (OhlroggeyBrowse,1995;Dormänn,2005);elrestodel16:0‐ACPeshidrolizado porlasacil‐ACPtioesterasasdetipoAoB(FatAoFatB)(Jonesetal.,1995a),ylos AGslibresresultantessonexportadosfueradelosplastidiosyre‐esterificados paraformaracil‐CoAsatravésdelaaccióncatalíticadelaacil‐CoAsintetasa (LACS)(OhlroggeyBrowse,1995;Li‐Beissonetal.,2010).Aunquepartedel18:0‐ ACPpuedeserliberadofueradelplastidiotraslaaccióndelastioesterasas,la mayoríasoneficientementedesaturadosatravésdelaaccióncatalíticadela estearil‐ACPdesaturasa(SAD)plastidial,queintroduceundobleenlaceenla posiciónΔ9del18:0‐ACPparaformar18:1Δ9c‐ACP(Li‐Beissonetal.,2010).SAD esconsideradaunadesaturasaúnicaenelreinovegetalporsersolubleyestar localizadaenelestromadelplastidio,yaquelamayoríadelasdesaturasasson proteínasdemembrana(OhlroggeyBrowse,1995).Normalmentetienemayor actividadrelativaqueKASII,loqueexplicalamenoracumulaciónde18:0quede 16:0enplantas(Harwood,1996).El18:1‐ACPresultantepuedeasuvezser hidrolizadovíaaccióncatalíticadelastioesterasasyamencionadasparaformar AGslibres,loscuálessonposteriormenteexportadosalcitoplasma,oentrarenla rutaprocariotadesíntesisdeglicerolípidosyglicerofosfolípidos(Li‐Beissonetal., 2010)(Figura13).
Introducción 40 actualmentetambiénenArabidopsisthaliana(Hernándezetal.,2012),árboldel tung(Caoetal.,2013)ylevaduras(Ranietal.,2013),entreotros.Adiferenciade lasdosanteriores,lasproteínasDAGAT3sonsolubles,localizándoseenelcitosol (Sahaetal.,2006).Encuantoalpapelquepudieradesempeñarenlaproducción delípidosdereserva,pareceestarclaroquenoescrucial(Cahoonetal.,2007; Caoetal.,2013),sibienel30%delaactividadDAGATesimputablealafracción citosólica(Sahaetal.,2006),lacualpudieraestarimplicadaenelreciclajedelos AGsinsaturados18:2y18:3enTAGs(Hernándezetal.,2012). Engeneral,alserresponsabledelúltimopasodelabiosíntesisdeTAGsynoestar implicadoenladelípidosdemembrana,DAGATesconsideradalaenzimaclave enelcontroldelatasadesíntesisdeTAGsensemillas(Ichiharaetal.,1988; Cahoonetal.,2007;Napier,2007;Venegas‐Calerónetal.,2010).Además,las distintasespecificidadesporsustratolaconviertenenresponsabledirectadela distribucióndelosdistintosAGsenTAGs,porloquesucaracterizaciónresulta fundamentalenlamodificacióndedeterminadosaceites.Estosaspectosserán ampliamentedesarrolladosenIntroducción,4.3y4.4.2.
Introducción 41
Introducción 42 Figura13.Esquemageneraldelarutadebiosíntesisdelípidosenplantas. ACC:acetil‐CoAcarboxilasa|ACP:proteínatransportadoradeacilo|AG: ácidograso|CoA:coenzimaA|DAG:diacilglicerol|DAGAT:diacilglicerol aciltransferasa|DAG‐CPT:CDP‐colina:diacilglicerolcolinafosfotransferasa| DGDG:digalactosildiacilglicerol|DGTA:DAG:DAGtransacilasa|DH:hidroaxil‐ ACPdeshidratasa|ER:enoil‐ACPreductasa|FAD2:oleildesaturasa|FAD3: linoleildesaturasa|FAE:complejodelaelongasadeácidosgrasos|FAS: complejodelasintasadeácidosgrasos|FatA/B:acil‐ACPtioesterasastipoA yB|G3PDH:glicerol‐3‐Pdeshidrogenasa|GPAT:glicerol‐3‐fosfato aciltransferasa|HmACC:acetil‐CoAcarboxilasahomomérica|KAS:ßcetoacil‐ACPsintasa|KR:3‐oxoacil‐ACPreductasa|LACS:acil‐CoAsintetasa decadenalarga|LPAAT:lisofosfatidatoaciltransferasa|LPC: lisofosfatidilcolina|LPCAT:lisofosfatidilcolinaaciltransferasa|MAG: monoacilglicerol|MAGAT:monoacilglicerolaciltransferasa|MAT:malonil‐ CoA:ACPtransacilasa|MGDG:monogalactosildiacilglicerol|PA:ácido fostatídico|PAP:fosfatidatofosfatasa|PC:fosfatidilcolina|PDCT: fosfolípido:diacilglicerolcolinafosfotransferasa|PG:fosfatidilglicerol|PLA2: fosfolipasaA2|PDAT:fosfolípido:diacilglicerolaciltransferasa|SAD:estearil‐ ACPdesaturasa|SQDG:sulfoquinovosildiacilglicerol|TAG:triacilglicérido| *:Malonil‐ACP.Enrojosemarcanlasenzimaspertenecientesalarutade Kennedy,mientrasqueenazulsemarcanlasenzimaspertenecientesalas rutasindependientesdeacil‐CoA.Losacil‐CoAssombreadosenverdeestán presentesenexclusividadenlafamiliaBrassicaceae.ModificadodeBaudy Lepiniec,2010.
Introducción 43 4.LÍPIDOSDEPLANTAS:MODIFICACIÓN Losaceitesvegetalesseusantantoparaconsumohumanocomoparausos industrialesnoalimentarios(productosfarmacéuticos,jabones,pinturas, cosméticos,biolubricantes,biodiesel,etc.)(Napier,2007;Durrettetal.,2008; Dyeretal.,2008;DyeryMullen,2008;NapieryGraham,2010;RogalskiyCarrer, 2011;Tayloretal.,2011;Yuetal.,2011;Santorietal.,2012).Delaproducción mundialdeaceitesvegetales,el70‐80%sedestinaalconsumohumano,yasea deformadirecta,atravésdeladieta(aceitescrudosparaaderezar,aceitespara freírycocinar,margarinas,etc…),odeformaindirecta,atravésdeproductos procesadosdestinadosalaindustriaalimentaria(industriapanadera,pastelera, paralaconfeccióndehelados,etc…).Puestoquelasaplicacionesdelosaceites vegetalessonmuydiversas,exigiendocadaunadeellasunascaracterísticas físico‐químicasdiferentes,esobvioquerequierandistintosperfilesóptimos específicosdeácidosgrasos.Noobstante,cualquierintentodemodificaciónde estosaceitesestarálógicamentesometidoalaspropiaslimitacionesnaturalesde lasplantasentérminosdeviabilidadseminalycrecimientovegetal(KnaufyDel Vecchio,2008). Lamodificacióndelípidosdeplantasoleaginosassecentraendosaspectos fundamentales:lamejoraenelcontenidograsodelasemillaylacalidaddel aceiteproducido. DadoqueestaTesissehadesarrolladodentrodeproyectosdeinvestigacióndel GrupodeGenéticayBioquímicadeLípidosdeSemillas(GGBLS)encaminadosala obtencióndenuevosaceitessaludablesparaelconsumohumano,esteapartado secentraráenlasmodificacionesdeoleaginosasorientadasalaobtenciónde aceitesdeinterésparalaindustriaalimentaria.
Introducción 44 4.1CRITERIOSDESELECCIÓN Loscriteriosdeselecciónhacenreferenciaaunaseriederequisitosquedebe cumplirtodoaceitevegetaldestinadoalconsumohumano;éstossepueden dividirentrelosquepersiguenmejorasdesdeunpuntodevistanutricionalo aquéllosquepersiguenmejorastecnológicasdelosaceites. Elefectoqueejercenlasgrasasconsumidasenladietasobrelasalud cardiovasculardependedelacomposiciónenácidosgrasosdeéstas,locualestá relacionadodirectamenteconlosnivelesdecolesterolplasmático(Mensinket al.,2003).Elcolesterolsetransportaeneltorrentesanguíneoasociado fundamentalmentealipoproteínasdealtaybajadensidad(HDLyLDL, respectivamente).ElcolesterolasociadoaLDLsedepositaenelendoteliodelos vasossanguíneosysuexcesodeterminalaaparicióndeateromasqueobstruyen elflujo. ExistennumerososestudioscientíficosquedemuestranquelosAGsinsaturados (oleico,linoleicoylinolénico)incrementanlasHDLydisminuyenlasLDL,porlo queseconsideransaludables.Engeneral,grasasconAGssaturadosdecadena menoraC18(láurico,mirísticoypalmítico)aumentanenconjuntotantolasLDL comolasHDL,incrementandolarelaciónLDL/HDL(Mensinketal.,2003).No obstante,alanalizarelefectodeestosácidosgrasosdemaneraindependientese observannotablesdiferencias(Duboisetal.,2007;Steijns,2008),atribuyéndose peoresresultadosalmirísticoquealláurico,aunquelaposicióndeéstosenel triacilglicéridoseestimaimportante(Hunter,2001);encuantoalpalmítico, algunosestudioshandemostradorelativaneutralidad(KhoslaySundram,1996). Elácidoesteárico,sinembargo,esconsideradoneutroopositivodesdela perspectivadelasaludcardiovascular(Kellyetal.,2001;OMS,2003;Mensink, 2005;ThijssenyMensink,2005).Ésteseencuentramayoritariamente esterificadoenlasposicionesprimariassn‐1ysn‐3delTAG,loquecontribuyea suliberaciónporlaaccióndelaslipasasestereoespecíficasdeesosenlaces duranteladigestión.Estosácidosgrasosnoseabsorbenfácilmentedebidoasu altopuntodefusiónyalatendenciadeéstosaformarsalescálcicasinsolubles, porloquesonexcretadosfinalmente(Bracco,1994;Zocketal.,1995;Ramírezet
Introducción 45 al.,2001).Otrascontribucionesbasanelefectoneutroopositivodelácido esteáricoasutransformaciónenácidooleico,másqueaunalimitadaabsorción (BonanomeyGrundy,1988;Grundy,1994).Porelcontrario,losácidosgrasos queestánenlaposicióncentralsn‐2delosTAGssonpreferentemente absorbidosatravésdelaparedintestinal(Small,1991). Asípues,desdeunpuntodevistanutricional,sepretendeincrementarel consumodeaceitesconAGsinsaturadosenlaposicióncentralsn‐2delosTAGs, muchomásbeneficiososparalasaludquelossaturadosenesamismaposición, yaqueéstos,excluyendoalácidoesteárico,estáníntimamenterelacionadoscon enfermedadescardiovasculares. Porotraparte,desdeunpuntodevistatecnológicosepersigueelaumentodela estabilidadoxidativadelosaceitesylaobtencióndegrasasplásticasdeorigen vegetal.Laoxidacióndelosaceitesseproduceporlareaccióndelosdobles enlacesdelasmoléculaslipídicasconeloxígeno,produciendounavariedadde productosquímicos.Lasconsecuenciasdeestareacciónsonunadisminucióndel valornutricionaldelalimentoylaformacióndesaboresnodeseables acompañadosderancidez.AceitesconaltoscontenidosenAGsesencialesω3y ω6,enprincipiosaludables,tienenunamenorestabilidadoxidativaporelalto contenidoendoblesenlaces,oxidándosemuyrápidamente,porloquesonmás adecuadosparaelconsumodirecto.PorotraparteaceitesmuyricosenAGs saturadospresentanunamayorestabilidadperoestánasociadosaproblemas cardiovasculares.Porello,paraelusoindustrial,enelquelosaceitesygrasasse vensometidosfrecuentementeaaltastemperaturas,sonmásadecuadosaceites ricosenAGsmonoinsaturados,comoelácidooleico,ysaturadossaludables, comoelácidoesteárico. Laspropiedadesfísicasmásimportantesdelasgrasassonelintervalodefusióny laconsistenciaquepresentan,lascuálesestánestrechamenterelacionadasy proporcionanlatexturaadecuadadealimentosgrasosyelaborados.Comose describióenapartadosanteriores,ambaspropiedadesfísicasdependendelas distintasespeciesdeTAGsquelascomponenyéstas,asuvez,delanaturaleza delosácidosgrasosquelasconforman.LasgrasasnaturalessonmezclasdeTAGs
Introducción 46 ypresentan,portanto,intervalosdefusión,loscuálessealcanzana temperaturasmoderadamentebajas,provocandolalicuefacciónoel ablandamientodelasgrasasconcalentamientosmoderados.Asípues,la consistenciadelasgrasasestádirectamenterelacionadaconsusintervalosde fusión:grasassometidasatemperaturaspordebajodelpuntoinicialdeéstos presentaránunaconsistencialíquida,mientrasqueatemperaturasmayoresdel puntofinaldeéstosmostraránunaconsistenciacompletamentesolidificada.Sin embargo,esatemperaturascomprendidasdentrodesuintervalodefusión cuandolasgrasaspresentanlaspropiedadesmásinteresantesparala elaboracióndealimentosgrasosyelaboradoscomomargarinas,productosde bollería,reposteríaogalletería.Lasgrasasensuintervalodefusiónse denominangrasasplásticas.Asípues,laplasticidaddeunagrasaenglobalas característicasdeconsistenciaanteriormentemencionadas(RodríguezRiveray SimónMagro,2008). Porúltimo,lacapacidaddecristalizacióndeestosaceitestambiénseerigecomo factordeterminanteensuselección.Porejemplo,losaceitesempleadosen friturasy/obiolubricantesnodeberíancontenercristalesoTAGsquecristalizaran fácilmente,mientrasqueparalosuntablesesdeseablequeesténypermanezcan enlaformaβ’(C16‐18),loquelesconfiereunasuperficiebrillanteyunsuave realce,envezdelaformaβ(C18)que,peseaformarcristalespequeños,creceen aglomerados,produciendounatexturagranuladaysiendomenoscapacesde incorporarlíquido(Gunstone,2001). Asípues,desdeunpuntodevistatecnológico,sepretendedisminuirelusode aceitesconAGspoliinsaturados(PUFAs),yaqueencasosdeconsumoindirectose daprioridadalaestabilidadoxidativaaexpensasdelvalornutritivodeéstos. Además,paraobtenerbuenasgrasasplásticassehacenecesarioestablecerun equilibrioentreAGssaturadosyAGsmonoinsaturados,conespecialatencióna losácidosoleicoyesteárico.LalongituddelosAGsquecomponenestosaceites puedevariarenfuncióndesuusoyelgradodecristalizacióndeseados.
Introducción 47 Figura14.Diagramaesquemáticodelarutadebiosíntesisdelosácidosgrasosprincipales saturados,monoinsaturado(MUFA)ypoliinsaturados(PUFAs)ensemillasdeoleaginosas, asícomosuspropiedadesnutritivasyfuncionales.ModificadodeLiuetal,2002a. sólido SATURADOS 16:0 16:0 18:0 18:0 18:1 18:1 18:2 18:2 18:3 18:3 palmítico esteárico oleico linoleico linolénico MUFA PUFAs KASIII SAD FAD2 FAD3 líquido estable inestable LDLLDL aceites estables y saludables sólido SATURADOS 16:0 16:0 18:0 18:0 18:1 18:1 18:2 18:2 18:3 18:3 palmítico esteárico oleico linoleico linolénico MUFA PUFAs KASIII SAD FAD2 FAD3 líquido estable inestable LDLLDL aceites estables y saludables Acontinuaciónseresumelaidoneidaddeciertosácidosgrasosenfuncióndelos criteriosdeseleccióndescritosanteriormente(Figura14). Unavezestablecidosloscriteriosdeselección,esprecisoidentificarla variabilidadgenéticadecadaespecieyaplicartécnicaseficientesde modificación. 4.2PROBLEMÁTICAACTUAL Comosededucedelosapartadosanteriores,lamayoríadelosusosenla industriaalimentariarequierengrasasqueseansólidasatemperaturaambiente y/obastanteresistentesalaoxidación. Originariamente,yparatalfin,laindustriaalimentariausabagrasasdeorigen animal,comolamantecadecerdoylamantequilla.Sinembargo,ydebidoala riquezadeestasgrasasendeterminadosAGssaturadosenlaposicióncentralsn‐ 2delosTAGs,enlosúltimos30añossehapromovidosusustituciónporaceites deorigenvegetal.LosaceitesvegetalesapenasposeenAGssaturadosendicha posición,porloqueseconsideranmuybeneficiososparaelconsumohumano.
Introducción 48 Noobstante,suelevadocontenidoenAGsinsaturadoshacequeseanlíquidosa temperaturaambiente,porloqueestosaceitesnosonapropiadosparala fabricacióndemargarinas. Paraconseguirquelosaceitesvegetalestenganunaconsistenciamássólidase manipulanquímicamentedemaneraqueselesmodificasucomposiciónde ácidosgrasosy/olaestructuradesusTAGs.Losprincipalesprocesosquese utilizanconestefinsonlahidrogenaciónylatransesterificación. Lahidrogenación(Patterson,1994;Dijkstra,2007)esunprocesoquímicoquese realizaaaltastemperaturas,utilizandocorrientesdehidrógenoyciertos catalizadoresmetálicos,normalmenteníquel,paraconvertirlosAGsinsaturados presentesenestosaceitesensaturados,mediantelareduccióndelnúmerode susdoblesenlaces.Lahidrogenaciónpermiteasíconvertirlosaceitesvegetales líquidosengrasassólidasy/osemisólidasatemperaturaambiente.Noobstante, duranteesteprocesotambiénseproducenisómerostransdelosácidosgrasos, loscuálespuedenllegararepresentarhastaun40%deltotaldelaceiteycuyo consumoestáestrechamenterelacionadoconlaaparicióndeenfermedades cardiovasculares(StenderyDyerberg,2004;Weggemansetal.,2004; Mozaffarianetal.,2006,2009;PfeufferySchrezenmeir,2006;Tarrago‐Traniet al.,2006;Gebaueretal.,2007;Chardignyetal.,2008;Jakobsenetal.,2008;Khor yEsa,2008;Kummerow,2009;Anadónetal.,2010;EFSA,2010).Estosedebea quesuingestaproduceunaumentodelaconcentraciónplasmáticadeLDLyla disminucióndeladeHDL,enmayorproporciónquelohaceelconsumodegrasas animalessaturadasalasquesustituye. Latransesterificación(Schuchardtetal.,1998;Dijkstra,2007),porsuparte,esun procesoquímicoporelcualseproduceunaredistribucióndelosácidosgrasosen lamoléculadeTAG,seguidodeunfraccionamientoqueenriquecealaceiteen AGssaturados.Latransesterificaciónpermiteasíconvertirestosaceitesvegetales engrasasmásparecidasalaanimal.Sinembargo,dichareordenaciónfavorecela disposicióndelosAGssaturadosenlaposicióncentralsn‐2delosTAGs,siendo absorbidosatravésdelaparedintestinalycausandolosefectosbiológicos comentadosanteriormente.
Introducción 49 Actualmente,ysegúnlosexpertos,elaceiteograsaquedebeusarlaindustria tienequeserdeorigenvegetal,sinmanipulaciónquímicaalgunaquepudiera disminuirsucalidadnutricionalyelevarsucoste,ypudiendotenerunmayor contenidoenAGssaturadosenlasposicionesprimariassn‐(1+3),yaquela estructuranaturaldelosTAGsdeaceitesvegetalespermiteesteincrementosin serperjudicialparalasalud. Conelpropósitodecubrirestademandasevienendesarrollandonumerosas técnicasdemodificacióngenéticadeplantasoleaginosasyaque,apesardesu granvariabilidadgenéticaydelamejoradesuproducciónconelusodehíbridos, nosecubrencompletamenteestasnecesidades(Cahoonetal.,2007).Entreestas técnicascabedestacarlamutagénesis,tantofísicacomoquímica,asícomola ingenieríagenética,cuyousosehadisparadoenlosúltimosañosgraciasal desarrollodelabiologíamolecularylabiotecnología.Avancesrecientesenla comprensióndemecanismosbioquímicos,molecularesycelularesdela biosíntesisdeaceiteensemillasdeplantasoleaginosas,juntoalaidentificacióny clonacióndegenesimplicadosenesteproceso,hanfacilitadoasuvezla obtencióndeinnumerablesaceitesconcomposicióndeácidosgrasosmodificada. 4.3MODIFICACIÓNDELCONTENIDOGRASODELASSEMILLAS Lamejoraenelcontenidodeaceitedelassemillasestáencaminadaa incrementarelrendimientodeaceiteporunidaddesuperficie,disminuyendo consigoloscostesdeproducción(Frentzen,1998;ThelenyOhlrogge,2002;Dyer yMullen2005;LungyWeselake,2006). Engeneral,lamejoraenesteaspectosecentraenelcontroldelflujodecarbono hacialaproduccióndeaceite(Weselakeetal.,2009;BaudyLepiniec,2010). Hastaahora,lascontribucionesalamejoradelcontenidodeaceitesehan producidoprincipalmenteatravésdelastécnicasclásicasdemejoraenplantas oleaginosasdegraninteréscomocolzaysoja(Weselakeetal.,2009)ogirasol (Introducción,1.5).Actualmente,elusodetécnicasdeingenieríagenéticaha permitidoabordarestamejoradesdeotropuntodevista.Inicialmente,los estudiosbasadosenestastécnicassecentraronenlosprimerospasosdelaruta
Introducción 56 4.4.2ModificaciónenladistribucióndeácidosgrasosenTAGs Comosehamencionadoanteriormente,lacomposicióndeácidosgrasos,su disponibilidadysudistribuciónenlasdistintasespeciesdeTAGsdeterminanlas propiedadesfísico‐químicasynutricionalesdelosaceitesydependenenúltima instanciadelaespecificidadporsustratodelasaciltransferasasquelassintetizan, principalmentelasqueformanpartedelarutadeKennedy:GPAT,LPAATy DAGAT. EnelcasodeGPATdeplantas,nohasidoposibleidentificarhastalafechaningún genparalaisoformamicrosomal.SóloenelcasodeArabidopsisthaliana,lacual presentahastaochoisoformasplastidialesrelacionadasconlasíntesisdecutinay suberina(Li‐Beissonetal.,2010;Yangetal.,2012),secreehaberencontradouna novenaisoformapresumiblementemicrosomaly,porconsiguiente,relacionada directamenteconlabiosíntesisdeTAGs,GPAT9(Giddaetal.,2009).Porcontra, laisoformaplastidialdeGPAThasidobienestudiadaenvariasespeciesvegetales (FrentzenyWolter,1998;Jainetal.,2000). LasLPAATdeplantas,porsuparte,presentanunamayorpreferenciaporAGs insaturadosdeC18,porloqueunadelasprincipalescaracterísticasdelosaceites vegetales,aexcepcióndealgunostropicalestalescomopalmaycoco(Gunstone yHarwood,2007),eselbajocontenidodeAGssaturadosenlaposicióncentral sn‐2deTAG.Estaespecificidadporsustratosemantieneinclusocuandose elevanloscontenidosdeácidoesteáricoendeterminadaslíneasdegirasolHE, manteniéndoselasproporcionesdeésteentrelasdistintasposicionesdela moléculaTAG(Fernández‐Moyaetal.,2005).Noobstante,losgenesLPAAThan demostradoserútilesparaaumentarlaacumulacióndedeterminadosAGs inusualesenlaposicióncentralsn‐2deTAGsencultivosoleaginosos,comoel ácidoerúcico(Lassneretal,1995;Broughetal.,1996;Lietal,2012)oelácido láurico(Knutzonetal,1999).
Introducción 57 Comoyamencionamos,DAGATejerceasuvezunafuerteinfluenciasobrela cantidadycomposicióndelosTAGssintetizadoseneldesarrollodesemillas (Katavicetal.,1995;Settlageetal.,1998;Routabouletal.,1999;Zouetal.,1999; Bouvier‐Naveetal.,2000;Jakoetal.,2001;Slabasetal.,2001;LungyWeselake, 2006;Lardizabaletal.,2008,2010;Xuetal.,2008;Yenetal.,2008;Zhengetal., 2008;Locketal.,2009;Snyderetal.,2009;Weselakeetal.,2009),presentando unampliorangodeafinidadpordistintosácidosgrasos. Enlíneasgenerales,lasespeciesdeAGsinsaturadosestánpresentes principalmenteenlaposicióncentralsn‐2delglicerol,mientrasquelasespecies saturadasquedanrelegadasalasposicionesprimariassn‐1ysn‐3(Miquely Browse,1995).Apesardequeunsubconjuntolimitadodeestasespecies molecularesamenudopredomina(Brockerhoff,1971;Fatemietal.,1977;Burgal etal.,2008),lavariedaddeácidosgrasospresentesenundeterminadoaceite vegetalllevaalaproduccióndeunapoblaciónheterogéneademoléculasTAGs difícildecaracterizar.Paratalfinsehanvenidodesarrollandodistintastécnicas analíticasyteoríasmatemáticasque,encombinación,permitenadíadehoy determinarenmayoromenorgradolacalidaddeunaceiteenfuncióndesuuso, asícomolaposibilidaddecompararloconotrosdedistintacomposición. Entreestastécnicasanalíticascabedestacarelanálisisenlacomposiciónde ácidosgrasos,consideradalamásútilalahoradecaracterizardichapoblaciónde TAGs.Sinembargo,enalgunoscasos,estatécnicanoessuficienteparadistinguir entredosaceitesdiferentesounamezcladeellos.Estoocurre,principalmente, enalgunosaceitesvegetalesquetienenunperfilsimilardeácidosgrasos,por ejemploentreaceitesricosenácidolinoleico(girasol,cártamoymaíz),aceites ricosenácidooleico(oliva,altooleicodegirasol,yaltooleicodecártamo)o entremuchosnuevostiposdeaceitesvegetalesgenéticamentemodificados (Martínez‐ForceyGarcés,1999;Hazebroek,2000).Paracaracterizarmejory discriminarentreestosaceitesesnecesarioanalizarelperfildeTAGspor cromatografíalíquidadealtaresolución(HPLC)oporcromatografíagas‐líquido (GLC)(Reskeetal.1997;Fernández‐Moyaetal.2000a).Alternativamente,en algunoscasos,lacomposiciónenácidosgrasosenlaposicióncentralsn‐2de TAGspuedeseranalizadausandolipasasespecíficas(Luddyetal.1964);este
Introducción 58 enfoquehasidoutilizadotambiénparacaracterizarciertosaceitesvegetales (Reskeetal.1997;Álvarez‐Ortegaetal.1997).Másrecientemente,sehanpuesto apuntonuevastécnicasparaelanálisisestereoespecíficodeTAGs,haciendo posibleladeterminacióndelcontenidoenácidosgrasosenlastresposiciones (Laaksoetal,1990;TakagiyAndo,1991).Sinembargo,estastécnicas,pesea permitirdiferenciarnosóloaceitesdediferentescultivos(Santinellietal.1992; Reskeetal.1997;HarpyHammond,1998)sinotambiéndediferentes localizacionesycondicionesmedioambientales(Fatemietal.1977;Damianietal. 1997),resultansercomplejas,difícilesdeutilizardemanerarutinariaycon resultadosavecescontradictorios. Entrelasteoríaspropuestasparaexplicarladistribuciónestereoquímicadelos ácidosgrasosenTAGs,lateoría1,3‐random‐2‐random(VanderWal,1960)se convirtióenlamásampliamenteaceptada.Éstasebasaenunadistribuciónal azarysimétricadelosAGssaturadosenlasposicionesestereoquímicassn‐1ysn‐ 3deTAG.Aplicandoestateoríaesposiblecalcularconbastanteprecisiónlas especiesdeTAGspresentesenunaceiteapartirdeloscontenidosdeTAGsyde ácidosgrasosenlaposicióncentralsn‐2.Noobstante,ygraciasalusodeanálisis estereoespecíficosdelastresposicionessn‐,sehavueltoevidentequeenla mayoríadelosaceitesdeorigenvegetaldichadistribucióndeAGsnoesalazarni totalmentesimétrica,porloquenoesposibleaplicardichateoría.Porejemplo, elcontenidoenácidooleicoenlamantecadecacaoesmayorenlaposiciónsn‐1 queenlasn‐3delosTAGs(TakagiyAndo,1995;GunstoneyHarwood,2007)yes prácticamenteelmismoenelaceitedeoliva(Santinellietal.1992;Damianietal. 1997).Además,elácidoesteáricoseencuentrapredominantementeenla posiciónsn‐3delosTAGsenelaceitedegirasol(Reskeetal.,1997)yenelaceite deoliva(Santinellietal.,1992;Damianietal.1997),peroestádistribuido uniformementeenambasposicionesenlamantecadecacao(TakagiyAndo, 1995).Efectivamente,tambiénexistendiferenciasentreloscontenidosdeácidos grasosenlasposicionessn‐1ysn‐3entrediferentesvariedadesdeunmismo cultivooenaquellascultivadasbajodiferentescondicionesmedioambientales. Sinembargo,lasasimetríascaracterísticassonsiempremantenidas,esdecir,se mantienelatendenciaporunácidograsoespecíficoaserencontradoenuna posiciónsn‐enparticular(Fatemietal.1977;Damianietal.1997).
Introducción 59 4.4.2.1CoeficientedeasimetríaαSat ElcoeficientedeasimetríaαSatsurgedelanecesidaddepoderintegrartodala informaciónprovenientedelanálisisdelasdistintasespeciesTAGspresentesen aceitesvegetales.Estecoeficientepermitecalcularladistribuciónrelativadelos AGssaturadosentrelasposicionesprimariassn‐1ysn‐3enlosTAGsapartirdel contenidototaldeAGssaturados(S)delosTAGs,asícomoelcontenidodelos AGssaturadosenlaposiciónsn‐2(S2)ylasdiferentesespeciesmolecularesde TAGs:(αSUS/SUU)(Martínez‐Forceetal.,2004). ElvalordeαSatoscilaentre0,cuandounadelasposicionesprimariascontieneel 100%delosAGssaturados,y0,5,cuandolasdosposicionestienenelmismo contenidoenAGssaturados,oloqueeslomismo,unadistribuciónsimétricaen consonanciaconlateoríadeVanderWal(VanderWal,1960).Valoresinferiores a0,5implicaquehaymásAGssaturadosenlaposiciónsn‐1queensn‐3,o viceversa.Así,unvalordeαSat=0,33representaríaqueel33%delosAGs saturadosseencuentranenunaposiciónyel67%enlaotra,sindistinguirentre éstas.IgualmentenoesdeextrañarquecuandoelcontenidodeAGssaturados delaceiteesmuyalto,αSattiendeaserpróximoa0,5debidoaquetodoel sistemaenzimáticoestácompletamenteocupadodeAGssaturados(Fernández‐ Moyaetal.,2005). Comohemosvistohastaahora,ladistribucióndeestosAGssaturadosentrelas posicionessn‐1ysn‐3delosTAGsdeunaceiteesparticularmenterelevantede caraasusposiblesusosindustriales.Cuandolaasimetríaaumenta,lacantidadde TAGsdisaturados(SUS)sereducey,enconsecuencia,elvalorαSattambiénseve disminuido.Estoesexactamenteloqueseobservaenlosaceitesdegirasol, concretamenteenaquéllosconmásdeun12%deácidoesteárico(Fernández‐ Moyaetal.2000b).Aefectosprácticos,cuantomásbajoseaelvalorαSat,peor seránlaspropiedadesplásticasdeeseaceite.ElmáximodeespeciesSUS, aquéllasquetienenbuenaspropiedadesplásticasparalaelaboraciónde margarinas,pastelería,panadería,etc,seobtendríancuandoαSatalcanzaseel valorde0,5.Deestaforma,estecoeficientepermiteatribuiracadaaceiteun valorαSatespecíficoenfuncióndesucomposición,porloquesepuedeemplear
Introducción 60 comométododeselecciónañadidoaloscriteriosyamencionadosalahorade considerarundeterminadoaceitecomoaptoonoparaundeterminadouso, diferenciándolodelrestodeaceites. Noobstante,esimportanteseñalarquelosdatosobtenidosutilizandoel coeficientedeasimetríaαSat,nosontotalmentecomparablesconunanálisis estereoespecífico.Porejemplo,elcontenidoenAGssaturadosenlasposiciones sn‐1ysn‐3ensojafuemuysimilarcuandosedeterminóencadaposición estereoquímicadelTAG(Reskeetal.1997;HarpyHammond,1998).Sin embargo,elcoeficienteαSatdelaceitefue0,29,indicandoquelosAGssaturados sedistribuíanasimétricamente.Estasdiscrepanciassurgenporque,adiferencia delcoeficienteαSat,queescalculadoapartirdelacomposicióndeTAGs,el análisisestereoquímicoconsideralastresposicionescomoindependientes. Comoconsecuenciadeestaasimetría,elcontenidodelasubclaseSUSesmenor delesperadoyhaymásSUUpresente.ElcoeficienteαSatportantonodistingue entrelasposicionessn‐1ysn‐3.Comosehaindicadoanteriormente,ésteesun coeficientedeasimetría,nounanálisisestereoquímico.Sinembargo,enla mayoríadeaceitesconunadistribuciónasimétricayasehaidentificado,por análisisestereoquímicostradicionales,laposiciónsn‐conlamenorproporciónde unácidograsoenconcretoyessiemprelamisma.Porello,ysiasífuera necesario,sepodríaasumirquéposicióntieneelmenorvalorparaeseácido grasoenparticular.
Introducción 61 5.ACEITEDEGIRASOL 5.1CARACTERÍSTICASGENERALES Elaceitedegirasolesunexcelenteaceitecomestiblequeposeeunalto contenidoenAGsinsaturados(85‐91%),representadosensumayorparteporlos ácidosoleicoylinoleico.Enlamayoríadeloscasos,elaceitedegirasolesricoen ácidolinoleico,yaquerepresentadel50%al70%deltotal,mientrasqueelácido oleicosuelesuponerdel15al45%detodoslosácidosgrasosdelaceite(Tabla5); elhechodequeprácticamentenotengaácidolinolénicoleproporcionauna razonableestabilidadoxidativa(Murphy,1993;Fernández‐Moyaetal.,2005). El98‐99%deesteaceiteestáformadoporacilglicéridos,siendoel95%TAGs;el restosonsustanciasquesepuedenagruparconeltérminogenéricode “insaponificable”(ceras,mucílagos,carbohidratos,esterolesytocoferoles).Los fosfolípidosmayoritarios,quesuponenun2%delaceitetotal,sonPC(48,7%),PI (27,9%),PE(21,2%)yPA(2,2%)(Chapman,1980;Salasetal.,2006).Porúltimo,el contenidodeAGslibresseestimaenun0,5%,aligualqueenotrassemillas oleaginosas(Campbell,1983),porloquelacomposicióndeácidosgrasosdelos TAGsesprácticamenteigualaladelaceite. EnlaTabla6serepresentanlosporcentajesdelasdistintasespeciesdeTAGs mayoritariosenunaceitedegirasolestándar(RHA‐274),conaproximadamente un87%conteniendoalmenosunácidolinoleico.LosTAGsrestantesnollegana representarun20%(Fernández‐Moyaetal.,2005).Engeneral,el97%delas especiesTAGspresentesenelaceitedegirasolestándar(RHA‐274)están formadasporlassubclasesUUUySUU,siendocasiel3%restanteSUS;nohay presenciadeespeciesdelasubclaseSSSyelvalorαSatde0,27alcanzadosealeja delvalor0,5deseado(Tabla7). Elaceitedegirasolpresentaunaseriedecaracterísticasfísico‐químicasquelo sitúaentrelosmejoresaceitesvegetales,aloquesesumalapresenciade vitaminasliposolubles,esteroles(α‐tocoferol,β‐tocoferolyγ‐tocoferol),lecitinas, yotroscomponentesquecontribuyedemaneranotableaaumentarsuvalor
Introducción 62 nutritivo(Vrânceanu,1977;Gunstoneetal.,2007;Grompone,2011).No obstante,yenlíneaatodoloanteriormentedescrito,elaceitedegirasolhasido tambiénsusceptibledesermodificadoconvistasaaumentarsucalidaden funcióndesuuso(Garcésetal.,2009). 5.2OBTENCIÓNDEMUTANTESCONCOMPOSICIÓNMODIFICADADEACEITE Enelcasodelgirasolsonvarioslosmutantesobtenidosconmodificacionesen loslípidosdesemilla.ElprimermutantedegirasolseobtuvoenRusiautilizando comoagentemutagénicoeldimetilsulfato(DMS),queoriginólaprimera variedadaltooleico(70‐75%)(Soldatov,1976).Apartirdeestalínea,llamada Pervenets,derivantodaslaslíneasaltooleicoqueexistenenlaactualidad, algunosconhastael90%deesteácidograso(Garcésetal.,1989;Pleiteetal., 2006a;Garcésetal.,2009).Laintroducciónenelmercadoycomercializacióndel aceitedegirasolaltooleicosupusoungranavanceencuantoalamejoradela calidaddelosaceitescomestiblesymuestraconquéfacilidadsepueden modificarlascaracterísticasdeestosaceites. Posteriormente,enrespuestaalademandadegrasasqueseadecuenalos requerimientostécnicosparalaelaboracióndelosalimentos,sehaobtenidoen elInstitutodelaGrasa(CSIC)unacoleccióndelíneasdegirasolconcomposición deácidosgrasosmodificada,lallamadaCollectionAndalusianSunflower(CAS). Algunasdeestaslíneasmásimportantes,juntoasufenotipo,origen, composiciónmodificadadeAGsydistribuciónenTAGs,asícomoelcontenidode lasdistintasespeciesdeTAGs,contenidototaldeAGssaturados(Sat)ysus coeficientesdeasimetríaαSat,seresumenenlasTablas5,6y7. Entérminosgenerales,lamodificacióndelacomposicióndeácidosgrasosen estosaceitesdegirasolvienemarcadaporlosmismoscriteriosdeselección planteadosenIntroducción,apartado4.1.Igualmente,lasconsecuenciasdela modificacióndeunouotroácidograso,asícomola/sposible/senzima/s implicada/sendichasmodificacionessonlasmismasquelascitadasen Introducción,4.4.1,segúnelcaso.Deestaslíneasdegirasolcabríandestacar
Introducción 63 aquéllasconfenotipoaltoesteárico(HE),muyaltoesteárico(VHE)yaltooleico (HO),asícomolalíneaCAS‐15altooleicoaltoesteárico(HOHE)(Tabla5). Porotrolado,losperfilesdeTAGsdeestosaceitesdegirasol(Tabla6)se asemejanaalgunosaceitestropicalesconaltocontenidoenTAGdisaturados (SUS),enloscuálesestasubclasedeTAGrepresentael34%delcontenidototal (GunstoneyHarwood,2007).Aunasí,nolleganaigualarseaaceitescomolosde cacao,convaloresdel70‐80%. LosvaloresdeloscoeficientesdeasimetríaαSatdeestosaceites,asícomolos datosusadosparacalcularlos,TAGsdisaturados(SUS),monosaturados(SUU)y triinsaturados(UUU),yelcontenidototaldeácidosgrasossaturados(Sat)se muestranenlaTabla7.Comosepuedeobservar,nohayunarelaciónlógica entreSatylasespeciesSUSySUU;estosedebealcoeficienteαSatdecada aceite.Cuandolaasimetríaaumenta,Satsereduce,produciendovaloresbajos deαSat.Porejemplo,CAS‐19yCAS‐15tienencontenidossimilaresdeAGs saturadosperovaloresαSatmuydiferentes,0,36y0,28,respectivamente. Además,elcontenidodeSUSesmayorenCAS‐19inclusoteniendouncontenido deAGssaturadosligeramenteinferior.EstecoeficientedeasimetríaαSatseha calculadoenotrosaceitesconaltoSatyesnormalmentepequeño,sugiriendo unafuertedistribuciónasimétricadelosAGssaturadosenlasmoléculasdeTAGs (Martínez‐Forceetal.,2004).Hayqueremarcarquelaslíneasconmásácido oleicotienenlosvaloresαSatmáspequeños(CAS‐9,CAS‐33yCAS‐15), probablementeporquelaselectividadporsustratoenlabiosíntesisdeTAGses diferenteenelcasodelosácidosoleicoylinolénico.
Introducción 64 Tabla5.Composiciónmodificadadeácidosgrasosdeaceitesdelíneasdegirasolestándaresymutantes,algunasdelascuales pertenecenalaColeccióndelInstitutodelaGrasa.SD<10%. ModificadodeMartínez‐ForceyGarcés,1999;Fernández‐Moyaetal.,2005yTarrago‐Tranietal.,2006. Fenotipo:ST:estándar|HO:altooleico|HE:altoesteárico|VHE:muyaltoesteárico|ME:medioesteárico|HOME:altooleicomedio esteárico|HOHE:altooleicoaltoesteárico. Origenlalínea:IG:InstitutodelaGrasa|M:mutagénesis|USDA:DepartamentodeAgriculturadeEEUU|_x_:cruzamiento. Ácidosgrasos:16:0:ácidopalmítico|18:0:ácidoesteárico|18:1:ácidooleico|18:2:ácidolinoleico|20:0:ácidoaraquídico|22:0:ácido behénico. ComposiciónAG(mol%) FenotipoOrigen16:018:018:118:220:022:0Referencia RHA‐274STUSDA7,45,837,348,30,30,9Martínez‐Forceetal.,2004 HA89STUSDA6,95,218,169,8‐ ‐ Schuppertetal.,2006 RHA‐345HORHA‐274xPervenets3,54,489,130,6‐ ‐ Schuppertetal.,2006 PervenetsHOM3,95,488,91,8‐ ‐Schuppertetal.,2006 HA‐OL9HOHA89xPervenets5,23,788,11,50,31,1Álvarez‐Ortegaetal.,1997 CAS‐3HEM7,2 26,318,645,11,41,4Osorioetal.,1995 CAS‐6 STIG5,7 7,528,856,70,40,8Fernández‐Moyaetal.,2002 CAS‐19MECAS‐3xRHA‐2747,2 21,519,948,01,81,6Pérez‐Vichetal.,2004b CAS‐20MECAS‐3xRHA‐2746,010,038,343,70,41,6Pérez‐Vichetal.,2004b CAS‐29VHECAS‐3xCAS‐47,2 34,513,041,71,81,8Fernández‐Moyaetal.,2005 CAS‐30VHECAS‐36,6 30,310,249,61,51,8Fernández‐Moyaetal.,2005 CAS‐9HOHA‐OL9xRHA‐2743,15,286,23,30,71,5Fernández‐Moyaetal.,2005 CAS‐33HOMECAS‐3xRHA‐3456,1 17,464,19,71,11,7Fernández‐Moyaetal.,2005 CAS‐15HOHECAS‐3xRHA‐3455,4 24,957,88,21,81,9Fernández‐Moyaetal.,2005
Introducción 65 Tabla6.ComposiciónenTAGsmodificadadeaceitesdelíneasdegirasolpertenecientesalaColeccióndelInstitutodelaGrasa. SD<10%. ModificadodeMartínez‐Forceetal.,2004;Fernández‐Moyaetal.,2005. a:EstaespeciedeTAGnoseseparóyseincluyóenlaespeciedeTAGsuperior. Ácidosgrasos:P:ácidopalmítico|E:ácidoesteárico|O:ácidooleico|L:ácidolinoleico|A:ácidoaraquídico|B:ácidobehénico. TAG(mol%) TAGsRHA‐274CAS‐3CAS‐6CAS‐19CAS‐20CAS‐29CAS‐30CAS‐9CAS‐33CAS‐15 POP0,3‐‐ ‐ ‐ ‐ ‐‐0,50,5 PLP0,70,80,90,5‐0,60,5‐ ‐ ‐ POE0,52,0‐ 1,51,22,01,00,43,04,5 POO3,0‐‐0,72,8‐ ‐6,48,76,2 PLE1,26,81,14,81,46,85,8‐0,90,6 POL7,43,413,03,14,91,71,4‐0,81,4 PLL6,15,19,14,43,03,74,4‐0,4‐ EOE‐ 3,3‐ 3,11,35,62,90,54,310,4 EOO2,23,91,23,26,82,11,811,729,537,7 ELE‐ 11,0‐ 10,21,220,517,0‐ 1,4a OOO6,4‐5,1‐ 8,3‐ ‐70,932,514,3 EOL5,214,06,414,711,813,511,5a5,17,7 OOL18,92,815,63,818,6‐ ‐6,62,84,0 ELL5,225,0‐ 23,37,828,934,0‐ 3,01,2 OLL26,96,728,010,118,83,14,4‐1,10,8 LLL14,88,319,011,09,45,39,4‐ ‐ ‐ EOA‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ 0,41,5 ELA‐ 1,2‐ 1,2‐2,01,2‐ ‐ ‐ OOA‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ 0,91,52,8 OLA‐ 0,8‐ 0,80,70,70,8‐ ‐ 0,5 LLA‐ 1,3‐ 1,1‐1,11,4‐ ‐ ‐ EOB‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ ‐ 0,71,4 OOB‐ ‐ ‐ ‐ 0,8‐ ‐2,52,83,7 ELB‐ 0,8‐ 0,7a1,00,6‐ ‐ ‐ OLB0,50,8‐ 0,81,20,40,5‐ ‐ 0,7 LLB0,60,9‐ 1,1‐0,81,2‐ ‐ ‐
OBJETIVOS|73‐76 BLOQUEI:CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARYENZIMÁTICA DELASACILTRANSFERASASIMPLICADASENLABIOSÍNTESISDE TRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL 75 BLOQUEII:ANÁLISISDETRIACILGLICÉRIDOS(TAGs)ENLÍNEAS MUTAGENIZADASDEGIRASOLALTOOLEICOALTOESTEÁRICO(HOHE) YSELECCIÓNDENUEVOSCANDIDATOS 76
Objetivos 75 EstaTesisDoctoralseenmarcadentrodelacaracterizacióndelaruta biosintéticadetriacilglicéridosensemillasdegirasolqueelGrupodeGenéticay BioquímicadeLípidosdeSemillas(GGBLS)delDepartamentodeBioquímicay BiologíaMoleculardeProductosVegetalesdelInstitutodelaGrasa(CSIC)está llevandoacabodesdeelaño1995. Estetrabajosedivideendosbloquesprincipales,dosestrategias complementariasquepersiguenlaobtencióndenuevosaceitesdegirasolcon composiciónmodificadadelípidosrequeridasporlaindustria. Elprimerbloqueconsisteenelestudiogenéticoybioquímicodedosdelastres aciltransferasasimplicadasenlarutadebiosíntesisdeTAGsensemillasen desarrollodegirasol.Losresultadosdeestosestudiosnosproporcionaránla informaciónnecesariaparaenunfuturodesarrollarnuevasestrategiasde ingenieríagenéticabasadasenlasafinidadesporsustratodeestasenzimasque permitanmodificarladistribucióndeácidosgrasosenTAGsyasíobtenernuevos aceitesdegirasol.Esteprimerbloqueseresumeenlossiguientesobjetivos específicos: 1. Clonaciónycaracterizacióndelosgenesquecodificanparalas actividadeslisofosfatidatoaciltransferasa(LPAAT)ensemillasen desarrollodegirasol. 2. Clonaciónycaracterizacióndelosgenesquecodificanparalas actividadesdiacilglicerolaciltransferasa(DAGAT)ensemillasen desarrollodegirasol.
Objetivos 76 Elsegundobloqueseenmarcadentrodelestudiodemutantesconcomposición modificadadeácidosgrasosobtenidosmediantetécnicasdemutagénesise hibridaciónconvencionales.Medianteunaseriedecriteriosdeselección,este estudionospermitiráobtenerlíneasdegirasolconunacomposiciónmejorada deTAGs.Estesegundobloqueseresumeenelsiguienteobjetivoespecífico: 3. Obtenciónyseleccióndenuevosmutantesapartirdeunapoblación segregantealtooleicoaltoesteárico(HOHE)quecontenganuna mayorproporcióndeTAGsdeltipoSUS,yaseadebidoaun incrementoenelcontenidodeácidoesteáricoounamejor distribucióndelosAGssaturadosenlosTAGsy,enconsecuencia, valoresαSatpróximosal0.5óptimo.
MATERIALESYMÉTODOS|77‐154 1.MATERIALES 79 1.1APARATOSYMATERIALES 79 1.2REACTIVOSYQUÍMICOS80 1.3ENZIMASYKITS81 1.4MATERIALBIOLÓGICOYCONDICIONESDECULTIVO81 1.5MEDIOSDECULTIVOYSOLUCIONESNUTRITIVAS91 1.6ANTIBIÓTICOS93 1.7TAMPONESYSOLUCIONES95 1.8OLIGONUCLEÓTIDOS98 1.9PLÁSMIDOSYVECTORESDEEXPRESIÓN99 2.MÉTODOS102 2.1BIOLOGÍAMOLECULAR102 2.2 BIOQUÍMICA133 2.3BIOINFORMÁTICA142 2.4BIOESTADÍSTICA144 2.5DISEÑOEXPERIMENTALYCRITERIOSDESELECCIÓNLÍNEAHOHE150
MaterialesyMétodos 79 1.MATERIALES 1.1 APARATOSYMATERIALES AparatoModeloCompañía AgitadormagnéticoconcalefacciónAG‐2Raypa,España AgitadortipovórtexMS2 IKA ® ,Alemania AutoclavesPresoclave75LJPSelecta ® ,España 2540MLTuttnauer,Holanda BalanzaanalíticaTE313SSartorius,Alemania BalanzaanalíticadeprecisiónAL54MettlerToledo,España BañostermostáticosBiocold JPSelecta ® ,España SWB Stuart Scientific ® ,ReinoUnido SW22 Julabo,Alemania Unitronic320ORJPSelecta ® ,España BañosonicadorultrasonidoUltrasonsJPSelecta ® ,España CabinaflujolaminarverticalFASTERTWO30Cultek,España Cámaracultivo APT.lineTMKBWBinder,Alemania CentrífugaSorvallRC5CThermoScientific,EEUU ConcentradordemuestrasDB‐3DTechne,ReinoUnido ContadorlíquidodecentelleoLS‐6500BeckmanCoulterTM,EEUU Cromatógrafosdegases(GC)Clarus500PerkinElmer,EEUU 6890Agilent,EEUU DesionizadorS8000PStation,EEUU EspectrofotómetroUltrospec3300proAmersham‐Biosciences,EEUU IncubadoresorbitalesEcotronInforsHT,Suiza SI50Stuart Scientific ® ,ReinoUnido LupabinocularestéreoST‐30‐2LFOptika,Italia Microcentrífugas5415REppendorf,Alemania 5810REppendorf,Alemania HeraeusPicoThermoScientific,EEUU Spectrafuge24DLabnet,EEUU MicroscopioópticoSZM‐2Optika,Italia Mini‐BeadBeater8Biospec,EEUU NanoDrop2000ThermoScientific,EEUU pH‐metroInolab720WTW,Alemania RotavaporVWRIKA ® ,Alemania RotoresA‐4‐62Eppendorf,Alemania SorvallGSAThermoScientific,EEUU SorvallSS‐34ThermoScientific,EEUU 70iTiBeckmanCoulterTM,EEUU SistemasdeelectroforesishorizontalPower‐PacBasicBio‐Rad,EEUU Power‐Pac300Bio‐Rad,EEUU Sub‐Cell ® GTBio‐Rad,EEUU TermobloqueDigitalHeatblockVWRTM,EEUU TermocicladoresMJMiniTMGradientBio‐Rad,EEUU MiniOpticonTMRT‐PCRBio‐Rad,EEUU TGradientBiometra ® ,Alemania TransiluminadorChemiGenius2Syngene,ReinoUnido TFX‐20MVilberLourmat,Alemania UltracentrífugaL8‐70MBeckmanCoulterTM,EEUU Tabla8.Aparatosusadosenestetrabajo.
MaterialesyMétodos 80 1.2 REACTIVOSYQUÍMICOS Reactivo/QuímicoCompañía BromurodeetidioSigma‐Aldrich,EEUU ComponentesmedioscultivoyagarosaPronadisa,España Compuestosradiactivos GEHealthcare,EEUU Disolventesorgánicos,ácidosybases Panreac,España Ficoll400,PEG4000 Fluka,EEUU FungicidasistémicoPrevicur®NBayer,Alemania GasesyN2líquidoCarburosMetálicosyAirLiquide,España IPTG,X‐Gal,tampóndecarga,RNasaA,marcadores detamañoypesomolecularparaDNAydNTPs Fermentas,EEUU LíquidodecentelleoEcoscintTMHNationalDiagnostics,EEUU MedioMurashige‐Skoog(MS) Duchefa,Holanda PMSFycóctelinhibidordeproteasasdelevaduras Sigma‐Aldrich,EEUU ReactivodeBradford Bio‐Rad,EEUU SalesinorgánicasyDPM MerckMillipore,Alemania SilwetL‐77Momentive,EEUU SYBR®GreenQiagen,Alemania Tamponesorgánicos,salesorgánicas,metabolitos, enzimas,detergentes,compuestosorgánicos, aminoácidosyantibióticos Sigma‐Aldrich,EEUU YNBsinaminoácidosBDDifco™,EEUU MaterialModelo Compañía CámarasdeplacasTLC CAMAG,Alemania Cintaporosa3M Micropore,EEUU Cubetaselectroforesis Bio‐Rad,EEUU Glassbeads0.5mm Sigma‐Aldrich,EEUU Filtrosdejeringa(acetatodecelulosa)Minisart®16534‐KSartorius,Alemania MaterialdevidrioPyrex,ReinoUnido Microcubetasdensidadóptica HellmaAnalytics,Alemania PipetasP10,20,200,1000,5000 Eppendorf,Alemania PipetasPasteur 150mm VWRTM,EEUU PlacasdegeldesíliceTLC20x20cm MerckMillipore,Alemania Placasdepolipropileno Stratagene®,Alemania PlacasdePetri Tubosdemetilaryvialesdecentelleo Tabla10.Reactivosyquímicosusadosenestetrabajo. Tabla9.Materialesusadosenestetrabajo.
MaterialesyMétodos 81 Tabla11.EstirpesdeE.coli usadasenestetrabajo. Parabiologíamolecular,asícomoparalapreparacióndemediosdecultivo,se utilizóaguadegradoMilli‐Q,purificadamedianteunsistemadecartuchosde purificacióndeaguaMillipore.Elaguaempleadaenlosexperimentosde bioquímicaestabapurificadamedianteósmosisinversayposteriormente desionizadamedianteundesionizadormodeloS8000P(Station,EEUU). 1.3 ENZIMASYKITS Lasdistintasenzimasykitsutilizadosenestetrabajo,denoespecificarselo contrario,fueronadquiridasalassiguientescompañías: Ambion(EEUU),Amersham‐Biosciences(EEUU),Amersham‐Pharmacia(EEUU), Bio‐Rad(EEUU),BoehringerIngelheim(Alemania),Clontech(Japón),Ecogen (España),Invitrogen(EEUU),Macherey‐Nagel(Alemania),Mbiotech(EEUU),New EnglandBiolabs(ReinoUnido),Qiagen(Alemania).Stratagene®(Alemania). 1.4 MATERIALBIOLÓGICOYCONDICIONESDECULTIVO 1.4.1 Escherichiacoli DuranteeldesarrollodeestetrabajosehanutilizadodiferentesestirpesdeE. coli,empleadasenlosprocesosdeclonación(MaterialesyMétodos,2.1.8.1) (Tabla11). EstirpeGenotipoaCompañía Referencia XL1‐Blue Δ(mcrA)183Δ(mcrCB‐hsdSMR‐mrr)173 endA1supE44thi‐1recA1gyrA96relA1 lac[F´proAB,lacIqZΔM15,Tn10(tetr)] Invitrogen,EEUU Bullocketal.,1987 DH5‐α F ‐,deoRrecA1endA1hsdR17(r k ‐mk+) supE44lamda‐thi‐1gyrA96relA1 Invitrogen,EEUU Hanahan,1983 aLadescripcióndecadagenotiposeencuentraenlatablaI,secciónabreviaturas.
MaterialesyMétodos 88 Tabla15.LíneasdeA.thaliana usadasenestetrabajo. 1.4.5 Arabidopsisthaliana DuranteeldesarrollodeestetrabajoseusótantoelecotiposilvestreColumbia‐0 (Col‐0)comolíneasknockout(KO)dedeterminadosgenesdeinterés(Tabla15). LíneaNASC Gen CódigoAt Referencia Col‐0N22681 N504681 AtLPAT2At3g57650 N546680 AtLPAT3At1g51260 tag1‐1(AS11)N3861 AtDGAT1At2g19450 Katavicetal.,1995;Zouetal.,1999 LaslíneasKON504681yN546680fuerondonadasporelDr.JosephR.Ecker(The SalkInstituteforBiologicalStudies,California),obtenidamedianteinsercióndeT‐ DNAutilizandoparaelloelvectordetransformaciónpROK2(Baulcombeetal., 1986).LalíneaKON3861(AS11),porsuparte,fuedonadaporelDr.LjerkaKunst (UniversityofBritishColumbia,UBC),obtenidamedianteduplicacióngénica utilizandoetilmetanosulfonato(EMS)comoagentemutagénico. DelastreslíneasKO,tansóloN3861(AS11)estádescrita.Encomparaciónconla líneasilvestreCol‐0,éstasecaracterizaporteneralteradalacomposiciónde ácidosgrasos:mayoresnivelesdeácidoα‐linolénicofrenteaunmenorcontenido deácidoeicosenoico(20:1Δ11c)yácidooleico.Además,presentamenor actividadDGAT,porloqueelcontenidoenTAGsyaceiteensemillaseve reducidoy,enconsecuencia,poseemenortasadegerminación(Katavicetal., 1995;Zouetal.,1999). TodaslaslíneasKOfuerondistribuidasatravésdelEuropeanArabidopsisStock Center(NASC)(Scholletal.,2000)comolíneassegregantesenfondogenético Col‐0.
MaterialesyMétodos 89 1.4.5.1 Condicionesdecultivo Lassemillas,previagerminación,sesometieronauntratamientodeesterilización consistenteenunaprimerasolucióndelejíaal10%(v/v),seguidodeunasolución deetanolal70%(v/v)yunaseriedelavadossucesivosconabundanteagua.A continuación,lassemillaspudieronseguirdosmétodosdesiembra: 1. Cultivoentierra.‐Lassemillassesembrarondirectamenteensemilleros contierrahúmedapreviamentedesinfectadaconfungicidasistémico Previcur®N(Bayer,Alemania)paraevitarplagas,dispuestosenbandejas. 2. Cultivoinvitro.‐Lassemillasseresuspendieronenunasoluciónde agarosa0,8%(p/v)previamentecalentadaysesembraronsobreplacasde Petride9cmØselladasconcintaporosa(Micropore,3M,EEUU)en mediosólidoMS(MaterialesyMétodos,1.5.4). Indistintamentedelmediodecultivousado,lassemillassesometieronaun procesodeestratificacióndurante3díasa4°Cencondicionesdeoscuridady humedad,permitiendoasíunaóptimasincronizaciónenlagerminación. Finalmente,lagerminacióndelassemillasyelcrecimientodelasplantas tuvieronlugarencámarasdecultivoAPT.lineTMKBW(Binder,Alemania),bajo condicionesdetemperaturayfotoperiodocontroladas. Engeneral,latemperaturadecrecimientofuede20‐22°C(luz/oscuridad)yla intensidaddeluzde200μmolm‐2s‐1,confotoperiododeciclolargode16h/8h (luz/oscuridad)yhumedadde40‐50%.Lasplántulascrecidasapartirdecultivos invitrosetrasplantaronasemilleroscontierrahúmedadispuestosenbandejas dondecontinuósucrecimiento.Elriegoserealizódeformamanualdosvecespor semanamedianteinundacióndelabandeja,suplementadoconsoluciónnutritiva (MaterialesyMétodos,1.5.4);éstesedetuvounasemanaantesdelarecolección desemillasparapotenciarsudesecación.Elciclobiológicodelaplantaesde2‐3 meses.
MaterialesyMétodos 90 Enfuncióndelusoparaelquefuesensembradas,lasplantasysemillassufrieron modificacionespuntualesenlascondicionesdecultivo: 1. Lasplantasdestinadasacompletarsuciclobiológicoyproducirsemillas fueroncrecidasdirectamenteencultivosdetierrahúmeda. Excepcionalmente,lassemillasdelalíneaKON3861(AS11)fueron germinadasinvitrodebidoasunulagerminaciónentierra.Las condicionesdecrecimientofueronlasdescritasanteriormente. 2. LasplantasdestinadasasertransformadasconAgrobacteriummediante infiltración(MaterialesyMétodos,2.1.8.4.2)fuerontrasplantadasa macetascontierrahúmedaengruposdecincoporconstrucción,por triplicado,dispuestasenbandejas.Elcrecimientoserealizóigualmentea 20‐22°C(luz/oscuridad),peroestavezsesometieronprimeroa fotoperiododeciclocortode8h/16h(luz/oscuridad)parapotenciarel crecimientovegetativo,ydespuésafotoperiododeciclolargode16h/8h (luz/oscuridad),parainducirlafasereproductiva.Lasplantas,unavez transformadas,semantuvieronundíaenoscuridadyhumedad,para posteriormentevolverasertransformadasytraspasadasnuevamenteala cámaradecultivo,procurandoelaislamientodeunasconotraspara evitarcruzamientosnodeseadosyfavoreciendolaalternanciaposicional deéstas. 3. Lassemillasprocedentesdeplantastransformadasfuerongerminadasin vitroenplacasdePetride14cmØenmediosólidoMSsuplementadocon higromicina(15g/ml)parasuposterioridentificación.Elmétodo empleadoparatalfin,basadoencambiosenelfotoperiodo,asícomoel criteriodeselección,seespecificaenMaterialesyMétodos,2.1.8.4.3.
MaterialesyMétodos 91 1.4.5.2Recogidadematerialbiológico Lasmuestrasrecogidasvariaronenfuncióndelametodologíaseguida: 1. SeleccióndelíneasKOhomocigotas.‐Setomaronhojasbasalesdelíneas KOenlosestadíosinicialesdecrecimiento,tras15díasdespuésde siembra(DDS).TodasellassecongelarondirectamenteenN2líquidoyse almacenarona‐80°Chastasuposterioruso(MaterialesyMétodos, 2.1.1.3.4). 2. Análisisdegenotipoenhojas.‐ Setomaronigualmentehojasbasalesde líneastransgénicasT3enlosestadíosinicialesdecrecimiento,tras15días despuésdesiembra(DDS).Seprocediódeigualmodoqueenelpunto anterior(MaterialesyMétodos,2.1.1.3.4). 3. Análisisfenotípicodesemillas.‐Serecogieronsemillasmaduras,tantode líneassilvestrecomodelíneasKO(S0),ysemillasT3delíneastransgénicas. Lassemillasseguardaronenunlugaroscuroysecoatemperatura ambientehastasuvisualizaciónenlupa(MaterialesyMétodos,2.1.9.2.1). 4. Análisislipídicodesemillas.‐ Serecogieronsemillas,tantodelíneas silvestrecomodelíneasKO(S0)ydelíneastransgénicas(T3).Lassemillas seguardaronenunlugaroscuroysecoatemperaturaambientehastasu posterioranálisis(MaterialesyMétodos,2.2.1.1.2). 1.5 MEDIOSDECULTIVOYSOLUCIONESNUTRITIVAS Paraelcrecimientodelosdistintosorganismosobjetosdeestudioseemplearon lossiguientesmediosysoluciones: 1.5.1E.coli MedioLuria‐Bertani(LB)(Sambrooketal.,1989):Bactotriptonaal1%(p/v), extractodelevaduraal0,5%(p/v)yNaClal1%(p/v).
MaterialesyMétodos 92 1.5.2A.tumefaciens MedioLuria‐Bertani(LB)(Sambrooketal.,1989):Bactotriptonaal1%(p/v), extractodelevaduraal0,5%(p/v)yNaClal1%(p/v). 1.5.3S.cerevisiae MedioricoYPD:Extractodelevaduraal1%(p/v),peptonabacteriológicaal 2%(p/v),glucosaal2%(p/v). MediomínimoSC:YeastNitrogenBase(YNB)sinaminoácidosal0,67%(p/v), fuentedecarbono*al2%(p/v)yunamezclaenpolvodeaminoácidosy nucleósidosal0,13%(p/v)conteniendo:0,04g/Ladeninasulfato,0,02g/LL‐ arginina,0,1g/LácidoL‐aspártico,0,1g/LácidoL‐glutámico,0,02g/LL‐ histidina,0,06g/LL‐leucina,0,03g/LL‐lisina,0,02g/LL‐metionina,0,05g/LL‐ fenilalanina,0,375g/LL‐serina,0,2g/LL‐treonina,0,04g/LL‐triptófano,0,03 g/LL‐tirosina,0,15g/LL‐valinay0,15g/Luracilo;pH5,6ajustadoconNaOH. MediomínimoSC‐URA:MediomínimoSCsinuraciloparalaselecciónde auxotrofías. *Lasfuentesdecarbonoempleadasfueron:2%(p/v)glucosa,2%(p/v)rafinosao 2%(p/v)galactosa,segúnlafinalidaddelcultivo.Éstasseesterilizaronporfiltración atravésdeunamembranadefiltrodejeringadeacetatodecelulosade0,2µmde poroy25mmdediámetroMinisart®16534‐K(Sartorius,Alemania). 1.5.4A.thaliana MedioMurashige‐Skoog(MS):SalesMS(Sigma‐Aldrich,EEUU)al0,44%(p/v), sacarosaal1‐3%(p/v)yMESal0,05%(p/v);pH5,7ajustadoconKOH. Soluciónnutritiva:0,005MKNO3,0,0025MKH2PO4,0,004MMgSO4×7H2Oy 0,002MCa(NO3)2×4H2O.
MaterialesyMétodos 93 Entodosloscasos,losmediosysolucionessehicieronconaguadealtacalidadMilli‐Q (Millipore,ReinoUnido)yseesterilizaronenautoclavea120°Cy1atmdepresión durante20min.Engeneral,paralapreparacióndelosmediossólidosseañadióagaral 1,5%(p/v)previaesterilizaciónyserealizaronenplacasdePetri.Enlapreparaciónde mediosólidoparasemillasdeA.thalianaseusóencambiofitoagaral0,8%(p/v). Lassustanciastermolábilescomolosantibióticosseadicionaronenlasconcentraciones indicadas(MaterialesyMétodos,1.6)almediodecultivoyaestérilyenfriadopordebajo delos50°C,aligualquelasfuentesdecarbono(MaterialesyMétodos,1.5.3). ParalaseleccióndecoloniasdeE.colitransformadasconplásmidosquecontienen insertoyposeenelgenlacZ(MaterialesyMétodos,2.1.8.1.3)seañadieronisopropil‐ß‐ D‐tiogalactopiranósido(IPTG)0,5mMesterilizadoporfiltraciónatravésdeuna membranadefiltrodejeringadeacetatodecelulosade0,2µmdeporoy25mmde diámetroMinisart®16534‐K(Sartorius,Alemania)y5‐bromo‐4‐cloro‐3‐indolil‐β‐D‐ galactopiranósido(X‐Gal)80µg/mLalmediodecultivosólidoLByaestérilyenfriadopor debajodelos50°C. Losmediossólidosseconservarona4°Cylosmedioslíquidosatemperaturaambiente. 1.6 ANTIBIÓTICOS Paralaseleccióndelaspropiasestirpesylosdistintostransformantes,enfunción delorganismoobjetodeestudio,seutilizaronlossiguientesantibióticos: 1.6.1E.coli Ampicilina:Antibióticobactericidaqueinhibelasíntesisdelaparedcelular, actuandosobrelasenzimasresponsablesdedichasíntesis.Elgende resistenciaamppresenteenlosplásmidospGEM®‐TEasy,pMBL‐TypYES2 (MaterialesyMétodos,1.9)codificaparaunaenzimaperiplásmicaque rompeelanilloβ‐lactámicodelantibiótico.Laampicilina(salsódica)se preparóa100mg/mLenagua,diluyéndoseyadicionándoseposteriormente aunaconcentraciónfinalde100g/ml.
MaterialesyMétodos 94 Kanamicina:Antibióticobactericidaqueseunealasubunidad70Sdelos ribosomasycausalalecturaerróneadelRNA.Elgenderesistenciakan presenteenelplásmidopCAMBIA‐1300EC(MaterialesyMétodos,1.9) codificaparaunaenzimafosfotransferasaaminoglicidaquemodificael antibióticoyprevienesuinteracciónconelribosoma.Lakanamicinase preparóa50mg/mLenagua,diluyéndoseyadicionándoseposteriormentea unaconcentraciónfinalde50g/ml. 1.6.2A.tumefaciens Rifampicina:AntibióticobactericidaqueseunealasubunidadßdelaRNA polimerasa,inhibiendoasílasíntesisdeRNA.Laresistenciarifpresenteenla propiaestirpeGV3101(MaterialesyMétodos,1.4.2)comomarcador cromosomalevitalainteracciónantibiótico‐enzimamedianteunaseriede mutacionesdevariosaminoácidospresentesendichasubunidad.La rifampicinasepreparóa25mg/mLenmetanol,diluyéndoseyadicionándose posteriormenteaunaconcentraciónfinalde100g/ml. Gentamicina:Antibióticobactericidaqueseunealasubunidad30Sdelos ribosomas,interfiriendoenlaelongacióndelacadenapeptídica.Elgende resistenciagempresenteenelplásmidopMP90(MaterialesyMétodos,1.9) codificaparaunaenzimaadenililtransferasaaminoglicidaqueevitala interacciónantibiótico‐ribosonamediantelamodificacióndeunaminoácido presenteendichasubunidad.Lagentamicinasepreparóa50mg/mLen agua,diluyéndoseyadicionándoseposteriormenteaunaconcentraciónfinal de50g/ml. Kanamicina:Antibióticobactericidaqueseunealasubunidad70Sdelos ribosomasycausalalecturaerróneadelRNA.Elgenderesistenciakan presenteenelplásmidopCAMBIA‐1300EC(MaterialesyMétodos,1.9) codificaparaunaenzimafosfotransferasaaminoglicidaquemodificael antibióticoyprevienesuinteracciónconelribosoma.Lakanamicinase preparóa50mg/mLenagua,diluyéndoseyadicionándoseposteriormentea unaconcentraciónfinalde50g/ml.
MaterialesyMétodos 95 1.6.3A.thaliana HigromicinaB:Antibióticoquematatantoabacteriascomohongosycélulas eucariotassuperioresalinhibirlasíntesisproteica.Elgenderesistenciahyg presenteenelplásmidopCAMBIA‐1300EC(MaterialesyMétodos,1.9) codificaparaunaquinasaqueinactivaalantibióticoatravésdela fosforilacióndelmismo.Lahigromicinasepreparóa15mg/mLenagua, diluyéndoseyadicionándoseposteriormenteaunaconcentraciónfinalde15 g/ml. Todoslosantibióticospreparadosenaguafueronposteriormenteesterilizadospor filtraciónatravésdeunamembranadefiltrodejeringadeacetatodecelulosade0,2µm deporoy25mmdediámetroMinisart®16534‐K(Sartorius,Alemania)ysealmacenaron a‐20°Chastasuposterioruso.Aquellosantibióticosquefueronpreparadosenmetanol noprecisaronesterilizaciónalguna. 1.7 TAMPONESYSOLUCIONES 1.7.1BiologíaMolecular 1.7.1.1Ácidosnucleicos TAE:40mMTris‐acetatoy1mMEDTApH8,0. TE:10mMTris–HCl,1mMEDTA,pH8,0. Soluciónparalosgelesdeagarosa:0,8‐2%agarosa(p/v),suplementandocon TAE. Solucióndeextracción2xCTAB:0,1MTrispH8,0,2%CTAB(bromurode hexadeciltrimetilamonio‐C19H42NBr)(Sigma‐Aldrich,EEUU),1,4MNaCly20 mMEDTApH8,0.Añadirenelmomentodeusar50µg/mLdeRNAasa.
MaterialesyMétodos 96 Tampóndeextracción:0,2MTris‐HClpH7,5,0,25MNaCl,25mMEDTApH 8,0ySDS0,5%(p/v). 1.7.1.2Preparacióndecélulascompetentes MedioψBroth:bactotriptona2%(p/v),extractodelevadura0,5%(p/v), MgSO40,4%(p/v),10mMKCl. SoluciónTjBI:100mMRbCl,50mMMnCl2∙4H2O,30mMacetatopotásico,10 mMCaCl2,glicerol15%(p/v);pH5,8ajustadoconacético0,2Myesterilizado porfiltración. SoluciónTjBII:10mMMOPS,10mMRbCl,75mMCaCl2,glicerol15%(p/v); pH7ajustadoconNaOHyesterilizadoporfiltración. SoluciónCaCl2:20mMdeCaCl2. 1.7.1.3Transformacióndecélulas SolucióndeCaCl2:10mMPipespH7,0,60mMCaCl2yglicerol15%(p/v). Tampón“Plate”:PEG400040%(p/v),0,1Macetatodelitio,10mMTris‐HCl pH7.5y1mMEDTA. 1.7.1.4Transformacióndeplantas Solucióndetransformación:sacarosa5%(p/v)ySilwetL‐770,05%(p/v) (Momentive,EEUU). 1.7.1.5Microsomasdelevaduras Tampóndeextracción:0,2MHEPES‐NaOH,pH7,4,0,5Msacarosa.Añadir1 mMPMSF(Sigma‐Aldrich,EEUU)justoantesdeusar.
MaterialesyMétodos 97 Tampónderesuspensión:10mMHEPES‐NaOH,pH7,4. TampónSCEM:1Msorbitol,citratosódico2,94%(p/v),10mMEGTA;pH6,5‐ 7,0. Tampónderotura“breakagebuffer”:10mMMESpH6,9ajustadoconTris‐ HCl,Ficoll40012%(p/p)y0,2mMEDTA.Añadir1mMPMSFycóctel inhibidordeproteasasdelevaduras0,6%(v/v)(Sigma‐Aldrich,EEUU)justo antesdeusar. TampónTEGM:50mMTrispH7,5,1mMEGTA,1mMβ‐mercaptoetanol,1 mMPMSF. TampónTEGM/33:TEGMenglicerol33%(p/v). 1.7.1.6Stockdecélulas Solucióndeglicerol:25mMTris‐HCl,pH7,5,glicerol70%(p/v). Todaslassolucionesutilizadasparabiologíamolecularfueronesterilizadasmedianteun procesodeautoclavea120°Cy1atmdepresióndurante20min.Lassolucionesqueno podíanresistiresascondicionesfueronesterilizadasporfiltraciónatravésdeuna membranadefiltrodejeringadeacetatodecelulosade0,2µmdeporoy25mmde diámetroMinisart®16534‐K(Sartorius,Alemania).Elmaterialdevidrioyotrosequipos eranesterilizadosa200°Cdurante1h. 1.7.2Bioquímica 1.7.2.1Extraccióndelípidosymetilacióndeácidosgrasos Mezclademetilaciónyextracción:metanol/tolueno/dimetoxipropano/H2SO4 (39:20:5:2,v/v/v/v). Mezclademetilar:metanol/tolueno/H2SO4(88:10:2,v/v/v).
MaterialesyMétodos 104 2.1.1.3.2AislamientodemRNA PartiendodelamuestradeRNAtotaldelapartadoanterior,serealizóelpasode purificacióndelRNAmensajeroutilizandoelkitcomercialGenElutemRNA Miniprepkit(Sigma‐Aldrich,EEUU),siguiendolasinstruccionesdelfabricante.El precipitadodeRNAmensajerofueresuspendidoen33µLdesoluciónTElibrede RNAasa(MaterialesyMétodos,1.7.1.1). 2.1.1.3.3SíntesisdelaprimeracadenadecDNA LasíntesisdecDNAapartirdelmRNAextraídoserealizóigualmenteutilizandoel kitReady‐To‐GoTMT‐PrimedFirst‐StrandKit(Amersham‐Biosciences,EEUU), siguiendolasinstruccionesdelfabricante.Despuésdelaprimerasíntesisde cDNA,lareacciónestuvolistaparalaclonacióngénicamediantereaccionesde PCRestándar(MaterialesyMétodos,2.1.3.1.a)yelanálisisdeexpresióngénica mediantePCRcuantitativa(MaterialesyMétodos,2.1.3.4)oPCRcualitativa (MaterialesyMétodos,2.1.9.2.2). 2.1.1.3.4ExtraccióndegDNA DependiendodelacantidaddeDNAgenómicoquesepretendióaislar,se siguierontresprotocolosdiferentes: a) Aislamientoconkitcomercial.‐ Serecogieron0,1gdehojasfrescasdela plantaestudio.RápidamentesecongelaronconN2líquidoysemachacaron conmorteroymazaestérilhastalaobtencióndeunpolvofino.ElgDNAfue posteriormenteextraídodelmaterialusandoelkitcomercialGenElutePlant GenomicDNAMiniprepkit(Sigma‐Aldrich,EEUU),siguiendolasinstrucciones delfabricante.Unavezextraído,elgDNAfueresuspendidoen100µLdeTEy almacenadoa‐20°Chastasuposterioruso.Lacantidadobtenidaconeste métodofue,comomáximo,de20µgporpreparación.
MaterialesyMétodos 105 b) AislamientoconprotocoloCTAB.‐Sesiguióelmétododescritoenelartículo deMurrayyThompson(1980).Setomaron2,5gdehojasfrescasdelaplanta aestudio.RápidamentesecongelaronconN2líquidoysemachacaroncon morteroymazaestérilhastalaobtencióndeunpolvofino.Altejidose añadieron5mLdelasolución2xCTABconRNAasa(MaterialesyMétodos, 1.7.1.1),mezclandoporinversión.Lamezclaseincubóa65°Cdurante20min, añadiendoposteriormente5mLdeCHCl3(MerckMillipore,Alemania)y mezclandovigorosamenteporinversión.Tras2mindecentrifugacióna 15.000gseañadieron5mLdeisopropanolpuro,mezclandoinmediatamente eincubando1‐2minatemperaturaambiente.Trasunanuevacentrifugación de5mina15.000gseaprecióunprecipitadoligeramenteamarilloporel precipitadodelgDNA.Acontinuación,selavóelprecipitadoconetanol70% (v/v),seprecipitótras5mina15.000gysedejósecarencampanatras retirarelsobrenadante.Unavezseco,seresuspendióen875µLdeaguayse almacenóa‐20°Chastasuposterioruso.Lacantidadobtenidaconeste métodofue,comomáximo,de2mgporpreparación. c)AislamientoconprotocolomodificadoCTAB.‐Sesiguióunmétodomodificado delanteriorquenorequeríaelusodefenolnicloroformoy,enconsecuencia, másrápido.Setomaronhojasfrescasindividualesdelaplantaaestudio. RápidamentesecongelaronconN2líquidoentubosEppendorfyse machacaronconpuntaestérilde1mLhastalaobtencióndeunamasa compacta.Estamasasemaceróatemperaturaambientedurante15sya continuaciónseañadieron400µLdetampóndeextracción(Materialesy Métodos,1.7.1.1),mezclandovigorosamentedurante5s.Tras1minde centrifugacióna13000rpm,setransfirieron300µLdelsobrenadanteaun nuevotuboyseañadieron300µLdeisopropanolpuro,mezclando inmediatamenteeincubando2minatemperaturaambiente.Trasunanueva centrifugaciónde5mina13000rpmseobtuvoelprecipitadodegDNA,el cuálfuesecadoyresuspendidoen100µLdetampónTE(Materialesy Métodos,1.7.1.1)ysealmacenóa‐20°Chastasuposterioruso.Lacantidad obtenidaconestemétodofuesuficientepararealizaranálisisporPCR screening(MaterialesyMétodos,2.1.3.1c).
MaterialesyMétodos 106 2.1.2Cuantificacióndeácidosnucleicos Laconcentraciónypurezadelosácidosnucleicossedeterminóindistintamente midiendolaabsorbanciaa260y280nmenunespectrofotómetroUltrospec 3300pro(Amersham‐Biosciences,EEUU)oenunNanodrop2000(Thermo Scientific,EEUU).Larelaciónentrelaabsorbanciamedidaa260nmya280nm (260/280)indicalapurezadelosácidosnucleicos,mientrasquelaabsorbancia medidaa260nmpermiteestimarlaconcentracióndeácidosnucleicospresentes enlapreparación. Así,unarelación260/280próximaa1,8indicaqueelDNAespuro, correspondiéndoseunaunidaddeabsorbanciaa260nmaunaconcentraciónde 50µg/mLdeDNAdedoblecadena.ParaelcasodelRNA,larelación260/280 debeaproximarsea2,correspondiéndoseunaunidaddeabsorbanciaa260nma unaconcentraciónde40µg/mLdeRNA(Sambrooketal.,1989). 2.1.3Reacciónencadenadelapolimerasa(PCR) 2.1.3.1AmplificacióndeDNAmediantePCR TodaslasamplificacionessellevaronacaboenuntermocicladorTGradient (Biometra®,Alemania)oenunMJMiniTMGradient(Bio‐Rad,EEUU).Dependiendo delafinalidadyelmoldeaamplificar,sellevaronacabocuatrotiposde reacciones: a)Reacciónestándar.‐Lasreaccionessedesarrollaronenunvolumenfinalde50 μLconteniendo:tampóncomercialdelapolimerasa(10x),2mMdeMgCl2, 0,25mMdeunamezclaqueconteníatodoslosdesoxinucleótidostrifosfato (dNTPs),0,5μMdecadaoligonucleótido,0,1‐1μgdeDNAmoldey0,05Ude EcoTaqDNApolimerasa(Ecogen,España).Deformarutinaria,lamezclade reacciónsesometióaunaactivacióndelaenzimayprimera desnaturalizacióna94°Cdurante3min.Posteriormente,seefectuaron30 ciclosqueconsistíanenunaprimeraetapadedesnaturalizacióna94°C durante30s,unafasedealineamientodeoligonucleótidosde30saun
MaterialesyMétodos 107 temperatura2°pordebajodelaTmmenordelpardeoligonucleótidos,yuna etapadeextensióna72°Cconunaduraciónquevariabaenfuncióndela longituddelfragmentoaamplificar,siendolarelaciónde1min/kb. Finalmente,traslos30ciclos,lamezclasesometióa72°Cdurante10minen losqueseprodujounaextensiónfinaldelosfragmentosobtenidos.La temperaturadealineamientosemodificóhastaencontrarelpuntoóptimo paracadareacción. b)Reaccióndealtafidelidad.‐EnestetipodereacciónseempleólaiProofDNA polimerasa(Bio‐Rad,EEUU),enzimaconactividadcorrectora(3´‐ 5´exonucleasa)capazdeaumentarenseisveceslafidelidadenlasíntesisde DNAencomparaciónconlaTaqpolimerasa.Alnoposeeractividad transferasaterminal,losfragmentossintetizadosconlaiProofposeen extremosromos.Enestecaso,lasreaccionessellevaronacaboenun volumenfinalde50μLquecontenía:1XiProofHFbuffer,0,25mMdela mezcladedNTPs,0,5μMdecadaoligonucleótido,0,1‐1μgdeDNAmoldey 0,02UdeiProofDNApolimerasa(Bio‐Rad,EEUU).Lamezclasesometióauna activacióndelaenzimayprimeradesnaturalizacióna98°Cdurante30s. Posteriormente,seefectuaronde25‐30ciclosenlosquelamezclasesometía aunaprimeraetapadedesnaturalizacióna98°Cdurante10s,seguidadeuna etapadealineamientodesecuenciasenlaquelatemperaturaensayadafue nuevamentelaTmmásbajadelosdosoligonucleótidosmenos2°Cdurante 10‐30s,yunaterceraetapadeextensióna72°Cconunduraciónquevariaba enfuncióndelalongituddelfragmentoaamplificar,siendoestavezla relaciónde15‐30s/kb.Finalmente,lamezclasesometióa72°Cdurante5‐10 minutosenlosqueseprodujounaextensiónfinaldelascadenas.La temperaturadealineamientosemodificóhastaencontrarelpuntoóptimo paracadareacción. c)PCRdiagnósticaoscreening.‐ Medianteestatécnicaseobtienela amplificacióndirectadesecuenciasgénicasapartirdecoloniasdebacteriaso levadurassinnecesidaddelaislamientopreviodelDNAusadocomomoldede lareacción.Suusoenestetrabajotuvocomofinlaidentificacióndeclones portadoresdelassecuenciasdeinterés,ensucorrectaorientación,porlo
MaterialesyMétodos 108 quelamezcladereacciónyamplificaciónseasemejaronalasdelapartadoa). Noobstante,existenpequeñasvariaciones:elDNAmoldesesustituyópor0,5 µLdeunadiluciónpreviaen20µLdelacoloniaaprobaryelpasoinicialde 95°C/98°Cserealizódurante5minutosparafavorecerlaroturadelapared celular. ExisteademásotrousodePCRscreening,idénticoenmetodologíaal apartadoa),enlaseleccióndelíneasKOhomocigotas(genotipado)como pasoprevioalatransformacióngénicadeA.thaliana(MaterialesyMétodos, 2.1.8.4.1). d)Análisisdeexpresióngénica.‐ enestetipodereacción,deidéntica metodologíaalapartadoa),loscDNAsusadoscomomoldefueronobtenidosa partirdelasestirpestransformantesdelevadura(MaterialesyMétodos, 2.1.9.1.1a)ydelasplantastransgénicasT2deArabidopsis(Materialesy Métodos,2.1.9.2.2).Lasparejasdeoligonucleótidosespecíficosusados estabandiseñadosapartirdelaregióncodificantedecadagen.Enestecaso, lafinalidadfuedeterminarcualitativamentelaexpresiónonodelosgenesa estudio. 2.1.3.2AmplificaciónrápidadelosextremosdelcDNA(RACE) SegúnelextremodeloscDNAsquesequisoamplificar,sellevaronacabo distintosmétodos: a) Extremo3´.‐ Paralaamplificacióndeesteextremoseutilizóelkitde optimizacióndePCR(Invitrogen,EEUU),medianteelusodeun oligonucleótidointernodelfragmentoobtenidoconlosoligosdegeneradosy otrodiseñadoapartirdelacoladepoliadeninadelmRNA(FA2Z)(ApéndiceI). Elprocedimientoseguidofueeldescritoparaelusodeestekit. b) Extremo5´.‐ParalaamplificacióndeesteextremoseutilizóelSmartTM‐RACE cDNAamplificationkit(Clontech,Japón).Traslasíntesisdelaprimeracadena decDNAserealizóunareaccióndePCRquecontenía:tampónBDAdvantage
MaterialesyMétodos 109 2PCR(10X),unamezcladedNTPsenunaconcentraciónfinalde0,2mMpara cadauno,1µLdeBDAdvantage2PolimerasaMix(50X)y5µLdelamezcla deloligonucleótidouniversal(UPM,UniversalPrimerMix)(10X)(ApéndiceI), suministradotodoelloporelkit.Aestamezclaseañadióunoligonucleótido reversoespecíficomásalejadodelextremo5´aunaconcentraciónfinalde 0,2µM.LascondicionesdePCRvariaronconrespectoalasestándar (MaterialesyMétodos,2.1.3.1a)yconsistieronen25ciclosconunprimer pasodedesnaturalizacióna94°Cdurante30s,unaetapadealineamientoa 68°Cdurante30syunaúltimaetapadeextensióna72°Cdurante3min.Con elproductodeestareacciónserealizóunasegundaPCRde20ciclos utilizandolascondicionesanteriores,peroenlaquelosoligonucleótidos utilizadosfueronNUP(NestedUniversalPrimer)(10X)(ApéndiceI),delpropio kit,yunsegundooligonucleótidoreversoespecífico.Posteriormente,aeste productoselerealizóunanuevaPCRconunterceroligonucleótidoespecífico yNUP,siguiendolasmismascondicionesqueenlasegundareacción. 2.1.3.4AnálisisdeexpresióngénicamediantePCRcuantitativa 2.1.3.4.1Basesteóricas Mediantelacombinacióndetécnicasdefluorescenciaylacapacidadde detección,laPCRcuantitativaatiemporeal(qRT‐PCR)permitemonitorizarel procesodereacciónsiguiendosudesarrollocicloaciclo(Heidetal.,1996;Bustin, 2002). EnelprocesodelareaccióndePCRsepuedendistinguirdosfasesbien diferenciadas:unaprimerafase,dondetienelugarunincrementoexponencialde lasmoléculasdeDNA,enlaqueunamayorcantidaddeDNAdepartidaimplica mayorproductodereacción,yunasegundafase,enlaquelareacciónalcanza unafaseestacionariadondeloscomponentesdelamezcladereacción comienzanaserlimitantes,losinhibidoresdelareacciónseacumulanyla polimerasapierdeactividad.
MaterialesyMétodos 110 Fluorescencia(ΔRn) 10.000 20.000 30.000 246810 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40 Ciclos Ct línea base 10.000 20.000 30.000 246810 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40 10.000 20.000 30.000 246810 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40 Ct Elincrementoenlaemisióndefluorescencia(ΔRn)quetienelugarduranteel transcursodelareacciónestádirectamenterelacionadoconelincrementoenla amplificacióndelasecuenciadiana.Cuandoesteincrementoesexpresadofrente alnúmerodeciclosseobtieneunacurvadeamplificación(Figura16).El parámetroCt(cicloumbral)sedefinecomoelcicloenelcuallaseñalde fluorescenciacruzaelumbralsuperandolalíneabase.Enestepuntoenelcualla curvadefluorescenciacruzaelumbral,lareacciónseencuentraenfase exponencial,existiendorelaciónlinealentreellogaritmodecambiode fluorescenciayelnúmerodeciclos.CuantomayoreslacantidaddeDNAmolde departida,menosciclossonnecesariosparaqueelproductodereacciónse acumuleypuedaserdetectadoy,portanto,másrápidosealcanzaelCt.ElCt permitecuantificarelDNApresenteenlamuestrayasí,laexpresióndelgen. ComométododegeneracióndefluorescenciaseempleóSYBR®Green(Qiagen, Alemania),cuyafluorescenciaseveincrementadacuandoseunealsurcomenor delDNAdedoblecadenageneradoenlaPCR.Ladiscriminaciónentreproductos específicosynoespecíficosselogramediantelarepresentacióndela fluorescenciacomounafuncióndelatemperatura,generandounacurvade desnaturalización(meltingcurve)paracadaproductodeamplificación.Así,cada productoposeeunpicodedesnaturalización(meltingpeak)característicoen funcióndesucomposiciónnucleotídica,quepermitedistinguirlodeposibles artefactosgeneradosdurantelaamplificación. Figura 16.CurvadeamplificacióndelaqRT‐PCR.
MaterialesyMétodos 111 ParalacuantificacióndelproductodePCR,laseñaldefluorescencia,medida duranteeltranscursodelareacción,esdigitalizadaytransformadaenunvalor numéricoquecorrespondealvalordeCtparacadaunodelosproductos amplificados. 2.1.3.4.2Aplicacióntécnica ElmRNAaisladodelasmuestrasdematerialvegetal(MaterialesyMétodos, 2.1.1.3.2)fueretrotranscritoacDNA(MaterialesyMétodos,2.1.1.3.3).Éste últimofuecuantificadosegúnelprocedimientopreviamentedescrito(Materiales yMétodos,2.1.2)yseutilizódemoldeparalarealizacióndePCRcuantitativas. Elestudiodelaexpresióndecadaunodelosgenesfuerealizadomediantela amplificacióndeunaregiónconcretadelosmismos,deunas100pb,medianteel diseñoyusodeoligonucleótidosespecíficos(ApéndiceI). ComoreactivoparalaemisióndefluorescenciaseempleóSYBR®Green(Qiagen, Alemania).Lasreaccionesdeamplificaciónatiemporealserealizaronenun volumenfinalde25µL,conteniendo:12μLdeQuantiTectSYBR®GreenPCR Mastermix(2x),con2,5mMdeMgCl2,0,3μMdecadaoligonucleótido,2μLde cDNAyagualibredeRNasa.Lasreacciones,incluyendoloscontrolesnegativos, sellevaronacaboportriplicadoenplacasdepolipropilenode48pocillos (Stratagene®,Alemania)cubiertascontiras“Opticalcap”(Stratagene®,Alemania). ParallevaracabolasreaccionesdeamplificaciónseutilizóelsistemaMJMini PersonalThermalCycler(Bio‐Rad,EEUU)acopladoauncabezalMiniOpticon RealTimePCRSystem(Bio‐Rad,EEUU),mediantesoftwareespecífico, monitorizandoasílareacciónatiemporeal.Elprogramaseguidoconsistióenuna incubacióninicialdelamezcladereaccióna50°Cdurante2min,seguidadeuna etapadeactivacióndelaenzimayprimeradesnaturalizacióna95°Cdurante15 min.Posteriormente,seefectuaron40ciclosqueconsistíanenunaprimera etapadedesnaturalizacióna94°Cdurante15s,unafasedealineamientode oligonucleótidosde30sa62°C,yunaetapadeextensióna72°Cde15s. Finalmente,traslos40ciclos,lamezclasesometióaunacurvade
MaterialesyMétodos 112 desnaturalizaciónquecomenzabaa70°Cyterminabaa90°C,conunincremento de0,2°C/s,enlosqueseprodujounaextensiónfinaldelosfragmentos obtenidos.Latemperaturadealineamientosemodificóligeramentehasta encontrarelpuntoóptimoparacadareacción. Trasfinalizarlasreaccionessecomprobólaausenciadedímerosde oligonucleótidosmedianteelanálisisdelascurvasdedisociación.Esteanálisis consistióenunaprimeraetapadedesnaturalizacióndurante1mina95°C, seguidadeunaetapadehibridacióna55°Cyotradeunincrementode temperaturade0,2°C/shasta95°C.Además,sepudoconstatarlaespecificidad deproductosdePCRobtenidosmedianteelectroforesisengeldeagarosaal2% (MaterialesyMétodos,2.1.4.1). 2.1.3.4.2Eficienciadeamplificación Paradeterminarlaeficienciadeamplificacióndecadaparejadeoligonucleótidos serealizóunacurvaestándarportriplicado,preparandodilucionesseriadasde lasmuestrasdecDNA(1:2,1:5,1:10,1:20,1:40,1:80,1:160y1:320)y representandolosvaloresdeCtfrenteallogaritmodelasdiferentesdiluciones decDNA.Entodosloscasos,elvalordelapendientedelarectaestaba comprendidoentre‐3,1y‐3,6,loquesignificabaquelareacciónteníauna eficienciadeamplificación(E=[10(‐1/pendiente)]‐1)de90‐110%.Asimismo,el coeficientederegresiónobtenidoera≥0,985,locualindicabaquelas condicionesdelensayoeranaceptablesencuantoaprecisión,reproducibilidady sensibilidad. 2.1.3.4.3CuantificacióndelosproductosdePCR Lacuantificacióndelnúmerodecopiasdelostranscritosgénicossellevóacabo mediantecuantificaciónabsoluta,enlaquelosvaloresdeCtdeterminanel númerodecopiasdelostranscritosdelosgenesenestudio,trasrelacionarla señaldePCRconunacurvadecalibración(Bustin,2000).Lascurvasde calibraciónserealizarondeterminandolasCtdediferentesdilucionesde concentraciónconocida,utilizándosecomomoldeconstruccionesdelplásmido
MaterialesyMétodos 113 pMBL‐Tqueconteníanelgenaestudio.Lasrectasdecalibraciónserealizaron conociendoelnúmerodecopiasdemoléculasdeplásmido/µlDNAysuCt. Finalmente,losresultadosobtenidosseexpresaroncomolamedia±SD. 2.1.4Separaciónypurificacióndeácidosnucleicos 2.1.4.1ElectroforesisdeDNAengeldeagarosa LaseparacióndelosfragmentosdeDNAsellevóacabomedianteelectroforesis engeldeagarosa,segúnSambrooketal.(1989).ElgelsepreparaentampónTAE (MaterialyMétodos,1.7.1.1).Laconcentracióndeagarosa(p/v)enlosgeles puedevariarentre0,8%,paralaseparacióndebandasdetamañosmayoreso igualesa1kb,y2%,parabandasdepequeñotamaño.Antesdesersometidasa electroforesis,lasmuestrassesuplementancon1/6delvolumendetampónde carga6x(sacarosa40%(p/v),0,1MEDTAyazuldebromofenol0,25%(p/v)) (Fermentas,EEUU).ParadeterminareltamañodelosfragmentosdeDNAse emplearonlosmarcadoresdepesomolecular:GeneRulerTM1kbDNALadder,y MassRulerTMDNALadderMix(Fermentas,EEUU).Laselectroforesissellevarona caboenunacubetahorizontalalimentadaporlafuentePowerPac(Bio‐Rad, EEUU),aplicandodiferenciasdepotencialentre80y120V. ParaladeteccióndelDNAenlosgelesysuvisualización,seañadierondurantela preparacióndelgel0,5ng/mLdebromurodeetidio(Sigma‐Aldrich,EEUU).La visualizacióndelosgelesyelalmacenamientodelasimágenesserealizó medianteuntransiluminadordeluzultravioletaChemiGenius2(Syngene,Reino Unido),elcualincluyeunacámaraFIREWIRECCDdealtaresolución,yestá acopladoaunordenadorpersonalqueincluyeelsoftwareGeneSnap(Syngene, ReinoUnido).
Resultados 216 Asípues,todosestosdatosnospermitieronobtenerunaaproximaciónmás exactadeladistribucióndelavariable“contenidodeesteárico(E)”enlas poblacionesanalizadas. 3.1.2ContenidodeEOE Paralavariable“contenidodeEOE”secreónuevamenteunatablade distribucióndefrecuencias(MaterialesyMétodos,2.4.1),lacualresumela contribucióndelassemillasanalizadasadichavariable,generacióntras generación(Tabla27). GeneraciónM2:Prácticamenteel100%delcontenidodeEOEacumulado pertenecienteaestageneracióninicialsecorrespondeconlasumadelas frecuenciashalladasenlasdosprimerasdelasseisclasesestablecidasparaesta variable[0‐8].Enconcreto,laclase1[0‐4]aportaun59%deltotalalencontrarse enella1109semillasdelas1869acumuladasenestosintervalos,loquela convierteenlaclasemásfrecuente,nosóloaestenivel,sinotambiéndel cómputoglobal,contribuyendoconun57%deltotalanalizado.Laclase2[4‐8], porsuparte,aportaalgomásdeun40%altotalpertenecientealintervalo[0‐8], hallándoseenésta760semillas.Laclase3[8‐12]aglutinatansólo67delas semillasanalizadas,loquesuponeaproximadamenteun3%deltotalanalizado, mientrasquelaaportacióndelaclase4[12‐16]noalcanzael1%deltotal,con tansólo2semillas.Asípues,lasumadelosporcentajesdeestasdosúltimas clasescoincideconelporcentajedesemillasanalizadasquecumplieronel criteriodeselecciónestablecidoparaestavariable(EOE≥8),yaquelasclases5y 6[16‐24],alnoreunirningunadelasfrecuenciasanalizadas,notuvieron aportaciónalguna.
Resultados 217 GENERACIÓNCLASELILSFAFAAFRFRA M2 104110911090,570,57 24876018690,390,96 38126719360,031,00 41216219380,001,00 51620019380,001,00 62024019380,001,00 M3 10427270,140,14 24860870,310,44 3812851720,430,88 41216221940,110,99 5162021960,011,00 6202401960,001,00 M4 104880,080,08 24845530,430,51 3812481010,460,97 4121631040,031,00 5162001040,001,00 6202401040,001,00 M5 104000,000,00 24846460,630,63 381223690,320,95 412162710,030,97 516201720,010,99 620241730,011,00 Tabla27.Distribucióndefrecuenciasdelavariable“contenidodeEOE”enlasdistintas generacionespoblacionales(M2‐M5).Lasfrecuenciassedividieronenclasesointervalos, consuscorrespondienteslímiteinferior(LI)ylímitesuperior(LS).FA:frecuenciaabsoluta| FAA:frecuenciaabsolutaacumulada|FR:frecuenciarelativa|FRA:frecuenciarelativa acumulada.
Resultados 218 GeneraciónM3:Ladistribucióndelasfrecuenciasenestageneración,a diferenciadelaanterior,fueligeramentemásdispersa.Enestaocasión,casila mitaddelcontenidodeEOEacumulado(44%)sedebióalasumadelas frecuenciashalladasenlasdosprimerasclases[0‐8],siendolaclase2[4‐8]laque mayoraportaciónhizoadichointervalo,conunas60semillasdelas87 acumuladas(69%).Noobstante,laclasemásfrecuenteenestapoblaciónfuela3 [8‐12],contribuyendoconun43%altotalanalizado.Laclase4[12‐16]volvióa acumularfrecuencias,estavezcon22delassemillasanalizadas,loquesupone un11%deltotalanalizado.Laclase5[16‐20],adiferenciadelaclase6[16‐24],sí obtuvorepresentaciónenestageneración,aportando2semillasalcómputo global,loquesuponeaproximadamenteun1%deltotalacumulado.Deeste modo,elporcentajedesemillasquecumplieronelcriteriodeselección(EOE≥8) coincidióconlasumadelosporcentajesobtenidosenlasclases3,4y5,loque suponemásdelamitaddelassemillasanalizadas,concretamenteun55%. GeneraciónM4:Enestecaso,lamitaddelcontenidodeEOEacumuladodeesta generaciónsecorrespondeconlasumadelasfrecuenciashalladasenlasdos primerasclases[0‐8],un7%másdelobservadoenlageneraciónanterior.De nuevo,laclasequemayoraportaciónhizoaesteintervalofuela2[4‐8],conunas 45semillasdelas53acumuladas(85%).Laclase3[8‐12],con48semillasdel totalanalizadovuelveaconvertirseenlaclasemásfrecuentedelapoblación (46%).Laclase4[12‐16]volvióaacumularfrecuencias,sibiensuaportaciónal cómputoglobaldisminuyóhastael3%;lasclases5y6[16‐24]noacumularon frecuenciasenestaocasión.Finalmente,elporcentajedesemillasque cumplieronelcriteriodeselección(EOE≥8)paraestageneraciónsecorrespondió conlasumadelosporcentajesobtenidosenlasclases3y4,un49%deltotal analizado,nuevamentealrededordelamitaddelassemillasanalizadas. GeneraciónM5:Enestageneración,laaportacióndelaclase1[0‐4]alcontenido deEOEacumuladoesnula.Estavez,laclase2[4‐8]aparececomolaclasemás frecuentedelapoblación,conunas46semillasdelas73analizadas(63%).La clase3[8‐12],porsuparte,supusoun32%deltotalanalizado,mientrasquela clase4seviorepresentadaenun3%.Lasclases5y6[16‐24]acumularontan sólo1semillacadauna,loquesuponeunescaso2%deltotalacumulado.El porcentajedesemillasquecumplieronelcriteriodeselección(EOE≥8)enesta
Resultados 219 generaciónfuedel37%analizado(27semillas),frutodelasumadefrecuencias observadasenlasclases3,4,5y6. Engeneral,elaltoporcentajedelcontenidoEOEacumuladoenlaclase1[0‐4]de lageneracióninicialM2severeducidodrásticamenteenfavordelrestodeclases alolargodelassiguientesgeneraciones.Lasclases2y3[4‐12]tiendena acumularelmayorporcentajedefrecuencias,llegandoasuponermásdel75%en lageneraciónM3ymásdel90%enM4yM5.Noobstante,elrepartodeestas frecuenciasvarióenfuncióndelageneración,demaneraquelaclase3enM3 comenzósiendosuperioryterminósiendosuperadaporlaclase2,lacualllegóa representarhastaun63%deltotalacumuladoenM5.Lasclases4y5[16‐20],por suparte,apenasquedanrepresentadas,apesardelbuendatoobtenidoparala primeraenM3(11%),mientrasquelaclase6[20‐24]apareceexclusivamenteen laúltimageneraciónanalizada. Estamismaevoluciónsepuedeconstatargráficamentealcompararlos histogramasygráficosdesectoresgeneradosapartirdedichatablaparacada generación(Figura50).Enellosquedapatenteelfenómenodecribaalquese sometióalasdiferentespoblacionesgeneracionalesbajoelcriteriodeselección correspondiente(EOE≥8). Figura50.Distribuciónentérminosabsolutosyporcentuales delavariable“contenidode EOE”enlasdistintasgeneracionespoblacionales(M2‐M5).Lalínearojadiscontinuapresente enloshistogramasdelimitaelcriteriodeselecciónestablecidoparadichavariable(EOE≥8).
Resultados 220
Resultados 221 Acontinuaciónseextrajeronycalcularonlosestadísticosdescriptivos(Materiales yMétodos,2.4.1.1y2.4.1.2).EnlaTabla28seresumenlosestadísticosde posiciónydispersiónrelativosalcontenidodeEOEobservadoencadaunadelas poblacionesestudiadas,antes(P)ydespués(S)deaplicarelcriteriodeselección establecidoparaestavariable(EOE≥8).Posteriormente,seevaluarálaformayel tipodedistribuciónenbasealapoblacióninicialM2. Apartirdelasmedidasresumenrecogidasenlatablaanterior,seobservólo siguiente: GeneraciónM2:ElcontenidomediodeEOEdelapoblacióninicialanalizada pertenecienteaestageneración,conuntamañomuestralde1938semillas,fue del3,77±2,11%.SibienseobservaroncontenidosdeEOEentre0,00y12,24%,la mayoríadeéstossesituóentre1,09y6,51%,conun10%delosvalores inferioresal1,09%(P10)yun10%mayoresal6,51%(P90).Estamisma poblaciónsecaracterizóporposeerunaaltavariaciónrelativaparaestavariable, comoponeenevidenciaelaltocoeficientedevariación.Unavezaplicadoel criteriodeselección(EOE≥8),lapoblaciónquecumplíadichocriterioseredujoa 69semillas,un3,5%delapoblacióninicial.ElcontenidomediodeEOEaumentó hastael9,23±1,06%,convaloresmínimosymáximosde8,00y12,24%, Estadísticosdescriptivos Medidasdeposición Medidasdedispersión nMediaMedianaP10P90SDMinMaxRangoVarianzaCV M2P19383,77 3,631,09 6,51 2,11 0,00 12,24 12,244,440,56 S699,23 8,948,17 10,84 1,06 8,00 12,24 4,241,130,12 M3P1968,31 8,383,39 12,35 3,59 0,27 16,83 16,5612,890,43 S10910,86 10,668,38 13,96 1,95 8,09 16,83 8,733,800,18 M4P1047,68 7,834,72 10,71 2,51 0,53 13,81 13,286,300,33 S519,60 9,218,22 11,00 1,33 8,08 13,81 5,721,770,14 M5P738,13 7,516,46 9,62 2,35 5,67 20,86 15,195,500,29 S2710,05 8,858,29 13,61 2,94 8,08 20,86 12,788,620,29 Tabla28.Estadísticosdescriptivosrelativosalavariable“contenidodeEOE”enlasdistintas generacionespoblacionales(M2‐M5).Lasgeneracionessedividieronenpoblacionesantes(P) ydespués(S)deaplicarelcriteriodeselección(EOE≥8).CV:coeficientedevariación|Max: valormáximo|Min:valormínimo|n:tamañomuestral|P10:percentil10|P90:percentil 90|SD:desviaciónestándar.
Resultados 222 respectivamente,situándoselamayoríaentre8,17y10,84%.Lavariación relativadeestapoblaciónsevioreducidaconsiderablemente. GeneraciónM3:ElcontenidomediodeEOEdelapoblaciónanalizada pertenecienteaestageneración,conuntamañomuestralde196semillas,fue del8,31±3,59%.SibienseobservaroncontenidosdeEOEentre0,27y16,83%,la mayoríadeéstossesituóentre3,39y12,35%,conun10%delosvalores inferioresal3,39%(P10)yun10%mayoresal12,35%(P90).Estamisma poblaciónsecaracterizónuevamenteporposeerunaaltavariaciónrelativapara estavariable.Unavezaplicadoelcriteriodeselección(EOE≥8),lapoblaciónque cumplíadichocriterioseredujoa109semillas,un55,6%delapoblacióntotal.El contenidomediodeEOEaumentóhastael10,86±1,95%,convaloresmínimosy máximosde8,09y16,83%,respectivamente,situándoselamayoríaentre8,38y 13,96%.Lavariaciónrelativadeestapoblaciónsevioreducidanuevamente. GeneraciónM4:ElcontenidomediodeEOEdelapoblaciónanalizada pertenecienteaestageneración,conuntamañomuestralde104semillas,fue del7,68±2,51%.SibienseobservaroncontenidosdeEOEentre0,53y13,81%,la mayoríadeéstossesituóentre4,72y10,71%,conun10%delosvalores inferioresal4,72%(P10)yun10%mayoresal10,71%(P90).Estamisma poblaciónsecaracterizóporposeeraúnunaaltavariaciónrelativaparaesta variable.Unavezaplicadoelcriteriodeselección(EOE≥8),lapoblaciónque cumplíadichocriterioseredujoa51semillas,un49,0%delapoblacióntotal.El contenidomediodeEOEaumentóhastael9,60±1,33%,convaloresmínimosy máximosde8,08y13,81%,respectivamente,situándoselamayoríaentre8,22y 11,00%.Lavariaciónrelativadeestapoblaciónfuemenorquelaanterior. GeneraciónM5:ElcontenidomediodeEOEdelapoblaciónanalizada pertenecienteaestageneración,conuntamañomuestralde73semillas,fuedel 8,13±2,35%.SibienseobservaroncontenidosdeEOEentre5,67y20,86%,la mayoríadeéstossesituóentre6,46y9,62%,conun10%delosvalores inferioresal6,46%(P10)yun10%mayoresal9,62%(P90).Estamisma poblaciónsecaracterizónuevamenteporposeerunaaltavariaciónrelativapara estavariable.Unavezaplicadoelcriteriodeselección(EOE≥8),lapoblaciónque
Resultados 223 cumplíadichocriterioseredujoa27semillas,un36,9%delapoblacióntotal.El contenidomediodeEOEaumentóhastael10,05±2,94%,convaloresmínimosy máximosde8,08y20,86%,respectivamente,situándoselamayoríaentre8,29y 13,61%.Lavariaciónrelativadeestapoblaciónfueigualquelaanterior. Encuantoalaevolucióndelasmedidasresumenalolargodelasgeneraciones, sepudodeterminarque: Tamañomuestral(n):eltamañomuestraldelapoblacióninicialpertenecientea lageneraciónM2sevioreducidoun96%trasaplicarelcriteriodeselección.A partirdelasiguientegeneración(M3),elporcentajedesemillascribadassuperó el50%conrespectoaltotalanalizadoporgeneración,conexcepcióndelaúltima generación(M5),cuyaporcióncribadasupusoun37%desupoblacióndeorigen. Media±SD:elcontenidodeEOEmedioenlageneracióninicialM2pasódeun 3.77%presenteenlapoblaciónorigen(P)aun9.23%trasaplicarelcriteriode selección(S),locualsuponeundiferencialaproximadode5.5%.Apartirdela generaciónM3,lasmediasestimadasdelaspoblacionescribadas(S)se mantuvieronentornoalos2puntosporencimadelasmediasestimadasparalas poblacionesdeorigen(P),sinunatendenciadeterminada,conpequeñas fluctuaciones.LasdesviacionesestándarparacadapoblaciónS,porsuparte,se mantuvieronsiempreinferioresalasdelaspoblacionesdelasqueprocedían, salvoenlageneraciónM5,dondefueligeramentesuperior. Mediana:lamedianacalculadaenlageneracióninicialM2pasódeun3.63% presenteenlapoblaciónorigen(P)aun8.94%traslaaplicacióndelcriteriode selección(S),locualsuponeundiferencialaproximadode5.3%.Apartirdela generaciónM3,elcomportamientoobservadofuemuysimilaralanalizado anteriormenteparalasmediaspoblacionales. Percentiles10/90(P10/P90):losvaloresP10alcanzadosencadageneración previoalaaplicacióndelcriteriodeselección(EOE≥8)fueronaumentando progresivamente,detectándoseunimportantesaltocuantitativoentrelas generacionesM2yM3,ysiemprefueronmenoresalosalcanzadosporlas
Resultados 224 poblacionescribadas(S)encadageneración.Porelcontrario,losvaloresP90 tantoenlaspoblacionesdeorigen(P)comoenlaspoblacionescribadas(S), aumentaroninicialmenteparaposteriormenteirdisminuyendoencada generación,conlaexcepcióndelapoblacióncribada(S)pertenecienteala generaciónM5queaumentó.Teniendoencuentaambasmedidasseobservó cómolosdatosrelativosaestavariablesefueronconcentrandoalolargodelas generaciones. Valoresmáximo(Max)ymínimo(Min):losvaloresmáximosalcanzadosenestas poblacionesoscilanentrelos12.24%registradosenlageneraciónM2ylos 20.86%delageneraciónM5,loquenospermitecalcularun diferencial/incrementodel8.62%enelcontenidodeEOE,sibienlaevoluciónno essiemprealalza,convaloresparaelrestodegeneracionesde16.83%(M3)y 13.81%(M4).Elvalormínimoalcanzadoencadageneracióndelaspoblaciones origen(P)vaaumentandoprogresivamente,detectándoseunimportantesalto cuantitativoentrelasgeneracionesM4yM5;losvaloresmínimosparatodaslas poblacionescribadas(S),comocabríaesperar,sesituaronentornoal8%, superandoasíelvalorestablecidoenlapropiacriba(EOE≥8). AmplitudoRango:elrangoobservadoenlassucesivaspoblacionescribadas(S), generacióntrasgeneración,adquirióvaloressiempreinferioresalosobtenidos porsuspoblacionesdeorigen(P). Varianza:Seobservaunaumentoconsiderabledeéstasalpasodelageneración M2alaM3,tantoenlapoblacióndeorigen(P)comoenlacribada(S),seguidode undescensoenlageneraciónM4yunaumentoenlageneraciónM5,paraambas poblaciones.Losvaloresdelavarianzaenlapoblacióncribadafueronsiempre menoresalosdelapoblacióndeorigen,siendoestehechounaconstantealo largodelasgeneraciones,conexcepcióndeloocurridoenlageneraciónM5.Para elestudioenprofundidaddelasvarianzascalculadasserealizaronanálisisde varianzas(ANOVA),paralocualfuenecesarioconocerladistribucióndelas poblaciones.
Resultados 225 CoeficientedeVariación(CV):Alanalizarloscoeficientesdevariación(CV)se observacómolavariacióndelcontenidodeEOEenlaspoblacionesorigen(P)va disminuyendoamedidaqueseobtienennuevasgeneraciones.Noobstante,las variacionesdetectadasenlaspoblacionescribadas(S)fluctúanconstantemente. Losvaloresdelcoeficientedevariaciónenlapoblacióncribadafueronsiempre menoresalosdelapoblacióndeorigen,siendoestehechounaconstantealo largodelasgeneraciones,conexcepcióndelageneraciónM5,enlaqueestos valoresfueroniguales. Enresumen,eltamañomuestralfuedisminuyendoprogresivamenteamedida queseavanzóenelprocesodecribageneracional.Duranteesteproceso,el contenidomediodeEOEfluctuóentornoal9‐10%,condesviacionesestándar (SD)enligeroaumento.Encuantoalasvarianzasycoeficientesdevariación(CV), éstosexperimentaronciertasfluctuacionesamedidaqueseavanzóenla obtencióndenuevasgeneraciones. Finalmente,seevaluólaformaytipodedistribucióncorrespondienteala poblacióninicialM2(MaterialesyMétodos,2.4.1.3).Unaprimeravisióndel histograma(Figura50)yposterioranálisisdelamediaymedianacalculadaspara dichapoblación(Tabla19),convaloresmuysimilaresentornoal3,7%, sugirieronunaciertanormalidadyasimetríadeladistribucióndelosdatos obtenidosparadichapoblación.EltestdeKolmogorov‐Smirnovrecalcóesta apreciaciónrevelandoquelosdatosnoseasemejabanaunadistribuciónnormal (p=0,5).Elcoeficientedeasimetríaestimado,conunvalorde0,56,determinó quelanonormalidadtestadasedebíaaunaasimetríadesplazadahaciala derecha.Porotrolado,elcoeficientedecurtosis,conunvalorde0,39,hizo referenciaaunamayorconcentracióndedatosalrededordelamedia,esdecir, unadistribuciónmásapuntadayconcolasmásanchasquelanormal. Asípues,todosestosdatosnospermitieronobtenerunaaproximaciónmás exactadeladistribucióndelavariable“contenidodeEOE”enlaspoblaciones analizadas.
Resultados 232 mayoríadeéstossesituóentre12,55y20,35%,conun10%delosvalores inferioresal12,55%(P10)yun10%mayoresal20,35%(P90).Estamisma poblaciónsecaracterizónuevamenteporposeerunaaltavariaciónrelativapara estavariable.Unavezaplicadoelcriteriodeselección(SUS≥20),lapoblaciónque cumplíadichocriterioseredujoatansólo8semillas,un10,9%delapoblación total.ElcontenidomediodeSUSaumentóhastael26,41±8,39%,convalores mínimosymáximosde20,36y39,93%,respectivamente,situándoselamayoría enestemismointervalo.Lavariaciónrelativadeestapoblaciónfueligeramente superiorquelaanterior. Encuantoalaevolucióndelasmedidasresumenalolargodelasgeneraciones, sepudodeterminarque: Tamañomuestral(n):eltamañomuestraldelapoblacióninicialpertenecientea lageneraciónM2sevioreducidoun93%trasaplicarelcriteriodeselección.A partirdelasiguientegeneración(M3),elporcentajedesemillascribadassuperó el20%conrespectoaltotalanalizadoporgeneración,conexcepcióndelaúltima generación(M5),cuyaporcióncribadasupusotansóloun11%desupoblaciónde origen. Media±SD:ElcontenidodeSUSmedioenlageneracióninicialM2pasódeun 12.30%presenteenlapoblaciónorigen(P)aun22.73%trasaplicarelcriteriode selección(S),locualsuponeundiferencialaproximadode10.4%.Apartirdela generaciónM3,lasmediasestimadasdelaspoblacionescribadas(S)fueronen continuoaumento,alcanzandolos26.41%enlageneraciónM5.Estamisma evoluciónseobservóalcompararlasmediasestimadasdelaspoblacionesde origen(P),sibienlamediaenlageneraciónM5disminuyócasien2puntosen relaciónalvalordelageneraciónanterior.Lasdesviacionesestándarparacada poblaciónS,porsuparte,semantuvieronsiempreinferioresalasdelas poblacionesdelasqueprocedían,salvoenlageneraciónM5,dondefue notablementesuperior.
Resultados 233 Mediana:lamedianacalculadaenlageneracióninicialM2pasódeun12.13% presenteenlapoblaciónorigen(P)aun21.81%trasaplicarelcriteriode selección(S),locualsuponeundiferencialaproximadode9.7%.Apartirdela generaciónM3,elcomportamientoobservadofuemuysimilaralanalizado anteriormenteparalasmediaspoblacionales,sibienelvalorobservadoenla poblacióncribada(S)enlageneraciónM5fuemenorqueelobservadoenésta mismaenlageneraciónanterior. Percentiles10/90(P10/P90):losvaloresP10alcanzadosencadageneración previoalaaplicacióndelcriteriodeselección(SUS≥20)fueronaumentando progresivamenteysiemprefueronmenoresalosalcanzadosporlaspoblaciones cribadas(S)encadageneración.Igualmente,losvaloresP90tantodelas poblacionesdeorigen(P)comodelaspoblacionescribadas(S)fueron aumentando,sibienelvalorobtenidoenlageneraciónM5delapoblaciónde origendisminuyóconrespectoalaobtenidaenlageneraciónanterior.Teniendo encuentaambasmedidasseobservócómolosdatosrelativosaestavariableen laspoblacionesdeorigen(P)sefuerondesplazandomientrasquelosdatosenlas poblacionescribadas(S)sefuerondispersandoalolargodelasgeneraciones. Valoresmáximo(Max)ymínimo(Min):losvaloresmáximosalcanzadosenestas poblacionesoscilanentrelos33.29%registradosenlageneraciónM3ylos 40.50%delageneraciónM2.Noobstante,enlageneraciónM5seregistróun máximode39.93%,próximoalobservadoenlageneracióninicialM2.Porcontra, elvalormínimoalcanzadoencadageneraciónpreviaalacribavaaumentando progresivamente,detectándoseunimportantesaltocuantitativoentrelas generacionesM4yM5.Losvaloresmínimosparatodaslaspoblacionescribadas (S),comocabríaesperar,sesituaronentornoal20%,superandoasíelvalor establecidoenlapropiaselección(SUS≥20). AmplitudoRango:elrangoobservadoenlassucesivaspoblacionescribadas(S), generacióntrasgeneración,adquirióvaloressiempreinferioresalosobtenidos porsuspoblacionesdeorigen(P).
Resultados 234 Varianza:Seobservaunaumentoconsiderabledeéstasalpasodelageneración M2alaM3,tantoenlapoblacióndeorigen(P)comoenlacribada(S).Apartirde estemomento,lasvarianzasdelaspoblacionesdeorigen(P)experimentaronun descensopaulatino,mientrasquelaspoblacionescribadas(S)vieronaumentada suvarianza,destacandoelincrementodel53%observadoentrelasgeneraciones M4yM5.Losvaloresdelavarianzaenlapoblacióncribadafueronsiempre menoresalosdelapoblacióndeorigen,siendoestehechounaconstantealo largodelasgeneraciones,conexcepcióndeloocurridoenlageneraciónM5.Para elestudioenprofundidaddelasvarianzascalculadasserealizaronanálisisde varianzas(ANOVA),paralocualfuenecesarioconocerladistribucióndelas poblaciones. CoeficientedeVariación(CV):loscoeficientesdevariación(CV)experimentaron lamismatendenciaobservadaalanalizarlasvarianzas,estoes,undescenso paulatinoenlaspoblacionesdeorigen(P)yunaumentogradualenlas poblacionescribadas(S).Losvaloresdelcoeficientedevariaciónenlapoblación cribadafueronsiempremenoresalosdelapoblacióndeorigen,siendoeste hechounaconstantealolargodelasgeneraciones,conexcepcióndela generaciónM5,enlaqueestatendenciaseinvirtió. Enresumen,eltamañomuestralfuedisminuyendoprogresivamenteamedida queseavanzóenelprocesodecribageneracional.Duranteesteproceso,el contenidomediodeSUSsemantuvoentornoal22‐26%,condesviaciones estándar(SD)relativamentebajas.Encuantoalasvarianzasycoeficientesde variación(CV),éstosexperimentaronunaumentoconstanteamedidaquese avanzóenlaobtencióndenuevasgeneraciones. Finalmente,seevaluólaformaytipodedistribucióncorrespondienteala poblacióninicialM2(MaterialesyMétodos,2.4.1.3).Unaprimeravisióndel histograma(Figura51)yposterioranálisisdelamediaymedianacalculadaspara dichapoblación(Tabla21),convaloresmuysimilaresentornoal12,2%, sugirieronunaciertanormalidadysimetríadeladistribucióndelosdatos obtenidosparadichapoblación.Noobstante,eltestdeKolmogorov‐Smirnov revelóquelosdatosnoseasemejabanaunadistribuciónnormal(p=0,5).El
Resultados 235 coeficientedeasimetríaestimado,conunvalorde0,39,determinóquelano normalidadtestadasedebíaaunaasimetríadesplazadahacialaderecha.Por otrolado,elcoeficientedecurtosis,conunvalorde0,61,hizoreferenciaauna mayorconcentracióndedatosalrededordelamedia,esdecir,unadistribución másapuntadayconcolasmásanchasquelanormal. Asípues,todosestosdatosnospermitieronobtenerunaaproximaciónmás exactadeladistribucióndelavariable“contenidodeSUS”enlaspoblaciones analizadas. 3.1.4ValorαSat Paralavariable“valorαSat”secreónuevamenteunatabladedistribuciónde frecuencias(MaterialesyMétodos,2.4.1),lacualresumelacontribucióndelas semillasanalizadasadichavariable,generacióntrasgeneración(Tabla31). GeneraciónM2:El68%delvalorαSatacumuladopertenecienteaesta generacióninicialsecorrespondeconlasumadelasfrecuenciashalladasenlas tresprimerasdelascuatroseisestablecidasparaestavariable[0.0‐0.3].En concreto,laclase1[0.0‐0.1]nollegóaaportarniel1%deltotalalencontrarseen ellatansólo4semillasdelas1328queacumulanestosintervalos.Lasclases2 [0.1‐0.2]y3[0.2‐0.3],porsuparte,aportaronalrededordeun7y93%aeste total,respectivamente.Laclase3[0.2‐0.3],asuvez,seconvierteenlaclasemás frecuentedeltotalanalizado,contribuyendoconun64%,seguidadelaclase4 [20‐30],lacualsupusoun24%deestetotal.Lasclases5[0.4‐0.5]y6[0.5‐0.6] sumaronentrelasdos140delassemillasanalizadas,loquesupuso aproximadamenteun7%deltotalanalizado.Elporcentajedesemillasque cumplieronelcriteriodeselecciónestablecidoparaestavariable(αSat≥0.30) resultódelasumadelosporcentajesdelasclases4,5y6,untotalde31%.
Resultados 236 Tabla31.Distribucióndefrecuenciasdelavariable“valorαSat”enlasdistintas generacionespoblacionales(M2‐M5).Lasfrecuenciassedividieronenclasesointervalos,con suscorrespondienteslímiteinferior(LI)ylímitesuperior(LS).FA:frecuenciaabsoluta|FAA: frecuenciaabsolutaacumulada|FR:frecuenciarelativa|FRA:frecuenciarelativa acumulada. GENERACIÓNCLASELILSFAFAAFRFRA M2 10,00,1440,000,00 20,10,291950,050,05 30,20,3123313280,640,68 40,30,447017980,240,93 50,40,56418620,030,96 60,50,67619380,041,00 M3 10,00,1110,010,01 20,10,249500,250,26 30,20,31351850,690,94 40,30,451900,030,97 50,40,501900,000,97 60,50,661960,031,00 M4 10,00,1000,000,00 20,10,2440,040,04 30,20,383870,800,84 40,30,4131000,130,96 50,40,511010,010,97 60,50,631040,031,00 M5 10,00,1000,000,00 20,10,2330,040,04 30,20,365680,890,93 40,30,43710,040,97 50,40,51720,010,99 60,50,61730,011,00
Resultados 237 GeneraciónM3:Enestaocasión,elvalorαSatacumuladoenlastresprimeras clases[0.0‐0.3]sumóun94%.Concretamente,laclasequemayoraportaciónhizo adichointervalofuelaclase3[0.2‐0.3],conunas135semillasdelas185 acumuladas(73%),seguidadelaclase2[0.1‐0.2]con49semillas(26%)ylaclase 1[0.0‐0.1],contansólo1semilla,menosdel1%deestetotal.Laclase3[0.2‐0.3], porsuparte,volvióaserlaclasemásrepresentadaenlapoblación,conun69% deltotalanalizado.Laclase4[0.3‐0.4]obtuvounescasarepresentaciónenesta generaciónaligualquelaclase6[0.5‐0.6],aportandoun3%cadauna.Laclase5 [0.4‐0.5]noobtuvorepresentaciónalgunaestavez,porloqueelporcentajede semillasquecumplieronelcriteriodeselección(αSat≥0.30)enestageneración secalculósumandolosporcentajesrelativosdelasclases5y6,un6%deltotal analizado. GeneraciónM4:El84%delvalorαSatacumuladodeestageneraciónse correspondeconlasumadelasfrecuenciashalladasenlasclases2y3[0.1‐0.3], yaquenoseobservaronfrecuenciasreferentesalaclase1[0.0‐0.1].Denuevo,la clasequemayoraportaciónhizoaesteintervalofuela3[0.2‐0.3],conunas83 semillasdelas87acumuladas(95%),convirtiéndoseasuvezenlaclasemás representadaenlapoblaciónconun80%deltotalanalizado.Laclase4[0.3‐0.4] volvióaestarrepresentada,estavezaportando13deltotaldesemillas analizadas(13%).Lasclases5[0.4‐0.5]y6[0.5‐0.6],porsuparte,sumaronentre ambas4semillas,loquesecorrespondióconun4%deltotalanalizado.Asípues, elporcentajedesemillasquecumplieronelcriteriodeselección(αSat≥0.30)en estageneraciónfuedel17%,sumadelosporcentajescalculadosdelasclases4,5 y6. GeneraciónM5:Prácticamenteel100%delvalorαSatacumuladoenestaocasión secorrespondeconlasumadelasfrecuenciashalladasenlasclases2y3[0.1‐ 0.3],yaque,aligualqueocurrieseenlageneraciónanterior,laaportacióndela clase1[0.0‐0.1]fuenula.Laclasequemayoraportaciónhizoaesteintervalofue la3[0.2‐0.3],conunas65semillasdelas68acumuladas(96%),convirtiéndosede nuevoenlaclasemásrepresentadaenlapoblaciónconun89%deltotal analizado.Laclase4[0.3‐0.4],porsuparte,acumulótansólo3semillas,loque supusounescaso4%.Lasclases5[0.4‐0.5]y6[0.5‐0.6],con1semillacadauna,
Resultados 238 aportaronel2%restante.Finalmente,elporcentajedesemillasquecumplieron elcriteriodeselección(αSat≥0.30)enestageneraciónfuetansólodel6%del totalanalizado(5semillas),frutodelasumadefrecuenciasobservadasenlas clases4,5y6. Engeneral,elmayorporcentajedevalorαSatacumuladosesituóentornoalas clases3y4[0.2‐0.4]paralasgeneracionesM2,M4yM5yentornoalasclases2y 3[0.1‐0.3]paralageneraciónM3.Noobstante,entodasellas,laclasemás representadafuela3[0.2‐0.3],aumentandosuporcentajealolargodelas generaciones.Elrestodelasclasesquedanensegundoplano,yaquenosuperan el7%observadoenlageneracióninicialM2.Apesardeesto,lasclases5[0.4‐0.5] y6[0.5‐0.6]fueronimportantesdecaraalacriballevadaacaboencada generación. Estamismaevoluciónsepuedeconstatargráficamentealcompararlos histogramasygráficosdesectoresgeneradosapartirdedichatablaparacada generación(Figura52).Enellosquedapatenteelfenómenodecribaalquese sometióalasdiferentespoblacionesgeneracionalesbajoelcriteriodeselección correspondiente(αSat≥0.30). Figura52.Distribuciónentérminosabsolutosyporcentuales delavariable“valorαSat”en lasdistintasgeneracionespoblacionales(M2‐M5).Lalínearojadiscontinuapresenteenlos histogramasdelimitaelcriteriodeselecciónestablecidoparadichavariable(αSat≥0,30).
Resultados 239
Resultados 240 Acontinuaciónseextrajeronycalcularonlosestadísticosdescriptivos(Materiales yMétodos,2.4.1.1y2.4.1.2).EnlaTabla32seresumenlosestadísticosde posiciónydispersiónrelativosalvalorαSatobservadoencadaunadelas poblacionesestudiadas,antes(P)ydespués(S)deaplicarelcriteriodeselección establecidoparaestavariable(αSat≥0,30).Posteriormente,seevaluarálaforma yeltipodedistribuciónenbasealapoblacióninicialM2. Apartirdelasmedidasresumenrecogidasenlatablaanterior,seobservólo siguiente: GeneraciónM2:ElvalormediodeαSatdelapoblacióninicialanalizada pertenecienteaestageneración,conuntamañomuestralde1938semillas,fue de0,29±0,07.SibienseobservaronvaloresdeαSatentre0,10y0,50,lamayoría deéstossesituóentre0,22y0,36,conun10%delosvaloresinferioresa0,22 (P10)yun10%mayoresa0,36(P90).Estamismapoblaciónsecaracterizópor poseerunavariaciónrelativamoderadaparaestavariable,comoponeen evidenciaelcoeficientedevariaciónmedido.Unavezaplicadoelcriteriode selección(αSat≥0,30),lapoblaciónquecumplíadichocriterioseredujoa610 Estadísticosdescriptivos MedidasdeposiciónMedidasdedispersión nMediaMedianaP10P90SDMinMaxRangoVarianzaCV M2P19380,29 0,280,220,36 0,07 0,10 0,50 0,40 0,000,23 S6100,36 0,330,300,50 0,07 0,30 0,50 0,20 0,000,19 M3P1960,23 0,230,180,27 0,06 0,05 0,50 0,45 0,000,27 S110,43 0,500,320,50 0,08 0,32 0,50 0,18 0,010,19 M4P1040,26 0,240,210,32 0,06 0,12 0,50 0,38 0,000,23 S170,36 0,340,300,50 0,07 0,30 0,50 0,20 0,010,20 M5P730,24 0,230,200,26 0,05 0,20 0,50 0,30 0,000,22 S50,40 0,380,300,50 0,09 0,30 0,50 0,20 0,010,23 Tabla32.Estadísticosdescriptivosrelativosalavariable“valorαSat”enlasdistintas generacionespoblacionales(M2‐M5).Lasgeneracionessedividieronenpoblacionesantes(P) ydespués(S)deaplicarelcriteriodeselección(αSat≥0,30).CV:coeficientedevariación| Max:valormáximo|Min:valormínimo|n:tamañomuestral|P10:percentil10|P90: percentil90|SD:desviaciónestándar.
Resultados 241 semillas,un31,4%delapoblacióninicial.ElvalormediodeαSataumentóhasta 0,36±0,07,convaloresmínimosymáximosde0,30y0,50,respectivamente, situándoselamayoríaenestemismointervalo.Lavariaciónrelativadeesta poblaciónsevioreducidaligeramente. GeneraciónM3:ElvalormediodeαSatdelapoblaciónanalizadapertenecientea estageneración,conuntamañomuestralde196semillas,fuede0,23±0,06.Si bienseobservaronvaloresdeαSatentre0,05y0,50,lamayoríadeéstossesituó entre0,18y0,27,conun10%delosvaloresinferioresa0,18(P10)yun10% mayoresa0,27(P90).Estamismapoblaciónsecaracterizóporposeerunaalta variaciónrelativaparaestavariable.Unavezaplicadoelcriteriodeselección (αSat≥0,30),lapoblaciónquecumplíadichocriterioseredujoatansólo11 semillas,un5,6%delapoblacióntotal.ElvalormediodeαSataumentóhasta 0,43±0,08,convaloresmínimosymáximosde0,32y0,50,respectivamente, situándoselamayoríaenestemismointervalo.Lavariaciónrelativadeesta poblaciónsevioreducidanuevamente. GeneraciónM4:ElvalormediodeαSatdelapoblaciónanalizadapertenecientea estageneración,conuntamañomuestralde104semillas,fuede0,26±0,06.Si bienseobservaronvaloresdeαSatentre0,12y0,50,lamayoríadeéstossesituó entre0,21y0,32,conun10%delosvaloresinferioresa0,21(P10)yun10% mayoresa0,32(P90).Estamismapoblaciónsecaracterizóporposeeraúnuna variaciónrelativamoderadaparaestavariable.Unavezaplicadoelcriteriode selección(αSat≥0,30),lapoblaciónquecumplíadichocriterioseredujoa17 semillas,un16,3%delapoblacióntotal.ElvalormediodeαSataumentóhasta 0,36±0,07,convaloresmínimosymáximosde0,30y0,50,respectivamente, situándoselamayoríaenestemismointervalo.Lavariaciónrelativadeesta poblaciónfuemenorquelaanterior. GeneraciónM5:ElvalormediodeαSatdelapoblaciónanalizadapertenecientea estageneración,conuntamañomuestralde73semillas,fuede0,24±0,05.Si bienseobservaronvaloresdeαSatentre0,20y0,50,lamayoríadeéstossesituó entre0,20y0,26,conun10%delosvaloresinferioresa0,20(P10)yun10% mayoresa0,50(P90).Estamismapoblaciónsecaracterizónuevamentepor
Resultados 248 Figura54.Relaciones entrelasvariablesestudiadasenlapoblacióninicialpertenecientea lageneraciónM2medianteAnálisisdeComponentesPrincipales(ACP).CP:Componente Principal. - Existeunaaltacorrelaciónentrelasvariables“contenidodeE”y“EOE”. - Existeunaciertacorrelaciónentrelasdosvariablesanteriormentecitadas ylavariable“contenidodeSUS”. - Existeunalevecorrelaciónentrelasvariables“valorαSat”y“SUS”. - Noexistecorrelaciónalgunaentrelasvariables“valorαSat”y“contenidos deE”y“EOE”.
Resultados 249 Acontinuación,serepresentaronentresdimensioneslasfrecuenciasabsolutas delascuatrovariablesestudiadasdelapoblacióninicialpertenecienteala generaciónM2(MaterialesyMétodos,2.4.2)(Figura55). Finalmente,semuestralatabladefrecuenciasabsolutasyrelativas(%)desólo aquellosdatosquecumplíanalmenosunodeloscriteriosdeselección, estableciéndoserelacionesentrelasdistintasvariablesenlapoblacióninicial pertenecientealageneraciónM2(Tabla26). 3.2.2GeneraciónM3 Aligualqueenelcasoanterior,serepresentaronentresdimensioneslas frecuenciasabsolutasdelascuatrovariablesestudiadas,estavezdelapoblación pertenecientealageneraciónM3(MaterialesyMétodos,2.4.2)(Figura55). Delmismomodo,semuestraenlaTabla26lasfrecuenciasabsolutasyrelativas (%)desóloaquellosdatosquecumplíanalmenosunodeloscriteriosde seleccióndelapoblaciónpertenecientealageneraciónM3. 3.2.3GeneraciónM4 EnlaFigura55serepresentanlasfrecuenciasabsolutasdelascuatrovariables estudiadascorrespondientesalageneraciónM4.Igualmente,enlaTabla26 aparecenlasfrecuenciasabsolutasyrelativas(%)desóloaquellosdatosque cumplíanalmenosunodeloscriteriosdeseleccióndelapoblación pertenecientealageneraciónM4. 3.2.4GeneraciónM5 Aligualqueparalasanterioresgeneraciones,enlaFigura55yTabla35se puedenobservarlasfrecuenciasabsolutasyrelativas(%)desóloaquellosdatos quecumplíanalmenosunodeloscriteriosdeseleccióndelapoblación pertenecientealageneraciónM5.
Resultados 250 Figura55.Distribucióndelasfrecuenciasabsolutasdelas variablesestudiadasenlas poblacionespertenecientesalasgeneracionesM2‐M5.Encadaplanogeneradoseproyectan lasrelaciones“dosados”entrelasfrecuenciasabsolutasdelasvariablesestudiadas.Engris semarcanaquellasfrecuenciasquenocumplieronloscriteriosdeselecciónmarcadospara cadavariableyenazulsemarcanaquéllasquesílohicieron.Lavariable“valorαSat”queda representadaporeltamañodelospuntos. M2M3 M4M5
Resultados 251 EEOESUSαSatE+EOEE+SUSE+αSatEOE+SUSEOE+αSatSUS+αSatTODOS M2 EFA166679886 51357133 FR0.08*0.400.590.52 0.300.210.420.20 EOEFA67695237 5135 3533 FR0.970.03*0.750.53 0.740.50 0.500.48 SUSFA98521289751 71 35 33 FR0.760.400.06*0.750.40 0.55 0.27 0.25 αSatFA8637976103571 35 33 FR0.140.060.160.31*0.050.11 0.05 0.05 M3 EFA151108416 36454 FR0.76*0.710.270.04 0.240.020.030.02 EOEFA108109375 364 44 FR0.990.55*0.340.04 0.330.03 0.030.03 SUSFA4137426365 4 4 FR0.970.880.21*0.140.86 0.12 0.10 0.10 αSatFA65611454 4 FR0.540.450.540.05*0.360.45 0.36 0.36 M4 EFA87512814 206126 FR0.83*0.580.320.16 0.230.070.140.07 EOEFA5151206 206 66 FR1.000.48*0.390.11 0.390.11 0.110.11 SUSFA2820281220 12 6 6 FR1.000.710.26*0.430.71 0.43 0.21 0.21 αSatFA1461217612 6 6 FR0.820.350.700.16*0.350.70 0.35 0.35 M5 EFA712684 7444 FR0.91*0.360.110.05 0.100.050.050.05 EOEFA262775 74 44 FR0.960.34*0.260.18 0.260.15 0.150.15 SUSFA878474 4 4 FR1.000.870.10*0.500.87 0.50 0.50 0.50 αSatFA4545444 4 FR0.801.000.800.06*0.800.80 0.80 0.80 Tabla35.Distribucióndefrecuenciasentre lasvariablesestudiadasenlasdistintas p oblacionesestudiadas ( M 2 ‐M 5 ) .
DISCUSIÓN|253‐288 BLOQUEI:CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARYENZIMÁTICADELAS ACILTRANSFERASASIMPLICADASENLABIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL 255 1.CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARDELASENZIMASIMPLICADAS ENLABIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL: HaLPAATsYHaDAGATs 255 1.1CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNFISICOQUÍMICADEHaLPAATsYHaDAGATs255 1.2ANÁLISISFILOGENÉTICODE HaLPAATsYHaDAGATs256 1.3PREDICCIÓNDEESTRUCTURASDEHaLPAATsYHaDAGATs258 1.4LOCALIZACIÓNSUBCELULARDE HaLPAATsYHaDAGATs266 1.5ESTUDIOCOMPARATIVODEMODELOSTOPOLÓGICOSDE HaLPAATsYHaDAGATs270 1.6ANÁLISISCOMPARATIVODELOSNIVELESDEEXPRESIÓNDEHaLPAATsYHaDAGATs273 2.CARACTERIZACIÓNBIOQUÍMICADELASENZIMASIMPLICADAS ENLABIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL: HaLPAATsYHaDAGATs 277 2.1HaLPAATs277 2.2HaDAGATs280 BLOQUEII:ANÁLISISDETRIACILGLICÉRIDOS(TAGs)ENLÍNEASMUTAGENIZADASDE GIRASOLALTOOLEICOALTOESTEÁRICO(HOHE)YSELECCIÓNDENUEVOSCANDIDATOS 288
Discusión 255 BLOQUEI:CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARYENZIMÁTICADE LASACILTRANSFERASASIMPLICADASENLABIOSÍNTESISDE TRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL 1.CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNMOLECULARDELASENZIMASIMPLICADAS ENLABIOSÍNTESISDETRIACILGLICÉRIDOSENGIRASOL:HaLPAATsYHaDAGATs 1.1CLONACIÓNYCARACTERIZACIÓNFISICOQUÍMICADEHaLPAATsYHaDAGATs DuranteeldesarrollodelapresenteTesisDoctoralsehanclonadodosLPAATde Helianthusannuus,HaLPAAT1[gi|145692846]yHaLPAAT2[gi|156122739],así comotresDAGATs,HaDAGAT1A[gi|188998307],HaDAGAT1B[gi|161334748] yHaDAGAT2[gi|156122741](Resultados,1.1y2.1).Lasclonacionesse realizaronusandocDNAdesemillasdegirasolde15DDF,estadíodondela expresióndeestasaciltransferasasfuemáxima(Resultados,1.3Figura30y2.3 Figural43). MientrasquelasdosisoformasHaLPAATspresentancaracterísticas fisicoquímicassemejantes,lasHaDAGATsdifierenunasdeotras,diferenciándose lasdosisoformasHaDAGAT1sdeHaDAGAT2. HaLPAAT1yHaLPAAT2presentanuntamañode385y382aminoácidos, respectivamente,conpesosmolecularesestimadosentornoa43kDaypuntos isoeléctricosprácticamenteidénticos,delordende10(Resultados,1.2.1,Tabla 17).Estaspropiedadesfisicoquímicasestánenconsonanciaconlashalladaspara lamayoríadeLPATsmicrosomalesdeplantasdescritashastalafecha(Brownet al.1994;Brownetal.1995;Knutzonetal.,1995;Kimetal.,2005;Chenetal., 2012;Arroyo‐Caroetal.,2013). HaDAGAT1AyHaDAGAT1B,porsuparte,presentanuntamañode479y506 aminoácidos,respectivamente,conpesosmolecularesestimadosentornoa56 kDaypuntosisoeléctricosdelordende9.HaDAGAT2,sinembargo,presentaun tamañode336aminoácidos,menorenrelaciónaHaDAGAT1s,conpeso molecularestimadode38.09kDaypuntoisoeléctricode10(Resultados,2.2.1
Discusión 262 Apesardeestasdiferencias,existenresiduosaltamenteconservadosenla mayoríadeDGATsdescritasquesecreenseresencialesparalaactividad catalíticadeéstas(Cao,2011).Porunladoseobservanunresiduodeprolina(P) quesecorresponderíaconP250,P276yP165enHaDAGAT1A,HaDAGAT1By HaDAGAT2,respectivamente,yunresiduodefenilalanina(F)seguidodeun residuodeglicina(G)altamenteconservadoquesecorresponderíaconF345, F371yF239enHaDAGAT1A,HaDAGAT1ByHaDAGAT2(Resultados,2.2.3,Figuras 39y40).Existeademásotroresiduodeprolina(P),conexcepcióndeDGAT2de Ostreococcustauri,quesecorresponderíaconP412,P438yP290en HaDAGAT1A,HaDAGAT1ByHaDAGAT2(Resultados,2.2.3,Figuras39y40). ElalineamientoaminoacídicodeHaDAGAT1sconotrasDGAT1s(Resultados, 2.2.3,Figura39)muestraungrandominioconservadopertenecienteala superfamiliadelasO‐aciltransferasasdeuniónamembrana(MBOAT)delaque formanparte(Casesetal.,1998;Hofmann,2000;Turkishetal.,2005;Wagnery Daum,2005;Yenetal.,2005;Marchler‐Bauereta.,2015).Igualmentese encuentranhastasieteregionesaltamenteconservadas(I‐VII)halladasen diversosorganismos(Cao,2011),delascualesseis,I‐VI,quedanembebidasenel dominioMBOAT(Resultados,2.2.3,Figura39).Encuantoalosmotivos funcionales,quedanperfectamentedefinidosalgunoscomunesaestafamiliay otrosexclusivosdeDGAT(Bouvier‐Navéetal.,2000;Guoetal.,2001;Ilaiyarajaet al.,2008;Yenetal.,2008;Shindouetal.,2009;Turchetto‐Zoletetal.,2011;Liuet al.,2012).Enconcreto,losmotivosRXXXE(I),HXXXD(II)yHXXXXD(IV‐V)estarían implicadosenelsitioactivodelaenzima,mientrasquelosmotivosFYXDWWN (V)yHXXXXRHXXXP(V)loestaríanenlaunióndesustratosacil‐CoAsy DAG/forbol,respectivamente(Resultados,2.2.3,Figura39).Porotrolado,existen datosqueapuntanaquelassecuenciasaminoacídicasKESPLSSDAIFKQSHAGLF(II) ySRLIIEN(III)(Resultados,2.2.3,Figura39),pudierandesempeñarpapelesclaveen launiónaacil‐CoAsysitioactivodelaenzima,respectivamente.Inclusoseha postuladounmecanismodeacciónsimilaralosresiduosdehistidina(H)yácido aspártico(D)encontradosenGPATsyLPATsparalosresiduosdearginina(R)y ácidoglutámico(E)presentesenSRLIIEN(III)(Jakoetal.,2001;Milcampsetal., 2005).
Discusión 263 Destacaasuvezlapresenciadeunacremalleradeleucinaformadapor5 residuosdeleucina(L)consecutivos,separadosentresíporseisaminoácidos (LX6LX6LX6LX6L)(I‐II)(Resultados,2.2.3,Figura39),ademásdemúltiplessitiosde fosforilaciónalolargodelassecuencias,aunquenoestádeltodoclarosiestas regionessonimportantesenlafunción,estructuraoregulacióndeestasenzimas invivo.EstacremalleradeleucinaestápresenteenungrannúmerodeDGAT1s deplantasperonodeanimales(Hobbsetal.,1999;Bouvier‐Navéetal.,2000; Nykiforuketal.,2002;LungyWeselake,2006).Estaregióncoincideademáscon unmotivodeuniónaproteínasimplicadaseneltransporteatravésde membrana,habiéndosepropuestoqueestaregióndelaenzimapodría interaccionarconproteínastransportadorasdesustratosacil‐CoAs(ACBPs,acil‐ CoAsbindingproteins)(Heetal.,2004a).Encuantoalossitiosdefosforilación, éstosestánigualmentepresentesenDGAT1sysondemuyvariadanaturaleza, encontrándosesitiosdelaproteínquinasaC,caseínquinasaIIytirosínquinasa (Hobbetal.,1999;Nykiforuketal.,2002;Heetal.,2004a;Guihéneufetal., 2011),solapandoesteúltimositioconelmotivoFYXDWWN(V)previamente discutidocomosupuestositiodeuniónacil‐CoA.Algunosestudioshanprobadola funcionalidaddeestossitiosmediantesustitucionesaminoacídicas,conla consecuentedisminucióndelaafinidadporsustratos(Guoetal.,2001;Thuilleet al.,2005).Recientemente,Lopesetal.,2014handadounpasomáshaciael entendimientodelasinteraccionesdeestosmotivosconsussupuestossustratos: usandopéptidossintéticoscorrespondientesalossitiosdeunióndeDGAT1shan probadocomounodeellos,aquelqueincluíaelmotivoFYXDWWN,cambiabasu conformaciónenpresenciadeacil‐CoAs,loquesugieresucapacidaddeunióna estossustratos.LaregulacióndelaactividadDGAT1atravésdefosforilaciónes convincentenosóloporserésteunmecanismocomúndecontroldeactividad enzimáticaeneucariotassinotambiénporqueDGATpuede“secuestrar”DAG, unamoléculaimportanteimplicadaencascadasdeseñalizacióndefosforilación (CarrascoyMerida,2007). Porúltimo,seobservaenelextremoN‐terminaldeDGAT1sunclústerde argininasaltamenteconservado(RRR)ylasecuenciaYYHD(L/V)MN(VII)cercana alextremoC‐terminaldelasmismas(Resultados,2.2.3,Figura39),loscuálesserán
Discusión 264 objetodediscusiónmásadelante,debidoasusposiblesimplicacionesenla localizaciónsubcelulardeestasenzimas. ElalineamientoaminoacídicodeHaDAGAT2conotrasDGAT2s(Resultados,2.2.3, Figura40)muestraungrandominioconservadocaracterísticodelafamiliade lisofosfolípidoaciltransferasas(LPLATs)deltipoMGAT,implicadasenla biosíntesisdeglicerofosfolípidos(Yenetal.,2002;Kroonetal.,2006;Lungy Weselake,2006;Marchler‐Bauereta.,2015).Englobadasenestedominiose encuentranhastaseisregionesaltamenteconservadas(I‐VI)(Resultados,2.2.3, Figura40)halladasendiversosorganismos(Stoneetal.,2006;Cao,2011; Turchetto‐Zoletetal.,2011),entredosdelascuales,IyIII,aparecendiversos residuosaminoacídicosqueconformaríanunsupuestobolsillodeuniónaacilos (Cao,2011).Encuantoalosmotivosfuncionales,quedanperfectamente definidosalgunosdeelloscomoFFP,EPHS(I)yRKGFVRLAMETNSPLVPVFGFGQ (IV‐V),implicadosdealgunamaneraenlaactividadenzimáticadeDGAT2s(Liuet al.,2011).Enestecasopocoseconocesobreelpapelespecíficoquepudieran desempeñarestosmotivos.ElmotivoFFPrepresentaunavariacióndela secuenciaconsensoYFP,conservadaenanimales,plantas,algasylevaduras(Cao, 2011;ChenySmith,2012),mientrasquelasecuenciaEPHS(I),conservadaen DGAT2deplantas(Turchetto‐Zoletetal.,2011),equivaldríaalasecuencia consensoHPHGdeDGAT2sdeanimalesyhongos,lacualesreconocidacomo dominiodeuniónalípidoneutro(Stoneetal.,2006).Estosdosmotivosaparecen igualmenteenalgas,peseamostrarciertasvariaciones(ChenySmith,2012). Finalmente,lasecuenciaLQLRIMpresenteenelextremoC‐terminalde HaDAGAT2(Resultados,2.2.3,Figura40),seráobjetodediscusiónmásadelante, debidoasuposibleimplicaciónenlalocalizaciónsubcelulardeestaenzima. Enresumen,yapesardelasdiferenciasanteriormentediscutidas,hoydíase asumequeeldominiocatalíticodeDGATssesitúaenelextremoC‐terminal, mientrasqueeldominioreguladordescansasobreelextremoN‐terminal,elcuál pudieraigualmenteserresponsabledelasdistintasespecificidadesporsustrato deestasenzimasdebidoasufaltadehomologíaentresussecuencias aminoacídicas.
Discusión 265 Porúltimo,comocuriosidad,ningunodelosmotivosoresiduosaltamente conservadosenlasfamiliasDGAT1syDGAT2sestánpresentesenDGAT3sy DGAT4s.Estadivergenciadesecuenciasescontrariaalacreenciageneraldeque lossitiosactivosdelasenzimasquecatalizanlasmismasosimilaresreacciones bioquímicasdeberíanposeerciertogradodeconservacióndurantelaevolución (Cahoonetal.,2007). 1.3.2Estudiocomparativodedominiostransmembrana(TMDs) Losdominiostransmembrana(TMDs)deHaLPAATsyHaDAGATssedeterminaron enbasealosresultadosobtenidosporelprogramabioinformáticodepredicción TMHMM2.0. Deestamanerasepudoestimarlapresenciadealmenostresdominios transmembranaparaambasHaLPAATs(Resultados,1.2.3,Figura28),en consonanciaconLPATsdeE.coli,levadurasyBrassicanapus(Bourgisetal., 1999).Noobstante,otrosprogramasdeprediccióndeTMDsdeterminanhasta cuatrodominiostransmembranaparaHaLPAATs,aligualqueparaLPATs mitocondrialesdehumanos,ovejasyvacas(MistryyMedrano,2002;Yamashita etal.,2007),AtLPAT2yAtLPAT3deA.thaliana(KimyHuang,2004;Kimetal., 2005)ycacahuete(Chenetal.,2012).Porelcontrario,LPATmicrosomaldecoco presentatansólodosdominiostransmembrana(Knutzonetal.,1995),aligual queLPAT3dehumanos(Schmidtetal.,2010),loquehacenecesariorevisary compararconmayorexactitudlosprogramasdeprediccióndeestosdominios. EnelcasodelasHaDAGATs,hubodisparidadenelnúmerodeTMDs. HaDAGAT1Apresentaochodominios,nueveparaHaDAGAT1Bytansólodos paraHaDAGAT2(Resultados,2.2.3Figura41).Estudiosenplantashanmostrado queDGAT1sdeBrassicajuncea(Illaiyarajaetal.,2008),Echium(Manas‐ Fernándezetal.,2009)yHelianthusannuus(Sunetal.,2011)poseennueve dominiostransmembrana,aligualqueDGAT1sdeArabidopsisthaliana,ricino (Ricinuscomunis),soja(Glycinemax)yarroz(Oryzasativa),entreotras (Turchetto‐Zoletetal.,2011).Noobstante,otrosautoreshacenreferenciaadiez deestosdominioscuandoestudianalgunasdelasDGAT1syacitadas,DGAT1del
Discusión 266 árboldetung(Verniciafordii)incluida(Shockeyetal.,2006).DGAT2sdeestas plantas,sinembargo,coincidenenposeertansólodosdominiostransmembrana (Shockeyetal.,2006;Turchetto‐Zoletetal.,2011),aligualqueDGAT2de Brassicajuncea(Illaiyarajaetal.,2008),sibienDga1pdeS.cerevisiaeposee cuatroTMDs(Liuetal.,2011).Engeneral,DGAT1spresentanmayorvariaciónen elnúmerodedominiostransmembrana(6‐10)mientrasqueDGAT2spresentan másconsenso(1‐2)(Liuetal.,2012).Lasdiferenciashalladasenelnúmerode TMDsentreDGAT1syDGAT2sindicaríanasuvezdiferenciasencuantoasus topologíasy,enconsecuencia,condiferentespapelesfisiológicos(Yenetal., 2008;Holmes,2010). 1.4LOCALIZACIÓNSUBCELULARDEHaLPAATsYHaDAGATs Ennuestrotrabajo,lalocalizaciónsubcelulardeHaLPAATsyHaDAGATsse determinóenbasealosresultadosobtenidosporlosprogramasbioinformáticos depredicciónProtComp9.0yWoLFPSORT. Todasestasprediccionescoincidieronenseñalaralasaciltransferasasestudiadas comoproteínasintegralesdemembrana,formandopartedelRE(Resultados, 1.2.3y2.2.3).Además,losaltosporcentajesdehidrofobicidadeinsolubilidad característicosdeestasaciltransferasas(Discusión,1.1),asícomolapresenciade dominiostransmembranas(Discusión,1.3.2)refutanaúnmáslalocalizaciónde estasenzimasendichocompartimento. Porotrolado,aligualquelamayoríadelasaciltransferasasmicrosomales previamenteidentificadas,HaLPAATsyHaDAGATsnopresentanpéptidosseñales detránsitoalretículoendoplásmico(RE),sibienpresentanotrassecuencias relacionadasconesteorgánulo. HaLPAATspresentanunprimerdominiotransmembranalocalizado aproximadamenteenlaposición4‐27desusextremosN‐terminalquepudieran serconsideradossupuestassecuenciashidrofóbicasdeanclajedetipoII (Resultados,1.2.3,Figura28).Estassecuenciasactuaríaninsertandoalasenzimas demaneracotranslacional,ynopost‐translacional,alasmembranasdelRE
Discusión 267 medianteunmecanismodependientedelapartículadereconocimientodeseñal, SRP(McCartneyetal.,2004).Estemecanismodeinserciónpareceocurrir tambiénenloscasosdeFAD2yFAD3,dosenzimaslocalizadasexclusivamenteen elretículoendoplasmático,hechorefutadoatravésdeanálisisbioquímicosy estudiosdeinmunolocalización(DyeryMullen,2001,2008). HaDAGATsnoparecenposeerestassecuenciashidrofóbicasdeanclaje,sibiense asumequesoninsertadasalREtambiénmedianteestemecanismodependiente deSRP.Noobstante,sehapodidoconstatarlapresenciadeciertassecuencias aminoacídicasconservadasensusextremos.Porunlado,seobservalapresencia delyacitadoclústerdeargininasaltamenteconservado(RRR)enlosextremosN‐ terminaldeHaDAGAT1s,posiblementeimplicadonosóloenlalocalización subcelulardeéstasenREsinotambiénensuretenciónendichocompartimento (Michelsenetal.,2005;Boulaflousetal.,2009;Liuetal.,2012).Porotrolado, aparecenensusextremosC‐terminalsecuenciasquepudieranreconocersecomo señalderetornoalRE(McCartneyetal.,2004):YYHDV(L/V)MN(VII)enelcasode HaDAGAT1s(Resultados,2.2.3,Figura39)yLQLRIMenelcasodeHaDAGAT2 (Resultados,2.2.3,Figura40),porhomologíaconlasencontradasenDGAT1y DGAT2deotrasplantas(Kroonetal.,2006;Shockeyetal.,2006).Estas secuenciasderetornonoaparecenconservadasenDGATsdeanimalesyhongos pesealocalizarsetambiénenelRE(Cao,2011). Bajoestossupuestos,HaLPAATsseríaninicialmentedirigidasalretículo endoplasmáticoporinsercióncotranslacionalenlasmembranasdelretículo,sin señalesderetornoalREensuextremoC‐terminalquelodevuelvanaeste orgánulodesdeelaparatodeGolgi.Encambio,HaDAGATsnopresentarían insercióncotranslacionalaparenteperosíseñalesderetornoalREensuextremo C‐terminal.
Discusión 268 1.4.1Localizaciónensubdominiosyrelaciónconotroselementos Engeneral,existennumerosasevidenciasquerelacionanestasenzimasconla fracciónmicrosomal,indicativodesurelaciónconmembranas.Lamayoríade estasevidenciassebasanenelusodeestetipodefraccionesenensayosde actividadinvitro.Igualmente,lainmunolocalizaciónpermiteconfirmarla asociacióndeestasenzimasalretículoendoplasmático,comoasíocurrieseen algunoscasosdeLPATsdeplantas(Brownetal.,2002;Kimetal.,2005)yDGATs (BrowseandSomerville,1991;Shockeyetal.,2006;Stoneetal.,2006;Hernández etal.,2012). Ennumerososestudios,lalocalizaciónsubcelulardeestasenzimashasidoobjeto dediscrepanciaencuantoasiestáasociadaexclusivamentealretículo endoplasmáticoositambiénloestáacuerposlipídicosuoleosomas(Hsiehy Huang,2004;LungyWeselake,2006;Silotoetal.,2006).Hoydíaexisten evidenciasqueestablecennosólounaasociaciónestrechaentrelabiosíntesisde TAGsylaformacióndecuerposlipídicos(Murphy,2001;Oelkersetal.,2002; Sandageretal.,2002;Czabanyetal.,2008;Guoetal.,2009;Athenstaedty Daum,2011;Wilflingetal.,2013;KlugyDaum,2014;Kochetal.,2014),sino tambiénunalocalizaciónespacio‐temporaldeestasenzimasendiferentes subdominiosespecializadosenestafuncióndentrodelRE(DyeryMullen,2008). Estefenómenodecompartimentaciónesentendidocomounmecanismo adicionalmásadoptadoporlascélulasvegetalesparacontrolarlaproducciónde aceitedeentretodoslosmecanismosdescritoshastalafechaquerelacionan diferentessubdominioscondistintasfuncionesbioquímicasdentrodeeste compartimento(Staehelin,1997;LevineyRabouille,2005).Ejemplosdeesta compartimentaciónlosencontramosenLPATsdeArabidopsis(Kimetal.,2005)y DGATsdeVerniciafordii(Shockeyetal.,2006).Enesteúltimocaso,cabe destacarqueVfDGAT1selocalizaenregionesdistintasaVfDGAT2,loquesugiere queestasdosenzimasproducendiferentespoolsdeTAGsdentrodelRE.Sin embargo,losmecanismosmolecularesqueconducenaestacompartimentación yasociaciónnoseconocenconexactitud.Dehecho,losmotivosderetornoaRE presentesenVfDGTAssonnecesariosysuficientesparasupermanenciaenelRE, peroinsuficientesparalocalizarlasenestossubdominios(McCartneyetal.,2004;
Discusión 269 Shockeyetal.,2006),porloquedebehaberotrasregionesensussecuenciasy/o mecanismosimplicadosparatalfin.Elreclutamientodeotrasproteínas adicionalestalescomooleosinaspudieraaportaresamaquinariaadicionalque permitalaproducciónespecializadadeTAGsasociadaaoleosomas.Enrelacióna esto,sehacomprobadocomolapresenciadetresprolinas(P)conservadasen DGAT2deratónlocalizadasenlapequeñaregiónflanqueadaporlosdos dominiostransmembranacaracterísticosdeestasenzimas,asícomola disposicióndesusextremosN‐yC‐terminalhaciaelladocitoplasmáticodelRE, estánrelacionadosconlaformacióndecuerposlipídicosmediadaporestas proteínas(Stoneetal.,2009).Enplantas,sehaverificadoigualmentela asociacióndirectaentreDGAT1yDGAT2deArabidopsisylaformaciónde oleosomas(Bouvier‐Naveetal.,2000;Kwiatkowskaetal.,2012;Ayméetal., 2014).Otromecanismoporelcualestasenzimassepudieranagruparen regionesespecíficasdelRE,ademásdeserunprerrequisitoparallevaracabosu actividadenzimática,seríasuoligomerizaciónhomotópica.Ejemplosdeestolo encontramosenratón(McFieetal.,2010),humanos(Chengetal.,2001;Yenet al.,2008)yBrassicanapus(Wesealkeetal.,2006;Caldoetal.,2015),cuyas DGAT1spuedenllegaraformarhomodímerosy/ohomotetrámeros.Deeste modo,laoligomerizacióndeDGATsdeplantasestaríatambiénimplicadaenla regulacióndesusactividades,comosedemuestraenlosexperimentosllevadosa caboporMcFieetal.,2010enDGAT1deratón.Porúltimo,elreclutamientode otrasaciltransferasaspudieracontribuiradichacompartimentacióneinclusoala formacióndeheterooligómerosentreéstas,posibilidadqueestásiendo investigadaenlaactualidad.Noobstante,laaparenteincapacidaddeinteractuar entreDGAT1yDGAT2resultaríaensímismounmecanismodesegregación espacialdeestasenzimas,favoreciendoasílaproduccióndelosdiferentespools deTAGscomentadosanteriormente(Thaminyetal.,2004). Finalmente,mencionarquetodosestosmecanismosqueparecenocurriral mismotiempoestánrelacionadosconsecuenciaslocalizadasenelextremoN‐ terminaldeestasenzimas,elcualfuepropuestonosólocomoclaveenla especificidaddesustrato,sinotambiénenlapropiaconformacióny/oregulación desusactividadesenzimáticas(Discusión,1.3.1).
Discusión 270 1.5ESTUDIOCOMPARATIVODEMODELOSTOPOLÓGICOSDEHaLPAATsYHaDAGATs Enesteestudio,sehanpostuladounaseriedemodelostopológicospara HaLPAATsyHaDAGATsbasadosenlarecopilacióndelosdatosobtenidosenlos apartadosanteriores:presenciademotivosconservadosydominios transmembrana(TMDs),asícomolalocalizaciónsubcelulardeestasenzimasen elretículoendoplasmático. Enbaseaesto,losmodelostopológicospropuestosparaambasHaLPAATs presentaríanalmenostresdominiostransmembranas,loquesituaríalos extremosN‐terminalenelladocitosólico,mientrasqueprácticamenteelresto delasenzimassehallaríanenellumendelRE,incluyendolosextremosC‐ terminal.Noobstante,comoyacomentamos,otrosprogramasdepredicciónde TMDsproponenuncuartodominiotransmembranaparalasHaLPAATs, localizadoaproximadamenteenlaposición46‐73conrespectoalextremoN‐ terminalparaHaLPAAT1yenlaposición45‐71paraHaLPAAT2.Deestamanera, lascuatroregionesaltamenteconservadas(I‐IV)consupuestasfunciones catalíticasestaríanexpuestashaciaelcitosol,aligualquelosextremosN‐ yC‐ terminal(Figura58).EstosmodelospropuestosparaHaLPAATscoincidenen númerodeTMDsconlosplanteadosparaLPATsmitocondrialesdehumanos, ovejasyvacas(MistryyMedrano,2002;Yamashitaetal.,2007),asícomoconlos propuestosparaAtLPAT2yAtLPAT3deA.thaliana(KimyHuang,2004;Kimetal., 2005),cacahuete(Chenetal.,2012).Porelcontrario,LPATsdeE.coli,levaduras yBrassicanapuscontendríanalmenostresdeestosdominios(Bourgisetal., 1999;Pagacetal.,2011),mientrasqueLPATdecocotansólotendríados (Knutzonetal.,1995),aligualqueLPAT3dehumanos(Schmidtetal.,2010). EnelcasodelosmodelospropuestosparaHaDAGAT1s,éstosdifieren básicamenteenelnúmerodedominiostransmembrana,ochoparaHaDAGAT1A ynueveparaHaDAGAT1B.Deestamanera,losextremosN‐terminalestarían situadosenelcitosol,aligualqueprácticamenteelrestodelasenzimas,con excepcióndelextremoC‐terminaldeHaDAGAT1B,quesesituaríahaciaellumen delRE;algunasdelassieteregionesaltamenteconservadas(I‐VII)aparecerían solapándoseconalgunosTMDs(Figura58).Estosmodelospropuestospara
Discusión 271 HaDAGAT1sdifierensustancialmentedelospropuestosparaDGAT1sdeVernicia fordii(Shockeyetal.,2006)yderatón(McFieetal.,2010),sibientodos coincidenensituarelextremoN‐terminalhaciaelladocitosólicodelRE,hecho probadoexperimentalmenteenDGAT1deBrassicanapus(Weselakeetal., 2006). Porúltimo,elmodelopropuestoparaHaDAGAT2presentaríadosdominios transmembranasituadosenelextremoN‐terminal,loquesituaríaaambos extremosenelladocitosólicodelRE.Deestamanera,lascuatroregiones altamenteconservadas(I‐IV)consupuestasfuncionescatalíticasestarían igualmenteexpuestashaciaelcitosol(Figura58).Estemodelopropuestopara HaDAGAT2seasemejaalpropuestoparaDGAT2deVerniciafordii(Shockeyet al.,2006).EnelcasodeDGAT2deratón,aúnnosehadeterminadoconexactitud sidichaenzimapresentadosdominiostransmembranaestrechamenteasociados ounasolaregiónhidrofóbicaembebidaenlamembranadelRE(Stoneetal., 2006),mientrasqueelmodelotopológicopropuestoparaDGAT2delevaduras presentaríahastacuatroTMDs(Liuetal.,2011).Noobstante,todoslos anterioresmodelospropuestoscoincidenensituarambosextremosdeDGAT2s haciaelcitosol. Engeneral,laincapacidaddepurificardebidamenteestasenzimas,hecho discutidoaliniciodeDiscusión,1.3,hacequelastécnicasempleadassean insuficientesparadeterminarconexactitudlosmodelostopológicosdeestas enzimasintegralesdemembranay,endefinitiva,elentendimientodesu contextometabólico.
Discusión 278 2.1.1Nivelcantidad 2.1.2Nivelcalidad Encuantoalaespecificidadporsustrato,lasLPAATshanmostradounagran variabilidad(Knutzonetal.,1995;Lassneretal.,1995;Brownetal.,2002a, 2002b).Engeneral,LPAATpresentamayorespecificidadporoleil‐CoAylinoleil‐ CoAynoincorporaAGssaturados;losVLCFAssongeneralmenteexcluidosdela posicióncentralsn‐2(Frentzen,1993;Voelkeretal.,1996).Noobstante,en aquellasespeciesvegetalescuyosaceitesposeenciertascantidadesdeAGs inusualesenlaposiciónsn‐2,existenLPAATsadicionalesconpreferenciapor estossustratos(Caoetal.,1990;LaurentyHuang,1992;Brownetal.,1995; Frentzen,1998). LosestudiospreviosalaislamientodeLPAATsehabíanconcentradoenla purificaciónproteicayenlosensayosenzimáticos.Estoesmuchomásdifícilpara enzimasunidasamembranaporqueimplicalasolubilización,enlacual,la actividadenzimáticapuedeserperdidarápidamente,ylareconstituciónen vesículasdemembranaparaensayarbiológicamentelaactividad.Conla clonaciónporcomplementación,estosobstáculosfueroneliminadosyla actividadpudoserdirectamenteensayadaenlasmembranasdeE.coli,que contienenpocaactividadendógena. LaLPAATdelendospermoinmadurodecoco(Cocosnucífera)fuepurificaday tuvocomosustratosacilosdecadenamedia(Daviesetal.1995).Utilizandolas secuenciasparcialesdeaminoácidosdelaproteínapurificada,seobtuvieronlos clonesdecDNArespectivos(Knutzonetal.1995).Porotrolado,losclonesde cDNAdelaLPAATespecíficade22:1‐CoAdeL.douglasii(Brownetal.1995; Hankeetal.1995)hansidoaisladosmediantecomplementaciónconelmutante deE.coli.
Discusión 279 Losestudiosenzimológicosinicialesconsistieronenladeterminacióndela especificidadporsustratodelaLPAATdemicrosomasdediferentesespeciesde plantas,usandodiferentescombinacionesdedonadoresydeaceptores.Enla mayoríadeloscultivostradicionalesdesemillasoleaginosas,comolassemillas decolza,esteenzimamanifiestaespecificidadesporsustratotípicasdelasLPAAT microsomalesimplicadasenlasíntesisdelípidosdemembrana:preferentemente dirigeinsaturadosC18alaposiciónsn‐2,yexcluyealosácidosgrasosinusuales como22:1y12:0deestaposición(Frentzen,1993;Voelkeretal.1996).Como consecuencia,debidoalaspropiedadesdeestasLPAAT,seprevienelaformación detriacilglicéridosconunacomposiciónhomogéneadeácidosgrasoscomola trierucinaolatrilaurina. Encontrasteconlaenzimadecolza,lasLPAATsmicrosomalesexpresadas específicamenteensemillasdeciertasespeciesdeplantaspuedenincorporarde unamaneraefectivagruposaciloinusualesenlaposiciónsn‐2delTAG.Porlo tanto,losgenesquecodificanparaLPAATsespecíficasdesemillasparecenserlos apropiadosparamejorarlasaplicacionesindustrialesdelaceitedesemillasa partirdecultivosdesemillasoleaginosastradicionalesporingenieríagenética. Porello,variosgrupos,utilizandodiferentesestrategiasymétodos,hanhecho grandesesfuerzosparaclonarlaLPAAT. VariosgruposhanestadointeresadosenclonarlaLPAATdeLimnanthessp.con elpropósitodetransformarlaenB.napus,alterandoasílaproporcióndeácido erúcicoenlaposiciónsn‐2delamoléculadeTAGeincrementandoel rendimientodeácidoerúcico.SehanaisladodoscDNAsdiferentesquecodifican paraLPAATsapartirdeunalibreríadecDNAdeL.douglasii,llamadasLAT1 (Limnanthesaciltransferasa1)yLTA2(Brownetal.1995).ElcDNAdeLAT2fue aisladodemaneraindependienteporHankeetal.(1995)yporLassneretal. (1995).Esteenzimaescapazdeincorporarácidoerúcicoenlaposiciónsn‐2de LPAaaltavelocidad.Brownetal.,2002caracterizaronestasdosLPATs..ElcDNA aisladodecoco(Knutzonetal.1995)tuvounafuertehomologíaconlasecuencia delaLAT2.
Discusión 280 2.2HaDAGATs ParaHaDAGAT1ssehatestadosuactividaddirectaenlaformacióndeTAGsenel casodeexpresiónheterólogaenestirpecuádruplemutanteH1246deS. cerevisiaeysuefectoindirectoenlaformacióndeTAGsenelcasodeexpresión funcionalenlíneamutanteAS11(dgat1)deA.thaliana,quenodejadetener DGAT2funcional,porloqueseríacomplementariedad. ParaHaDAGAT2sehatestadosuactividaddirectaenlaformacióndeTAGsenel casodeexpresiónheterólogaenestirpecuádruplemutanteH1246deS. cerevisiaeysusobreexpresiónenlaformacióndeTAGsenelcasodeexpresión funcionalenlíneamutanteAS11(dgat1)deA.thaliana,quenodejadetener DGAT2funcionalapesardetenermutadaDGAT1. NosedetectaactividadensayadainvitroHaDAGAT2;posiblesrazones: 1. AligualqueocurreconotrasDGAT2s,nosepuededetectarinvitro porquenoseestáexpresandoonoseestáconfigurandobienlaenzima activa.Estopuedeserdebidoaquelaenzimanecesitedeotrasproteínas parallevaracabosuactividad,ACPs,porejemplo.Sinembargo, HaDAGAT2seexpresaenH1246,curvadecrecimientocercanaaWT, aumentanlosTAGsydisminuyenlosDAGsenrelaciónaestirpeH1246 conysinplásmidopYES2vacío(controles)invivo,locualnosllevaauna segundahipótesis. 2. RealmenteHaDAGAT2estáactiva,peronohemosensayadoconlos sustratospertinentesparalosqueHaDAGAT2presentaactividad.DGAT2s deplantaspudierandesempeñarpapelenincorporacióndeAGsinusuales enTAGsenaquellasplantasqueacumulanestetipodeAGsensusTAGsy quepudieraserquegirasolseaunadeestasespecies,acumulando linoleico,50‐70%deltotal.Dehecho,algoasíocurreconVgDGAT2,muy relacionadafilogenéticamenteconHelianthusannuus,perteneciendoa mismafamiliaAsteráceas.
Discusión 281 3. LaactividadDGAT2seestádesviandoacuerposlipídicos,comoyaocurre conDga1p:Dga1pactivityinS.cerevisiaelocalizestotheERandlipid droplets(SorgeryDaum,2002). HaDAGAT2parecejugarpapelimportanteenbiosíntesisdeTAGsengirasol,a raízdeloobservadoalestudiarsuexpresiónensemillasendesarrollo(RT‐PCR,la quemás).Sinembargo,ypeseatenerunaaltaexpresiónyaumentarlatasade crecimientoenS.cerevisiae(curvacrecimiento,laquemáspordebajodeH1246‐ SC‐ALL),nosehanobtenidomedidasdeactividadalguna…Hayqueteneren cuentaquesucurvadepHnoreflejaningúnpHóptimooque,almenos,elpH elegidoparalosensayosdeactividadnolofavorecían.Puedequetambiénsea porquenotieneafinidadalgunaporlossustratosadministrados,dioleínay/o oleico/esteárico…Recordarqueaceitedegirasolnosecaracterizaprecisamente porestaespeciedeTAGyquesuácidograsomásrepresentativoesellinoleico… Igualmenteesimportantelosresultadosobtenidosapartirdelanálisisfuncional detransgénicosA.thaliana. Ennuestroestudio,sehacomprobadoqueHaDAGATstienenactividaden formacióndeTAGsapartirdeDAGsyacil‐CoAscomodonadordeacilos.Hay DGATsquesonmultifuncionales,másquenadaenmicroorganismosy mamíferos,conactividadACATyMGAT..SedescartaactividadMGATalanalizar losDAGs,quedisminuyencuandorealizamosanálisisinvivoynoaumentan comopudieraesperarsedeunasupuestaactividadMGAT.Sedescartatambién actividadACATpuesnoseobservasíntesisdeesteroles(SE)enplacasdeTLC..La simplehomologíasecuencialnoessuficienteparasostenerlafuncionalidadreal delproductodeungen(Kroonetal.,2006). 2.2.1Nivelcantidad Enlamayoríadelasespeciesdeplantas,DAGAT1parecejugarunpapelmás importanteenlaacumulacióndeaceitedesemillas(Lietal.,2010a).Enlas plantas,laacumulacióndeácidosgrasosinusuales,DAGAT2parecetenerun papelmásimportanteenlaincorporacióndeestosácidosgrasosinusualesen TAG(Lietal.,2010a).
Discusión 282 Comohemoscomentadoanteriormente,existeunconsensoencuantoalpapel clavequetieneDGATenlabiosíntesisdeTAG,especialmenteensemillas.Sin embargo,noseconoceconexactitudelpesoqueunouotrotipodeDGATejerce sobredichabiosíntesis. Haydatosquesostienenque,enmamíferos(ratas,ratonesyhumanos),elgrueso delabiosíntesisdeTAG,especialmenteenlosórganosespecializadoshígadoy tejidoadiposo,lollevaacaboDAGAT2(Turkishetal.,2005;Yenetal.,2005).Más aún,ratonesmutantescarentesdeactividadDGAT1sedesarrollancontotal normalidadypresentannivelesséricosdeTAGcompletamentenormales, mientrasqueratonescarentesdeactividadDGAT2muerenprematuramente (Turkishetal.,2005). Enlevadura,Dga1p,laproteínahomólogaaDGAT2,estambiénlaquecontribuye enmayormedidaalabiosíntesisdeTAGentantoquelasproteínasAre1py Are2p,homólogasaDAGAT1,sonresponsablesdelabiosíntesisdeésteresde esteroles,conunaintervenciónleveenlabiosíntesisdeTAG(Oelkersetal.,2002; Sandageretal.,2002;SorgeryDaum,2003;Turkishetal.,2005;WagneryDaum, 2005;Yenetal.,2005). Enplantaslasituaciónesalgodistintaymenosclara.EnArabidopsisseha observadoquelamutacióndga1(mutanteAS11)produceunareducción significativadeTAGsensemillasyunaalteracióndelperfildeácidosgrasosdelos TAGs(Katavicetal.,1995;Zouetal.,1999;Routabouletal.,1999;Jakoetal., 2001;Mhaskeetal.,2005),acumulandosóloel55‐75%deTAGsensemillascon respectoalalíneasilvestre(Katavicetal.,1995;Routabouletal.,1999).No obstante,elhechodequeelmutantepuedasintetizarlamitadomásdesu contenidonormaldeTAGssugierelaexistenciadeotrosmecanismosimplicados enlabiosíntesisdeTAGs(LuyHills,2002).Análogamente,entabaco,el silenciamientopostranscripcionaldeDAGAT1provocaunareduccióndeTAGsen semillasyenotrotejidos(Zhangetal.,2005).Porsuparte,lasobreexpresiónde DGAT1enArabidopsishizoqueaumentaseladeposicióndeaceiteensemillay, enconsecuencia,supeso(Jakoetal.,2001).ElpatróndeexpresióndeDGAT1en Arabidopsisesrelativamenteubicuo,peroconunmáximodeactividaden
Discusión 283 semillasendesarrollo,dondetambiénesmáximalapresenciadelaproteína DGAT1(Luetal.,2003).Enconcretoseestimaquealmenosel50%dela biosíntesisdeTAGensemillasesatribuibleaDGAT1(Katavicetal.,1995; Routabouletal.,1999;Luetal.,2003).Finalmente,sehaobservadoquela abundanciadeDGAT1estácorrelacionadaconlacantidaddeTAGensemillasen desarrollo(Nykiforuketal.,2002;Luetal.,2003).Estudiosdecomplementación génicadeAtDGAT1yAtDGAT2enlaestirpemutanteH1246deS.cerevisiae revelóqueAtDGAT1fuecapazderestablecerlasíntesisdeTAGsmientrasque AtDGAT2no(Zhangetal.,2009). Porotraparte,enárboldetung(Verniciafordii),DGAT2pareceserla responsabledelaproduccióndelaceitetípicodeV.fordiiricoenácido eleoesteárico(Shockeyetal.,2006).Sinembargo,curiosamente,invitro, VfDGAT2esmenosactivaqueVfDGAT1y,enlevadurastransformadas,se observaquelascepastransformadasconVfDGAT1producemásTAGsquelas transformadasconVfDGAT2(Shockeyetal.,2006). Enricino,sehanhechoestudiossimilaresquesugierencomoprobablemente DGAT2sealacontribuyenteprincipalalabiosíntesisdeTAGensemillas(Kroonet al.,2006).Sinembargo,estudiosdecomplementacióngénicadeRcDGAT2enla estirpemutanteH1246deS.cerevisiaenofuecapazderestablecerlasíntesisde TAGs,mientrasqueRcDGAT1sí(Turchetto‐Zoletetal.,2011). TantoDAGAT1yDAGAT2sehansobreexpresadoconéxitoencultivosconidea deaumentarelcontenidodeaceitedelasemilla.ElmutantedeArabidopsisAS11 tieneunamutacióninducidaporetilmetanosulfonato(EMS),loqueproducela modificaciónenlacomposicióndeácidosgrasosydisminucióndelaactividad DGATycontenidodeTAGenelaceitedelasemilla(Katavicetal.,1995).En comparaciónconeltiposilvestre(WT)deArabidopsis(ecotipoColumbia),el aceitedesemilladeArabidopsisAS11hareducidolacantidaddeácido eicosenoico(20:01cisΔ11)yácidooleico,yelaumentodelosnivelesdeαlinolénico(Katavicetal.,1995).LasobreexpresióndelcDNAdeDAGAT1de ArabidopsisenelmutanteAS11diocomoresultadounaumentoenelcontenido deaceitedesemillasyenelpesomediodelasemilla(Jakoetal.,2001).B.napus,
Discusión 284 expresandoDAGAT1deArabidopsisWToBrassicanapusL.cvJetNeuf, mostraronunaumentoenelcontenidodeaceitedesemillacuandoseprueba bajoinvernaderoocondicionesdecampo(Tayloretal,2009;Weselakeetal, 2008).LaexpresióndeDAGAT2delhongodelsuelo(Umbelopsisramanniana)en lasoja(Glycinemax)resultóenunincrementodel1,5%(enpeso)enelcontenido deaceitedesemillasymayorformacióncuerposlipídicosencondicionesde campo(Lardizábaletal.,2008). Enlamayoríadelasespeciesdeplantas,DAGAT1parecejugarunpapelmás importanteenlaacumulacióndeaceitedesemillas(Lietal.,2010a).Enlas plantas,laacumulacióndeácidosgrasosinusuales,talescomohidroxiyepoxi ácidosgrasos,DAGAT2parecetenerunpapelmásimportanteenla incorporacióndeestosácidosgrasosinusualesenTAG(Lietal.,2010a).Los diferentespatronesdeexpresióndeDAGAT1yDAGAT2enlassemillasen desarrollotambiénpodríantenerunpapelenladeterminacióndelacomposición finaldeácidosgrasosdelaceitedelasemillaenlamadurez.Duranteeldesarrollo desemillasdeárboldetung,laexpresiónDAGAT1seincrementóligeramente, mientrasquelaexpresióndeDAGAT2fuefuertementeinducidaantesdelinicio delaacumulacióndeTAG(Shockeyetal.,2006).LaexpresióndeDAGAT1se correspondeconlabiosíntesisdeTAGendiversostejidos,yDAGAT2pareceestar másdirectamenteimplicadaenlasíntesisdeTAGenlassemillas(Shockeyetal., 2006).Esdifícil,sinembargo,paraextrapolarelpapelreguladordeDAGATde unasespeciesdecultivoaotras.Porejemplo,laactividaddeDAGATtieneuna graninfluenciaenlaformacióndeTAGenelolivo(Oleaeuropaea)yB.napus (Weselakeetal.,2008),perolaactividadDAGATejercesólouncontrolmenor sobrelaformacióndeTAGenlapalma(Elaeisguineensis)(Ramlietal.,2005).Por lotanto,esnecesariaunamejorcomprensióndelaexpresiónylaacciónenzima DAGAT. Asípues,DGATesconsideradalaenzimaclaveenelcontroldelatasadesíntesis deTAGsensemillasalserresponsabledelúltimopasodelabiosíntesisdeTAGsy noestarimplicadaenladelípidosdemembrana(Ichiharaetal.,1988;Cahoonet al.,2007;Napier,2007;Venegas‐Calerónetal.,2010).Esdifícil,sinembargo, extrapolarelpapelreguladordeDAGATdeunasespeciesdecultivoaotras.Por
Discusión 285 ejemplo,laactividaddeDAGATtieneunagraninfluenciaenlaformacióndeTAG enelolivo(Oleaeuropaea)yB.napus(Weselakeetal.,2008),perolaactividad DAGATejercesólouncontrolmenorsobrelaformacióndeTAGenlapalma (Elaeisguineensis)(Ramlietal.,2005).Porlotanto,esnecesariaunamejor comprensióndelaexpresiónylaacciónenzimaDAGAT. Asípues,lacontribuciónrelativadeestasenzimasalaformacióndelípidosde reservaensemillasvaríaentreespecieseinclusoentretejidosdeunmismo organismo(Casesetal.,1998,2001;Shockeyetal.,2006;Chenetal.,2007;Liet al.,2010). Enresumen,laimportanciarelativadeDAGAT1vs.DAGAT2encuantoala biosíntesisdeTAGestodavíamateriadedebate(LungyWeselake,2006;Cahoon etal.,2007).Lasevidenciasacumuladastransmitenunaimagenmudable,enla quedependiendodelorganismo,yaseaanimal,planta,levadura,etc,..esunau otraDAGATlaquellevaelpesodelabiosíntesisdeTAG.Actualmentesepuede afirmarqueDAGAT1tieneunpapelclaveenplantas(LungyWeselake,2006), peroque,inclusodentrodelreinovegetal,yaniveldeespecie,lacontribuciónde cadaDAGATpuedevariarconsiderablemente(Shockeyetal.,2006;Chenetal., 2007). 2.2.2Nivelcalidad Comoyahemosdiscutido,DAGAT1yDAGAT2,enconjunto,jueganunpapel importanteenlabiosíntesisdeTAGs,perovaríantantoensuspatronesde expresióncomoenlaspreferenciasrelativasdesustrato. LaspropiedadesbioquímicasdeDAGAThansidoampliamenteinvestigadaspor complementacióndeestudiosinvitroeinvivo.Losprimerosestudiosinvitrode especificidady/oselectividadporelsustratoDAGATnoreconocenlasdiferencias entreDAGAT1yDAGAT2.Eldescubrimientodelosgenesquecodificanestosdos polipéptidosDAGAThapermitidounanálisismásdetalladodelabiosíntesisde TAG.Ahora,lasobreexpresióndecDNAsDAGATenorganismosdeficientesen
Discusión 286 DAGATendógenoylabiosíntesisdeTAGofreceunaherramientaeficazpara caracterizarlaespecificidadylaselectividadporelsustratodeDAGATs. UnanálisiscomparativodelasDAGAT1yDAGAT2deplantasseharealizadoenel tungárbol(Verniciafordii),Vernoniagalamensisyelricino(Ricinuscommunis). ExpresióndeDAGATsdeltungárbol(VfDAGATs)encélulasdelevadura,seguida deensayodelasenzimasinvitro,revelóqueVfDAGAT1yVfDAGAT2mostraban sólopequeñasdiferenciasenlapreferenciadesustrato,yVfDAGAT2tenían menoresnivelesdeactividadqueVfDAGAT1(Shockeyetal.,2006).Sinembargo, envivo,VfDAGAT2mostraroncincovecesmayoractividadparalaincorporación deácidoα‐eleosteáricoenTAGqueVfDAGAT1(Shockeyetal.,2006).Delmismo modo,laexpresiónespecíficadeVgDAGAT1yVgDAGAT2ensemillasdesoja mostraronqueVgDAGAT2eramásselectivoqueVgDAGAT1parasustratoscon ácidovernólico(12,13‐epoxi,ácido9‐cis‐octadecenoico),unácidograsoinusual quecontieneunenlaceepoxy(Lietal.,2010b).Porotraparte,DAGAT2delricino (RcDAGAT2)tambiénseencontróqueprefiereácidosgrasosinusualescomoel ácidoricinoleico(Burgaletal,2008;.Kroonetal,2006).Engeneral,estos estudiosseñalaronlapreferenciadeDAGAT2paracatalizarlaproducciónde especiesdeTAGconunacomposicióndeácidosgrasosmásbiendefinida. LasobreexpresióndeDAGATsquecodificanenzimasconlaspreferencias específicasdelossustratospuedeaumentarelcontenidodeácidosgrasos inusualesenlasplantastransgénicas.Burgaletal.(2008)observóqueDAGAT2 delricino(Ricinuscommunis),designadoRcDAGAT2,prefiereacil‐CoAyDAGque contieneácidoricinoleico(12‐hidroxi‐9‐cis‐octadecenoicoácido).Lacoexpresión delahidroxilasadeácidosgrasosdericino(RcFAH)yDAGAT2diolugaraun aumentodel30%enácidoricinoleico,nivelquefuedosvecesmásquela expresióndeRcFAHsolo(Burgaletal.,2008).Porotraparte,elcDNAque codificatungárbol(Verniciafordii)DAGAT2(VfDAGAT2)fueclonadoy sobreexpresadoencélulasdelevadura,ymostróaltapreferenciaparalasíntesis deTAGquecontieneácidoeleosteárico(18:03cisΔ9,transΔ11,transΔ13) (Shockeyetal.,2006).Estosestudiosdemostraronlaimportanciadelaactividad DAGATenafectaralacomposicióndeácidosgrasos,ademásdelaacumulación deTAG.
Discusión 287 Encuantoalaespecificidadporsustrato,DAGAT1poseeunampliorangode afinidadpordistintosAGs,jugandounpapelprincipalenlabiosíntesisdeTAGs duranteeldesarrollodelasemilla(LungyWeselake,2006;Liuetal.,2012), mientrasqueDAGAT2,relegadaenocasionesaunsegundoplano,parecetener unpapelclaveenlaincorporacióndeAGsinusualesaTAGsenaquellasplantas quelosacumulan(Kroonetal.,2006;Shockeyetal.,2006;Burgaletal.,2008;Xu etal.,2008;Yenetal.,2008;Cagliarietal.,2010;Lietal.,2010;Liuetal.,2012). Generalmente,sehadescritolaactividadDAGATcomodeampliaespecificidad porsustrato(Frentzen,1998),refiriéndosealaciloincorporado,sinhacer hincapiéenelotrosustratoimplicadoenlareacción,DAG,lamoléculareceptora delacilo. Respectoalacilo,losdatosmostradoshastaelmomentosonmuydiferentes,a vecesdependiendodelaespecie.Enazafrán,lacomposiciónsn‐3depende exclusivamentedeladisponibilidaddeacil‐CoAs(Ichiharaetal.,1988);algo similarsucedeenelcasodelcacahuete.Sinembargo,enespinaca,ricinoymaíz, síexisteunapreferenciaespecífica:losdosprimerosprefieren16:0‐CoA,en tantoqueelmaízesel18:0‐CoAelpreferido(Ichiaharaetal.,1988).Enun estudioposterior,laDAGATdericinoexhibepreferenciaporelácidoricinoleico, 18:1‐OH(VogelyBrowse,1996).Porsuparte,laDAGATdeArabidopsistiene preferenciapor20:1‐CoA(Katavicetal.,1995)yladeGarciniaindicaporel18:0‐ CoA(Danieletal.,2003).TrabajosrecientesconVernoniagalamensisyStokesia laevis,dosespeciescaracterizadasporacumularácidovernólico,demuestranque DAGATtienepreferenciaporelvernoloil‐CoA(Yuetal.,2006). LostrabajoscentradosenlaespecificidadporDAG,asuvez,ponendemanifiesto unapreferenciadesustratoenfuncióndelaespecie(MiégeyMarechal,1999). EnazafrányCuphealanceolada,DAGATprefiereespeciesdeDAGdeltipo 10:0/10:0,mientrasqueenricinoes18:1‐OH/18:1‐OHlaespeciepreferida(Vogel yBrowse,1996;Heetal.,2004a).EnV.galamensisyS.laevis,DAGATprefiere DAGaciladoconácidovernólico(Yuetal.,2006).
Conclusiones 294 14. Engeneral,losresultadosobtenidosdelanálisisdelasdistintaspoblaciones desemillasprovenientesdelalíneasegregantealtooleicoaltoesteárico (HOHE)degirasolalolargodecuatrogeneracionessugierenqueelmétodo deselecciónhasidoefectivoparamejorarlosparámetrosrelativosal contenidoenesteárico(E),EOEySUS,conincrementosconsiderablessobre todoenelprimerodeellos.Lafaltaderespuestaobservadaenrelaciónal parámetrovalorαSatfuecontrariaalasestimacionesquesehicieron inicialmente,loquesugierelaconvenienciadeincorporaryconsiderar nuevosparámetrosalestudio. 15. Elanálisisbidimensionalmediantematricesdedispersiónyelanálisisde componentesprincipalesllevadosacaboentrelasvariablesestudiadas permitierondeterminarlaexistenciaderelacionesentreéstas.Así,existeuna altacorrelaciónentrelasvariablescontenidodeesteárico(E)yEOE,una menorcorrelaciónentreestasvariableyelcontenidoSUSylafaltade correlaciónentretodasellasyelvalorαSat.
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APÉNDICES|327‐332
Apéndices 329 APÉNDICEI Oligonucleótidosdenuevageneración Nombre Secuencia(5’>3’)Nº degs. TM (ºC) Gen/Plásmido/ ProteínaFunción* LPATf1aFMGRWSNGAYATTGAYTGG25652.6HaLPAAT1Clonación LPATf1spFTGTCATAGGTTGGTCAATGTGG‐58.4HaLPAAT1Clonación LPATf2spFAAGGGACTCGATTTACTAATGC‐56.5HaLPAAT1Clonación LPATr1RACRAANCCYTTNGTDCKDGG115257.6HaLPAAT1Clonación LPATr2spRACATTGACCAACCTATGACAGG‐58.4HaLPAAT1Clonación LPATr3spRAAGATGCATATTCTTGAGCTGC‐56.5HaLPAAT1Clonación qHaLPAT1f1spFGTCTCACATTCACTGCAGCC‐59.4HaLPAAT1qRT‐PCR qHaLPAT1r1spRTCTTGTACACTGCCGTTACC‐57.3HaLPAAT1qRT‐PCR KpnILPAT1FFAAGGTACCATGGCAATCTCAGCAGCAGC‐ 69.0HaLPAAT1ClonaciónpYES2 XbaILPAT1RRCGGTCTAGATCAATGCAGTTTTTCTTGTACACTGC‐69.0HaLPAAT1ClonaciónpYES2 BamHILPAT1FFAAGGATCCATGGCAATCTCAGCAGCAGC‐68.0HaLPAAT1ClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC XmaILPAT1RRACCCGGGTCAATGCAGTTTTTCTTGTACAC‐66.8HaLPAAT1ClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC LPATf1spFTGTCATAGGTTGGTCAATGTGG‐58.4HaLPAAT2Clonación LPATf2spFAAGGGACTCGATTTACTAATGC‐56.5HaLPAAT2Clonación HaLPAT2f1spFTGTACACAGATGCCGAGACCC‐61.8HaLPAAT2Clonación LPATr2spRACATTGACCAACCTATGACAGG‐58.4HaLPAAT2Clonación LPATr3spRAAGATGCATATTCTTGAGCTGC‐56.5HaLPAAT2Clonación HaLPAT2r1spRACTTTAACGTGAATCACAGACG‐56.5HaLPAAT2Clonación qHaLPAT2f2spFGCTCACATTCACTGCAATTGGG‐60.3HaLPAAT2qRT‐PCR qHaLPAT2r1spRCTCTTGTACATTACCATTGC‐53.2HaLPAAT2qRT‐PCR KpnILPAT2FFAAAGGTACCATGGCTATCGCAGCAGCAGC‐ 69.5HaLPAAT2ClonaciónpYES2 XbaILPAT2RRCGGTCTAGATCAGTGCAGTTTCTCTTGTACATTACC‐69.5HaLPAAT2ClonaciónpYES2 BamHILPAT2FFAAGGATCCATGGCTATCGCAGCAGC‐66.3HaLPAAT2ClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC XmaILPAT2RRACCCGGGTCAGTGCAGTTTCTCTTGTACATTACC‐70.7HaLPAAT2ClonaciónpCAMBIA‐
Apéndices 330 DGAT1ABf3FTGGCCACTTCTWATGTGC253.7HaDAGAT1AClonación DGAT1f2spFTGCATAGTGGTGCTTGTTGC‐57.3HaDAGAT1AClonación DGAT1Af2spFACGTATAGCCGACTCTGCTGC‐61.8HaDAGAT1AClonación DGAT1AATGFGATCATAGGATGTCATCC‐51.4HaDAGAT1AClonación DGAT1r1RAYARCATCARTGWMACRCC6453.4HaDAGAT1AClonación DGAT1Ar1spRTGCAGCAAGTGGGAATACTGG ‐ 59.8HaDAGAT1AClonación qHaDGAT1Af1spFGTCTGTCACTTCCAGTCTTCC‐59.8HaDAGAT1AqRT‐PCR qHaDGAT1Ar1spRAAGAGTGATAGCAGCAGAGTCG‐60.3HaDAGAT1AqRT‐PCR KpnIDGAT1AFFAAGGTACCATGGCATCCGACGTACGTAGG‐ 69.5HaDAGAT1AClonaciónpYES2 XbaIDGAT1ARRGCGGTCTAGATTATTTGGTGTTGACTTTTCTATTC‐66.0HaDAGAT1AClonaciónpYES2 BamHIDGAT1AFFAAGGATCCATGTCATCCGACGTACGTAGG‐68.1HaDAGAT1AClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC XmaIDGAT1ARRAAGGACCCGGGTTATTTGGTGTTGACTTTTCTATTC‐68.3HaDAGAT1AClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC DGAT1ATGFTAATGGCGTTAYTAGATMCG453.2HaDAGAT1BClonación DGAT1ABf3FTGGCCACTTCTWATGTGC253.7HaDAGAT1BClonación DGAT1f2spFTGCATAGTGGTGCTTGTTGC‐57.3HaDAGAT1BClonación DGAT1Bf3spFGTTACGACAATTGATCAAGC‐53.2HaDAGAT1BClonación DGAT1r1RAYARCATCARTGWMACRCC6453.4HaDAGAT1BClonación DGAT1ABr1RGATTYTCAATGATGAGCC250.3HaDAGAT1BClonación DGAT1BSTOPRGTCTTGTTTAAAATTCACTTGCC‐55.3HaDAGAT1BClonación qHaDGAT1Bf1spFTGTGCTGCCTCTCTCTTCTGC‐61.8HaDAGAT1BqRT‐PCR qHaDGAT1Br1spRCATGTAGAGCGATTACAATAGGG‐58.9HaDAGAT1BqRT‐PCR BamHIDGAT1BFFAAGGATCCACCATGGCGTTATTAGATCCGCC‐ 69.5HaDAGAT1BClonaciónpYES2 XbaIDGAT1BRRCGGTCTAGATCACTTGCCATTATTCACC‐65.1HaDAGAT1BClonaciónpYES2 BamHIDGAT1BF2FAAGGATCCATGGCGTTATTAGATCCGCC‐66.6HaDAGAT1BClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC XmaIDGAT1BRRGAACCCGGGTCACTTGCCATTATTCACC‐68.0HaDAGAT1BClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC DGAT2f1spFAGGCATATATGGACATGG‐51.4HaDAGAT2Clonación DGAT2r1spRGTTGCAGCCGTTAGTCCAAGC‐61.8HaDAGAT2Clonación DGAT2r2spRCTCTCGAATAGATCTTCAACC‐58.4HaDAGAT2Clonación qHaDGAT2f1spFCTGAGGCATATATGGACATGG‐57.9HaDAGAT2qRT‐PCR
Apéndices 331 qHaDGAT2r1spRAACGTCTCCTGAACGCCACC‐61.4HaDAGAT2qRT‐PCR KpnIDGAT2F2FAAGGTACCATGGCCACGACGACGGAGAACAC‐ 69.5HaDAGAT2ClonaciónpYES2 XbaIDGAT2RRCGGTCTAGATCACATAATTCTTAACTGAAGATTAGG‐66.1HaDAGAT2ClonaciónpYES2 BamHIDGAT2F3FAGGATCCATGTCCACGACGACGGAGAACACA‐70.8HaDAGAT2ClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC XmaIDGAT2R3RACCCTCCCGGGTCACATAATTCTTAACTGAAGATTAGGA TAACC‐ 71.3HaDAGAT2ClonaciónpCAMBIA‐ 1300EC N504681LPFACCACCCGGTTAATTTTTCTG‐55.9AtLPAT2AtGenotipado N504681RPRCTTTTTACCACATGCAAAGGG‐55.9AtLPAT2AtGenotipado N546680LPFGAAAGCCATTGCAGTAGCTTG‐57.9AtLPAT3AtGenotipado N546680RPRCGTGTAGGTTGTCTTGGAAGC‐59.8AtLPAT3AtGenotipado LBb1.3FCGGGTACCATGGAGGTTAAGATATCGG ‐ 61.3AtLPAT2/AtLPAT3AtGenotipado N3861LAFCGACCGTCGGTTCCAGCTCATCGG‐69.6AtDGAT1AtGenotipado N3861LCFTAAACAGTAGACTCATCATCG‐54.0AtDGAT1AtGenotipado N3861RBRGCGGCCAATCTCGCAGCGATCTTG‐67.8AtDGAT1AtGenotipado N852633LP FCCAACTCGAACAAAAGAAACG‐55.9AtFatA1AtControlgenómico N852633RPRCAATGGTTTCAACAGTAGCGG‐57.9AtFatA1AtControlgenómico AtActin‐FFGGAAGGATCTGTACGGTAAC‐57.3AtActinaAtAnálisisexpresión AtActin‐RRTGTGAACGATTCCTGGACCT‐57.3AtActinaAtAnálisisexpresión Sc18Sf1spFTTGGCCGAGAGGTCTTGGTA‐59.4ScSubunidad18SScAnálisisexpresión Sc18Sr1spRGGGACGTAATCAACGCAAGC‐59.4ScSubunidad18SScAnálisisexpresión M13forwardFTGTAAAACGACGGCCAGTG‐56.7pMBL‐TPCRscreening M13reverseRCAGGAAACAGCTATGACCATG‐57.9pMBL‐TPCRscreening GAL1forFGTCAAGGAGAAAAAACCCCGGATC‐62.7pYES2PCRscreening CYCrevRGCGTGACATAACTAATTACATGATGCG‐61.9pYES2PCRscreening CaMV35SF1FCGTAAGGGATGACGCACAAT‐57.3pCAMBIA‐1300ECPCRscreening nosTRACGTCATGCATTACATGTTAATTA‐54.2pCAMBIA‐1300ECPCRscreening
Apéndices 332 Enverdesemarcadianaderestricción,enazulcodóndeiniciodetranscripción(ATG),enrojocodóndestopdetranscripción. SubrayadosemarcalasecuenciaKozak(ANNATGG). CódigonucleotídicoIUPAC.‐M:A/C;R:A/G;W:A/T;Y:C/T;S:G/C;K:G/T;H:A/C/T;D:A/G/T;N:A/C/G/T. *Seindicanlasfuncionesparalosquefuerondiseñadosinicialmente,sibienalgunosoligonucleótidosseusaronademáspara comprobar,mediantePCRscreening,lapresenciaycorrectaorientacióndelosfragmentosoclonesinsertadosenlosdiferentes plásmidosdeclonaciónovectoresdeexpresión,asícomoelanálisisdelaexpresióndelasproteínasrecombinantes. Oligonucleótidoscomerciales NombreSecuencia(5’>3’)Nº degs. TM (ºC)CompañíaFunción FA2ZRAACTGGAAGAATTCGCGG‐53.7 Clonaciónextremo3´ UPMLongFCTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTAACAACG CAGAGT‐ 74.0RACE,Clontech(Japón)Clonaciónextremo5´ UPMShortFCTAATACGACTCACTATAGGGC‐58.4RACE,Clontech(Japón)Clonaciónextremo5´ NUPFAAGCAGTGGTAACAACGCAGAGT‐54.7RACE,Clontech(Japón)Clonaciónextremo5´