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Análisis bioinformático y funcional del sistema de secreción tipo III en cepas de Pseudomonas savastanoi aisladas de diversos huéspedes

Moreno-Pérez, Alba,Pérez-Baena, Antonio,Murillo, Jesús,Bardaji, Leire,Ramos-Rodríguez, Cayo Juan

Abstract

La especie Pseudomonas savastanoi se engloba dentro del complejo Pseudomonas syringae, constituido por un conjunto de bacterias fitopatógenas Gram (-) de gran interés agrícola y económico. Dentro de esta especie, hay descritos actualmente 4 patovares capaces de infectar plantas leñosas: pv. savastanoi (aislados de olivo), pv. nerii (aislados de adelfa), pv. fraxini (aislados de fresno) y pv. retacarpa (aislados de retama). Además, se han aislado cepas de P. savastanoi de otros huéspedes, entre los que se encuentra la dipladenia (Mandevilla spp.), aunque los aislados de esta planta no se han asignado aún a un patovar concreto. Dentro del complejo P. syringae, uno de los factores más importantes para el establecimiento de la enfermedad es el sistema de secreción tipo III (T3SS), así como su repertorio de efectores (T3E), los cuales han sido identificados como uno de los factores más relevantes en la determinación del rango de huésped. Actualmente, los genomas de varios aislados de los patovares savastanoi, nerii, fraxini y retacarpa están disponibles en NCBI. Además, hemos obtenido el borrador de la secuencia de aislados adicionales de P. savastanoi, incluyendo el de una cepa patógena en dipladenia. En la actualidad, estamos llevando a cabo ensayos de patogenicidad cruzada de todas estas cepas en diferentes huéspedes de P. savastanoi, con el objetivo de poder relacionar su especificidad de huésped con sus diferencias genómicas. Análisis bioinformáticos comparativos del T3SS de todas estas cepas y de su repertorio de T3E, nos ha permitido identificar el conjunto de T3E compartido entre todas las cepas, así como los específicos de cada una de ellas. Además, hemos construido mutantes en cepas modelo de cada patovar, así como en el aislado de la dipladenia, del gen hrpA, que codifica la principal proteína estructural del pilus del T3SS, y del gen hrpL, que codifica un activador transcripcional de los genes del T3SS y de la mayoría de sus T3E. En la actualidad, estamos analizando el papel de ambos genes en la patogenicidad de las cepas de P. savastanoi seleccionadas y la expresión de varios T3E que podrían estar implicados en el rango de huésped.

Full text

Sesión III:!In e acciones bac e ias pa ógenos-plan a ! MIP´17, 8-10 mayo. Salamanca 22 Análisis bioin o má ico y uncional del sis ema de sec eción ipo III en cepas de Pseudomonas sa as anoi aisladas de di e sos huéspedes Mo eno-Pé ez, A.1, Pé ez-Baena, A.1, Mu illo, J.2, Ba daji, L.2, Ramos, C1. 1Ins i u o de Ho o u icul u a Sub opical y Medi e ánea «La Mayo a», Uni e sidad de Málaga-CSIC, Á ea de Gené ica, Uni e sidad de Málaga, Campus de Tea inos s/n, 29010; 2Labo a o io de Pa ología Vege al, ETS Ingenie os Ag ónomos, Uni e sidad Pública de Na a a, 31006 Pamplona. E-mail: [email protected] La especie Pseudomonas sa as anoi se engloba den o del complejo Pseudomonas sy ingae, cons i uido po un conjun o de bac e ias i opa ógenas G am (-) de g an in e és ag ícola y económico. Den o de es a especie, hay desc i os ac ualmen e 4 pa o a es capaces de in ec a plan as leñosas: p . sa as anoi (aislados de oli o), p . ne ii (aislados de adel a), p . axini (aislados de esno) y p . e aca pa (aislados de e ama). Además, se han aislado cepas de P. sa as anoi de o os huéspedes, en e los que se encuen a la dipladenia (Mande illa spp.), aunque los aislados de es a plan a no se han asignado aún a un pa o a conc e o. Den o del complejo P. sy ingae, uno de los ac o es más impo an es pa a el es ablecimien o de la en e medad es el sis ema de sec eción ipo III (T3SS), así como su epe o io de e ec o es (T3E), los cuales han sido iden i icados como uno de los ac o es más ele an es en la de e minación del ango de huésped. Ac ualmen e, los genomas de a ios aislados de los pa o a es sa as anoi, ne ii, axini y e aca pa es án disponibles en NCBI. Además, hemos ob enido el bo ado de la secuencia de aislados adicionales de P. sa as anoi, incluyendo el de una cepa pa ógena en dipladenia. En la ac ualidad, es amos lle ando a cabo ensayos de pa ogenicidad c uzada de odas es as cepas en di e en es huéspedes de P. sa as anoi, con el obje i o de pode elaciona su especi icidad de huésped con sus di e encias genómicas. Análisis bioin o má icos compa a i os del T3SS de odas es as cepas y de su epe o io de T3E, nos ha pe mi ido iden i ica el conjun o de T3E compa ido en e odas las cepas, así como los especí icos de cada una de ellas. Además, hemos cons uido mu an es en cepas modelo de cada pa o a , así como en el aislado de la dipladenia, del gen h pA, que codi ica la p incipal p o eína es uc u al del pilus del T3SS, y del gen h pL, que codi ica un ac i ado ansc ipcional de los genes del T3SS y de la mayo ía de sus T3E. En la ac ualidad, es amos analizando el papel de ambos genes en la pa ogenicidad de las cepas de P. sa as anoi seleccionadas y la exp esión de a ios T3E que pod ían es a implicados en el ango de huésped. Ag adecimien os. Es e abajo ha sido inanciado po los p oyec os AGL2014-53242-C2-1-R y AGL2014-53242-C2-2-R del MINECO (co inanciados po FEDER). !