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La proteína Rep de geminivirus reduce la sumoilación

Sabarit Penalosa, Blanca

Abstract

Los geminivirus, llamados así por la forma icosaédrica de su cápside, son una familia de virus patógenos de plantas que causan algunas de las enfermedades con mayor impacto económico a nivel mundial. Estos pequeños virus de DNA se replican en el núcleo de las células vegetales utilizando la maquinaria celular del hospedador, además de requerir de forma esencial la presencia de una de sus proteínas, denominada Rep (replication protein). Para llevar a cabo la infección, los geminivirus alteran rutas de regulación post-traduccional, lo cual consiguen mediante la interacción de algunas de sus proteínas con componentes de estas rutas1,2,3. Dos de las modificaciones post-traduccionales más importantes, la sumoilación y la ubiquitinación, que consisten en la adición mediante una cascada enzimática de pequeños péptidos (ubiquitina y SUMO) a residuos de lisina de la molécula diana, están involucradas en numerosos procesos de la planta, incluidos el desarrollo y el ciclo celular, y juegan un papel relevante en la respuesta a estreses tanto bióticos como abióticos. Trabajos previos desarrollados en nuestro grupo mostraron que la proteína Rep del geminivirus Tomato Golden mosaic virus interacciona con SCE1 (SUMO Conjugating enzyme)4, una de las enzimas que participan en la ruta de sumoilación, y PCNA (Proliferating Cell Nuclear Antigen)5,6, una proteína homotrimérica que actúa como coordinador central en la replicación y reparación del DNA y en la que las modificaciones postraduccionales juegan un importante papel regulando su interacción con otras proteínas. Posteriormente, se vio que la interacción entre Rep y SCE1 es necesaria para la infección por geminivirus y que la expresión de Rep tiene un efecto específico sobre la sumoilación de las proteínas de la planta4,7. Mediante ensayos en Escherichia coli usando el sistema de sumoilación de Arabidopsis thaliana, hemos detectado que una de estas proteína es PCNA y que su sumoilación se ve reducida por la presencia de la proteína viral. Así mismo, se ha comprobado que esa disminución se produce por un mecanismo que no implica la interacción de Rep con SCE1 e identificado las lisinas de PCNA cuya sumoilación se ve afectada. Además, utilizando un sistema de ubiquitinación en E. coli8, se comprobó si la presencia de Rep produce el mismo efecto en la ubiquitinación. Resultados preliminares indican que la proteína viral no reduce, al menos al mismo nivel, la ubiquitinación de PCNA. Se discutirán las posibles consecuencias que para el virus puede tener la interferencia en la sumoilación de PCNA.

Full text

La#proteína Rep de#geminivirus reduce#la# sumoilación de#PCNA B.#Sabarit,#M.#Arroyo-Mateos,#M.#A.#Sánchez-Durán,#E.#R.#Bejarano Geminivirus ssDNA Replicación#por círculo#rodante Replicación Dependiente#de Recombinación Replicación dsDNA Movimiento#del# DNA ? ? Plasmodesmos Modificado-de-Hanley-Bowdoin et#al.-2013Geminivirus Encapsidación Transcripción Proteínas#virales mRNA Traducción Rep Rep Rep Rep:-esencial-en-la-replicación-de-los-geminivirus C G G A T G A A C G C C A T T A T AA T A T T (C1# )ATG ATG-(V2#) G C C T A C C G G C G TATA TATA IR Rep Rep Maquinaria celular (PCNA,-primasas,-DNA-polimerasas) RepPCNA Regulación#del#ciclo#celular p21 ciclinas,-CDKs Reparación#del#DNA XPG DNA-polimerasas-β, η, ι, κ, λ Recombinación Srs2 Replicación#del#DNA Fen1 DNA-polimerasa-δ DNA-polimerasa-ε DNA-ligasa I RFC Rep PCNA:-MODIFICACIONES-POSTRADUCCIONALES Regulación#del#ciclo#celular p21 ciclinas,-CDKs Reparación#del#DNA XPG DNA-polimerasas-β, η, ι, κ, λ Recombinación Srs2 Replicación#del#DNA Fen1 DNA-polimerasa-δ DNA-polimerasa-ε DNA-ligasa I RFC Ub SUMO Ub Ub PCNA Proliferating Cell Nuclear-Antigen Rep Rep interacciona-con-muchas-proteínas-de-la-planta (Castillo-et#al.#2004) (Castillo-et#al.,-2003;-Bagewadi et#al.-2004) PCNA Proliferating Cell Nuclear-Antigen Rep Rep interacciona-con-muchas-proteínas-de-la-planta SCE SUMO-Conjugating Enzyme (Castillo-et#al.,-2003;-Bagewadi et#al.-2004) (Castillo-et#al.,-2004) SUMOILACIÓN SUMO- (small ubiquitin-like modifier) Proteasa SCE1 S Proteína SCE1 Proteína E3 SAE1 SAE2 Interacción •Actividad •Localización Proteasa Degradación SUMO- (100aa) Sumoilación 1. Conservación 2. Localización 3. Dominio-de-sumoilación Selección de#lisinas: falciparum que no contiene un residuo de lisina en la posición 164. Adicionalmente a estas lisinas, se seleccionaron otras tres situadas en el exterior del anillo: (i) la lisina 168 por su localización cercana a la lisina 164 y por estar conservado en todos los PCNAs de plantas, mamíferos y en la mayoría de los animales; (ii) la lisina 190 situada en la cara del lazo de PCNA en una posición muy cercana a K164 y conservada en todas las secuencias de plantas y animales, excepto en Anguilla japónica y (iii) la lisina 91, que forma parte de una secuencia consenso de sumoilación en C. elegans, se localiza en la cara del lazo y esta conservada en la secuencia de todos los PCNA de plantas y en algunos animales y microorganismos eucarióticos. En la figura 1.5 se muestran la posición que ocupan las lisinas seleccionadas en las estructura tridimensional de PCNA. Construcción de mutantes y ensayos de sumoilación Utilizando como molde el plásmido pET28b-SlPCNA (Sánchez-Durán et al., 2011) se generaron mutantes puntuales en los residuos K164, K168 y ¿Qué-lisinas-se-sumoilan? 1. Conservación 2. Localización 3. Dominio-de-sumoilación Selección de#lisinas: ¿Qué-lisinas-se-sumoilan? SlPCNA E1/E2/SUMO Rep - - wt ++++++ +- - - - - K164A K164A K168A K164A K254A K254A wtwt 37 50 75 Anti-PCNA 1. Conservación 2. Localización 3. Dominio-de-sumoilación Selección de#lisinas: falciparum que no contiene un residuo de lisina en la posición 164. Adicionalmente a estas lisinas, se seleccionaron otras tres situadas en el exterior del anillo: (i) la lisina 168 por su localización cercana a la lisina 164 y por estar conservado en todos los PCNAs de plantas, mamíferos y en la mayoría de los animales; (ii) la lisina 190 situada en la cara del lazo de PCNA en una posición muy cercana a K164 y conservada en todas las secuencias de plantas y animales, excepto en Anguilla japónica y (iii) la lisina 91, que forma parte de una secuencia consenso de sumoilación en C. elegans, se localiza en la cara del lazo y esta conservada en la secuencia de todos los PCNA de plantas y en algunos animales y microorganismos eucarióticos. En la figura 1.5 se muestran la posición que ocupan las lisinas seleccionadas en las estructura tridimensional de PCNA. Construcción de mutantes y ensayos de sumoilación Utilizando como molde el plásmido pET28b-SlPCNA (Sánchez-Durán et al., 2011) se generaron mutantes puntuales en los residuos K164, K168 y Las#lisinas#164#y#254#se#sumoilan ¿Qué-lisinas-se-sumoilan? Evolución-de-los-geminivirus Alta#tasa#de#recombinaciónAlta#tasa#de#mutación PCNA GG PCNA Otros# factores Reparación Síntesis-de-translesión Replicación Reparación-libre-deerror PCNA GG SUMO PCNA Translesion polymerase GG Polimerasas# translesión Srs2 Inhibición#de#la# recombinación Lys 164 PCNA UbUbUbUb Ub Interferencia-de-Rep en-la-sumoilación Pol Srs2 S Suppresión de#eventos# de#recombinación PCNA Modificado-de-Mailand,-2013 PCNA Pol Incremento#de#eventos# de#recombinación Rep Rad51 Infección#por Geminivirus Rad51Líneas futuras: 1.#Detección de-la-interferencia-in#planta. 2.#Búsqueda-de-más-proteínas-cuya-sumoilación se-vea-alterada-por-Rep. Agradecimientos Harrold van-den-Burg Francesca-Maio Linda-Hanley-Bowdoin José-T.-Ascencio-Ibáñez